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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-01-06 |
HiST: Histological Images Reconstruct Tumor Spatial Transcriptomics via MultiScale Fusion Deep Learning
2026-Jan-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514351
PMID:41487073
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研究论文 | 本研究开发了一个名为HiST的多尺度卷积深度学习框架,用于从组织学图像重建肿瘤空间转录组数据 | HiST通过多尺度融合深度学习,首次实现了从组织学图像高精度预测空间基因表达谱,其性能优于现有模型约两倍 | NA | 解决空间转录组技术成本高昂的问题,通过深度学习从组织学图像重建空间基因表达谱 | 多种癌症类型(如乳腺癌)的组织学图像和空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 多尺度卷积深度学习框架 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 542 | 2026-01-06 |
CGRP Enhances the Regeneration of Bone Defects by Regulating Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Through Promoting ANGPTL4 Secretion by Bone Blood Vessels
2026-Jan-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202522295
PMID:41487103
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研究论文 | 本文探讨了CGRP通过促进骨血管分泌ANGPTL4来增强骨缺损再生的机制 | 揭示了CGRP通过FAK-AKT-VEGF通路促进血管生成,并通过ANGPTL4驱动骨髓间充质干细胞成骨分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床数据有限,且未涉及其他潜在信号通路 | 研究CGRP在骨再生中的作用机制,特别是通过血管生成促进骨修复 | 人类临床数据、小鼠模型、人微血管内皮细胞系-1、骨髓间充质干细胞 | NA | 骨缺损 | 单细胞RNA测序、转录组分析、实验分析 | NA | 临床数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2026-01-06 |
Spatially Resolved Multiomics Reveals Metabolic Remodeling and Autophagy Activation in Adamantinomatous Craniopharyngiomas
2026-Jan-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516965
PMID:41489092
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研究论文 | 本研究通过整合空间分辨多组学技术,揭示了颅咽管瘤中代谢重塑和自噬激活是其进展和复发的关键驱动因素 | 首次在颅咽管瘤中整合应用CosMx SMI单细胞空间转录组学和AFADESI-MSI空间分辨代谢组学,结合代谢组学和功能验证,系统揭示了肿瘤上皮细胞亚群的空间异质性、独特的“囊液-肿瘤细胞”代谢轴及其与自噬激活的直接耦合关系 | 研究样本量未明确说明,且主要基于观察性关联分析,需要进一步的功能实验验证代谢轴与自噬激活之间的因果关系 | 揭示颅咽管瘤进展和复发的驱动因素,为这种难治性肿瘤提供精准生物标志物驱动的治疗机会 | 颅咽管瘤组织样本,包括肿瘤区域和复发性肿瘤上皮组织 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学,代谢组学,多重免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据,代谢组数据,图像数据 | NA | NanoString | 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学 | CosMx SMI | CosMx SMI单细胞空间分子成像平台,用于单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 544 | 2026-01-06 |
Integrative transcriptomics defines CD36 as a key regulator of immunometabolic signaling in acute myeloid leukemia
2026-Jan-05, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01728-6
PMID:41489721
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和空间验证,揭示了CD36在急性髓系白血病(AML)中作为免疫代谢信号关键调节因子的作用 | 首次将CD36定义为AML中免疫代谢信号的核心枢纽,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学验证其在免疫微环境中的功能 | 需要更全面的体外和体内实验验证 | 研究CD36在AML发病机制中作为免疫代谢介质的调控作用 | 急性髓系白血病(AML)细胞、单核细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 整合转录组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 545 | 2026-01-06 |
A pseudouridine-related prognostic model of colorectal cancer based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2026-Jan-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34933-0
PMID:41486187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 546 | 2026-01-06 |
Novel insights into meningioma brain invasion with spatial transcriptomic profiling
2026-Jan-04, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02206-6
PMID:41486296
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究脑膜瘤脑侵袭的分子特征,重点关注肿瘤细胞和免疫细胞在脑-瘤边界的基因表达变化 | 首次应用空间转录组学分析脑膜瘤脑侵袭的分子机制,揭示了KRT18、CSF1R等关键基因在侵袭过程中的空间特异性表达模式 | 样本量较小(16例肿瘤),需要更大规模研究验证发现;空间分辨率有限,无法达到单细胞水平 | 探究脑膜瘤脑侵袭的分子机制及其与预后的关系 | 脑膜瘤患者肿瘤组织(包括侵袭性和非侵袭性病例) | 空间转录组学 | 脑膜瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 16例脑膜瘤肿瘤(8例侵袭性,8例非侵袭性) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiling平台,使用1800个基因panel |
| 547 | 2026-01-06 |
Targeting IL27RA Enhances Immunotherapy in Triple-Negative Breast Cancer by Modulating Tumor Cells and the Tumor Microenvironment
2026-Jan-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516703
PMID:41486362
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现,在三阴性乳腺癌中,恶性上皮细胞高表达IL27RA会通过激活PI3K/AKT通路抑制MHC-I表达,从而损害CD8⁺ T细胞功能并导致免疫检查点抑制剂耐药,靶向IL27RA可增强免疫治疗效果 | 首次揭示了IL27RA在三阴性乳腺癌免疫治疗耐药中的关键作用,并阐明了其通过非经典的PI3K/AKT通路(而非经典的IL-27/STAT轴)抑制MHC-I表达的新机制 | 研究主要基于临床样本和小鼠模型,IL27RA靶向治疗的临床转化效果仍需进一步验证 | 探究三阴性乳腺癌免疫检查点抑制剂耐药的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本、小鼠原位肿瘤模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含未达到病理完全缓解(非pCR)患者的配对治疗前后肿瘤样本,以及3名pCR患者的独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 548 | 2026-01-06 |
SAGE: Spatially Aware Gene Selection and Dual-View Embedding Fusion for Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Jan-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520333
PMID:41486374
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SAGE的统一可重复框架,用于空间转录组学中的空间域识别,该框架结合了主题驱动的基因选择和双视图嵌入融合 | 提出了一种结合主题建模与分类器重要性评分的空间信息基因选择方法,并通过融合局部表达图与主题驱动的非局部图来联合学习空间和功能嵌入 | 未在摘要中明确说明 | 解决空间转录组学中由于复杂组织结构和方法限制导致的准确分割空间域的挑战 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌、黑色素瘤 | 空间转录组学 | 非负矩阵分解、图表示学习 | 空间基因表达数据 | 34个真实世界数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 549 | 2026-01-06 |
A novel stromal cell source of RANKL during sustained osteoclast activation in disuse osteoporosis
2026-Jan-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289268
PMID:41486510
|
研究论文 | 本研究利用小鼠模型,揭示了在废用性骨质疏松中,脂肪生成性CAR细胞是RANKL的新来源,并阐明了破骨细胞介导的骨吸收在疾病早期进展中的关键作用 | 首次发现脂肪生成性C-X-C基序趋化因子配体12富集的网状(adipo-CAR)细胞是废用性骨质疏松期间RANKL表达的特异性细胞来源,而非传统的成骨细胞或骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的普适性有待进一步验证;研究聚焦于早期骨丢失阶段,对后期机制探讨有限 | 阐明废用性骨质疏松的细胞和分子机制,特别是骨吸收持续增强的细胞来源 | 使用螺旋钢丝固定(SWI)模型的小鼠,特别是其骨组织、骨细胞和骨髓细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,转录组分析,命运图谱技术 | NA | RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2026-01-06 |
BHLHE40 Orchestrates Effector Tissue-Resident Memory CD8+ T Cells and Limits Long-Term Survival of Kidney Graft
2026-Jan-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520518
PMID:41486507
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研究论文 | 本研究利用小鼠肾移植模型,通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了CD49a+PD-1+ CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞的一个亚群,在移植排斥中的关键作用及其分化调控机制 | 首次在小鼠肾移植模型中,通过单细胞和空间转录组学,鉴定出CD49a+PD-1+ CD8+ T细胞是效应性组织驻留记忆T细胞的一个亚群,并阐明了BHLHE40在调控其分化和效应功能中的核心作用,强调了驻留免疫细胞而非循环细胞在移植排斥中的主导贡献 | 研究基于小鼠模型,其结论在人类移植中的普适性有待验证;研究聚焦于长期观察,早期事件可能未被完全捕捉;机制研究主要围绕BHLHE40和TGF-β通路,可能存在其他调控因子未被探索 | 探究组织驻留记忆T细胞在肾移植排斥中的稳态、分化及其调控机制 | 小鼠肾移植模型中的组织驻留记忆CD8+ T细胞 | 空间转录组学 | 肾移植排斥 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 551 | 2026-01-06 |
Multi-omics analysis identifies a glycosyltransferase-related prognostic signature linked to the immune landscape in colorectal cancer
2026-Jan-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116158
PMID:41485251
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,构建了一个与结直肠癌免疫景观相关的糖基转移酶相关预后特征,并鉴定出核心基因CHPF | 首次整合了批量转录组、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,系统性地揭示了糖基转移酶相关基因在结直肠癌肿瘤微环境异质性、细胞间通讯和预后中的作用,并识别出一个九基因预后特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进行进一步验证;功能实验仅针对核心基因CHPF,其他特征基因的生物学功能有待探索 | 阐明糖基转移酶相关基因在结直肠癌肿瘤微环境、免疫景观和患者预后中的作用,并构建预后模型 | 结直肠癌患者(来自TCGA-COAD/READ和GSE39582队列)及其肿瘤组织 | 生物信息学,计算生物学 | 结直肠癌 | 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学,LASSO-Cox回归,功能实验(细胞增殖、迁移、侵袭) | LASSO-Cox回归模型(用于构建预后特征) | 基因表达数据(转录组),临床数据,突变数据,单细胞表达数据,空间表达数据 | 训练队列(TCGA-COAD/READ)和外部验证队列(GSE39582)的结直肠癌患者样本;单细胞RNA-seq数据集(GSE132257) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 552 | 2026-01-06 |
Targeting CDH2 and TUBA1A in Neuroblastoma Bone Marrow Metastasis: Insights from Single-Cell Analysis and Drug Screening
2026-Jan-02, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.12.004
PMID:41485549
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析结合孟德尔随机化方法,识别了神经母细胞瘤骨髓转移的关键基因CDH2和TUBA1A,并验证了它们作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞转录组分析结合孟德尔随机化方法,系统性地识别了神经母细胞瘤骨髓转移的关键基因CDH2和TUBA1A,并发现DMNQ作为潜在抑制剂 | 研究主要基于体外实验和患者样本分析,缺乏体内动物模型验证,且临床转化潜力需进一步评估 | 探究神经母细胞瘤骨髓转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 神经母细胞瘤细胞系、高/低风险患者样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 药物筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,包括有/无骨髓转移的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 553 | 2026-01-06 |
The Role of Microglial Cells and Cytokine Modulation in Alzheimer's Disease: A Neuroinflammatory Perspective
2026-Jan-02, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
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综述 | 本文从神经炎症角度综述了阿尔茨海默病中微胶质细胞和细胞因子调节的作用 | 强调了神经炎症作为阿尔茨海默病起始和进展关键初始事件的新兴证据,并探讨了疾病相关微胶质细胞(DAM)的复杂性及细胞因子失衡的自我延续炎症循环 | 针对微胶质细胞和细胞因子活性的疗法临床效果不一,仍需进一步探索神经炎症反应的时机、背景和变异以开发有效靶向治疗 | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症过程与经典神经病理特征之间的关系,以及免疫反应的动态双重效应 | 阿尔茨海默病中的微胶质细胞、细胞因子信号及神经炎症机制 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 神经影像学(如TSPO-PET)、细胞因子收集与组成分析、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 554 | 2026-01-06 |
Oncogenic Ras, Yki and Notch signals converge to confer clone competitiveness through Upd2
2026-Jan, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.04.017
PMID:40320143
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了Ras、Yki和Notch信号通路在果蝇翅盘细胞竞争中通过上调Upd2来增强克隆竞争力,促进组织生长并可能驱动肿瘤发生 | 首次发现Ras、Yki和Notch信号通路在细胞竞争中共同上调Upd2作为关键汇聚点,并证明Upd2是维持组织生长但失调时可促进肿瘤发生的关键细胞适应性因子 | 研究主要基于果蝇模型,尚未在哺乳动物系统中验证;单细胞转录组学数据可能未完全捕捉所有信号通路细节 | 探究细胞竞争中信号通路如何通过共同机制克服克隆消除压力 | 果蝇翅盘中的scribble突变克隆和肠道干细胞 | 单细胞转录组学 | 肿瘤发生 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 555 | 2026-01-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals critical causative candidates for Down syndrome-related lung diseases
2026-Jan, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.05.009
PMID:40451386
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了唐氏综合征相关肺部疾病的关键致病候选因素 | 利用Dp16小鼠模型结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地探索了21号染色体三体对肺部疾病的影响,并发现了APP相关相互作用增强、MHC-II信号上调等新机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;样本量相对有限,且性别差异的深入分析不足 | 探究唐氏综合征相关肺部疾病的分子机制和致病候选因素 | Dp16小鼠模型的肺部细胞 | 数字病理学 | 唐氏综合征相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、组织免疫荧光评估、经胸超声心动图 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | Dp16小鼠模型的肺部细胞样本(包括雄性和雌性) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 556 | 2026-01-06 |
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组学分析,揭示了动静脉瘘(AVF)创建后静脉壁的细胞和分子变化,为理解AVF成熟失败机制提供了新见解 | 首次构建了人类静脉在动静脉瘘创建前后的单细胞转录组图谱,识别了失败AVF中持续的炎症反应和关键信号通路(如Myddosome复合物和骨桥蛋白) | 样本量相对有限(20例患者),且为观察性研究,未能验证潜在治疗靶点的临床效果 | 探究动静脉瘘(AVF)成熟失败的生物学机制,以改善血液透析患者的治疗效果 | 人类静脉组织样本,包括术前静脉、早期切除样本、成熟AVF和失败AVF | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织切片图像 | 20例患者的70,281个细胞,以及23例患者的组织活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 557 | 2026-01-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.042
PMID:41173191
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活及配体-受体关系的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下应用空间转录组学技术,解析了CAMR中肾小球内皮细胞、NK细胞和巨噬细胞的空间分子相互作用,发现了新的配体-受体相互作用通路 | 研究样本量有限,仅基于福尔马林固定石蜡包埋的肾活检组织,且未进行功能验证实验 | 探究慢性活动性抗体介导排斥反应的发病机制,特别是肾小球内细胞的空间分子相互作用 | 慢性活动性抗体介导排斥反应患者的肾移植活检组织,以及无排斥反应的对照组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但包括CAMR患者和对照组的肾活检组织 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪,用于单细胞分辨率的空间转录组分析 |
| 558 | 2026-01-06 |
Transcript profiling and gene regulation of the human pre-implantation embryo: parental effects and impact of ARTs
2026-Jan-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmaf022
PMID:40891422
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综述 | 本文综述了人类植入前胚胎转录组如何受父母特征、辅助生殖技术条件及胚胎内在因素的影响 | 整合了多种因素(如父母年龄、ART干预、胚胎倍性)对胚胎转录组的影响,并利用单细胞RNA测序数据绘制了囊胚阶段谱系特异性转录模式 | 关于PCOS、子宫内膜异位症、精子异常及部分ART技术影响的人类囊胚数据仍然有限,部分结论依赖动物研究或其他发育阶段数据 | 探索父母特征、ART条件及胚胎因素如何影响人类植入前胚胎的转录组,并识别常见的失调分子通路 | 人类囊胚 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序,基因本体分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 559 | 2026-01-06 |
Insights into arteriovenous fistula (non)maturation: single-cell transcriptomics reveals new drivers of arteriovenous fistula remodeling
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.09.034
PMID:41485805
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析动静脉瘘,揭示其失败主要由持续炎症、内皮功能障碍和成纤维细胞驱动的纤维化驱动,而非平滑肌增殖 | 首次应用单细胞转录组学于动静脉瘘研究,挑战了传统以平滑肌增殖为主导的失败机制观点,强调了炎症和纤维化在动静脉瘘重塑中的关键作用 | 未明确样本量或具体技术细节,可能缺乏临床验证或长期随访数据 | 探究动静脉瘘成熟失败的分子机制,以指导未来治疗策略 | 动静脉瘘组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 560 | 2026-01-06 |
G protein inhibitory alpha subunits 1 and 3 regulate Wnt/beta-catenin signaling to promote osteogenesis and bone formation
2025-Dec-30, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf143
PMID:41273070
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研究论文 | 本研究揭示了Gαi1/3蛋白通过调控Wnt/β-catenin信号通路促进成骨作用与骨形成的新机制 | 首次发现Gαi1/3(而非Gαi2)介导Wnt/β-catenin信号通路,并阐明其通过结合Axin1并招募至细胞膜使β-catenin降解复合体失活的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠胚胎成骨前体细胞模型,人体组织验证及临床转化潜力需进一步探索 | 探究Gαi1/3蛋白是否及如何介导Wnt/β-catenin信号通路以调控骨形成 | 小鼠胚胎成骨前体细胞及不同Gαi1/3表达水平的小鼠模型 | 分子细胞生物学 | 骨质疏松症 | 单细胞测序分析、病毒转染、基因编辑、免疫共沉淀、共聚焦显微镜、Western blot、碱性磷酸酶染色、茜素红染色、显微CT | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |