单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 7161 - 7180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7161 | 2025-10-06 |
Classes and continua of hippocampal CA1 inhibitory neurons revealed by single-cell transcriptomics
2018-06, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2006387
PMID:29912866
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示海马CA1区抑制性神经元的分类谱系和连续变异模式 | 发现抑制性神经元多样性不仅需要离散分类描述，还需要连续变异模式；识别出3个先前被认为不同的细胞类型实际上相同；通过潜在因子分析揭示单个连续变量可预测多个基因表达水平 | 研究仅聚焦于海马CA1区，结果可能无法直接推广到其他脑区；样本量相对有限（3,663个细胞） | 解析海马CA1区抑制性神经元的分子分类和多样性特征 | 小鼠海马CA1区的GABA能抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在因子分析 | 单细胞转录组数据 | 3,663个CA1抑制性细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7162 | 2025-10-06 |
Batch effects in single-cell RNA-sequencing data are corrected by matching mutual nearest neighbors
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4091
PMID:29608177
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研究论文 | 提出一种基于互近邻匹配的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 不依赖预定义的细胞群体组成或批次间相同群体组成的假设，仅要求批次间共享部分细胞群体 | NA | 开发单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互近邻匹配算法 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,液滴式单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7163 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the origin and the order of mutation acquisition in T-cell acute lymphoblastic leukemia
2018-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-018-0127-8
PMID:29740158
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示T细胞急性淋巴细胞白血病中突变获取的起源和顺序 | 首次使用靶向单细胞测序技术结合图论算法解析T-ALL突变获取顺序，发现白血病发展可从多能祖细胞起始 | 仅分析了4例T-ALL病例，样本量较小 | 探究T-ALL中突变获取的顺序和起源细胞 | T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 靶向单细胞测序 | 图论算法 | 基因组测序数据 | 4例T-ALL病例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 7164 | 2025-10-06 |
Simultaneous lineage tracing and cell-type identification using CRISPR-Cas9-induced genetic scars
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4124
PMID:29644996
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研究论文 | 提出一种结合CRISPR-Cas9基因编辑与单细胞RNA测序的技术，实现单细胞谱系追踪与细胞类型鉴定同步进行 | 开发LINNAEUS技术，通过核酸酶激活的通用序列编辑实现数千个单细胞中谱系追踪与转录组分析同步完成 | NA | 理解单个细胞如何发育成包含多种细胞类型的完整生物体 | 斑马鱼幼体和成体的心脏、肝脏、胰腺及端脑组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 谱系条形码计算分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因编辑条形码数据 | 数千个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7165 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling: a window into embryonic cell-type specification
2018-06, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-018-0002-5
PMID:29666443
|
综述 | 本文综述单细胞转录组分析技术在胚胎发育研究中的应用与进展 | 系统整合单细胞转录组学与成像技术的最新进展，并概述相关生物信息学分析方法 | 未明确说明具体技术限制，但提及单细胞研究面临的当前挑战 | 探讨单细胞技术如何促进对哺乳动物胚胎发育过程中细胞命运决定机制的理解 | 哺乳动物早期胚胎发育过程中的细胞谱系分化 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、成像技术 | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7166 | 2025-10-06 |
Cnidarian Cell Type Diversity and Regulation Revealed by Whole-Organism Single-Cell RNA-Seq
2018-05-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.05.019
PMID:29856957
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研究论文 | 通过全生物体单细胞RNA测序揭示刺胞动物细胞类型多样性及其调控机制 | 首次在非两侧对称动物Nematostella vectensis中开展全生物体单细胞转录组分析，整合转录因子表达、染色质分析和序列 motif 识别揭示细胞特异性表达的调控机制 | 研究仅限于单一刺胞动物物种，未与其他动物门类进行广泛比较 | 探索刺胞动物细胞类型多样性及基因调控程序的进化 | 星虫海葵(Nematostella vectensis)的成年和幼体细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，染色质分析，序列motif分析 | NA | 单细胞转录组数据，染色质数据 | 全生物体细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7167 | 2025-10-06 |
BGP: identifying gene-specific branching dynamics from single-cell data with a branching Gaussian process
2018-05-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1440-2
PMID:29843817
|
研究论文 | 开发了一种名为分支高斯过程(BGP)的非参数模型，用于从单细胞数据中识别基因特异性分支动态 | 能够识别单个基因的分支动态，并为每个基因提供分支时间估计及相关可信区间 | NA | 识别细胞分化过程中的基因特异性分支动态 | 单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分支高斯过程(BGP) | 单细胞基因表达数据 | 模拟数据、造血单细胞RNA-seq研究、小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴条形码技术 |
| 7168 | 2025-10-06 |
Evolution of pallium, hippocampus, and cortical cell types revealed by single-cell transcriptomics in reptiles
2018-05-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar4237
PMID:29724907
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研究论文 | 通过爬行动物大脑皮层的单细胞转录组学研究揭示了哺乳动物皮层细胞类型的进化起源 | 首次在爬行动物中构建了大脑皮层的单细胞基因表达图谱，揭示了哺乳动物新皮层细胞类型的进化路径 | 仅研究两种爬行动物物种，可能无法完全代表所有羊膜动物的进化特征 | 探究羊膜动物大脑皮层中谷氨酸能和GABA能神经元的进化历程 | 两种爬行动物的大脑皮层细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 两种爬行动物物种的大脑皮层细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7169 | 2025-10-06 |
A single-cell hematopoietic landscape resolves 8 lineage trajectories and defects in Kit mutant mice
2018-05-24, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2017-12-821413
PMID:29588278
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析小鼠骨髓造血干祖细胞的8种谱系分化轨迹，并揭示Kit突变小鼠的造血缺陷 | 识别了共同的嗜碱性粒细胞/肥大细胞骨髓祖细胞，并在单细胞水平表征其分子特征 | 研究仅基于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 解析造血干祖细胞向特定血液谱系的分化轨迹和系统性疾病解释 | 小鼠骨髓造血干祖细胞 | 单细胞转录组学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,802个小鼠骨髓HSPCs + 13,815个c-Kit突变小鼠HSPCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7170 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Lymph Node Stromal Cells Reveals Niche-Associated Heterogeneity
2018-05-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.04.006
PMID:29752062
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示淋巴结基质细胞的异质性及其在免疫微环境中的功能 | 首次使用液滴单细胞RNA测序技术系统鉴定出9个淋巴结非内皮基质细胞亚群，包括多个新型基质细胞类型 | 研究仅关注外周淋巴结，未涉及其他淋巴组织；单细胞测序技术本身存在技术限制 | 解析淋巴结基质细胞的多样性及其在免疫微环境中的功能 | 小鼠外周淋巴结基质细胞 | 单细胞组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 7171 | 2025-10-06 |
Parental haplotype-specific single-cell transcriptomics reveal incomplete epigenetic reprogramming in human female germ cells
2018-05-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04215-7
PMID:29760424
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类女性生殖细胞中不完全的表观遗传重编程过程 | 首次结合外显子组测序和单细胞RNA测序，重建完整亲本单倍型并量化全基因组范围内的亲本等位基因特异性表达变化 | 研究仅包含五名供体样本，样本量相对有限 | 探究人类女性生殖细胞中转录和表观遗传重塑的复杂性和细胞间异质性 | 人类女性生殖细胞（包括原始生殖细胞、减数分裂前和减数分裂期细胞） | 单细胞生物学 | NA | 外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 五名人类供体的生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7172 | 2025-10-06 |
Whole-Body Single-Cell Sequencing Reveals Transcriptional Domains in the Annelid Larval Body
2018-05-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msx336
PMID:29373712
|
研究论文 | 通过全幼虫单细胞测序揭示了环节动物幼虫体内的转录域结构 | 首次在环节动物幼虫中通过全身体单细胞测序识别出基于差异基因表达的空间转录域 | 研究仅针对海洋环节动物Platynereis dumerilii的幼虫阶段 | 表征整个动物体内的细胞身份和空间转录组织 | 海洋环节动物Platynereis dumerilii的幼虫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，全胚胎原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，空间表达数据 | 从全幼虫中随机挑选的单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7173 | 2025-10-06 |
Identification of spatial expression trends in single-cell gene expression data
2018-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4634
PMID:29553578
|
研究论文 | 提出了一种基于标记点过程的trendsceek方法，用于识别具有显著空间表达趋势的基因 | 开发了基于标记点过程的创新计算方法，能够识别空间基因表达数据中的统计显著表达趋势 | NA | 开发计算分析策略来处理单细胞分辨率空间基因表达数据 | 空间转录组数据、连续荧光原位杂交数据和单细胞RNA-seq数据的低维投影 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、连续荧光原位杂交、单细胞RNA-seq | 标记点过程 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 荧光原位杂交 | NA | NA |
| 7174 | 2025-10-06 |
Sensitivity to sequencing depth in single-cell cancer genomics
2018-04-16, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0537-2
PMID:29661213
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞癌症基因组数据，评估测序深度对变异检测敏感性的影响 | 首次系统评估单细胞癌症基因组测序中测序深度对变异检测、克隆推断和系统发育重建的影响 | 研究基于已发表的五个数据集，可能受原始数据质量和特定癌症类型的限制 | 探索单细胞癌症基因组测序中成本效益最优的测序策略 | 单细胞癌症基因组数据集 | 单细胞基因组学 | 癌症 | 单细胞全基因组测序, 单细胞全外显子组测序 | NA | 基因组测序数据 | 5个单细胞癌症数据集，共生成6280个单细胞BAM文件 | NA | 单细胞全基因组测序, 单细胞全外显子组测序 | NA | NA |
| 7175 | 2025-10-06 |
Early emergence of cortical interneuron diversity in the mouse embryo
2018-04-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar6821
PMID:29472441
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了小鼠胚胎中皮质中间神经元多样性的早期起源机制 | 首次在胚胎期神经节隆起中识别出具有时空限制性转录模式的祖细胞和新生神经元类型 | 研究仅限于小鼠模型，未验证其他物种的普适性 | 探究哺乳动物大脑皮质中间神经元多样性的发育起源 | 小鼠胚胎期神经节隆起的祖细胞和新生神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7176 | 2025-10-06 |
The use of single-cell RNA-Seq to understand virus-host interactions
2018-04, Current opinion in virology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.coviro.2018.03.001
PMID:29558678
|
综述 | 本文探讨了利用单细胞RNA测序技术揭示病毒-宿主相互作用的研究进展 | 通过单细胞转录组分析揭示病毒感染过程中的细胞异质性和特定细胞亚群表型 | NA | 理解病毒与宿主之间的相互作用机制 | 病毒感染过程中的细胞异质性 | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7177 | 2025-10-06 |
Repurposing Tin Mesoporphyrin as an Immune Checkpoint Inhibitor Shows Therapeutic Efficacy in Preclinical Models of Cancer
2018-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-17-2587
PMID:29339440
|
研究论文 | 本研究评估了锡中卟啉作为免疫检查点抑制剂在癌症治疗中的疗效 | 首次将锡中卟啉重新用作免疫检查点抑制剂，靶向血红素加氧酶-1以增强化疗引发的抗肿瘤免疫反应 | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 评估锡中卟啉作为免疫检查点阻断疗法在癌症治疗中的疗效 | 乳腺癌小鼠模型和人类乳腺癌患者数据 | 免疫肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，肿瘤微阵列分析 | NA | 基因表达数据，临床生存数据 | 乳腺癌患者临床数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序，微阵列分析 | NA | NA |
| 7178 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals hidden transcriptional variation in malaria parasites
2018-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.33105
PMID:29580379
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了疟原虫中隐藏的转录变异 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于单细胞生物疟原虫，发现了生命周期中隐藏的离散转录特征和性别特异性表达模式 | 研究仅针对疟原虫特定种类，样本数量相对有限（500多个个体） | 探究单细胞水平上疟原虫的转录变异特征 | 啮齿类和人类疟原虫，包括无性和有性生活周期阶段 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 500多个个体疟原虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7179 | 2025-10-06 |
Defining the Transcriptional Landscape during Cytomegalovirus Latency with Single-Cell RNA Sequencing
2018-03-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.00013-18
PMID:29535194
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人巨细胞病毒潜伏感染期间的转录组景观 | 颠覆了传统对疱疹病毒潜伏期相关基因表达程序的认识，发现潜伏期基因表达主要体现为定量变化而非定性变化 | 研究主要基于实验性潜伏模型，自然感染环境下的验证仍需进一步研究 | 阐明人巨细胞病毒潜伏感染期间的病毒基因表达特征 | 人巨细胞病毒在造血细胞中的潜伏感染 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 转录组RNA测序 | NA | RNA测序数据 | GTEx项目生成的大规模转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7180 | 2025-10-06 |
Defining the earliest step of cardiovascular lineage segregation by single-cell RNA-seq
2018-03-09, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aao4174
PMID:29371425
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠心血管祖细胞在早期发育阶段的谱系分离机制 | 首次在单细胞水平上定义了心血管祖细胞从多能状态退出的最早步骤，并识别了与不同心脏区域和细胞谱系承诺相关的分子特征 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 阐明心血管祖细胞早期区域和谱系分离的分子调控机制 | 野生型和Mesp1缺失型小鼠的心血管祖细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠心血管祖细胞单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |