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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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601 | 2025-10-05 |
Understanding and mitigating the impact of ambient mRNA contamination in single-cell RNA-sequencing analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332440
PMID:40991648
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研究论文 | 本研究探讨了环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响,并评估了两种校正方法的有效性 | 首次系统评估环境mRNA污染对差异基因表达和通路富集分析的影响,并比较两种校正方法的性能 | 仅使用了两个独立数据集,可能无法代表所有单细胞RNA测序场景 | 理解和减轻环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响 | 登革热患者外周血单个核细胞和人类胎儿肝组织样本 | 单细胞转录组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | CellBender, SoupX | 单细胞转录组数据 | 10个PBMC样本和42个人类胎儿肝组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴式单细胞RNA测序平台 |
602 | 2025-10-05 |
The role of microglia and complement C5/C5a in the pathogenesis of rhegmatogenous retinal detachment with choroidal detachment
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.019
PMID:40994539
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离的细胞和分子特征,探讨小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示RRDCD独特的细胞景观,发现小胶质细胞与树突状细胞间增强的连接性以及补体C5-C5AR1相互作用的上调 | 样本量相对有限,研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 识别区分RRDCD与典型RRD的细胞和分子特征,研究小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离患者的玻璃体样本,原代视网膜小胶质细胞,RF/6A内皮细胞和ARPE-19上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序,体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | RRD和RRDCD患者的玻璃体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
603 | 2025-10-05 |
Biallelic Loss-of-Function Variants in UBAP1L and Nonsyndromic Retinal Dystrophies
2024-Nov-01, JAMA ophthalmology
IF:7.8Q1
DOI:10.1001/jamaophthalmol.2024.3836
PMID:39325468
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研究论文 | 本研究通过临床和分子特征分析,发现UBAP1L基因的双等位基因功能丧失变异与非综合征性视网膜营养不良相关 | 首次将UBAP1L基因鉴定为新的视网膜营养不良致病基因,并通过小鼠模型和单细胞RNA测序验证其功能 | 样本量较小(仅6名患者),小鼠模型未表现出视网膜退化表型 | 阐明遗传性视网膜营养不良的遗传基础,改善临床诊断和预后 | 6名来自4家三级医院的遗传性视网膜营养不良患者 | 遗传学 | 视网膜营养不良 | 外显子组测序,基因组测序,单细胞RNA测序,小基因检测,基因敲除小鼠模型 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据,转录组数据,临床评估数据 | 6名患者,来自6个家庭 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
604 | 2025-10-05 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveals unexpected first heart field predominance of human iPSC differentiation
2023-Jun-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80075
PMID:37284748
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研究论文 | 开发TBX5/MYL2谱系追踪系统并结合单细胞RNA测序分析人iPSC心脏分化过程 | 首次建立TBX5/MYL2谱系追踪报告系统,结合单细胞RNA测序发现人iPSC分化中第一心区优势现象 | 研究基于体外iPSC分化模型,不能完全模拟体内胚胎发育环境 | 研究人诱导多能干细胞心脏分化过程中的谱系特化机制 | 人诱导多能干细胞及其分化产生的心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,谱系追踪 | 谱系追踪报告系统 | 单细胞转录组数据 | 2个独立iPSC系,12个时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于寡核苷酸样本多重分析的scRNA-seq |
605 | 2025-10-05 |
A Comprehensive Immune Cell Atlas of Cystic Kidney Disease Reveals the Involvement of Adaptive Immune Cells in Injury-Mediated Cyst Progression in Mice
2022-04, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021030278
PMID:35110364
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研究论文 | 本研究通过构建小鼠囊性肾病免疫细胞图谱,揭示了适应性免疫细胞在损伤介导的囊肿进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统描绘囊性肾病免疫细胞图谱,发现适应性免疫细胞在损伤加速型囊肿进展中的特异性作用机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究免疫细胞在囊性肾病进展中的作用机制 | 成年诱导性条件性Ift88基因敲除小鼠(纤毛突变小鼠) | 单细胞组学 | 囊性肾病 | 单细胞RNA测序 | NicheNet | 单细胞转录组数据 | 79,355个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
606 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing atlas of bovine caudal intervertebral discs: Discovery of heterogeneous cell populations with distinct roles in homeostasis
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101149R
PMID:34591994
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建牛尾椎间盘细胞图谱,发现具有不同稳态功能的异质性细胞群体 | 首次创建牛尾椎间盘单细胞转录组图谱,识别出15个独特细胞簇并发现新型细胞标记物 | 研究仅基于牛模型,结果向人类转化需要进一步验证 | 解析椎间盘的细胞异质性以促进再生治疗发展 | 牛尾椎间盘组织 | 单细胞生物学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
607 | 2025-10-05 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
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研究论文 | 本研究揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下调节心肌细胞适应性生长的关键机制 | 首次证明特定心脏驻留巨噬细胞亚群通过产生IGF-1直接调控心肌细胞的适应性生长,而非传统认为的免疫细胞仅参与炎症反应 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证相对有限 | 探究免疫细胞在高血压引起的心脏适应性生长过程中的作用机制 | 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞命运示踪, 基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常血压和高血压动物模型,人类心肌病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
608 | 2025-10-05 |
Single-cell multi-omics data reveal heterogeneity in liver tissue microenvironment induced by hypertension
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102696
PMID:40989794
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术揭示高血压诱导的肝组织微环境异质性 | 首次在单细胞分辨率上识别高血压相关的肝细胞亚群及其调控网络 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究高血压对肝脏细胞亚群和微环境的影响 | 正常和高血压肝组织 | 单细胞多组学 | 高血压 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 组蛋白ChIP测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
609 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals a novel porcine alveolar macrophage subtype with high SLAMF7 expression promoting PRRSV infection
2025-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2560894
PMID:40944943
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现猪肺泡巨噬细胞新亚型,揭示SLAMF7高表达促进PRRSV感染机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出具有高PRRSV感染率的猪肺泡巨噬细胞新亚型S5和SS6,并发现SLAMF7是促进PRRSV感染和炎症反应的关键基因 | 体外培养的PAMs可能无法完全反映体内疾病过程,仅部分GO术语和KEGG通路重合 | 研究PRRSV感染机制及猪肺泡巨噬细胞在病毒感染中的作用 | 猪肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞 | 单细胞转录组学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
610 | 2025-10-05 |
Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control
2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250466
PMID:40986319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了I型干扰素在结核分枝杆菌感染早期通过驱动中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞-巨噬细胞相互作用的新机制 | 发现相对耐药小鼠早期肺内I型干扰素反应更强,并首次阐明I型干扰素通过促进中性粒细胞群聚而空间隔离CD4+ T细胞的免疫调控新机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类中验证;观察时间窗口限于感染初期 | 探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结局的免疫机制 | C57BL/6和C3HeB/FeJ小鼠的肺部免疫细胞 | 免疫学 | 结核病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两种小鼠品系的肺部组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
611 | 2025-10-05 |
T Cells Expressing Ras Homolog Family Member a Display Enhanced Cytotoxicity but are Reduced in Lupus Peripheral Blood
2025-Oct, Immunological investigations
IF:2.9Q3
DOI:10.1080/08820139.2025.2517364
PMID:40536306
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研究论文 | 本研究探讨系统性红斑狼疮患者T细胞亚群中RhoA的表达及其临床意义 | 首次发现RhoA+T细胞具有增强的细胞毒性功能,并可能作为SLE的早期免疫学标志物 | 样本量有限,主要关注新诊断患者,需要更大规模研究验证 | 探索RhoA在系统性红斑狼疮T细胞亚群中的表达和临床相关性 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血T细胞亚群 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, ROC曲线分析 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 新诊断SLE患者和年龄性别匹配的健康对照者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
612 | 2025-10-05 |
Immunoregulatory Roles of Tumor-Originated Pericytes Identified by Single-Cell Analysis in Glioblastoma
2025-Sep-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511856
PMID:41001759
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研究论文 | 通过单细胞分析鉴定胶质母细胞瘤中肿瘤源性周细胞的免疫调节作用 | 首次在胶质母细胞瘤中区分肿瘤源性周细胞和正常源性周细胞,并发现CD44+周细胞亚群通过促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化调控肿瘤生长 | 样本来源仅限于人类原发胶质母细胞瘤,需要进一步验证在其他肿瘤类型中的普适性 | 探究胶质母细胞瘤中周细胞的起源和功能异质性及其免疫调节作用 | 人类原发胶质母细胞瘤中的CD146+周细胞 | 单细胞分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 人类原发胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
613 | 2025-10-05 |
Time-Series Transcriptomics Identifies Xanthine Dehydrogenase in Injured Neurons Correlated With Orthodontic Pain
2025-Sep-26, Orthodontics & craniofacial research
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/ocr.70036
PMID:41002069
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研究论文 | 本研究通过时间序列转录组学分析发现黄嘌呤脱氢酶(Xdh)在正畸疼痛损伤神经元中高表达 | 首次将时间序列转录组学与单细胞RNA-seq数据整合,识别出Atf3+损伤神经元中Xdh的上调与疼痛峰值相关 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索正畸牙齿移动疼痛的分子和细胞机制 | 小鼠三叉神经节组织和神经元 | 转录组学 | 疼痛疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 小鼠三叉神经节组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
614 | 2025-10-05 |
Increased AIF-1-mediated p38 MAPK phosphorylation in the mid-secretory endometrium impairs endometrial receptivity in women with recurrent implantation failure
2025-Sep-26, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf174
PMID:41003697
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研究论文 | 本研究探讨了同种异体移植炎症因子-1(AIF-1)通过p38 MAPK磷酸化途径损害复发性种植失败患者子宫内膜容受性的机制 | 首次揭示AIF-1在子宫内膜基质细胞中通过p38 MAPK磷酸化途径抑制细胞增殖和蜕膜化,从而降低子宫内膜容受性的具体分子机制 | AIF-1在子宫内膜巨噬细胞中对胚胎植入的作用尚不明确 | 探究AIF-1对复发性种植失败患者子宫内膜容受性的影响机制 | 复发性种植失败患者和生育能力正常女性的子宫内膜组织、人子宫内膜基质细胞、子宫内膜基质细胞系、CD-1小鼠 | 生殖医学 | 复发性种植失败 | 单细胞RNA测序,定量PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 18例RIF患者,18例对照组患者,30例不同月经周期阶段的额外对照组患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
615 | 2025-10-05 |
Change in brain molecular landscapes following electrical stimulation of the nucleus accumbens
2025-Sep-25, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02241-w
PMID:40999234
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究伏隔核深部脑刺激对小鼠大脑分子景观的影响 | 首次使用高分辨率空间转录组学技术(Stereo-seq)在全脑范围内系统分析NAc DBS诱导的基因表达变化 | 研究仅在小鼠模型中进行,需要进一步在人类中验证;刺激参数固定,未探索不同参数的影响 | 阐明伏隔核深部脑刺激治疗神经精神疾病的分子机制 | 接受伏隔核电刺激的小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 随机分配接受电刺激或假处理的小鼠 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | 高分辨率空间转录组学技术 |
616 | 2025-10-05 |
MAN1A1 promotes colorectal cancer liver metastasis by maintaining TGFBR2 protein stability
2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025164
PMID:40999906
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现MAN1A1通过维持TGFBR2蛋白稳定性促进结直肠癌肝转移 | 首次揭示MAN1A1通过延长TGFBR2蛋白半衰期促进结直肠癌肝转移的分子机制 | 未详细说明MAN1A1调控TGFBR2蛋白稳定性的具体分子通路 | 探究结直肠癌肝转移的分子机制及潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞及肝转移组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, Transwell实验, 基因操作 | NA | 基因表达数据, 蛋白质稳定性数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
617 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveals apolipoprotein A4-mediated metabolic-immune reprogramming in lymphocytes during early obesity-related chronic kidney disease
2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025171
PMID:40999903
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了载脂蛋白A4在肥胖相关慢性肾病早期淋巴细胞代谢-免疫重编程中的关键调控作用 | 首次发现Apoa4通过调节淋巴细胞代谢和免疫功能在肥胖相关慢性肾病早期发挥保护作用,揭示了肾脏免疫代谢景观的重塑机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;机制研究仍需进一步深入 | 探究Apoa4在肥胖诱导的慢性肾病早期免疫细胞代谢和功能调控中的作用 | 野生型和Apoa4敲除小鼠的肾脏淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光染色,qPCR | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 野生型和Apoa4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
618 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing across diverse cell types to identify PFOA-induced ovarian cellular senescence
2025-Sep-24, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119089
PMID:40997563
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PFOA暴露诱导卵巢细胞衰老的机制 | 首次从细胞衰老角度揭示PFOA卵巢毒性的单细胞水平机制,发现卵丘细胞对PFOA诱导的耗竭特别敏感 | 研究仅使用小鼠模型,样本量相对有限 | 探究PFOA暴露导致卵巢功能障碍的细胞机制 | 雌性ICR小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29,000+个细胞,8个不同细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
619 | 2025-10-05 |
TRIB3 promotes endometrial cancer progression through interacting with E2F1 and enhancing PKM2-mediated tumor glycolysis
2025-Sep-24, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.09.008
PMID:40997650
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研究论文 | 本研究探讨了TRIB3通过稳定E2F1和增强PKM2转录促进子宫内膜癌进展的机制 | 首次揭示TRIB3通过E2F1-PKM2轴促进子宫内膜癌糖酵解的新机制,并发现吲达帕胺可作为TRIB3抑制剂 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索TRIB3在子宫内膜癌中的作用机制 | 子宫内膜癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,qRT-PCR,Western blot,共免疫沉淀,双荧光素酶报告基因,免疫荧光双染色,泛素化分析,染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,临床数据 | 人类子宫内膜癌组织及癌旁组织,异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
620 | 2025-10-05 |
Inflammatory, transcriptomic, and cell fate responses underlying the mammalian transmission of avian influenza viruses
2025-Sep-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00647-25
PMID:40778772
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研究论文 | 本研究通过雪貂鼻上皮细胞对H1N1禽流感病毒的反应,揭示了与病毒空气传播能力相关的宿主应答机制 | 首次在哺乳动物呼吸道关键部位识别出与禽流感病毒空气传播表型相关的特异性宿主反应特征 | 研究仅限于雪貂模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究禽流感病毒在哺乳动物呼吸道中的宿主反应与空气传播能力的关系 | 雪貂鼻上皮细胞和H1N1禽流感病毒株 | 转录组学 | 流感 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 雪貂鼻上皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |