单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9141 - 9160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9141 | 2024-08-30 |
Identifying tumor cells at the single-cell level using machine learning
2022-05-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02683-1
PMID:35637521
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研究论文 | 本文提出了一种名为ikarus的机器学习管道，用于在单细胞水平上区分肿瘤细胞和正常细胞 | ikarus能够在多个实验环境中实现高灵敏度和特异性 | NA | 旨在解决单细胞或空间测序实验中肿瘤细胞的识别问题 | 肿瘤细胞和正常细胞的区分 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习管道 | 单细胞数据集 | 多个单细胞数据集 |
| 9142 | 2024-08-30 |
Modern venomics-Current insights, novel methods, and future perspectives in biological and applied animal venom research
2022-05-18, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giac048
PMID:35640874
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综述 | 本文综述了现代毒液学领域的最新进展和新策略，探讨了技术革新和多组学方法如何显著提升对有毒动物毒液的研究 | 文章介绍了CRISPR和敲降技术在研究基因组及其修饰中的应用，以及质谱成像与空间转录组学、原位杂交技术和现代计算机断层扫描技术在毒液系统空间分布和功能研究中的应用 | NA | 探讨毒液成分的进化、功能及其在不同发育阶段的生物学意义，以及毒液在农业化学、制药、治疗和诊断等领域的应用 | 有毒动物的毒液及其成分 | 生物学 | NA | CRISPR, 质谱成像, 空间转录组学, 原位杂交技术, 计算机断层扫描 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质 | NA |
| 9143 | 2024-08-30 |
Distinct phenotypic states and spatial distribution of CD8+ T cell clonotypes in human brain metastases
2022-05-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100620
PMID:35584630
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研究论文 | 本文分析了人脑转移瘤中CD8+ T细胞克隆型的不同表型状态和空间分布 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了增殖和耗竭的CD8 T细胞之间存在显著的克隆重叠，但与其他肿瘤浸润CD8 T细胞和循环中的CD8 T细胞克隆重叠最小 | NA | 研究脑转移瘤中CD8 T细胞的表型状态和空间分布，以探索针对脑转移瘤的免疫治疗新靶点 | 人脑转移瘤中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA | NA |
| 9144 | 2024-08-30 |
Single-cell transcriptomics reveals age-resistant maintenance of cell identities, stem cell compartments and differentiation trajectories in long-lived naked mole-rats skin
2022-05-04, Aging
DOI:10.18632/aging.204054
PMID:35507806
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了裸鼹鼠皮肤在长寿过程中细胞身份、干细胞区室和分化轨迹的年龄抵抗性维持 | 研究发现裸鼹鼠皮肤在衰老过程中保持了细胞类型和皮肤区室的稳定性，干细胞数量恒定，且表皮基因表达未随年龄变化 | NA | 探讨裸鼹鼠皮肤在长寿过程中的细胞和遗传特征 | 裸鼹鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年裸鼹鼠 |
| 9145 | 2024-08-30 |
Microfluidic cell sorter sample preparation for genomic assays
2022-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0092358
PMID:35698630
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研究论文 | 本文探讨了微流控细胞分选技术在基因组测序样本准备中的应用 | 介绍了NanoCellect Biomedical开发的WOLF Cell Sorter和WOLF G2微流控细胞分选器，这些设备使用温和的分选技术，兼容多种RNA测序平台 | 传统的液滴式分选器存在操作复杂、可访问性差以及可能对细胞造成压力的问题 | 研究如何通过微流控分选技术提高单细胞转录组学的样本质量 | 单细胞RNA测序样本的准备和细胞分选技术 | NA | NA | 微流控技术，RNA测序 | NA | 细胞 | 未具体说明 |
| 9146 | 2024-08-30 |
Spatial transcriptomic analysis reveals inflammatory foci defined by senescent cells in the white matter, hippocampi and cortical grey matter in the aged mouse brain
2022-04, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-022-00521-7
PMID:35098444
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研究论文 | 本文通过空间转录组学方法分析了老年小鼠大脑中细胞衰老的空间分布及其与神经炎症的关系 | 首次使用空间转录组学技术，结合组织学信息，精确地定位了老年小鼠大脑中包含衰老细胞的微域，并分析了这些区域的基因表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性和可靠性 | 探讨衰老细胞在大脑中的空间分布及其与年龄相关认知衰退的关系 | 老年C57BL/6小鼠的大脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | mRNA表达数据 | 3个月和28个月大的C57BL/6小鼠各若干只 |
| 9147 | 2024-08-30 |
Vemurafenib acts as a molecular on-off switch governing systemic inflammation in Langerhans cell histiocytosis
2022-02-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005442
PMID:34619771
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研究论文 | 本文报道了一名Langerhans细胞组织细胞增生症（LCH）患者在接受vemurafenib和挽救性化疗联合治疗后，实现了持续的临床和分子缓解的全面分析 | 研究发现vemurafenib能快速、高效但可逆地抑制系统性炎症的临床表现，并且炎症细胞因子的血清水平与vemurafenib的使用完全一致 | NA | 探讨vemurafenib在LCH治疗中的作用及其对系统性炎症的影响 | LCH患者及其细胞类型 | NA | Langerhans细胞组织细胞增生症 | 单细胞转录组分析 | NA | 血液和骨髓细胞 | 一名LCH患者 |
| 9148 | 2024-08-30 |
Glycan Profiling by Sequencing to Uncover Multicellular Communication: Launching Glycobiology in Single Cells and Microbiomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.919168
PMID:35712658
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGR-seq的新技术，用于在单细胞水平上同时分析糖类和RNA，并将其应用于异质细胞群和微生物群的表面糖类分析 | 首次开发了一种能够在单细胞水平上分析糖组的技术，通过使用DNA条形码凝集素将糖信息转化为基因信息，从而实现糖类和RNA的同时分析 | NA | 探索糖类在细胞间和细胞与微生物间通信中的功能，扩展糖生物学到单细胞和微生物群水平 | 单细胞和微生物群中的糖类 | 生物技术 | NA | scGR-seq | NA | 糖类和RNA | 异质细胞群和微生物群中的单个细胞 |
| 9149 | 2024-08-30 |
Myocardial-Treg Crosstalk: How to Tame a Wolf
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914033
PMID:35693830
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综述 | 本文综述了心肌梗死（MI）后心肌调节T细胞（Tregs）在组织修复和局部炎症控制中的核心作用 | 讨论了心肌微环境如何通过塑造肌球蛋白特异性T细胞向调节表型发展，从而控制潜在的自体攻击性局部免疫反应 | NA | 探讨心肌梗死后免疫系统如何通过Tregs协调组织修复和控制炎症反应 | 心肌调节T细胞（Tregs）及其在心肌梗死修复中的作用 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学和T细胞受体分析 | NA | 图像 | 使用转基因小鼠模型进行研究 |
| 9150 | 2024-08-08 |
Identifying In Vitro Cultured Human Hepatocytes Markers with Machine Learning Methods Based on Single-Cell RNA-Seq Data
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.916309
PMID:35706505
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和机器学习方法，识别体外培养的人肝细胞在不同分化时期的标志物 | 本研究通过先进的计算分析方法，解决了肝细胞分化过程中的异质性问题，并挖掘了不同分化时期的生物标志物 | NA | 阐明肝细胞发育的过程和机制，为细胞移植相关的肝病治疗策略提供潜在目标 | 体外培养的人肝细胞及其分化过程中的标志物 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林、k-最近邻、决策树 | 转录组数据 | 一批压缩和有效的分类特征 |
| 9151 | 2024-08-29 |
RNA-binding protein AZGP1 inhibits epithelial cell proliferation by regulating the genes of alternative splicing in COPD
2024-Nov-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148736
PMID:38950687
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研究论文 | 研究探讨了RNA结合蛋白AZGP1通过调控选择性剪接基因在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中抑制上皮细胞增殖的作用 | 首次揭示了AZGP1在COPD中通过调控选择性剪接事件影响上皮细胞增殖和粘附的新机制 | 研究主要基于单细胞转录组测序和批量RNA测序数据，未进行体内外实验验证 | 探究RNA结合蛋白在COPD中的作用及其对上皮细胞增殖的调控机制 | RNA结合蛋白AZGP1及其在COPD中的表达和功能 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 使用了两组数据集：GSE173896（单细胞RNA测序）和GSE124180（批量RNA测序） |
| 9152 | 2024-08-29 |
Analysis of single-cell transcriptome data from a mouse model implicates protein synthesis dysfunction in schizophrenia
2024-Sep, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01545-3
PMID:39083157
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序数据分析了Setd1a±敲除小鼠模型中基因表达的变化，以揭示精神分裂症的发病机制 | 首次在单细胞水平上分析了Setd1a±敲除小鼠模型中与精神分裂症相关的基因表达变化，并识别了关键的生物学途径，如蛋白质合成和EIF2信号传导途径 | 研究仅限于Setd1a±敲除小鼠模型，结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证 | 探讨精神分裂症的发病机制，特别是基因表达变化和相关生物学途径 | Setd1a±敲除小鼠的前额叶皮质和纹状体中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 前额叶皮质和纹状体中共识别了273个独特的差异表达基因（DEGs）和675个包含差异转录使用的基因峰（DTU） |
| 9153 | 2024-08-29 |
Function of unconventional T cells in oral lichen planus revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01912-6
PMID:39073597
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔扁平苔藓中非典型T细胞的功能和分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了口腔扁平苔藓中单个细胞的特征，并揭示了非典型T细胞在疾病中的独特应激反应状态 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术探索口腔扁平苔藓中非典型T细胞的分子特征 | 口腔扁平苔藓患者的颊黏膜样本和健康个体的颊黏膜样本 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 口腔扁平苔藓患者和健康个体的颊黏膜样本 |
| 9154 | 2024-08-29 |
Distinct granzyme k expression in immune cells: a single-cell rna-seq meta-analysis
2024-Sep, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01555-1
PMID:39115674
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序元分析，探讨了GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序元分析揭示了GZMK在不同免疫细胞和组织中的独特表达调控机制 | NA | 揭示GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 | GZMK在不同免疫细胞类型中的表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及成熟T细胞、NK细胞、B细胞和NKT细胞等多种免疫细胞类型 |
| 9155 | 2024-08-29 |
Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer
2024-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108989
PMID:39142223
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，建立了一个与癌症相关成纤维细胞（CAFs）相关的miRNA模型，用于评估前列腺癌的预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选 | 首次通过单细胞转录组学分析，确定了89个与CAFs相关的mRNAs，并建立了一个基于9个CAFs相关miRNA的预后模型，用于预测前列腺癌的生化复发 | 研究主要基于数据库中的数据进行分析，未涉及大规模的临床试验验证 | 建立一个与CAFs相关的miRNA模型，用于个性化和精准治疗前列腺腺癌患者 | 前列腺癌相关成纤维细胞（CAFs）及其相关的miRNAs | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（buRNA-seq） | 支持向量机（SVM） | RNA测序数据 | 34名前列腺癌患者 |
| 9156 | 2024-08-29 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文报道了一种通过吸入方式递送干细胞衍生的外泌体（SCENT）促进心肌梗死后心脏修复的非侵入性和可重复方法 | 首次提出通过吸入方式递送外泌体进行心脏修复，并使用单细胞RNA测序探索其作用机制 | 研究主要在动物模型中进行，临床应用的可行性和安全性需要进一步验证 | 验证SCENT治疗急性心肌梗死损伤的可行性、有效性和安全性，并探索其作用机制 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | C57BL/6小鼠和猪的心肌梗死模型 |
| 9157 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA-sequencing Analysis Reveals the Promoting Role of the Hedgehog Pathway in Epithelial Cells during Cervical Cancer Progression
2024-Aug-26, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨了Hedgehog通路在宫颈癌进展中对上皮细胞的促进作用 | 发现了Hedgehog通路在STYK1+和TP73+上皮细胞亚型中的异常激活，并揭示了其在宫颈癌上皮细胞增殖和病毒过程中的作用 | NA | 全面分析Hedgehog通路在宫颈癌上皮细胞中的激活机制及其对肿瘤进展的影响 | 宫颈癌上皮细胞中的Hedgehog通路 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 9种主要细胞亚群 |
| 9158 | 2024-08-29 |
Comprehensive Analysis and Experimental Validation of TLL2 as a Potential New Prognostic Biomarker Associated with Immune Infiltration in Lung Adenocarcinoma
2024-Aug-26, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究全面分析并实验验证了TLL2作为肺腺癌中与免疫浸润相关的潜在新型预后生物标志物 | 首次详细探讨了TLL2在肺腺癌中的表达与免疫浸润、肿瘤干细胞指数及药物敏感性的关联 | NA | 旨在深入分析TLL2在肺腺癌中的功能及其作为预后标志物的潜力 | TLL2在肺腺癌中的表达及其与临床症状、预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 实时定量PCR | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA数据库中的数据以及GSE87340和细胞系样本 |
| 9159 | 2024-08-29 |
Endothelial cell heterogeneity in colorectal cancer: tip cells drive angiogenesis
2024-Aug-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05411-z
PMID:39172168
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研究论文 | 本研究旨在揭示结直肠癌（CRC）中内皮细胞（ECs）的异质性及其在血管生成中的关键作用，特别是尖端细胞的作用 | 通过单细胞RNA测序分析ECs，发现CRC中的ECs主要表现为增强的血管生成和减少的抗原呈递，这种表型转变主要由尖端细胞驱动 | NA | 揭示结直肠癌中内皮细胞的异质性及其在血管生成中的作用 | 结直肠癌中的内皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 9160 | 2024-08-29 |
Dual nature of type I interferon responses and feedback regulations by SOCS1 dictate malaria mortality
2024-Aug-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.027
PMID:39181199
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析、流式细胞术和数学建模，探讨了I型干扰素（IFN-I）在对抗疟原虫感染中的双重作用及其调控机制。 | 首次采用比较方法，利用两种疟原虫模型研究IFN-I反应的潜在机制，并揭示了SOCS1在IFN-α/β动态中的作用。 | NA | 探讨I型干扰素在疟疾感染中的作用及其调控机制。 | I型干扰素（IFN-I）在疟原虫感染中的作用及其调控机制。 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序分析（scRNA-seq）、流式细胞术 | 数学模型 | RNA | 涉及P. yoelii 17XL和P. berghei ANKA两种疟原虫模型 |