单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 8761 - 8780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8761 | 2024-09-10 |
Uncovering the dynamic effects of DEX treatment on lung cancer by integrating bioinformatic inference and multiscale modeling of scRNA-seq and proteomics data
2022-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105999
PMID:35998480
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学推断和多尺度建模，探讨了DEX治疗对肺癌的动态效应 | 创新性地结合了生物信息学和系统生物学方法，开发了多尺度模型来模拟DEX治疗对肺癌细胞的影响，并提供了一个名为BIMM的用户友好工具 | NA | 探讨DEX治疗对肺癌的动态效应及其潜在的临床应用 | 肺癌细胞A549在DEX治疗后的基因表达和蛋白质组学数据 | 生物信息学 | 肺癌 | scRNA-seq, 蛋白质组学 | 多尺度模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 肺癌细胞A549的时间序列数据 |
| 8762 | 2024-09-10 |
DestVI identifies continuums of cell types in spatial transcriptomics data
2022-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01272-8
PMID:35449415
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DestVI的方法，用于在空间转录组数据中识别细胞类型的连续变异 | DestVI通过变分推断解卷积空间转录组数据，能够识别同一类型细胞内的转录组连续变异，优于现有方法 | NA | 开发一种新方法以在空间转录组数据中识别细胞类型的连续变异 | 空间转录组数据中的细胞类型连续变异 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 变分推断 | 转录组数据 | 感染的淋巴结和鼠肿瘤模型中的样本 |
| 8763 | 2024-09-10 |
Immune features of COVID-19 convalescent individuals revealed by a single-cell RNA sequencing
2022-Jul, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.108767
PMID:35453072
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示COVID-19康复者外周血样本中的免疫特征 | 首次系统地绘制了COVID-19康复者外周血样本中SARS-CoV-2特异性免疫反应的表型景观，揭示了T细胞和B细胞在康复过程中的复杂功能 | 研究仅限于外周血样本，未涉及其他组织或器官的免疫反应 | 探讨自然感染后免疫反应的持续性及其对长期免疫保护的重要性 | COVID-19康复者的外周血样本 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | COVID-19康复者的外周血样本 |
| 8764 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8765 | 2024-09-10 |
Single-Cell Transcriptome Identifies Drug-Resistance Signature and Immunosuppressive Microenvironment in Metastatic Small Cell Lung Cancer
2022-Jun, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202100060
PMID:36618022
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了转移性小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 首次揭示了转移性小细胞肺癌在单细胞水平上的异质性，并发现了与药物抗性和免疫抑制相关的基因表达模式 | 研究样本仅来自七名患者，可能无法完全代表所有转移性小细胞肺癌的情况 | 探究转移性小细胞肺癌在单细胞水平上的异质性及其与药物抗性和免疫抑制微环境的关系 | 转移性小细胞肺癌患者的淋巴结样本中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24,081个细胞，来自七名转移性小细胞肺癌患者 |
| 8766 | 2024-09-10 |
Multiomic analysis for optimization of combined focal and immunotherapy protocols in murine pancreatic cancer
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.73218
PMID:36451859
|
研究论文 | 本文研究了在小鼠胰腺癌中结合局部和系统性免疫疗法的优化策略 | 通过多组学分析，结合磁共振引导聚焦超声（MRgFUS）消融和抗体疗法，优化了免疫疗法在小鼠胰腺癌中的应用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 优化结合局部和系统性免疫疗法在胰腺癌中的应用 | 小鼠胰腺癌和乳腺癌模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、光谱流式细胞术、组织学分析 | NA | 基因组数据、细胞数据 | 两个小鼠模型：KPC胰腺腺癌模型和NDL乳腺腺癌模型 |
| 8767 | 2024-09-10 |
Sparcle: assigning transcripts to cells in multiplexed images
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac048
PMID:36699413
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Sparcle的概率模型，用于在多重图像中将转录本分配给细胞 | Sparcle模型基于基因协变模式和空间特征（如到细胞核的距离）重新分配转录本，无需精确的细胞分割，适用于多种技术平台 | NA | 提高空间转录组学中转录本分配的准确性 | 多重图像中的转录本分配 | 计算机视觉 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | 概率模型 | 图像 | NA |
| 8768 | 2024-09-10 |
Single-cell RNA-seq data analysis using graph autoencoders and graph attention networks
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1003711
PMID:36568390
|
研究论文 | 本文开发了一种基于图神经网络的多模态模型scGAEGAT，用于单细胞RNA测序数据分析 | 提出了结合图自编码器和图注意力网络的多模态模型scGAEGAT，用于处理非欧几里得空间数据 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据的基因插补和细胞聚类分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 四个具有金标准细胞标签的单细胞RNA测序数据集 |
| 8769 | 2024-09-10 |
LFSC: A linear fast semi-supervised clustering algorithm that integrates reference-bulk and single-cell transcriptomes
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1068075
PMID:36531230
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为LFSC的线性快速半监督聚类算法，该算法利用参考样本（来自bulk RNA测序数据）来识别单细胞转录组中的细胞类型 | LFSC通过构建锚点图来描述参考样本与细胞之间的关系，并通过应用连接性约束来保留底层聚类结构，其总体复杂度与数据大小呈线性关系，显著提高了有效性和效率 | NA | 研究细胞异质性在疾病中的作用，并开发新的聚类算法来识别复杂组织中的细胞类型 | 单细胞转录组数据和bulk RNA测序数据 | 生物信息学 | 肝癌 | RNA测序 | 聚类算法 | 转录组数据 | NA |
| 8770 | 2024-09-10 |
Single-cell profiling of T cells uncovers a tissue-resident memory-like T-cell subset associated with bidirectional prognosis for B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.957436
PMID:36532049
|
研究论文 | 研究分析了B细胞急性淋巴细胞白血病患者外周血T细胞的单细胞RNA测序数据，发现了一种与双向预后相关的组织驻留记忆样T细胞亚群 | 首次发现了一种在B细胞急性淋巴细胞白血病患者中升高的循环CD103+ T细胞亚群，该亚群具有双向发育潜力，与患者的预后密切相关 | 研究样本量较小，仅包括三名B细胞急性淋巴细胞白血病患者和11名健康对照 | 深入理解T细胞亚型与B细胞急性淋巴细胞白血病患者预后之间的关系 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者的T细胞亚型及其与预后的关系 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三名B细胞急性淋巴细胞白血病患者和11名健康对照，共分析了16,143个B-ALL患者T细胞和53,701个健康成人T细胞 |
| 8771 | 2024-09-10 |
Advances in Single-Cell Sequencing Technology and Its Applications in Triple-Negative Breast Cancer
2022, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S388534
PMID:36540278
|
研究论文 | 本文综述了单细胞测序技术在三阴性乳腺癌中的应用进展 | 单细胞测序技术在三阴性乳腺癌中的应用，揭示了肿瘤细胞的异质性、转移、耐药机制、突变和克隆性 | NA | 探讨单细胞测序技术在三阴性乳腺癌中的应用及其对临床治疗的指导作用 | 三阴性乳腺癌肿瘤细胞 | 生物技术 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 8772 | 2024-09-10 |
Detection of differentially expressed genes in spatial transcriptomics data by spatial analysis of spatial transcriptomics: A novel method based on spatial statistics
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.1086168
PMID:36523429
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为空间转录组学空间分析（saSpatial）的新方法，用于检测空间转录组数据中的差异表达基因 | 提出了一种基于空间统计学的新方法saSpatial，能够同时考虑基因表达的位置和数量信息，相比传统方法FindMarkers，能够检测到更多有价值的差异表达基因 | NA | 开发一种能够有效检测空间转录组数据中差异表达基因的新方法 | 空间转录组数据中的差异表达基因 | 空间转录组学 | 缺血性脑卒中 | 空间统计学 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 8773 | 2024-09-10 |
Single-cell analyses reveal the therapeutic effects of ATHENA and its mechanism in a rhabdomyosarcoma patient
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1039145
PMID:36523982
|
研究论文 | 研究报道了ATHENA疫苗在一名横纹肌肉瘤患者中的治疗效果及其机制 | 开发了一种改进的全细胞肿瘤疫苗ATHENA，并展示了其在横纹肌肉瘤患者中的治疗效果 | 研究样本量较小，仅涉及一名患者 | 探讨ATHENA疫苗在横纹肌肉瘤患者中的治疗效果及其机制 | 一名6岁男性横纹肌肉瘤患者 | NA | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1名患者 |
| 8774 | 2024-09-10 |
Single-cell atlases link macrophages and CD8+ T-cell subpopulations to disease progression and immunotherapy response in urothelial carcinoma
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.77281
PMID:36451860
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了上尿路上皮癌中的免疫细胞亚群及其与免疫治疗反应的关系 | 首次使用单细胞RNA测序研究上尿路上皮癌，并开发了一种新的基因表达特征（Macro-C3评分）来预测免疫治疗反应 | 研究仅限于上尿路上皮癌和膀胱尿路上皮癌，样本量相对较小 | 探讨上尿路上皮癌中免疫细胞亚群与疾病进展及免疫治疗反应的关系 | 上尿路上皮癌患者的手术组织样本 | 数字病理学 | 泌尿系统癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 13个手术组织样本，404个膀胱尿路上皮癌样本，158个上尿路上皮癌样本，348个转移性尿路上皮癌样本 |
| 8775 | 2024-09-10 |
Early IFN-α signatures and persistent dysfunction are distinguishing features of NK cells in severe COVID-19
2021-11-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.09.002
PMID:34592166
|
研究论文 | 研究分析了205名COVID-19患者中自然杀伤细胞（NK细胞）的单细胞转录组和蛋白质组学特征，发现早期严重COVID-19中IFN-α水平升高与NK细胞功能障碍相关 | 首次详细描述了严重COVID-19中NK细胞的早期IFN-α信号特征及其与疾病结果的关联 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的COVID-19病例类型 | 探讨COVID-19中先天免疫系统的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的自然杀伤细胞（NK细胞） | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学和蛋白质组学 | NA | 基因表达数据和蛋白质数据 | 205名患者，403个样本 |
| 8776 | 2024-09-10 |
Protective heterologous T cell immunity in COVID-19 induced by the trivalent MMR and Tdap vaccine antigens
2021-09-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.08.004
PMID:34414383
|
研究论文 | 研究MMR和Tdap疫苗抗原是否通过诱导交叉反应性T细胞来减轻COVID-19的严重程度 | 发现MMR和Tdap疫苗诱导的记忆T细胞可以被SARS-CoV-2重新激活，从而提供对严重COVID-19的保护 | NA | 研究MMR和Tdap疫苗是否通过诱导交叉反应性T细胞来减轻COVID-19的严重程度 | COVID-19康复者、未感染者和COVID-19 mRNA疫苗接种者的T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 酶联免疫吸附试验（ELISA）、酶联免疫斑点试验（ELISpot）、流式细胞术、TCR克隆型分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | T细胞、细胞因子 | COVID-19康复者、未感染者和COVID-19 mRNA疫苗接种者的T细胞样本 |
| 8777 | 2024-09-10 |
A modified vaccinia Ankara vector-based vaccine protects macaques from SARS-CoV-2 infection, immune pathology, and dysfunction in the lungs
2021-03-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.02.001
PMID:33631118
|
研究论文 | 研究了基于改良安卡拉痘苗（MVA）载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护作用 | 首次展示了MVA/S疫苗在非人灵长类动物中诱导强效中和抗体和CD8 T细胞反应，并有效保护免受SARS-CoV-2感染和肺部病理损伤 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，尚未在人类中进行验证 | 评估基于MVA载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护效果 | SARS-CoV-2感染的非人灵长类动物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及小鼠和非人灵长类动物 |
| 8778 | 2024-09-10 |
Embryonic lethality and defective mammary gland development of activator-function impaired conditional knock-in Erbb3 V943R mice
2021-Mar, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.10036
PMID:36618440
|
研究论文 | 研究了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型的胚胎致死性和乳腺发育缺陷 | 首次报道了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型，并研究了其对胚胎发育和乳腺发育的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种的研究 | 研究ERBB3 V943R突变对小鼠胚胎发育和乳腺发育的影响 | ERBB3 V943R条件性敲入小鼠 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个小鼠样本，具体数量未明确 |
| 8779 | 2024-09-09 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
|
研究论文 | 研究树突状细胞（DCs）及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中激活细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）的作用及其对疾病进展的影响 | 揭示了DCs衍生的CXCL10在抑制卵巢癌生长和转移中的关键作用，为卵巢癌治疗提供了潜在的治疗靶点 | NA | 探讨DCs及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中激活CTLs的作用及其对疾病进展的影响 | 树突状细胞（DCs）、细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）、卵巢癌 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫浸润分析 | NA | 基因数据 | NA |
| 8780 | 2024-09-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF/ACKR3 receptor-ligand interaction between neutrophils and nucleus pulposus cells in intervertebral disc degeneration
2024-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.011
PMID:38823438
|
研究论文 | 研究揭示了在椎间盘退变过程中，中性粒细胞与髓核细胞之间的MIF/ACKR3受体-配体相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞与髓核细胞之间的MIF/ACKR3轴在椎间盘退变中的作用 | 研究主要集中在体外和体内实验，缺乏长期临床随访数据 | 揭示椎间盘退变过程中微环境中中性粒细胞的异质性和功能 | 中性粒细胞和髓核细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 71520个单细胞，来自5个对照和9个退变椎间盘样本 |