单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10341 - 10360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10341 | 2024-08-05 |
Amphiregulin-producing TH2 cells facilitate esophageal fibrosis of eosinophilic esophagitis
2024-Aug, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2024.100287
PMID:39040657
|
研究论文 | 这篇文章探讨了TH2细胞产生的amphiregulin在嗜酸粒细胞食管炎中的作用，导致食管纤维化。 | 本研究首次揭示了TH2细胞产生的amphiregulin在食管纤维化中的作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | 本研究主要基于小鼠模型及少量人类样本，可能影响普适性 | 阐明嗜酸粒细胞食管炎中食管纤维化的细胞和分子机制 | 研究对象为嗜酸粒细胞食管炎模型小鼠及其对应的人类患者样本 | 数字病理学 | 嗜酸粒细胞食管炎 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | 小鼠模型 | 组织活检样本 | 小鼠模型与少量人类患者样本 |
| 10342 | 2024-08-04 |
Exploring ABHD5 as a Lipid-Related Biomarker in Idiopathic Pulmonary Fibrosis: Integrating Machine Learning, Bioinformatics, and In Vitro Experiments
2024-Jul-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02107-1
PMID:39046603
|
研究论文 | 本研究探讨了ABHD5作为特发性肺纤维化(IPF)的脂质相关生物标志物的潜力 | 通过整合机器学习、生物信息学和体外实验，提出了ABHD5作为IPF新生物标志物的概念 | 研究可能存在样本量不足或特定数据集选择偏倚的问题 | 旨在探索IPF的脂质相关生物标志物及其机制 | 涉及特发性肺纤维化相关的数据集与细胞实验 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 机器学习、单细胞测序，细胞计数试剂盒-8，5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 涉及多个数据集和细胞实验，具体样本数量未提供 |
| 10343 | 2024-08-04 |
Key factor screening in mouse NASH model using single-cell sequencing combined with machine learning
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33597
PMID:39040415
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习相结合，识别与非酒精性脂肪肝炎（NASH）进展密切相关的基因 | 结合单细胞RNA测序和深度学习技术，揭示了NASH相关基因与免疫细胞之间的关系 | NA | 识别与NASH进展相关的关键基因 | 小鼠NASH模型中的细胞群体和基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因数据 | 比较Chow组和NASH组的细胞群体数据 |
| 10344 | 2024-08-04 |
Mechanisms of regeneration: to what extent do they recapitulate development?
2024-Jul-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202541
PMID:39045847
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回顾 | 该文章探讨了再生生物学中再生与发育的关系及其机制 | 提出了再生是一种更动态和可变的过程，并探讨了其对形态发生的新理解 | 未提及具体的实验数据或样本分析 | 研究再生与发育之间的关系及其背后的生物机制 | 主要集中在不同模型生物的再生机制 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR系统 | NA | NA | NA |
| 10345 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on drug response genes to predict prognosis and therapeutic response in ovarian cancer
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33367
PMID:39040239
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研究论文 | 本研究利用单细胞和大规模RNA测序识别出可预测卵巢癌预后和治疗反应的药物反应基因特征 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，构建了高灵敏度和特异性的预后模型 | 未提及具体样本大小和多样性，可能影响模型的普适性 | 探索卵巢癌的可靠生物标志物，以预测药物反应和指导治疗选择 | 卵巢癌患者和其基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10346 | 2024-08-04 |
Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis
2024-Jul-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae028
PMID:38289873
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研究论文 | 本文通过转录组分析，识别出Itih4作为动脉粥样硬化中特异性的平滑肌细胞基因。 | 首次确定Itih4为与动脉粥样硬化相关的平滑肌细胞特异性基因，并链接其与冠状动脉疾病的关系。 | 研究依赖于特定的转基因小鼠模型，可能限制结果的普适性。 | 探讨平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的基因表达变化。 | 使用SMCTRAP小鼠模型分析动脉粥样硬化相关的平滑肌细胞基因表达。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 转译核糖体亲和纯化测序 | 转基因小鼠 | 组织样本 | 15个月大的SMCTRAP和SMCTRAP-AS小鼠的胸主动脉样本 |
| 10347 | 2024-08-04 |
Exploring the immune landscape and drug prediction of an M2 tumor-associated macrophage-related gene signature in EGFR-negative lung adenocarcinoma
2024-Jul, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15375
PMID:38886907
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研究论文 | 本研究探讨了EGFR阴性肺腺癌中M2肿瘤相关巨噬细胞基因特征的免疫景观和药物预测 | 构建了基于M2-TAM的预后特征，揭示了EGFR阴性肺腺癌的免疫景观，并预测了免疫治疗反应 | 可能缺乏大样本验证，临床适用性需进一步研究 | 改善EGFR阴性肺腺癌患者的免疫治疗效果 | EGFR阴性肺腺癌（LUAD）患者 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA |
| 10348 | 2024-08-04 |
PARE: A framework for removal of confounding effects from any distance-based dimension reduction method
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012241
PMID:38985831
|
研究论文 | 本研究介绍了一种去除混杂效应的PARE框架，可应用于任何基于距离的降维方法 | PARE框架允许从任何距离基础的降维方法中去除混杂效应，扩展了降维方法的应用 | 暂无明显的限制提及 | 研究目标是开发一种去除混杂效应的框架，以提高生物学模式的可视化 | 研究对象包括基因组和神经影像数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 高维数据 | 涉及单细胞测序数据和神经影像测量的多种样本 |
| 10349 | 2024-08-05 |
S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis
2024-Jun-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06849-6
PMID:38942784
|
研究论文 | S100A8/A9高表达的中性粒细胞通过线粒体复合体I缺陷诱导内皮细胞的线粒体功能障碍和PANoptosis | 首次揭示了S100A8/A9通过调节Nrf1表达而抑制线粒体复合体I中Ndufa3的表达，从而导致内皮细胞线粒体功能障碍的机制 | 研究的机制需要进一步探讨，尤其是在临床转化方面的应用 | 探讨S100A8/A9在脓毒症中引发内皮细胞功能障碍的机制 | 高表达S100A8/A9的中性粒细胞与内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 脓毒症 | scRNA-seq和bulk RNA-seq分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10350 | 2024-08-05 |
Enhanced abscopal anti-tumor response via a triple combination of thermal ablation, IL-21, and PD-1 inhibition therapy
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03718-1
PMID:38833177
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研究论文 | 该研究探讨了热消融、IL-21和PD-1抑制治疗的三重组合在肿瘤治疗中的作用 | 研究首次探讨了热消融、IL-21和抗PD-1单克隆抗体的联合疗法对肿瘤的抗肿瘤效果 | 研究未提供不同治疗组的外部验证和临床试验数据 | 研究三重组合疗法在转移性癌症治疗中的潜力 | 探讨热消融对肿瘤浸润淋巴细胞中IL-21R表达的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10351 | 2024-08-05 |
SIRPG expression positively associates with an inflamed tumor microenvironment and response to PD-1 blockade
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03737-y
PMID:38833156
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研究论文 | 本研究旨在探讨信号调节蛋白伽玛（SIRPG）与肿瘤免疫微环境表型及T细胞介导的适应性抗肿瘤免疫之间的关系 | 高SIRPG表达与癌症中的发炎免疫表型及对PD-1阻断的良好反应相关，暗示其作为预测生物标志物和新的免疫治疗靶点的潜力 | 缺乏对不同癌症类型中SIRPG功能机制的深入研究 | 探讨SIRPG与肿瘤免疫微环境及PD-1阻断反应的关系 | 对157名非小细胞肺癌和黑色素瘤患者进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 157名患者的临床数据和103,599个细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 10352 | 2024-08-04 |
The neuroblastoma tumor microenvironment: From an in-depth characterization towards novel therapies
2024-Jun, EJC paediatric oncology
DOI:10.1016/j.ejcped.2024.100161
PMID:39036648
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综述 | 本文总结了神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征及其针对新疗法的研究进展 | 提出通过深入理解肿瘤微环境以识别新的疗法组合，特别是针对免疫逃逸和药物耐受性的组合策略 | 本文主要是对已有研究的总结，缺乏新的实验数据 | 探讨神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征以及靶向该微环境的新疗法 | 神经母细胞瘤患者的肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | 体内和体外实验模型 | 文本 | 众多相关临床试验和研究数据 |
| 10353 | 2024-08-04 |
TRPV1 inhibition suppresses non-small cell lung cancer progression by inhibiting tumour growth and enhancing the immune response
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00894-7
PMID:37902941
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研究论文 | 本研究探讨了TRPV1在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用，发现其表现为肿瘤促进因子。 | 首次明确了TRPV1在NSCLC中的促进肿瘤生长和影响免疫反应的机制。 | 缺乏长期的临床数据或患者数量的足够样本来全面评估TRPV1的作用。 | 探讨TRPV1在非小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤进展的影响。 | 研究对象为非小细胞肺癌组织及相关细胞系。 | 数字病理学 | 肺癌 | LC-MS/MS, ELISA, 免疫组化, CCK8, 流式细胞仪, qPCR, 西方印迹 | NA | 组织样本, 细胞系 | 使用了来自TCGA数据库的多个肿瘤组织和小鼠肿瘤异种移植模型 |
| 10354 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of the rare virosphere reveals the native hosts of giant viruses in the marine environment
2024-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01669-y
PMID:38605173
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序方法，揭示了海洋环境中巨病毒的原生宿主 | 首次通过单细胞RNA测序技术配对活跃的巨病毒与其原生原生生物宿主 | 未能全面覆盖所有可能的宿主和巨病毒之间的相互作用 | 研究巨病毒的原生宿主及其生态重要性 | 研究在诱导的藻类 bloom 中收集的样本中，与巨病毒感染相关的宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 在多个宿主谱系中检测到数百个单细胞 |
| 10355 | 2024-08-05 |
The Efficacy of Imiquimod-Induced Psoriasis Model on Murine Cells
2024-Jun, Cureus
DOI:10.7759/cureus.62914
PMID:39040747
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研究论文 | 本研究集中于使用Imiquimod诱导小鼠皮肤细胞的类银屑病模型的有效性 | 本研究通过单细胞RNA测序和轨迹分析首次阐明了IMQ诱导的细胞与对照细胞在分化模式上的显著差异 | 研究指出IMQ诱导的细胞与银屑病细胞之间的差异因素仍需进一步探索 | 研究IMQ在诱导类银屑病模型中的有效性 | 小鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 10356 | 2024-08-05 |
ITGB2-ICAM1 axis promotes liver metastasis in BAP1-mutated uveal melanoma with retained hypoxia and ECM signatures
2024-Jun, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00908-4
PMID:38150154
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研究论文 | 这项研究探讨了ITGB2-ICAM1轴在BAP1突变的葡萄膜黑色素瘤中促进肝转移的机制 | 揭示了BAP1缺失驱动UM转移的机制，并提出了ITGB2-ICAM1轴作为潜在的治疗靶点 | 本研究主要基于小鼠模型，临床转化的可行性尚待验证 | 研究BAP1突变葡萄膜黑色素瘤中的转移机制和相关的信号通路 | 主要分析BAP1突变与转移性葡萄膜黑色素瘤的单细胞RNA测序数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 免疫竞争性小鼠肝脏转移模型 | 基因表达数据 | 包含初级和转移性UM样本的单细胞RNA测序数据，且使用免疫小鼠模型进行实验 |
| 10357 | 2024-08-04 |
Insights for disease modeling from single-cell transcriptomics of iPSC-derived Ngn2-induced neurons and astrocytes across differentiation time and co-culture
2024-Apr-02, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01867-4
PMID:38566045
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研究论文 | 本文探讨了通过Ngn2诱导的人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的神经元和星形胶质细胞的单细胞转录组学，及其在疾病建模中的应用 | 文章提供了hiPSC衍生神经元和星形胶质细胞与其体内对应细胞的同质性和相似性的新见解，并整合了公共单细胞RNA测序数据 | 研究指出了所调查细胞模型在神经精神疾病研究中的重要局限性 | 研究旨在优化复杂脑部疾病的细胞建模方法 | 研究对象为通过Ngn2诱导的hiPSC衍生神经元和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及多种hiPSC衍生细胞的样本，具体数量未说明 |
| 10358 | 2024-08-04 |
A subpopulation of human bone marrow erythroid cells displays a myeloid gene expression signature similar to that of classic monocytes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0305816
PMID:39038020
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研究论文 | 本研究探讨了人类骨髓红细胞亚群的特征及其在先天免疫中的作用 | 首次揭示人类骨髓红细胞的亚群表现出与经典单核细胞相似的髓系基因表达特征 | 研究可能受限于样本规模和单细胞RNA测序数据的可用性 | 阐明人类骨髓红细胞的特性及其在先天免疫反应中的潜在角色 | 人类骨髓红细胞亚群 | 数字病理学 | NA | NanoString基因表达分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 10359 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of PPP4C's impact on prognosis, immune microenvironment, and immunotherapy response in lung adenocarcinoma using single-cell sequencing and multi-omics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1416632
PMID:39026674
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研究论文 | 本研究分析了PPP4C对肺腺癌预后、免疫微环境和免疫治疗反应的影响 | 提出了一个基于PPP4C水平的预后框架，能够有效预测肺腺癌患者的预后以及免疫治疗的有效性 | 对PPP4C如何影响特定免疫细胞类型的执行机制的研究仍然不够深入 | 探讨PPP4C在肺腺癌中的角色及其与免疫微环境的相互作用 | 肺腺癌患者的PPP4C表达水平及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序与多组学分析 | WGCNA | RNA测序数据 | LUAD患者样本和相关免疫基因数据集 |
| 10360 | 2024-08-05 |
Matrix Reordering for Noisy Disordered Matrices: Optimality and Computationally Efficient Algorithms
2024-Jan, IEEE transactions on information theory
IF:2.2Q3
DOI:10.1109/tit.2023.3305538
PMID:39036782
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研究论文 | 本文研究了基于噪声无序单调Toeplitz矩阵模型的矩阵重排序问题 | 提出了一种新的多项式时间自适应排序算法，并保证性能改进 | 分析的多项式时间算法的计算复杂度较高，存在一定的局限性 | 探讨矩阵重排序在单细胞生物学和宏基因组学中的应用 | 聚焦于噪声无序的单调Toeplitz矩阵模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | 两个真实的单细胞RNA测序数据集 |