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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-01-07 |
4R-tau seeding activity reveals molecular subtypes in progressive supranuclear palsy
2025-Dec-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67744-y
PMID:41476155
|
研究论文 | 本研究通过分析进行性核上性麻痹(PSP)患者大脑中tau蛋白的分子形式,揭示了tau种子活性与疾病分子异质性的关联 | 首次发现高分子量tau组装体在PSP患者大脑中的丰度和生物活性存在差异,并证明tau种子活性可反映疾病的分子异质性 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证;分子机制尚未完全阐明 | 探究PSP临床异质性的分子基础,开发患者分层方法 | 进行性核上性麻痹(PSP)患者大脑组织 | 神经退行性疾病研究 | 进行性核上性麻痹 | 生化检测、种子扩增试验、蛋白质组学分析、空间转录组学 | NA | 蛋白质数据、转录组数据 | PSP患者大脑组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 502 | 2026-01-07 |
Dissection of Gαs and Hedgehog Signaling Crosstalk Reveals Therapeutic Opportunities to Target Hedgehog-Dependent Tumors
2025-Dec-29, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1109
PMID:41460725
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研究论文 | 本研究通过组织学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs和Hedgehog信号通路在基底细胞癌中的交互作用,并提出了针对Hedgehog依赖性肿瘤的治疗策略 | 首次发现Gαs通路失活可驱动与经典Hedgehog信号相似的基底细胞癌样肿瘤,并识别出Gαs和PKA活性降低的突变存在于人类BCC中,为SMO非依赖性肿瘤提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类BCC样本,临床转化需进一步验证 | 探究Gαs和Hedgehog信号通路的交互作用及其在基底细胞癌发生和治疗中的潜在应用 | 小鼠基底细胞癌样肿瘤和人类基底细胞癌样本 | 数字病理学 | 基底细胞癌 | 组织学分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠肿瘤模型和人类BCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2026-01-07 |
The Sixth Annual Symposium of the Midwest Aging Consortium
2025-Dec-22, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf280
PMID:41429578
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会议记录 | 本文记录了2025年4月在美国明尼苏达州罗切斯特市梅奥诊所举行的中西部衰老联盟第六届年度研讨会的概况与成果 | 强调了区域合作平台在促进跨学科衰老研究、整合前沿方法(如单细胞与空间转录组学)以及加速基础发现向临床转化方面的持续影响力 | 本文为会议记录,非原创性研究论文,未报告具体实验数据或新发现 | 促进衰老研究领域的跨学科合作、知识交流与区域协同创新,加速衰老机制发现向临床干预的转化 | 衰老研究人员(包括受训人员和早期职业研究者)、衰老生物学机制、新型治疗概念与临床试验方法 | 老年医学 | 老年疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 类器官培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 504 | 2026-01-07 |
Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis
2025-Dec-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.11.031
PMID:41435820
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研究论文 | 本研究通过跨物种纵向单细胞多组学分析,揭示了慢性代谢压力下肝细胞的功能变化如何为未来肿瘤发生奠定基础 | 开发了整合计算方法,识别并实验验证了扰动肝细胞功能平衡、在压力下增加增殖并直接促进未来肿瘤发生的关键调控因子 | 未明确说明样本的具体数量或实验设计的局限性 | 探究慢性代谢压力对肝细胞功能的影响及其与肿瘤发生的关系 | 肝细胞(非转化肝细胞) | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) | 单细胞多组学、空间转录组学 | 整合计算方法、地理回归分析 | 单细胞多组学数据、空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 505 | 2026-01-07 |
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2025-Dec-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf268
PMID:41389000
|
研究论文 | 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者如何通过表观遗传印记在循环髓系细胞中引发过度的免疫反应,从而在COVID-19中导致更严重的疾病 | 揭示了ASCVD患者通过单核细胞的表观遗传启动,增强炎症介质和I型干扰素信号表达,导致COVID-19中髓系免疫反应失调的分子机制 | 研究主要基于德国队列,可能无法完全推广到其他人群;且机制验证部分依赖于体外实验 | 探究心血管疾病患者COVID-19病情加重的分子机制 | ASCVD患者与无ASCVD患者的免疫细胞(特别是髓系细胞) | 单细胞组学与免疫学 | 心血管疾病与COVID-19 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、体外感染实验、多重细胞因子检测、ELISA、bulk RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、细胞因子数据、RNA测序数据 | 德国全国性队列(NAPKON)中的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2026-01-07 |
Ketogenic diet impairs NK cell cytotoxic function in colorectal cancer liver metastasis by inducing ferroptosis via suppression of the p62-Keap1-Nrf2 pathway
2025-Dec-10, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103969
PMID:41385828
|
研究论文 | 本研究揭示了生酮饮食通过诱导NK细胞铁死亡促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次阐明生酮饮食通过p62-Keap1-Nrf2通路诱导NK细胞铁死亡,从而损害抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚不充分 | 探究生酮饮食对结直肠癌肝转移的影响及其免疫调控机制 | 结直肠癌肝转移小鼠模型、患者肿瘤微环境NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、非靶向代谢组学、免疫荧光染色 | 小鼠转移模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量,包含小鼠模型和患者样本对比 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 507 | 2026-01-07 |
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-Dec, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110925
PMID:41207622
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性及其混合起源 | 首次在单细胞水平上系统描述了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组动态变化,并揭示了其混合的胚胎和成体骨髓起源 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;功能机制研究有待深入 | 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组可塑性和细胞起源 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞(表达胆碱乙酰转移酶) | 单细胞转录组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮下白色脂肪组织细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-01-07 |
SGMS2+ macrophages enhance NR4A3hi NK cell infiltration to improve prognosis and PD-1 treatment efficacy in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07040-x
PMID:41316300
|
研究论文 | 本研究揭示了SGMS2在肝细胞癌中通过极化巨噬细胞为M1表型并分泌CXCL2招募NR4A3hi NK细胞,从而改善预后和增强PD-1治疗效果的机制 | 首次阐明了SGMS2在巨噬细胞中的特异性作用,及其通过CXCL2介导的NK细胞招募机制改善肝细胞癌免疫微环境和PD-1治疗反应 | 研究主要基于回顾性临床数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本量相对有限(临床队列188例) | 探究SGMS2在肝细胞癌免疫微环境中的作用及其对患者预后和PD-1治疗疗效的影响 | 肝细胞癌患者组织样本、TCGA数据库、THP-1单核细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、流式细胞术、慢病毒转染 | NA | RNA-seq数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | TCGA-LIHC数据集371例,独立临床队列188例(2017-2022) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 509 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2026-01-07 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02773-6
PMID:41299485
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析,揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用,并识别了FABP4、RNASET2和FILIP1L作为潜在诊断标志物和治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,应用机器学习算法识别与巨噬细胞胆固醇代谢相关的关键基因,并构建风险评分模型进行外部验证,同时通过体外实验验证基因功能 | 研究主要依赖于公共数据库数据,可能受样本来源和批次效应影响;体外实验验证范围有限,需进一步体内研究确认基因功能 | 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制,并识别相关诊断和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者组织样本中的巨噬细胞及相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 逻辑回归, 机器学习算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的一个单细胞RNA测序数据集和多个批量mRNA转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2026-01-07 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据,识别骨关节炎相关基因并预测潜在药物 | 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别关键基因,并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物效果 | 研究主要依赖公共数据集和预测算法,实验验证仅在斑马鱼模型中进行,未涉及人类临床试验 | 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 | 骨关节炎相关基因和候选药物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,RT-qPCR | 随机森林,hdWGCNA,PPI网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 512 | 2026-01-07 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
|
综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子亚型分类的研究进展及其在预后预测和个性化治疗中的应用 | 系统总结了CMS分类的预后价值、预测作用、鉴定方法(包括基于深度学习的图像分类器)、与免疫治疗等靶向治疗的关联,并探讨了肿瘤内异质性带来的挑战及单细胞测序等新兴解决方案 | 肿瘤内异质性和技术壁垒阻碍了临床广泛应用 | 回顾CMS分类在结直肠癌中的研究进展,旨在推动亚型驱动的治疗策略 | 结直肠癌及其共识分子亚型 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 深度学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-01-07 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
|
研究论文 | 本研究设计了一种多酶纳米催化剂,通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 开发了表面修饰有胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin的单原子钴基纳米酶(Rh@SAE),首次将催化疗法应用于急性胰腺炎治疗,并同时靶向细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于动物模型,尚未进行临床试验;纳米材料的长期生物安全性需要进一步评估 | 开发新型纳米药物治疗急性胰腺炎,改善临床预后 | 急性胰腺炎(AP)和重症急性胰腺炎(SAP)的病理过程 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 514 | 2026-01-07 |
The ANTsX ecosystem for mapping the mouse brain
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66741-5
PMID:41274934
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研究论文 | 本文介绍了使用ANTsX生态系统开发的小鼠大脑映射流程,用于对齐多种数据集到共享坐标框架 | 提出了两种新方法:基于速度场的发育时间点连续插值方法和使用最小标注公开数据的深度学习自动脑分区框架 | NA | 解决小鼠大脑图谱构建中多样化数据集对齐到共享坐标框架的挑战 | 小鼠大脑 | 数字病理学 | NA | MERFISH空间转录组学、fMOST形态学数据、发育MRI、LSFM数据 | 深度学习框架 | 图像、空间转录组学数据、形态学数据、MRI数据 | NA | NA | 空间转录组学、形态学成像、MRI、光片荧光显微镜 | NA | NA |
| 515 | 2026-01-07 |
SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013667
PMID:41223185
|
研究论文 | 本文提出了一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的新型深度学习模型SpaMWGDA,用于空间转录组数据的空间域识别 | 通过多视图加权融合图卷积网络和数据增强,成功捕获了spot特征的全面邻域信息,并自适应地学习空间信息与基因特征之间的依赖关系 | 未在摘要中明确提及 | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性和效率 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多视图加权融合图卷积网络(GCN) | 基因表达和空间信息数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 516 | 2026-01-07 |
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03996-4
PMID:41174727
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据,识别出UBE2H作为结直肠癌对奥沙利铂耐药的潜在标志物 | 首次将多组学数据(转录组、甲基化组、单细胞RNA测序)整合分析,系统揭示了UBE2H在奥沙利铂耐药中的作用及其与免疫微环境、细胞分化和增殖状态的关联 | 研究主要基于细胞系和公共数据集,缺乏前瞻性临床队列验证;耐药机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 识别结直肠癌对奥沙利铂耐药的生物标志物并探索其生物学机制 | 结直肠癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、正常结肠组织单细胞数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型, 差异表达分析 | 转录组数据, 甲基化数据, 单细胞基因表达数据 | 多个公共数据集(TCGA及5个GEO数据集)及细胞系数据,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 517 | 2026-01-07 |
[Progress of scRNA-seq technology in nasopharyngeal carcinoma research]
2025-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology head and neck surgery
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在鼻咽癌研究中的应用进展 | 总结了scRNA-seq技术在揭示鼻咽癌肿瘤细胞亚群、进化轨迹及肿瘤微环境细胞功能与相互作用方面的新思路 | NA | 探讨scRNA-seq技术在鼻咽癌发病机制、肿瘤异质性、肿瘤微环境、耐药性及治疗反应研究中的应用 | 鼻咽癌 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 518 | 2026-01-07 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's Disease (AD)
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667719
PMID:40766691
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研究论文 | 本研究利用多区域空间转录组学结合Aβ免疫荧光染色,揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在多个脑区同时进行空间转录组学与Aβ斑块分析,识别了抑制性神经元和细胞通讯网络的区域特异性变化 | 样本量较小(仅两名患者),且局限于Braak III和Thal 4阶段的AD病例,可能无法代表疾病全谱 | 探究阿尔茨海默病中脑区特异性对Aβ斑块诱导变化的脆弱性和恢复力的细胞与分子机制 | 两名Braak III和Thal 4阶段阿尔茨海默病患者的多个脑区组织,包括内嗅、枕颞、背外侧前额和纹状皮质 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据,免疫荧光图像 | 两名患者,覆盖四个脑区 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 519 | 2026-01-07 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664370
PMID:40791434
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠在单次臭氧暴露模型中肺泡巨噬细胞的特异性转录组响应及其功能调控 | 首次在单细胞分辨率下系统分析了不同浓度臭氧暴露对肺泡巨噬细胞转录组的影响,并识别出浓度依赖性的通路富集和亚群特异性变化 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别或品系差异;暴露时间固定为3小时,未探索不同时间点的动态变化 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制,特别是不同浓度下的转录组变化和功能调控 | C57BL/6J雄性成年小鼠的肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6J雄性成年小鼠,分为过滤空气暴露组、1 ppm臭氧暴露组和1.5 ppm臭氧暴露组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2026-01-07 |
DeepDeconUQ estimates malignant cell fraction prediction intervals in bulk RNA-seq tissue
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013133
PMID:40465796
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研究论文 | 本研究开发了DeepDeconUQ模型,用于基于bulk RNA-seq数据估计恶性细胞比例的预测区间 | 首次将不确定性量化整合到恶性细胞比例预测中,利用scRNA-seq数据和保形化分位数回归生成可靠的预测区间 | 未提及模型在特定癌症类型或临床场景中的验证局限性 | 提高癌症组织中恶性细胞比例估计的准确性,并量化预测不确定性 | 癌症组织中的恶性细胞比例 | 机器学习 | 癌症 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | 深度神经网络, 分位数回归神经网络 | RNA-seq数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |