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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-01-06 |
Single-Cell RNA sequencing identifies NAMPT as a potential therapeutic target in autoimmune uveitis
2025-Dec-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.030
PMID:41475661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了NAMPT在自身免疫性葡萄膜炎中的关键作用,并探讨了其作为潜在治疗靶点的机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面分析NAMPT在自身免疫性葡萄膜炎中对免疫细胞亚群、转录程序和细胞间通讯网络的影响,并验证了NAMPT-Hif1α轴在人类疾病中的保守性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的人类临床试验来验证NAMPT抑制剂的疗效和安全性 | 探究NAMPT在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其潜在机制,以发现新的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的颈引流淋巴结细胞、VKH病患者的PBMCs以及健康对照 | 单细胞测序 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、过继转移实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 包括正常、EAU和NAMPT抑制剂处理的EAU小鼠的CDLN细胞,以及VKH患者和健康对照的PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 562 | 2026-01-06 |
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2025-Dec-24, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.047
PMID:41445186
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研究论文 | 本研究开发了一种通过基因工程改造造血干细胞,使其在胸腺微环境中持续产生CAR-T细胞的平台,以解决CAR-T细胞体内持久性不足和肿瘤复发的问题 | 首次利用胸腺微环境支持造血干细胞分化为T细胞的特性,建立可诱导表达CAR的基因工程平台,通过调节共刺激信号和内源性T细胞受体库来规避胸腺阴性选择,实现自体反应性CAR-T细胞的胸腺内发育 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;长期安全性和对正常组织的潜在影响仍需进一步评估;诱导表达系统的精确调控和时效性需要优化 | 开发能够持续在体内生成、具有自我更新能力的CAR-T细胞疗法,以克服现有CAR-T细胞治疗中持久性不足和肿瘤复发的挑战 | 基因工程改造的造血干细胞和祖细胞、胸腺微环境、CD19 CAR-T细胞 | 细胞与基因治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序、连续移植研究、基因工程 | NA | 单细胞RNA测序数据、移植实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 563 | 2026-01-06 |
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2025-Dec-21, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.002
PMID:41435889
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了小鼠星状病毒(muAstV)在肠道上皮细胞中的感染特性,并阐明了MDA5-MAVS信号通路和干扰素-λ在限制病毒感染中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序明确了muAstV在多种肠道上皮细胞(包括杯状细胞和多种肠上皮细胞)中的感染特性,并揭示了MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类星状病毒感染的直接转化需要进一步验证 | 阐明小鼠星状病毒感染中先天免疫调控机制,特别是MDA5-MAVS信号通路和干扰素-λ的作用 | 小鼠星状病毒(muAstV)及其感染的肠道上皮细胞 | 单细胞组学 | 肠道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2026-01-06 |
Senescent CD8 T Effector Memory Cells are Functionally Impaired, Enriched in Aging and Disease, and a Barrier to Immunotherapy
2025-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.16.694716
PMID:41446063
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研究论文 | 本文研究了表达SA-βGal的CD8 T效应记忆细胞的衰老状态、功能特性及其在衰老和疾病中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了SA-βGal表达CD8 T细胞的独特转录特征,并证明T细胞衰老与T细胞耗竭不同且占主导地位,限制了免疫疗法的反应 | 研究主要基于人类样本,未涉及动物模型验证;样本来源和疾病类型可能有限,需要进一步扩大验证 | 探究CD8 T细胞的衰老状态及其在衰老、疾病和免疫疗法反应中的功能影响 | 人类CD8 T细胞,特别是表达SA-βGal的效应记忆T细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病、癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自老年供体、年龄相关疾病患者、癌症患者和吸烟者的CD8 T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 565 | 2026-01-06 |
Integrated Single-cell Analysis Uncovers Regulatory Logic of Cranial Ectoderm Development
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.17.694990
PMID:41446274
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据分析,揭示了颅部外胚层发育的调控逻辑,重点关注转录因子下游活性及跨胚层信号网络 | 首次在鸡中脑轴向水平发育系列中,通过高分辨率单细胞转录组分析,识别了与特定发育域时空限制相关的泛表达染色质修饰因子,并建立了分析scRNAseq数据以理解组织模式的新框架 | 研究基于鸡胚胎模型,可能不完全适用于其他物种;且主要依赖计算推断,需实验验证 | 探究颅部外胚层发育过程中,相邻组织间时空协调的基因调控机制 | 鸡胚胎中脑轴向水平从原肠胚形成到神经胚后阶段的发育系列细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2026-01-06 |
scCotag: Diagonal integration of single-cell multi-omics data via prior-informed co-optimal transport and regularized barycentric mapping
2025-Dec-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693589
PMID:41446270
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研究论文 | 本文提出了一种名为scCotag的深度学习框架,用于单细胞多组学数据的对角线整合,通过先验信息引导的协同最优传输和正则化重心映射来解决现有方法的局限性 | 提出了一种基于协同最优传输的深度学习框架,能够迭代推断细胞对齐和特征对应关系,并利用先验信息,同时通过正则化重心映射和图重加权联合学习细胞和特征嵌入,特别擅长处理并非所有细胞都可对齐的模拟不平衡场景 | 未明确提及 | 开发一种更稳健的单细胞多组学数据对角线整合方法,以促进更精细的生物学解释和调控机制推断 | 单细胞多组学数据(RNA-seq和ATAC-seq) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 深度学习框架(基于协同最优传输) | 单细胞多组学数据 | 涉及人脑、骨髓和血液数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 567 | 2026-01-06 |
Considerations for Spatial Omics, Metabolite Analyses, and Tissue-Harvesting Artifacts
2025-Dec, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70315
PMID:41347273
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评论 | 本文讨论了空间组学、代谢物分析及组织采集过程中可能产生的伪影问题 | 强调了在空间生物学新兴技术背景下,组织采集和酶失活方法对保持神经化学物质完整性和避免伪影生成的重要性 | 本文为社论性质,未提供具体实验数据或案例研究 | 探讨空间分子分析技术应用中组织准备的关键考虑因素 | 空间组学和代谢物分析技术 | 空间生物学 | NA | 空间质谱成像、空间转录组学、激光显微切割、单细胞类型分析、下一代RNA测序 | NA | 空间分子数据、代谢物数据 | NA | NA | 空间质谱成像、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2026-01-06 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics Uncovers Shared and Distinct Molecular Signatures in Cystic Fibrosis and Primary Ciliary Dyskinesia
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.17.688876
PMID:41332697
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞转录组学分析,揭示了囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍在分子特征上的异同 | 首次使用预训练的transformer模型(scGPT)进行基因调控网络分析,通过差异注意力分析识别两种疾病间注意力分数改变的基因和通路 | 研究依赖于公开可用数据及本团队生成的数据,可能存在样本选择偏差,且未进行实验验证 | 比较囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍的分子特征,以指导个性化治疗策略 | 囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍患者的呼吸道细胞 | 自然语言处理 | 囊性纤维化,原发性纤毛运动障碍 | 单细胞RNA-seq | transformer (scGPT) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2026-01-06 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
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研究论文 | 本文介绍了REMODEL试验的设计和基线特征,该试验旨在研究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾脏病患者中的肾脏特异性效应和作用机制 | 该试验首次结合了MRI成像、肾脏活检以及单核和空间转录组学等多维度方法,以探索GLP-1受体激动剂在肾脏保护中的机制 | 样本量相对较小(106名参与者),且试验周期为52周,可能无法完全捕捉长期效应 | 研究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾脏病患者中的肾脏特异性效应及作用机制 | 2型糖尿病和慢性肾脏病的成年患者 | 数字病理学 | 2型糖尿病和慢性肾脏病 | 磁共振成像(MRI)、单核转录组学、空间转录组学、病理学和组织学评估 | NA | 医学影像、组织样本、临床数据 | 106名参与者(其中33名为肾脏活检亚组) | NA | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 570 | 2026-01-06 |
Identification of lipid metabolism-related signature in nonalcoholic fatty liver: evidences from transcriptomics and single cell RNA-sequencing analysis
2025-Oct-13, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03215-w
PMID:41084051
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞RNA测序分析,识别了与非酒精性脂肪肝相关的脂质代谢基因,构建了诊断模型并探索了其免疫浸润机制 | 结合转录组学、单细胞RNA测序和机器学习算法,识别了PRKAA2和ME1作为NAFLD的关键脂质代谢基因,并构建了高诊断性能的列线图模型 | 研究依赖于公共数据库数据,实验验证仅针对ME1基因,样本来源和多样性可能有限 | 识别脂质代谢相关基因,构建NAFLD诊断模型,并揭示其潜在机制 | 非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD) | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝 | 转录组学,单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blotting | 机器学习算法,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 571 | 2026-01-06 |
Spatial Transcriptome Analysis of B7-H4 in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: A Novel Therapeutic Target for Anti-Immune Checkpoint Inhibitors
2025-Jun-30, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01815-w
PMID:40586978
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研究论文 | 本研究通过免疫组化和空间转录组学分析,探讨了B7-H4在头颈部鳞状细胞癌中的表达模式及其作为免疫检查点抑制剂耐药治疗靶点的潜力 | 揭示了B7-H4与PD-L1在肿瘤细胞中的互斥表达模式,并首次结合空间转录组学证实了B7-H4蛋白与VTCN1 mRNA的共定位,为ICI耐药患者提供了新的治疗靶点 | 样本量相对较小(空间转录组学仅分析6例),且未进行功能性验证实验 | 评估B7-H4在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其作为免疫检查点抑制剂替代治疗靶点的可行性 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本,包括肿瘤组织、相邻鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组化,空间转录组学 | NA | 组织图像,空间转录组数据 | 组织微阵列包含94例HNSCC、94例相邻SIN和69例相邻NOM样本;空间转录组学分析6例HNSCC及其配对的SIN和NOM | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2026-01-06 |
Mapping satellite glial cell heterogeneity reveals distinct spatial organization and signifies functional diversity in the dorsal root ganglion
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654813
PMID:40475507
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性,并通过整合单细胞RNA测序与免疫组化等技术,识别、验证并空间定位了四个不同的SGC亚群 | 首次在小鼠背根神经节中对卫星胶质细胞异质性进行综合表征,识别并空间定位了四个功能不同的SGC亚群,并在人类DRG中发现了内外双层SGC结构 | NA | 探究背根神经节中卫星胶质细胞的异质性、空间分布及其潜在功能意义 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2026-01-06 |
High-Sensitivity PD-L1 Staining Using Clone 73-10 Antibody and Spatial Transcriptomics for Precise Expression Analysis in Non-Tumorous, Intraepithelial Neoplasia, and Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck
2025-May-20, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01798-8
PMID:40392349
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研究论文 | 本研究利用高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术,评估头颈部鳞状细胞癌中PD-L1的表达,旨在扩大免疫检查点抑制剂治疗的适用患者范围 | 首次结合高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学分析,系统评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌、上皮内瘤变及正常组织中的表达,并揭示其与免疫微环境及预后的关联 | 样本量相对有限(94例临床样本,其中6例进行空间转录组学分析),且为单中心研究,可能影响结果的普遍性 | 评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中的表达,探索其作为免疫治疗生物标志物的潜力,以优化患者筛选策略 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本,包括癌组织、配对的上皮内瘤变及正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色,空间转录组学 | NA | 组织图像,转录组数据 | 94例头颈部鳞状细胞癌临床样本,包括配对的鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜样本,其中6例进行了空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 574 | 2026-01-06 |
Single-cell insights into epithelial morphogenesis in the neonatal mouse uterus
2023-12-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316410120
PMID:38019863
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠子宫上皮细胞的形态发生过程 | 首次在新生儿期小鼠子宫中应用单细胞转录组技术,识别了上皮细胞异质性、新腺体上皮基因以及调控网络 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他哺乳动物;样本时间点限于出生后1至15天 | 阐明新生儿期子宫上皮细胞的成熟、决定和分化的细胞与分子机制 | 新生小鼠子宫的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠子宫上皮细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 575 | 2026-01-05 |
Gut microbiota dysbiosis exacerbates acute pancreatitis via Escherichia coli-driven neutrophil heterogeneity and NETosis
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2606480
PMID:41439481
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研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群失调,特别是大肠杆菌的增多,通过重塑免疫系统、促进异常中性粒细胞胞外诱捕网形成,从而加剧急性胰腺炎的机制 | 首次将肠道菌群失调与急性胰腺炎中特定的中性粒细胞亚群异质性及NETosis通路激活联系起来,并明确了革兰氏阴性菌(尤其是大肠杆菌)是关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型,人体样本验证相对有限;特定细菌与免疫亚群之间的直接因果机制仍需进一步阐明 | 探究肠道菌群失调加剧急性胰腺炎的具体微生物种类及其免疫学机制 | 无菌小鼠、无特定病原体小鼠、急性胰腺炎患者的粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序、鸟枪法宏基因组测序、粪便微生物移植、抗生素调节实验、单菌定植实验 | NA | 单细胞转录组数据、宏基因组数据、病理学数据 | 小鼠模型及急性胰腺炎患者的粪便样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 宏基因组测序 | NA | NA |
| 576 | 2026-01-05 |
Integrated Multi-Omics Analysis Reveals Cytokine Network Dynamics and Prognostic Signatures in Hepatitis B Virus-Associated Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-04, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05528-2
PMID:41484748
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了细胞因子网络在HBV相关肝细胞癌中的动态变化,并构建了一个基于六种细胞因子的预后风险模型 | 首次整合bulk和单细胞转录组学分析HBV-HCC中的细胞因子网络,构建了基于LASSO的六细胞因子预后特征,并通过功能实验验证了关键细胞因子GHR的作用 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;样本量可能有限,需要更大规模的前瞻性研究验证预后模型的临床适用性 | 阐明细胞因子在HBV相关肝细胞癌中的作用机制,并开发预后风险分层模型 | HBV相关肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织和血清) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清学检测, 体外功能实验 | LASSO回归模型 | RNA测序数据, 单细胞转录组数据, 血清蛋白数据 | 训练和验证队列中的HBV-HCC患者样本(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 577 | 2026-01-05 |
Tight junction-high and CDH17-positive cell population is the source of colorectal cancer liver metastases
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68169-3
PMID:41484106
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌中一种由紧密连接重塑驱动的、具有转移能力的上皮细胞状态,并发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分促进肝转移 | 首次发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分(如CLDN2)促进结直肠癌转移,并鉴定出CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群是肝转移灶的主要细胞来源 | 研究主要基于患者来源类器官和单细胞转录组学,体内转移过程的动态机制和临床相关性仍需进一步验证 | 探究结直肠癌转移的细胞特征和分子机制 | 结直肠癌患者来源类器官、转移性肿瘤组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、组织染色、遗传学与药理学抑制 | NA | 转录组数据、组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及患者来源类器官和肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 578 | 2026-01-05 |
Oxidative stress and GPX2 control pancreatic vs. non-pancreatic cell fate in human endoderm
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68145-x
PMID:41484137
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研究论文 | 本研究揭示了氧化应激和GPX2在调控人类后前肠分化中决定胰腺与非胰腺细胞命运的关键作用 | 首次将氧化应激确立为胰腺细胞命运的关键调控因子,并发现GPX2通过调节转录因子和细胞外基质重塑来影响谱系分化 | 研究主要基于体外分化模型,体内验证和临床转化潜力尚需进一步探索 | 探究代谢产物在人类内胚层发育中细胞命运决定的作用机制 | 人类后前肠分化过程中的细胞 | 发育生物学 | NA | 批量转录组学、单细胞转录组学、染色质可及性分析 | NA | 转录组数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 579 | 2026-01-05 |
Spatial transcriptomics of developing human lungs defines cellular phenotypes associated with age, lineage and location
2026-Jan-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34594-z
PMID:41484334
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 580 | 2026-01-05 |
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-Jan-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00672-6
PMID:41484377
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛素信号在果蝇卵泡细胞中的作用,揭示了胰岛素受体活性激增通过上调CrebA驱动卵黄生成,并发现这一调控轴在人类颗粒细胞中保守 | 利用基于相分离的报告系统观察到卵泡细胞中胰岛素受体活性激增,并通过单细胞RNA-seq识别出对饮食敏感的卵泡细胞亚群,揭示了CrebA在胰岛素信号阶段特异性效应中的关键作用 | 研究主要基于果蝇模型,人类颗粒细胞中的保守性验证可能需进一步实验支持,且高蔗糖饮食的影响机制尚未完全阐明 | 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞发育和卵黄生成中的功能及机制 | 果蝇卵泡细胞和人类颗粒细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及果蝇卵泡细胞单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |