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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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661 | 2025-10-05 |
Single-cell analyses identify monocyte gene expression profiles that influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts
2025-May-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59833-9
PMID:40442100
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞IL1B基因表达与HIV-1病毒库大小呈负相关 | 首次通过单细胞RNA测序揭示单核细胞IL1B表达与HIV-1病毒库大小的负相关性及其潜在机制 | 样本量较小且仅包含男性患者,研究结果需在更广泛人群中验证 | 研究宿主基因表达对HIV-1病毒库大小的影响 | 急性感染期开始ART治疗的HIV-1感染者外周血细胞 | 单细胞基因组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序,完整前病毒DNA检测 | 差异表达分析,相互作用建模 | 单细胞RNA测序数据 | 两个队列:14名男性(发现队列)和38名男性(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
662 | 2025-10-05 |
AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation
2025-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640907
PMID:40093069
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研究论文 | 通过AI驱动的单细胞RNA-seq数据分析揭示视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态 | 首次使用AI辅助工具SCassist系统分析Müller细胞亚群功能动态,发现活化Müller细胞表达免疫检查点分子抑制Th1细胞活性的新机制 | 研究基于Aire-/-小鼠模型数据,结果在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探究视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能特性和与T细胞的相互作用 | Aire-/-小鼠视网膜中的Müller细胞和T细胞 | 单细胞分析 | 视网膜自身免疫炎症 | 单细胞RNA测序 | SCassist AI工作流程 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
663 | 2025-10-05 |
Extraction of a stromal metastatic gene signature in breast cancer via spatial profiling
2025-Mar-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03353-3
PMID:40065328
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研究论文 | 通过空间转录组学分析识别乳腺癌中的基质转移基因特征 | 首次利用空间转录组学技术系统分析乳腺癌原发灶和转移灶的基质特征,识别出与转移相关的基质基因特征 | 研究样本数量有限,需要在更大队列中进一步验证 | 识别乳腺癌转移的分子特征,特别是基质成分在转移过程中的作用 | 乳腺癌原发灶和转移灶的微区域 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 代表性微区域集合 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
664 | 2025-10-05 |
Identification and Pharmacological Targeting of Treatment-Resistant, Stem-like Breast Cancer Cells for Combination Therapy
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.08.562798
PMID:38798673
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析识别并靶向治疗耐药性乳腺癌干细胞样细胞,开发基于机制的联合疗法 | 利用单细胞RNA测序和网络分析方法识别调控化疗耐药性癌症干细胞样细胞的主调控蛋白,并发现抗寄生虫药物阿苯达唑可特异性清除该亚群 | 研究样本量有限,仅包含7名转移性乳腺癌患者,需要在更大队列中验证 | 开发针对治疗耐药性乳腺癌干细胞样细胞的联合治疗策略 | 转移性乳腺癌患者样本和三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型 | 单细胞分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,CROP-seq测定,患者来源异种移植模型 | 网络分析 | 单细胞RNA测序数据 | 7名转移性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
665 | 2025-10-05 |
CD226 identifies effector CD8+ T cells during tuberculosis and costimulates recognition of Mycobacterium tuberculosis-infected macrophages
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634303
PMID:39896604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别CD226作为结核病中效应CD8+T细胞的关键标志物,并证实其参与识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的共刺激过程 | 首次发现CD226是区分结核病中效应性和耗竭性CD8+T细胞谱系的最显著差异表达基因,并证明其对于CD8+T细胞识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的关键作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究慢性结核感染期间肺实质CD8+T细胞的多样性变化及其识别机制 | C57BL/6J小鼠的肺实质CD8+T细胞和结核分枝杆菌感染的巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, IFNγ-eYFP报告基因系统 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | 感染6周和41周的C57BL/6J小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
666 | 2025-10-05 |
Deciphering the toxic effects of polystyrene nanoparticles on erythropoiesis at single-cell resolution
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探究了聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼胚胎红细胞生成的毒性影响 | 首次在单细胞分辨率下系统评估聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼红细胞生成的影响 | 研究仅针对斑马鱼胚胎,未涉及其他生物或发育阶段 | 评估聚苯乙烯纳米颗粒对水生生物造血过程的毒性效应 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
667 | 2025-10-05 |
High expression of CCL3/CCL4/CCL5/CCR5 promotes exhausted CD8+ T cells terminal differentiation and is associated with poor prognosis in pediatric B-ALL patients
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251346823
PMID:40522146
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL细胞与终末耗竭CD8+T细胞相互作用中上调,并建立多变量Cox回归模型预测儿科B-ALL患者预后 | 首次报道CCL3/CCL4/CCL5-CCR5轴在B-ALL终末耗竭CD8+T细胞分化中的关键作用,并开发整合这些标志物的预后预测模型 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究不够深入 | 识别B-ALL细胞与耗竭CD8+T细胞间差异上调的配体-受体相互作用,开发儿科B-ALL患者生存预测模型 | 儿科B细胞急性淋巴细胞白血病患者,特别是其B-ALL细胞和耗竭CD8+T细胞 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序,定量实时聚合酶链反应,多变量Cox回归分析 | 多变量Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,临床预后数据 | 221例儿科B-ALL样本,另包含本中心成人B-ALL患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
668 | 2025-10-05 |
Blood memory CD8 T cell phenotypes in lung cancer patients predict immune checkpoint treatment responses
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1629802
PMID:40989699
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析肺癌患者外周血CD8+ T细胞表型,建立预测免疫检查点治疗反应的机器学习模型 | 首次在单细胞水平系统分析不同免疫治疗反应组患者的CD8+ T细胞表型特征,并开发出高精度的预测模型 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中验证模型的普适性 | 开发能够预测肺癌患者免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者的外周血CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,TCR repertoire分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据,表面标志物表达数据,TCR序列数据 | 包含长期应答者、新治疗应答者和新治疗无应答者的患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
669 | 2025-10-05 |
Identification of Core SASP-Related Genes TGFBI and ANXA6 for Diagnosing Ulcerative Colitis-Related Colorectal Cancer Through Machine Learning
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S538960
PMID:40989757
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研究论文 | 通过机器学习方法识别溃疡性结肠炎相关结直肠癌的核心SASP相关基因TGFBI和ANXA6作为诊断标志物 | 首次系统筛选SASP相关基因在UCRCC中的作用,并通过113种机器学习算法组合鉴定出核心基因TGFBI和ANXA6 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索衰老相关分泌表型在溃疡性结肠炎相关结直肠癌精准诊断和发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者基因表达数据及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析,单细胞RNA测序,机器学习算法 | 10种机器学习算法的113种组合 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | UC和CRC数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
670 | 2025-10-05 |
Multi-omics reveals immune features in immune and non-immune cells, an IFN-γ/IFN-α-B2M positive feedback loop, and targeted metabolic therapy in multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575079
PMID:40990011
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了多发性骨髓瘤中的免疫特征、IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路及靶向代谢治疗策略 | 识别了新的MM亚群(骨髓瘤激活的造血干细胞和ISG15+ B细胞),发现了IFN-γ/IFN-α-B2M正反馈环路,并通过多组学整合筛选出四种候选药物 | NA | 建立多发性骨髓瘤的多组学图谱,表征驱动免疫逃逸和疾病进展的细胞亚群和信号通路 | 多发性骨髓瘤的免疫和非免疫细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞代谢分析, 批量RNA测序, 多重免疫荧光, CCK-8检测, 流式细胞术, Western blotting | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 单细胞代谢分析 | NA | NA |
671 | 2025-10-05 |
FCRLs and atypical transcriptional pattern in tumor infiltrating B cells from lung and renal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587088
PMID:40990023
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肺癌和肾癌中肿瘤浸润B细胞的功能差异及FCRL4作为功能失调标志物的重要性 | 发现sIgA+ B细胞中FCRL4、PDCD1和RUNX2的过表达特征,以及FCRL4/CD20表达比与生存率的相关性 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏功能性验证实验 | 探究肿瘤浸润B细胞中不同抗体亚型的功能差异及其在肿瘤进展中的作用 | 肺癌和肾癌中的肿瘤浸润B细胞,特别是表面IgA+和IgG+记忆B细胞 | 免疫学 | 肺癌, 肾癌 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序, 批量转录组分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA LUAD队列及公共scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
672 | 2025-10-05 |
Glycolysis-Driven Immune Evasion in Microsatellite Instability-High Colorectal Cancer: An Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Study
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S538018
PMID:40990035
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了糖酵解驱动的免疫逃逸机制在微卫星高度不稳定结直肠癌中的作用 | 首次在微卫星高度不稳定结直肠癌中发现糖酵解富集的肿瘤亚群与免疫抑制微环境的共定位关系,并阐明乳酸分泌促进Treg分化和巨噬细胞极化的分子机制 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要基于相关性分析,缺乏功能性实验验证 | 探究微卫星高度不稳定结直肠癌中肿瘤细胞功能异质性及其在免疫逃逸中的作用 | 微卫星高度不稳定结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 非负矩阵分解, 基因集富集分析 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
673 | 2025-10-05 |
An aberrant immune-epithelial progenitor niche drives viral lung sequelae
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07926-8
PMID:39232171
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠模型揭示了病毒性肺后遗症中异常免疫-上皮祖细胞生态位驱动纤维化的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用通过IFNγ+TNF-IL-1β轴损害肺泡再生并驱动纤维化后遗症 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者样本验证仍需进一步扩展 | 阐明呼吸道病毒后遗症(PASC)的细胞分子机制 | 三个呼吸道PASC患者队列和病毒后肺病小鼠模型 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学、成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据、图像数据 | 三个患者队列和相应小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
674 | 2025-10-05 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 本研究通过抑制TRPC3通道改善阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 | 首次发现TRPC3在AD兴奋性神经元中特异性上调,并鉴定出高效抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床试验验证 | 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病发病机制中的作用及治疗潜力 | AD患者脑组织、AD小鼠模型、大鼠海马神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、功能筛选、海马RNA-seq | NA | 基因表达数据、电生理数据、行为学数据 | AD患者队列、急性和慢性AD小鼠模型、培养的大鼠海马神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
675 | 2025-10-05 |
Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type specific responses in primary human pancreatic islets
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604861
PMID:39211206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了柯萨奇病毒B感染在人类胰岛不同细胞类型中引发的特异性转录反应 | 首次在单细胞分辨率上系统揭示了CVB感染对不同胰岛细胞类型的特异性转录响应,并发现β细胞中长链非编码RNA与病毒感染的关系 | 使用尸体来源的胰岛样本,可能无法完全反映体内真实情况;研究时间点仅限于24和48小时 | 探究柯萨奇病毒B感染对人类胰岛不同细胞类型的特异性影响及其与1型糖尿病的关系 | 人类尸体来源的胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类尸体胰岛样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
676 | 2025-10-05 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
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研究论文 | 本研究揭示了杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用调节TDP-43相关神经退行性疾病中皮层兴奋性的神经保护机制 | 首次发现具有独特形态和转录特征的杆状小胶质细胞亚群,并证明其通过调节兴奋性突触输入来抑制运动皮层过度活跃 | 研究仅限于TDP-43神经退行性疾病小鼠模型,尚未在人类或其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病运动皮层回路过度兴奋中的调控作用 | TDP-43神经退行性疾病小鼠模型(rNLS8)的运动皮层神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 多通道探针记录、纵向钙成像、空间转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 电生理信号、钙成像数据、转录组数据 | rNLS8转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
677 | 2025-10-05 |
Technological innovations promote cancer stem cell-based translational research
2025-Oct-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217949
PMID:40712971
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综述 | 本文综述了癌症干细胞研究领域的技术创新及其对转化医学的推动作用 | 系统整合单细胞测序、功能基因组学、器官芯片和人工智能等前沿技术用于癌症干细胞研究 | NA | 探讨技术创新如何促进基于癌症干细胞的转化研究 | 癌症干细胞及其肿瘤微环境 | 生物医学工程 | 癌症 | 单细胞测序, 功能基因组学, 器官芯片, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
678 | 2025-10-05 |
Radiotherapy in combination with PD-1 and TIGIT blockade mediate antitumor abscopal effects and immune memory via CD8+ T cells
2025-Oct-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217935
PMID:40714064
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研究论文 | 本研究探讨放疗联合抗PD-1和抗TIGIT抗体通过CD8+ T细胞介导抗肿瘤远隔效应和免疫记忆的机制 | 首次揭示三重疗法通过激活CD8 T细胞和M1巨噬细胞极化增强抗肿瘤远隔效应和长期免疫记忆 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在临床试验中验证 | 探索放疗联合免疫检查点抑制剂增强抗肿瘤疗效的机制 | C57/BL6小鼠的四种皮下肿瘤模型(LLC、CMT-167、B16-F10、MC38) | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、多色免疫荧光、单细胞转录组学、Luminex细胞因子分析 | NA | 细胞表型数据、基因表达数据、细胞因子数据 | 四种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
679 | 2025-10-05 |
Inhibition of ACVR1 in Cancer-Associated Fibroblasts Suppresses Colorectal Cancer Cell Growth
2025-Oct, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-17765-0
PMID:40745121
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现ACVR1-BMP7轴是结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的潜在治疗靶点 | 首次在二维类器官模型中揭示ACVR1-BMP7轴在癌症相关成纤维细胞与癌细胞相互作用中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的分子靶向治疗策略 | 结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、小鼠模型 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、类器官培养 | 二维类器官模型、小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、生存数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
680 | 2025-10-05 |
Poor Collateralization in T2DM: Role of SLC4A10+ MAIT Cells
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322718
PMID:40808651
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研究论文 | 本研究探讨2型糖尿病患者中黏膜相关恒定T细胞对侧支循环形成的影响机制 | 首次发现MAIT细胞通过CCL3L1-CCR5轴驱动巨噬细胞向促炎表型极化,从而抑制侧支循环形成 | 样本量有限,需要更大规模研究验证MAIT细胞作为生物标志物的临床价值 | 探究2型糖尿病慢性完全闭塞患者免疫细胞动态与侧支循环形成的关系 | 2型糖尿病慢性完全闭塞患者和糖尿病小鼠模型 | 免疫学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 共培养实验, 缺血模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 两组不同侧支循环状态的2型糖尿病患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |