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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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681 | 2025-10-05 |
CXCL4-Induced PBMCs Modulate Vascular Extracellular Matrix via Wnt5a-Dependent Matrix Metalloproteinase-7 and Calcifying Extracellular Vesicle Release
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322067
PMID:40836918
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研究论文 | 本研究揭示了CXCL4诱导的单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴促进基质金属蛋白酶-7和钙化性细胞外囊泡释放,从而驱动血管细胞外基质重塑的新机制 | 首次发现CXCL4诱导的促炎单核细胞通过Wnt5a-CaMKII信号轴分泌MMP7+S100A8+钙化性细胞外囊泡,驱动血管钙化的新机制 | 研究主要基于体外实验和人类颈动脉斑块组织学验证,需要进一步在体实验确认机制 | 探究CXCL4诱导的单核细胞在血管炎症反应中促进细胞外基质重塑和钙化的分子机制 | 人类外周血单核细胞、血管平滑肌细胞、人类颈动脉斑块 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、细胞外囊泡分析、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 人类颈动脉斑块样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
682 | 2025-10-05 |
Genomic Insights at the Maternal-Fetal Interface: Preeclampsia Subtypes and Clinical Implications
2025-Oct, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.321710
PMID:40874308
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综述 | 通过单细胞转录组学揭示子痫前期在母胎界面的细胞特异性基因表达变化及其临床亚型 | 发现胎盘主导型和母体心血管主导型两种子痫前期亚型具有独特的病因学特征 | 未明确说明研究样本量及具体技术平台细节 | 探索子痫前期的基因组学机制及临床分型 | 母胎界面的细胞类型(合体滋养细胞、基质细胞、免疫细胞) | 基因组学 | 子痫前期 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
683 | 2025-10-05 |
Expression and Clinical Implications of LAG-3 in Small Cell Lung Cancer
2025-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502183R
PMID:40960909
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研究论文 | 本研究评估了LAG-3在小细胞肺癌中的表达及其临床意义 | 首次系统评估28种免疫检查点分子在小细胞肺癌中的表达,发现LAG-3表达高于其他肺癌亚型和黑色素瘤,并验证其作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 研究基于多个数据集,可能存在样本异质性;需要进一步实验验证LAG-3作为生物标志物的临床实用性 | 探索PD-L1之外可用于免疫检查点抑制剂的分子标志物 | 小细胞肺癌细胞系和肿瘤组织 | 癌症免疫学 | 小细胞肺癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 多个公共数据集和内部数据集(包括CCLE数据库、IMpower133数据集等) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
684 | 2025-10-05 |
Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis
2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734
PMID:40910702
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研究论文 | 本研究揭示了环状七肽FZ1作为整合素αvβ3激动剂通过增强血管生成促进糖尿病皮肤伤口愈合的机制 | 首次发现靶向整合素αvβ3的肽类激动剂FZ1,并证明其在糖尿病伤口中的促愈合作用 | NA | 开发有效的糖尿病伤口治疗药物并阐明其调控机制 | 环状七肽FZ1及其在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 生物医学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序,RNA干扰,表面等离子共振,分子对接 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
685 | 2025-10-05 |
Rolling circle amplification for next-generation molecular diagnostics, genome analysis, and spatial transcriptome profiling
2025-Sep-25, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03032c
PMID:40917009
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综述 | 本综述全面探讨滚环扩增技术的基本原理、设计改进及其在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用 | 将RCA与CRISPR检测、生物传感器和纳米颗粒辅助信号放大技术整合,显著提升了诊断潜力,实现核酸、蛋白质、细胞外囊泡和单细胞的超灵敏检测 | 面临反应特异性、自动化和成本效益等关键挑战 | 探索RCA技术在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用及未来发展 | 核酸、蛋白质、细胞外囊泡、单细胞和组织结构中的基因表达 | 分子诊断 | 癌症 | 滚环扩增、CRISPR检测、生物传感器、纳米颗粒辅助信号放大 | NA | DNA序列、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
686 | 2025-10-05 |
AURKA Enhances Antitumor Immunity by Activating CD4+ T Cell Proliferation in Colorectal Cancer
2025-Sep-25, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2025.2559403
PMID:40995659
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示AURKA在结直肠癌中通过激活CD4+ T细胞增殖增强抗肿瘤免疫的双重作用机制 | 首次整合空间转录组学与单细胞测序技术,发现AURKA在肿瘤周围T细胞富集区特异性表达并与免疫激活相关 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证AURKA作为免疫治疗生物标志物的临床价值 | 探究AURKA在结直肠癌肿瘤微环境中的双重调控作用及其免疫治疗意义 | 结直肠癌患者组织样本、免疫检查点抑制剂治疗队列、小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, IHC/HE染色, CIBERSORT/ssGSEA分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞测序数据, 临床病理数据 | 未明确具体样本数量,包含临床队列和动物模型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
687 | 2025-10-05 |
Nonalcoholic Fatty Liver Disease Exacerbates the Advancement of Renal Fibrosis by Modulating Renal CCR2+PIRB+ Macrophages Through the ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP Axis
2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509351
PMID:40995682
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研究论文 | 本研究揭示了非酒精性脂肪肝病通过ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP轴调控肾脏CCR2+PIRB+巨噬细胞加剧肾纤维化的机制 | 首次发现NAFLD通过肝脏分泌的ANGPTL8激活肾脏特异性CCR2+PIRB+巨噬细胞,通过破坏亚油酸代谢促进肾纤维化的肝-肾轴信号通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探讨NAFLD在肾纤维化进展中的具体作用和分子机制 | 小鼠模型、原代肾巨噬细胞、共培养模型 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 流式细胞术, 免疫荧光 | 动物模型, 细胞培养模型 | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 流式数据, 图像数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
688 | 2025-10-05 |
Single-Cell Immune Profiling Reveals Neutrophils Promote Myasthenia Gravis Exacerbation Through BAFF Secretion
2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509260
PMID:40995750
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示中性粒细胞通过分泌BAFF促进重症肌无力恶化的机制 | 首次发现中性粒细胞-BAFF-浆细胞轴在重症肌无力急性加重中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模临床验证 | 探究中性粒细胞在重症肌无力急性加重中的具体作用机制 | 重症肌无力患者骨髓和外周血样本、实验性自身免疫性重症肌无力小鼠模型 | 单细胞生物学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 重症肌无力患者和EAMG小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
689 | 2025-10-05 |
RNA Sequencing at Single Vesicle Resolution via 3D Printed Embedded Droplet Arrays
2025-Sep-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c09959
PMID:40938793
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研究论文 | 开发了一种通过3D打印嵌入式液滴阵列实现单细胞外囊泡RNA测序的平台 | 利用3D打印技术创建嵌入式液滴阵列,首次实现单细胞外囊泡水平的多聚腺苷酸RNA测序 | NA | 解决细胞外囊泡RNA载物的异质性问题 | 单个细胞外囊泡 | 单细胞测序技术 | NA | RNA测序, 3D打印, PCR | NA | RNA测序数据 | 3689个独特条形码对应的细胞外囊泡 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D打印嵌入式液滴阵列 | 基于有机凝胶支持介质的3D打印液滴阵列平台 |
690 | 2025-10-05 |
Next-generation translational genomics for developing future crops
2025-Sep-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01704-z
PMID:40987990
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综述 | 本文探讨现代转化基因组学在作物育种中的最新进展与创新策略 | 从单一基因组转向泛基因组分析,从批量转录组转向单细胞转录组技术,结合人工智能实现高通量表型分析 | NA | 通过整合基因组学、转录组学和表型数据加速作物改良 | 作物育种与遗传改良 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、高通量基因分型、表型分析 | AI和机器学习模型 | 基因组数据、转录组数据、表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
691 | 2025-10-05 |
TYK2 Promotes Immunosurveillance of Colorectal Cancer Liver Metastasis
2025-Sep-24, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4224
PMID:40991399
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研究论文 | 本研究通过小鼠结直肠癌类器官移植模型发现TYK2通过树突状细胞依赖的机制控制结直肠癌肝转移的免疫监视 | 首次揭示TYK2通过树突状细胞MHC-I介导的抗原交叉呈递机制调控结直肠癌肝转移免疫监视 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探索结直肠癌肝转移免疫监视的调控机制 | 结直肠癌肝转移小鼠模型和免疫细胞亚群 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,类器官移植模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
692 | 2025-10-05 |
Spatial profiling of human pancreatic ductal adenocarcinoma reveals molecular alterations associated with venous invasion
2025-Sep-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ady7524
PMID:40991729
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研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征 | 首次系统描绘PDAC静脉侵犯的空间分子图谱,发现静脉侵犯区域表现出与更好预后相关的分子特征 | 样本量相对有限(8例患者95个样本),需在更大队列中验证 | 探究胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征及其临床意义 | 人类胰腺导管腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, RNA-seq | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 公共RNA-seq数据 | 95个PDAC组织样本(来自8例初治患者),独立验证队列19例患者 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
693 | 2025-10-05 |
Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment
2025-Sep-24, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03206-y
PMID:40993310
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综述 | 本文综述了人工智能在组织学评估中的变革作用,特别是在癌症诊断和个性化治疗中的应用 | AI从诊断辅助工具发展为临床决策的组成部分,通过深度学习技术复制和增强病理学家决策,并整合组织学、基因组和临床数据 | AI预测验证存在挑战,特别是在预后应用方面,资源有限环境中的可及性仍需解决 | 探索人工智能在组织病理学评估中的临床应用和发展前景 | 组织学图像、基因组数据和临床数据的整合分析 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习、空间转录组学、多模态方法 | 深度学习模型 | 全切片图像(WSIs)、基因组数据、临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
694 | 2025-10-05 |
HEBP2-governed glutamine competition between tumor and macrophages dictates immunotherapy efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Sep-23, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.08.009
PMID:40992373
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了HEBP2调控的肿瘤细胞与巨噬细胞间谷氨酰胺竞争决定三阴性乳腺癌免疫治疗疗效的机制 | 首次发现HEBP2/GSTP1轴调控的肿瘤-巨噬细胞代谢检查点,开创了单细胞水平免疫代谢评估免疫治疗脆弱性的新范式 | 样本量相对有限(scRNA-seq队列N=27,空间转录组学队列N=88),需要在更大队列中验证 | 阐明三阴性乳腺癌免疫治疗疗效受限的代谢机制 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | scRNA-seq队列27例患者,空间转录组学队列88例患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
695 | 2025-10-05 |
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-Sep-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.024
PMID:40412386
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研究论文 | 本研究通过工程化血管系统成功诱导人多能干细胞来源的胰岛类器官实现功能成熟 | 首次构建了包含血管系统的三维胰岛类器官模型,揭示了血管通过形成胰岛样基底膜和BMP信号通路促进β细胞功能成熟的机制 | 研究中使用的血管系统模型仍需进一步优化以更精确模拟体内生理环境 | 开发具有血管系统的功能性胰岛类器官用于糖尿病研究和治疗 | 人多能干细胞来源的胰岛细胞、人原代内皮细胞和成纤维细胞 | 组织工程 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、微流体技术、三维细胞培养 | NA | 基因表达数据、钙离子成像数据、胰岛素分泌数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
696 | 2025-10-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 首次应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据中,识别出特定的疾病相关β细胞亚群 | 研究样本量有限,未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群以更好理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,免疫染色 | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据,批量表达数据,图像数据 | 来自健康和2型糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
697 | 2025-10-05 |
Novel radiation-derived gene blueprint stratifying patients with breast cancer
2025-Sep-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03549-1
PMID:40983794
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研究论文 | 开发基于辐射相关基因的乳腺癌预后风险模型 | 首次利用辐射相关基因构建乳腺癌预后预测模型,并揭示其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 | 需要更多独立队列验证模型的临床适用性 | 开发乳腺癌预后预测生物标志物和个性化治疗策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多组学分析 | 随机森林, LASSO Cox回归, stepAIC | 基因表达数据 | TCGA-BRCA队列和METABRIC数据集患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
698 | 2025-10-05 |
SIGEL: a context-aware genomic representation learning framework for spatial genomics analysis
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03748-7
PMID:40983914
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研究论文 | 提出一种用于空间基因组学分析的情境感知基因组表示学习框架SIGEL | 开发了能够从空间转录组数据中利用空间基因组情境生成基因表示的创新框架 | NA | 解决空间转录组学中生成空间感知基因表示方法的局限性 | 空间转录组数据中的基因表示 | 空间基因组学 | NA | 空间转录组学 | 表示学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
699 | 2025-10-05 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
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研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI,利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合,通过知识引导增强基因调控网络推断的准确性 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络和驱动基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
700 | 2025-10-05 |
The Single Cell Landscape of the Human Vein After Arteriovenous Fistula Creation and Implications for Maturation Failure
2025-Sep-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类静脉在动静脉瘘建立后的细胞景观,阐明了瘘管成熟失败的机制 | 首次构建了人类静脉在动静脉瘘建立前后的单细胞转录组图谱,发现了成熟失败瘘管中持续的炎症反应和异常修复反应特征 | 样本量相对有限(20例单细胞测序患者),且为观察性研究 | 探究动静脉瘘成熟的生物学机制,特别是成熟失败的分子基础 | 接受血液透析患者的静脉组织和动静脉瘘样本 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 23例患者(组织学分析),20例患者(单细胞测序,共70,281个细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |