单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 8821 - 8840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8821 | 2024-09-08 |
SpaceX: gene co-expression network estimation for spatial transcriptomics
2022-11-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac645
PMID:36179087
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研究论文 | 开发了一种用于空间转录组学的统计框架SpaceX，用于检测空间结构组织中的基因共表达模式 | 提出了SpaceX方法，结合空间泊松模型和高维因子模型，能够识别共享和集群特异性共表达网络，并提高了计算效率 | NA | 增强空间转录组技术在生物发现中的能力和潜力 | 空间结构组织中的基因共表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间泊松模型和高维因子模型 | 贝叶斯方法 | 转录组数据 | 小鼠下丘脑和人类乳腺癌的空间转录组数据 |
| 8822 | 2024-09-08 |
Multi-omic analyses of changes in the tumor microenvironment of pancreatic adenocarcinoma following neoadjuvant treatment with anti-PD-1 therapy
2022-11-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.10.001
PMID:36306792
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研究论文 | 研究了抗PD-1疗法在新辅助治疗后胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的多组学变化 | 揭示了GVAX疫苗与nivolumab联合治疗后肿瘤微环境中的免疫调节机制，特别是T细胞和肿瘤相关中性粒细胞的变化 | 研究样本量较小，且仅限于特定的治疗组合 | 探讨抗PD-1疗法在新辅助治疗后胰腺导管腺癌中的免疫反应机制 | 胰腺导管腺癌患者在接受GVAX疫苗与nivolumab联合治疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多组学分析 | NA | RNA序列 | 前后的配对样本 |
| 8823 | 2024-09-08 |
SRSF10 is essential for progenitor spermatogonia expansion by regulating alternative splicing
2022-Nov-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78211
PMID:36355419
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研究论文 | 研究了SRSF10在调节选择性剪接中的作用，及其对精原细胞扩展和男性生育能力的影响 | 首次揭示了SRSF10在精原细胞扩展中的关键作用，并通过选择性剪接调控这一过程 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨选择性剪接在精子发生中的作用 | SRSF10基因及其在精原细胞扩展中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 8824 | 2024-09-08 |
Cellular Heterogeneity and Molecular Reprogramming of the Host Response during Influenza Acute Lung Injury
2022-11-09, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01246-22
PMID:36286482
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了流感病毒感染引起的急性肺损伤中宿主反应的细胞异质性和分子重编程 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了流感病毒感染引起的急性肺损伤中宿主反应的细胞异质性和分子重编程机制 | 尚未完全阐明流感病毒感染引起的急性肺损伤的病理免疫机制 | 探讨流感病毒感染引起的急性肺损伤中宿主反应的细胞和分子机制 | 流感病毒感染引起的急性肺损伤中的宿主反应 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8825 | 2024-09-08 |
The memory B cell response to influenza vaccination is impaired in older persons
2022-11-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111613
PMID:36351385
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研究论文 | 研究探讨了老年人接种流感疫苗后记忆B细胞反应的年龄相关性变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术追踪流感疫苗接种后记忆B细胞的反应，并发现年轻人在接种后产生具有FcRL5“非典型”表型的记忆B细胞，而老年人的反应较弱 | 研究样本量较小，仅包括20名健康成年人 | 探讨年龄对流感疫苗接种后记忆B细胞反应的影响 | 记忆B细胞对流感疫苗的反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20名健康成年人 |
| 8826 | 2024-09-08 |
Deep autoencoder for interpretable tissue-adaptive deconvolution and cell-type-specific gene analysis
2022-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34550-9
PMID:36347853
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TAPE的深度学习方法，用于组织适应性解卷积和细胞类型特异性基因分析 | TAPE通过连接批量RNA测序和单细胞RNA测序，实现了快速且精确的解卷积，并能预测细胞类型特异性基因表达 | NA | 开发一种新的深度学习方法，用于提高单细胞RNA测序数据的解卷积精度和速度 | 单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA测序 | 深度自编码器 | RNA测序数据 | NA |
| 8827 | 2024-09-08 |
Single-cell technologies: From research to application
2022-Nov-08, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2022.100342
PMID:36353677
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综述 | 本文综述了单细胞技术的发展及其在多个领域的应用，并展望了未来的研究方向 | 本文介绍了基于人工智能的大数据分析方法在单细胞研究中的应用，并探讨了空间转录组学和单细胞多组学的潜力 | NA | 综述单细胞技术的发展及其应用，并展望未来的研究方向 | 单细胞技术及其在肿瘤学、辅助生殖、胚胎发育和植物育种等领域的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞技术 | NA | 单细胞组学数据 | NA |
| 8828 | 2024-09-08 |
Characterization of BCMA Expression in Circulating Rare Single Cells of Patients with Plasma Cell Neoplasms
2022-Nov-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113427
PMID:36362214
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研究论文 | 开发并验证了一种基于玻片的免疫荧光检测方法，用于检测和量化浆细胞肿瘤患者血液中表达BCMA的细胞 | 首次验证了BCMA在循环肿瘤细胞中的表达，并开发了一种无需富集的液体活检方法用于早期疾病检测和治疗反应监测 | 研究样本量较小，仅涉及9名患者 | 验证BCMA在循环肿瘤细胞中的表达，并开发一种新的检测方法用于早期疾病检测和治疗反应监测 | 浆细胞肿瘤患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 免疫荧光检测 | NA | 细胞 | 9名浆细胞肿瘤患者 |
| 8829 | 2024-09-08 |
FastRNA: An efficient solution for PCA of single-cell RNA-sequencing data based on a batch-accounting count model
2022-11-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2022.09.008
PMID:36206757
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FastRNA的高效解决方案，用于基于批次和细胞大小因子计数模型的单细胞RNA测序数据的主成分分析 | FastRNA方法在处理大规模数据时比其他基于计数的方法快两个数量级，比标准对数归一化快一个数量级，并且完全避免了在内存中形成大型密集残差矩阵 | NA | 开发一种高效的方法来处理单细胞RNA测序数据的主成分分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | PCA | 计数数据 | 200万细胞 |
| 8830 | 2024-09-08 |
Spatial Positioning and Matrix Programs of Cancer-Associated Fibroblasts Promote T-cell Exclusion in Human Lung Tumors
2022-11-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-1714
PMID:36027053
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研究论文 | 本文研究了癌症相关成纤维细胞（CAF）在人类肺肿瘤中促进T细胞排除的空间定位和基质程序 | 本文通过单细胞RNA测序结合多重成像技术，揭示了两种与T细胞排除相关的CAF亚群及其独特的分子程序 | NA | 探讨癌症相关成纤维细胞在肺肿瘤中促进T细胞排除的机制 | 癌症相关成纤维细胞（CAF）及其在肺肿瘤中的空间定位和基质程序 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量肺肿瘤样本 |
| 8831 | 2024-09-08 |
Progenitor Hierarchy of Chronic Myelomonocytic Leukemia Identifies Inflammatory Monocytic-Biased Trajectory Linked to Worse Outcomes
2022-11-02, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-21-0217
PMID:36053528
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研究论文 | 研究了慢性粒单核细胞白血病（CMML）中CD34+造血干细胞和祖细胞（HSPC）的分化轨迹，发现单核细胞偏向轨迹与不良预后相关 | 首次使用单细胞RNA测序和高参数流式细胞术揭示了CMML中CD34+ HSPC的三种分化轨迹，并发现单核细胞偏向轨迹与不良预后相关 | 研究主要集中在CMML，未涵盖其他骨髓增生性肿瘤，且治疗策略的探索有限 | 揭示慢性粒单核细胞白血病中CD34+造血干细胞和祖细胞的分化轨迹及其与预后的关系 | 慢性粒单核细胞白血病（CMML）中的CD34+造血干细胞和祖细胞（HSPC） | 血液学 | 白血病 | 单细胞RNA测序、高参数流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 8832 | 2024-09-08 |
Molecular and anatomical characterization of parabrachial neurons and their axonal projections
2022-11-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81868
PMID:36317965
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研究论文 | 本文研究了副神经节核神经元的分子和解剖特征及其轴突投射 | 首次提供了数十个副神经节核神经元亚群的分子身份、空间位置和投射模式的数据库 | 未明确说明不同行为如何由独特的信号分子或受体编码 | 探讨副神经节核神经元的多样性和其在不同行为中的作用 | 副神经节核神经元的亚群及其轴突投射 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多重原位杂交 | NA | 分子数据、空间位置数据、投射模式数据 | 21个Cre驱动小鼠品系 |
| 8833 | 2024-09-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular reprograming landscape of gliomas and lung cancer brain metastases
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1101
PMID:36336787
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质瘤和肺癌脑转移的细胞和分子重编程景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了胶质瘤和肺癌脑转移的肿瘤微环境异质性，并发现了与预后相关的特定细胞亚群和基因特征 | 研究样本量较小，可能影响结果的普适性 | 揭示胶质瘤和肺癌脑转移的细胞和分子重编程特征，为开发针对脑转移的免疫治疗提供理论基础 | 胶质瘤和肺癌脑转移的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个胶质瘤样本和10个肺癌脑转移样本 |
| 8834 | 2024-09-08 |
Excessive IL-10 and IL-18 trigger hemophagocytic lymphohistiocytosis-like hyperinflammation and enhanced myelopoiesis
2022-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.06.017
PMID:35792218
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研究论文 | 研究探讨了IL-10和IL-18在超炎症中的协同作用及其对噬血细胞性淋巴组织细胞增多症样超炎症和增强的髓系生成的影响 | 首次揭示了IL-10和IL-18共同升高足以驱动噬血细胞性淋巴组织细胞增多症样超炎症综合征，并通过IL-10阻断在HLH模型中显示出保护作用 | NA | 研究IL-10和IL-18在超炎症中的协同作用 | 噬血细胞性淋巴组织细胞增多症患者和转基因小鼠模型 | NA | 噬血细胞性淋巴组织细胞增多症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 87名噬血细胞性淋巴组织细胞增多症患者和转基因小鼠模型 |
| 8835 | 2024-09-08 |
Single-cell genomics reveals population structures from in vitro evolutionary studies of Salmonella
2022-09, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.000871
PMID:36125951
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研究论文 | 本文介绍了使用单细胞基因组学方法研究体外进化实验中沙门氏菌群体结构的方法 | 首次将单细胞方法应用于研究进化中的克隆微生物群体，并展示了其在抗生素压力下的抗性和多样性 | NA | 研究沙门氏菌在抗生素压力下的进化和群体结构 | 沙门氏菌的单细胞基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 基因组序列 | 多个单细胞样本 |
| 8836 | 2024-09-08 |
Heparanase Blockade as a Novel Dual-Targeting Therapy for COVID-19
2022-04-13, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-22
PMID:35319225
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研究论文 | 研究评估了肝素酶抑制剂Roneparstat在COVID-19病理和治疗中的作用 | 首次提出肝素酶抑制剂Roneparstat作为COVID-19的双靶点治疗药物，既能减少病毒感染又能抑制炎症反应 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序分析，尚未进行临床试验验证 | 探索肝素酶抑制剂Roneparstat在COVID-19病理中的作用，并验证其作为双靶点治疗药物的潜力 | SARS-CoV-2、SARS-CoV-1、HTLV-1和HIV-1病毒，以及COVID-19患者的肺泡灌洗液细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | COVID-19患者的肺泡灌洗液细胞 |
| 8837 | 2024-09-08 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of aortic valve interstitial cells demonstrates the regulation of integrin signaling by nitric oxide
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.742850
PMID:36386365
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析主动脉瓣间质细胞，揭示了硝酸氧化物通过调节整合素信号通路来预防钙化过程 | 首次描述了硝酸氧化物介导的S-亚硝基化作为预防钙化过程的新机制 | 研究仅限于猪主动脉瓣间质细胞，且需要持续的硝酸氧化物暴露来抑制钙化 | 探讨硝酸氧化物和S-亚硝基化在主动脉瓣钙化中的作用机制 | 主动脉瓣间质细胞和硝酸氧化物 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,247个差异表达基因 |
| 8838 | 2024-09-08 |
Single-cell transcriptomic characterization reveals the landscape of airway remodeling and inflammation in a cynomolgus monkey model of asthma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040442
PMID:36439114
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了哮喘猕猴模型中气道重塑和炎症的细胞图谱 | 发现了新的成纤维细胞亚型，该亚型介导了哮喘肺中的I型炎症反应，并揭示了细胞间相互作用网络在哮喘和气道重塑中的作用 | NA | 研究哮喘猕猴模型中气道重塑和炎症的机制 | 哮喘猕猴模型的肺部组织 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8839 | 2024-09-08 |
Identification of COVID-19 severity biomarkers based on feature selection on single-cell RNA-Seq data of CD8+ T cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1053772
PMID:36437952
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据中的特征选择，识别了CD8+ T细胞中与COVID-19严重程度相关的潜在生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序数据和多种特征选择方法，识别出CD8+ T细胞中与COVID-19严重程度相关的潜在生物标志物 | 研究仅基于三个CD8 T细胞亚型和三种疾病状态的数据，样本量有限 | 探究CD8+ T细胞在COVID-19感染中的免疫调节机制，并识别潜在的严重程度生物标志物 | CD8+ T细胞的单细胞基因表达数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 梯度提升机 | 基因表达数据 | 三个CD8 T细胞亚型（效应T细胞、记忆T细胞和幼稚T细胞），每种亚型包含三种疾病状态（急性COVID-19、康复期COVID-19和未暴露个体） |
| 8840 | 2024-09-08 |
Reprogramming landscape highlighted by dynamic transcriptomes in therapy-induced neuroendocrine differentiation
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.10.031
PMID:36382181
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研究论文 | 本文研究了在药物治疗诱导的神经内分泌分化过程中，动态转录组学揭示的重编程景观 | 通过结合单细胞和批量mRNA测序工作流程，本文首次在时间解析的方式下展示了前列腺癌细胞在AR抑制剂enzalutamide作用下，从上皮形态转变为神经内分泌样形态，并激活了特定的神经内分泌相关转录程序 | 本文主要集中在AR抑制剂诱导的神经内分泌分化过程，未涉及其他治疗方式或不同类型前列腺癌的影响 | 探讨在AR抑制剂治疗下，前列腺癌从AR阳性腺癌向AR阴性神经内分泌前列腺癌转变的分子机制 | 前列腺癌细胞在AR抑制剂治疗下的转录组变化和形态学转变 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序和批量mRNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及17-25%接受AR抑制剂治疗的患者样本 |