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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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9061 | 2024-09-01 |
Microglia Phenotypes in Aging and Neurodegenerative Diseases
2022-06-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132091
PMID:35805174
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综述 | 本文综述了在健康、衰老和神经退行性疾病中微胶质细胞表型和炎症反应的当前研究 | 强调了微胶质细胞在急性和慢性疾病中的异质性表型反应,并探讨了潜在的治疗靶点 | NA | 全面概述微胶质细胞在不同病理状态下的表型和炎症反应 | 微胶质细胞在健康、衰老和神经退行性疾病中的表型和炎症反应 | NA | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA |
9062 | 2024-09-01 |
Bookend: precise transcript reconstruction with end-guided assembly
2022-06-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02700-3
PMID:35768836
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研究论文 | 开发了Bookend软件包,用于结合不同RNA-seq技术数据的转录本组装,特别关注RNA的5'和3'端识别与利用 | Bookend通过利用端标记读取数据,显著提高了单细胞中转录本组装的精确度,并展示了跨短读、长读和端捕获RNA-seq数据集的混合组装能力 | NA | 旨在提高转录本组装的精确度,并探索不同RNA-seq技术数据的整合应用 | RNA-seq数据中的转录本组装,特别是RNA的5'和3'端识别 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 序列数据 | 涉及拟南芥和单个小鼠胚胎干细胞的RNA-seq数据集 |
9063 | 2024-09-01 |
TAS-Seq is a robust and sensitive amplification method for bead-based scRNA-seq
2022-06-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03536-0
PMID:35760847
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研究论文 | 本文介绍了一种基于终止子、末端转移酶和纳米孔/珠基平台的单细胞RNA测序方法TAS-Seq,该方法在鼠和人类肺样本中显示出比10X Chromium v2和Smart-seq2更高的基因检测灵敏度和更稳健的细胞间相互作用及生长因子/白细胞介素表达检测 | TAS-Seq方法对末端转移酶反应的变化具有高度耐受性,提高了单细胞RNA测序数据的准确性和细胞组成的分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法,以提高细胞组成的准确性和细胞间相互作用的检测 | 鼠和人类肺样本的单细胞RNA测序 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠和人类肺样本 |
9064 | 2024-09-01 |
The immune cell atlas of human neuroblastoma
2022-06-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100657
PMID:35688160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学技术,分析了19个人类神经母细胞瘤样本的免疫细胞组成,并与正常胎儿肾上腺数据进行比较 | 本研究揭示了神经母细胞瘤中27种免疫细胞亚型,并发现与成人癌症和先前研究不同,神经母细胞瘤中炎症性单核细胞状态增加,而T细胞的细胞毒性和耗竭评分以及Treg活性没有差异 | NA | 旨在理解人类神经母细胞瘤的完整免疫细胞组成,为开发免疫治疗提供依据 | 人类神经母细胞瘤的免疫细胞组成 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19个人类神经母细胞瘤样本 |
9065 | 2024-09-01 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived treatment of severe pulmonary arterial hypertension
2022-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00083-z
PMID:39195868
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研究论文 | 本文报道了人脐带间充质干细胞(HUCMSC)衍生的治疗方法在肺动脉高压(PAH)中的应用 | 首次使用HUCMSC的条件培养基(CM)进行连续血管内输注治疗PAH,并展示了其显著的临床和血流动力学改善效果 | 需要进一步的前瞻性临床研究来确认和探索HUCMSC衍生治疗对PAH的益处 | 探索HUCMSC衍生治疗在PAH中的应用及其潜在机制 | HUCMSC的条件培养基(CM)及其在PAH治疗中的效果 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及三个人脐带间充质干细胞(HUCMSC)和两个人脐带静脉内皮细胞(HUVEC)的控制样本 |
9066 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA sequencing in silent corticotroph tumors confirms impaired POMC processing and provides new insights into their invasive behavior
2022-May-12, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1530/EJE-21-1183
PMID:35521707
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了静默性和活性皮质垂体瘤的细胞组成和转录组,揭示了POMC加工缺陷及其侵袭行为的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术深入研究了静默性皮质垂体瘤中POMC加工缺陷和侵袭行为的分子机制 | NA | 探究静默性皮质垂体瘤中POMC加工缺陷和侵袭行为的分子机制 | 静默性和活性皮质垂体瘤的细胞组成和转录组 | 数字病理学 | 垂体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
9067 | 2024-09-01 |
Spatial mapping of protein composition and tissue organization: a primer for multiplexed antibody-based imaging
2022-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01316-y
PMID:34811556
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perspective | 本文探讨了多重抗体成像技术在组织蛋白质组成和结构组织空间映射中的应用 | 介绍了多重蛋白成像方法的最新进展,这些方法能够提供复杂组织的空间和功能详细图谱 | 目前的方法主要依赖于单细胞测序,缺乏理解细胞间通信和相关结构组织所需的空间背景 | 旨在为多重抗体成像技术提供必要的资源和关键考虑,以促进其广泛应用和数据标准化 | 组织和器官中的细胞类型及其在生理功能中的协同作用 | NA | NA | 多重蛋白成像 | NA | 图像 | NA |
9068 | 2024-09-01 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Changes of Tumor Immune Microenvironment in Oral Squamous Cell Carcinoma After Chemotherapy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.914120
PMID:35784460
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research paper | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤免疫微环境的变化 | 本研究首次在单细胞转录组水平揭示了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤微环境的特征 | NA | 研究化疗对口腔鳞状细胞癌中肿瘤细胞和肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌化疗后的肿瘤微环境 | digital pathology | 口腔癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
9069 | 2024-09-01 |
Applications and Achievements of Single-Cell Sequencing in Gastrointestinal Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.905571
PMID:35785171
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用及其最新进展 | 单细胞测序技术提供了比大规模测序技术更准确的数据,能够解析细胞和分子层面的单细胞分辨率特征 | NA | 探讨单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用 | 胃肠癌的来源、异质性、微环境信息以及诊断和治疗方法 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA |
9070 | 2024-09-01 |
Progress and Prospect of Immunotherapy for Triple-Negative Breast Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.919072
PMID:35795050
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌(TNBC)免疫治疗的进展和前景 | 介绍了基于免疫分子疗法、溶瘤病毒疗法和过继免疫细胞转移疗法等多种新型免疫治疗方法 | 目前免疫治疗在乳腺癌患者中的总体反应不强,且存在一系列挑战和机遇 | 探讨三阴性乳腺癌免疫治疗的新发现、临床试验结果及未来发展方向 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其免疫治疗策略 | 肿瘤学 | 乳腺癌 | 免疫检查点抑制剂(ICIs)、单细胞测序、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA |
9071 | 2024-09-01 |
Tumor-Infiltrating Regulatory T-cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Is Mediated by IL33/ST2 Signaling
2020-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0828
PMID:32878747
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中肿瘤浸润调节性T细胞(Treg)积累的分子机制,特别是IL33/ST2信号通路的作用 | 首次揭示了IL33/ST2轴在肿瘤微环境中调节性T细胞积累的关键作用,并提出了这一通路作为癌症免疫治疗潜在靶点的可能性 | NA | 阐明肿瘤微环境中调节性T细胞积累的分子机制 | 肿瘤浸润调节性T细胞及其在肿瘤微环境中的积累机制 | 免疫学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 来自同种肿瘤小鼠的肿瘤浸润Treg和脾脏Treg |
9072 | 2024-09-01 |
Development and Arealization of the Cerebral Cortex
2019-09-25, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.07.009
PMID:31557462
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综述 | 本文综述了大脑皮层区域多样性的早期发育过程,包括内在和外在机制,并提出了一个整合模型。 | 引入单细胞转录组学等新兴技术,提供了一个新的视角来理解区域特异性的分子多样性。 | NA | 探讨大脑皮层区域多样性的发育过程及其在神经发育障碍中的潜在应用。 | 大脑皮层的发育过程和区域多样性。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
9073 | 2024-08-31 |
Personalized composite scaffolds for accelerated cell- and growth factor-free craniofacial bone regeneration
2024-Nov, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.029
PMID:39188380
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研究论文 | 本文介绍了一种用于加速颅面骨再生的个性化复合支架系统,该系统采用3D打印技术制造,包含多孔聚二醇柠檬酸-羟基磷灰石复合弹性体和聚二醇柠檬酸-石墨烯氧化物水凝胶复合物。 | 该支架系统通过材料中心的设计,无需细胞和生长因子即可促进骨再生,具有简化的制造过程和临床转化优势。 | NA | 开发一种新型的复合支架系统,用于加速颅面骨的再生。 | 颅面骨的再生 | 生物材料 | 骨骼疾病 | 3D打印 | NA | NA | NA |
9074 | 2024-08-31 |
Bi-functional CpG-STAT3 decoy oligonucleotide triggers multilineage differentiation of acute myeloid leukemia in mice
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102268
PMID:39171140
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研究论文 | 研究通过使用双功能CpG-STAT3诱饵寡核苷酸,触发小鼠急性髓系白血病细胞的多谱系分化 | 本研究揭示了通过STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并展示了双功能寡核苷酸通过同时抑制STAT3和/或DNMT来释放TLR9驱动的白血病细胞分化的免疫治疗潜力 | NA | 阐明STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并探索双功能寡核苷酸在白血病治疗中的应用 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 寡核苷酸技术 | NA | 转录组数据 | 小鼠来源的急性髓系白血病细胞 |
9075 | 2024-08-31 |
A single-cell atlas of the miracidium larva of Schistosoma mansoni reveals cell types, developmental pathways, and tissue architecture
2024-Aug-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95628
PMID:39190022
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序创建了Schistosoma mansoni的miracidium幼虫的全身体细胞图谱,揭示了其细胞类型、发育途径和组织结构 | 首次为miracidium幼虫创建了包含约365个细胞的单细胞图谱,并通过原位杂交和轨迹分析揭示了细胞类型特异性和干细胞的性别偏倚转录特征 | NA | 旨在深入理解miracidium幼虫在细胞和分子水平上的特性 | Schistosoma mansoni的miracidium幼虫 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 约365个细胞 |
9076 | 2024-08-31 |
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome
2024-08-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65345-1
PMID:39191856
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组数据,构建并验证了一个基于急性髓系白血病(AML)肿瘤微环境(TME)的预后评分模型 | 首次基于AML的单细胞转录组数据,构建了一个包含10个关键基因的预后评分模型,用于区分AML患者的高风险和低风险组 | 需要进一步的研究来验证模型在更大样本量和其他数据集上的泛化能力 | 开发一种新的预后评分模型,以帮助预测AML患者的生存率和指导治疗策略 | 急性髓系白血病患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | 预后评分模型 | 转录组数据 | 18,251个单细胞 |
9077 | 2024-08-31 |
Assessment of SWI/SNF chromatin remodeling complex related genes as potential biomarkers and therapeutic targets in pan-cancer
2024-Aug-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02015-w
PMID:39192265
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研究论文 | 本研究全面分析了SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达差异、体细胞突变、潜在生物途径、基质或免疫细胞浸润及药物敏感性,并评估了其在肾透明细胞癌中的进化趋势、预后标志和免疫治疗反应。 | 首次全面分析SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的多方面作用,并构建了肾透明细胞癌的预后标志。 | 研究主要集中在SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因,未涉及其他可能的生物标志物和治疗靶点。 | 探讨SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因作为潜在生物标志物和治疗靶点在泛癌中的作用。 | SWI/SNF染色质重塑复合体相关基因在泛癌中的表达、突变、生物途径、细胞浸润和药物敏感性。 | 数字病理学 | 泛癌 | scRNA-seq, qRT-PCR, CCK-8 assay | NA | 基因表达数据 | 14种肿瘤类型的患者数据 |
9078 | 2024-08-29 |
Correction: Varied cellular abnormalities in thin vs. normal endometrium in recurrent implantation failure by single-cell transcriptomics
2024-Aug-27, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01283-x
PMID:39192335
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
9079 | 2024-08-31 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | 本文介绍了Morphology-Enhanced Spatial Transcriptome Analysis Integrator (METI)框架,该框架通过整合细胞形态学和空间转录组学来深入分析肿瘤生态系统 | METI框架结合了空间转录组学、细胞形态学和精选基因签名,增强了我们对组织内分子景观和细胞相互作用的理解 | NA | 开发和评估一种新的分析工具METI,用于改善肿瘤微环境研究中的细胞类型和状态的分层以及细胞共定位分析 | 胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 | 数字病理学 | 胃癌, 肺癌, 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因数据 | 多种肿瘤组织样本,包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织 |
9080 | 2024-08-31 |
The interferon/STAT1 signaling axis is a common feature of tumor-initiating cells in breast cancer
2024-Aug-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557958
PMID:37745510
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研究论文 | 本文研究了干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用 | 开发了一种新的STAT响应性谱系追踪系统,并结合原有的报告基因,揭示了STAT信号在肿瘤起始细胞中的作用 | 研究仅限于某些基底样三阴性乳腺癌异种移植模型 | 探讨干扰素/STAT1信号轴在乳腺癌肿瘤起始细胞中的作用及其潜在的治疗意义 | 乳腺癌肿瘤起始细胞及其相关的信号通路 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括异种移植模型和临床样本 |