单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9081 - 9100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9081 | 2024-08-31 |
Multimodal analysis unveils tumor microenvironment heterogeneity linked to immune activity and evasion
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110529
PMID:39161957
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研究论文 | 本文通过系统生物学方法，从肺癌转录组数据中提取肿瘤微环境（TME）异质性的特征，并探讨其在不同癌症中的保守性及其与抗肿瘤免疫的关系。 | 首次提出名为iHet的特征，该特征能够预测癌症免疫治疗的效果，并通过单细胞和空间转录组数据分析其细胞起源。 | NA | 研究肿瘤微环境的异质性及其在免疫治疗中的作用。 | 肺癌及其他癌症的肿瘤微环境异质性。 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9082 | 2024-08-31 |
Activation of limbal epithelial proliferation is partly controlled by the ACE2-LCN2 pathway
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110534
PMID:39175771
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研究论文 | 本文探讨了角膜损伤后角膜上皮干细胞及其直接后代早期过渡放大（eTA）细胞的激活机制，特别是ACE2-LCN2通路在其中的作用 | 首次揭示了ACE2在角膜上皮细胞增殖中的作用及其通过TGFA/EGFR/LCN2通路的调控机制 | NA | 研究角膜损伤后角膜上皮干细胞和eTA细胞激活的调控机制 | 角膜上皮干细胞和eTA细胞的增殖机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 9083 | 2024-08-31 |
Personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma: a non-randomized phase 1 trial
2024-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50880-2
PMID:39128904
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研究论文 | 本研究探讨了在未治疗的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中使用个性化新抗原疫苗作为早期干预的效果 | 首次在人类中使用新抗原DNA疫苗治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤，并观察到稳定的疾病进展和激活的骨髓T细胞克隆 | 研究为非随机第一阶段试验，样本量较小，且未涉及标准疗法的比较 | 评估个性化新抗原疫苗在淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 九名无症状的淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 九名患者 |
| 9084 | 2024-08-31 |
bHLH transcription factors cooperate with chromatin remodelers to regulate cell fate decisions during Arabidopsis stomatal development
2024-Aug, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002770
PMID:39150946
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研究论文 | 本文研究了bHLH转录因子与染色质重塑因子在拟南芥气孔发育中的细胞命运决策中的协同作用 | 本文通过scRNA-seq和ChIP-seq数据分析，揭示了气孔发育中转录调控的不同阶段，并提出了bHLH转录因子和染色质重塑因子共同调控转录和染色质重塑的模型 | NA | 探讨转录因子、顺式调控元件和表观基因组在细胞命运承诺中的协同调控机制 | 拟南芥叶表皮中的气孔发育 | 分子生物学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq | bHLH转录因子, SWI/SNF染色质重塑复合体, 组蛋白乙酰转移酶HAC1 | 基因组数据 | NA |
| 9085 | 2024-08-31 |
Soma-germline communication drives sex maintenance in the Drosophila testis
2024-Aug, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae215
PMID:39183747
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了果蝇睾丸中体细胞与生殖细胞间通讯在性别维持中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术，详细解析了体细胞中Chinmo蛋白在性别决定和胰岛素信号通路中的直接调控作用 | 研究主要集中在果蝇睾丸模型中，可能需要进一步在其他物种中验证相关机制 | 探讨体细胞信号如何调控生殖细胞以实现正常的配子发生 | 果蝇睾丸中的体细胞和生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CUT&Tag | NA | RNA | 多个果蝇睾丸样本 |
| 9086 | 2024-08-31 |
Multiomics unveils extracellular vesicle-driven mechanisms of endothelial communication in human carotid atherosclerosis
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.21.599781
PMID:38979218
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研究论文 | 本文研究了外周血管疾病中的细胞间通信机制，特别是通过外泌体在颈动脉粥样硬化中的作用 | 首次综合分析了外泌体在颈动脉粥样硬化中的多组学特征，揭示了其在疾病进展中的复杂通信网络和功能影响 | 研究样本量相对较小，且仅限于颈动脉粥样硬化的特定阶段 | 探讨外泌体在颈动脉粥样硬化中的细胞间通信机制及其对疾病进展的影响 | 颈动脉粥样硬化患者的外泌体及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 全转录组miRNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | RNA测序数据和蛋白质组学数据 | 症状性患者16例，无症状患者13例 |
| 9087 | 2024-08-31 |
Negative selection allows human primary fibroblasts to tolerate high somatic mutation loads induced by N-ethyl-N-nitrosourea
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.07.588286
PMID:38617356
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研究论文 | 本文研究了人类原代成纤维细胞在N-乙基-N-亚硝基脲（ENU）诱导的高体细胞突变负荷下的耐受性 | 首次揭示了单个细胞能够承受约60,000个单核苷酸变异（SNVs）而仅轻微影响生长速率，并证明了这种高突变水平仅通过基因编码区域和维持基本细胞功能及生长的遗传途径中的负选择来耐受 | 研究仅限于人类原代成纤维细胞，未涉及其他组织类型 | 探讨细胞在衰老过程中积累的突变负荷对功能的影响 | 人类原代成纤维细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 多个低剂量ENU处理的细胞样本 |
| 9088 | 2024-08-31 |
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids reveal tubular epithelial pathobiology of heterozygous HNF1B-associated dysplastic kidney malformations
2024-Jun-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.04.011
PMID:38788724
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研究论文 | 研究使用CRISPR-Cas9基因编辑的人胚胎干细胞和诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官，揭示了HNF1B杂合突变相关的肾发育不良的病理生物学机制 | 首次揭示了HNF1B在人类肾小管分化和形态发生中的形态学、分子和生理学作用，以及其在突变HNF1B导致的肾脏疾病发展中的起源 | NA | 理解HNF1B杂合突变导致的肾发育不良的病理生物学机制 | HNF1B杂合突变的人胚胎干细胞和诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾发育不良 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自HNF1B相关肾发育不良家族的细胞 |
| 9089 | 2024-08-31 |
Characterizing enteric neurons in dopamine transporter (DAT)-Cre reporter mice reveals dopaminergic subtypes with dual-transmitter content
2024-May, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16307
PMID:38487941
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研究论文 | 本研究利用报告鼠系对肠道中的多巴胺能神经元进行了全面表征，揭示了具有双重递质含量的多巴胺能亚型。 | 本研究首次在肠道神经系统中发现了一种新型多巴胺能神经元群体，这些神经元同时表达胆碱乙酰转移酶和多巴胺转运体。 | 需要进一步研究以定义这些多巴胺能肠道神经元的功能特征及其在疾病中的作用。 | 旨在全面表征肠道中的多巴胺能神经元，并揭示其亚型和功能。 | 肠道神经系统中的多巴胺能神经元及其亚型。 | 神经科学 | NA | 免疫荧光、单细胞转录组学、原位杂交 | NA | 图像 | 使用多巴胺转运体报告鼠系进行研究 |
| 9090 | 2024-08-31 |
Involvement of microglia-expressed MS4A6A in the onset of glioblastoma
2024-May, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16309
PMID:38488530
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研究论文 | 本文探讨了微胶质细胞表达的MS4A6A在胶质母细胞瘤发病中的作用 | 首次揭示了MS4A6A在胶质母细胞瘤中的表达及其对肿瘤细胞增殖和迁移的影响 | 尚未阐明MS4A6A参与胶质母细胞瘤调控的具体机制 | 研究MS4A6A在胶质母细胞瘤中的作用及其作为潜在生物标志物的可能性 | 胶质母细胞瘤患者样本及微胶质细胞中的MS4A6A表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胶质母细胞瘤患者样本 |
| 9091 | 2024-08-31 |
Opto-combinatorial indexing enables high-content transcriptomics by linking cell images and transcriptomes
2024-04-16, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00866e
PMID:38506394
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研究论文 | 本文介绍了一种将细胞表型行为与单细胞RNA测序（scRNA-seq）相结合的集成分析方法，通过利用细胞的光学指数和凝胶珠的组合实现 | 该方法通过联合颜色编码将传统落射荧光显微镜测得的光学组合与细胞-凝胶珠对创建的DNA分子条形码相匹配，实现了细胞图像与scRNA-seq的准确链接 | NA | 旨在开发一种新的方法，将细胞表型与单细胞转录组学数据关联起来 | 细胞表型行为与单细胞RNA测序数据的关联 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像和文本 | 涉及多种浓度紫杉醇处理的HeLa细胞 |
| 9092 | 2024-08-31 |
Reversal of tamoxifen resistance by artemisinin in ER+ breast cancer: bioinformatics analysis and experimental validation
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.047257
PMID:38827320
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了青蒿素逆转雌激素受体阳性乳腺癌中他莫昔芬耐药性的机制 | 本研究首次通过生物信息学分析和实验验证，揭示了青蒿素逆转他莫昔芬耐药性的潜在机制 | 研究中未详细说明所使用的五个特征基因和七个药物-疾病交叉基因的具体信息 | 探索青蒿素逆转他莫昔芬在雌激素受体阳性乳腺癌中的耐药性 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞及他莫昔芬耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | WGCNA交叉分析, scRNA-seq分析, 分子目标对接 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 9093 | 2024-08-31 |
Single-cell RNA sequencing of nc886, a non-coding RNA transcribed by RNA polymerase III, with a primer spike-in strategy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0301562
PMID:39190696
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研究论文 | 本研究开发了一种针对nc886的单细胞RNA测序方法，通过引入特定的oligo-tagged nc886引物，实现了对RNA聚合酶III转录的非编码RNA的测序 | 首次采用引物混合策略，成功捕获并测序了RNA聚合酶III转录的非编码RNA nc886，为单细胞水平上非编码RNA的研究提供了新方法 | 引物混合策略在目标特异性方面存在局限，需要通过后续的序列验证来确保基因表达计数的准确性 | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，用于研究RNA聚合酶III转录的非编码RNA | nc886作为RNA聚合酶III转录的非编码RNA的代表 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种细胞系，分别表达高、低和零水平的nc886 |
| 9094 | 2024-08-31 |
The significance of CD16+ monocytes in the occurrence and development of chronic thromboembolic pulmonary hypertension: insights from single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1446710
PMID:39192976
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨CD16+单核细胞在慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）发生发展中的作用及其分子特征 | 首次系统研究了CTEPH患者中单核细胞亚群的分布、基因表达谱及分化轨迹，揭示了CD16+单核细胞在肺动脉血栓形成和内膜重塑中的重要作用 | NA | 揭示CTEPH患者中单核细胞的特征和功能，为CTEPH的诊断和治疗提供新见解 | CTEPH患者的外周血单个核细胞（PBMCs）及肺动脉内膜切除术（PEA）后的组织 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 健康对照、CTEPH患者及CTEPH患者肺动脉内膜切除术后的组织样本 |
| 9095 | 2024-08-31 |
Identification and validation of Rab GTPases RAB13 as biomarkers for peritoneal metastasis and immune cell infiltration in colorectal cancer patients
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1403008
PMID:39192986
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研究论文 | 本研究旨在识别和验证Rab GTPases RAB13作为结直肠癌患者腹膜转移和免疫细胞浸润的生物标志物 | 首次探讨了RAB13在结直肠癌腹膜转移中的作用及其与免疫细胞浸润的关系 | NA | 确定与结直肠癌腹膜转移相关的生物标志物及其与免疫细胞浸润的关系 | 结直肠癌患者的腹膜转移和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 使用了公共数据库中的结直肠癌组织样本 |
| 9096 | 2024-08-31 |
Antigen-specific CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph node and blood following vaccination in humans
2023-Sep-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3304466/v1
PMID:37790414
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研究论文 | 本研究评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中刺突特异性CD4 T细胞的单细胞转录组学特征 | 本研究定义了新的克隆型，并使用基于深度学习的反向表位映射方法Trex来预测抗原特异性 | NA | 研究SARS-CoV-2感染和mRNA疫苗接种诱导的CD4 T细胞反应及其在保护性免疫中的作用 | 人类血液和引流淋巴结中的刺突特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | 深度学习 | 转录组数据 | 多个刺突特异性CD4 T细胞克隆型 |
| 9097 | 2024-08-31 |
Connecting past and present: single-cell lineage tracing
2022-11, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-022-00913-7
PMID:35441356
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review | 本文综述了单细胞谱系追踪技术的发展，主要特点，应用以及技术考虑和局限性 | 利用克隆分析和单细胞RNA测序技术，单细胞谱系追踪提供了新的机会来探究细胞状态和谱系历史 | 尽管上述策略已在动物发育和干细胞研究中得到证明，但实施这些方法仍需谨慎和努力 | 描绘细胞的历史、状态和命运是现代生物学的基本目标 | 单细胞的谱系追踪 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 9098 | 2024-08-31 |
Single-cell transcriptomics reveals conserved cell identities and fibrogenic phenotypes in zebrafish and human liver
2022-07, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1930
PMID:35315595
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，比较了斑马鱼和人类肝脏中的细胞类型和纤维化表型，揭示了两者之间的高度保守性。 | 首次建立了成年斑马鱼肝脏的单细胞转录组图谱，并发现了斑马鱼肝星状细胞的新型保守标记物colec11。 | NA | 旨在通过单细胞转录组测序技术，评估成年斑马鱼肝脏作为研究肝纤维化模型的有效性。 | 成年斑马鱼和人类肝脏的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 9099 | 2024-08-31 |
An introduction to spatial transcriptomics for biomedical research
2022-06-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01075-1
PMID:35761361
|
review | 本文介绍了空间转录组学的方法，包括记录杂交mRNA分子位置、细胞位置成像以及使用空间阵列mRNA探针等，并讨论了组织保存对平台选择的影响以及生物信息学方法在分析空间转录组数据中的应用 | 介绍了多种商业可用的空间转录组学平台，并讨论了它们在发现筛选和假设检验中的适用性 | NA | 旨在为希望在其生物医学研究中使用空间转录组学的研究人员提供入门级指导 | 空间转录组学方法及其在生物医学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因转录数据 | NA |
| 9100 | 2024-08-31 |
scDART: integrating unmatched scRNA-seq and scATAC-seq data and learning cross-modality relationship simultaneously
2022-06-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02706-x
PMID:35761403
|
研究论文 | 提出了一种名为scDART的深度学习框架，用于整合不匹配的scRNA-seq和scATAC-seq数据，并同时学习跨模态关系 | scDART框架能够保留连续细胞群体中的细胞轨迹，并可应用于整合数据上的轨迹推断 | NA | 整合不同批次的scRNA-seq和scATAC-seq数据，并学习跨模态关系 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习框架 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | NA |