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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4421 | 2025-10-06 |
CAF-derived GLUT1 and its role in modulating ovarian cancer progression: a multi-dimensional analysis of the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08380-6
PMID:40629043
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研究论文 | 本研究通过多维度分析揭示了卵巢癌微环境中癌症相关成纤维细胞高表达GLUT1并通过代谢重编程促进肿瘤进展的机制 | 首次发现GLUT1在CAFs中的关键代谢调控作用,并通过单细胞测序和3D生物打印模型验证其在肿瘤微环境重塑中的功能 | 未明确GLUT1在CAFs中高表达的具体上游调控机制 | 解析卵巢癌微环境中癌症相关成纤维细胞的葡萄糖代谢重编程及其在肿瘤进展中的作用 | 卵巢癌微环境中的癌症相关成纤维细胞和卵巢癌细胞 | 肿瘤代谢 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 3D生物打印 | 3D生物打印模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4422 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis links DCUN1D5 to immune remodeling and cisplatin resistance in recurrent osteosarcoma
2025-Jul-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08409-w
PMID:40629059
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示DCUN1D5在复发性骨肉瘤免疫重塑和顺铂耐药中的作用机制 | 首次通过整合多个单细胞RNA测序数据集,发现DCUN1D5基因通过促进破骨前体细胞成熟驱动骨肉瘤复发和顺铂耐药 | NA | 探究骨肉瘤复发和顺铂耐药的分子机制,特别关注肿瘤微环境的作用 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 单细胞分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4423 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals the cellular heterogeneity of vestibular schwannoma
2025-Jul-08, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01028-y
PMID:40629113
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术揭示了前庭神经鞘瘤的细胞异质性 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,识别出VEGFA富集的雪旺细胞亚型并验证其空间定位 | 样本量较小(3例单细胞测序样本和2例空间转录组样本),研究结果需要更大样本验证 | 探索前庭神经鞘瘤的发育机制和空间异质性 | 前庭神经鞘瘤组织样本 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 5例前庭神经鞘瘤样本(3例用于scRNA-seq,2例用于空间转录组学) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4424 | 2025-10-06 |
Mechanistic study of CTHRC1 in promoting Wilms' tumor progression by regulating M2-type tumor-associated macrophages polarization
2025-Jul-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06752-4
PMID:40629408
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研究论文 | 本研究揭示CTHRC1通过TNFSF9-TNFRSF9轴调控M2型肿瘤相关巨噬细胞极化促进肾母细胞瘤进展的分子机制 | 首次发现CTHRC1通过TNFSF9-TNFRSF9轴调控M2-TAMs极化,并阐明M2-TAMs通过PI3K/Akt通路促进肾母细胞瘤恶性进展的双向作用机制 | NA | 探究CTHRC1在肾母细胞瘤进展中的作用及其通过调控M2-TAMs极化的分子机制 | 肾母细胞瘤组织、肿瘤细胞、M2型肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组化、免疫荧光、转录组测序、中和抗体拯救实验、共定位分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质表达数据、免疫细胞浸润数据 | NA | NA | 单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
4425 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers and exploration of mechanisms for atopic dermatitis based on transcriptome and scRNA-seq data analysis
2025-Jul-04, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042291
PMID:40629565
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研究论文 | 通过转录组和单细胞RNA测序数据分析鉴定特应性皮炎的生物标志物并探索其致病机制 | 结合转录组和单细胞RNA测序数据,首次系统鉴定特应性皮炎的关键基因并确定角质形成细胞为关键细胞类型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 鉴定特应性皮炎的生物标志物并探索其致病机制 | 特应性皮炎患者样本 | 生物信息学 | 特应性皮炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | PPI网络分析, MCC算法, 度算法, ROC分析 | 基因表达数据 | 数据集GSE16161和GSE32924(转录组), GSE180885(单细胞RNA测序) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
4426 | 2025-10-06 |
Large-Scale Production of Expandable Hepatoblast Organoids and Polarised Hepatocyte Organoids From hESCs Under 3D Static and Dynamic Suspension Conditions
2025-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70001
PMID:39921573
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研究论文 | 开发了一种在3D悬浮条件下从人胚胎干细胞大规模生产可扩展肝祖细胞类器官和极化肝细胞类器官的新方法 | 利用低浓度基质胶支持的3D悬浮培养系统,首次实现了人胚胎干细胞来源的可扩展肝祖细胞类器官和成熟极化肝细胞类器官的大规模生产 | NA | 建立大规模生产功能性肝细胞的技术平台 | 人胚胎干细胞(hESCs)、肝祖细胞类器官(HB-orgs)、极化肝细胞类器官(P-hep-orgs) | 干细胞生物学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 功能分析 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4427 | 2025-10-06 |
Klotho Regulates Club Cell Senescence and Differentiation in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70000
PMID:39930762
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研究论文 | 本研究探讨Klotho蛋白在慢性阻塞性肺疾病中调控Clara细胞衰老和分化的机制 | 首次揭示Klotho通过hnRNPA2/B1调控Clara细胞衰老,并发现neddylation是导致hnRNPA2/B1下调的关键因素 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人体中的直接验证尚不充分 | 阐明Klotho蛋白在COPD发病机制中对Clara细胞衰老和分化的调控作用 | COPD患者肺组织、香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型、Clara细胞 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, SA-β-gal染色, 基因敲除, 基因过表达 | NA | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | COPD患者肺组织和香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4428 | 2025-10-06 |
IGF2BP2 binding to CPSF6 facilitates m6A-mediated alternative polyadenylation of PUM2 and promotes malignant progression in ovarian cancer
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70388
PMID:40629911
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研究论文 | 本研究揭示了m6A通过IGF2BP2与CPSF6相互作用调控PUM2基因选择性多聚腺苷化的新机制,促进卵巢癌恶性进展 | 首次发现m6A通过IGF2BP2与CPSF6的相互作用调控选择性多聚腺苷化,介导PUM2基因3'UTR缩短并促进卵巢癌进展 | 研究主要聚焦于卵巢癌,机制在其他癌症中的普适性需要进一步验证 | 探索m6A与选择性多聚腺苷化在卵巢癌中的调控机制及其在肿瘤恶性进展中的作用 | 卵巢癌细胞系和临床样本 | 分子生物学 | 卵巢癌 | RNA甲基化测序,单细胞测序,RNA pull-down,免疫沉淀,质谱分析,Western blot,蛋白纯化,GST pull-down,PAS-seq,eCLIP-seq,RIP-seq,meRIP-seq,RT-qPCR,3'RACE,RNA稳定性检测,双荧光素酶报告基因检测 | NA | RNA测序数据,蛋白质相互作用数据,基因表达数据 | 卵巢癌细胞系和公共数据库中的临床样本 | NA | 单细胞测序,RNA测序,CLIP-seq,RIP-seq,meRIP-seq | NA | NA |
4429 | 2025-10-06 |
Underlining the Molecular Mechanism of Nonalcoholic Fatty Liver Disease and Coronary Artery Disease in Lipid Metabolism by Combining Multiple Sets of Data Sets
2025-Jul, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70040
PMID:40631874
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研究论文 | 通过整合多组数据集揭示非酒精性脂肪肝病与冠状动脉疾病在脂质代谢中的共同分子机制 | 首次通过整合多组数据集识别出GPD1、MVK和PIK3R2三个关键基因在NAFLD和CAD脂质代谢中的共同作用 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 阐明非酒精性脂肪肝病与冠状动脉疾病在脂质代谢中的共享遗传特征和分子机制 | 非酒精性脂肪肝病和冠状动脉疾病患者相关基因数据 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病,冠状动脉疾病 | 单细胞测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4430 | 2025-10-06 |
Investigating the dynamic signaling pathways involved in the specialization and differentiation of epiblast cells in early human embryos
2025-Jun-26, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.05.014
PMID:40581241
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研究论文 | 通过分析人类胚胎单细胞RNA测序数据,研究胚外组织信号对上皮细胞发育的调控机制 | 首次系统揭示BMP、WNT、FGF等多条信号通路在人类胚胎上皮细胞特化和分化过程中的动态调控网络 | 研究结果基于RNA表达模式推断,需要蛋白质水平和功能实验进一步验证 | 探究人类胚胎早期发育过程中胚外组织与上皮细胞间的信号通讯机制 | 人类早期胚胎(植入前、植入后、原肠胚形成前和早期原肠胚形成阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涵盖人类胚胎多个发育阶段的单细胞数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4431 | 2025-10-06 |
Single-cell RNAseq of Angiotensin II-induced abdominal aortic tissue identifies aneurysm-associated cell clusters in C57BL/6J mice
2025-05-28, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20241235
PMID:40440080
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析血管紧张素II诱导的小鼠腹主动脉瘤组织,识别与动脉瘤相关的关键细胞群 | 首次在腹主动脉瘤中发现由内皮细胞转化的特殊细胞群(恶性ECs),并揭示Cxcl12-Cxcr4/Ackr3炎症轴在动脉瘤形成中的作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,样本量有限(不同年龄组样本数为21和7) | 探究腹主动脉瘤形成过程中起关键作用的特定细胞群 | C57BL/6J小鼠的腹主动脉组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 28只C57BL/6J小鼠(14周龄21只,32周龄7只) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4432 | 2025-10-06 |
Study on the mechanism of action of the active ingredient of Calculus Bovis in the treatment of sepsis by integrating single-cell sequencing and machine learning
2025-Apr-18, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042184
PMID:40258762
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研究论文 | 本研究整合单细胞测序和机器学习方法探究牛黄活性成分治疗脓毒症的作用机制 | 首次结合网络药理学、RNA测序、单细胞测序和多种机器学习模型系统研究牛黄治疗脓毒症的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探究牛黄活性成分治疗脓毒症的分子作用机制 | 脓毒症相关基因和牛黄活性成分靶点 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | XGBoost,SVM,Decision Tree,KNN | 基因表达数据 | 来自中国国家基因库数据库和GSE65682数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
4433 | 2025-10-06 |
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00905-6
PMID:39910249
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研究论文 | 本研究揭示FLASH放疗通过重编程巨噬细胞脂质代谢逆转肿瘤免疫抑制,并增强CAR-T细胞疗法对髓母细胞瘤的疗效 | 首次发现FLASH放疗通过调节脂质代谢影响巨噬细胞免疫表型,并证明其与CAR-T细胞疗法的协同作用 | 研究基于基因工程小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索FLASH放疗对肿瘤免疫的影响及其与CAR-T细胞疗法的联合治疗效果 | 髓母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4434 | 2025-10-06 |
Targeting mitophagy in diabetic retinopathy: novel insights into SQSTM1/BNIP3L pathway regulated by luteolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1593213
PMID:40635752
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研究论文 | 本研究探讨了木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬对糖尿病视网膜病变的保护作用 | 首次揭示木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬的新机制,并发现单核细胞活性与VISFATIN信号通路在DR进展中的新联系 | 木犀草素的确切分子机制仍未完全阐明 | 探索木犀草素治疗糖尿病视网膜病变的局部和全身免疫机制 | 糖尿病视网膜病变患者的PBMC和视网膜组织 | 生物医学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序,分子对接模拟,DCFDA测定,H&E染色,PAS染色,ELISA,免疫荧光,免疫组化,Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据,分子对接数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4435 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA dequencing to identify and validate prognostic genes related to T Cell senescence in acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1606284
PMID:40635996
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别并验证与急性髓系白血病中T细胞衰老相关的预后基因 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,系统分析T细胞衰老相关基因在AML预后中的作用 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索T细胞衰老相关基因在急性髓系白血病进展中的作用并构建预后模型 | 急性髓系白血病患者和T细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR | 风险模型, UMAP, 回归分析 | 基因表达数据, 生存数据 | TCGA-LAML队列和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
4436 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome and multi-omics integration reveal ferroptosis-driven immune microenvironment remodeling in knee osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1608378
PMID:40636124
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研究论文 | 通过单细胞转录组和多组学整合分析,揭示铁死亡驱动的免疫微环境重塑在膝骨关节炎中的作用 | 首次在单细胞分辨率下探索铁死亡与免疫功能障碍的相互作用,并鉴定出铁死亡活跃的稳态软骨细胞作为FGF介导滑膜炎和ECM重塑的关键枢纽 | 样本量相对有限(单细胞数据n=11,批量RNA-seq队列样本数较少),需要更大规模验证 | 解析膝骨关节炎中铁死亡驱动的免疫重塑机制并鉴定诊断生物标志物 | 膝骨关节炎患者的软骨细胞和免疫微环境 | 生物信息学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | LASSO-SVM诊断模型 | 基因表达数据 | 单细胞数据11个样本,批量RNA-seq队列:GSE114007(20例KOA/18例对照),GSE246425(8例KOA/4例对照) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
4437 | 2025-10-06 |
Investigating the role of tumor cell heterogeneity and angiogenesis genes in the prognosis of multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610833
PMID:40636123
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,探讨肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因在多发性骨髓瘤预后中的作用 | 首次发现C1亚群中CREB3L2高表达与血管生成抑制及肿瘤细胞增殖迁移的关联,并构建了基于血管生成和转录因子的预后模型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性验证 | 探索肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因对多发性骨髓瘤预后的影响 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, CNV分析, 转录因子分析, 细胞通讯分析, 免疫浸润分析 | 预后预测模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4438 | 2025-10-06 |
A bibliometric analysis of studies related to the nuclear factor kappa B signaling pathway in knee osteoarthritis between 2004 and 2023
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1572161
PMID:40636390
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文献计量分析 | 对2004-2023年间核因子κB信号通路在膝骨关节炎研究中发表文献进行文献计量分析 | 首次系统分析NF-κB信号通路在膝骨关节炎领域的研究趋势和热点演变 | 缺乏实时可视化NF-κB活性的体内成像技术 | 识别NF-κB信号通路在膝骨关节炎研究中的主要领域和趋势 | 752篇相关研究文献 | 文献计量学 | 膝骨关节炎 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 752篇研究文献 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | NA |
4439 | 2025-10-06 |
Delineation of single-cell Altas provides new insights for development of coronary artery lesions in Kawasaki disease: bad and good signaling molecules
2025, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2025.1596643
PMID:40636515
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱,揭示疾病发展的分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱,发现SPI1和MT2A的表达异常与B细胞发育紊乱相关 | 样本量较小(仅12个样本),缺乏独立验证队列 | 探索川崎病冠状动脉病变发展的分子机制 | 川崎病患者的周围血单核细胞 | 单细胞组学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析,细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 12个样本(3组KD非CAL患者治疗前后,3组KD CAL患者治疗前后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4440 | 2025-10-06 |
Identification of Shared Biomarkers in Chronic Kidney Disease and Diabetic Nephropathy Using Single-Cell Sequencing
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S514319
PMID:40636753
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研究论文 | 通过单细胞测序技术识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物 | 首次在单细胞水平系统比较CKD和DN的共享生物标志物,发现MX1、IRF7、STAT1和ISG15在两种疾病中的共同表达特征 | 样本量较小(仅9例),仅使用血液样本而未包含肾脏组织样本 | 识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物,探索其诊断和治疗潜力 | 人类血液样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析,蛋白质相互作用网络分析 | 单细胞转录组数据 | 9例人类血液样本(3例对照,3例CKD,3例DN) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |