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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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21 | 2025-10-05 |
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.08.005
PMID:40885193
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研究论文 | 本研究通过结合primed和naive人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型,模拟人类植入后早期发育过程 | 开发了结合primed和naive人多能干细胞的可诱导干细胞胚胎模型,能够更稳定地重现植入后早期发育的关键特征 | 模型仍不完美,存在一定的局限性 | 研究人类植入后早期发育过程 | 人类干细胞胚胎模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 干细胞胚胎模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
22 | 2025-10-05 |
Decoding Alzheimer's disease at the cellular level reveals promising combination therapy
2025-Oct-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.037
PMID:41043404
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和药物重定位方法,提出了一种针对阿尔茨海默病的有效联合疗法 | 利用单细胞RNA测序技术解析AD的细胞类型特异性调控变化,并通过药物重定位提出靶向多种AD相关细胞类型的联合治疗策略 | NA | 开发针对阿尔茨海默病的有效治疗方法 | 阿尔茨海默病患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
23 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomic profiling of metastatic renal cell carcinoma identifies chemokine-driven macrophage and CD8+ T-cell interactions predictive of immunotherapy response
2025-Oct-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012991
PMID:41043857
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析转移性肾细胞癌,发现趋化因子驱动的巨噬细胞和CD8+ T细胞相互作用可预测免疫治疗反应 | 首次使用高分辨率空间转录组学揭示转移性肾细胞癌中与免疫治疗反应相关的特异性免疫生态位 | 样本量较小(12例初治患者),需要更大规模研究验证 | 识别预测转移性肾细胞癌免疫检查点抑制剂疗效的组织生物标志物 | 转移性肾细胞癌患者肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 细胞类型反卷积分析 | 空间转录组数据,临床数据 | 12例初治mRCC患者,其中6例提供匹配的转移病灶 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, NanoString COSMx | 10x Visium空间转录组平台,NanoString COSMx空间分子成像平台 |
24 | 2025-10-05 |
SUMO-activating enzyme subunit 1 (SAE1) promotes non-small cell lung cancer metastasis by promoting the epithelial-mesenchymal transition through the SUMOylation of N-cadherin
2025-Oct, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2662-y
PMID:40643801
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研究论文 | 本研究揭示SUMO激活酶亚基1通过SUMO化修饰N-钙黏蛋白促进非小细胞肺癌转移的分子机制 | 首次发现SAE1通过SUMO化修饰N-钙黏蛋白稳定其表达并促进上皮-间质转化的新机制 | 未明确SAE1在其他类型肺癌中的作用及具体SUMO化位点 | 探究SAE1在非小细胞肺癌转移中的作用机制 | 非小细胞肺癌细胞系、临床肺癌组织样本、患者痰液样本 | 癌症生物学 | 肺癌 | 蛋白质表达谱分析、单细胞测序、基因敲低、蛋白SUMO化检测 | 体外细胞模型、体内动物模型 | 蛋白质组数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 肺癌组织样本、患者痰液样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞测序、蛋白质组分析 | NA | 基于痰液的薄片技术 |
25 | 2025-10-05 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
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研究论文 | 开发了一种多组学单细胞测序方法,用于精确评估CRISPR编辑后疾病变异的功能效应 | 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞功能基因组学方法 | 未明确说明样本规模和实验重复次数 | 识别疾病相关非编码等位基因的因果变异及其功能效应 | 人类原代T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 | 功能基因组学 | 自身免疫疾病 | CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 | NA | 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
26 | 2025-10-05 |
Amlodipine as an immunomodulator to enhance dendritic cell activation in cancer therapy with tumor-associated antigens
2025-Oct-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.07.030
PMID:40702728
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研究论文 | 本研究探讨氨氯地平通过增强树突状细胞成熟和抗肿瘤免疫反应的免疫调节作用 | 首次发现常用降压药氨氯地平具有促进树突状细胞成熟和增强抗肿瘤免疫的免疫调节功能 | 目前仅在鼠类肿瘤模型中进行验证,尚未开展临床试验 | 探索氨氯地平在癌症免疫治疗中的免疫调节作用 | 树突状细胞、CD8 T细胞、4T1乳腺癌和CT26结肠癌小鼠模型 | 免疫学 | 乳腺癌, 结肠癌 | 流式细胞术, ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 细胞因子数据 | 鼠类肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
27 | 2025-10-05 |
Surgical and Blood-Based Minimal Residual Disease in Patients with Ovarian Cancer after First-line Therapy: Clinical Outcomes and Translational Opportunities
2025-Oct-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0512
PMID:40748258
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研究论文 | 本研究探讨了晚期卵巢癌患者一线治疗后通过二次腹腔镜和ctDNA检测微小残留病灶的预后价值和转化意义 | 首次结合手术和血液检测方法评估卵巢癌微小残留病灶,并应用空间转录组学和蛋白质组学技术分析MRD病变的分子特征 | 样本量相对有限,空间多组学分析仅针对部分患者样本进行 | 评估微小残留病灶检测在卵巢癌预后预测和治疗靶点发现中的临床价值 | 高级别上皮性卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, ctDNA检测 | NA | 组织样本, 血液样本, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 95例高级别上皮性卵巢癌患者 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | GeoMx, Visium, CODEX | GeoMx和Visium空间转录组平台,CODEX蛋白质组分析技术 |
28 | 2025-10-05 |
HIV infection reprogrammes CD4+ T cells for quiescence and entry into proviral latency
2025-Oct, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02128-y
PMID:41006834
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研究论文 | 本研究揭示了HIV感染通过激活p53通路和KLF2介导的静息程序,促使CD4+ T细胞进入潜伏状态并形成病毒储存库的机制 | 首次发现HIV感染通过激活KLF2和p53信号通路诱导T细胞静息化,从而促进前病毒转录沉默和潜伏储存库形成 | 研究主要基于人类原代CD4+ T细胞模型,需要在更复杂的体内环境中进一步验证 | 探究HIV潜伏储存库形成的分子机制 | 人类原代CD4+ T细胞和HIV感染者的CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,功能缺失和功能获得研究,shRNA筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类原代CD4+ T细胞和HIV感染者捐赠的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
29 | 2025-10-05 |
A Phase I Trial of Evorpacept, Lenalidomide, and Rituximab for Patients with B-Cell Non-Hodgkin Lymphoma
2025-Oct-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1826
PMID:40729376
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研究论文 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的I期临床试验 | 首次将CD47阻断剂Evorpacept与来那度胺和利妥昔单抗联合用于治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤,并证明其可逆转SIRPα+巨噬细胞介导的耐药机制 | 单臂I期研究,样本量较小(20例患者),缺乏对照组 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗在B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和抗肿瘤活性 | 接受过至少两种系统治疗的B细胞非霍奇金淋巴瘤成年患者 | 肿瘤免疫学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 20例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
30 | 2025-10-05 |
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-Oct, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2548762
PMID:40838416
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和实验验证,发现NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾脏病进展中的关键调控作用 | 首次构建并验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2这一ceRNA调控轴在慢性肾脏病进展中的作用机制 | 生物信息学和临床队列的样本量适中,需要更大规模研究验证 | 识别慢性肾脏病的诊断生物标志物和治疗靶点 | 慢性肾脏病患者、健康对照者、TCMK1细胞系 | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | 生物信息学分析、单细胞测序、双荧光素酶报告基因检测、上皮-间质转化模型 | ceRNA网络、PPI网络 | 基因表达数据、临床样本数据、细胞实验数据 | 64例CKD患者和20例健康对照的临床样本,GEO数据集GSE137570 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
31 | 2025-10-05 |
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Oct, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0441
PMID:41027482
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研究论文 | 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式,能够从混沌系统中实现准确预测 | 首次引入混沌学习概念,通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入混沌动力系统,实现了对混沌系统的定量预测 | 仅使用了28个数据集和两种混沌动力系统作为概念验证,应用范围有待进一步扩展 | 探索混沌系统的可预测性,建立拓扑、混沌与学习之间的桥梁 | 脑电波、蛋白质数据集、单细胞RNA测序数据和图像数据 | 机器学习 | NA | 多尺度拓扑分析 | 混沌学习 | 脑电波、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 28个数据集(10个脑电波、4个蛋白质数据集、13个单细胞RNA测序数据集、1个图像数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
32 | 2025-10-05 |
Macrophage transition to a myofibroblast state drives fibrotic disease in uropathogenic E. coli-induced epididymo-orchitis
2025-Oct-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193793
PMID:41031892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了S100a4+巨噬细胞在UPEC诱导的附睾睾丸炎纤维化过程中向肌成纤维细胞状态转变的关键机制 | 首次发现S100a4+巨噬细胞在细菌感染诱导的纤维化过程中向肌成纤维细胞表型转变,并阐明其通过TGF-β/STAT3信号通路驱动胶原合成的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究睾丸巨噬细胞在UPEC诱导的附睾睾丸炎纤维化过程中的作用机制 | 小鼠模型及人类睾丸和附睾样本 | 单细胞生物学 | 男性不育相关感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠感染模型及人类组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
33 | 2025-10-05 |
BBS8-dependent ciliary Hedgehog signaling governs cell fate in the white adipose tissue
2025-Oct, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00524-y
PMID:40836034
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研究论文 | 本研究揭示了BBS8依赖性纤毛Hedgehog信号通路通过调控脂肪前体细胞命运决定白色脂肪组织稳态的新机制 | 首次发现初级纤毛功能障碍通过诱导P1脂肪前体细胞直接向纤维化祖细胞表型转换(绕过P2祖细胞状态)来调控脂肪生成与纤维生成平衡 | 研究主要基于Bbs8基因敲除小鼠模型,在人类临床验证方面仍需进一步研究 | 探究初级纤毛在白色脂肪组织细胞命运决定中的作用机制 | Bbs8基因敲除小鼠的脂肪前体细胞 | 细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Bbs8基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
34 | 2025-10-05 |
Hemocytes facilitate interclonal cooperation-induced tumor malignancy by hijacking the innate immune system in Drosophila
2025-Oct, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00547-5
PMID:40846901
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研究论文 | 本研究通过果蝇幼虫眼盘上皮建立肿瘤异质性模型,揭示血细胞通过劫持先天免疫系统促进肿瘤恶性转化的机制 | 首次在果蝇模型中建立肿瘤异质性模型,发现血细胞通过Pvf1-Pvr和Spz-Toll信号轴协调肿瘤细胞间合作促进恶性转化 | 研究基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究肿瘤微环境中不同细胞类型间的相互作用及其在肿瘤进展中的作用机制 | 果蝇幼虫眼盘上皮肿瘤模型 | 发育生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,遗传学分析 | 果蝇肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
35 | 2025-10-05 |
Disentangling associations between complex traits and cell types with seismic
2025-Oct-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63753-z
PMID:41034207
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研究论文 | 提出seismic框架,通过整合单细胞RNA测序与全基因组关联研究来解析复杂性状与细胞类型之间的关联 | 引入新颖的特异性评分方法,同时考虑表达量和跨细胞类型的一致性,并提出了影响基因分析来识别驱动细胞类型-性状关联的基因 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 开发可扩展、可解释且稳健的方法来识别复杂性状和疾病相关的细胞类型 | 28种多基因性状和1000多个不同粒度水平的细胞类型特征 | 生物信息学 | 帕金森病,阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,全基因组关联研究 | seismic框架 | 基因表达数据,基因型数据 | 超过1000个细胞类型特征和28种多基因性状 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
36 | 2025-10-05 |
Human endogenous retrovirus ERVK3-1 characterizes a metabolically active and immunosuppressive subtype of liver cancer
2025-Oct-01, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-025-02928-y
PMID:41034947
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研究论文 | 本研究揭示人类内源性逆转录病毒ERVK3-1在肝细胞癌中通过代谢重编程和免疫抑制促进肿瘤进展的作用机制 | 首次系统阐明ERVK3-1在肝细胞癌中的双重功能——既促进代谢活性又诱导免疫抑制,并发现其与免疫检查点表达和免疫治疗抵抗的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证ERVK3-1的具体分子机制 | 探索ERVK3-1在肝细胞癌中的生物学功能及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肝细胞癌患者转录组数据、单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 肝癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、功能富集分析、蛋白质相互作用网络分析 | 生物信息学分析模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA-LIHC队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
37 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals that EZH2 regulates the MIF-CD74 axis to modulate T cell activation and exhaustion in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07071-4
PMID:41034982
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq分析揭示了EZH2通过调控MIF-CD74轴影响肝细胞癌中T细胞活化与耗竭的机制 | 构建了包含16个基因的整合模型,首次发现EZH2通过MIF-CD74信号通路调控CD8+ T细胞的活化与耗竭状态 | 研究结果仍需在更大样本中验证,机制研究主要依赖小鼠模型 | 开发肝细胞癌预后和免疫检查点抑制剂反应预测模型,并探索相关基因在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肝细胞癌患者样本和免疫活性小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 整合基因模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
38 | 2025-10-05 |
TEAD3 + high-risk melanoma cells crosstalk with GAS6 + macrophages via the GAS6-TYRO3 ligand-receptor axis to modulate propionate metabolism and drive melanoma progression
2025-Oct-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03542-0
PMID:41034991
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了TEAD3驱动的高风险黑色素瘤亚型通过GAS6-TYRO3配体-受体轴与巨噬细胞相互作用,重编程丙酸代谢促进肿瘤进展的机制 | 首次发现TEAD3+高风险黑色素瘤细胞通过GAS6-TYRO3轴与巨噬细胞互作,调控丙酸代谢和甲基丙二酸积累驱动肿瘤进展 | 研究主要基于TCGA数据库和单细胞测序数据,需要更多临床样本验证 | 阐明短链脂肪酸代谢失调驱动的黑色素瘤亚型及其侵袭性机制 | 468例TCGA黑色素瘤样本和单细胞RNA-seq数据 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, CRISPR/Cas9, siRNA敲低, 免疫组化, 代谢分析, Seahorse分析 | 非负矩阵分解(NMF)聚类分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 468例TCGA黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
39 | 2025-10-05 |
Targeting tumor microenvironment with biomimetic nanovesicles for non-small cell lung cancer gene therapy
2025-Oct-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03684-5
PMID:41035023
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研究论文 | 本研究开发了一种仿生纳米囊泡用于非小细胞肺癌的基因治疗 | 首次构建了CAF膜包被的siRNA递送系统,靶向ACTN1基因治疗NSCLC | CAF-癌细胞相互作用的精确机制仍需进一步阐明 | 开发靶向肿瘤微环境的基因治疗策略 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 生物医学工程 | 肺癌 | 单细胞测序, siRNA基因沉默 | NA | 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
40 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics of organoids reveals transcriptional control of germline stem cell fate by an E2F1-TFAP2C-SOX17 positive-feedback loop in Turner syndrome
2025-Oct-01, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01464-0
PMID:41035077
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析特纳综合征类器官,揭示了E2F1-TFAP2C-SOX17正反馈环路调控生殖系干细胞命运的分子机制 | 首次在特纳综合征模型中建立类器官系统生成人类生殖系干细胞及其体细胞生态位,并发现E2F1作为关键命运调控因子通过正反馈环路控制生殖系干细胞命运 | 研究仅限于特纳综合征45,XO模型,尚未验证在其他类型生殖障碍中的普适性 | 探究特纳综合征患者生殖系干细胞发育的分子调控机制 | 特纳综合征患者来源的iPSCs、生殖系干细胞及其体细胞生态位 | 单细胞生物学 | 特纳综合征 | 单细胞转录组测序 | 类器官模型 | 单细胞RNA测序数据 | 特纳综合征45,XO类器官模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |