单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7181 - 7200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7181 | 2025-10-06 |
Observation weights unlock bulk RNA-seq tools for zero inflation and single-cell applications
2018-02-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1406-4
PMID:29478411
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研究论文 | 本文提出一种基于零膨胀负二项模型的加权策略，使传统bulk RNA-seq差异表达分析方法适用于单细胞RNA测序数据 | 开发了基因和细胞特异性权重策略，首次实现将传统bulk RNA-seq工具应用于零膨胀的单细胞RNA测序数据 | NA | 解决单细胞RNA测序中零膨胀导致的差异表达分析能力下降问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7182 | 2025-10-06 |
scNMT-seq enables joint profiling of chromatin accessibility DNA methylation and transcription in single cells
2018-02-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-03149-4
PMID:29472610
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研究论文 | 开发了一种可同时分析单细胞染色质可及性、DNA甲基化和转录组的测序方法 | 首次实现了在单细胞水平上同时分析三种分子层面（染色质可及性、DNA甲基化和转录组）的方法 | NA | 研究表观基因组与转录组之间的调控关系 | 小鼠胚胎干细胞分化过程 | 表观基因组学 | NA | scNMT-seq, GpC甲基转移酶标记, 亚硫酸氢盐测序, RNA测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | scNMT-seq（单细胞核小体、甲基化和转录测序） |
| 7183 | 2025-10-06 |
A molecular atlas of cell types and zonation in the brain vasculature
2018-02-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25739
PMID:29443965
|
研究论文 | 通过血管单细胞转录组学绘制小鼠大脑血管系统的细胞类型和分区图谱 | 首次在分子水平定义大脑血管主要细胞类型，揭示沿动静脉轴的连续表型变化模式，发现内皮细胞与壁细胞的连续模式差异 | 研究仅限于成年小鼠模型，人类血管系统可能存在差异 | 解析大脑血管系统的细胞组成和组织结构 | 成年小鼠大脑血管系统 | 单细胞生物学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 成年小鼠大脑血管细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7184 | 2025-10-06 |
Graded Arrays of Spinal and Supraspinal V2a Interneuron Subtypes Underlie Forelimb and Hindlimb Motor Control
2018-02-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2018.01.023
PMID:29398364
|
研究论文 | 本研究揭示了脊髓V2a中间神经元的分级阵列结构及其在前肢和后肢运动控制中的作用机制 | 首次发现V2a中间神经元存在I型和II型两种主要类型，并呈反向梯度分布，揭示了脊髓不同节段运动输出的特异性处理机制 | 研究主要基于发育过程中的观察，对成年后该系统的功能维持和可塑性需要进一步验证 | 探究脊髓中控制肢体运动的神经回路组织结构 | 小鼠脊髓V2a中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7185 | 2025-10-06 |
Defining murine organogenesis at single-cell resolution reveals a role for the leukotriene pathway in regulating blood progenitor formation
2018-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-017-0013-z
PMID:29311656
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序绘制小鼠原肠胚形成后器官发生的细胞图谱，揭示白三烯途径在血液祖细胞形成中的调控作用 | 首次在原肠胚形成后阶段(E8.25)对小鼠发育进行大规模单细胞转录组分析，识别出20种主要细胞类型及其亚结构，并发现白三烯途径在造血祖细胞生成中的新功能 | 研究仅聚焦于小鼠胚胎发育的特定时间点(E8.25)，未涵盖整个器官发生过程 | 解析小鼠器官发生阶段的细胞类型组成和分子调控机制 | 小鼠胚胎发育E8.25阶段的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7186 | 2025-10-06 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本研究揭示了成年小鼠脑室下区神经干细胞通过感知生态位占用情况来调节自身数量的新机制 | 发现Wnt靶基因Troy可同时标记活跃和静息态神经干细胞，并证实干细胞数量在共享生态位中随时间波动的随机命运决定模型 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究神经干细胞的分子特征、自我更新潜能和命运决定机制 | 成年小鼠脑室下区神经干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因谱系追踪,命运图谱分析 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | 小鼠神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7187 | 2025-10-06 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
|
研究论文 | 提出一种通用灵活的单细胞RNA测序数据信号提取方法ZINB-WaVE | 开发了零膨胀负二项模型，能同时处理数据中的零膨胀、过度离散和计数特性 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的低维表示方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ZINB-WaVE（零膨胀负二项模型） | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7188 | 2025-10-06 |
Transcriptomic Profiling of Zebrafish Hair Cells Using RiboTag
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00047
PMID:29765956
|
研究论文 | 开发了一种转基因斑马鱼模型，用于在原生组织环境中分析内耳和侧线毛细胞的翻译组 | 创建了首个用于斑马鱼毛细胞特异性翻译组分析的RiboTag转基因模型，避免了组织解离导致的基因表达变化 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果向哺乳动物系统的直接转化需要进一步验证 | 开发一种能够在原生组织环境中特异性分析斑马鱼毛细胞基因表达的方法 | 斑马鱼内耳器官和侧线神经丘中的毛细胞 | 功能基因组学 | 听力障碍 | RiboTag技术，RNA-Seq，免疫沉淀 | 转基因动物模型 | 转录组数据 | 斑马鱼幼虫 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 7189 | 2025-10-06 |
States and Origins of Mammalian Embryonic Pluripotency In Vivo and in a Dish
2018, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2017.11.002
PMID:29477162
|
综述 | 探讨哺乳动物早期胚胎多能性状态及其在体内外的起源与维持机制 | 通过单细胞转录组学揭示不同物种胚胎发育中细胞互作与命运决定的新机制 | 主要基于比较研究，尚未建立统一的跨物种多能性理论框架 | 解析哺乳动物早期胚胎多能性的发育原理与物种差异 | 小鼠和人类等哺乳动物的早期胚胎及多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多物种胚胎样本（未明确具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7190 | 2025-10-06 |
Somatic Mutations Activating the mTOR Pathway in Dorsal Telencephalic Progenitors Cause a Continuum of Cortical Dysplasias
2017-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.11.106
PMID:29281825
|
研究论文 | 本研究揭示了mTOR通路基因突变导致皮质发育不良的机制 | 首次证明mTOR通路激活在背侧端脑祖细胞中引起从局灶性皮质发育不良到半侧巨脑症的连续疾病谱系 | 样本量相对有限，仅66例病例 | 探究mTOR通路基因突变与皮质发育畸形的关系 | FCD/HME脑组织样本和转基因小鼠模型 | 神经科学 | 皮质发育不良 | 深度测序,单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | 66例FCD/HME病例 | NA | NA | NA | NA |
| 7191 | 2025-10-06 |
Differentiation dynamics of mammary epithelial cells revealed by single-cell RNA sequencing
2017-12-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02001-5
PMID:29225342
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示乳腺上皮细胞在成年发育过程中的分化动态 | 首次在四个发育阶段对乳腺上皮细胞进行单细胞RNA测序分析，提出乳腺上皮细胞应被视为连续分化谱系的概念 | NA | 解析乳腺上皮细胞的层级结构和在成年发育过程中的调控机制 | 乳腺上皮细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 23,184个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7192 | 2025-10-06 |
Experimental design for single-cell RNA sequencing
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx035
PMID:29126257
|
综述 | 本文讨论了单细胞RNA测序的实验设计原则，比较了两种主流方法的优缺点 | 系统比较了平板式Smart-Seq2和微滴式10x Chromium两种主流scRNA-seq技术的实验设计考量 | NA | 探讨单细胞RNA测序实验设计的关键因素 | 单细胞RNA测序技术 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 微滴式单细胞RNA测序平台 |
| 7193 | 2025-10-06 |
TH2 cell development and function
2018-02, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/nri.2017.118
PMID:29082915
|
综述 | 本文综述了T辅助2细胞（TH2）的发育与功能机制及其在疾病中的作用 | 整合了树突状细胞、先天淋巴样细胞和上皮细胞等多种细胞来源的分子信号对TH2细胞分化的调控机制，并探讨了单细胞技术带来的新研究机遇 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证 | 阐明TH2细胞分化机制及其在哮喘和过敏等疾病中的治疗靶点 | T辅助2细胞（TH2）及其分化调控机制 | 免疫学 | 哮喘和过敏 | 单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、体内细胞命运示踪技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 7194 | 2025-10-06 |
Spatial reconstruction of immune niches by combining photoactivatable reporters and scRNA-seq
2017-12-22, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aao4277
PMID:29217582
|
研究论文 | 开发了一种结合光激活报告基因和单细胞RNA测序的空间重建方法NICHE-seq | 首次将光激活荧光报告基因、双光子显微镜和单细胞RNA测序相结合，能够解析非结构化动态生态位中的细胞空间位置和基因程序 | NA | 阐明免疫细胞网络的高阶空间组织结构 | 免疫细胞生态位，包括B细胞滤泡、脾脏和肿瘤中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 光激活荧光报告基因，双光子显微镜，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，显微成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 7195 | 2025-10-06 |
Antibody Tumor Targeting Is Enhanced by CD27 Agonists through Myeloid Recruitment
2017-Dec-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2017.11.001
PMID:29198913
|
研究论文 | 本研究探讨了抗CD27抗体通过调节淋巴细胞招募并激活髓系细胞，增强抗CD20抗体对肿瘤的靶向治疗效果 | 首次发现抗CD27/CD20抗体联合使用可在多种淋巴瘤模型中实现治愈效果，并通过单细胞RNA测序揭示了其通过刺激CD8 T细胞和自然杀伤细胞释放髓系趋化因子和干扰素γ的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索免疫调节性单克隆抗体与肿瘤靶向抗体联合使用的治疗潜力 | 淋巴瘤模型和huCD27转基因小鼠 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种淋巴瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7196 | 2025-10-06 |
Mosaic autosomal aneuploidies are detectable from single-cell RNAseq data
2017-Nov-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-4253-x
PMID:29178830
|
研究论文 | 开发了一种利用单细胞RNA测序数据检测嵌合体常染色体非整倍体的方法 | 首次利用染色体范围的表达失衡从单细胞RNA-seq数据中识别非整倍体，相比传统单细胞DNA测序方法更快速经济 | 在基因表达高度可变的数据中效果较差 | 开发从单细胞RNA测序数据检测嵌合体非整倍体的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的染色体非整倍体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7197 | 2025-10-06 |
Transcriptomes of major renal collecting duct cell types in mouse identified by single-cell RNA-seq
2017-11-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1710964114
PMID:29089413
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术鉴定小鼠肾脏集合管主要细胞类型的完整转录组 | 首次使用新发现的c-Kit作为A型闰细胞的表面标记物，结合流式细胞分选技术富集合管细胞群体 | 研究仅针对小鼠模型，且集合管细胞仅占肾脏质量的很小部分 | 鉴定肾脏集合管主要细胞类型的完整转录组并建立基因表达数据库 | 小鼠肾脏集合管细胞（包括主细胞、A型闰细胞和B型闰细胞） | 单细胞基因组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 富集后的集合管细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7198 | 2025-10-06 |
f-scLVM: scalable and versatile factor analysis for single-cell RNA-seq
2017-11-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-017-1334-8
PMID:29115968
|
研究论文 | 开发了一种基于因子分析的单细胞RNA测序数据分析方法f-scLVM，用于解析基因表达异质性 | 使用通路注释指导可解释因子的推断，能联合估计个体因子相关性、优化基因集注释并推断无注释因子 | NA | 开发可扩展且多功能的因子分析方法用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分析模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7199 | 2025-10-06 |
Disturbed Placental Imprinting in Preeclampsia Leads to Altered Expression of DLX5, a Human-Specific Early Trophoblast Marker
2017-Nov-07, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过基因组学分析发现先兆子痫中胎盘印记紊乱导致DLX5基因上调，并建立了人类特异性滋养细胞模型 | 首次证实印记基因紊乱与先兆子痫的关联，发现DLX5作为人类特异性早期滋养细胞标志物在先兆子痫中的作用机制 | 缺乏稳健的动物模型系统，人类特异性使得研究面临方法学挑战 | 研究印记基因紊乱是否导致先兆子痫的发生 | 先兆子痫患者和健康对照的胎盘样本 | 基因组学 | 先兆子痫 | 高通量转录组分析，单细胞转录组测序，生物信息学分析，表观遗传学检测 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 多个先兆子痫患者和健康对照的胎盘样本 | NA | 单细胞RNA-seq，转录组分析 | NA | NA |
| 7200 | 2025-10-06 |
Assessing the reliability of spike-in normalization for analyses of single-cell RNA sequencing data
2017-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.222877.117
PMID:29030468
|
研究论文 | 评估spike-in标准化方法在单细胞RNA测序数据分析中的可靠性 | 通过使用两组不同的spike-in RNA进行混合实验，首次量化了板式protocol中spike-in RNA添加量的变异程度 | 仅评估了板式protocol，未包含其他单细胞RNA测序平台；仅使用两组spike-in RNA进行验证 | 评估spike-in标准化方法在单细胞RNA测序数据分析中的技术变异和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的技术变异和标准化方法 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 板式protocol单细胞RNA测序 |