单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-05-13 |
SUV39H1 Preserves Cancer Stem Cell Chromatin State and Properties in Glioblastoma
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.607856
PMID:39229036
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研究论文 | 本文揭示了SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）维持和肿瘤进展中的关键作用 | 首次报道SUV39H1在GSCs维持中的关键作用，并展示其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验 | 探索SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的作用及其治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs） | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、ATAC测序 | NA | RNA测序数据、染色质可及性数据 | 患者来源的GSCs和胶质母细胞瘤样本 |
| 482 | 2025-05-13 |
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
DOI:10.1186/s13014-024-02472-z
PMID:38926892
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示辐射后皮肤成纤维细胞亚群的变化及caveolin表达的变异性 | 首次在辐射诱导纤维化（RIF）中识别出成纤维细胞亚群的特定变化及Cav1与Cav2的拮抗作用 | 样本量较小（仅6例患者），且仅针对乳腺癌术后重建患者的皮肤样本 | 探究辐射损伤后皮肤纤维化的细胞机制 | 辐射与非辐射的人类皮肤样本 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（10X平台）、组织学评估、免疫组化、生物力学测试 | Seurat聚类分析、SingleR分类器 | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 6例女性患者的配对辐射/非辐射皮肤样本 |
| 483 | 2025-05-13 |
Mutual information for detecting multi-class biomarkers when integrating multiple bulk or single-cell transcriptomic studies
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.11.598484
PMID:38915481
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研究论文 | 提出了一种名为MICA的统计框架，用于从信息论角度检测跨多个组学研究的多类生物标志物 | MICA框架能够检测跨多个组学研究的多类生物标志物，填补了现有方法仅适用于两类别场景的空白 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种能够整合多个组学研究并检测多类生物标志物的统计方法 | 多类设计的组学研究数据（如多种疾病亚型、处理方式、组织或细胞类型） | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 转录组测序（包括bulk和单细胞RNA-Seq） | 互信息一致性分析（MICA） | 转录组数据 | 涉及小鼠代谢相关转录组研究的四种组织和雌激素处理表达谱的三个来源 |
| 484 | 2025-05-13 |
Immunomodulatory Role of the Stem Cell Circadian Clock in Muscle Repair
2024-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595728
PMID:38854114
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research paper | 该研究揭示了肌肉干细胞中的生物钟如何通过调节免疫微环境来影响肌肉再生 | 发现了肌肉干细胞生物钟通过NAD+代谢节律调控炎症反应基因的时间依赖性表达，揭示了CCL2在生物钟依赖的干细胞-中性粒细胞互作中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肌肉再生中的类似机制仍需验证 | 探索生物钟调控肌肉干细胞免疫调节功能的分子机制 | 肌肉干细胞及其免疫微环境 | 细胞生物学 | 肌肉损伤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 485 | 2025-05-13 |
STRUCTURE-FUNCTION RELATIONSHIPS OF MUCOCILIARY CLEARANCE IN HUMAN AIRWAYS
2024-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4164522/v1
PMID:38746209
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research paper | 研究人类气道上皮组织结构与纤毛功能之间的关系及其在黏液纤毛清除中的作用 | 首次绘制了人类和大鼠气道树上纤毛和分泌细胞的分布图，揭示了物种间纤毛功能的差异，并阐明了预测清除功能的上皮结构参数 | 研究主要依赖于动物模型数据，对人类气道屏障功能的理解存在局限 | 探究人类气道上皮组织结构与纤毛功能之间的关系及其在黏液纤毛清除中的作用 | 人类和大鼠的气道上皮组织 | 生物医学 | 慢性阻塞性肺病（COPD）、哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本数据 | 人类和大鼠的气道上皮组织样本 |
| 486 | 2025-05-13 |
scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord
2024-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.003
PMID:38224933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析文昌鱼脊索细胞的基因表达特征 | 首次在单细胞水平上揭示了文昌鱼脊索细胞的基因表达特征，并发现脊索中存在优先表达的肌原纤维基因 | 研究仅关注文昌鱼脊索细胞，未与其他脊索动物进行直接比较 | 解析脊索细胞的组成和功能，为理解脊索动物的起源和进化提供证据 | 文昌鱼脊索细胞 | 基因组学 | NA | Iso-seq分析, 单细胞RNA-seq分析, 原位杂交(ISH) | NA | RNA-seq数据 | 未明确说明样本数量 |
| 487 | 2025-05-13 |
Neutrophils facilitate the epicardial regenerative response after zebrafish heart injury
2024-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.011
PMID:38286185
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞在斑马鱼心脏再生早期事件中的作用 | 揭示了中性粒细胞通过FGF和MAPK/ERK信号通路促进心外膜细胞再生的新机制 | 研究仅基于斑马鱼模型，未在哺乳动物中进行验证 | 阐明心脏再生早期事件中的关键细胞类型和分子机制 | 斑马鱼心脏再生过程中的中性粒细胞和心外膜细胞 | 再生医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq分析 | 斑马鱼心脏损伤模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但使用了1 dpa（损伤后1天）的中性粒细胞进行scRNA-seq分析 |
| 488 | 2025-05-13 |
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-Dec, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00657-1
PMID:37945755
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研究论文 | 通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，研究基因组和免疫特征对新诊断多发性骨髓瘤患者免疫治疗方案的临床结果的预测作用 | 揭示了APOBEC突变活性、IKZF3和RPL5缺失以及8q增益等基因组驱动因素对临床结果的影响，并发现治疗前后免疫微环境的变化与持续微小残留病阴性相关 | 样本来源于特定的临床试验（NCT03290950），可能限制了结果的普遍适用性 | 预测新诊断多发性骨髓瘤患者在接受含抗CD38抗体的免疫治疗方案后的临床结果和治疗反应深度 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者 | 基因组学与免疫治疗 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 来自NCT03290950临床试验的患者样本 |
| 489 | 2025-05-13 |
Epigenomic landscape exhibits interferon signaling suppression in the patient of myocarditis after BNT162b2 vaccination
2023-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-36070-y
PMID:37264110
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research paper | 该研究追踪了BNT162b2疫苗接种后发生心肌炎患者外周血单个核细胞（PBMCs）的染色质动态变化 | 首次研究了BNT162b2疫苗接种后心肌炎患者PBMCs的染色质可及性和RNA测序变化，揭示了干扰素信号传导的下调和RUNX2/3活性的上调 | 研究样本量较小，仅针对单一疫苗接种后的心肌炎患者 | 探究BNT162b2疫苗接种后心肌炎的潜在机制 | BNT162b2疫苗接种后发生心肌炎的患者 | 基因组学 | 心肌炎 | 单细胞ATAC-seq和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据和转录组数据 | 一名BNT162b2疫苗接种后发生心肌炎的患者 |
| 490 | 2025-05-12 |
Comprehensive profiling of cell type-specific expression and distribution of complement genes in mouse and human kidneys: insights into normal physiology and response to kidney transplantations
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2471568
PMID:40015727
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研究论文 | 通过分析小鼠和人类肾脏的单细胞RNA测序数据，全面描绘了补体基因在细胞类型特异性表达和分布中的特征，并探讨了其在肾脏移植反应中的作用 | 首次在肾脏细胞动态变化的背景下，全面分析了补体基因的表达模式，并比较了小鼠和人类肾脏之间的相似性及其在肾脏损伤中的响应性 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行功能验证实验 | 研究补体基因在肾脏中的表达分布及其在生理功能和病理条件下的作用 | 健康人类、C57BL/6小鼠及肾脏移植排斥小鼠的肾脏细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康人类、C57BL/6小鼠及肾脏移植排斥小鼠的肾脏单细胞RNA测序数据 |
| 491 | 2025-05-12 |
Reading of human acute immune dynamics in omicron SARS-CoV-2 breakthrough infection
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2494705
PMID:40231451
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研究论文 | 本研究通过纵向前瞻性队列研究，探讨了人类对SARS-CoV-2突破性感染的急性免疫动态反应 | 揭示了突破性感染期间外周血从2型细胞因子反应向1型细胞因子反应的转变，并发现S100A8/A9在轻度病例早期显著增加 | 样本量较小，仅包含13名参与者 | 解析SARS-CoV-2突破性感染的免疫反应动态 | 13名SARS-CoV-2突破性感染参与者 | 免疫学 | COVID-19 | 转录组测序、单细胞测序、TCR测序、BCR测序、Olink蛋白质组学、抗原-抗体结合实验 | NA | 血液样本、转录组数据、蛋白质组数据 | 13名参与者 |
| 492 | 2025-05-12 |
Revealing NAPSA's role in ccRCC: Insights from single-cell RNA sequencing
2025-Aug-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149478
PMID:40194687
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了NAPSA在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达特征及其潜在作用 | 首次在单细胞水平上研究了NAPSA在ccRCC中的表达模式及其与肿瘤微环境的相互作用 | 样本量较小(7个肿瘤样本和2个正常样本)，且需要进一步实验验证NAPSA的具体作用机制 | 探索NAPSA在ccRCC中的分子特征及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)组织和细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 7个肿瘤样本和2个正常样本 |
| 493 | 2025-05-12 |
Lamb1-mediated Wnt/β-catenin signaling pathway drives endothelial angiogenesis for fracture healing
2025-Aug-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149481
PMID:40221061
|
research paper | 该研究探讨了Lamb1通过Wnt/β-catenin信号通路促进内皮细胞血管生成以加速骨折愈合的机制 | 揭示了Lamb1在骨折愈合过程中通过激活Wnt信号通路上调VEGFA表达，进而促进内皮细胞生长、迁移和血管生成的新机制 | 研究主要基于体外实验和公共数据集分析，缺乏体内动物模型的验证 | 探究内皮细胞在骨折愈合中的作用及其分子机制 | 内皮细胞（ECs）和骨折愈合过程 | 分子生物学与细胞生物学 | 骨折 | scRNA-seq, qRT-PCR, 细胞免疫荧光染色, transwell实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 体外实验数据 | 公共数据集中的单细胞数据，具体样本数量未明确说明 |
| 494 | 2025-05-12 |
RNA methylation: A new perspective in osteoarthritis research
2025-Aug-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149518
PMID:40254081
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综述 | 本文系统总结了RNA修饰在骨关节炎(OA)中的主要类型及其调控作用，并探讨了未来研究方向 | 聚焦RNA甲基化在OA中的动态调控功能，提出利用单细胞测序解析RNA修饰动态变化的新方向 | 未涉及具体实验验证数据，主要基于现有文献进行理论分析 | 探索RNA修饰在骨关节炎发病机制中的作用及其诊疗潜力 | 软骨细胞自噬、炎症反应及关键信号通路 | 表观遗传学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA |
| 495 | 2025-05-12 |
Immunogenic cuproptosis in cancer immunotherapy via an in situ cuproptosis-inducing system
2025-Aug, Biomaterials
IF:12.8Q1
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research paper | 该研究探讨了铜死亡在结直肠癌免疫治疗中的免疫原性及其与免疫治疗的联合应用 | 首次评估了铜死亡在结直肠癌中的免疫原性，并开发了一种原位铜死亡诱导系统以增强免疫治疗效果 | 研究主要集中于结直肠癌，其他癌症类型的适用性尚待验证 | 探索铜死亡在癌症免疫治疗中的潜在应用 | 结直肠癌(CRC)细胞及肿瘤微环境(TME) | 癌症免疫治疗 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 体外和体内实验 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | 内部队列和其他独立队列的样本 |
| 496 | 2025-05-12 |
Identification of KANK1 as a tumor suppressor gene in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-06-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151885
PMID:40288262
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研究论文 | 本研究通过整合mRNA-蛋白质丰度相关性分析，鉴定出KANK1作为胰腺导管腺癌（PDAC）中的新型肿瘤抑制基因 | 首次将KANK1鉴定为PDAC中的肿瘤抑制基因，并揭示其通过拷贝数缺失和肿瘤缺氧下调的机制 | 未涉及KANK1在PDAC中的具体分子机制及其作为治疗靶点的临床验证 | 鉴定PDAC中的关键肿瘤抑制基因并探索其功能机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | mRNA-蛋白质丰度相关性分析、单细胞RNA测序、免疫印迹分析 | NA | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个数据集（包括TCGA和CCLE数据库）的样本 |
| 497 | 2025-05-12 |
The integration of scRNA-seq with microarray and in-vivo experiments facilitates a comprehensive elucidation of the molecular mechanisms underlying endothelial cell involvement in myocardial infarction
2025-06-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151820
PMID:40288264
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研究论文 | 本研究通过整合scRNA-seq、微阵列数据和体内实验，揭示了内皮细胞在心肌梗死中的关键基因及其分子机制 | 结合scRNA-seq、微阵列数据和体内实验，首次鉴定并验证了DBP、NR1D1和TEF在心肌梗死发展中的关键作用 | 研究依赖于公开数据库数据，样本量可能有限，且体内实验仅在特定模型中进行验证 | 阐明内皮细胞在心肌梗死发展中的分子机制 | 内皮细胞及其在心肌梗死中的功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 微阵列, WB, qPCR, 免疫荧光 | hdWGCNA, scCODE, FindMarkers, PPI分析 | 基因表达数据, 图像数据 | 16个不同的细胞簇，涵盖7种独特的细胞类型，内皮细胞分为8个亚群 |
| 498 | 2025-05-12 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the ovarian immune microenvironment regulated by 17β-estradiol in neonatal mice
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究17β-雌二醇对新生小鼠卵巢免疫微环境的调控作用 | 首次全面描述了新生小鼠卵巢免疫微环境在17β-雌二醇调控下的动态变化，揭示了雌激素对巨噬细胞表型转换的影响 | 研究仅针对新生小鼠模型，结果可能无法完全反映成年个体的情况 | 探究雌激素在卵巢免疫微环境中的调控机制 | C57BL/6J新生小鼠的卵巢组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生小鼠卵巢组织样本 |
| 499 | 2025-05-12 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-May-10, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24531
PMID:40346999
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撤稿声明 | 该文章因同行评审过程存在问题而被撤稿 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2025-05-12 |
Spatial transcriptomic applications in orthopedics
2025-May-10, Connective tissue research
IF:2.8Q1
DOI:10.1080/03008207.2025.2501703
PMID:40347072
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综述 | 本文综述了空间转录组学在骨科研究中的应用，特别是在解析肌肉骨骼组织中复杂基因表达模式方面的变革性影响 | 强调了空间转录组学在识别新的细胞群体和细胞信号通路方面的创新应用 | 未提及具体的技术限制或研究中的不足 | 探讨空间转录组学在骨科研究中的应用及其潜力 | 肌肉骨骼组织（软骨、关节、骨、肌腱、韧带和滑膜） | 数字病理学 | 骨科疾病 | 10X Visium, 10X Xenium, seqFISH+, MERFISH, NanoString GeoMx DSP | NA | 空间转录组数据 | 29篇已发表的手稿，涉及软骨、骨、肌腱、滑膜和椎间盘 |