单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10361 - 10380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10361 | 2024-08-05 |
Coexpression enhances cross-species integration of scRNA-seq across diverse plant species
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569145
PMID:38076991
|
研究论文 | 本文展示了共表达如何增强不同植物物种之间单细胞RNA测序的整合 | 提出使用共表达来识别具有代理表达谱的非正交基因对，从而改善传统整合方法的性能 | 未提及具体的实验限制或样本限制 | 研究植物物种之间基因表达和细胞类型组成的跨物种差异 | 不同植物物种的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10362 | 2024-08-05 |
Single Cell Transcriptome of Stress Vulnerability Network in mouse Prefrontal Cortex
2023-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.14.540705
PMID:37662266
|
研究论文 | 该文章探讨了小鼠前额皮层中与压力脆弱性网络相关的单细胞转录组。 | 首次结合单细胞RNA测序和电脑网络测量，揭示压力脆弱性脑状态下的基因表达架构。 | 研究主要集中于小鼠模型，可能不完全适用于人类情绪障碍的理解。 | 探讨与压力脆弱性相关的基因表达和电脑网络活动之间的关系。 | 主要对象为小鼠，特别关注于小鼠前额皮层中不同细胞类型的转录组。 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多只小鼠，具体样本数量未在摘要中提供 |
| 10363 | 2024-08-04 |
Spatial single cell analysis of tumor microenvironment remodeling pattern in primary central nervous system lymphoma
2023-07, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-01908-x
PMID:37120690
|
研究论文 | 本研究探讨了原发性中枢神经系统淋巴瘤的肿瘤微环境重塑模式及其机制 | 提出了一种免疫压力感知模型，揭示了肿瘤细胞如何根据免疫压力重塑肿瘤微环境 | NA | 确定原发性中枢神经系统淋巴瘤的肿瘤微环境特性及转变机制 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤患者的肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 空间转录组学，单细胞测序 | NA | NA | PCNSL患者的匹配单细胞测序数据 |
| 10364 | 2024-08-04 |
Clinical molecular subtyping reveals intrinsic mesenchymal reprogramming in gastric cancer cells
2023-05, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-00989-z
PMID:37121972
|
研究论文 | 本研究揭示了胃癌细胞内在间充质重编程的分子亚型 | 本研究首次将TGF-β信号通路作为胃癌内在间充质表型的驱动通路和潜在治疗靶点 | 研究未详细探讨TGF-β信号通路在不同胃癌亚型中的机制差异 | 探讨胃癌细胞的间充质表型及其与肿瘤微环境的关联 | 547个胃癌患者的转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 转录组测序，空间转录组学，免疫组织化学 | 小鼠异种移植模型 | 转录组数据 | 547个胃癌样本 |
| 10365 | 2024-08-05 |
Murine skin-derived multipotent papillary dermal fibroblast progenitors show germline potential in vitro
2023-02-03, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03243-5
PMID:36737797
|
研究论文 | 这篇文章描述了从小鼠皮肤中分离的多能乳头真皮成纤维细胞前体，首次展示了其在体外诱导生成雄性生殖细胞的能力 | 揭示了多能乳头真皮成纤维细胞前体具有生殖细胞潜力，并展示了其在体外形成雄性生殖细胞的能力 | 该研究主要基于实验室条件，具体的体内功能验证尚未完成 | 探索小鼠皮肤衍生的多能细胞的起源及其生成雄性生殖细胞的能力 | 研究对象为从新生小鼠皮肤中获取的多能乳头真皮成纤维细胞前体 | 组织工程 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA转录组数据 | 7543个单细胞转录组 |
| 10366 | 2024-08-05 |
A zebrafish reporter line reveals immune and neuronal expression of endogenous retrovirus
2022-04-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.048921
PMID:35142349
|
研究论文 | 这项研究揭示了斑马鱼内源性逆转录病毒在免疫和神经系统中的表达 | 首个在任何物种中建立的体内逆转录病毒报告线，提供了新工具来研究ERV的功能 | 对哺乳动物基因组中众多复制的研究尚存在工具不足的问题 | 研究内源性逆转录病毒（ERV）在健康和疾病中的作用 | 斑马鱼内源性逆转录病毒zferv的八个拷贝 | 数字病理 | 自体炎症疾病与神经疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、活体成像 | NA | NA | NA |
| 10367 | 2024-08-05 |
The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
2021-Sep-27, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-021-00180-3
PMID:34579780
|
研究论文 | 该文章概述了海洋环节动物Platynereis dumerilii作为模型系统的最新研究进展和方法论 | 强调了Nereid幼虫在全身体积电子显微镜和单细胞测序中的独特优势 | 未提及具体的限制因素 | 旨在激发对Platynereis模型的进一步兴趣，并扩展活跃的研究社区 | 研究对象为Nereid Platynereis dumerilii及其相关生物学特征 | 生态毒理学 | NA | 全身体积电子显微镜、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 10368 | 2024-08-05 |
Expression profiling of single cells and patient cohorts identifies multiple immunosuppressive pathways and an altered NK cell phenotype in glioblastoma
2020-04, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1111/cei.13403
PMID:31784984
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和患者队列的表达分析，识别了胶质母细胞瘤中的多条免疫抑制通路和改变的NK细胞表型 | 通过结合NK细胞功能试验及基因和蛋白表达分析，深入探讨了胶质母细胞瘤的免疫微环境和细胞反应 | 未提供关于研究样本的详细信息，以及可能的个体变异性 | 研究胶质母细胞瘤中的免疫逃逸机制及其对免疫疗法的反应 | 胶质母细胞瘤患者的NK细胞及其在肿瘤微环境中的表现 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 研究涉及患者队列的转录组数据，具体样本量未明确 |
| 10369 | 2024-08-05 |
Genetic predisposition to mosaic Y chromosome loss in blood
2019-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1765-3
PMID:31748747
|
研究论文 | 本研究探讨了男性人群中Y染色体马赛克缺失的遗传易感性及其对健康的影响 | 识别了156个与Y染色体缺失相关的常染色体遗传决定因素，并在不同人群中进行了验证 | 缺乏对Y染色体缺失的因果机制的深入理解 | 研究Y染色体缺失对健康的影响以及相关的遗传因素 | 205,011名男性参与者，及757,114名具有欧洲和日本血统的男性 | 基因组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 205,011名男性 |
| 10370 | 2024-08-05 |
Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice
2024-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024
PMID:38286187
|
研究论文 | 本文研究了嗜碱性粒细胞在小鼠机械损伤后皮肤屏障功能恢复中的保护作用 | 揭示了嗜碱性粒细胞通过下调Il17a表达来对抗IL-17A对皮肤屏障功能恢复的不良影响 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果是否适用于人类尚不清楚 | 探索机械损伤后皮肤屏障功能恢复的机制 | 小鼠的皮肤屏障功能和细胞反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 10371 | 2024-08-04 |
CAbiNet: joint clustering and visualization of cells and genes for single-cell transcriptomics
2024-Jul-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae480
PMID:38850160
|
研究论文 | 该文章介绍了一种用于单细胞转录组学数据的聚类和可视化的新方法 | 提出了基于网络的对应分析双聚类方法CAbiNet，该方法高效地进行细胞及其标记基因的共同聚类和可视化 | 文章未提及具体的限制 | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据的聚类和可视化效果 | 研究对象是单细胞RNA测序数据中的细胞及其标记基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | NA |
| 10372 | 2024-08-05 |
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.02.573939
PMID:38260306
|
研究论文 | 本研究介绍了具有反向生物极性的人的气道类器官，推动药物开发标准化。 | 提出了一种新型的气道类器官，能够高通量分析与病毒感染的相关性，具有重要临床意义。 | 本研究主要集中在SARS-CoV-2的研究上，可能限制了其在其他病毒研究中的应用。 | 探讨高通量气道类器官在抗病毒药物筛选中的应用。 | 研究对象为与SARS-CoV-2相关的人气道类器官。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 约100个细胞 |
| 10373 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing, spatial transcriptome ad periodontitis: Rethink pathogenesis and classification
2024-07, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14761
PMID:37794757
|
综述 | 本综述阐明了单细胞RNA测序和空间转录组学在牙周炎中的应用 | 探讨了细胞群体和基因特征与牙周炎病因的相关性，带来了新的诊断思路 | 目前尚未确定与牙周炎相关的具体细胞或基因特征 | 研究单细胞测序和空间转录组学在牙周炎病理学和分类中的应用 | 人类的牙周炎相关研究 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 (ST) | NA | 文献 | 22篇涉及人类的研究论文 |
| 10374 | 2024-08-05 |
CTCF mutation at R567 causes developmental disorders via 3D genome rearrangement and abnormal neurodevelopment
2024-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49684-1
PMID:38951485
|
研究论文 | 本文探讨了CTCF R567W突变对发育紊乱的影响及其机制 | 研究首次揭示了CTCF突变如何通过3D基因组重构影响神经发育 | 仅探索了特定突变的影响，缺乏对其他CTCF突变的广泛分析 | 阐明CTCF突变对人类神经发育障碍的影响及其潜在机制 | 小鼠模型和人类胚胎干细胞衍生的皮层类器官模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠及其胚胎干细胞衍生的皮层类器官 |
| 10375 | 2024-08-05 |
[Analysis of correlation between high expression of nucleoporin 85 (NUP85) and immune cell infiltration in hepatocellular carcinoma]
2024-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:38952090
|
研究论文 | 该研究探讨了核孔蛋白85（NUP85）在肝细胞癌中的表达及其与免疫反应的相关性 | 首次系统分析了NUP85在HCC中高表达与免疫细胞浸润的相关性，并提出其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 本研究的局限性在于使用的数据库和分析方法可能存在的数据偏差 | 研究NUP85在肝细胞癌中的意义及其与免疫反应的关系 | 肝细胞癌（HCC）样本中的NUP85表达及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，基因表达分析 | NA | mRNA和蛋白数据 | 涉及HCC样本的突变率为19% |
| 10376 | 2024-08-05 |
Cell type evolution reconstruction across species through cell phylogenies of single-cell RNA sequencing data
2024-Feb, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02281-9
PMID:38182680
|
研究论文 | 该论文探讨了细胞类型的起源和进化，利用单细胞RNA测序数据重建细胞谱系 | 首次通过显式的谱系学方法应用于单细胞数据，使用主成分作为谱系特征以构建细胞谱系 | 谱系构建依赖于现有的数据，可能受限于样本的多样性和数量 | 研究细胞类型的进化及其在不同物种之间的比较 | 来自五种远缘相关哺乳动物的眼细胞的比较单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 基因表达数据 | 五种哺乳动物的眼细胞数据集 |
| 10377 | 2024-08-05 |
O-GlcNAc transferase regulates collagen deposition and fibrosis resolution in idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387197
PMID:38665916
|
研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAc转移酶在特发性肺纤维化中的作用。 | 这项研究首次揭示了OGT在特发性肺纤维化中的调节作用及其在胶原沉积和纤维化消退中的关键角色。 | 尚未在临床试验中验证OGT抑制对纤维化分辨率的影响。 | 研究OGT在特发性肺纤维化中的作用及其对胶原沉积和纤维化消退的影响。 | 本研究的对象包括来自特发性肺纤维化及非特发性肺纤维化捐赠者的人肺组织和孤立成纤维细胞。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 实验模型 | 组织样本和细胞样本 | 未提供具体样本量 |
| 10378 | 2024-08-05 |
Machine learning and single-cell sequencing reveal the potential regulatory factors of mitochondrial autophagy in the progression of gastric cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05287-9
PMID:37648811
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序全面分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 通过机器学习算法识别出关键基因和特定的转录因子，为线粒体自噬在胃癌中的机制提供新见解 | 本研究的局限性在于样本数量和多样性可能影响结果的适用性 | 旨在分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 研究对象为与胃癌相关的线粒体自噬基因及相关细胞类型 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 支持向量机递归特征消除, 随机森林算法 | 基因表达数据 | 13个胃癌样本中的28,836个细胞 |
| 10379 | 2024-08-05 |
Selenium metabolism heterogeneity in pan-cancer: insights from bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05333-6
PMID:37648807
|
研究论文 | 本研究探讨了硒代谢在肿瘤发生和免疫反应中的异质性 | 首次系统性探讨了硒代谢的预后意义及其与免疫反应的关系 | 研究主要依赖于公共数据库，可能存在样本选择偏倚 | 探究硒代谢对免疫反应和癌症生物学的影响 | 关注不同癌症类型中硒代谢的异质性及其相关的免疫调节模式 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 基于86个基因的分析，涉及多个癌症类型的数据 |
| 10380 | 2024-08-05 |
Single-cell multiomic analysis identifies a HOX-PBX gene network regulating the survival of lymphangioleiomyomatosis cells
2023-05-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8549
PMID:37163604
|
研究论文 | 本文通过单细胞多组学分析，识别了一种HOX-PBX基因网络，调控淋巴管平滑肌瘤细胞的生存。 | 研究揭示了HOX-PBX转录程序在肺淋巴管平滑肌瘤细胞中的激活及其对细胞生存的调控机制。 | 需要进行长期的药物管理以维持疗效，且部分患者无法耐受治疗或对疗法反应不佳 | 探索淋巴管平滑肌瘤细胞的致病机制以及潜在的治疗靶点。 | 淋巴管平滑肌瘤（LAM）细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和单核ATAC-seq | NA | RNA数据 | NA |