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当前共找到 41304 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-07-08 |
SenFlag gene signature identifies senescent cells in mouse and human tissues through a conserved core transcriptional program
2026-Jul-06, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00845-6
PMID:42410256
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研究论文 | SenFlag基因特征通过保守的核心转录程序识别小鼠和人类组织中的衰老细胞 | 基于整合核心基因表达特征，提出了一个简化且增强的基因标记SenFlag，能够识别体内小鼠和人类组织中罕见但逐渐积累的衰老细胞群体 | 未明确说明局限性 | 开发一个适用于单细胞转录组数据的衰老细胞识别工具 | 小鼠和人类组织中的衰老细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个衰老模型中的批量及单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-07-08 |
Gata3 dosage governs primitive endoderm versus trophectoderm specification in embryonic stem cells
2026-Jul-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00860-y
PMID:42410264
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研究论文 | 揭示Gata3剂量在小鼠胚胎干细胞中调控原始内胚层与滋养外胚层命运决定的双向作用 | 首次发现Gata3作为剂量敏感调控因子，能够通过剂量差异驱动原始内胚层与滋养外胚层两种互斥的细胞谱系程序，并揭示其剂量依赖的增强子重分布与先锋因子活性 | 主要基于小鼠胚胎干细胞和类胚体模型，可能尚未在体内胚胎发育或人类干细胞系统中验证 | 探究转录因子剂量在早期胚胎发育谱系特化中的调控机制 | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的3D类胚体 | 机器学学习 | 不适用 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎干细胞系及3D类胚体（具体样本数未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞转录组测序平台 |
| 43 | 2026-07-08 |
FZD5 drives macrophage-mediated immunomodulation and predicts prognosis in glioma: evidence from single-cell sequencing
2026-Jul-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16332-4
PMID:42410370
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研究论文 | 利用单细胞测序技术揭示FZD5在胶质瘤中驱动巨噬细胞介导的免疫调节并预测预后 | 首次从单细胞层面揭示FZD5信号主要来源于肿瘤相关巨噬细胞（TAM），并阐明其通过调控线粒体自噬和M2极化促进胶质瘤进展的机制 | 未明确说明局限性，可能包括体外实验的局限性及缺乏大规模临床验证 | 探究FZD5在胶质瘤免疫微环境中的作用及其预后价值 | 胶质瘤患者肿瘤组织及巨噬细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化 | Cox回归, LASSO回归, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 利用CGGA、TCGA及GEO数据集，具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2026-07-08 |
Spatial transcriptomic profiling reveals molecular signatures of endocapillary hypercellularity in IgA nephropathy
2026-Jul-06, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-026-05171-x
PMID:42410511
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示IgA肾病中毛细血管内细胞增多的分子特征 | 首次通过空间转录组学分析人类IgA肾病中毛细血管内细胞增多的分子特征，发现淀粉样β前体蛋白、分化簇47和整合素α V的新下调作用 | 样本量有限（仅东亚患者）且未提及外部验证，空间转录组学技术的分辨率可能限制对细胞异质性的深入解析 | 阐明IgA肾病中毛细血管内细胞增多的分子基础及其与疾病进展的关系 | IgA肾病患者的肾脏活检标本 | 数字病理学 | 肾病（IgA肾病） | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 来自东亚患者的肾脏活检标本，具体数量未说明 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析平台 |
| 45 | 2026-07-08 |
Prioritization of molecular signatures between BDE-209-relevant targets and ulcerative colitis: a network toxicology and bioinformatics analysis
2026-Jul-06, BMC pharmacology & toxicology
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40360-026-01170-8
PMID:42410645
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研究论文 | 通过网络毒理学和生物信息学分析，系统性评估BDE-209相关靶点与溃疡性结肠炎分子特征之间的重叠并优先排序候选基因 | 首次系统性地整合预测的BDE-209相关靶点与溃疡性结肠炎转录组特征，利用机器学习、单细胞RNA测序和分子对接等多方法联合分析，识别共享的分子标志物 | 研究依赖于公共数据集和计算机预测，缺乏实验验证；BDE-209相关靶点基于计算机预测而非直接实验数据，结果属于假设生成性质 | 评估BDE-209相关靶点与溃疡性结肠炎分子特征之间的重叠，并优先排序候选基因以探索环境污染物对UC的潜在影响 | BDE-209相关靶点和溃疡性结肠炎相关的分子标志物 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 转录组测序、单细胞RNA测序、分子对接 | 机器学习算法、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-07-08 |
Urinary volatile organic compound metabolites and depressive symptoms among U.S. adults with cardiovascular-kidney-metabolic syndrome stages 0-3: NHANES-based associations and in silico multi-omics insights
2026-Jul-04, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2026.103508
PMID:42398862
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研究论文 | 基于NHANES数据库和美国心血管-肾脏-代谢综合征0-3期成人数据，分析尿液中挥发性有机化合物代谢物与抑郁症状的关联，并结合计算机多组学分析揭示潜在机制 | 首次在CKM综合征0-3期成人中系统评估16种VOC代谢物与抑郁症状的关联，并结合网络毒理学和单细胞RNA测序揭示PI3K/AKT相关神经免疫通路的潜在作用 | NHANES为横断面研究，无法建立因果关系；VOC代谢物单次测量可能存在分类错误；未考虑CKM综合征不同亚组间的潜在差异 | 探究尿液挥发性有机化合物代谢物与美国CKM综合征0-3期成人抑郁症状的关联及潜在机制 | 美国NHANES 2011-2018数据库中CKM综合征0-3期成人 | 机器学习 | 心血管疾病 | NHANES数据关联分析, 网络毒理学, 单细胞RNA测序, 分子对接 | NA | 文本 | 基于NHANES 2011-2018数据库的CKM综合征0-3期成人样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-07-08 |
Pregnancy-induced tissue-resident memory-like T cells contribute to tumor control in breast cancer
2026-Jul-03, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02579-3
PMID:42399697
|
研究论文 | 本文揭示了妊娠诱导的乳腺组织驻留记忆样T细胞对乳腺癌具有保护作用 | 首次发现妊娠诱导的T样细胞在乳腺组织中富集，并通过IL-15和TGFβ信号通路调控，且这些细胞具有效应功能并能控制肿瘤生长 | 未明确T样细胞在人体中的长期持久性及具体分子机制 | 探究妊娠降低乳腺癌风险的潜在免疫机制 | 经产与未产妇及小鼠的乳腺组织和T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 人乳腺组织样本、小鼠模型（具体数量未详述） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组分析 |
| 48 | 2026-07-08 |
Pilot spatial transcriptomics of dental pulpitis suggests immune-fibroblast profiling linked to reversibility
2026-Jul-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08520-4
PMID:42399991
|
研究论文 | 利用空间转录组学分析牙髓炎的免疫-成纤维细胞特征，探索其与可逆性的关联 | 首次使用空间转录组学以空间分辨率方式比较健康牙髓、可逆性和不可逆性牙髓炎的分子异质性，并发现临床诊断与转录组状态可能存在不一致 | 样本量较小（仅4例），属于初步探索性研究，需在更大队列中验证候选标志物 | 探索牙髓炎的空间转录组异质性，识别与可逆性相关的免疫-成纤维细胞特征 | 人类牙髓组织（健康、可逆性牙髓炎、不可逆性牙髓炎） | 数字病理学 | 牙髓炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 4例人类牙髓组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium CytAssist V2 |
| 49 | 2026-07-08 |
scGenoByte: a GenoByte embedding transformer with biological priors for cell type annotation
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag369
PMID:42407121
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研究论文 | 提出scGenoByte框架，利用生物先验知识进行全基因建模以实现细胞类型注释 | 创新性地设计了GenoBytes生物一致单元，利用蛋白质-蛋白质相互作用网络和基因旁系同源网络实现全转录组高效建模，并通过整合蛋白质表示和通路活性预测任务增强细胞表征学习 | 未提及局限性 | 开发一种基于生物先验的全基因嵌入Transformer模型用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 8个数据集 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 50 | 2026-07-08 |
scImmuneCo: a compendium of cell-type-specific functional modules for decoding immune responses from single-cell RNA-seq data
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag366
PMID:42411821
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研究论文 | 开发了一个名为scImmuneCo的免疫细胞特异性共表达模块资源，用于从单细胞RNA-seq数据中解码免疫反应 | 通过修改的图框架从170万个细胞中构建了873个稳健模块，覆盖7种主要免疫细胞类型，提供了细胞类型特异性的功能推断网络，并能揭示传统通路工具无法捕捉的细胞特异性调控程序 | 未提供具体局限性信息 | 开发高分辨率、数据驱动的功能推断资源，以细胞分辨率解析免疫机制并识别疾病相关的转录程序 | 来自17种免疫学条件的170万个免疫细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图框架 | 基因表达数据 | 170万个细胞，来自17种免疫学条件 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-07-08 |
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-Jul-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aec8514
PMID:42096520
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研究论文 | 提出TranscriptFormer，一个跨1.53亿年进化史的生成式细胞图谱基础模型，在细胞类型分类和疾病状态识别上达先进水平 | 首次训练包含12个物种、1.12亿细胞的生成式基础模型，实现跨超过6.85亿年进化距离物种的零样本疾病状态识别，无需训练即可自然涌现发育轨迹和系统发育关系 | 未说明 | 开发通用单细胞分析框架，揭示跨物种细胞组织的普适原则 | 12个物种的细胞，涵盖1.53亿年进化史 | 机器学习 | 未指定 | 单细胞转录组测序 | 生成式基础模型（Transformer变体） | 单细胞基因表达数据 | 1.12亿个细胞 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 52 | 2026-07-08 |
Patterning human kidney organoids with synthetic Wnt-secreting organizers
2026-Jul-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adu9122
PMID:42391378
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研究论文 | 通过合成Wnt分泌组织者实现人类肾脏类器官的模式化 | 首次通过引入工程化的Wnt分泌细胞组织者，在体外重建了肾脏发育中的信号几何结构，从而实现对肾脏类器官空间模式的控制 | 未提及具体限制 | 研究肾脏发育中组织信号几何结构的作用，并探索在体外重建该结构以控制组织模式化的可能性 | 人类肾脏类器官及工程化Wnt分泌细胞组织者 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2026-07-08 |
The dual role of the microbiome in sepsis: A complex interplay between pathogenicity and protection
2026-Jul-02, Physics of life reviews
IF:13.7Q1
DOI:10.1016/j.plrev.2026.07.001
PMID:42407193
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综述 | 探讨微生物组在脓毒症中的双重作用，强调其既参与致病机制又具有保护潜力 | 提出超越传统抗感染治疗，以微生物组为中心的免疫-微生物稳态修复新范式 | 未明确讨论现有微生物组调控策略的具体临床转化障碍 | 总结微生物组在脓毒症发病和免疫调节中的双重作用，并展望基于微生物组调控的治疗策略 | 脓毒症患者中微生物组与宿主免疫系统的相互作用 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞组学，空间转录组学，代谢组学 | NA | 综述文章，不涉及具体数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026 Jul-Aug, Mycologia
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/00275514.2026.2631200
PMID:41871174
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研究论文 | 基于单细胞转录组学在阿拉斯加湾发现了一种新的海洋寄生微生物——Rozellomyces，并对其特征和分布进行了描述 | 首次通过单细胞转录组学方法从阿拉斯加湾分离并描述了一种新的罗兹菌门（Rozellomycota）物种，系统发育分析证实其与已知分类群的差异，并基于metaPR数据库恢复其地理分布 | 未明确提及限制，但可能受限于单一样本来源（阿拉斯加湾）和数据库依赖的分布推断 | 揭示海洋寄生微生物的多样性和生态功能，特别是罗兹菌门中未被充分研究的类群 | 来自阿拉斯加湾的新罗兹菌分离株，以及其寄主——海洋硅藻 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序、系统发育分析、扩增子序列变异分析 | NA | 转录组数据、扩增子序列数据 | 阿拉斯加湾的1个罗兹菌分离株样本及metaPR数据库中的相关序列变异 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-07-08 |
PTBP1 knockdown reprograms glioma stem cells into neuronal-like cells and suppresses tumorigenesis via the DUSP5-ERK1/2 signaling pathway
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag068
PMID:41903206
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研究论文 | 通过深度学习形态学分类、转录组学和单细胞RNA-seq分析，发现PTBP1敲低通过DUSP5-ERK1/2信号通路将胶质瘤干细胞重编程为神经元样细胞并抑制肿瘤发生 | 首次建立PTBP1/DUSP5/ERK1/2轴调控胶质瘤干细胞增殖与分化的新机制，并开发A2-PLGA/venetoclax纳米治疗策略，将白血病药物venetoclax重新用作PTBP1靶向药物 | 未提及 | 探究PTBP1在胶质瘤干细胞形态和肿瘤发生中的作用机制及潜在治疗方法 | 65名胶质瘤患者的H&E染色标本和小鼠原位模型 | 数字病理学， 机器学习 | 胶质瘤（胶质母细胞瘤） | RNA-seq， 单细胞RNA-seq， 慢病毒敲低 | 深度学习模型（形态学分类） | 图像（H&E染色）， 转录组数据， 单细胞RNA-seq数据 | 65名胶质瘤患者标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-07-08 |
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag073
PMID:41913047
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型探索胶质母细胞瘤的免疫环境，建立患者来源异种移植模型以模拟复发性人类GBM | 首次利用表达关键人细胞因子的免疫缺陷小鼠构建人源化GBM模型，成功重现人类复发性GBM的免疫细胞特征，并增强肿瘤异质性 | 仅评估了两个免疫缺陷小鼠品系，可能未涵盖所有相关细胞因子表达模型；人源化程度及长期稳定性未详细讨论 | 建立能真实反映人类GBM免疫环境的小鼠模型，以促进新型疗法（特别是免疫疗法）的研究 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者来源的放疗抵抗性异种移植物，以及人源化小鼠中重建的人类免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 两种免疫缺陷小鼠模型，接受CD34+造血干祖细胞移植后植入放疗抵抗性PDX肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-07-08 |
Glyoxalase 1 promotes glioma progression by modulating Sox2 transcriptional networks in glioma stem-like cells
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag090
PMID:42011505
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研究论文 | 通过单细胞转录组学等手段发现乙二醛酶1通过调节Sox2转录网络促进胶质瘤干细胞样细胞驱动的肿瘤进展 | 首次发现Glo1是胶质瘤干细胞样细胞的关键调控因子，并揭示其作为治疗靶点的潜力 | 未明确指出局限性 | 研究乙二醛酶1在胶质瘤干细胞样细胞和胶质母细胞瘤中的作用及治疗潜力 | 胶质瘤干细胞样细胞和胶质母细胞瘤 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学，功能性基因组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源异种移植模型和宫内电穿孔模型的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2026-07-08 |
Optics-free spatial genomics for mapping mammalian brain aging by IRISeq
2026-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02293-1
PMID:42120609
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研究论文 | 介绍一种无光学器件的空间基因组学平台IRISeq，用于绘制哺乳动物大脑衰老图谱 | 提出无光学器件、基于索引测序的空间交互映射平台IRISeq，实现可调尺寸和分辨率的组织分析，兼具高通量和低成本优势 | 未明确提及，可能包括分辨率受限或样本处理复杂性 | 开发无光学器件的空间转录组学平台，揭示大脑衰老中淋巴细胞依赖的区域特异性机制 | 成年和老年小鼠脑部冠状切片，包括野生型和两种淋巴细胞缺陷模型（Rag1和Prkdc突变体） | 机器学习和空间转录组学 | 老年性疾病 | 索引测序（Indexed Sequencing）、单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据 | 超过70个小鼠脑部冠状切片，生成超过46万个空间转录组图谱，整合783,264个单细胞转录组 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | IRISeq | 无光学器件的空间交互映射平台，分辨率为5-50微米 |
| 59 | 2026-07-08 |
Single-cell multi-omic atlas and morphogen screening informs midbrain and hindbrain organoid engineering
2026-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02316-x
PMID:42237030
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研究论文 | 通过单细胞多组学图谱和形态发生素筛选，指导中脑和后脑类器官的工程化构建 | 首次结合单细胞转录组与可及染色质测序，系统解析中脑和后脑类器官的细胞组成及调控机制，并通过高通量形态发生素筛选扩展类器官模型 | 研究主要依赖体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂微环境及长期发育过程 | 阐明中脑和后脑类器官的细胞类型及基因调控网络，优化类器官工程化策略 | 中脑和后脑类器官的细胞亚群及神经分化过程 | 数字病理学, 机器学习 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 转录因子扰动, 形态发生素筛选 | 基因调控网络, 转录因子扰动模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-07-08 |
Laser interstitial thermal therapy enhances bidirectional blood-brain barrier permeability in glioblastoma
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag080
PMID:41981754
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研究论文 | 激光间质热疗增强胶质母细胞瘤血脑屏障双向通透性的机制研究 | 首次揭示LITT通过下调细胞连接通路和上调胞吞作用实现血脑屏障双向通透性变化，并证明其能促进循环肿瘤DNA释放 | 未提及具体局限性 | 探究激光间质热疗对胶质母细胞瘤血脑屏障通透性的机制及时空特征 | 小鼠模型及人胶质母细胞瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、透射电镜、数字液滴PCR | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠模型（具体数量未提及）及人胶质母细胞瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |