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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptomic profiling identifies therapeutic subpopulations of adipose-derived mesenchymal stromal cells for human keloid management
2026-Mar, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05463-0
PMID:41511717
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，鉴定了脂肪来源间充质基质细胞中具有抑制瘢痕疙瘩形成潜能的治疗性亚群，并在小型猪模型中验证了其疗效 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出脂肪来源间充质基质细胞中能够特异性抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞和角质形成细胞发展的治疗性亚群，并揭示了其通过调控关键枢纽基因（如NOG、IL6、APP、NOTCH1）发挥作用的分子机制 | 研究主要在体外和小型猪模型中进行，尚未在人体临床试验中验证；对ASC亚群抑制瘢痕形成的具体信号通路和长期安全性需进一步探究 | 阐明脂肪来源间充质基质细胞治疗人类瘢痕疙瘩的潜力及其作用机制 | 瘢痕疙瘩成纤维细胞、瘢痕疙瘩角质形成细胞、脂肪来源间充质基质细胞 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 962 | 2026-03-21 |
Advances in the application of spatial transcriptomics in understanding development and disease
2026-Mar, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05470-1
PMID:41511721
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在理解发育和疾病中的应用进展 | 将空间转录组学作为一个总括性术语，区分了组织水平ST和空间解析单细胞转录组学，并整合了多模态数据 | NA | 综述空间转录组学方法学进展及其在发育和临床问题中的应用 | 空间转录组学技术及其在组织空间基因表达分析中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，包括RNA、DNA、ATAC、CUT&Tag和Ribo-seq等多模态测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 963 | 2026-03-21 |
TUSCAN: Tumor segmentation and classification analysis in spatial transcriptomics
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014058
PMID:41843898
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TUSCAN的新型计算方法，用于在空间转录组学数据中识别和分类肿瘤区域 | 提出了一种结合空间转录组学数据和H&E染色图像构建空间拷贝数变异谱的方法，以提高肿瘤区域识别的准确性，并提供了可解释的克隆进化推断 | NA | 提高空间转录组学数据中肿瘤区域识别的准确性 | 肿瘤组织切片 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，H&E染色 | NA | 空间转录组学数据，图像数据 | 多个来自不同平台的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 964 | 2026-03-21 |
Single-cell sequencing reveals unexpected genetic diversity among Bodo spp. flagellates and their bacterial endosymbionts
2026-Mar, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001642
PMID:41848149
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了Bodo属鞭毛虫及其细菌内共生体之间意想不到的遗传多样性 | 首次对未培养的Bodo属鞭毛虫进行单细胞测序，发现了三个潜在新物种，并揭示了宿主与内共生体之间协同进化的多样性模式 | 样本仅来自英国一处淡水地点，样本量较小（7个细胞），可能无法代表全球Bodo属的完整多样性 | 探究自由生活鞭毛虫Bodo属及其内共生体的遗传多样性和物种界定 | Bodo属鞭毛虫及其Holosporales目细菌内共生体 | 微生物基因组学 | NA | 单细胞测序、比较基因组学 | NA | 基因组序列数据 | 7个未培养的Bodo属细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 965 | 2026-03-21 |
The PKA/MBD2 Axis Transcriptionally Represses INPP5A to Modulate PI3K/Akt Signaling and Accelerate Pituitary Tumorigenesis
2026-Mar, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70817
PMID:41857481
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研究论文 | 本研究探讨了INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及分子机制，重点关注其与PI3K/Akt信号通路和表观遗传调控因子MBD2的相互作用 | 揭示了PKA/MBD2轴通过转录抑制INPP5A来调节PI3K/Akt信号通路并加速垂体肿瘤发生的新机制 | 研究主要基于体外实验和临床样本分析，缺乏体内动物模型的验证 | 研究INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 肿瘤生物学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞测序、免疫荧光染色、统计分析 | NA | 单细胞测序数据、临床样本数据 | 62例垂体神经内分泌肿瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 966 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen-specific monocyte heterogeneity and potential biomarkers in gram-positive versus gram-negative bloodstream infections
2026-Mar-01, World journal of emergency medicine
IF:2.6Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染中病原特异性的单细胞异质性，并鉴定了潜在的生物标志物 | 首次在单细胞水平上系统比较了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染对宿主单核细胞转录组的特异性影响，并发现了S100A12与降钙素原联合作为鉴别诊断生物标志物的潜力 | 单细胞测序样本量较小（仅4名患者），临床验证队列规模有限，需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 阐明革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染在单细胞水平的宿主免疫反应差异，并寻找鉴别诊断的生物标志物 | 健康志愿者、革兰氏阴性菌血流感染脓毒症患者、革兰氏阳性菌血流感染脓毒症患者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 血流感染/脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 单细胞测序：4名患者（2名GNB-BSI，2名GPC-BSI）+健康志愿者；临床验证：85名患者（45名GNB-BSI，40名GPC-BSI） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 967 | 2026-03-21 |
scDock: streamlining drug discovery targeting cell-cell communication via scRNA-seq analysis and molecular docking
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag103
PMID:41769845
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研究论文 | 本文介绍了scDock，一个集成的用户友好流程，用于通过scRNA-seq分析和分子对接简化针对细胞间通讯的药物发现 | scDock通过单一配置文件无缝连接scRNA-seq数据处理、细胞间通讯推断和基于分子对接的药物发现，为通讯靶向药物发现提供了一个可访问的端到端解决方案 | NA | 简化针对细胞间通讯网络的药物发现过程 | 单细胞RNA测序数据和分子对接 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，分子对接 | NA | scRNA-seq数据，蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 968 | 2026-03-21 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
|
研究论文 | 本文提出了一种基于物理模型的方法CellRefiner，通过整合单细胞数据集与配对的空间数据集，在空间数据中重建单细胞分辨率 | CellRefiner首次将细胞建模为通过力连接的粒子，并利用空间邻近约束、基因表达相似性和细胞间配体-受体相互作用优化细胞位置，从而从非单细胞分辨率空间数据中重建单细胞分辨率 | NA | 开发一种方法以从空间转录组数据中重建单细胞分辨率，以支持需要个体细胞分辨率和空间信息的下游分析 | 空间转录组数据，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集，以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 物理模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多种模拟和真实数据集，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | NA |
| 969 | 2026-03-21 |
The splenic norepinephrine-β2-adrenergic receptor axis aggravates sepsis-associated acute kidney injury via neutrophil-mediated immunosuppression
2026-Feb-20, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.024
PMID:41724376
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研究论文 | 本研究揭示了脾脏去甲肾上腺素-β2-肾上腺素能受体轴通过中性粒细胞介导的免疫抑制加剧脓毒症相关急性肾损伤的机制 | 首次明确了脾脏神经免疫调节在脓毒症相关急性肾损伤中的具体作用机制，特别是NE/β2-AR信号通过cAMP反应元件结合蛋白途径增强中性粒细胞前列腺素E2合成，从而抑制Th1细胞活化的新通路 | 研究主要基于小鼠盲肠结扎穿孔模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究集中在脾脏局部，全身性神经免疫相互作用的贡献未充分探讨 | 阐明脾脏神经免疫调节在脓毒症相关急性肾损伤发生发展中的作用机制 | 小鼠（包括脾神经切断、脾内持续输注、中性粒细胞特异性Adrb2敲除等模型） | 免疫学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 970 | 2026-03-21 |
Chronic inflammation promotes gastric cancer progression via ADAM10-mediated cleavage of CX3CL1
2026-Feb-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39743-6
PMID:41691064
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研究论文 | 本研究探讨了慢性炎症通过ADAM10介导的CX3CL1切割促进胃癌进展的分子机制 | 揭示了慢性炎症通过上调ADAM10表达，将膜结合型CX3CL1转化为可溶性形式，从而激活ADAM10/CX3CL1轴促进胃癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠皮下异种移植模型和体外细胞实验，缺乏更接近人体生理环境的体内模型验证 | 探究慢性炎症对胃癌进展的影响及其分子机制 | 胃癌细胞、615品系小鼠、胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、ELISA、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光染色 | 小鼠皮下异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型、胃癌细胞系和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 971 | 2026-03-21 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03994-3
PMID:41673899
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法，用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 | PreTSA在保持与现有先进方法结果一致的同时，显著减少了计算时间，为研究超大规模数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 | NA | 开发一种计算高效的方法来建模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 | 单细胞和空间转录组数据，包含数百万个细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 972 | 2026-03-21 |
Development and validation of an oxidative phosphorylation based prognostic model revealing tumor progression and immune microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-Feb-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04478-3
PMID:41670771
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于氧化磷酸化的预后模型，用于揭示肺腺癌的肿瘤进展和免疫微环境 | 首次构建了基于氧化磷酸化相关基因的预后模型，并揭示了UQCC3⁺和RAB5IF⁺上皮细胞通过TGF-β和Galectin信号通路促进恶性增殖和免疫抑制的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌的预后模型并探索氧化磷酸化在肿瘤进展中的作用机制 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集作为发现队列，多个GEO数据集作为独立验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 973 | 2026-02-13 |
Spatial transcriptomics and single-cell analyses reveal the role of the cisplatin-resistant gene panel in NSCLC progression and the tumor microenvironment, identifying LOXL2 as a potential therapeutic target
2026-Feb-11, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04170-0
PMID:41673658
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 974 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07256-w
PMID:41673792
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了重组细粒棘球绦虫P29蛋白缓解小鼠过敏性哮喘气道炎症的免疫机制 | 首次使用单细胞转录组测序结合实验方法探究rEg.P29在过敏性哮喘中的免疫调节作用，并识别了新的Treg细胞亚群Lag3+Tnfrsf9+ Treg | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本，且机制细节需进一步验证 | 探究rEg.P29如何缓解过敏性哮喘小鼠的气道炎症及其免疫机制 | 过敏性哮喘小鼠模型 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞转录组测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 细胞因子微球阵列 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 流式细胞数据, 血清学数据 | 小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 975 | 2026-03-21 |
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-Feb-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07835-6
PMID:41673874
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了TCF21-WNT5A轴通过基质-肿瘤细胞通讯驱动结直肠癌转移的分子机制 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，系统性地识别了与结直肠癌肝转移相关的12个关键基因，并阐明了TCF21通过调控WNT5A促进转移的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据和细胞系实验，缺乏大规模临床队列验证和体内功能实验的深入证实 | 解析结直肠癌肝转移的分子机制，寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌组织（正常组织、原发肿瘤、转移灶）和HCT116细胞系 | 计算生物学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, Bulk RNA-seq, 机器学习 | 机器学习（未指定具体模型） | 基因表达数据 | 从GEO数据库收集的scRNA-seq和Bulk RNA-seq数据，以及临床样本和HCT116细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 976 | 2026-02-11 |
Mitochondrial DNA methylation predicts immunotherapy response and prognosis in lung adenocarcinoma: evidence from scRNA-Seq and machine learning
2026-Feb-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15648-5
PMID:41663976
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 977 | 2026-03-21 |
Mapping Whole-Organism Genetic Comorbidities Across Model Species Using Unified Ontologies
2026-Feb-10, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
|
研究论文 | 本文提出了一种基于统一本体的计算方法，用于分析与非梗阻性无精子症（NOA）相关基因的全生物体共病模式，并揭示其跨物种的遗传共病机制 | 开发了一个整合新生殖表型本体与标准化全身表型类别的统一跨物种表型结构框架，支持直接跨物种比较，并创建了CoMorbidity DataBase Mapper（CoMo DBM）资源 | 研究依赖于模型生物数据库中的基因型-表型关联数据，可能受数据完整性和准确性限制，且跨物种映射可能忽略物种特异性差异 | 识别非梗阻性无精子症（NOA）基因的全生物体共病模式，并探索其跨物种的遗传共病机制 | 204个经实验验证的小鼠精子发生失败基因，及其在人类、小鼠、斑马鱼、果蝇和线虫中的直系同源基因和表型注释 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA-seq，基因本体注释，跨物种表型映射 | NA | 基因型-表型关联数据，基因表达数据 | 204个小鼠基因及其跨物种直系同源基因 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 978 | 2026-03-21 |
DANST enables cell-type deconvolution in spatial transcriptomics using deep domain adversarial neural networks
2026-Feb-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09659-y
PMID:41663685
|
研究论文 | 本研究提出了一个基于深度域对抗神经网络的细胞类型反卷积框架DANST，用于从空间转录组学数据中恢复细胞类型比例 | 首次将深度域对抗神经网络应用于空间转录组学反卷积，通过变分自编码器学习精细特征表示，并利用域对抗架构对齐伪空间数据与真实数据的特征分布 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发高精度的空间转录组学细胞类型反卷积方法 | 人类和小鼠的空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境分析 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | 深度域对抗神经网络，变分自编码器（VAE） | 基因表达数据，空间坐标数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 979 | 2026-03-21 |
Hepatic stellate cell derived lipid droplets drive protumoral M2 macrophage polarization in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04626-9
PMID:41663693
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研究论文 | 本研究揭示了在慢性肝损伤中，活化的肝星状细胞通过释放脂滴被肝巨噬细胞内吞，诱导其M2极化，从而促进肝细胞癌发展的新机制 | 首次发现活化的肝星状细胞释放的脂滴可作为直接代谢信号诱导肝巨噬细胞M2极化，并促进肝细胞癌生长，提出了一种新的HSC-巨噬细胞串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床相关性仅通过TCGA数据库分析验证，缺乏直接的患者样本功能验证 | 探究肝星状细胞脂滴在慢性肝损伤中的命运及其对肝巨噬细胞表型和肝细胞癌发展的影响 | 肝星状细胞、肝巨噬细胞、肝细胞癌 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、透射电子显微镜、流式细胞术、梯度离心、TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据、图像数据、临床数据 | C57BL/6小鼠（慢性肝损伤模型）、TCGA-LIHC队列患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 980 | 2026-03-21 |
Ex vivo long-term expansion of human hematopoietic stem and progenitor cells as a tool for modeling vector integration sites and clonality
2026-Feb-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07700-6
PMID:41654907
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研究论文 | 本研究开发了一种利用小分子APU（A83-01、pomalidomide和UM171）在体外长期扩增人类造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的方法，旨在通过整合位点分析（ISA）评估逆转录病毒载体（RVs）的基因毒性风险，并模拟基因治疗中的克隆性动态 | 首次利用APU小分子组合实现人类HSPCs的体外长期扩增和培养，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和异种移植研究，建立了一种新型的体外模型来预测插入突变和克隆性变化，为基因治疗的安全性评估提供了新工具 | 研究主要基于脐带血来源的HSPCs，可能不适用于其他来源的干细胞；体外模型与体内环境的差异可能影响结果的直接转化；样本量相对有限，需要进一步验证 | 评估基因治疗中逆转录病毒载体的基因毒性风险，开发一种基于人类HSPCs的体外模型来预测插入突变和克隆性动态 | 人类造血干细胞和祖细胞（HSPCs），特别是脐带血来源的CD34+CD38-CD45RA-CD90+EPCR+细胞 | 基因治疗与干细胞研究 | 单基因疾病（如通过基因治疗治疗的疾病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、整合位点分析（ISA）、异种移植研究 | 体外细胞培养模型 | 单细胞RNA测序数据、整合位点分析数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及脐带血来源的HSPCs和异种移植小鼠的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |