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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4881 | 2025-10-06 |
Development of a cell-free strategy to recover aged skeletal muscle after disuse
2023-11, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP282867
PMID:35318675
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研究论文 | 开发了一种基于过氧化氢预处理周细胞来源的小细胞外囊泡的无细胞策略,用于恢复老年小鼠废用性骨骼肌萎缩 | 首次发现周细胞在废用和恢复期间丧失抗氧化能力,并利用健康供体周细胞经H2O2刺激产生具有修复功能的小细胞外囊泡 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;sEVs中具体起作用的蛋白质机制需进一步确认 | 开发针对老年废用性骨骼肌萎缩的新型治疗策略 | 小鼠骨骼肌周细胞和骨骼肌纤维 | 肌肉生物学 | 肌肉萎缩 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,功能实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 年轻成年和老年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4882 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals gene expression signatures of breast cancer-associated endothelial cells
2018-Feb-16, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.23760
PMID:29541388
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示乳腺癌相关内皮细胞的基因表达特征 | 首次通过单细胞RNA测序系统比较乳腺癌内皮细胞与正常内皮细胞的基因表达差异,发现细胞外基质相关基因在肿瘤内皮细胞中的关键作用 | 研究样本来源有限,仅针对乳腺癌组织,需要更多癌症类型的验证 | 探究乳腺癌中肿瘤内皮细胞的基因表达特征及其生物学功能 | 从人类乳腺癌组织和减乳成形术组织中分离的内皮细胞 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, 层次聚类分析, GSEA | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4883 | 2025-10-06 |
TSC2/mTORC1 integrates deoxynivalenol signals recognized by membrane receptors IR and EGFR to restrict intestinal stem cell function
2025-Aug-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138769
PMID:40466374
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研究论文 | 本研究揭示脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)通过膜受体IR和EGFR调控TSC2/mTORC1通路从而限制肠道干细胞功能的分子机制 | 首次发现DON与膜受体IR/EGFR胞外域的直接相互作用,并阐明其通过TSC2/mTORC1通路调控肠道干细胞功能的完整信号传导机制 | 研究主要基于猪肠道类器官和IPEC-J2细胞系,在人体内的直接适用性需要进一步验证 | 探究DON毒素如何通过膜受体信号通路影响肠道干细胞功能 | 猪肠道干细胞、猪肠道类器官、IPEC-J2细胞系 | 分子生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 等温滴定量热法, 类器官培养 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4884 | 2025-10-06 |
Cancer stem cells-derived exosomal TSPAN8 enhances non-stem cancer cells stemness and promotes malignant progression in PDAC
2025-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03412-1
PMID:40251391
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中癌症干细胞通过富含TSPAN8的外泌体增强非干细胞癌细胞的干性并促进恶性进展的机制 | 首次发现癌症干细胞分泌的富含TSPAN8的外泌体可通过激活Sonic Hedgehog信号通路增强非干细胞癌细胞的干性 | 具体靶向治疗策略仍需进一步研究 | 探索胰腺导管腺癌中癌症干细胞与非干细胞癌细胞间的通讯机制及其在恶性进展中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,外泌体分析 | NA | 基因表达数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4885 | 2025-10-06 |
Neuroprotective liver portal area macrophages attenuate hepatic inflammation
2025-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02190-y
PMID:40537510
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研究论文 | 本研究通过整合全肝叶成像和单细胞RNA测序技术,发现了一种具有神经保护功能的肝脏门静脉区巨噬细胞亚群 | 首次识别出CX3CR1+CD63+肝脏门静脉区巨噬细胞(LPAMs)这一新亚群,揭示了其与交感神经的相互作用及其在肝脏免疫稳态中的保护功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类肝脏中得到验证 | 探究肝脏巨噬细胞亚群的空间分布和功能特性 | 小鼠肝脏中的CX3CR1+细胞 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序,全肝叶成像 | NA | 单细胞转录组数据,空间成像数据 | 小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4886 | 2025-10-06 |
Infiltrative classical monocyte-derived and SPP1 lipid-associated macrophages mediate inflammation and fibrosis in ANCA-associated glomerulonephritis
2025-Jun-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfae292
PMID:39694817
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示ANCA相关性肾小球肾炎中经典单核细胞来源巨噬细胞和SPP1脂质相关巨噬细胞介导炎症和纤维化的机制 | 首次在ANCA相关性肾小球肾炎中鉴定出四种主要巨噬细胞亚群,特别是发现经典单核细胞来源巨噬细胞和SPP1脂质相关巨噬细胞分别介导炎症和纤维化过程 | 样本量较小(仅5名活动期AGN患者),缺乏纵向随访数据 | 探究ANCA相关性肾小球肾炎中肾脏巨噬细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | ANCA相关性肾小球肾炎患者、狼疮性肾炎患者和肾切除对照者的肾脏CD45+免疫细胞 | 单细胞转录组学 | ANCA相关性肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组织化学数据, 流式细胞数据 | 25,485个新鲜获取的未冻存高质量肾脏CD45+免疫细胞,来自5名活动期AGN患者、1名狼疮性肾炎患者和1名肾切除对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4887 | 2025-10-06 |
Identification of key genes and development of an identifying machine learning model for sepsis
2025-Jun-30, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02068-7
PMID:40583108
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研究论文 | 通过整合多器官单细胞RNA测序和机器学习方法识别脓毒症关键基因并构建诊断模型 | 首次结合心脏和肺组织的单细胞RNA测序数据识别脓毒症关键基因,并采用支持向量机递归特征消除方法构建诊断模型 | 需要进一步研究验证发现结果,仅基于公共数据集分析 | 识别脓毒症关键基因并开发诊断模型 | 小鼠心脏和肺组织样本,人类基因同源物 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | SVM-RFE | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE207363, GSE207651, GSE185263, GSE69063, GSE134347) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4888 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals Sox6 positive interneurons enriched in the prefrontal cortex of female mice vulnerable to chronic social stress
2025-Jun-28, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03088-9
PMID:40581656
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示雌性小鼠前额叶皮层中富含Sox6阳性中间神经元与慢性社交应激易感性相关 | 首次在雌性小鼠中发现Sox6中间神经元在慢性社交应激易感性中的富集现象及其与炎症反应和突触功能的关联 | 研究仅限于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究抑郁症在女性中高发的细胞和分子机制 | 雌性小鼠前额叶皮层的各类细胞 | 神经科学 | 抑郁症 | 单核RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 雌性小鼠前额叶皮层细胞 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
4889 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing has revealed the palmitoylation landscape in lung adenocarcinoma and identified ABHD17C as a novel biomarker
2025-Jun-27, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.024
PMID:40582697
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了肺腺癌中的蛋白质棕榈酰化修饰景观,并鉴定出ABHD17C作为新型生物标志物 | 首次在单细胞水平系统描绘肺腺癌棕榈酰化修饰图谱,发现C4上皮亚型与肿瘤转移相关,鉴定ABHD17C为关键调控因子 | NA | 探索肺腺癌中蛋白质棕榈酰化修饰的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 肺腺癌上皮细胞 | 单细胞生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,拷贝数变异分析,伪时间分析,富集分析,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4890 | 2025-10-06 |
Uncovering minimal pathways in melanoma initiation
2025-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60742-0
PMID:40571713
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了黑色素瘤起始的最小通路,发现仅携带Braf突变的裸鼠也能产生缓慢生长的肿瘤 | 发现仅Braf单突变即可诱导黑色素瘤形成,并鉴定出神经嵴样细胞作为恶性前体细胞 | 无法找到解释大多数肿瘤发生的从头突变或结构变异 | 探索黑色素瘤起始的最小遗传通路 | 小鼠黑色素瘤模型 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4891 | 2025-10-06 |
Distinct expression of CD56 and CD19 marks molecular and functional endotypes of tetanus- versus RBD-specific human bone marrow plasma cells
2025-Jun-24, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf059
PMID:40581803
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研究论文 | 本研究通过分析CD56和CD19在人类骨髓浆细胞中的共表达模式,揭示了破伤风类毒素与SARS-CoV-2 RBD特异性浆细胞之间的分子和功能差异 | 首次发现CD56+CD19-骨髓浆细胞亚群在抗原特异性浆细胞中的差异分布,并揭示其与细胞组织滞留和长期存活的相关性 | 研究主要基于表型分析和已有单细胞RNA测序数据,缺乏功能性实验验证 | 探究不同抗原特异性骨髓浆细胞亚群的表型和转录特征差异 | 人类骨髓浆细胞,特别是破伤风类毒素和SARS-CoV-2 RBD特异性浆细胞 | 免疫学 | 传染病 | 多参数流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4892 | 2025-10-06 |
Direct single cell-type gene expression analysis in peripheral blood: novel ratio-based gene expression biomarkers using 2 novel monocyte reference genes (PSAP and CTSS) for detection of bacterial infection
2025-Jun-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf103
PMID:40581066
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研究论文 | 开发了一种无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法DIRECT LS-TA,用于检测细菌感染 | 提出了基于比例的生物标志物方法,使用PSAP和CTSS作为新型单核细胞参考基因,可直接从外周血量化单核细胞特异性基因表达 | NA | 开发无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法用于细菌感染检测 | 外周血单核细胞基因表达 | 基因表达分析 | 细菌感染 | 单细胞类型基因表达分析,比例生物标志物方法 | 数学细胞混合基因表达模型 | 基因表达数据 | 多个数据集验证 | NA | 基因表达分析 | NA | NA |
4893 | 2025-10-06 |
Plasmablast-like lymphoma cells as a distinct subpopulation confers multidrug resistance in PCNSL
2025-Jun-21, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf154
PMID:40580931
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术识别了原发性中枢神经系统淋巴瘤中的浆母细胞样淋巴瘤细胞亚群,并揭示了其在多药耐药中的关键作用 | 首次在PCNSL中识别出浆母细胞样淋巴瘤细胞这一独特亚群,并阐明其通过特定分子特征导致多药耐药的机制 | 样本量相对有限(56例患者),且为观察性研究 | 探索PCNSL的分子特征和耐药机制 | 56例新诊断的原发性中枢神经系统淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学,B细胞受体测序,多重免疫组织化学,离体药物反应试验 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学图像,药物反应数据 | 56例PCNSL患者肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq,B细胞受体测序 | NA | NA |
4894 | 2025-10-06 |
HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity
2025-Jun-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.06.14.25328971
PMID:40585110
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研究论文 | 本研究通过跨种族分析发现HLA-DQB1*03:01独立影响1型发作性睡病的发病年龄 | 首次进行跨种族发病年龄研究,发现DQB1*03:01对发病年龄的强烈影响独立于DQA1等位基因和种族背景 | 尚未确定导致疾病的T细胞 | 研究HLA-DQB1*03:01对1型发作性睡病发病年龄的影响 | 5,339例1型发作性睡病患者(来自中国、欧洲、韩国、日本和美国) | 遗传学 | 发作性睡病 | GWAS, HLA基因型推算, TCR分析, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因分型数据, RNA-seq数据 | 5,339例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4895 | 2025-10-06 |
Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304
PMID:40358364
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研究论文 | 本研究探讨奥拉帕尼联合或不联合地加瑞克在新诊断前列腺癌中的疗效及生物学机制 | 首次在无同源重组修复基因突变的前列腺癌患者中研究PARP抑制剂联合雄激素阻断的疗效机制 | 样本量有限,为单中心研究 | 研究PARP抑制剂和雄激素阻断联合治疗对原发性前列腺癌的生物学效应 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,基因测序 | NA | 组织样本,基因表达数据 | 未明确样本数量的前列腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4896 | 2025-10-06 |
Azacitidine, Venetoclax, and Magrolimab in Newly Diagnosed and Relapsed Refractory Acute Myeloid Leukemia: Phase Ib/II Study and Correlative Analysis
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0229
PMID:40198272
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研究论文 | 评估阿扎胞苷、维奈托克和马格罗利单抗三联疗法在初治和复发难治性急性髓系白血病患者中的安全性和疗效 | 首次在临床研究中评估CD47抗体马格罗利单抗与阿扎胞苷-维奈托克联合使用的协同治疗效果 | 样本量有限,未获得理想的生存结局数据 | 评估三联疗法在急性髓系白血病患者中的安全性和疗效 | 初治(不适合强化疗)和复发难治性急性髓系白血病成年患者 | 临床医学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析 | NA | 临床数据,基因表达数据 | 106名患者(初治队列54人,复发难治队列52人),其中27个纵向样本来自11名TP53突变患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4897 | 2025-10-06 |
Dissection of the immune landscape in psoriatic arthritis defines immunoproteasome up-regulation in treatment resistance
2025-06-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adu0284
PMID:40478933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者滑膜液免疫图谱,发现免疫蛋白酶体上调与治疗耐药性相关 | 首次在银屑病关节炎耐药患者中发现免疫蛋白酶体和MHC I类基因表达上调,并通过功能实验验证其治疗潜力 | 样本量相对有限(41例PsA患者和9例OA对照),需要更大规模研究验证 | 探索银屑病关节炎治疗耐药性的免疫学机制 | 银屑病关节炎患者和骨关节炎对照患者的滑膜液免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例银屑病关节炎患者和9例骨关节炎对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4898 | 2025-10-06 |
Potential Key Genes for Giant Cell Arteritis Revealed Based on Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Analysis
2025-May-09, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000546323
PMID:40349694
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,识别出与巨细胞动脉炎发病风险相关的三个关键基因 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法探索CD4+ T细胞中标志性基因对GCA的因果效应 | 研究结果需要进一步实验验证,样本来源和规模可能存在限制 | 识别与巨细胞动脉炎相关的关键基因并探索潜在致病机制 | 巨细胞动脉炎患者和CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析 | 两样本孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4899 | 2025-10-06 |
Fusion of spatiotemporal and network models to prioritize multiscale effects in single-cell perturbations
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf277
PMID:40545244
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研究论文 | 提出Perturb-STNet框架,通过融合时空和网络模型来识别单细胞扰动中的多尺度效应 | 开发了首个基于网络的时空模型框架,能够对单细胞扰动数据中的空间和时间差异表达调控因子进行排序 | 方法在复杂多细胞/多组织系统中的验证仍需进一步扩展 | 识别驱动发育和疾病过程的时空差异表达调控因子 | 单细胞扰动数据中的调控因子、细胞和邻域相互作用 | 计算生物学 | 肺癌、黑色素瘤、结肠炎 | 单细胞成像、空间转录组学 | 网络时空模型 | 单细胞时空数据 | 合成数据、肺癌数据、小鼠黑色素瘤模型、结肠炎数据 | NA | CODEX单细胞成像、MERFISH空间转录组学 | NA | CODEX单细胞成像时间序列数据、MERFISH空间转录组学时间序列数据 |
4900 | 2025-07-02 |
Correction to: ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf337
PMID:40580031
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |