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当前共找到 44127 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-10-07 |
Regulatory-prior-guided attention preserves biological structure during unpaired single-cell RNA-ATAC integration
2026-Oct-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag696
PMID:42758136
|
研究论文 | 提出 scHPGT，一种基于调控先验引导的 Transformer 模型，用于非配对单细胞 RNA 与 ATAC 数据的整合，在保持生物结构的同时实现模态对齐 | 采用模态特异性编码器、先验引导的跨模态 Transformer 约束基因-峰注意力、以及域对抗目标，在共享隐空间中对齐非配对 RNA 与 ATAC 数据，避免过度对齐生物学上不同的细胞状态 | 摘要中未明确提及局限性 | 解决非配对单细胞 RNA 与 ATAC 数据整合中特征空间、稀疏性和噪声差异带来的挑战，实现调控先验引导的整合并保持生物结构 | PBMC3k、小鼠脾脏、CITE-seq/ASAP-seq PBMC 和 PBMC10k 基准数据集中的单细胞 RNA 与 ATAC 图谱 | 机器学习 | NA | 单细胞 RNA 测序、单细胞 ATAC 测序 | Transformer | 文本 | 涉及 PBMC3k、小鼠脾脏、CITE-seq/ASAP-seq PBMC 和 PBMC10k 等多个基准数据集 | 10x Genomics | 单细胞 RNA 测序、单细胞 ATAC 测序、CITE-seq、ASAP-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-10-07 |
The heterogeneity and sexual-dimorphism of human TCRαβ+CD4-CD8- double negative T cells
2026-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.04.008
PMID:42009279
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组、TCR库和染色质可及性分析，揭示了健康人外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的异质性和性别二态性 | 首次系统性地结合单细胞转录组、TCR库和染色质可及性多组学手段，全面刻画了人类外周血DNT细胞的异质性，并揭示了其性别二态性特征 | 样本量较小（仅10名健康供体），且对疾病状态下DNT细胞变化的分析依赖于公开数据，缺乏实验验证 | 解析人类外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的分子和功能特征，探讨其在免疫相关疾病中的作用 | 10名健康供体外周血中的TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞 | 单细胞组学 | 溃疡性结肠炎, 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, TCR序列数据 | 10名健康供体的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 43 | 2026-10-07 |
Common γ-chain cytokines induce an epigenomically plastic precursor-like KIT+ ILC2 state linked to immune disease susceptibility
2026-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.05.029
PMID:42309230
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研究论文 | 本文通过多组学分析（转录组和表观基因组）结合体外培养实验，揭示了KIT+ ILC2细胞具有前体样表观基因组，表现出增强的表型可塑性，并与免疫疾病易感性相关 | 首次定义了KIT+ ILC2细胞的分子基础，发现其具有前体样表观基因组特征，整合了表观基因组数据与人类主要免疫疾病的遗传风险变异，并确定了IL-2/IL-7通过STAT5激活诱导和维持KIT+表型的机制 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 定义KIT+ ILC2细胞增强可塑性的分子基础，识别诱导该表型的信号，并探索其与免疫疾病易感性的联系 | 人类KIT+和KITneg ILC2细胞以及多能ILC祖细胞 | 机器学习 | 哮喘、自身免疫性疾病、银屑病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 文本（转录组和表观基因组数据） | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-10-07 |
The clinical and molecular landscape of thalamic glioma
2026-Oct-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag146
PMID:42377275
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研究论文 | 通过整合临床病理和多组学数据，分析106例丘脑胶质瘤的分子特征和手术管理 | 揭示了9p21缺失与H3F3A突变互斥，9p21缺失可作为非DMG的高度特异性辅助标志物；通过因果推断证明microsurgical third ventriculostomy可显著降低术后脑积水风险 | 未明确说明 | 通过整合临床病理和多组学数据，改进丘脑胶质瘤的分子诊断和手术管理 | 106例丘脑胶质瘤患者，包括65例弥漫性中线胶质瘤和41例非弥漫性中线胶质瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因组分析、单细胞RNA测序、正交测定 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 106例丘脑胶质瘤患者 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-10-07 |
Single-cell multiomics gene regulatory landscape reveals impaired spermatogonial stem cells and macrophage-driven inflammaging during testicular aging
2026-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.005
PMID:42167485
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学，构建年轻与衰老小鼠睾丸的多组学衰老图谱，揭示精原干细胞损伤及巨噬细胞驱动的炎性衰老机制。 | 首次构建小鼠睾丸衰老的单细胞多组学图谱，将染色质可及性变化与转录失调关联，鉴定ZFX为早期生殖细胞中持续下调的转录因子，发现CD206H2-Eb1巨噬细胞通过分泌CXCL13驱动局部炎症并破坏精原干细胞微环境，并通过跨物种分析鉴定保守的衰老相关调控子如BRCA1和E2F1。 | 研究基于小鼠模型，其发现是否完全适用于人类睾丸衰老仍需进一步验证；样本仅涵盖年轻与衰老两个时间点，可能遗漏衰老过程中的动态变化；未进行ZFX和CXCL13的体内功能验证实验。 | 全面理解睾丸衰老的表观遗传驱动因素，揭示精原干细胞损伤和巨噬细胞驱动的炎性衰老机制，为缓解年龄相关生殖衰退提供潜在治疗靶点。 | 年轻和衰老小鼠的睾丸组织 | 单细胞多组学、空间转录组学 | 生殖衰老、男性生殖健康衰退 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞表观遗传数据、空间转录组数据 | 年轻和衰老小鼠的睾丸组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序、10x Chromium单细胞ATAC测序、10x Visium空间转录组学 |
| 46 | 2026-10-07 |
Spatial biology in cancer epigenetics
2026-Oct, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70310
PMID:42487511
|
综述 | 本文综述了空间表观基因组学技术（包括空间ATAC-seq、空间CUT&Tag、空间CUT&RUN、空间DNA甲基化分析及多模态策略）在癌症研究中的应用现状与前景 | 系统性地总结了空间表观基因组学这一新兴领域的技术全景，涵盖染色质可及性、组蛋白修饰和DNA甲基化的空间检测方法，并提出了整合表观遗传、转录和蛋白质组信息的多模态策略 | 空间表观基因组学仍面临技术和计算方面的挑战，尚未完全成熟 | 探讨空间表观基因组学技术在癌症表观遗传学研究中的应用，包括在保留组织结构的前提下研究染色质可及性、组蛋白修饰和DNA甲基化 | 癌症组织及肿瘤微环境 | 空间表观基因组学 | 癌症 | 空间ATAC-seq、空间CUT&Tag、空间CUT&RUN、空间DNA甲基化分析、多模态整合策略 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、空间ATAC-seq、空间CUT&Tag、空间CUT&RUN、空间DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 47 | 2026-10-07 |
Membrane depolarization drives tumor-suppressive cell competition via hedgehog signaling activation
2026-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.05.010
PMID:42190941
|
研究论文 | 该研究结合果蝇遗传学、单细胞RNA测序和哺乳动物共培养模型，揭示膜去极化通过激活Hedgehog信号驱动肿瘤抑制性细胞竞争 | 首次揭示膜电位去极化通过稳定Smoothened蛋白、异常激活Hedgehog信号来驱动肿瘤抑制性细胞竞争，并发现果蝇与哺乳动物上皮细胞中该机制高度保守 | 研究主要基于果蝇眼上皮和MDCK细胞系模型，缺乏人类原发肿瘤样本或体内哺乳动物模型的直接验证 | 探究质膜电位在肿瘤抑制性细胞竞争中的机制作用及其与Hedgehog信号通路的关联 | 果蝇眼上皮中scribble缺陷的loser克隆以及Scrib敲低的Madin-Darby犬肾细胞 | 细胞生物学、肿瘤生物学 | 泛癌种（癌症预防与监测） | 单细胞RNA测序、果蝇遗传学、哺乳动物细胞共培养 | 果蝇遗传模型、MDCK细胞共培养模型 | 基因表达数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-10-07 |
Phase I Trial of GPC3-Targeted TCR Fusion Construct, CT0180, in Patients with Advanced Hepatocellular Carcinoma
2026-Oct-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-26-1084
PMID:42531433
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研究论文 | 该研究报道了靶向GPC3的TCR融合构建体CT0180在晚期肝细胞癌患者中的I期临床试验结果 | CT0180是一种将GPC3靶向单链可变区片段与CD3ε连接的新型TCR融合构建体，可整合入天然TCR复合物并在GPC3结合后激活完整TCR信号 | 样本量小（仅7例患者），为开放标签、剂量递增的I期试验，缺乏对照组，初步疗效需进一步验证 | 评估CT0180在晚期GPC3阳性肝细胞癌患者中的安全性、初步疗效及细胞药代动力学 | 经标准治疗进展或不耐受的晚期GPC3阳性肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 文本, 图像 | 7例患者，共接受15次输注 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-10-07 |
MAPK-driven glioma progression and reprogramming of the tumor-associated immune response
2026-Oct-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag147
PMID:42377256
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研究论文 | 本文通过多组学方法（单核RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学）研究了MAPK驱动的多形性黄色星形细胞瘤（PXA）从免疫丰富的低级别肿瘤向侵袭性胶质瘤演变过程中的肿瘤进展及肿瘤相关免疫应答重编程 | 利用PXA的疾病轨迹，结合单核RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学多组学方法，纵向追踪了胶质瘤从低级别到高级别进展过程中免疫微环境的动态变化，揭示了缺氧和趋化因子信号在胶质瘤-免疫景观演变中的关键作用 | NA | 识别调控胶质瘤-免疫景观的因素，探索胶质瘤进展过程中肿瘤微环境和免疫应答的动态变化，为胶质瘤的免疫治疗策略提供依据 | 38个肿瘤样本，包括10对纵向配对样本，来源于MAPK驱动的多形性黄色星形细胞瘤（PXA）患者 | 数字病理学, 机器学习 | 脑肿瘤, 胶质瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 图像, 文本 | 38个肿瘤样本，包括10对纵向配对样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-10-07 |
Bacterial serine protease EspP induces differentiation and expansion of enteroendocrine cells in human colonoids
2026-Oct-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用人结肠类器官，通过单细胞RNA测序技术，探究了细菌丝氨酸蛋白酶EspP对肠上皮细胞谱系分化和增殖的影响，发现EspP诱导肠内分泌细胞分化和扩增，并表达免疫相关细胞因子和趋化因子 | 首次在无微生物、基质和免疫细胞干扰的条件下，利用人结肠类器官结合单细胞RNA测序，揭示了EspP直接作用于肠上皮细胞，诱导肠内分泌细胞（尤其是肠嗜铬细胞）的优先分化和扩增，并发现这些诱导的肠内分泌细胞具有免疫特征，表达与巨噬细胞或中性粒细胞募集相关的细胞因子和趋化因子 | 研究仅关注急性EspP暴露的短期效应，未探讨长期暴露或慢性感染的影响；实验在体外类器官模型中进行，缺乏体内微环境和免疫细胞互作；未验证EspP诱导的肠内分泌细胞在体内的功能意义 | 探究EspP对肠上皮细胞转录组变化、细胞增殖和分化的影响，以及其在模拟EHEC感染肠道病理生理中的作用 | 人结肠类器官（human colonic organoids） | 单细胞组学 | 肠道感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序（droplet-based single-cell RNA sequencing） |
| 51 | 2026-10-07 |
Rates of Evolution Differ Between Cell Types Identified by Single-Cell RNAseq in Threespine Stickleback
2026-Oct, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.70565
PMID:42806242
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研究论文 | 该研究将单细胞RNA测序与进化基因组学相结合，探究三刺鱼不同细胞类型的特征基因在进化速率上是否存在差异 | 首次将scRNAseq与进化群体基因组学数据相结合，利用物种特异性细胞类型特征基因替代传统基因本体分类来研究进化速率差异，发现免疫细胞类型的特征基因进化尤为迅速 | 仅研究了肠道、头肾、肝脏和鳃四种组织，细胞类型覆盖有限；scRNAseq共表达网络中心性与FST之间仅呈弱相关趋势，因果关系尚不明确 | 利用单细胞RNA测序鉴定的细胞类型及其特征基因，结合进化基因组学数据，探究不同细胞类型的特征基因是否表现出不同的进化分化速率 | 三刺鱼（threespine stickleback）的肠道、头肾、肝脏和鳃组织 | 单细胞组学、进化基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、群体基因组学分析 | NA | 基因表达数据、基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-10-07 |
ATF6 contributes to cardiac macrophage polarization and metabolic reprogramming following myocardial ischemia/reperfusion injury
2026-Oct-01, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156791
PMID:42822644
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基础研究论文 | 本研究探讨了ATF6在心肌缺血再灌注损伤后对心脏巨噬细胞极化和代谢重编程的调控作用 | 首次揭示ATF6通过调控线粒体呼吸功能和ROS产生，影响单核细胞来源的CCR2+心脏巨噬细胞从促炎表型向修复表型的转化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证；ATF6调控巨噬细胞代谢重编程的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究ATF6在心肌缺血再灌注损伤后何时以及如何促进巨噬细胞极化和组织修复 | 野生型小鼠和ATF6敲除小鼠的心脏巨噬细胞及骨髓来源巨噬细胞 | 心血管疾病基础研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序、流式细胞术、Western blotting、免疫荧光、Seahorse代谢分析、ROS检测 | ATF6敲除小鼠心肌缺血再灌注模型 | 图像、文本、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-10-07 |
Unraveling the molecular landscape and therapeutic strategies for acute kidney injury: insights from transcriptomics, network pharmacology, virtual screening, and in vitro experiments
2026-Oct, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11528-z
PMID:42133161
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研究论文 | 该研究整合转录组学、网络药理学、虚拟筛选和体外实验，系统探究急性肾损伤的分子机制与潜在治疗靶点 | 整合多队列转录组分析、网络枢纽基因优先级排序、单核细胞类型定位、转化药物重定位分析及体外实验验证，构建了多层次框架来优先筛选AKI候选生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型的直接验证以及临床样本的大规模验证 | 系统研究急性肾损伤的分子机制并筛选潜在治疗靶点和药物 | 急性肾损伤相关的转录组数据、单细胞RNA测序数据及体外细胞模型 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 转录组测序， 单细胞RNA测序， 网络药理学， 分子对接 | WGCNA， PPI网络， CytoHubba， MCODE | 文本， 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq， single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-10-07 |
Redefining PHOX2B-Related Neurodevelopmental Disorders as Circuitopathies: A New Paradigm in Autonomic Network Medicine
2026-Oct, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-026-01641-2
PMID:42287513
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学、空间转录组学和病毒环路追踪等技术揭示的PHOX2B广泛解剖分布，提出将PHOX2B相关神经发育障碍重新定义为“PHOX2B环路病”这一多系统网络疾病新范式 | 提出“PHOX2B环路病（PHOX2B circuitopathies）”这一全新概念框架，将CCHS及相关疾病重新概念化为多系统网络障碍，区分原发性环路破坏与继发性全身级联反应，推动领域从被动对症管理转向主动精准药物发现和环路靶向策略 | 映射证据主要来源于小鼠模型，人类疾病模型（如多能干细胞来源的脑干类器官）的见解仍有限，尚需更多人类数据验证该环路病框架 | 解决PHOX2B在脑干中看似局限的表达如何导致广泛多系统临床表型这一长期悖论，并提出新的疾病分类和治疗范式 | PHOX2B基因及其相关神经发育障碍，包括先天性中枢性低通气综合征（CCHS）、Hirschsprung病和神经母细胞瘤 | 神经科学、网络医学 | 先天性中枢性低通气综合征、Hirschsprung病、神经母细胞瘤、神经发育障碍 | 单细胞转录组学、空间转录组学、病毒环路追踪 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2026-10-07 |
Transcriptomic profiling identifies tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF)-5 expression in human atherosclerotic plaques as a predictor of future cardiovascular events
2026-Oct, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 该研究通过批量转录组学比较早期与晚期颈动脉斑块中TRAF1-7的表达，在616例颈动脉内膜切除标本中评估TRAF5的预后价值，并通过单细胞RNA测序探索其免疫细胞机制 | 首次在人类动脉粥样硬化斑块中系统表征TRAF1-7的表达谱，发现TRAF5是唯一在晚期病变中显著下调的TRAF家族成员，并独立预测颈动脉内膜切除术后较低的心血管事件风险 | 研究局限于颈动脉内膜切除标本，结论可能不适用于其他血管床；单细胞RNA测序分析为观察性研究，TRAF5+B细胞的功能机制需要进一步实验验证；样本主要来自Athero-Express生物库，可能存在选择偏倚 | 表征人类动脉粥样硬化斑块中TRAF1-7的表达，确定其与斑块表型、心血管结局和细胞功能的关联 | 人类颈动脉粥样硬化斑块组织及其中浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 批量转录组学、单细胞RNA测序 | 多变量Cox回归 | 转录组数据、图像、文本 | 616例颈动脉内膜切除标本用于批量转录组学和预后分析，79例人类斑块中的259,493个细胞用于单细胞RNA测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于259,493个细胞的转录组分析 |
| 56 | 2026-10-07 |
Window-of-Opportunity Study Utilizing Preoperative Cetuximab in Patients with Head and Neck Cancer
2026-Oct-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-26-0258
PMID:42691952
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研究论文 | 一项单中心、单臂、开放标签的机会窗研究，对15例头颈癌患者术前给予西妥昔单抗，评估AXL表达与疗效的关系，并通过单细胞RNA测序探索耐药机制 | 利用术前机会窗设计在头颈癌患者中验证AXL作为西妥昔单抗耐药生物标志物的假设，并建立患者来源异种移植模型结合单细胞RNA测序分析敏感与耐药肿瘤的转录组差异 | 研究因COVID-19疫情提前终止，样本量较小（15例），AXL未能被验证为耐药生物标志物 | 验证临床前研究提出的假设，即低AXL表达与头颈癌患者对西妥昔单抗的临床反应相关，并描述术前给予西妥昔单抗的可行性和安全性 | 头颈癌患者 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 15例头颈癌患者，14例完成术前西妥昔单抗治疗 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-10-07 |
Integrated Genetic Screening Identifies FEN1 as a Selective Vulnerability and Temozolomide Resistance Mediator in Glioblastoma Stem Cells
2026-Oct-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-26-0150
PMID:42770249
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研究论文 | 该研究通过全基因组CRISPR-Cas9功能缺失筛选，在胶质母细胞瘤干细胞中鉴定出FEN1是选择性脆弱性靶点及替莫唑胺耐药介导因子 | 首次通过全基因组CRISPR-Cas9筛选在患者来源的胶质母细胞瘤干细胞模型中鉴定FEN1为选择性脆弱性靶点，并揭示其在替莫唑胺耐药中的关键作用，同时发现FEN1抑制可恢复耐药模型的化疗敏感性 | FEN1抑制仅对部分对FEN1抑制敏感的胶质母细胞瘤干细胞具有与替莫唑胺的协同致死效应，且研究主要基于体外和动物模型，尚未开展临床验证 | 鉴定胶质母细胞瘤干细胞中的选择性脆弱性靶点，探索克服治疗耐药的策略 | 患者来源的胶质母细胞瘤干细胞模型、正常神经干细胞、患者来源异种移植模型 | 机器学习 | 脑肿瘤 | CRISPR-Cas9全基因组功能缺失筛选、单细胞转录组学 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-10-07 |
A State-Resolved Single-Cell and Spatial Atlas Reveals IDH-Associated Differences in Malignant and Immune Architecture in Diffuse Glioma
2026-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.71022
PMID:42830894
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、单核RNA测序和空间转录组学对69个弥漫性胶质瘤样本进行分析，解析了七种恶性细胞状态，并揭示了IDH突变状态对恶性细胞状态和免疫微环境的影响 | 首次在IDH突变型与野生型弥漫性胶质瘤中系统性地解析了七种复发性恶性细胞状态，并揭示了IDH轴通过限制恶性细胞状态库和偏向状态特异性代谢及免疫调节程序来塑造胶质瘤行为 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究IDH生物学如何限制恶性细胞状态库及其免疫调节潜力，并阐明IDH突变型与野生型胶质瘤在恶性细胞状态和免疫结构上的差异 | 69个成人型弥漫性胶质瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 69个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2026-10-07 |
A graph-attentive GAN for rare-cell-aware single-cell RNA-seq data generation
2026-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014601
PMID:42832552
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研究论文 | 该论文提出了一种名为GARAGE的图注意力稀有细胞感知单细胞数据生成方法，通过在生成器输入中注入注意力加权的真实细胞泄漏信息来增强合成单细胞RNA测序数据的质量 | 首次将图注意力网络与生成对抗网络耦合，通过在生成器输入中注入基于k近邻细胞图和GAT优先化的高注意力细胞嵌入（即注意力引导的泄漏），来引导合成过程朝向数据流形中生物学合理的区域，同时尊重细胞类型比例，从而加速训练、减少模式丢失并保留稀有细胞结构 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 解决单细胞RNA测序下游分析中高维小样本（HDSS）困境以及稀有细胞类型导致的类别不平衡问题，提升特征选择和细胞聚类的鲁棒性，并生成更真实的合成单细胞数据 | 单细胞RNA测序数据，特别是包含稀有细胞类型的真实scRNA-seq基准数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | GAN, GAT | 文本（基因表达矩阵） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-10-07 |
TGF-β/Smad-Associated Epithelial-Fibroblast Remodeling Underlies Collagen Deposition in Chronic Rhinosinusitis With Nasal Polyps
2026-Oct, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70532
PMID:42836585
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序数据与组织及蛋白水平验证，揭示TGF-β/Smad3相关的上皮-成纤维细胞重塑程序驱动慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的胶原沉积 | 整合了两个独立人类队列的单细胞RNA测序数据，结合组织学和蛋白水平验证，首次系统刻画了CRSwNP中上皮-成纤维细胞-免疫细胞间通过TGF-β/Smad3信号轴协调重塑的程序，并发现GPNMB阳性巨噬细胞亚群是TGFB1的优先来源 | 因果关系仍需空间转录组学和功能实验验证，地塞米松仅部分逆转重塑表型 | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉鼻黏膜重塑中上皮-间质转化、成纤维细胞活化、胶原沉积与TGF-β/Smad信号是否协同作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻息肉组织及对照鼻黏膜组织，以及OVA/SEB诱导的CRSwNP样小鼠模型 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Masson三色染色, PAS染色, Western blot | NA | 图像, 文本 | 两个独立人类队列的公开单细胞RNA测序数据集，CRSwNP患者及对照的鼻息肉组织样本，以及OVA/SEB诱导的小鼠模型（含地塞米松干预组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |