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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-01-05 |
A human pathophysiological 3D-bone marrow model reveals immune and stromal cell heterogeneity
2026-Jan-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09433-6
PMID:41484482
|
研究论文 | 本文介绍了一种标准化的三维人类骨髓模型,用于模拟骨髓微环境的关键特征 | 开发了一种三维骨髓模型,能更好地模拟人类骨髓微环境,相比二维培养,单核细胞/巨噬细胞表现出更强的促炎表型,造血祖细胞在长期培养中保持干性 | NA | 研究人类骨髓微环境的生理和病理机制 | 骨髓微环境中的基质细胞、内皮细胞、免疫细胞和造血细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2026-01-05 |
Microglia Mitochondrial Metabolism in Neurological Diseases
2026-Jan-03, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05640-8
PMID:41484491
|
综述 | 本文综述了小胶质细胞线粒体代谢在神经退行性疾病中的作用机制及其对神经炎症和疾病进展的影响 | 提出了线粒体质量控制失败导致线粒体DNA释放并激活cGAS-STING通路形成“表观遗传锁”的统一致病机制,并强调代谢灵活性丧失(而非糖酵解本身)是病理的真正驱动因素 | 缺乏纵向人类数据验证,缺少经过验证的生物标志物,实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型在多发性硬化症研究中存在争议 | 阐明小胶质细胞线粒体代谢在神经疾病中的作用机制,并提出针对恢复线粒体动力学和代谢灵活性的精准医学框架 | 小胶质细胞(中枢神经系统的常驻免疫细胞) | 神经科学 | 阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、缺血性中风 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 583 | 2026-01-05 |
Integrated experimental and computational workflows for single-cell transcriptomics in plants
2026-Jan-03, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01490-6
PMID:41484617
|
研究论文 | 本研究为植物单细胞转录组学建立了优化的实验和计算工作流程,通过系统基准测试和集成策略,提高了数据质量和细胞类型识别的稳健性 | 开发了改进的bulk RNA-seq协议作为单细胞数据参考,比较了原生质体、新鲜核和冷冻核三种输入类型在组织中的转录组可比性,并利用bulk RNA-seq提供额外生物学背景以验证单细胞发现 | 所有实验数据均来源于玉米,可能限制了在其他植物物种中的直接适用性,但原则和策略具有普适性指导意义 | 优化植物单细胞转录组学的实验和计算工作流程,以解决组织制备、核分离和转录组质量等挑战 | 玉米(Zea mays)组织,包括原生质体、新鲜核和冷冻核作为输入类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 584 | 2026-01-05 |
Comprehensive profiling of lactylation-associated genes in pulmonary hypertension through bulk and single-cell RNA sequencing integration
2026-Jan-03, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03446-9
PMID:41484613
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,全面分析了肺动脉高压中乳酸化相关基因,并鉴定出LCP1作为核心诊断标志物 | 首次在肺动脉高压中系统整合bulk和单细胞RNA-seq数据来研究乳酸化相关基因,并发现LCP1作为关键乳酸化相关枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏更深入的体内功能验证 | 探究乳酸化在肺动脉高压发生发展中的作用机制 | 肺动脉高压患者和对照组的基因表达数据,以及缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR, western blot | NA | 基因表达数据 | 包含多个数据集(GSE113439, GSE186996, GSE210248)的肺动脉高压患者和对照组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2026-01-05 |
Identification of Cuproptosis-Associated Biomarker Candidates in Hypertrophic Cardiomyopathy via Machine Learning and Multi-Omics Integration
2026-Jan-03, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05533-5
PMID:41484731
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习与多组学数据,识别了与肥厚型心肌病相关的铜死亡生物标志物候选物 | 首次将铜死亡相关基因与肥厚型心肌病关联,并利用机器学习整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据构建诊断模型 | 研究发现是关联性的且为假设生成性质,需要前瞻性临床评估和机制研究(如铜稳态扰动和基因操作)才能做出治疗推断 | 识别肥厚型心肌病的新型生物标志物候选物和治疗靶点 | 健康对照和肥厚型心肌病患者的基因表达数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 加权基因共表达网络分析, 诊断模型 | 基因表达数据 | 来自健康对照和HCM患者的bulk RNA-seq和scRNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 586 | 2026-01-05 |
A pan-cancer single cell landscape reveals heterogeneity and functional diversity of double-negative T cells
2026-Jan-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02548-8
PMID:41484771
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | 首次在泛癌水平上构建了双阴性T细胞的单细胞图谱,识别了14个不同的DNT亚群,并阐明了它们在肿瘤免疫治疗中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,功能验证仍需进一步实验支持 | 探究双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性、功能多样性及其对免疫治疗反应的影响 | 双阴性T细胞 | 单细胞组学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 2,369个样本,涵盖23种癌症类型,包含157,025个高质量DNT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 587 | 2026-01-05 |
Single-cell RNA sequencing unveils enhanced antitumor immunity in colorectal cancer with PD-1 blockade and LINC00673 deletion
2026-Jan-03, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00888-7
PMID:41484808
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 588 | 2026-01-05 |
Autologous human iPSC-derived alveolus-on-chip reveals early pathological events of Mycobacterium tuberculosis infection
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea9874
PMID:41477823
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于单供体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,用于模拟人类远端肺的细胞组成和机械环境,并应用于结核分枝杆菌感染的早期病理事件研究 | 首次构建了包含肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞的自体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,结合微流体技术模拟三维机械拉伸和气液界面,用于研究结核分枝杆菌感染的早期病理机制 | 模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境和长期感染动态,且基于单供体细胞,个体差异影响未评估 | 开发一种免疫活性且实验可及的人类肺泡系统模型,以研究呼吸系统疾病如结核病的病理机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞,以及结核分枝杆菌 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片 | 图像,单细胞RNA测序数据 | 基于单供体人类诱导多能干细胞的模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 589 | 2026-01-05 |
Apolipoprotein E drives microglia activation in the development of autoimmune uveitis through up-regulation of peptidyl prolyl isomerase F
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3991
PMID:41477830
|
研究论文 | 本研究探讨了载脂蛋白E通过上调肽基脯氨酰异构酶F驱动小胶质细胞激活,在自身免疫性葡萄膜炎发展中的作用机制 | 首次揭示了ApoE通过ROS途径调控小胶质细胞激活,并验证了其在EAU模型和AU患者PBMCs中的关键作用 | 研究主要基于小鼠EAU模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且具体信号通路细节需进一步探索 | 阐明ApoE在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用及其与小胶质细胞激活的关联 | 小鼠实验性自身免疫性葡萄膜炎模型、小胶质细胞、AU患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 蛋白质组分析 | NA | RNA-seq数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 590 | 2026-01-05 |
Treatment nonresponders in lupus nephritis characteristically exhibit persistent type I interferon signalling in monocytes: a longitudinal single-cell transcriptomic analysis
2026-Jan-02, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.002
PMID:41484050
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞RNA测序分析,揭示了狼疮性肾炎治疗无应答者中单核细胞持续I型干扰素信号的特征 | 首次通过纵向单细胞转录组分析,识别出狼疮性肾炎治疗无应答者单核细胞中持续的I型干扰素信号通路激活 | 样本量较小(n=10),需在更大独立队列中进一步验证 | 表征狼疮性肾炎治疗应答相关的动态转录变化 | 狼疮性肾炎患者的PBMCs和单核细胞 | 单细胞转录组学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 单细胞RNA测序队列10例患者,bulk RNA测序验证队列13例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 591 | 2026-01-05 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes identifies B cell features associated with neoadjuvant chemoradiotherapy sensitivity in rectal cancer
2026-Jan-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31068-0
PMID:41484196
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了与直肠癌新辅助放化疗敏感性相关的B细胞亚群及其特征基因 | 应用Scissor算法整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,首次在直肠癌中鉴定出与nCRT反应相关的特定B细胞亚群,并基于此开发了机器学习预测模型 | 样本量有限,验证队列仅包含64个样本,且研究主要基于转录组数据,缺乏功能实验验证 | 探究B细胞在直肠癌新辅助放化疗反应中的作用,并开发预测模型 | 直肠癌患者样本 | 数字病理学 | 直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组测序 | 机器学习模型 | RNA-seq数据 | 未明确总样本数,验证队列包含64个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 592 | 2026-01-05 |
Unravelling the progression of the zebrafish primary body axis with reconstructed spatiotemporal transcriptomics
2026-Jan-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03917-8
PMID:41484648
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为Palette的流程,通过整合批量RNA-seq数据和空间转录组学数据,重建了斑马鱼胚胎发育过程中的时空基因表达谱,并识别了调控前后轴发育的关键形态发生素和转录因子 | 提出了Palette流程,能够从批量RNA-seq数据中推断详细的空间基因表达模式,仅需现有空间转录组数据作为参考;创建了斑马鱼时空表达谱(zSTEP)这一综合性图谱资源 | 未明确说明Palette流程在不同组织或物种中的通用性验证;空间转录组参考数据的质量和覆盖范围可能影响推断结果的准确性 | 研究斑马鱼胚胎发育过程中基因表达的时空动态,特别是前后轴建立的调控机制 | 斑马鱼胚胎 | 空间转录组学 | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习 | RNA-seq数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 三个发育阶段的53个连续切片批量RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 593 | 2026-01-05 |
Designing 5' UTR sequences improves the capacity of mRNA therapeutics in preclinical models of aging and obesity
2026-Jan-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.060
PMID:41485049
|
研究论文 | 本研究通过设计5' UTR序列,在衰老和肥胖小鼠模型中提高了mRNA疗法的治疗潜力 | 发现核糖体蛋白mRNA的5' UTR(如RPS9)能增强合成mRNA在氧化应激条件下的蛋白输出,并改善衰老和肥胖模型中的免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;机制探索集中在LARP1/LARP4和TOP基序,可能忽略其他调控因素 | 优化mRNA疗法在衰老和肥胖个体中的应用效果 | 合成mRNA的5' UTR序列及其在细胞和小鼠模型中的功能 | 生物信息学与基因治疗 | 衰老与肥胖 | RNA-seq, scRNA-seq, Ribo-seq, CLIP-seq | NA | 转录组与翻译组数据 | 人类和小鼠细胞,以及衰老和高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 594 | 2026-01-05 |
XIAP-ULK1-mediated mitophagy modulates carnitine metabolism to mitigate diabetic kidney disease
2026-Jan, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2581214
PMID:41139215
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研究论文 | 本研究探讨了XIAP-ULK1介导的线粒体自噬在调节肉碱代谢中的作用及其在缓解糖尿病肾病中的治疗潜力 | 揭示了XIAP通过K48连接的多聚泛素化导致ULK1降解,从而损害线粒体自噬并破坏肉碱代谢的新机制 | NA | 阐明线粒体自噬如何连接肉碱代谢通路至糖尿病肾病,并探索其治疗策略 | 糖尿病肾病患者的肾活检样本、糖尿病小鼠模型、高糖处理的肾小管上皮细胞 | NA | 糖尿病肾病 | 分子对接、RNA测序、单细胞RNA测序、液相色谱-质谱联用、免疫组织化学、免疫荧光、透射电子显微镜 | NA | 分子数据、细胞数据、动物模型数据、临床样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 595 | 2026-01-05 |
Single-cell multi-omic landscape reveals anatomical-specific immune features in adult and pediatric sepsis
2026-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02345-x
PMID:41339491
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了成人和儿童脓毒症中解剖部位特异性的免疫特征 | 整合单细胞转录组、T细胞受体和B细胞受体测序、CITE-seq、bulk RNA测序和血浆蛋白质组学,首次系统描绘了脓毒症中解剖部位和年龄特异性的免疫程序 | 研究主要基于外周血样本,可能未完全反映局部感染部位的免疫状态;样本量虽较大,但外部验证队列规模有限 | 探究不同感染解剖部位如何塑造脓毒症的免疫反应,并识别潜在的精准免疫治疗靶点 | 成人和儿童脓毒症患者及对照个体的外周血单核细胞和血浆 | 单细胞多组学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序, 单细胞T细胞受体测序, 单细胞B细胞受体测序, CITE-seq, bulk RNA测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 281名成人和儿童个体(脓毒症患者及对照),外加164名独立个体用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 596 | 2026-01-05 |
Plasma apolipoprotein E protein attenuates pulmonary fibrosis through LRP1 and PLAU dual receptor-mediated TGF-β/Smad inhibition
2025-Dec-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.045
PMID:41475664
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研究论文 | 本研究揭示了血浆载脂蛋白E(apoE)通过双重受体LRP1和PLAU抑制TGF-β/Smad信号通路,从而减轻肺纤维化的新机制,并提出了LXR激动剂RGX-104作为潜在治疗策略 | 首次发现血浆apoE是肺纤维化的因果性保护因子,并阐明其通过LRP1和PLAU双重受体协同作用抑制TGF-β/Smad信号通路的新机制;利用CRISPR工程APOE缺陷犬模型和单细胞转录组学等技术进行跨物种验证和机制解析 | 研究主要基于动物模型和体外实验,其临床转化效果和长期安全性仍需进一步的人体临床试验验证 | 识别肺纤维化的新治疗靶点并阐明血浆apoE减轻该疾病的机制 | 特发性肺纤维化(IPF) | NA | 肺纤维化 | 整合荟萃分析、双样本孟德尔随机化、CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、SPIDER技术、表面等离子体共振(SPR) | NA | 血浆队列数据、基因数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 七个血浆队列(具体样本数未明确)、APOE缺陷犬、Apoe‒/‒小鼠、人精准切割肺切片 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 597 | 2026-01-05 |
Myeloid immune checkpoint blockade overcomes antibiotic resistance in bone infection by enhancing efferocytosis and suppressing MSC PANoptosis
2025-Dec-29, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101348
PMID:41483713
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了抗生素耐药性骨感染中巨噬细胞与间充质干细胞之间失调的免疫-基质相互作用机制 | 首次发现抗生素耐药性骨感染中SIRPα-Thbs1-CD47轴介导的巨噬细胞检查点机制,并证明靶向该轴可恢复胞葬作用、减轻炎症并促进骨再生 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在临床患者中进行验证 | 阐明抗生素耐药性骨感染中骨免疫平衡失调的细胞与分子机制 | 感染骨组织中的巨噬细胞、间充质干细胞和中性粒细胞 | 单细胞组学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 101,336个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 598 | 2026-01-05 |
Expression patterns and clinical implications of chaperonin subunit 3 mRNA and protein in laryngeal squamous cell carcinoma
2025-Dec-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i12.112161
PMID:41480162
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研究论文 | 本研究探讨了伴侣蛋白亚基3(CCT3)在喉鳞状细胞癌(LSCC)中的表达模式、临床意义及其对癌细胞生长的影响 | 首次通过整合多数据库mRNA表达数据、单细胞RNA-seq验证、免疫组化分析及CRISPR基因敲除功能实验,系统揭示了CCT3在LSCC中的致癌作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 临床样本量相对有限(88例免疫组化样本),且临床参数亚组分析未发现显著差异,需更大规模队列验证 | 探究CCT3在喉鳞状细胞癌中的表达特征、临床相关性及其对癌细胞生长的调控机制 | 喉鳞状细胞癌(LSCC)组织样本(269例mRNA数据、88例蛋白数据)及LSCC细胞系 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA-seq, 免疫组化, CRISPR基因敲除, 基因集富集分析, 蛋白质相互作用网络构建 | NA | mRNA表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组化图像数据 | 269例LSCC组织(mRNA数据), 88例临床样本(30例LSCC vs 58例非LSCC,蛋白数据) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 599 | 2026-01-05 |
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017873
PMID:41061151
|
综述 | 本文探讨了CAR T细胞疗法疗效的预测标志物,重点关注CAR T细胞适应性与系统性免疫之间的相互作用 | 整合了单细胞转录组学、蛋白质组学分析和细胞因子多功能性检测等新兴技术,结合机器学习方法,用于识别预测性生物标志物并优化治疗策略 | NA | 识别和优化CAR T细胞疗法的预测性生物标志物,以改善患者分层和治疗效果 | CAR T细胞疗法在复发或难治性淋巴恶性肿瘤患者中的应用 | 机器学习 | 淋巴恶性肿瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质组学分析、细胞因子多功能性检测 | 机器学习 | 转录组、蛋白质组、细胞因子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 600 | 2026-01-05 |
Guardians within: Cross-talk between the gut microbiome and host immune system
2025-Dec-22, World journal of gastrointestinal pathophysiology
DOI:10.4291/wjgp.v16.i4.111245
PMID:41479870
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综述 | 本文综述了肠道微生物群与宿主免疫系统之间的复杂互作,探讨了微生物如何影响免疫细胞分化、调节炎症反应并维持免疫稳态 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞测序等最新技术进展,深入揭示了微生物-免疫轴的作用机制,为基于微生物组的治疗策略开辟了新途径 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且微生物-免疫互作的因果机制仍需进一步实验验证 | 探讨肠道微生物群与宿主免疫系统之间的互作关系及其在健康和疾病中的作用 | 肠道微生物群、宿主免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞、先天淋巴细胞、T细胞、B细胞)及其代谢产物(如短链脂肪酸) | NA | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、癌症 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |