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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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481 | 2025-10-05 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.10.574997
PMID:38260455
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研究论文 | 本研究通过表观基因组分析鉴定了一类响应机械微环境的基因组增强子——机械增强子 | 首次发现并定义了一种新型基因组增强子,能够响应细胞外基质硬度的机械信号调控转录 | 机械增强子调控转录的具体分子机制尚未完全阐明 | 探索机械微环境如何通过表观遗传调控影响细胞转录和表型 | 细胞机械微环境与表观遗传调控的相互作用 | 表观遗传学 | NA | 全基因组表观基因组分析, 表观基因组编辑, 单细胞RNA-seq CRISPR筛选 | NA | 表观基因组数据, 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
482 | 2025-10-05 |
Leveraging single-cell transcriptomic data to uncover immune suppressive cancer cell subsets in triple-negative canine breast cancers
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1434617
PMID:39376916
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研究论文 | 利用单细胞转录组数据识别三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制癌细胞亚群 | 首次通过整合分析已发表单细胞测序数据揭示犬三阴性乳腺癌的免疫抑制亚群及其作用机制 | 基于已发表数据集进行二次分析,缺乏原始实验验证 | 鉴定和表征犬三阴性乳腺癌中的免疫抑制癌细胞亚群 | 犬三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30只狗分为6组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
483 | 2025-10-05 |
Rapid and signal crowdedness-robust in situ sequencing through hybrid block coding
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2309227120
PMID:37963245
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研究论文 | 介绍一种名为SPRINTseq的新型原位测序方法,通过混合块编码和分子稀释策略实现快速、高分辨率的空间转录组分析 | 结合混合块编码和分子稀释策略,解决了现有方法在分辨率、灵敏度或速度方面的限制 | NA | 开发改进的空间转录组技术以探索复杂生物过程和疾病机制 | 小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 原位测序 | NA | 空间转录组数据 | 4个小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞,恢复超过1.42亿个转录本 | NA | 空间转录组学,原位测序 | SPRINTseq | 使用108个基因panel的混合块编码和分子稀释策略 |
484 | 2025-10-05 |
NMDAR antagonists suppress tumor progression by regulating tumor-associated macrophages
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302126120
PMID:37967215
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研究论文 | 本研究揭示了NMDAR在肿瘤相关巨噬细胞中的免疫抑制作用及其拮抗剂的抗肿瘤潜力 | 首次发现NMDAR激活通过钙内流和活性氧生成驱动肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制功能,并证明NMDAR拮抗剂可逆转此过程 | 研究主要聚焦于肝细胞肉瘤和纤维肉瘤模型,尚未验证其他肿瘤类型 | 探究NMDAR在肿瘤微环境中对巨噬细胞的调控机制及治疗潜力 | 肿瘤相关巨噬细胞、T细胞、NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞肉瘤、纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
485 | 2025-10-05 |
Controlling donor and newborn neuron migration and maturation in the eye through microenvironment engineering
2023-11-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302089120
PMID:37931105
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研究论文 | 通过微环境工程控制供体和新生神经元在眼中的迁移与成熟 | 建立了'计算模拟-体外实验-体内验证'框架,首次利用单细胞转录组数据筛选出SDF1作为引导分子,在视网膜中构建人工梯度显著促进神经元迁移 | 研究仅聚焦于视网膜神经节细胞,未验证该方法在其他神经元类型或脑区的普适性 | 开发控制移植后供体细胞行为的精准方法,促进神经元整合 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞转录组测序,计算机模拟分析,体外功能实验 | NA | 基因表达数据,细胞迁移数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
486 | 2025-10-05 |
A cellular and molecular spatial atlas of dystrophic muscle
2023-07-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221249120
PMID:37410813
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,构建了营养不良肌肉的高分辨率细胞和分子空间图谱 | 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序相结合,揭示了DMD肌肉中细胞群体的非均匀分布和异步再生特征 | 研究基于D2-mdx小鼠模型,结果向人类DMD的转化需要进一步验证 | 研究杜氏肌营养不良症中异步肌肉再生对疾病进展的生物学机制 | 严重营养不良的D2-mdx小鼠模型的肌肉组织 | 空间生物学 | 杜氏肌营养不良症 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据, 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
487 | 2025-10-05 |
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01251-x
PMID:36732642
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研究论文 | 开发STARmap PLUS方法,结合空间转录组学和蛋白质检测,绘制阿尔茨海默病小鼠模型的单细胞转录状态与组织病理学图谱 | 首次实现高分辨率空间转录组学与蛋白质检测在同一组织切片中的整合,揭示淀粉样斑块周围的核心-壳结构细胞分布 | 仅在阿尔茨海默病小鼠模型中验证,样本量有限 | 研究阿尔茨海默病发病机制中的时空细胞和分子变化 | 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,蛋白质检测 | NA | 空间转录组数据,蛋白质表达数据,组织图像 | 8月龄和13月龄阿尔茨海默病小鼠脑组织 | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS | 高分辨率空间转录组学与蛋白质检测整合方法 |
488 | 2025-10-05 |
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00938-x
PMID:34663959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术,构建了小鼠伏隔核的细胞图谱,揭示了其细胞异质性 | 首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的细胞分类系统,揭示了神经元亚型的转录和空间多样性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证 | 解析小鼠伏隔核的分子、细胞和解剖异质性 | 小鼠伏隔核脑区 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
489 | 2025-09-30 |
Single-cell transcriptomics unveils iron dysregulation in macrophages: Implicated genes in periodontitis pathogenesis identified via Mendelian randomization
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101544
PMID:41019505
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
490 | 2025-09-30 |
Uncovering stromal cell fate genes and a novel risk stratification in UCEC by integrating single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101743
PMID:41019513
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
491 | 2025-10-05 |
Activated MAFB in ovarian cancer promotes cytoskeletal remodeling and immune microenvironment suppression by interfering with m6A modifications through WTAP competition
2025-Oct, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03522-w
PMID:40796955
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研究论文 | 本研究揭示了MAFB通过竞争性结合WTAP干扰m6A修饰,促进卵巢癌细胞骨架重塑和免疫微环境抑制的新机制 | 首次发现MAFB通过竞争性结合m6A甲基转移酶复合物核心组分WTAP,建立MAFB-WTAP-CD55调控轴,连接转录调控与表观转录组修饰 | NA | 探索卵巢癌免疫逃逸的分子机制 | 卵巢癌 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个临床队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
492 | 2025-10-05 |
Taurine improves bovine oocyte maturation through recovering mitochondrial dysfunction and oxidative stress-induced apoptosis after microplastics exposure
2025-Oct, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-26435
PMID:40818686
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研究论文 | 本研究探讨微塑料暴露对牛卵母细胞成熟的影响及牛磺酸的修复作用 | 首次揭示微塑料通过线粒体功能障碍导致牛卵母细胞成熟失败,并发现牛磺酸具有修复作用 | 研究仅针对牛卵母细胞,对人类生殖系统的直接适用性需要进一步验证 | 探究微塑料对雌性生殖系统的毒性作用及牛磺酸的保护机制 | 牛卵母细胞 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 免疫荧光染色,单细胞转录组测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
493 | 2025-10-05 |
Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence
2025-Sep-29, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
PMID:40999941
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞等新型免疫细胞亚群 | 需要进一步开展空间转录组学和蛋白质组学研究,改进动物模型,加强机制发现与靶向治疗的转化研究 | 阐明IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞等免疫细胞及成纤维细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
494 | 2025-10-05 |
The Biomarkers and Underlying Mechanisms of Mitochondrial and PCD Related Genes in Epilepsy by Combining Transcriptome and Single-Cell Sequencing
2025-Sep-29, Journal of Korean Neurosurgical Society
IF:1.4Q3
DOI:10.3340/jkns.2024.0230
PMID:41017268
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研究论文 | 本研究通过结合转录组和单细胞测序技术,探索线粒体和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的生物标志物及其潜在机制 | 首次结合转录组和单细胞RNA测序分析,识别出与线粒体和程序性细胞死亡相关的癫痫生物标志物LTBR和IRF1 | 样本量有限,仅使用两个数据集和临床样本进行验证 | 探索线粒体和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的作用机制和生物标志物 | 癫痫患者样本和对照样本 | 生物信息学 | 癫痫 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | Spearman相关分析, ROC曲线分析 | 基因表达数据, 单细胞数据 | GSE134697和GSE168375数据集样本,外加临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
495 | 2025-10-05 |
Pathogenicity of Mediator Complex Subunit 27 (MED27) in a Neurodevelopmental Disorder with Cerebellar Atrophy
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505535
PMID:41017421
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研究论文 | 本研究揭示了MED27基因变异通过破坏中介体复合物稳定性导致神经发育障碍和小脑萎缩的致病机制 | 首次阐明了MED27部分功能缺失导致神经发育障碍的具体分子机制,并建立了研究中介体亚基致病性变异的原型模型 | NA | 研究MED27基因变异导致神经发育障碍和小脑萎缩的致病机制 | 携带患者特异性MED27变异的体外干细胞和Med27功能缺失的小鼠模型 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞空间转录组学,转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
496 | 2025-10-05 |
Extracellular Vesicle-Packaged circTAX1BP1 from Cancer-Associated Fibroblasts Regulates RNA m6A Modification through Lactylation of VIRMA in Colorectal Cancer Cells
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514008
PMID:41017455
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过细胞外囊泡递送circTAX1BP1调控结直肠癌肝转移的新机制 | 首次发现CAF来源的EV-packaged circTAX1BP1通过VIRMA乳酰化调控RNA m6A修饰,并鉴定出ITGA11 myCAFs亚群在正反馈环路中的关键作用 | 机制研究主要基于体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并探索治疗靶点 | 结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、细胞外囊泡 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, PDX模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
497 | 2025-10-05 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-Sep-29, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
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综述 | 本文探讨氧化还原机制在微血管生理和病理生理中的作用及其治疗策略 | 强调微血管与大血管对ROS/RNS反应差异,指出单细胞RNA测序揭示不同血管床内皮细胞具有独特基因特征 | 技术挑战限制了可靠关联ROS/RNS水平与微血管结果的能力,缺乏针对微血管氧化还原信号的特效治疗方法 | 阐明氧化还原介导的微血管功能障碍在疾病发病机制中的具体作用 | 微血管内皮细胞及其对活性氧/活性氮物种(ROS/RNS)的响应 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
498 | 2025-10-05 |
Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment
2025-Sep-29, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04593-y
PMID:41020944
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化方法揭示了铁死亡调控因子CTSB通过调节免疫微环境驱动前列腺癌进展的因果机制 | 首次提供了铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据,识别了CTSB作为关键风险因子 | 研究主要基于遗传学证据,需要进一步实验验证机制细节 | 探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌的遗传因果关系及免疫介导机制 | 前列腺癌患者样本和免疫细胞类型 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 多组学孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白组数据 | 涉及731种免疫细胞类型的多组学数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
499 | 2025-10-05 |
Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics
2025-Sep-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202510939
PMID:41017207
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研究论文 | 开发了一种名为scDUAL-seq的新方法,能够在单细胞水平同时测量RNA合成和降解速率 | 整合了双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序技术,首次实现单细胞水平转录组范围内RNA合成和降解速率的同步测量 | NA | 解析动态过程中RNA调控机制 | 异质性细胞群体中的RNA转录和降解过程 | 单细胞组学 | NA | 双核苷类似物脉冲标记,化学核苷转化,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
500 | 2025-10-05 |
Immune cell dynamics and their role in cardiac injury: Mechanisms and therapeutic implications
2025-Sep-27, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118608
PMID:41016152
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综述 | 本文综述了心脏损伤中免疫细胞动态变化及其作用机制与治疗前景 | 整合单细胞转录组学、空间组学、免疫代谢和神经内分泌-免疫相互作用等多维度数据,提出精准免疫治疗框架 | NA | 阐明心脏疾病中免疫细胞动态变化机制及其治疗意义 | 中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、T细胞等免疫细胞及其与心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 空间组学, 免疫代谢分析 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |