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当前共找到 35128 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-01-04 |
The Role of Sphingolipid Metabolism and Neuron Death in Ischemic Stroke: A New Perspective from Bioinformatics
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71172
PMID:41474773
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法，结合批量与单细胞转录组学数据，探讨了鞘脂代谢在缺血性卒中神经元死亡中的作用 | 首次整合批量转录组与单细胞RNA测序数据，系统分析鞘脂代谢在缺血性卒中中的作用，并鉴定出App基因作为关键调控因子 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，体内验证仅在MCAO大鼠模型中进行，需要更多临床样本和功能实验验证 | 探索鞘脂代谢与缺血性卒中神经元死亡之间的分子机制和潜在治疗靶点 | 缺血性卒中患者外周血样本、MCAO小鼠模型外周血单细胞数据、MCAO大鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 转录组数据 | 人类外周血批量数据(GSE16561)、MCAO小鼠外周血单细胞数据(GSE225948)、MCAO大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2026-01-04 |
Identifying vascular stiffening-sensitive macrophages through integration of single-cell transcriptomics and imaging flow cytometry
2025-Dec-31, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240063
PMID:41477484
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和成像流式细胞术，识别了在血管硬化过程中对细胞外基质刚度敏感的SPP1+巨噬细胞亚群 | 首次结合单细胞转录组学与成像流式细胞术，在动脉硬化模型中系统性地识别并验证了SPP1+巨噬细胞是对细胞外基质刚度敏感的特定免疫细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养系统，在人体样本中的验证尚不充分，且未深入探讨SPP1+巨噬细胞促进血管硬化的具体分子机制 | 旨在识别在心血管疾病中响应动脉硬化的特定免疫细胞成分和关键因子 | 硬化颈动脉斑块中的免疫细胞、不同刚度聚丙烯酰胺凝胶上培养的巨噬细胞、急性钙化小鼠模型中的血管组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，成像流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-01-04 |
A competition model of multilineage priming and cell-fate decisions
2025-Dec-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116690
PMID:41481416
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综述 | 本文综述了多谱系启动和细胞命运决策的竞争模型，探讨了祖细胞如何通过基因表达程序的竞争产生多样化的细胞命运 | 提出了集体多能性作为群体自我调节以平衡胚胎发育中所有下游命运产生的新兴状态，并整合了诱导性发育与自主性命运选择模式 | NA | 探讨祖细胞和干细胞如何通过多谱系启动和基因表达程序的竞争性相互作用产生多样化的细胞命运 | 祖细胞、干细胞及其在胚胎发育中的命运决策过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、克隆谱系追踪、多组学整合 | 竞争模型 | 转录组数据、谱系数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2026-01-04 |
Epidermal resident memory T cell fitness requires antigen encounter in the skin
2025-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107096
PMID:41468295
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研究论文 | 本文研究了表皮驻留记忆T细胞（T）的适应性，发现其在皮肤中遭遇抗原的经历能增强其持久性和增殖能力 | 揭示了抗原在表皮中的遭遇如何通过TGFβ信号通路增强T细胞的持久性和增殖能力，并识别了TGFβRIII的关键作用 | NA | 探讨表皮驻留记忆T细胞适应性的机制，特别是抗原遭遇对其持久性和功能的影响 | 表皮驻留记忆T细胞（T） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 625 | 2026-01-04 |
Quantum Generative Modeling of Single-Cell transcriptomes: Capturing Gene-Gene and Cell-Cell Interactions
2025-Dec-19, ArXiv
PMID:41281198
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研究论文 | 本文提出了一种基于量子计算的单细胞转录组模拟器qSimCells，利用量子纠缠同时建模基因-基因和细胞-细胞相互作用 | 首次引入量子计算框架，通过参数化量子电路和CNOT门编码非线性基因调控网络和具有明确因果方向的细胞间通讯拓扑，克服了经典方法仅依赖线性相关的局限 | 未明确说明模拟数据规模与真实数据的定量对比指标，且量子计算硬件依赖可能限制实际应用 | 开发能够捕获单细胞转录组数据中非线性依赖关系的高保真模拟方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 量子生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2026-01-04 |
Temporal single-cell analysis reveals age-associated delay in immune resolution after respiratory viral infection
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694321
PMID:41446064
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术，比较了年轻和老年小鼠在流感病毒感染后的肺部免疫反应，揭示了老年宿主中干扰素信号通路异常导致免疫细胞持续存在和慢性免疫病理的机制 | 首次在老年宿主中系统性地结合时间序列单细胞分析，识别出干扰素α/γ信号通路在单核细胞来源巨噬细胞和间质巨噬细胞亚群中的关键作用，并证明抑制该通路可改善长期呼吸结局 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；且主要关注肺部免疫，未全面评估全身性免疫反应 | 阐明老年宿主在急性呼吸道病毒感染后免疫病理增强和肺修复延迟的免疫决定因素 | 年轻和老年小鼠的肺部组织 | 数字病理学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 年轻和老年小鼠的肺部样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2026-01-04 |
Host Genetic Architecture between Epstein-Barr Virus Activity and Multiple Sclerosis Reveals Shared Pathways
2025-Dec-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2025.12.11.25342083
PMID:41445616
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研究论文 | 本研究通过开发从全基因组测序数据量化EBV DNA的流程，进行了跨祖先的EBV DNA阳性全基因组关联研究，揭示了EBV活动与多发性硬化症风险之间的遗传和细胞联系 | 开发了从全基因组测序数据量化EBV DNA的新流程，并首次在人群规模队列中进行了跨祖先的EBV DNA阳性GWAS，同时建立了优化的单细胞RNA-seq方法用于EBV检测 | 未明确说明样本的具体临床特征或随访时间，且独立验证队列样本量较小（n=94） | 阐明EBV活动与多发性硬化症之间的宿主遗传机制和细胞通路 | EBV感染、多发性硬化症、宿主遗传变异、B细胞 | 基因组学 | 多发性硬化症 | 全基因组测序、GWAS、qPCR、单细胞RNA-seq、孟德尔随机化分析 | 多基因风险评分、孟德尔随机化 | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 617,186名个体（GWAS），94名个体（独立验证队列），以及MS患者和健康个体的单细胞样本 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 628 | 2026-01-04 |
MisTIC: Missegmented Transcript Inference Correction for Improved Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Dec-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693759
PMID:41446065
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MisTIC的变分贝叶斯模型，用于校正空间转录组学数据中的转录本错误分配问题，以提高分析准确性 | MisTIC模型无需重新分割细胞，即可有效校正转录本错误分配，从而提升下游分析的精度并支持新的研究视角 | NA | 开发一种校正空间转录组学数据中转录本错误分配的方法，以改善细胞类型识别、差异表达分析和细胞间通讯检测 | 空间转录组学数据中的转录本分配错误 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 变分贝叶斯模型 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学 | 10X Xenium, MERSCOPE, CosMx | NA |
| 629 | 2026-01-04 |
SEEK-VEC: Robust Latent Structure Discovery via Ensemble Topic Modeling
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.12.693799
PMID:41427368
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研究论文 | 本文提出了一种名为SEEK-VEC的集成框架，用于通过主题建模发现计数数据中的潜在结构 | SEEK-VEC通过集成多个候选主题模型，利用谱集成程序自动强化信号并减轻噪声，生成数据的共识低维嵌入，从而在信号弱时优于现有方法 | NA | 开发一个鲁棒的集成框架，用于在计数数据中检测潜在结构，以克服标准主题建模方法的限制 | 计数数据，包括自报告的心理病理症状数据、食物偏好问卷和单细胞转录组学数据 | 机器学习 | NA | 主题建模 | 集成主题模型 | 计数数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 630 | 2026-01-04 |
Spatiotemporal Atlas of Heart Development Reveals Blood-Flow-Dependent Cellular, Structural, Metabolic, and Spatial Remodeling
2025-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693024
PMID:41427371
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研究论文 | 本研究通过扰动鸡胚胎心脏血流，结合单细胞和空间转录组学，构建了血流依赖的心脏发育时空图谱，揭示了血流力学如何重塑心脏组织的细胞、结构和代谢特征 | 首次在胚胎心脏发育中系统整合血流力学扰动与高分辨率空间转录组学，揭示了血流依赖的跨尺度（分子、细胞、结构）重塑机制，并识别了LOX表达心肌细胞等新的血流敏感细胞状态 | 研究基于鸡胚胎模型，其结论在哺乳动物或人类中的普适性需进一步验证；空间转录组分辨率虽高但仍存在技术限制 | 探究血流力学如何调控胚胎心脏的细胞程序、组织结构和代谢适应，阐明血流依赖的发育重塑机制 | 鸡胚胎心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 631 | 2026-01-04 |
Riemannian Metric Learning for Alignment of Spatial Multiomics
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693237
PMID:41427348
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研究论文 | 本文提出了一种名为Manifold Gromov-Wasserstein (MGW)的度量学习框架，用于对齐空间多组学数据中的异构模态 | MGW框架利用神经场推断模态特定的黎曼度量，并通过Gromov-Wasserstein最优传输对齐这些度量，实现了无需超参数的成本计算，并具有理论不变性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够对齐空间多组学数据中不同模态的方法 | 空间多组学数据，包括转录组、表观基因组、蛋白质组和代谢组等 | 机器学习 | 结直肠癌、肾癌 | 空间转录组学、空间代谢组学 | 神经场 | 空间多模态数据 | 数千个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 632 | 2026-01-04 |
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7769205/v1
PMID:41333415
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研究论文 | 本文介绍了人类肿瘤图谱网络（HTAN）开发的基于云的基础设施，用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据 | 引入了两个关键创新：基于来源的HTAN ID表简化了队列构建和跨检测整合；以及将BigQuery的地理空间功能创新性地应用于空间生物学，实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 | 未明确提及具体的技术或应用限制 | 开发一个基于云的基础设施，以降低整合和分析大规模、多模态癌症数据的技术和计算障碍 | 人类肿瘤图谱网络（HTAN）生成的多模态癌症数据，包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 | NA | 单细胞数据、空间数据、临床数据、图像数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | Google BigQuery | 基于Google BigQuery的云基础设施，托管于系统生物学研究所癌症云网关（ISB-CGC） | |
| 633 | 2026-01-04 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
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研究论文 | 本文通过小鼠模型和单细胞转录组学，揭示了急性髓系白血病（AML）微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能，导致免疫抑制和感染易感性 | 首次使用非照射中性粒细胞报告小鼠模型，结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选，系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路影响中性粒细胞成熟和功能，并发现其免疫抑制能力 | 研究主要基于小鼠模型，虽然患者数据支持类似生物学现象，但人类AML的异质性可能未被完全覆盖，且机制细节如特定细胞因子作用需进一步验证 | 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响，以解释患者中性粒细胞减少和感染易感性的机制 | AML暴露的中性粒细胞（来自小鼠模型和患者样本） | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学，体外细胞因子筛选，染色质重塑分析，基序发现 | NA | 转录组数据，染色质数据 | 小鼠模型和患者样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 634 | 2026-01-04 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal a Tumor-Associated Macrophage Subpopulation that Mediates Prostate Cancer Progression and Metastasis
2025-Jul-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0791
PMID:40105746
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多重免疫荧光数据，揭示了前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的异质性，并识别出一个与转移相关的SPP1+/TREM2+ TAM亚群 | 首次整合单细胞和空间转录组学数据，识别出SPP1+/TREM2+ TAM亚群在前列腺癌转移中的关键作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模临床验证；SPP1阻断策略的长期疗效和安全性未充分评估 | 探究前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用机制 | 人类前列腺癌患者样本、小鼠前列腺癌模型（RM1模型） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | 人类患者样本和小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 635 | 2026-01-04 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法，并实现了名为klue的程序 | 提出了一种基于k-mer伪组装的方法，用于识别单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性变异 | NA | 开发一种识别基因组序列变异的新方法 | 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 彩色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-01-04 |
Microglia depletion reduces human neuronal APOE4-related pathologies in a chimeric Alzheimer's disease model
2025-Jan-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.10.005
PMID:39500314
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研究论文 | 本研究通过在小鼠海马中移植人类iPSC来源的神经元，并利用小胶质细胞耗竭技术，探讨了小胶质细胞对神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理的影响 | 首次在嵌合模型中结合神经元APOE基因型和小胶质细胞耗竭，揭示了APOE4与小胶质细胞协同促进Aβ和tau病理形成的机制 | 研究基于嵌合小鼠模型，可能不完全反映人类AD的复杂环境；样本量未明确说明 | 探究小胶质细胞在神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理形成中的作用 | 人类iPSC来源的神经元（APOE4、APOE3和APOE-KO基因型）移植到人类APOE3或APOE4敲入小鼠海马中 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 637 | 2026-01-04 |
Histopathologic Analysis of Human Kidney Spatial Transcriptomics Data: Toward Precision Pathology
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.011
PMID:39097165
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研究论文 | 本研究通过形态学方法分析人类肾脏空间转录组学数据，旨在推进精准病理学的发展 | 首次将基于形态学的分析方法应用于人类肾脏空间转录组学数据，以病理学为基础识别聚类，并成功投影到其他样本中 | 仅基于单一人类肾脏样本进行建模，未涉及大规模验证或多种疾病状态的比较 | 探索基于形态学的空间转录组学数据分析方法，以提升对慢性肾脏病病变机制的理解 | 人类肾脏组织样本，包括健康与疾病状态 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学 | NA | 图像与空间转录组学数据 | 单个人类肾脏样本，并扩展到肾切除或针吸活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 638 | 2026-01-04 |
Spatial Transcriptomics: Integrating Morphology and Molecular Mechanisms of Kidney Diseases
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.012
PMID:39097166
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的应用，整合形态学与分子生物学以提升对组织生物学和疾病机制的理解 | 整合了空间转录组学技术与肾脏疾病研究，强调了高分辨率空间技术在生命科学中的革命性潜力 | NA | 探讨空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的科学和潜在医学价值 | 肾脏疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 639 | 2026-01-04 |
Differential TGF-β1/SMAD4 Signaling Regulates PMN-MDSC Differentiation and Reshapes the Immune Microenvironment in Breast Cancer
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S566995
PMID:41476671
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β1/SMAD4信号通路如何调节多形核髓源性抑制细胞的分化并重塑乳腺癌免疫微环境 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析乳腺癌组织中中性粒细胞亚群的异质性，并揭示了TGF-β1在正常与荷瘤小鼠中对PMN-MDSC分化的差异调控作用 | 需要进一步在临床环境中验证TGF-β1通路作为治疗靶点的疗效 | 阐明TGF-β1/SMAD4信号通路调控PMN-MDSC分化及调节乳腺癌免疫微环境的机制 | 乳腺癌组织中的中性粒细胞亚群、4T1小鼠乳腺癌转移模型及脾源性造血干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 流式细胞术, Western blotting | NA | 基因表达谱, 图像 | 使用GSE176078数据集及建立的4T1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-01-04 |
Inhibitors of KAT2A Alleviate the Progression of AKI by Alleviating Macrophage Ferritinophagy
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S568586
PMID:41476772
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，揭示了组蛋白乙酰转移酶KAT2A通过调控NCOA4介导的巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING炎症信号通路，促进急性肾损伤（AKI）的进展，并发现KAT2A抑制剂MB-3可减轻AKI的病理变化 | 首次阐明了KAT2A在AKI中通过调节巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING信号通路的作用机制，并验证了KAT2A抑制剂MB-3的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验，人类样本验证有限，且MB-3的长期疗效和安全性尚未在临床中评估 | 探究KAT2A在急性肾损伤（AKI）进展中的作用机制，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠肾脏组织、RAW264.7巨噬细胞系、人类AKI活检样本 | 单细胞测序与分子病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲低与过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量，涉及小鼠模型、细胞系和人类活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |