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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-08-21 |
Noninvasive Multi-Omics Radiomic Model Integrating scRNA-seq and Bulk RNA-seq for Hepatocellular Carcinoma Prognosis
2026-Aug, Journal of imaging informatics in medicine
DOI:10.1007/s10278-025-01668-3
PMID:41068348
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研究论文 | 开发了一种整合单细胞RNA测序和批量RNA测序的机器学习影像组学预后模型,用于肝细胞癌的风险分层 | 将单细胞和批量RNA测序数据与影像组学特征相结合,通过机器学习方法构建非侵入性预后模型 | 未明确提及局限性 | 通过整合分子和影像数据,提高肝细胞癌患者的预后风险分层准确性 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境相关基因和影像组学特征 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、影像组学 | 支持向量机 | 基因表达数据、影像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-08-21 |
The Cilia-Associated Protein CCDC89 Is Dispensable for Male Fertility in Mice
2026-Aug, Cytoskeleton (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cm.70057
PMID:41074672
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研究论文 | 本研究鉴定CCDC89为一种新的纤毛相关蛋白,并发现其在小鼠中缺失不影响男性生育能力 | 首次鉴定CCDC89为新的纤毛蛋白,并通过超分辨成像揭示其在运动纤毛轴丝管腔中的定位 | 未发现CCDC89敲除小鼠的明显表型异常,可能掩盖其潜在功能 | 探索CCDC89在纤毛中的生理功能及其对小鼠生育能力的影响 | 小鼠CCDC89蛋白及其敲除小鼠模型 | 细胞生物学 | 纤毛病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、超分辨成像、基因敲除 | NA | 图像和基因表达数据 | CCDC89敲除小鼠及其对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-08-21 |
Tumor-Infiltrating mregDCs Restrain Anti-Tumor Immunity in Early Relapse HCC
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75695
PMID:42133204
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研究论文 | 本研究通过全长单细胞RNA测序,揭示了早期复发肝细胞癌中肿瘤浸润性成熟调节性树突状细胞(mregDCs)通过募集功能障碍性CD8+ T细胞并激活非经典NF-κB通路抑制抗肿瘤免疫的机制,并提出了TNFR2作为联合免疫治疗靶点 | 首次在早期复发肝细胞癌中鉴定出mregDCs亚群,并阐明其通过TNFR2介导的免疫抑制网络,且发现TNFR2与PD-L1双重阻断可增强抗肿瘤效果,为肝癌免疫治疗提供新靶点 | 研究主要依赖体内小鼠模型和有限的临床样本,mregDCs在人体内的详细机制及其临床适用性仍需进一步验证 | 探究肿瘤浸润性髓系细胞在肝细胞癌复发中的免疫调节作用及潜在治疗靶点 | 原发性和早期复发性肝细胞癌患者的肿瘤样本及小鼠肝癌模型 | 单细胞测序 | 肝细胞癌 | 全长单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 原发性和早期复发性肝细胞癌患者样本(具体数量未详述)及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-08-21 |
HESpotEx: a dual-stream deep learning framework for spot-level gene expression prediction from histological images
2026-Aug, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-026-00992-0
PMID:42141326
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研究论文 | 提出HESpotEx,一种双流多模态深度学习框架,仅从组织学图像预测空间基因表达模式 | 创新性地结合图注意力自编码器、图像编码器和图卷积网络解码器,实现从WSI图像预测高达5,457个基因的表达,且具有较好的鲁棒性和跨数据集的泛化能力 | 依赖高质量的组织学图像和空间转录组数据训练,可能对图像质量敏感,且未提及处理批次效应或跨平台差异 | 开发一种仅从全切片组织学图像预测空间基因表达的模式,以降低成本并揭示组织学模式背后的空间分子特征 | 多种癌症和非癌症样本的空间转录组数据集,以及大型TCGA WSI数据集和内部WSI数据集 | 计算机视觉、机器学习 | 癌症(多种) | 空间转录组学 | 图注意力自编码器、图卷积网络 | 图像、基因表达数据 | 多种癌症和非癌症样本数据集,以及TCGA大规模WSI数据集和内部数据集,具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2026-08-21 |
A Phase II Study of Stereotactic Ablative Radiotherapy plus Atezolizumab plus Tiragolumab in Treatment-Naïve Patients with Advanced Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Jul-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4990
PMID:42008740
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研究论文 | 一项评估立体定向消融放疗联合阿替利珠单抗和替瑞利尤单抗在初治晚期非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性的二期研究 | 首次探讨将立体定向体部放疗与阿替利珠单抗和替瑞利尤单抗联合用于PD-L1阳性晚期非小细胞肺癌,并结合单细胞RNA测序分析治疗前后免疫微环境的变化 | 单中心、单臂设计,样本量有限,缺乏对照组,且单细胞RNA测序仅分析了5名患者 | 评估立体定向体部放疗联合阿替利珠单抗和替瑞利尤单抗是否能增强晚期PD-L1阳性非小细胞肺癌的抗肿瘤疗效 | PD-L1阳性的晚期非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本, 基因表达数据 | 41名患者,其中5名进行了单细胞RNA测序分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 46 | 2026-08-21 |
FLT3-ITD scaffolds PKCι-STAT1 to drive noncanonical S727 phosphorylation and CD276-driven CD8+ T-cell exhaustion in AML
2026-07-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032254
PMID:41878790
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和流式细胞术数据,揭示FLT3-ITD通过支架作用组装PKCι-STAT1复合物,驱动STAT1 S727磷酸化并上调CD276,导致CD8+ T细胞耗竭,提出联合FLT3和CD276靶向治疗策略 | 首次揭示FLT3-ITD作为突变特异性支架,非激酶依赖性地组装PKCι-STAT1三元复合物,驱动非经典S727磷酸化而非经典Y701位点,从而上调CD276并促进免疫逃逸 | 研究基于细胞系和异种移植模型,临床验证有限;未深入探索STAT1 S727磷酸化在肿瘤细胞外的潜在影响;联合治疗策略需进一步临床试验验证 | 阐明FLT3-ITD AML中激酶非依赖性免疫抑制机制,并评估联合靶向策略的疗效 | FLT3-ITD急性髓系白血病患者样本及细胞系 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫共沉淀, 染色质免疫沉淀, 电泳迁移率变动分析, 荧光素酶报告基因, 多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 图像 | 104例原发性患者样本和2个单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 47 | 2026-08-21 |
CD28+ CD8+ Tem cells with a STAT1-dependent glucocorticoid receptor deficit contribute to steroid-refractory acute GVHD
2026-07-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032587
PMID:41980031
|
研究论文 | 通过综合多组学方法分析类固醇难治性急性移植物抗宿主病患者外周血,发现CD28+ CD8+ Tem细胞扩增且存在STAT1依赖性糖皮质激素受体缺陷,提示其关联类固醇抵抗机制 | 首次通过集成多组学方法识别出CD28+ CD8+ Tem细胞作为类固醇难治性aGVHD的预测性生物标志物,并揭示STAT1-GR调控轴在类固醇抵抗中的作用 | 研究为回顾性分析,样本量有限,多中心验证队列仍需更大规模前瞻性研究证实 | 阐明类固醇难治性急性移植物抗宿主病的免疫机制,并寻找可靠的类固醇抵抗预测标志物 | 异基因造血干细胞移植受者外周血样本,分为无aGVHD、类固醇敏感aGVHD和类固醇难治性aGVHD三组 | 免疫学,多组学 | 急性移植物抗宿主病 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,功能实验 | NA | 外周血免疫细胞多组学数据(质谱流式、单细胞转录组) | 多中心队列,具体数量未在摘要中说明 | NA | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-08-21 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
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研究论文 | 本研究结合遗传学、单细胞RNA测序、功能实验和小鼠模型,探讨NOTCH4基因变异在系统性硬化症血管病变中的作用,并发现NOTCH4信号通路抑制可恢复血管生成,为治疗提供新策略 | 首次通过全外显子组关联分析发现NOTCH4变异在非裔美国人系统性硬化症患者中显著富集,并阐明其通过增加NOTCH4表达和信号传导导致血管生成减少和内皮-间质转化增加的机制 | 研究主要聚焦于非裔美国人群体,样本量有限,且未深入探讨NOTCH4变异在其他种族或更广泛人群中的作用 | 探讨系统性硬化症严重血管表型的遗传病因,并评估NOTCH4作为治疗靶点的潜力 | 非裔美国人系统性硬化症患者及其血管病变相关细胞 | 基因组学、细胞生物学 | 系统性硬化症 | 全外显子组测序、单细胞RNA测序、基因功能实验、小鼠模型 | 基因关联分析模型、小鼠模型 | 基因组测序数据、单细胞转录组数据、临床表型数据 | 非裔美国人系统性硬化症患者及对照组个体(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-08-21 |
Integrating multiomic layers to decode psychiatric disease mechanisms
2026-06, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102451
PMID:41831411
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综述 | 本文综述了整合多组学技术(如单细胞转录组学、表观基因组学、蛋白质组学和空间 profiling)在解码精神疾病(如精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症)遗传机制中的应用。 | 强调了从风险变异到基因调控、细胞类型易感性和电路功能障碍的机制性理解,并引入了因果推断的计算框架。 | 未详细讨论技术挑战或数据整合的具体瓶颈,可能对实际应用中的局限性覆盖不足。 | 展示多组学整合分析如何推动精神疾病机制研究,并为生物标志物发现和精准治疗策略奠定基础。 | 精神疾病(精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症)的遗传和分子机制。 | 计算生物学、基因组学、单细胞生物学 | 精神疾病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组和空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-08-21 |
Multi-omics reveals a novel Cxcr4+ subpopulation of alveolar macrophages and therapeutic effect of AMD3100 in mice with advanced silicosis
2026-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70705
PMID:42204838
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了晚期矽肺小鼠模型中Cxcr4+肺泡巨噬细胞亚群及其与Cxcl12+成纤维细胞的相互作用在肺纤维化进展中的作用,并验证了AMD3100的治疗效果。 | 首次通过多组学方法识别出Cxcr4+肺泡巨噬细胞亚群,并阐明其与Cxcl12+成纤维细胞之间的正反馈循环驱动矽肺纤维化,为靶向Cxcl12/Cxcr4轴的疗法提供了新思路。 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步验证在人类矽肺中的适用性;机制探索主要在体外进行,体内详细机制尚需更深入探究。 | 阐明矽肺纤维化进展的分子机制,特别是Cxcr4+巨噬细胞和Cxcl12+成纤维细胞的作用,并评估AMD3100的治疗潜力 | 小鼠矽肺模型中的肺组织细胞,特别是巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞组学 | 矽肺 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、体外细胞实验 | 小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组图像 | 小鼠肺组织样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序及空间转录组学平台 |
| 51 | 2026-08-21 |
Integrated transcriptomic analysis identifies liver aging-driven fibrosis signatures and reveals therapeutic strategies based on medicine-food homology
2026-May-26, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-026-00904-6
PMID:42191706
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研究论文 | 通过整合纵向转录组学、单细胞RNA测序和机器学习方法,识别肝脏衰老驱动的纤维化特征,并筛选药食同源草药作为治疗策略 | 首次结合纵向转录组学、单细胞RNA测序和机器学习算法建立衰老基因评分(AGS)和五基因生物标志物面板,并利用网络药理学和分子对接筛选药食同源草药,发现金荞麦和黄芪的活性成分MOL000098与纤维化靶点COL3A1的强结合 | 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验,缺乏体内动物模型验证以及临床样本的进一步确认 | 系统性表征肝脏衰老驱动的纤维化过程,并探索基于药食同源的抗衰老和抗纤维化干预策略 | 肝脏衰老相关的基因表达数据、单细胞RNA测序数据、肝细胞和巨噬细胞、纤维化相关靶点和药食同源草药成分 | 机器学习 | 肝脏纤维化 | 转录组学、单细胞RNA测序、分子对接 | Boruta和LASSO算法、网络药理学 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-08-21 |
AI-driven multi-omics drug repurposing nominates AZD7762 as a multitarget inhibitor of IL22RA1 and FAM221A in esophageal squamous cell carcinoma
2026-May-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01485-z
PMID:42191940
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研究论文 | 本研究开发了一种AI驱动的多组学管线,将预后建模与多靶点药物重定位相结合,用于食管鳞状细胞癌,并提名AZD7762作为IL22RA1和FAM221A的多靶点抑制剂 | 创新性地将孟德尔随机化、转录组数据、单细胞RNA测序和机器学习药物预测整合到多组学流程中,以识别预后基因和药物靶点,并提出多靶点药物重定位策略 | 未提及具体局限性,但可能包括需要进一步临床验证和机制研究 | 开发AI驱动的多组学管道,以识别食管鳞状细胞癌的预后基因和多靶点药物重定位候选药物,提供精准肿瘤学策略 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者样本及相关细胞系 | 多组学、机器学习、数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、药物敏感性预测、分子对接 | Cox回归、非负矩阵分解、Lasso Cox、SHAP解释、机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、药物敏感性数据 | 未提供具体样本数量,但涉及肿瘤样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2026-08-21 |
Epithelial CD155-TIGIT/CD226 signaling links CD8⁺ T-cell exhaustion to frequent exacerbations in COPD
2026-May-21, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03717-z
PMID:42168982
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研究论文 | 本研究探讨了COPD中上皮细胞CD155与TIGIT/CD226信号通路如何导致CD8⁺ T细胞耗竭,并增加频繁急性加重风险 | 首次整合单细胞RNA测序与多组织样本分析,揭示TIGIT-CD155/CD226通路在COPD免疫检查点失调中的关键作用,并证明TIGIT敲低可逆转T细胞耗竭状态 | 横断面观察设计,未能追踪时间动态;样本来源有限,可能限制结论的普遍性 | 确定TIGIT通路激活是否促进COPD中CD8⁺ T细胞耗竭及频繁急性加重易感性 | COPD患者和健康对照的外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织 | 免疫学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、功能实验(细胞因子检测、凋亡、慢病毒TIGIT敲低) | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、组织图像 | NA(涉及人类肺组织单细胞数据及多组患者样本) | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | NA |
| 54 | 2026-08-21 |
A mitochondrial ROS-dependent antiviral response promotes β cell resilience and is diminished in donors with type 1 diabetes
2026-May-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adx7770
PMID:42160450
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研究论文 | 本研究通过体内外成像和遗传分析,探究了IFN-α诱导的人类β细胞线粒体ROS产生及其在抗病毒反应和1型糖尿病发病中的作用 | 首次发现人类β细胞亚群对IFN-α反应产生线粒体ROS,并鉴定出相关基因签名,揭示ROS在抗病毒反应中的关键作用及其在T1D中减弱的现象 | 未明确说明局限性,但可能包括样本量有限或仅基于体外和离体实验,缺乏体内验证 | 研究IFN-α对人类β细胞生理的影响,特别是线粒体ROS在抗病毒反应和T1D发病机制中的作用 | 人类胰岛β细胞、供体胰岛、β细胞系 | 病理学 | 1型糖尿病 | RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、成像、遗传分析 | NA | 图像、基因表达数据、测序数据 | 来自多个供体的人胰岛样本及β细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 55 | 2026-08-21 |
Pancreatic tumor microenvironment reprogramming via alloantigen-expressing virotherapy elicits tumor rejection and improves immunotherapy response
2026-May-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013671
PMID:42120181
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研究论文 | 本研究提出一种利用重组溶瘤病毒rVMG表达同种异体抗原的策略,通过诱导肿瘤特异性抗原错配反应,重塑胰腺导管腺癌的肿瘤微环境,增强免疫治疗反应并建立持久抗肿瘤免疫 | 首次利用同种异体抗原表达的溶瘤病毒(rVMG-H-2Kb/H-2Kk)激活急性移植排斥机制,将免疫冷肿瘤转化为免疫热肿瘤,并协同检查点阻断显著提高生存率 | 研究仅在免疫活性小鼠模型中进行,需进一步验证在人类PDAC中的适用性;rVMG-H-2Kk诱导的代偿性免疫抑制通路可能影响长期疗效 | 开发一种基于同种异体抗原表达的溶瘤病毒免疫治疗平台,用于重塑胰腺癌肿瘤微环境并增强免疫检查点抑制剂疗效 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤模型及携带同种异体抗原的溶瘤病毒(rVMG-H-2Kb和rVMG-H-2Kk) | 免疫治疗 | 胰腺癌 | 溶瘤病毒治疗 | 小鼠肿瘤模型 | 空间转录组数据、免疫表型数据 | 两个免疫活性PDAC小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2026-08-21 |
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01738-2025
PMID:41412718
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研究论文 | 本研究探讨成纤维细胞活化蛋白(FAP)作为慢性肺同种异体移植功能障碍(CLAD)早期生物标志物的潜力 | 首次在肺移植模型中通过单细胞RNA测序揭示FAP在致病性成纤维细胞亚群中的特异性表达,并结合大型临床队列验证其作为CLAD早期诊断标志物的可行性 | FAP阳性面积的判别能力中等(AUC=0.78),需在多中心前瞻性队列中进一步验证 | 评估FAP表达在CLAD中的变化及其作为早期诊断标志物的价值 | 小鼠肺移植模型和人类肺组织及经支气管活检样本 | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | 2个鼠模型、5例对照和5例CLAD患者的人肺组织、240例肺移植受者的经支气管活检(62例有CLAD,178例无CLAD) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 57 | 2026-08-21 |
Niacin promotes motor function recovery after spinal cord injury via Hcar2-dependent microglia immunometabolic regulation
2026-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70683
PMID:42068080
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研究论文 | 本研究探讨了烟酸通过Hcar2依赖性小胶质细胞免疫代谢调控促进脊髓损伤后运动功能恢复的机制 | 首次揭示Hcar2在脊髓损伤后小胶质细胞中的富集表达及其作为代谢检查点的作用,并证明烟酸可通过Hcar2将小胶质细胞代谢从糖酵解重编程为氧化磷酸化,促进抗炎表型转化,从而改善运动功能恢复 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,缺乏人体临床试验验证;未完全阐明Hcar2调控免疫代谢的详细分子机制 | 探究Hcar2在脊髓损伤中的作用及其作为治疗靶点的潜力,评估烟酸激活Hcar2对运动功能恢复的保护效果 | 脊髓损伤小鼠模型、Hcar2基因敲除小鼠、LPS诱导的BV2小胶质细胞模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光染色、Western blotting、实时聚合酶链反应 | 基因敲除小鼠模型、细胞模型 | 转录组数据、图像、基因表达数据 | 小鼠和恒河猴的单细胞RNA测序数据集;小鼠模型和BV2细胞模型(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2026-08-21 |
Excitatory neurons and astrocytes-specific dysregulation and aberrant interactions are vulnerable to FCDI as suggested by single-cell spatial transcriptomics
2026-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70673
PMID:42068085
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研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,构建了局灶性皮质发育不良I型(FCDI)患者致痫皮层的单细胞空间转录组图谱,揭示了兴奋性神经元和星形胶质细胞的特异性失调及异常细胞互作,为FCDI发病机制提供了新见解。 | 首次通过单细胞空间转录组学整合分析,鉴定FCDI中兴奋性神经元和星形胶质细胞的特异性变化,构建了TF-枢纽基因调控网络,并发现CBLN2highEx-1亚群与神经元过度兴奋相关。 | 样本量较小(3例FCDI患者和3例对照),需要扩大样本量以验证结果的普适性;研究基于组织样本,未能完全排除个体差异的影响。 | 探索FCDI的分子机制,特别是兴奋性神经元和星形胶质细胞的失调及其相互作用,寻找潜在的治疗靶点。 | FCDI患者的致痫皮层组织和相对正常的皮层组织(对照)。 | 数字病理学,空间转录组学 | 局灶性皮质发育不良I型,癫痫 | 单核RNA测序(snRNA-seq),空间转录组学(spatial transcriptomics),Western blot,免疫荧光 | NA | 基因表达数据(单细胞和空间),蛋白质表达数据 | 6个样本(3个FCDI患者致痫皮层组织,3个相对正常皮层组织作为对照) | 10x Genomics | 单核RNA-seq,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序和10x Visium空间转录组学平台进行多组学整合分析 |
| 59 | 2026-08-21 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Transcriptional Activation of PTGS2 by FOS in Progression From T2DM to T2DM-Associated NAFLD
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71182
PMID:42108421
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研究论文 | 本研究整合批量与单细胞RNA测序分析,揭示了FOS介导的PTGS2转录激活在2型糖尿病向非酒精性脂肪肝进展中的作用机制 | 首次通过整合批量转录组和单细胞转录组数据,结合转录因子预测和双荧光素酶实验,证实FOS直接结合PTGS2启动子并驱动其转录,从而促进T2DM向NAFLD的进展 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、体外实验与体内环境的差异等 | 阐明2型糖尿病向相关非酒精性脂肪肝进展过程中FOS介导PTGS2激活的分子调控机制 | T2DM相关NAFLD患者的转录组数据、单细胞转录组数据及体外细胞模型 | 转录组学 | 2型糖尿病、非酒精性脂肪肝 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、双荧光素酶报告基因实验 | LASSO回归、随机森林 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,涉及GEO批量数据、患者转录组及细胞实验 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-08-21 |
Alveolar Type 2 Cell Dysfunction Is Associated with Bile Acid Alterations in Experimental Hepatopulmonary Syndrome
2026-Apr-28, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag067
PMID:42048159
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研究论文 | 本研究探讨了实验性肝肺综合征中肺泡2型细胞功能障碍与胆汁酸变化之间的关系 | 首次通过AT2细胞特异性RiboTag RNA测序和单细胞RNA测序揭示胆汁酸水平升高与AT2细胞功能障碍的关联,并发现FXR激动剂可恢复SP-C产生 | 研究基于小鼠模型,需进一步验证在人类肝肺综合征中的适用性 | 探究肝肺综合征中肺泡2型细胞功能障碍是否与胆汁酸变化相关,并评估潜在治疗靶点 | 胆管结扎小鼠的肺泡2型细胞、肺组织及MLE12细胞系 | 数字病理学 | 肝肺综合征 | RNA测序、单细胞RNA测序、质谱分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、代谢组学数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序平台,Illumina NovaSeq用于RNA测序,质谱分析用于胆汁酸谱 |