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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-24 |
Genome doubling as a dynamic driver of ovarian cancer evolution: insights from single-cell sequencing
2025-Nov-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01860-7
PMID:41257949
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综述 | 本文通过单细胞测序技术探讨全基因组加倍作为卵巢癌进化动态驱动因子的作用机制 | 重新定义全基因组加倍在肿瘤进化中的核心驱动作用,揭示其通过抑制先天免疫通路导致免疫抑制表型的新机制 | NA | 探讨全基因组加倍在高级别浆液性卵巢癌进化过程中的动态驱动作用及临床意义 | 高级别浆液性卵巢癌 | 基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-24 |
Precise combination therapy of radiotherapy and immunotherapy guided by joint PD-L1 imaging and T-cell imaging
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012300
PMID:41260899
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研究论文 | 本研究开发了一种通过联合PD-L1成像和T细胞成像指导放疗与免疫治疗精准联合治疗的新策略 | 首次提出联合使用PD-L1表达动态成像和肿瘤浸润T细胞成像来指导和预测放疗与免疫检查点抑制剂联合治疗的时机与疗效 | 研究仅在动物模型中进行验证,尚未在临床患者中证实其有效性 | 提高放疗与PD-1/PD-L1阻断疗法联合治疗的有效性和安全性 | 免疫热肿瘤和冷肿瘤模型 | 分子影像学 | 癌症 | SPECT/CT成像,单细胞RNA测序 | NA | 影像数据,基因表达数据 | 动物肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序,分子影像 | NA | 使用PD-L1靶向探针(99mTc-MY1523)和T细胞靶向探针(99mTc-sum IL-2)进行SPECT/CT成像 |
| 43 | 2025-11-24 |
Oligoclonal tumor-specific CD8 T-cell revival and IRE1α/XBP1-GDF15-mediated immunosuppressive niches determine neoadjuvant chemoimmunotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012630
PMID:41260902
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学技术,揭示了宫颈癌新辅助化疗免疫治疗疗效差异的免疫学机制 | 发现内质网应激信号IRE1α/XBP1轴通过诱导GDF15产生促进免疫抑制微环境形成,并鉴定出寡克隆肿瘤特异性CD8 T细胞复活与治疗反应的关系 | 样本量相对有限(单细胞测序n=10,验证队列n=23),需要更大规模研究验证 | 探究局部晚期宫颈癌新辅助化疗免疫治疗疗效差异的分子机制 | 局部晚期宫颈癌患者样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,空间转录组学,多重免疫组化 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化数据 | 单细胞测序10例患者(5对治疗前后配对样本),验证队列23例患者,6例手术标本mIHC分析 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞VDJ测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-24 |
Pan-cancer analysis identifies adhesion G protein-coupled receptor G6 as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker with its functional validation
2025-Nov-19, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149128
PMID:41265596
|
研究论文 | 通过泛癌分析鉴定黏附G蛋白偶联受体G6作为潜在预后和免疫治疗生物标志物,并通过功能实验验证其作用 | 首次在泛癌水平系统评估ADGRG6的表达模式、临床意义和免疫调节功能,并验证其作为免疫治疗联合靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和有限细胞系验证,缺乏更广泛的临床样本验证 | 探究ADGRG6在多种癌症中的表达特征、预后价值和免疫治疗潜力 | 33种癌症类型,乳腺癌和胶质瘤细胞系,CD8+ T细胞 | 生物信息学,癌症研究 | 泛癌分析(包括乳腺癌、胶质瘤、肺鳞癌、胰腺癌等) | 空间转录组学,体外共培养,体内实验,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,临床数据,空间转录组数据 | TCGA、GTEx、GEO数据库的多癌种样本,乳腺癌和胶质瘤细胞系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-11-24 |
From sample to clinical insight: a review of exome sequencing in disease diagnostics
2025-Nov-19, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.11.007
PMID:41271122
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综述 | 本文全面回顾了外显子组测序在疾病诊断中的方法学、数据分析流程、临床应用及伦理考量 | 系统评估了新兴长读长测序系统与多组学整合框架,强调了机器学习在变异优先排序中的未来方向 | 作为综述文章未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳分析 | 探讨外显子组测序在疾病诊断和精准医疗中的临床应用与发展前景 | 外显子组测序技术及其在人类疾病诊断中的应用 | 基因组学 | 多种疾病 | 外显子组测序 | 机器学习 | 基因组数据 | NA | NA | 外显子组测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-24 |
Toward a ToxAtlas of Carbon-Based Nanomaterials: Single-Cell RNA Sequencing Reveals Initiating Cell Circuits in Pulmonary Inflammation
2025-Nov-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12054
PMID:41183169
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示碳基纳米材料引发肺部炎症的起始细胞回路 | 首次在单细胞分辨率下系统比较不同碳基纳米材料引发的特异性分子起始事件,并开发了ToxAtlas网络工具 | 仅关注急性炎症反应(12小时),未研究长期慢性炎症发展过程 | 理解纳米材料特性如何驱动急性肺部炎症反应 | 小鼠肺部细胞 | 单细胞组学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肺部细胞(鉴定出41种细胞状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-11-24 |
Oncolytic virus-induced IL-1β+ monocyte-IL-6+ CAF axis suppresses dendritic cell-mediated antitumor immunity in pancreatic cancer
2025-Nov-18, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013175
PMID:41253490
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中溶瘤病毒诱导的单核细胞-CAF-DC免疫抑制轴机制 | 首次发现溶瘤病毒通过诱导单核细胞产生IL-1β进而激活CAF产生IL-6,从而抑制树突状细胞功能的免疫抑制新通路 | 研究主要基于小鼠和患者来源的肿瘤模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究胰腺癌微环境中基质成分如何调节溶瘤病毒疗效的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因工程病毒构建 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠模型和患者来源肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-11-24 |
scMFF: a machine learning framework with multiple feature fusion strategies for cell type identification
2025-Nov-18, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06309-8
PMID:41254497
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据细胞类型识别的多特征融合机器学习框架 | 整合四种特征表示并探索六种融合策略,克服单一特征局限性,提升细胞分类性能 | NA | 开发更准确稳定的单细胞RNA测序细胞类型分类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 42个疾病相关数据集和1个外部COVID-19数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-11-24 |
ELF3-regulated PES1 targets VEGFR2 to mediate angiogenesis and retinal inner barrier injury in diabetic retinopathy
2025-Nov-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07334-0
PMID:41254671
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,揭示了ELF3/PES1/VEGFR2信号通路在糖尿病视网膜病变中调控血管生成和血视网膜屏障功能的关键作用 | 首次发现PES1在糖尿病视网膜病变中的关键作用,并阐明ELF3通过结合PES1启动子调控其表达,进而影响VEGFR2介导的血管生成和屏障功能损伤的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床验证仍需进一步开展 | 探讨PES1在糖尿病视网膜病变血管生成和血视网膜屏障功能中的作用及调控机制 | 糖尿病视网膜病变中的血管内皮细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病视网膜病变 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, Western blot, 划痕实验, 管形成实验, Transwell, EdU增殖实验, 免疫荧光, Evans Blue实验, PAS染色, H&E染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-11-24 |
HLA-A drives diabetic retinopathy pathogenesis: multi-omics integration reveals resveratrol's therapeutic potential via immunomodulation
2025-Nov-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07117-7
PMID:41254735
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合分析发现HLA-A是糖尿病视网膜病变的致病因子,并揭示白藜芦醇通过免疫调节具有治疗潜力 | 首次通过双向孟德尔随机化和单细胞RNA测序确定HLA-A在糖尿病视网膜病变中的因果作用,并发现白藜芦醇可调节HLA-A表达 | 样本量相对有限(n=81),且主要基于中国人群队列 | 识别糖尿病视网膜病变的新型生物标志物和治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者外周血样本和THP-1细胞系 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 双向孟德尔随机化, 分子对接, 细胞实验 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 临床数据 | 81例中国人群外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-11-24 |
Intercellular signaling and synaptic deconstruction uncovered by single-cell and spatial transcriptomics in an AD tauopathy model
2025-Nov-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08959-z
PMID:41249845
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术研究AD tau蛋白病变模型中的细胞间信号传导和突触解构 | 首次在人类样tau蛋白病变转基因大鼠模型中结合单细胞多组学和空间转录组学分析,揭示了tau过度磷酸化和衰老对细胞通讯的影响 | 研究基于转基因动物模型,可能与人类AD病理存在差异 | 探索阿尔茨海默病发病机制中tau蛋白病变对细胞通讯和突触功能的影响 | 转基因tau蛋白病变大鼠模型的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞多组学测序, 空间转录组学 | 转基因动物模型 | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2025-11-24 |
Transcriptomic profiling confirms microRNA-140 is more functional in joint development than in disease
2025-Nov-14, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.11.005
PMID:41242538
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析确认microRNA-140在关节发育中的功能比在骨关节炎疾病中更为重要 | 首次利用空间转录组学技术揭示miR-140-5p在静止软骨细胞和软骨膜中的特异性功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 探究miR-140在骨骼发育和骨关节炎中的不同作用机制 | Mir140基因敲除小鼠模型 | 转录组学 | 骨关节炎 | RNA测序,空间转录组学,CRISPR-Cas9基因编辑 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,组织学图像 | 7日龄小鼠肋软骨细胞和后肢生长板组织 | NA | 空间转录组学,RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-11-24 |
Liquiritigenin attenuates thrombosis by inhibiting P2Y12R-mediated Src/PLCγ2 signaling and cytoplasmic Ca2+ mobilization in platelets
2025-Nov-13, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157553
PMID:41273866
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研究论文 | 本研究探讨甘草素通过抑制P2Y12R介导的Src/PLCγ2信号通路和胞质Ca2+动员来抑制血小板活化并减轻血栓形成 | 首次揭示甘草素通过靶向P2Y12R关键残基(LYS179、CYS97和ASN191)抑制血小板活化,这些残基也是ADP结合位点 | 研究主要聚焦于ADP激活的血小板,对其他激动剂的抑制效果相对较弱 | 探索甘草素抑制血小板活化以减轻血栓形成的分子机制 | 血小板、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、急性肺血栓栓塞和冠状动脉微血管功能障碍动物模型 | 药理学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、透射电镜、荧光标记、Western blotting、分子建模、单细胞转录组分析 | NA | 实验数据、分子相互作用数据、动物模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-11-24 |
Disease duration impacts intestinal gene expression profiles in Crohn's disease but not in ulcerative colitis
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf179
PMID:41063393
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研究论文 | 本研究探讨疾病持续时间对克罗恩病和溃疡性结肠炎患者肠道基因表达谱的影响 | 首次系统比较疾病持续时间对克罗恩病和溃疡性结肠炎肠道转录组的不同影响,并识别出与疾病持续时间相关的共享基因特征 | 研究主要基于观察性队列,需要进一步功能验证;单细胞RNA测序样本量较小(n=18) | 理解克罗恩病和溃疡性结肠炎中与疾病持续时间相关的肠道转录组变化 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者的肠道组织 | 转录组学 | 炎症性肠病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 通路分析 | NA | 基因表达数据 | MSCCR队列: 498例CD患者, 421例UC患者; SPARC IBD队列: 777例CD患者, 440例UC患者; 单细胞RNA测序: 18例CD患者 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-11-24 |
Targeting the cell adhesion related ligands MAC1 with Indirubin to inhibit AGE-RAGE signaling and mitigate colitis in an mouse model
2025-Nov-04, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157504
PMID:41273872
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研究论文 | 本研究揭示靛玉红通过靶向MAC1抑制AGE-RAGE信号通路缓解溃疡性结肠炎的机制 | 首次发现靛玉红通过抑制MAC1-CTCF介导的转录激活来调控AGE-RAGE信号通路 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明靛玉红在溃疡性结肠炎中的抗炎作用机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和细胞模型 | 生物医学研究 | 溃疡性结肠炎 | 蛋白质组测序,单细胞RNA测序,免疫荧光,分子对接,双荧光素酶报告基因检测 | 动物疾病模型,细胞模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,荧光成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-24 |
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Nov-03, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104183
PMID:41187056
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研究论文 | 本文提出了一种通过单细胞多组学分析解码免疫检查点阻断治疗反应预测因子的实验方案 | 整合单细胞RNA测序、单细胞免疫分析和质谱流式技术,结合基因调控网络和细胞间相互作用分析,实现跨癌种的免疫预测因子识别 | NA | 开发识别免疫检查点阻断治疗反应相关T细胞亚群和预测性生物标志物的分析方法 | 多种癌症类型中的T细胞动态 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分析, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-24 |
Characterization of Early Metastatic Subpopulations in Uveal Melanoma: Single-Cell Insights Into SPP1+ Cells and Their Interactions With Macrophages
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.37
PMID:41247132
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定葡萄膜黑色素瘤中与早期转移相关的高侵袭性SPP1+肿瘤细胞亚群及其与巨噬细胞的相互作用 | 首次在单细胞水平识别出与葡萄膜黑色素瘤早期转移相关的SPP1+细胞亚群,并揭示其通过HMGB1/TIM-3轴与CCL3+巨噬细胞的相互作用机制 | 样本量相对较小(11例单细胞测序样本),需要更大规模研究验证 | 探究葡萄膜黑色素瘤早期转移的细胞机制和潜在治疗靶点 | 葡萄膜黑色素瘤患者肿瘤样本和细胞系 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光, CCK8检测, Transwell实验, 流式细胞术, RT-qPCR | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 图像数据 | 11例单细胞测序样本(11位患者),133例批量RNA测序验证样本(53例自建队列+80例TCGA数据库) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-11-24 |
FatePredictor: Cell fate decision-making prediction with an ensemble deep learning model
2025-Nov-03, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.101010
PMID:41268507
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研究论文 | 开发了一种基于集成深度学习模型的细胞命运决策预测计算框架FatePredictor | 结合分岔理论和最优输运理论,利用动态非平衡最优输运方法重建细胞轨迹,并采用集成深度学习模型预测细胞命运分岔类型 | NA | 预测细胞命运决策过程中的分岔现象和揭示复杂细胞轨迹 | 细胞分化过程中的命运决策机制 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-11-24 |
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Nov, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.025
PMID:39842636
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多色免疫组化等技术,揭示了胎盘分子细胞形态特征及其在生殖免疫中的新机制 | 发现胚胎滋养层细胞在植入前就表达免疫检查点蛋白,揭示了母胎界面免疫平衡的胎儿驱动机制 | 研究样本包含正常和异位妊娠及动物模型,但具体样本数量未明确说明 | 探究人类生殖过程中胎盘在早期和晚期的细胞分子特征及免疫调节机制 | 正常妊娠、异位妊娠胎盘组织及动物模型 | 生殖免疫学 | 妊娠相关疾病 | 空间转录组学,多重免疫组织化学,免疫组化-荧光原位杂交双标记 | NA | 空间转录组数据,组织图像,蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-24 |
NF-κB p65 mediated lnc-Traf3ip2 exacerbates renal fibrosis in diabetic kidney disease
2025-Nov, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02515-1
PMID:40471299
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研究论文 | 本研究探讨了NF-κB p65介导的长链非编码RNA lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用机制 | 首次发现lnc-Traf3ip2在肾小球系膜细胞中高表达并通过NF-κB p65转录调控参与糖尿病肾病纤维化过程 | 样本量相对有限(小鼠n=35,患者n=40),且主要聚焦于系膜细胞的纤维化机制 | 探究lnc-Traf3ip2在糖尿病肾病肾纤维化中的作用及分子机制 | 糖尿病肾病小鼠模型、db/db小鼠、人血浆样本、肾小球系膜细胞 | 分子生物学 | 糖尿病肾病 | scRNA-seq, RNA-seq, qRT-PCR, western blot, 免疫荧光, 双荧光素酶报告基因检测, ChIP | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 小鼠共38只(db/db 3只+对照3只+DKD小鼠35只),DKD患者40例 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |