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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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9161 | 2024-08-29 |
Exploration of bacterial lipopolysaccharide-related genes signature based on T cells for predicting prognosis in colorectal cancer
2024-Aug-06, Aging
DOI:10.18632/aging.206041
PMID:39115879
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研究论文 | 本研究通过分析细菌脂多糖(LPS)相关基因与免疫细胞的关系,探索了基于T细胞的LPS相关基因特征,用于预测结直肠癌(CRC)的预后 | 首次建立了基于T细胞的LPS相关基因风险特征,用于预测CRC的预后和免疫治疗效果 | 研究受限于技术手段,对微生物在CRC中的影响尚未完全理解 | 探索新的生物标志物,用于预测结直肠癌的预后 | 结直肠癌(CRC)的预后和免疫治疗 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | TCGA-COAD队列和GSE39582队列 |
9162 | 2024-08-29 |
NNMT switches the proangiogenic phenotype of cancer-associated fibroblasts via epigenetically regulating ETS2/VEGFA axis
2024-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03112-2
PMID:39069579
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研究论文 | 本研究探讨了尼古丁酰胺N'-甲基转移酶(NNMT)通过表观遗传调控ETS2/VEGFA轴在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中促进血管生成的机制 | 首次揭示了NNMT在癌症相关成纤维细胞(CAFs)中通过表观遗传重编程ETS2-VEGFA信号轴促进血管生成的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序和临床样本分析,未来需更多体内外实验验证 | 阐明NNMT在OSCC中促进血管生成的表观遗传分子调控网络 | NNMT在癌症相关成纤维细胞中的作用及机制 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个临床样本 |
9163 | 2024-08-29 |
Egr1 regulates regenerative senescence and cardiac repair
2024-Aug, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00493-1
PMID:39196027
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,揭示了成年小鼠心脏中再生性衰老的多组学特征,并探讨了其在新生小鼠心脏再生和成年小鼠心脏修复中的作用 | 首次报道了Egr1作为再生性衰老的调控因子,并揭示了其在新生和成年小鼠心脏再生中的具体作用机制 | NA | 探讨再生性衰老在心脏再生中的分子特征和功能益处 | 成年和新生小鼠心脏 | NA | 心血管疾病 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质, RNA | 成年和新生小鼠心脏样本 |
9164 | 2024-08-29 |
APOE-NOTCH axis governs elastogenesis during human cardiac valve remodeling
2024-Aug, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00510-3
PMID:39196035
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类胎儿心脏瓣膜,揭示了APOE-NOTCH轴在瓣膜重塑过程中弹性蛋白生成的调控作用 | 首次发现APOE在胎儿心脏瓣膜间质细胞中调控弹性蛋白生成,并通过NOTCH2信号通路介导这一过程 | 研究主要集中在胎儿瓣膜,未来需进一步探讨在成人瓣膜中的作用 | 探讨APOE和NOTCH在人类心脏瓣膜重塑中调控弹性蛋白生成的机制 | 人类胎儿心脏瓣膜间质细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类胎儿心脏瓣膜的单细胞RNA测序数据 |
9165 | 2024-08-29 |
Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Jul-31, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01263-1
PMID:39085925
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法,比较了薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的细胞异常情况 | 首次系统地研究了薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的分子特征、细胞相互作用和结构变化 | 需要进一步的研究来验证这些发现并将其转化为临床应用 | 阐明薄型和正常厚度子宫内膜在反复植入失败中的差异 | 反复植入失败患者和生育能力正常个体的子宫内膜 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | TE-RIF组3人,NE-RIF组2人,对照组3人 |
9166 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA-Seq analysis reveals cell subsets and gene signatures associated with rheumatoid arthritis disease activity
2024-Jul-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178499
PMID:38954480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析外周血单个核细胞,揭示了与类风湿性关节炎疾病活动相关的细胞亚群和细胞类型特异性基因特征 | 本研究首次揭示了IFN诱导的跨膜3过表达的IFN激活单核细胞亚群,并观察到疾病活动水平不同的患者中特定细胞亚群的变化 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术,识别与类风湿性关节炎疾病活动相关的细胞亚群和基因特征 | 外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36名个体(18名类风湿性关节炎患者和18名匹配的对照组) |
9167 | 2024-08-29 |
Machine learning for the identification of neoantigen-reactive CD8 + T cells in gastrointestinal cancer using single-cell sequencing
2024-Jul, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02737-0
PMID:38849478
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术,开发了一种基于26个基因的机器学习模型,用于识别胃肠道癌症中的新抗原反应性CD8+ T细胞。 | 本文创新性地利用机器学习模型快速识别新抗原反应性T细胞及其对应的T细胞受体,加速了新抗原反应性T细胞的治疗应用。 | NA | 开发一种快速识别胃肠道癌症中新抗原反应性CD8+ T细胞的方法。 | 胃肠道癌症中的新抗原反应性CD8+ T细胞及其T细胞受体。 | 机器学习 | 胃肠道癌症 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 数千个肿瘤浸润淋巴细胞 |
9168 | 2024-08-29 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Dysregulated POSTN+WNT5A+ Fibroblast Subclusters in Prurigo Nodularis
2024-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.021
PMID:38246584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了28,695个病灶和非病灶性痒疹结节(PN)细胞,揭示了PN中失调的POSTN+WNT5A+成纤维细胞亚群 | 首次揭示了PN中POSTN+WNT5A+成纤维细胞亚群的失调,并发现其与癌症相关成纤维细胞的关联 | NA | 探究痒疹结节(PN)的发病机制 | 痒疹结节(PN)中的成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,695个病灶和非病灶性PN细胞 |
9169 | 2024-08-29 |
SLC45A3 Serves as a Potential Therapeutic Biomarker to Attenuate White Matter Injury After Intracerebral Hemorrhage
2024-Jun, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-023-01145-5
PMID:36913120
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析和单细胞RNA测序,确定SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中的作用,并验证其作为治疗靶点的潜力。 | 首次确定SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中的关键作用,并提出其作为治疗靶点的可能性。 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨脑出血后白质损伤的分子机制及潜在治疗靶点。 | 脑出血后的白质损伤及SLC45A3基因的功能。 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、扩散张量成像 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE24265和GSE125512)及单细胞RNA测序数据(GSE167593) |
9170 | 2024-08-29 |
Human Pluripotent Stem Cells Derived Endothelial Cells Repair Choroidal Ischemia
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202302940
PMID:38115754
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研究论文 | 本文研究了从人多能干细胞衍生的内皮细胞修复脉络膜缺血的能力 | 首次证明了人多能干细胞衍生的内皮细胞能够整合到脉络膜血管中,并改善动物模型的视觉功能 | NA | 探索人多能干细胞衍生的内皮细胞在修复脉络膜缺血中的应用 | 人多能干细胞衍生的内皮细胞及其在脉络膜缺血修复中的作用 | NA | 年龄相关性黄斑变性,视网膜色素变性,病理性近视 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 涉及大鼠模型 |
9171 | 2024-08-29 |
Unbiased Single-Cell Sequencing of Hematopoietic and Immune Cells from Aplastic Anemia Reveals the Contributors of Hematopoiesis Failure and Dysfunctional Immune Regulation
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304539
PMID:38145351
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研究论文 | 本研究通过无偏差的单细胞RNA测序技术,构建了再生障碍性贫血患者的细胞图谱和微环境相互作用,揭示了造血功能衰竭和免疫调节功能障碍的贡献者。 | 发现了新的KIR CD8调节性T细胞亚群,并揭示了其参与免疫稳态的机制,以及铁死亡在造血干细胞破坏中的作用。 | NA | 揭示再生障碍性贫血的造血功能衰竭和免疫调节功能障碍的机制。 | 再生障碍性贫血患者的造血和免疫细胞。 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA |
9172 | 2024-08-29 |
Targeting the cGAS-STING Pathway Inhibits Peripheral T-cell Lymphoma Progression and Enhances the Chemotherapeutic Efficacy
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306092
PMID:38145335
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研究论文 | 本研究探讨了cGAS-STING通路在周围T细胞淋巴瘤(PTCL)进展中的作用及其机制 | 发现cGAS抑制剂能抑制肿瘤生长并损害DNA损伤修复,CLK1抑制能增强对cGAS抑制剂的敏感性 | NA | 研究cGAS-STING通路在PTCL中的作用,以优化治疗策略 | 周围T细胞淋巴瘤(PTCL) | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
9173 | 2024-08-29 |
Highly Accurate Estimation of Cell Type Abundance in Bulk Tissues Based on Single-Cell Reference and Domain Adaptive Matching
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306329
PMID:38072669
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCROAM的新型计算方法,用于基于单细胞参考和域自适应匹配,准确估计大量组织中的细胞类型丰度 | SCROAM方法通过将单细胞和大量RNA测序数据转换到共享特征空间,有效消除了潜在空间中的分布差异,从而提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 旨在提高对复杂组织细胞组成的识别准确性,以更好地理解疾病发病机制、早期诊断和预防 | 单细胞和大量RNA测序数据,以及小鼠脊髓组织 | 数字病理学 | 肝癌,胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及小鼠脊髓组织和多种癌症组织 |
9174 | 2024-08-29 |
Targeting YAP1-regulated Glycolysis in Fibroblast-Like Synoviocytes Impairs Macrophage Infiltration to Ameliorate Diabetic Osteoarthritis Progression
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304617
PMID:38044289
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨糖尿病性骨关节炎中滑膜细胞的组成,发现纤维母细胞样滑膜细胞中YAP1调控的糖酵解增加是导致滑膜巨噬细胞浸润和极化的关键因素,并开发了一种新型纳米粒子治疗策略。 | 首次揭示YAP1/TXNIP信号轴在纤维母细胞样滑膜细胞中调控糖酵解的作用,并开发了一种针对糖尿病性骨关节炎的新型治疗策略。 | NA | 探讨糖尿病性骨关节炎中免疫细胞与纤维母细胞样滑膜细胞的相互作用及其在疾病进展中的作用。 | 糖尿病性骨关节炎患者的滑膜细胞及纤维母细胞样滑膜细胞。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及糖尿病性骨关节炎患者的滑膜细胞及db/db糖尿病骨关节炎小鼠模型。 |
9175 | 2024-08-29 |
Pan-Cancer Single-Nucleus Total RNA Sequencing Using snHH-Seq
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304755
PMID:38010945
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研究论文 | 本文开发了一种名为snHH-seq的高通量和高灵敏度方法,用于对临床冷冻样本中的单个细胞核进行总RNA测序,并应用于多种肿瘤类型的研究。 | snHH-seq方法结合了随机引物和预索引策略,能够在单个细胞核水平上检测总RNA,为肿瘤异质性研究提供了新的工具。 | NA | 研究肿瘤异质性及其对肿瘤进展和癌症治疗的影响。 | 单个细胞核中的总RNA。 | 数字病理学 | 多种肿瘤类型 | snHH-seq | NA | RNA序列数据 | 超过730,000个单个细胞核,来自32名不同肿瘤类型的患者 |
9176 | 2024-08-29 |
Deciphering Immune Landscape Remodeling Unravels the Underlying Mechanism for Synchronized Muscle and Bone Aging
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304084
PMID:38088531
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人体肌肉和骨骼的衰老相关转录动力学,揭示了脂质相关巨噬细胞(TREM2 Macs)在肌肉和骨骼衰老中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了TREM2 Macs在肌肉和骨骼同步衰老中的保守作用,并阐明了其通过CD6-ALCAM信号通路调节SPP1表达的机制。 | 研究仅限于人体肌肉和骨骼的单细胞RNA测序分析,未涉及其他组织或动物模型。 | 探究肌肉和骨骼同步衰老的潜在机制。 | 人体肌肉和骨骼的衰老过程及其相关细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人体肌肉和骨骼样本 |
9177 | 2024-08-29 |
Single-Cell Atlas of Human Ovaries Reveals The Role Of The Pyroptotic Macrophage in Ovarian Aging
2024-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305175
PMID:38036420
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同生育年龄的人类卵巢,揭示了随着年龄增长,卵巢中巨噬细胞的焦亡途径激活增加,从而影响卵巢的免疫微环境,加速生殖功能衰退。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类卵巢衰老过程中巨噬细胞焦亡途径的激活及其对免疫微环境的影响。 | 研究主要基于细胞和动物实验,未来需要更多临床数据验证这些发现。 | 探索人类卵巢衰老过程中细胞和分子层面的变化及其机制。 | 人类卵巢中的巨噬细胞及其焦亡途径。 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 不同生育年龄的人类卵巢样本 |
9178 | 2024-08-29 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Regulatory Dynamics in Developing Cotton Anthers
2024-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304017
PMID:37974530
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研究论文 | 本研究建立了棉花花药的第一个单细胞转录组图谱和染色质可及性调查,揭示了花药中不同细胞类型的特异性表达和表观遗传景观,并探讨了高温应激对花药细胞的异质性响应。 | 首次在棉花花药中建立了单细胞转录组图谱和染色质可及性调查,重建了减数分裂细胞、绒毡层细胞和中层细胞的发育轨迹,并揭示了高温应激下花药细胞的异质性响应。 | NA | 研究花药发育过程中的空间表达图谱和调控动态,以及高温应激下的响应机制。 | 棉花花药中的不同细胞类型及其在高温应激下的响应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
9179 | 2024-08-29 |
SPASCER: spatial transcriptomics annotation at single-cell resolution
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac889
PMID:36243975
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研究论文 | 本文构建了一个名为SPASCER的新型空间转录组数据库,旨在帮助理解组织结构的异质性、区域特异性微环境及跨组织结构的多层次细胞间相互作用 | SPASCER数据库整合了来自43项研究的1082个子数据集,涵盖四种物种的16种器官类型,并结合scRNA-seq数据进行空间转录组的解卷积/映射,以及空间细胞间相互作用、基因模式和通路富集分析 | NA | 研究目的是通过构建SPASCER数据库,深入理解健康和疾病组织中的生物学过程机制 | 研究对象包括组织结构异质性、区域特异性微环境及细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 43项研究的1082个子数据集,涵盖16种器官类型,涉及四种物种 |
9180 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA sequencing unravels heterogeneity of skeletal progenitors and cell-cell interactions underlying the bone repair process
2022-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2022.05.001
PMID:35619947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了骨骼前体细胞在骨修复过程中的异质性和细胞间相互作用 | 首次在单细胞分辨率下描述了多潜能骨骼前体细胞及其分化方向,并识别了Ccl9信号通路作为骨再生的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 深入理解骨骼前体细胞在骨修复过程中的行为及其分子机制 | 骨骼前体细胞及其在骨修复中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用Sox9-CreERT2;R26R tdTomato小鼠模型进行线粒体追踪和单细胞RNA测序分析 |