单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-10-05 |
Molecular cascades and cell type-specific signatures in ASD revealed by single-cell genomics
2024-05-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh2602
PMID:38781372
|
研究论文 | 通过单细胞基因组学技术揭示自闭症谱系障碍中细胞类型特异的分子级联反应和特征 | 首次结合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学技术，系统揭示自闭症中细胞类型特异性基因调控网络的失调 | 研究基于死后脑组织样本，可能无法完全反映活体状态下的分子变化 | 探索自闭症谱系障碍的分子机制和遗传易感性 | 自闭症患者死后脑组织 | 单细胞基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 722 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of 5-aminolevulinic acid intraoperative labeling specificity for glioblastoma
2024-04-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2023.7.JNS23122
PMID:37773782
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析评估5-氨基乙酰丙酸在胶质母细胞瘤术中标记的特异性 | 首次在单细胞水平验证5-ALA标记胶质瘤细胞的特异性，发现其标记并非仅针对肿瘤细胞 | 需要进一步系统比较5-ALA与其他荧光引导手术替代方案的性能 | 确定5-ALA在胶质母细胞瘤中标记不同细胞类型的特异性 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、胶质瘤细胞培养模型、小鼠胶质瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞光学表型与表达测序(SCOPE-seq2)、单细胞RNA测序、细胞培养 | NA | 图像、RNA测序数据 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、细胞培养模型、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | SCOPE-seq2（配对单细胞成像和RNA测序方法） |
| 723 | 2025-10-05 |
Deep scRNA sequencing reveals a broadly applicable Regeneration Classifier and implicates antioxidant response in corticospinal axon regeneration
2023-12-20, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.09.019
PMID:37848024
|
研究论文 | 通过深度单细胞RNA测序揭示了一个广泛适用的再生分类器，并证明抗氧化反应在皮质脊髓轴突再生中的重要作用 | 开发了可广泛应用的再生分类器，首次发现抗氧化反应和线粒体生物合成在皮质脊髓轴突再生中的关键作用 | 仅对数百个表型鉴定的神经元进行测序，样本规模有限 | 研究中枢神经系统轴突再生的分子机制，特别是皮质脊髓束的再生潜力 | 皮质脊髓束神经元，特别是在PTEN和SOCS3缺失后的再生神经元 | 单细胞基因组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | 监督分类(Garnett) | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于patch的单细胞RNA测序 |
| 724 | 2025-10-05 |
Brain-wide correspondence of neuronal epigenomics and distant projections
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06823-w
PMID:38092919
|
研究论文 | 通过epi-retro-seq技术将小鼠全脑33,034个神经元的表观基因组与远距离投射联系起来 | 首次在全脑范围内将单细胞表观基因组与神经元远距离投射特征进行系统关联 | 研究仅限于小鼠模型，样本来源区域划分可能不够精细 | 解析神经元表观基因组特征与远距离投射功能之间的关系 | 小鼠全脑33,034个神经元，涉及32个脑区向24个靶区的225种投射组合 | 神经科学 | NA | epi-retro-seq, 空间转录组学 | NA | 表观基因组数据, 转录组数据, 空间定位数据 | 33,034个神经元，32个脑区，24个投射靶区 | NA | 单细胞表观基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 725 | 2025-10-05 |
Single-cell DNA methylome and 3D multi-omic atlas of the adult mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06805-y
PMID:38092913
|
研究论文 | 本研究构建了成年小鼠大脑的单细胞DNA甲基组和3D多组学图谱 | 首次在空间背景下生成全脑单细胞甲基组和染色质构象联合图谱，识别了4673个细胞群和274个跨模态注释亚类 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种 | 构建大脑细胞类型及其基因调控景观的完整分子图谱 | 成年小鼠大脑117个解剖区域的细胞 | 表观基因组学 | 神经系统疾病 | 单核甲基组测序(snmC-seq3), 多组学测序(snm3C-seq), 空间转录组学 | NA | 甲基组数据, 染色质构象数据, 转录组数据 | 301,626个甲基组和176,003个染色质构象-甲基组联合图谱 | NA | 单细胞甲基组测序, 单细胞多组学测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 726 | 2025-10-05 |
The molecular cytoarchitecture of the adult mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06818-7
PMID:38092915
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据构建成年小鼠大脑细胞类型综合图谱 | 首次将高通量单核RNA测序与近细胞分辨率的Slide-seq空间转录组技术相结合，系统绘制全脑细胞类型图谱 | 研究仅限于小鼠模型，人类大脑的细胞架构可能存在差异 | 构建哺乳动物大脑细胞类型的综合空间图谱 | 成年小鼠大脑 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, Slide-seq空间转录组 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 全脑范围样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Slide-seq | 近细胞分辨率的空间转录组方法 |
| 727 | 2025-10-05 |
Molecularly defined and spatially resolved cell atlas of the whole mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06808-9
PMID:38092912
|
研究论文 | 本研究通过整合空间分辨单细胞转录组技术，构建了首个全小鼠大脑的高分辨率分子定义细胞图谱 | 首次实现了全脑范围的单细胞空间转录组分析，整合了MERFISH和scRNA-seq数据，系统鉴定了5,000多个转录 distinct 细胞簇和300多种主要细胞类型 | 研究仅针对成年小鼠大脑，人类大脑的复杂性可能有所不同；技术方法可能对某些低表达基因检测灵敏度有限 | 构建全脑范围的分子定义细胞空间图谱，解析大脑细胞类型组成和空间组织规律 | 成年小鼠全脑约1,000万个细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 多重误差鲁棒荧光原位杂交，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，单细胞转录组数据 | 约1,000万个细胞，覆盖整个成年小鼠大脑 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 整合MERFISH和scRNA-seq技术的空间分辨单细胞表达谱分析 |
| 728 | 2025-10-05 |
Differences in cell shape, motility, and growth reflect chromosomal number variations that can be visualized with live-cell ChReporters
2023-12-01, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E23-06-0207
PMID:37903225
|
研究论文 | 利用活细胞染色体报告系统研究染色体数目变化对细胞形态、运动和生长的影响 | 开发了活细胞'ChReporter'方法，可实时识别单个染色体缺失的细胞，并揭示染色体数目变化与细胞机械表型的关系 | 染色体报告系统阳性克隆的机械表型-基因型关系较为复杂，研究主要集中于标准癌细胞系 | 理解染色体数目变化如何影响细胞形态、运动能力和生长特性 | 标准癌细胞系及其克隆种群 | 细胞生物学 | 癌症 | 活细胞成像, 单细胞RNA测序, 药物反应测试 | NA | 图像, 基因表达数据, 药物反应数据 | 标准癌细胞系及其克隆种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 729 | 2025-10-05 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06812-z
PMID:38092916
|
研究论文 | 构建了成年小鼠全脑的高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 结合700万单细胞RNA测序和430万细胞空间转录组数据，创建了包含5,322个细胞簇的层次分类系统 | 研究仅限于成年小鼠脑部，未涉及其他发育阶段或物种 | 建立哺乳动物大脑细胞类型的综合参考图谱 | 成年小鼠全脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, MERFISH | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 约700万细胞（400万通过质控）scRNA-seq，430万细胞MERFISH | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) |
| 730 | 2025-10-05 |
Latent human herpesvirus 6 is reactivated in CAR T cells
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06704-2
PMID:37938768
|
研究论文 | 本研究通过病毒基因组学分析发现人类疱疹病毒6型可在CAR T细胞中被重新激活 | 首次通过大规模病毒基因组挖掘识别出CAR T细胞中HHV-6病毒重新激活现象，并发现病毒'超级表达'细胞亚群 | 研究样本量有限，需要进一步验证病毒重新激活的临床影响 | 探究细胞治疗产品中潜伏病毒重新激活的机制和风险 | 人类CD4 T细胞、CAR T细胞治疗产品 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞测序、病毒基因组挖掘 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据 | 研究级异体CAR T细胞、临床试验患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 731 | 2025-10-05 |
CD201+ fascia progenitors choreograph injury repair
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06725-x
PMID:37968392
|
研究论文 | 本研究通过识别小鼠筋膜中的CD201+成纤维细胞祖细胞，揭示了其在伤口愈合过程中协调炎症反应和瘢痕形成的新机制 | 首次发现筋膜中CD201标记的多能成纤维细胞祖细胞，并阐明其通过视黄酸和缺氧信号通路调控促炎性成纤维细胞和肌成纤维细胞分化的时空序列 | 研究主要基于小鼠模型，人类组织中的验证尚需进一步研究 | 探究伤口愈合过程中成纤维细胞祖细胞的分化调控机制 | 小鼠皮肤伤口模型和筋膜组织 | 单细胞转录组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞转录组测序，遗传谱系追踪，基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 小鼠皮肤损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 732 | 2025-10-05 |
Single-cell, whole-embryo phenotyping of mammalian developmental disorders
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06548-w
PMID:37968388
|
研究论文 | 本研究建立了基于单细胞RNA测序的全胚胎表型分析平台，用于系统表征小鼠发育障碍模型 | 首次将组合索引单细胞RNA测序应用于全胚胎水平，实现了对哺乳动物发育障碍的系统性分子和细胞表型分析 | 研究仅针对胚胎期13.5天的小鼠胚胎，未覆盖其他发育阶段 | 建立可扩展的小鼠遗传模型系统表型分析平台 | 101个小鼠胚胎，包括22种突变型和4种野生型基因型 | 单细胞组学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 101个小鼠胚胎，超过160万个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 组合索引单细胞RNA测序 |
| 733 | 2025-10-05 |
Self-patterning of human stem cells into post-implantation lineages
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06354-4
PMID:37369348
|
研究论文 | 人类多能干细胞自组织形成模拟早期胚胎发育后植入阶段的三维结构 | 首次实现人类干细胞自组织形成同时包含胚胎外胚层样和胚外下胚层样谱系的三维结构，模拟了人类胚胎植入后发育的关键时空事件 | 未建立胎盘细胞类型，仅涵盖Carnegie阶段4-7的发育特征 | 理解人类早期发育的基本细胞和分子机制 | 人类多能干细胞 | 发育生物学 | 先天性疾病 | 单细胞转录组测序 | 三维干细胞自组织模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 734 | 2025-10-05 |
A molecularly defined and spatially resolved cell atlas of the whole mouse brain
2023-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.06.531348
PMID:36945367
|
研究论文 | 通过整合MERFISH和scRNA-seq技术，构建了全小鼠大脑的高分辨率空间细胞图谱 | 首次在全脑范围内实现单细胞水平的高通量空间转录组分析，识别了5000多个转录特征不同的细胞簇 | 研究仅针对成年小鼠大脑，尚未在人类或其他物种中验证 | 解析大脑的分子和细胞结构基础 | 成年小鼠全脑约800万个细胞 | 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 约800万个细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | MERFISH技术检测>1100个基因, 整合scRNA-seq数据进行全转录组分析 |
| 735 | 2025-10-05 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.06.531121
PMID:37034735
|
研究论文 | 构建了成年小鼠全脑的高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 结合单细胞RNA测序和MERFISH空间转录组技术，首次在单细胞水平创建了全脑尺度的分层细胞分类系统 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种或人类大脑 | 建立哺乳动物大脑细胞类型的完整目录，理解大脑功能和组织原理 | 成年小鼠全脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, MERFISH空间转录组 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 约700万单细胞RNA测序细胞, 约430万MERFISH空间转录组细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | MERFISH空间转录组技术 |
| 736 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling of long non-coding RNAs in the hematopoietic system
2025-Dec, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000240
PMID:40979441
|
研究论文 | 通过整合9个单细胞RNA测序数据集，构建了包含207,113个细胞的造血系统单细胞lncRNA图谱 | 首次构建了涵盖从造血干细胞到分化血细胞的全面单细胞lncRNA图谱，鉴定出3,463个谱系特异性lncRNA | 研究主要基于已有数据集整合分析，实验验证的lncRNA数量有限 | 探索长链非编码RNA在正常和异常造血过程中的功能作用 | 造血干细胞、祖细胞及分化血细胞，包括中性粒细胞、单核细胞、B细胞、T/NK细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 207,113个细胞，来自30名健康供者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2025-10-05 |
Microfluidic chip-integrated vascularized endometrial complexes: Mitochondrial function and paracrine crosstalk enhance regenerative potential
2025-Dec, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.08.035
PMID:40980506
|
研究论文 | 开发了一种集成微流控芯片的血管化三重细胞子宫内膜复合体，用于子宫内膜修复研究 | 首次将子宫内膜上皮类器官、基质细胞和内皮细胞整合到微流控芯片中构建血管化三重细胞复合体，揭示了细胞间旁分泌相互作用机制 | 研究使用免疫缺陷小鼠模型，可能无法完全模拟人类子宫内膜修复的免疫环境 | 开发具有生理相关性的子宫内膜修复模型并研究其再生机制 | 血管化三重细胞子宫内膜复合体（包含上皮类器官、基质细胞和内皮细胞） | 组织工程 | 子宫内膜损伤 | 单细胞RNA测序，微流控技术 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | 免疫缺陷小鼠子宫内膜损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 738 | 2025-10-05 |
A human-mouse atlas of intrarenal myeloid cells identifies conserved disease-associated macrophages in lupus nephritis
2025-Nov-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241873
PMID:40900124
|
研究论文 | 通过跨物种比较研究狼疮性肾炎中肾内髓系细胞的保守特征 | 首次建立人鼠肾内髓系细胞图谱，识别出在狼疮性肾炎中保守的疾病相关巨噬细胞亚群 | 研究仅针对狼疮性肾炎，未涉及其他肾脏疾病 | 比较狼疮性肾炎患者和小鼠模型中肾内髓系细胞的异同 | 155例狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型的肾内髓系细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞分析, 空间转录组学, 功能研究 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 155例狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 739 | 2025-10-05 |
Hyperactivation of the m6A demethylase FTO to down-regulate SLC7A11/xCT-mediated redox homeostasis and epigenetic remodeling in facial infiltrating lipomatosis
2025-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了m6A去甲基化酶FTO通过下调SLC7A11破坏氧化还原稳态和表观遗传重编程，从而促进面部浸润性脂肪瘤病发病的分子机制 | 首次发现FTO通过m6A依赖方式抑制SLC7A11，扰乱氧化还原平衡，并通过SIRT6-H3K9ac介导的表观遗传重编程促进脂肪生成的新机制 | 研究聚焦于罕见疾病面部浸润性脂肪瘤病，样本量可能有限，且机制研究主要在细胞和动物模型中进行 | 探究FTO介导的m6A去甲基化在面部浸润性脂肪瘤病发病机制中的作用 | 面部浸润性脂肪瘤病患者组织、脂肪干细胞和祖细胞(ASPCs)、异种移植模型 | 分子生物学 | 面部浸润性脂肪瘤病 | Western blotting, qPCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, MeRIP-seq, RIP-qPCR, 荧光素酶报告基因检测, ATAC-seq, ChIP-qPCR, 酶活性检测 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2025-10-05 |
Peripartum dapagliflozin improves late-life maternal cardiovascular outcomes in a murine model of superimposed preeclampsia
2025-Oct, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2025.03.035
PMID:40164294
|
研究论文 | 本研究在小鼠叠加先兆子痫模型中评估了围产期使用达格列净对母体心血管结局的长期影响 | 首次在叠加先兆子痫动物模型中测试围产期SGLT2抑制剂治疗对母体长期心血管功能的保护作用 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类研究中进一步验证 | 评估SGLT2抑制剂在妊娠期和产后对母体心血管结局的影响 | BPH/2J小鼠模型（叠加先兆子痫模型） | 心血管研究 | 先兆子痫 | 连续超声心动图，空间转录组学，Masson三色染色 | BPH/2J小鼠模型 | 生理参数，组织病理学，转录组数据 | 未明确具体样本数量，使用BPH/2J怀孕小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |