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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4161 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA and bulk RNA sequencing revealed malignant ductal cell heterogeneity and prognosis signatures in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1579184
PMID:40666516
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序揭示胰腺癌中恶性导管细胞的异质性及其预后标志物 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序识别出ANLN、NT5E和CTSV作为胰腺癌新型预后生物标志物,并揭示恶性导管细胞与巨噬细胞之间的促肿瘤相互作用机制 | 样本量相对有限(74个单细胞RNA测序样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索胰腺癌中恶性导管细胞的异质性并鉴定预后相关基因标志物 | 胰腺癌患者样本中的恶性导管细胞和肿瘤微环境细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,染色体拷贝数变异分析,非负矩阵分解,机器学习特征选择 | 非负矩阵分解,机器学习特征选择算法 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | 74个单细胞RNA测序样本,TCGA数据集和两个独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
4162 | 2025-10-06 |
Identification and validation of genes related to stem cells and telomere maintenance mechanisms as biomarkers for breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618193
PMID:40666524
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研究论文 | 通过整合转录组和单细胞RNA测序分析,鉴定并验证与干细胞和端粒维持机制相关的乳腺癌生物标志物 | 首次整合转录组和单细胞RNA测序分析干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因在乳腺癌中的作用,并识别关键细胞亚群 | 样本量较小(8对样本),需要更大规模研究验证 | 探索干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因作为乳腺癌生物标志物的潜力 | 乳腺癌肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR, LASSO算法, PPI网络分析 | LASSO | RNA测序数据, 单细胞数据 | 8对乳腺癌肿瘤和癌旁组织(共16个样本) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
4163 | 2025-10-06 |
Thymic hyperplasia in myasthenia gravis: a narrative review
2025, Mediastinum (Hong Kong, China)
DOI:10.21037/med-25-12
PMID:40666538
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综述 | 本文综述了早发型重症肌无力中胸腺滤泡增生的病理特征、免疫机制及研究进展 | 整合了单细胞和空间转录组学等新兴技术对胸腺增生机制的研究前景 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨早发型重症肌无力中胸腺增生的病理机制和未来研究方向 | 乙酰胆碱受体抗体阳性重症肌无力患者的胸腺病理 | 病理学 | 重症肌无力 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 胸腺类器官模型 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
4164 | 2025-10-06 |
Resolving the design principles that control postnatal vascular growth and scaling
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627758
PMID:39713449
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研究论文 | 本研究揭示了出生后主动脉生长的设计原则,发现其扩张与脊柱长度而非体重相关,并通过两波细胞增殖和内皮细胞挤出实现稳态生长 | 首次发现主动脉生长与脊柱长度直接相关,识别了两波具有独特细胞周期动力学的增殖波,并证明内皮细胞挤出对稳态生长至关重要 | 研究主要聚焦于主动脉,未涉及其他血管类型;遗传模型仅限于软骨发育不全 | 解析控制出生后血管生长和比例缩放的设计原则 | 小鼠主动脉和血管细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 数学建模, 多尺度计算方法 | 数学模型 | 基因表达数据, 细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4165 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals vascularization-associated cell subpopulations in dental pulp: PDGFRβ+ DPSCs with activated PI3K/AKT pathway
2024-10-09, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae051
PMID:39167061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出牙髓中与血管化相关的PDGFRβ+ DPSCs细胞亚群,并揭示其通过PI3K/AKT通路发挥促血管生成功能 | 首次在牙髓发育过程中鉴定出具有显著促血管生成能力的PDGFRβ+ DPSCs新亚群,并阐明其通过PDGFR/PI3K/AKT信号通路发挥作用 | NA | 解决牙髓再生治疗中的挑战,特别是针对不同年龄和条件供体来源的干细胞移植问题 | 牙髓干细胞(DPSCs)、人脐静脉内皮细胞(HUVEC)、基因编辑小鼠模型 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学、假时序分析、转录组测序、基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4166 | 2025-10-06 |
Unveiling impaired vascular function and cellular heterogeneity in diabetic donor-derived vascular organoids
2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae043
PMID:39049437
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研究论文 | 本研究通过糖尿病供体来源的血管类器官揭示了糖尿病血管功能障碍和细胞异质性 | 首次在糖尿病供体来源的血管类器官中发现特异性内皮细胞亚群,揭示其ROS通路过度表达和血管生成特征表达不足 | 类器官可能需要额外的器官特异性分化因子来促进器官特异性身份的形成 | 研究糖尿病血管病变的体外模型和药物筛选平台 | 糖尿病和非糖尿病供体来源的诱导多能干细胞生成的血管类器官 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病和非糖尿病供体来源的血管类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4167 | 2025-10-06 |
Dual-specificity phosphatases 13 and 27 as key switches in muscle stem cell transition from proliferation to differentiation
2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae045
PMID:38975693
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研究论文 | 本研究揭示了双特异性磷酸酶DUSP13和DUSP27在肌肉干细胞从增殖向分化转变过程中的关键调控作用 | 首次发现MyoD直接靶向调控Dusp13和Dusp27,并证明这两个磷酸酶在肌肉干细胞命运转变中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类肌肉干细胞中的功能需要进一步验证 | 探究肌肉干细胞从增殖向分化转变的分子调控机制 | 肌肉干细胞(MuSCs) | 发育生物学 | 肌肉再生障碍 | 单细胞RNA测序,基因敲除,基因过表达 | NA | 基因表达数据 | MyoD敲入小鼠和Dusp13:Dusp27双敲除小鼠的肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4168 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of long isoform sequencing and functional data identifies distinct cortical layer neuronal subtypes derived from human iPSCs
2024-09-01, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.00045.2024
PMID:38988287
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研究论文 | 比较两种培养基中人类iPSCs分化为神经元的效果,发现E8M培养基能更高效生成功能性皮层神经元 | 首次结合长读长单细胞RNA测序和功能验证,鉴定出人类iPSCs来源的特定皮层神经元亚型 | 研究仅观察了35天内的分化效果,未评估长期稳定性 | 优化人类iPSCs向神经元分化的方法,提高分化效率 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs) | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 长读长单细胞RNA测序, 免疫细胞化学, 全细胞膜片钳记录 | NA | 单细胞RNA测序数据, 电生理记录数据, 免疫荧光图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4169 | 2025-10-06 |
Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells
2024-07-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae030
PMID:38655770
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研究论文 | 通过重新分析单细胞RNA测序数据揭示了循环髓系细胞的起源、分化和功能 | 首次系统揭示循环髓系细胞的起源、分化过程及其在生理和病理条件下的功能 | NA | 研究循环髓系细胞的起源、分化和功能 | 循环髓系细胞,特别是aCMCs亚群 | 单细胞生物学 | 创伤损伤、癌症、病原体感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4170 | 2025-10-06 |
Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814
PMID:38499264
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研究论文 | 本研究揭示白色念珠菌感染通过调节髓系细胞-T淋巴细胞轴改变口腔肿瘤微环境并促进肿瘤进展 | 首次发现白色念珠菌感染通过髓系细胞-T淋巴细胞轴调控口腔肿瘤微环境,揭示了IL-17A和γδ T细胞在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究白色念珠菌感染对口腔肿瘤微环境的影响机制 | 口腔肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4171 | 2025-10-06 |
An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813
PMID:38499266
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研究论文 | 本研究建立了一种高效的两阶段NMBzA诱导大鼠食管癌模型,并发现FAT-Hippo-YAP1轴驱动食管鳞癌进展 | 使用索拉非尼作为肿瘤促进剂建立高效两阶段致癌模型,首次揭示大鼠ESCC中FAT-Hippo-YAP1轴的渐进性超活化 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 建立高效的食管鳞癌动物模型并研究其致癌机制 | NMBzA诱导的大鼠食管鳞癌模型及衍生细胞系 | 癌症研究 | 食管鳞状细胞癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 3D类器官培养 | 动物模型, 细胞系模型, 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据, 细胞表型数据 | NMBzA诱导的大鼠食管肿瘤样本及衍生细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
4172 | 2025-10-06 |
Therapeutic application of human type 2 innate lymphoid cells via induction of granzyme B-mediated tumor cell death
2024-02-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.12.015
PMID:38211590
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研究论文 | 本研究揭示了人类2型先天淋巴细胞通过分泌颗粒酶B诱导肿瘤细胞死亡的新机制 | 首次发现人类ILC2细胞具有分泌颗粒酶B并直接裂解肿瘤细胞的能力,建立了可扩展2000倍的人类ILC2细胞培养平台 | 未在小鼠ILC2细胞中观察到相同现象,研究主要基于体外和动物模型 | 探索人类2型先天淋巴细胞的抗肿瘤治疗潜力 | 人类2型先天淋巴细胞和肿瘤细胞 | 免疫学 | 白血病和实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4173 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Technology Landscape in 2023
2024-01-13, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad077
PMID:37934608
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综述 | 本文综述了2023年单细胞RNA测序技术发展现状及其在干细胞研究中的应用 | 系统梳理了单细胞RNA测序技术分类、比较优势及最新技术发展格局 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于技术现状描述 | 概述单细胞RNA测序技术发展现状与技术挑战 | 单细胞RNA测序技术方法 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基于液滴、平板、水凝胶和空间转录组学等多种技术平台 |
4174 | 2025-10-06 |
Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq
2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338241252610
PMID:38766816
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示S100A6/S100A11在肝细胞癌T细胞免疫调控中的作用机制 | 首次发现S100A6/S100A11在肿瘤T细胞中差异表达并通过NF-κB通路影响肿瘤微环境 | 未明确说明样本数量和研究队列的具体特征 | 探究S100蛋白家族在肝细胞癌免疫细胞中的作用机制 | 肝细胞癌和乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 时序细胞轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4175 | 2025-10-06 |
Targeting KIT With Antibody-Drug Conjugates in Chromophobe Renal Cell Carcinoma
2025-Aug, Clinical genitourinary cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.clgc.2025.102359
PMID:40408838
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研究论文 | 本研究探讨了在染色质肾细胞癌中使用靶向KIT的抗体-药物偶联物的治疗潜力 | 首次发现KIT在染色质肾细胞癌中高表达,并证明靶向KIT的抗体-药物偶联物能有效抑制癌细胞活力 | 研究样本量有限,仅测试了5个细胞系,尚未进行临床试验 | 评估KIT作为染色质肾细胞癌治疗靶点的可行性 | 染色质肾细胞癌细胞系、转移性肿瘤标本、正常肾细胞 | 癌症研究 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot分析、免疫组化染色 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞活力数据 | 15个转移性ChRCC标本、5个ChRCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4176 | 2025-10-06 |
SOX11 and GLIS2: Novel Biomarkers for Understanding the Progression of Oral Leukoplakia
2025-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.100872
PMID:40543136
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,鉴定SOX11和GLIS2作为口腔白斑进展的新型生物标志物 | 首次发现SOX11和GLIS2作为口腔白斑特异性分子标志物,并揭示其通过调控上皮间质转化和血管生成影响疾病进展 | 样本量有限,需要更大规模研究验证生物标志物的临床应用价值 | 探索口腔白斑进展的分子机制并鉴定关键生物标志物 | 口腔白斑组织样本和TCGA数据库中的口腔鳞状细胞癌数据 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据,生存数据,组织图像 | 患者口腔白斑组织样本和TCGA数据库OSCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
4177 | 2025-10-06 |
Decoding Cellular Landscapes: Unravelling Periodontitis and Periapical Periodontitis at the Single-Cell Frontier
2025-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.100851
PMID:40554261
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的基因表达差异和细胞异质性 | 首次在单细胞水平系统比较牙周炎和根尖周炎的细胞异质性,识别了疾病特异性关键基因和关键细胞类型 | 研究依赖于公共数据库数据,样本来源和数量可能有限 | 阐明牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的关键基因表达差异和细胞异质性 | 牙周炎和根尖周炎患者的牙槽骨组织 | 单细胞生物学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序,实时定量PCR | SingleR细胞注释 | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE171213和GSE181688) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4178 | 2025-10-06 |
Integrated Analyses to Identify the Roles of GPX1 in Frailty and Hypertension
2025-Aug, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 通过整合分析鉴定GPX1在衰弱和高血压中的作用 | 首次采用双样本孟德尔随机化分析评估2532个可成药基因对衰弱和高血压的因果效应,并通过单细胞RNA测序验证GPX1的作用机制 | 研究主要基于遗传学分析,需要进一步实验验证GPX1的具体作用机制 | 识别衰弱和高血压的有效治疗靶点 | 老年人群体中的衰弱和高血压疾病 | 生物信息学 | 老年疾病 | 双样本孟德尔随机化分析,RNA表达谱分析,单细胞RNA测序,中介孟德尔随机化分析,分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 遗传数据,RNA表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4179 | 2025-10-06 |
Interleukin (IL)-34 promotes the inflammatory role of IL-1β-producing myeloid cells in pemphigus lesions
2025-Jul-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf130
PMID:40203120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现IL-34通过促进IL-1β产生髓系细胞在天疱疮皮损异位淋巴样结构形成中发挥关键作用 | 首次揭示IL-1β产生巨噬细胞是天疱疮皮损中主要髓系亚群,并发现IL-34/CSF-1R通路在驱动局部炎症中的新机制 | 研究主要基于体外实验和测序数据,需要进一步体内功能验证 | 探究髓系细胞在天疱疮皮损异位淋巴样结构形成中的作用及潜在治疗靶点 | 天疱疮皮肤病变组织中的髓系细胞和角质形成细胞 | 免疫学 | 天疱疮 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 流式细胞术, 批量RNA测序, Transwell趋化实验 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞培养数据 | 天疱疮皮肤病变组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4180 | 2025-10-06 |
An unbiased genomewide screen uncovers 7 genes that drive hematopoietic stem cell fate from mouse embryonic stem cells
2025-Jul-17, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027742
PMID:40209065
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研究论文 | 通过全基因组CRISPR激活筛选发现7个驱动小鼠胚胎干细胞向造血干细胞分化的关键基因 | 首次采用无偏见的全基因组CRISPR激活筛选方法,在胚胎干细胞中胚层分化阶段鉴定出7个能够诱导造血干细胞生成的新基因 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型,尚未在人类细胞中验证 | 探索调控造血干细胞体外生成的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的造血干细胞和祖细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | CRISPR激活筛选、单细胞RNA测序、胚胎体分化 | NA | 基因表达数据、移植实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |