单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31406 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-09-23 |
Inhibition of bone morphogenetic protein 4 alleviates angiotensin II-induced abdominal aortic aneurysm by reducing inflammation and endothelial-mesenchymal transition
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMP4在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中通过调控内皮-间质转化和炎症促进疾病进展的机制 | 首次发现BMP4在AAA进展中的关键作用，通过单细胞测序识别三种内皮细胞亚型及其动态变化 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究腹主动脉瘤的发病机制及BMP4在其中的调控作用 | 血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤小鼠模型和小鼠主动脉内皮细胞 | 血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(10x)、伪时间轨迹分析、蛋白质相互作用分析、免疫共沉淀 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 血管紧张素II诱导的AAA小鼠模型及体外细胞实验 |
| 342 | 2025-09-23 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和遗传关联数据，识别与血管疾病相关的细胞状态 | 开发新计算方法整合单核RNA测序数据与GWAS数据，首次揭示血管平滑肌细胞表型连续体与血管疾病的关联 | 样本量有限（正常n=7，动脉瘤n=9，动脉粥样硬化n=2），仅关注胸主动脉组织 | 鉴定导致早期血管功能障碍的特定血管亚群和中间细胞状态 | 人类升主动脉组织中的内皮细胞、血管平滑肌细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、全基因组关联研究（GWAS）、RNA轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据、遗传关联数据 | 18例人类主动脉样本（7例正常，9例动脉瘤，2例动脉粥样硬化） |
| 343 | 2025-09-23 |
Fate (or state) of CA2 neurons in a mineralocorticoid receptor knockout
2024-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.29.626110
PMID:39651204
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研究论文 | 通过空间转录组学方法研究盐皮质激素受体敲除后海马CA2区神经元的分子表型变化 | 首次揭示MR缺失导致CA2神经元获得CA1样分子表型，证明MR控制CA2神经元发育状态 | NA | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2区神经元命运/状态的影响 | 小鼠海马CA2区神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 344 | 2025-09-23 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
|
研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的单细胞RNA测序数据，揭示癌症转录异质性的重复性基因表达模式 | 首次大规模整合跨癌症类型的单细胞转录组数据，系统识别解释转录异质性的重复性模式 | NA | 解析癌症转录异质性景观并探索其功能意义 | 24种癌症类型的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 整合77项研究的多癌症数据集 |
| 345 | 2025-09-23 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
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研究论文 | 通过人类胃类器官模型研究TP53双等位基因失活引发的癌前病变演化规律 | 建立首个模拟人类胃癌早期演化的实验模型，揭示癌前病变中存在确定性演化路径和严格选择压力 | 研究基于类器官模型，与体内真实肿瘤微环境存在差异 | 探索人类肿瘤发生最早期的演化规律和恶性转化机制 | TP53缺陷型人类胃类器官 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序、高通量谱系追踪、细胞条形码技术 | 类器官模型 | 基因组测序数据、转录组数据 | 多个克隆来源的类器官培养物进行长达2年的实验演化 |
| 346 | 2025-09-23 |
Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity across a thousand tumours
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06130-4
PMID:37258682
|
研究论文 | 通过整合77项研究的单细胞RNA测序数据，系统分析24种肿瘤类型中转录组瘤内异质性的共性模式 | 首次大规模整合跨肿瘤类型的单细胞转录组数据，识别出41个保守的元程序并归纳为11个瘤内异质性标志 | 回顾性研究，依赖于已有数据集的整合分析 | 系统揭示跨肿瘤类型的转录组瘤内异质性共性特征 | 1,163个肿瘤样本（涵盖24种肿瘤类型）的恶性细胞和非恶性细胞 | 癌症基因组学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 1,163个肿瘤样本（整合自77项研究） |
| 347 | 2025-09-23 |
Systems vaccinology of the BNT162b2 mRNA vaccine in humans
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03791-x
PMID:34252919
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研究论文 | 采用系统疫苗学方法研究BNT162b2 mRNA疫苗在人体内诱导的先天和适应性免疫反应 | 首次系统描绘mRNA疫苗的免疫激活机制，发现加强免疫可显著增强先天免疫反应 | 样本量有限（56名健康志愿者），未涵盖特殊人群 | 解析mRNA疫苗的免疫作用机制 | 健康志愿者接种BNT162b2疫苗后的免疫反应 | 免疫学 | COVID-19 | 系统疫苗学、单细胞转录组学 | NA | 免疫细胞数据、转录组数据 | 56名健康志愿者 |
| 348 | 2025-09-22 |
Repopulation of microglia and its implications for CNS disorders: Insights from the single-cell era
2025-Oct-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107066
PMID:40865648
|
综述 | 本文全面总结了小胶质细胞的起源、发育、再殖和异质性研究，并强调单细胞时代下小胶质细胞再殖对中枢神经系统疾病的治疗意义 | 结合单细胞测序技术揭示小胶质细胞在发育、稳态和病理状态下的细胞命运与异质性，并探讨再殖小胶质细胞的新型治疗价值 | NA | 增强对小胶质细胞再殖的理解并为新治疗策略提供见解 | 小胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 349 | 2025-09-22 |
Single-cell transcriptomics reveals hypoxia-driven iCAF_PLAU is associated with stemness and immunosuppression in anorectal malignant melanoma
2025-Oct, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02273-5
PMID:40613916
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示缺氧驱动的iCAF_PLAU在肛管恶性黑色素瘤中与干性和免疫抑制相关 | 首次在ARMM中发现独特的iCAF_PLAU成纤维细胞亚群，并阐明其通过WNT5A_FZD3_LRP6和NRG1_ERBB3途径增强癌细胞干性，以及通过CCL2-CCR1轴介导免疫抑制的新机制 | 样本量较小（仅3例患者），需更大队列验证 | 解析肛管恶性黑色素瘤的肿瘤微环境特征及其治疗抵抗机制 | 肛管恶性黑色素瘤患者肿瘤组织和血液样本 | 数字病理学 | 肛管恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 3例ARMM患者肿瘤和血液样本，结合GEO数据库皮肤黑色素瘤数据集 |
| 350 | 2025-09-22 |
Identification of a unique subpopulation of mucosal fibroblasts in colorectal cancer with tumor-restraining characteristics
2025-Oct, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2025.100263
PMID:40759242
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定出结直肠癌中具有肿瘤抑制特性的独特黏膜成纤维细胞亚群 | 首次在结直肠癌中发现并表征ADAMDEC1/CXCL14/EDNRB/PROCR表达的肿瘤抑制性癌症相关成纤维细胞(Tr-CAFs)亚群 | NA | 探究结直肠癌中肿瘤抑制性成纤维细胞的存在及其特征 | 结直肠癌样本中的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, TCGA RNA-seq, 免疫组化 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据, 组织学图像 | 多个结直肠癌数据集（包含单细胞测序数据和TCGA数据） |
| 351 | 2025-09-22 |
FAPI-engineered nanoprobe induces dual-cell ferroptosis therapy and enables light-up magnetic resonance imaging for gastric cancer peritoneal metastasis
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102261
PMID:40969390
|
研究论文 | 开发了一种多功能诊疗纳米探针，用于胃癌腹膜转移的双细胞铁死亡治疗和点亮式磁共振成像 | 整合铁死亡诱导、CAF靶向递送和MRI成像的多功能纳米探针，首次实现针对癌症相关成纤维细胞的铁死亡治疗 | NA | 开发针对胃癌腹膜转移的精准治疗和成像策略 | 胃癌腹膜转移模型和癌症相关成纤维细胞 | 纳米医学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq，磁共振成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | NA |
| 352 | 2025-09-22 |
Delineating unique MASH-endothelial cells in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease using single-cell lensing
2025-Oct, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.dld.2025.07.035
PMID:40846560
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝病中独特的MASH内皮细胞特征及其在疾病中的作用 | 首次鉴定出五种独特的MASH内皮细胞亚群，发现关键turquoise模块在代谢通路中的作用，并通过机器学习识别出10个特征基因和两个新的因果基因ENTPD1和IFITM3 | NA | 阐明内皮细胞在代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)病理机制中的贡献 | MASLD患者的内皮细胞亚群 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞测序、批量测序、hdWGCNA、孟德尔随机化 | 机器学习算法 | 单细胞测序数据、批量测序数据 | NA |
| 353 | 2025-09-22 |
Tryptophan metabolic dysregulation drives immune activation and cartilage degradation in osteoarthritis: Functional validation integrated with transcriptomic and single-cell RNA sequencing
2025-Sep-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152497
PMID:40907267
|
研究论文 | 本研究探讨色氨酸代谢紊乱在骨关节炎发病机制中的作用，通过转录组和单细胞RNA测序分析揭示其驱动免疫激活和软骨降解的代谢机制 | 首次系统验证色氨酸代谢异常（特别是犬尿氨酸途径）在OA中的致病作用，并识别关键代谢酶IDO1、TDO2及特定软骨细胞亚群 | NA | 阐明色氨酸代谢在骨关节炎病理过程中的功能作用 | 骨关节炎软骨组织及IL-1β刺激的软骨细胞模型 | 生物医学研究 | 骨关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 354 | 2025-09-22 |
UCP2 is identified as a therapeutic target for abdominal aortic aneurysm by comprehensive bioinformatic analysis and experimental validation
2025-Sep-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152589
PMID:40915059
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证，鉴定UCP2作为腹主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次系统探索efferocytosis相关基因在AAA中的作用，并发现UCP2在巨噬细胞中高表达且其药理抑制可显著减缓疾病进展 | 研究主要基于生物信息学预测和小鼠模型，尚未进行临床干预试验 | 探究efferocytosis相关基因在腹主动脉瘤发病机制中的作用并寻找治疗靶点 | 人类和小鼠的AAA组织样本及弹性蛋白酶诱导的小鼠AAA模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq（单细胞RNA测序）、免疫荧光染色 | LASSO、Random Forest、XGBoost | 基因表达数据 | 多个数据集（GSE47472、GSE57691、GSE7084）及人类和小鼠组织样本 |
| 355 | 2025-09-22 |
A practical guide to spatial transcriptomics: lessons from over 1000 samples
2025-Sep-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.020
PMID:40975650
|
指南 | 本文基于1000多个空间样本的处理与分析经验，提供空间转录组学的实用操作指南 | 整合多平台大规模样本实践经验，系统总结实验设计与分析的最佳实践 | NA | 为研究人员提供可重复的空间转录组学工作流程指导 | 临床样本与多种空间转录组学平台 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达空间数据 | 超过1000个空间样本 |
| 356 | 2025-09-22 |
Multi-modal characterization of metabolic and immune gene clusters in adrenocortical carcinoma treatment
2025-Sep-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01092-4
PMID:40968257
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研究论文 | 通过多模态分析开发并验证了肾上腺皮质癌（ACC）的类固醇相关免疫评分（SIS），用于指导免疫和激素治疗 | 结合基因组学、数字病理和AI技术开发SIS评分，发现其与淋巴细胞浸润相关并验证了DHCR7基因作为潜在治疗靶点 | NA | 实现肾上腺皮质癌的精准医疗并改善患者预后 | 肾上腺皮质癌（ACC）患者 | 数字病理 | 肾上腺皮质癌 | scRNA-seq, 多模态分析, CAMs技术 | ResNet50, Vision Transformer-B16 | 基因组数据, 病理图像数据 | 外部ACC队列验证 |
| 357 | 2025-09-22 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析良性和恶性外周神经鞘瘤，揭示其空间和生物学异质性 | 首次将空间转录组学应用于PNSTs，构建了空间细胞分化图谱并整合组织学特征与单细胞数据 | 初步研究，样本量有限，需进一步验证 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性，改善诊断和分类 | 福尔马林固定石蜡包埋的病变外周神经组织 | 数字病理学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学，免疫组织化学，加权相关网络分析 | 空间聚类分析 | 转录组数据，图像数据 | 未明确样本数量，使用FFPE组织样本 |
| 358 | 2025-05-02 |
Spatial transcriptomics: Advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf116
PMID:40305521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2025-09-22 |
Elucidating anti-triple-negative breast cancer mechanisms and mitigating toxicity of Fritillaria thunbergii Miq.: A multi-omics and network pharmacology approach
2025-Sep-13, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120600
PMID:40953776
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研究论文 | 本研究采用多组学和网络药理学方法探讨浙贝母抗三阴性乳腺癌的机制并评估其毒性风险 | 首次整合网络药理学、机器学习与单细胞RNA测序系统解析浙贝母抗TNBC机制，并通过结构优化降低毒性 | 基于计算模拟研究，缺乏体内外实验验证 | 评估传统中药浙贝母抗三阴性乳腺癌的治疗机制与安全性 | 浙贝母生物活性成分及其与三阴性乳腺癌靶点的相互作用 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接与动力学模拟 | 机器学习算法 | 组学数据、化合物结构数据 | 识别42种生物活性成分和148个潜在靶点（基于数据库分析） |
| 360 | 2025-09-22 |
Elevated P4HB expression in hepatocellular carcinoma and its role in UCA1-mediated malignant progression
2025-Sep-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112131
PMID:40945634
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研究论文 | 本研究探讨P4HB在肝细胞癌中的高表达及其通过UCA1促进恶性进展的作用 | 首次发现P4HB与lncRNA UCA1的相互作用并揭示其通过增强糖酵解促进HCC恶性行为 | NA | 研究P4HB在肝细胞癌进展中的作用及其作为诊断生物标志物的潜力 | 肝细胞癌（HCC）细胞及患者样本 | 癌症研究 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、ROC分析、体外和体内功能实验 | NA | 测序数据、血清数据、实验数据 | HCC患者、健康对照及良性肝病患者血清样本 |