单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7141 - 7160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7141 | 2025-10-06 |
Gene expression variability across cells and species shapes innate immunity
2018-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0657-2
PMID:30356220
|
研究论文 | 本研究通过跨物种和单细胞水平的转录组分析，揭示了先天免疫反应的表达变异模式及其进化机制 | 首次系统性地揭示了先天免疫反应中不同功能基因在物种间和细胞间的表达变异规律，提出了基因表达变异性作为免疫调控精细平衡机制的新观点 | 研究主要基于转录组数据，对蛋白质水平和功能验证的深入分析可能不足 | 探究先天免疫反应在物种进化和细胞异质性层面的表达调控机制 | 成纤维细胞和单核吞噬细胞 | 转录组学 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个物种的成纤维细胞和单核吞噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7142 | 2025-10-06 |
Disease-relevant transcriptional signatures identified in individual smooth muscle cells from healthy mouse vessels
2018-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-06891-x
PMID:30385745
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合谱系追踪技术，在健康小鼠血管中识别出与血管疾病相关的转录特征 | 首次在健康血管的单个平滑肌细胞中发现疾病相关转录特征，并鉴定出表达多能祖细胞标志物Sca1的罕见VSMC谱系细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类血管中验证 | 探究健康小鼠血管中血管平滑肌细胞的异质性及其与血管疾病的关系 | 小鼠血管平滑肌细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序，谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7143 | 2025-10-06 |
Single-molecule DNA-mapping and whole-genome sequencing of individual cells
2018-10-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1804194115
PMID:30322920
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研究论文 | 开发用于单细胞DNA提取和基因组结构分析的低成本微纳流控芯片 | 结合单分子DNA光学图谱和全基因组测序技术，直接揭示单细胞基因组结构变异 | 实验样本量较小，仅使用LS174T结直肠癌细胞系进行验证 | 解析组织和肿瘤中的细胞异质性和克隆进化 | LS174T结直肠癌细胞系中的单个细胞 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单分子DNA光学图谱, 全基因组测序, 微纳流控技术 | NA | 基因组DNA, 光学图谱数据, 测序数据 | LS174T细胞系中的单个细胞 | NA | 单细胞全基因组测序, 单分子光学图谱 | NA | 微纳流控芯片，包含DNA提取、测序和变性-复性光学图谱模块 |
| 7144 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis uncovers convergence of cell identities during axolotl limb regeneration
2018-10-26, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaq0681
PMID:30262634
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示蝾螈肢体再生过程中细胞身份的趋同现象 | 首次结合Cre-loxP报告基因谱系追踪和单细胞mRNA测序技术，在分子水平追踪成熟结缔组织细胞向肢体芽基状态的转变过程 | 研究仅针对蝾螈前肢再生模型，结果在其他脊椎动物中的普适性有待验证 | 揭示脊椎动物复杂器官再生过程中的分子和细胞重编程机制 | 蝾螈前肢再生过程中的结缔组织细胞和芽基前体细胞 | 单细胞生物学 | 组织再生 | Cre-loxP谱系追踪, scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7145 | 2025-10-06 |
Isolation of Adult Spinal Cord Nuclei for Massively Parallel Single-nucleus RNA Sequencing
2018-10-12, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/58413
PMID:30371670
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研究论文 | 开发了一种用于大规模并行单核RNA测序的成年脊髓核分离方法 | 提出了一种高通量核分离方案，可与两种大规模并行液滴封装平台兼容，适用于新鲜或冷冻脊髓样本 | NA | 开发适用于单核RNA测序的脊髓核分离方法 | 成年脊髓样本 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序(snRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序,大规模并行液滴封装 | NA | NA |
| 7146 | 2025-10-06 |
Reproducibility of Molecular Phenotypes after Long-Term Differentiation to Human iPSC-Derived Neurons: A Multi-Site Omics Study
2018-10-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2018.08.013
PMID:30245212
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研究论文 | 通过多中心研究评估人类iPSC衍生神经元长期分化后分子表型的可重复性 | 首次在五个独立实验室对相同iPSC系进行长期神经元分化协议的可重复性系统评估 | 仅使用两个iPSC细胞系，样本规模有限 | 评估干细胞分化协议在多实验室环境下的可重复性 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)衍生的神经元 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 因子分析 | 基因表达数据 | 两个iPSC细胞系在五个实验室的重复实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7147 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Quiescent HIV Infection Reveals Host Transcriptional Profiles that Regulate Proviral Latency
2018-10-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.09.020
PMID:30282021
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究HIV潜伏感染的宿主转录调控机制 | 首次在单细胞水平揭示HIV潜伏与特定宿主转录特征之间的关联 | 使用细胞系和原代细胞模型，可能存在与体内真实情况的差异 | 探索HIV潜伏感染的建立和维持机制 | HIV潜伏感染的细胞系和原代细胞 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7148 | 2025-10-06 |
Terminal exon characterization with TECtool reveals an abundance of cell-specific isoforms
2018-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0114-z
PMID:30202060
|
研究论文 | 开发了一种用于识别RNA末端外显子的TECtool工具，并发现人类细胞中存在大量未知的细胞特异性异构体 | 开发了TECtool工具，能够从RNA测序数据中识别未知的转录本异构体和细胞类型特异性末端外显子 | 需要具有RNA切割和polyA位点注释的基因组数据支持 | 识别和表征RNA末端外显子及细胞特异性异构体 | 人类细胞中的RNA转录本 | 生物信息学 | NA | RNA测序，单细胞测序，核糖体分析 | NA | RNA测序数据，单细胞测序数据 | NA | NA | RNA-seq，单细胞测序 | NA | NA |
| 7149 | 2025-10-06 |
Correcting the Mean-Variance Dependency for Differential Variability Testing Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2018-09-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2018.06.011
PMID:30172840
|
研究论文 | 提出一种校正单细胞RNA测序数据均值-方差依赖性的分析方法，用于差异变异性检验 | 扩展BASiCS统计框架，推导出不受均值表达影响的变异性残差度量，并开发无需技术spike-in分子的稳健技术噪声量化程序 | NA | 解决单细胞RNA测序中技术变异和变异性与均值估计混淆的问题，实现细胞群体间表达变异性的有意义的比较 | 免疫细胞（特别是CD4 T细胞）的细胞间转录变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | BASiCS统计框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7150 | 2025-10-06 |
Aligning Single-Cell Developmental and Reprogramming Trajectories Identifies Molecular Determinants of Myogenic Reprogramming Outcome
2018-09-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2018.07.006
PMID:30195438
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析MYOD介导的成纤维细胞向肌管重编程过程，并开发轨迹对齐技术比较发育与重编程轨迹 | 引入轨迹对齐这一新型分析技术，能够定量比较两个生物过程中的基因表达动力学 | 仅研究MYOD介导的特定重编程系统，结果可能不适用于其他重编程模型 | 揭示重编程效率低下的分子障碍，识别决定重编程结果的关键分子因素 | 人类成纤维细胞向肌管的重编程过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹对齐分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7151 | 2025-10-06 |
Large-Scale Single-Cell RNA-Seq Reveals Molecular Signatures of Heterogeneous Populations of Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Endothelial Cells
2018-08-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.118.312913
PMID:29986945
|
研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序揭示人诱导多能干细胞来源内皮细胞异质性群体的分子特征 | 首次利用液滴单细胞RNA测序技术系统分析人iPSC-EC分化过程中的细胞异质性，鉴定出四个主要内皮细胞亚群 | 分化技术效率不足，存在非内皮细胞污染 | 解析人诱导多能干细胞来源内皮细胞的异质性特征 | 人诱导多能干细胞分化后的内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个人iPSC细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 7152 | 2025-10-06 |
RNA velocity of single cells
2018-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0414-6
PMID:30089906
|
研究论文 | 本研究提出并验证了通过区分未剪接和已剪接mRNA来直接估计单细胞RNA速度的方法 | 首次提出RNA速度概念，通过分析未剪接和已剪接mRNA的比例来预测细胞未来状态 | 仅能预测数小时时间尺度内的细胞状态变化 | 开发能够分析时间分辨生物学过程的新计算方法 | 单细胞基因表达数据 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7153 | 2025-10-06 |
Genome-Scale Oscillations in DNA Methylation during Exit from Pluripotency
2018-07-25, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2018.06.012
PMID:30031774
|
研究论文 | 本研究揭示了多能性退出过程中DNA甲基化存在基因组尺度的振荡现象 | 首次发现DNA甲基化在全基因组范围内存在协调振荡，且振幅与CpG密度相关 | NA | 探索早期胚胎发育过程中表观遗传异质性的产生机制 | 多能性干细胞及其向体细胞谱系分化的过程 | 表观遗传学 | NA | 单细胞测序,定量生物物理建模 | 生物物理模型 | 表观遗传数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序,平行单细胞转录和表观遗传分析 | NA | NA |
| 7154 | 2025-10-06 |
Interferon gene therapy reprograms the leukemia microenvironment inducing protective immunity to multiple tumor antigens
2018-07-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-05315-0
PMID:30042420
|
研究论文 | 本研究通过单核细胞介导的IFNα基因疗法重塑白血病微环境，诱导针对多种肿瘤抗原的保护性免疫 | 首次证明IFN基因疗法能逆转白血病诱导的免疫抑制性髓系细胞扩增，并通过单细胞转录组分析揭示微环境重编程机制 | 研究仅使用小鼠模型，临床转化潜力尚需进一步验证 | 开发通过基因疗法改善肿瘤微环境以增强免疫治疗效果的新策略 | 白血病小鼠模型 | 免疫治疗 | 白血病 | 基因治疗，单细胞转录组分析，批量转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 7155 | 2025-10-06 |
Detection and removal of barcode swapping in single-cell RNA-seq data
2018-07-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-05083-x
PMID:29991676
|
研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序数据中的条形码交换问题，并开发了相应的校正算法 | 首次使用两种统计方法量化条形码交换比例，并开发了针对10x Genomics实验的分子级校正算法 | 研究主要基于HiSeq 4000平台，在其他测序平台上的适用性需要进一步验证 | 检测和校正单细胞RNA测序中的条形码交换现象 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 测序数据 | 两个板式单细胞RNA测序数据集 | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | HiSeq 4000, 10x Chromium | Illumina HiSeq 4000图案化流动槽测序仪，10x Genomics单细胞测序平台 |
| 7156 | 2025-10-06 |
Human in vivo-generated monocyte-derived dendritic cells and macrophages cross-present antigens through a vacuolar pathway
2018-07-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04985-0
PMID:29967419
|
研究论文 | 本研究揭示了人类体内产生的单核细胞来源树突状细胞和巨噬细胞通过液泡途径交叉呈递抗原的机制 | 首次证明人类自然发生的单核细胞来源树突状细胞具有交叉呈递能力，并阐明其独特的液泡途径机制 | 研究样本仅来源于腹水，未涉及其他组织或疾病模型 | 探究人类单核细胞来源免疫细胞的抗原交叉呈递能力及分子机制 | 人类腹水中的单核细胞来源树突状细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 腹水来源的免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7157 | 2025-10-06 |
Early metazoan cell type diversity and the evolution of multicellular gene regulation
2018-07, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-018-0575-6
PMID:29942020
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究早期后生动物细胞类型多样性及其基因调控机制的演化 | 首次在非两侧对称动物（海绵、栉水母、扁盘动物）中系统绘制细胞类型特异性转录图谱，发现扁盘动物存在多种未知的肽能细胞类型 | 研究仅涵盖三种早期后生动物类群，尚未扩展到更广泛的后生动物谱系 | 探索后生动物细胞类型及其基因调控程序的演化 | 海绵（Porifera）、栉水母（Ctenophora）和扁盘动物（Placozoa）物种 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种早期后生动物类群的全生物体单细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7158 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal the dynamic of haematopoietic stem cell production in the aorta
2018-06-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04893-3
PMID:29955049
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了小鼠胚胎主动脉中造血干细胞生成的动态过程 | 首次在体内完整解析了造血干细胞生成过程中内皮细胞向造血细胞转变及主动脉内造血细胞簇形成的分子事件 | 研究仅限于小鼠胚胎模型，人类系统中的适用性需要进一步验证 | 深入理解造血干细胞在体内生成的分子机制 | 小鼠胚胎主动脉中的非造血内皮细胞、造血内皮细胞、内皮-造血转化细胞、主动脉内造血细胞簇细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从小鼠胚胎主动脉分离的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7159 | 2025-10-06 |
Dissection of Influenza Infection In Vivo by Single-Cell RNA Sequencing
2018-06-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2018.05.008
PMID:29886109
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析流感病毒感染过程中肺组织细胞的异质性反应 | 首次在单细胞水平同时分析病毒和宿主转录组，揭示旁观者细胞与感染细胞的差异，并发现流感感染特异性新标志物 | NA | 研究流感病毒感染过程中不同细胞类型的宿主反应异质性 | 流感病毒感染的小鼠肺组织细胞 | 单细胞组学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7160 | 2025-10-06 |
Genetic identification of brain cell types underlying schizophrenia
2018-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0129-5
PMID:29785013
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别精神分裂症相关的特定脑细胞类型 | 首次将精神分裂症的基因组位点与特定脑细胞类型进行系统性映射，发现风险基因主要集中于特定神经元类型 | 研究主要基于常见变异，未深入探讨罕见变异的作用；细胞类型分析可能存在技术局限性 | 确定精神分裂症遗传基础所对应的特定脑细胞类型 | 人脑细胞类型及其基因表达谱 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |