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当前共找到 34984 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-08 |
sc-eQTL unveil immunogenetic architecture of polycystic ovary syndrome
2026-Jan-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34726-5
PMID:41495349
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研究论文 | 本研究整合GWAS数据和单细胞eQTL分析，揭示了多囊卵巢综合征的免疫遗传学机制 | 首次在单细胞水平上整合GWAS和sc-eQTL数据，识别PCOS的免疫相关风险基因和细胞特异性调控机制 | 未明确说明样本来源和单细胞测序的具体技术细节，可能限制结果的普适性 | 阐明多囊卵巢综合征在细胞水平的遗传和免疫机制 | 多囊卵巢综合征患者及相关免疫细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序，全基因组关联研究，表达数量性状位点分析 | NA | 基因组数据，单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-01-08 |
Spatial transcriptomics decodes the cellular landscape of plant-pathogen interaction
2026-Jan-06, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02204-5
PMID:41495461
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2026-01-08 |
ASTRO: Automated Spatial-Transcriptome whole RNA Output
2026-Jan-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf688
PMID:41495477
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研究论文 | 本文介绍了一个名为ASTRO的自动化流程，用于处理空间转录组学数据，特别针对FFPE样本进行全转录组分析 | ASTRO优化了FFPE样本的空间转录组数据分析，通过专门过滤步骤和空间条形码调用优化，提高了映射率，并支持编码和非编码RNA（如miRNA）的空间定量 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一个自动化流程以处理空间转录组学数据，特别是针对FFPE样本的全转录组分析 | FFPE组织样本的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2026-01-08 |
A Single-cell Transcriptome-wide Association Study Reveals Susceptibility Genes for Age-related Hearing Loss
2026-Jan-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf137
PMID:41495531
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研究论文 | 本研究通过两阶段单细胞转录组范围关联研究，揭示了与年龄相关性听力损失相关的易感基因和细胞类型 | 首次应用单细胞转录组范围关联研究于年龄相关性听力损失，识别出多个新候选基因如TNF、ZC3HAV1和SLC44A4，并提供了药物重用的遗传证据 | 研究样本仅限于欧洲血统个体，可能限制结果在其他人群中的普适性 | 识别年龄相关性听力损失的新易感基因和相关细胞类型 | 96,372例年龄相关性听力损失患者和141,590例对照的欧洲血统个体 | 自然语言处理 | 老年疾病 | 单细胞转录组范围关联研究 | NA | 转录组数据 | 237,962个样本（96,372例病例和141,590例对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-01-08 |
LOXL2⁺ cancer-associated fibroblasts shape WNT signaling to drive chemoresistance and poor outcomes in colorectal cancer: Insights from multi-omics and epidemiological analyses
2026-Jan-06, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101267
PMID:41496273
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研究论文 | 本研究通过整合多组学与流行病学分析，揭示了LOXL2⁺癌症相关成纤维细胞通过激活WNT信号通路驱动结直肠癌化疗耐药与不良预后的机制 | 首次系统整合多组学与流行病学数据，鉴定出LOXL2⁺ CAF亚型作为结直肠癌化疗耐药的关键基质决定因素，并阐明其通过WNT5A介导的肿瘤干细胞性调控机制 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要前瞻性临床研究验证LOXL2作为生物标志物的临床效用 | 阐明癌症相关成纤维细胞亚型在结直肠癌化疗耐药中的作用机制与临床意义 | 结直肠癌患者组织样本、癌症相关成纤维细胞、肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、免疫荧光、功能实验 | 多组学整合分析模型 | 转录组数据、空间定位数据、临床数据 | 多个结直肠癌队列的批量与单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-01-08 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveals RPL8 as a prognostic biomarker and therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-06, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102663
PMID:41496405
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研究论文 | 本研究通过整合多组学、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了核糖体蛋白L8（RPL8）在肝细胞癌中的诊断和预后价值，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序结合，系统性地解析RPL8在肝细胞癌微环境中的表达模式及其与免疫浸润的关联，并验证了其作为治疗靶点的功能 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 | 评估RPL8在肝细胞癌中的临床价值、微环境作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者的多组学数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据以及体外细胞模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、基因敲低、增殖/迁移实验、药物敏感性筛选 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞数据、空间表达数据 | 基于公共数据库（TCGA、CPTAC、GSE146115）的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 47 | 2026-01-08 |
ERBB2 amplification is a late event in the pathogenesis of high-grade endometrial carcinomas with heterogeneous HER2 expression
2026-Jan-06, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70014
PMID:41496508
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析，揭示了ERBB2扩增是高级别子宫内膜癌中HER2异质性表达的晚期事件 | 首次通过空间分辨的基因组和转录组分析，揭示了ERBB2扩增在高级别子宫内膜癌中是肿瘤进化过程中的晚期获得性事件，而非驱动肿瘤起始的因素 | 样本量较小（n=9），空间转录组学分析仅为探索性，需要更大规模的研究验证 | 阐明HER2异质性高级别子宫内膜癌的分子发病机制和进化轨迹 | 高级别子宫内膜癌（HG-EC）患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 下一代测序（NGS），空间转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 9例肿瘤的空间区分样本（全外显子测序7例，靶向panel测序2例） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2026-01-08 |
Cell-type- and chromosome-specific chromatin landscapes and DNA replication programs of Drosophila testis tumor stem cell-like cells
2026-Jan-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280809.125
PMID:41371963
|
研究论文 | 本研究开发了细胞类型特异性基因组技术，分析了果蝇睾丸肿瘤干细胞样细胞的转录组、组蛋白修饰模式和复制时序 | 开发了细胞类型特异性染色质分析技术，整合多组学数据揭示体内干细胞群的基因组调控差异 | NA | 研究体内成人干细胞的转录、染色质和复制时序特征 | 果蝇睾丸中的生殖干细胞样细胞和体细胞囊干细胞样细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，组蛋白修饰分析，复制时序分析 | NA | 转录组数据，染色质数据，复制时序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-01-08 |
HIV disrupts the lung molecular clock, leading to lung inflammation and features of emphysema
2026-Jan-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09284-1
PMID:41486302
|
研究论文 | 本研究探讨了HIV如何通过TAT蛋白上调miR-126-3p并抑制SIRT1，从而破坏肺分子钟，导致肺炎症和肺气肿特征 | 首次将HIV TAT蛋白与肺分子钟失调联系起来，并揭示了TAT/miR-126-3p/SIRT1轴在HIV诱导肺炎症中的作用机制 | 研究样本包括转基因小鼠和人类细胞，但人类样本数量有限，且未完全涵盖HIV感染者的多样性 | 探究HIV如何破坏肺分子钟并促进肺炎症，以识别缓解HIV相关COPD的治疗策略 | 人类支气管上皮细胞、SPC-TAT转基因小鼠和HIV阳性捐赠者的肺组织 | 分子生物学 | HIV相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 4月龄SPC-TAT转基因小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-01-08 |
Correlation of G protein-coupled receptor and tumor microenvironment with gastric cancer outcomes and therapies
2026-Jan-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003605
PMID:41486495
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，构建了一个基于G蛋白偶联受体和肿瘤微环境的分类器，用于预测胃癌的预后和治疗反应 | 首次开发了一个结合GPCR特征和TME评分的分类器，能够将胃癌患者分为四个预后不同的亚组，并预测免疫检查点阻断治疗的反应 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，临床样本量较小（仅10例），需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 探究G蛋白偶联受体和肿瘤微环境在胃癌预后和治疗中的作用，并开发预测模型 | 胃癌组织样本和公共数据库中的转录组数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，bulk转录组测序，qRT-PCR | Cox比例风险回归，LASSO回归，风险模型 | RNA测序数据，基因表达数据 | 公共数据库数据（GSE167297，GSE62254，TCGA-STAD）和10例临床胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-01-08 |
Integrating single cell- and spatial- resolved transcriptomics unravels the inter-tumor heterogeneity and immunosuppressive landscape in HBV- and Clonorchis sinensis-associated hepatocellular carcinoma
2026-Jan-05, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02381-z
PMID:41491521
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组学，揭示了HBV和华支睾吸虫相关肝细胞癌的肿瘤间异质性和免疫抑制微环境 | 首次系统比较了HBV、华支睾吸虫及双重感染三种不同感染背景的HCC在单细胞和空间层面的肿瘤间异质性及免疫微环境差异 | 样本量相对有限，且部分分析依赖于公共数据集，需要更大规模的前瞻性队列验证 | 探究不同感染背景（HBV、华支睾吸虫）对肝细胞癌肿瘤异质性和免疫微环境的影响 | 269例原发性肝细胞癌患者，包括华支睾吸虫相关HCC、HBV相关HCC及双重感染HCC患者的肿瘤和癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序，免疫荧光，免疫组织化学，体外实验 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，图像数据 | 269例HCC患者队列，并对其中CP和DP患者的肿瘤及癌旁样本进行了scRNA-seq和ST-seq分析，同时整合了公共HP患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-01-08 |
Skin fibroblasts in health and disease: From extracellular matrix remodeling to immune regulation
2026-Jan-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.002
PMID:41493297
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综述 | 本文综述了皮肤成纤维细胞在健康和疾病中的作用，从细胞外基质重塑到免疫调节的演变 | 重新定义成纤维细胞为动态、免疫调节细胞，揭示其在炎症、纤维化和肿瘤进展中的关键作用，并利用单细胞和空间转录组学技术发现异质性亚群 | 关于皮肤成纤维细胞的谱系身份、功能可塑性和表型驱动基因调控网络的知识仍存在空白 | 探讨皮肤成纤维细胞在炎症性皮肤病中的异质性、可塑性和多样化功能 | 皮肤成纤维细胞及其在自身免疫、过敏、纤维化和肿瘤性皮肤病中的表现 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2026-01-08 |
Differentiation-induced reduction in functional diversity restricts the ability of cytomegalovirus-specific CD8 T cells to eliminate virus-infected cells
2026-Jan-05, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106107
PMID:41494240
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研究论文 | 本研究通过多模态分析揭示了巨细胞病毒特异性CD8 T细胞分化程度与功能多样性之间的关系，解释了高频率NLV-T细胞个体对病毒再激活控制减弱的原因 | 首次通过单细胞RNA测序结合TCR谱分析，系统比较了高频率和低频率NLV-T细胞的功能差异，揭示了分化程度对细胞杀伤能力和细胞因子分泌能力的影响 | 研究样本仅来自健康HCMV阳性供体，未包括免疫抑制患者或临床病例，且主要关注单一病毒表位NLVPMVATV | 探究巨细胞病毒特异性CD8 T细胞分化状态与功能多样性之间的关系，解释高频率NLV-T细胞个体对病毒再激活控制减弱的机制 | 来自116名健康HCMV阳性供体的NLV特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | 多色光谱流式细胞术，单细胞RNA测序，TCR谱分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞术数据 | 116名健康HCMV阳性供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-01-08 |
Restoring immune homeostasis in atherosclerotic plaques via inorganic violet phosphorus nano-immunotherapy
2026-Jan-05, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102528
PMID:41494534
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研究论文 | 本研究开发了一种无机纳米粒子平台（PEG化紫磷纳米片），用于通过调节免疫细胞来治疗动脉粥样硬化 | 开发了新型无机纳米粒子平台，首次通过单细胞RNA测序揭示其调节四种关键免疫细胞群并重塑细胞间通讯的机制 | 未明确提及样本量或长期安全性数据 | 开发一种针对动脉粥样硬化的免疫调节纳米疗法 | 动脉粥样硬化小鼠模型中的免疫细胞（如巨噬细胞、单核细胞、T/B细胞） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-01-08 |
SCALE: unsupervised multiscale domain identification in spatial omics data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1456
PMID:41495880
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCALE的无监督算法，用于在空间转录组学数据中识别多尺度功能域 | SCALE结合了基于深度学习的图表示学习和基于熵的搜索算法，首次系统性地解决了空间转录组学中多尺度功能域层次结构的识别问题，并在模拟和真实数据上表现出色 | NA | 开发一种无监督算法，以识别空间转录组学数据中的多尺度功能域层次结构 | 小鼠大脑（Xenium和MERFISH平台）和患者来源的肾脏组织的空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习图表示学习 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics, Vizgen | 空间转录组学 | Xenium, MERFISH | 10x Xenium和Vizgen MERFISH平台用于小鼠大脑和患者肾脏组织的空间转录组学分析 |
| 56 | 2026-01-08 |
scSuperAnnotator: a platform for benchmarking comparison and visualizing automated cellular annotation methods for scRNA-seq data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1470
PMID:41495899
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研究论文 | 介绍了一个名为scSuperAnnotator的在线平台，用于整合多种细胞类型识别方法，以自动化注释单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 首个集成多种细胞类型识别方法（包括基于标记基因和参考的方法）的在线平台，提供用户友好界面和一站式注释分析功能 | 未提及具体的技术限制或性能评估细节 | 开发一个综合平台，以促进单细胞RNA-seq数据中细胞类型的自动化注释和比较分析 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型识别方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-01-08 |
Microenvironment-aware spatial modeling for accurate inference of cell identity
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1477
PMID:41495904
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研究论文 | 本文提出了一种名为MEcell的无参数方法，通过整合空间上下文信息来改进细胞身份建模，并在多个空间转录组学平台和数据集上验证了其优越性 | MEcell方法首次明确结合空间微环境信息，自动调整其对细胞身份建模的贡献，解决了传统方法忽略局部环境影响的问题 | NA | 开发一种能够准确推断细胞身份的空间建模方法，以更好地理解细胞异质性和组织架构 | 空间转录组学数据中的细胞身份 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 无参数方法 | 空间转录组学数据 | 90个模拟数据集和7个真实数据集 | Vizgen, 10x Genomics, NanoString, 10x Genomics, Broad Institute, 开放平台 | 空间转录组学 | MERFISH, Xenium, CosMx, Visium HD, Slide-seqV2, open-ST | 包括MERFISH/Vizgen、Xenium、CosMx、Visium HD、Slide-seqV2和open-ST等多种空间转录组学平台 |
| 58 | 2026-01-08 |
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686400
PMID:41280052
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研究论文 | 本研究首次证明，通过吸烟或鼻吸方式的可卡因使用障碍患者表现出口腔微生物失调和选择性口腔至血液微生物易位 | 首次在人体中证明可卡因使用障碍导致口腔微生物失调和选择性口腔至血液微生物易位，并揭示其与免疫激活的关联 | 样本量较小（10名CUD患者和24名对照），且为横断面研究，无法确定因果关系 | 确定口腔是否为当前可卡因使用障碍患者循环微生物DNA易位的来源 | 可卡因使用障碍患者和人口统计学匹配的非药物对照个体 | 微生物组学 | 物质使用障碍 | 16S rRNA V4区域测序，单细胞RNA测序 | NA | 微生物DNA序列，单细胞RNA序列 | 10名可卡因使用障碍患者和24名对照个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2026-01-08 |
Radial-glia-to-astrocyte trans-differentiation and astrocyte transcriptional convergence are coordinated by CEH-43/DLX in C. elegans
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.682973
PMID:41279325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了线虫中CEPsh星形胶质细胞形成的两阶段程序，并发现转录因子CEH-43/DLX在协调径向胶质细胞向星形胶质细胞转分化和转录收敛中的关键作用 | 首次在线虫模型中利用谱系限制性单细胞RNA测序技术，系统解析了无细胞分裂条件下径向胶质细胞向星形胶质细胞转分化的分子程序，并发现保守的转录因子CEH-43/DLX在驱动这一过程中的核心调控功能 | 研究主要基于线虫模型，虽然在小鼠中进行了初步比较，但哺乳动物系统中的直接验证和机制细节仍需进一步探索 | 揭示径向胶质细胞向星形胶质细胞转分化和转录收敛的分子机制 | 线虫（C. elegans）的CEPsh星形胶质细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-01-08 |
Cannabidiol suppresses emergency MDSCs generation by disturbing EEF1B2-mediated C/EBPβ protein synthesis in colorectal adenomas
2026-Jan-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013081
PMID:41485775
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研究论文 | 本研究探讨了CBD如何通过干扰EEF1B2介导的C/EBPβ蛋白合成来抑制结直肠腺瘤中MDSCs的生成 | 首次揭示CBD通过靶向EEF1B2的鸟嘌呤核苷酸交换因子结构域，抑制翻译延伸和C/EBPβ合成，从而阻断MDSCs的生成 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探究CBD在结直肠腺瘤中的预防作用及其免疫调节机制 | 结直肠腺瘤小鼠模型（AOM/DSS诱导和高脂饮食喂养的Apcmin/+小鼠） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，靶向响应可及性分析，免疫荧光，分子生物学实验 | NA | RNA测序数据，图像数据 | 两种小鼠模型中的结直肠腺瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |