单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 32431 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2025-11-08
Effects of nucleic acid metabolism on prognosis and immune invasion of triple-negative breast cancer
2025-Nov-06, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 本研究探讨核酸代谢在三阴性乳腺癌中的预后价值和免疫浸润影响 首次发现PDE8B作为致癌基因通过促进上皮间质转化诱导TNBC转移,构建了包含四个核酸代谢相关基因的精准预后预测模型 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证预测模型的普适性 阐明核酸代谢在三阴性乳腺癌发展中的作用机制及其临床意义 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,体内外实验验证 预后预测模型 RNA测序数据,临床数据 297个TNBC样本来自三个数据集 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
282 2025-11-08
Advancements in single-cell sequencing for cervical cancer research
2025-Nov-06, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
综述 本文综述单细胞测序技术在宫颈癌研究中的最新进展,包括肿瘤异质性、肿瘤微环境动态和分子机制 揭示了宫颈癌中HPV驱动的致癌机制、代谢重编程空间组织以及肿瘤微环境中免疫细胞与基质细胞的复杂相互作用 临床转化面临耐药机制挑战,缺乏关键靶点抑制剂,需要进一步功能验证 推动单细胞测序在宫颈癌精准免疫治疗领域的应用 宫颈癌肿瘤微环境中的各类细胞(肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞) 单细胞测序 宫颈癌 单细胞测序 NA 单细胞分子数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间多组学 NA NA
283 2025-11-08
Targeting Treg-fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Nov-05, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学等技术揭示了脂肪性肝病相关肝癌中Treg细胞与CAF通过TNFSF14-TNFRSF14信号轴驱动免疫抑制和免疫治疗抵抗的机制 首次发现TNFSF14-TNFRSF14介导的Treg-CAF相互作用是SLD-HCC免疫治疗抵抗的关键驱动因素,并证明靶向该信号轴可增强抗肿瘤免疫 样本量相对有限,需要在更大队列中验证 研究SLD-HCC的免疫微环境和免疫治疗抵抗机制 脂肪性肝病相关肝癌患者组织和肝癌模型 单细胞生物学 肝癌 单细胞转录组学,质谱流式细胞术,空间转录组学,多重免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质表达数据 22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC病例,另有103例患者独立队列验证 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,质谱流式细胞术 NA NA
284 2025-11-08
Sox9 prevents retinal degeneration and is required for limbal stem cell differentiation in the adult mouse eye
2025-Nov-05, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示了Sox9转录因子在成年小鼠眼睛中维持视网膜完整性和促进角膜缘干细胞分化的关键作用 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术证明Sox9在基底角膜缘干细胞群体中的表达及其在形成两种长寿细胞克隆中的功能 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 揭示Sox9转录因子在成年眼睛不同细胞类型中的功能 成年小鼠的眼睛组织,特别是视网膜色素上皮细胞、Müller胶质细胞和角膜缘基底上皮细胞 发育生物学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因敲除 NA 基因表达数据, 细胞谱系数据 成年基因敲除小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
285 2025-11-08
scCausalVI disentangles single-cell perturbation responses with causality-aware generative model
2025-Nov-05, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 开发了一种因果关系感知生成模型scCausalVI,用于解耦单细胞RNA测序数据中的内在细胞状态与外部刺激效应 通过深度结构因果网络显式建模细胞状态特异性对外部扰动的响应机制,整合结构因果建模与跨条件计算机预测 NA 解耦单细胞数据中内在细胞变异与外部刺激诱导的外在效应 单细胞RNA测序数据 机器学习 COVID-19 单细胞RNA测序 生成模型, 深度结构因果网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
286 2025-11-08
Single-nuclei sequencing of Moricandia arvensis reveals bundle sheath cell function in the photorespiratory shuttle of C3-C4 intermediate Brassicaceae
2025-Nov-04, Journal of experimental botany IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序技术揭示了Moricandia arvensis中维管束鞘细胞在C3-C4中间型光合作用中的功能 首次在十字花科C3-C4中间型植物中应用单核RNA测序技术,揭示了光呼吸相关基因在维管束鞘细胞中的特异性表达模式 研究仅限于十字花科中的一种C3-C4中间型植物,需要更多物种验证 探究C3-C4中间型植物中细胞特异性对光呼吸途径的影响 Moricandia arvensis(十字花科C3-C4中间型植物)和拟南芥(C3植物)的叶片组织 植物生物学 NA 单核RNA测序,电子显微镜,免疫金标记 NA 单细胞转录组数据,显微镜图像 Moricandia arvensis单核RNA测序数据集和拟南芥公开单细胞转录组数据 NA 单核RNA测序,单细胞转录组测序 NA NA
287 2025-11-08
RANBP1 promotes immune evasion in triple-negative breast cancer by suppressing T cell infiltration via the miR-769-5p/PRUNE2 axis
2025-Nov-04, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究揭示RANBP1通过miR-769-5p/PRUNE2轴抑制T细胞浸润,促进三阴性乳腺癌免疫逃避的分子机制 首次发现RANBP1通过调控miR-769-5p/PRUNE2通路影响T细胞浸润,揭示了三阴性乳腺癌免疫逃避的新机制 研究样本量有限(87例TNBC组织),机制研究仍需进一步验证 探究RANBP1在三阴性乳腺癌中调控T细胞浸润和肿瘤进展的作用机制 三阴性乳腺癌细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组织化学、Kaplan-Meier分析 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床生存数据 87对三阴性乳腺癌肿瘤及癌旁组织,TCGA和GSE65194数据库 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
288 2025-11-08
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning reveals 4-aminobiphenyl exposure signatures and novel diagnostic biomarkers in bladder cancer
2025-Nov-04, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了4-氨基联苯暴露特征并识别了膀胱癌的新型诊断生物标志物 首次在单细胞分辨率下系统阐明4-氨基联苯的致癌机制,并通过机器学习识别出由六个核心基因组成的诊断面板 研究具有回顾性性质,依赖公共测序数据,缺乏详细临床元数据,无法对识别亚型进行生存分析 研究环境致癌物4-氨基联苯在膀胱癌发生中的分子机制并识别诊断生物标志物 膀胱癌组织样本 生物信息学, 机器学习 膀胱癌 单细胞RNA测序, 分子对接模拟, ssGSEA LASSO, SVM, 随机森林 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 95,136个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
289 2025-11-08
Heterogeneity in an adeno-associated virus transfection-based production process limits the production efficiency
2025-Nov-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了基于腺相关病毒转染的生产过程中细胞异质性对生产效率的限制 首次在单细胞水平上揭示了rAAV生产过程中细胞转染异质性的关键瓶颈,发现仅不到5%的细胞实际产生病毒颗粒 研究仅针对rAAV9血清型和HEK293T细胞系,结果可能不适用于其他AAV血清型或生产细胞系 提高基于瞬时转染的rAAV生产效率和产量 HEK293T细胞系和rAAV9病毒载体 生物技术 基因治疗 单细胞转录组学,流式细胞术,qPCR NA 转录组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
290 2025-11-08
Single-cell multi-omics analysis revealed the expansion of age-associated B cells in the pancreas of type 1 autoimmune pancreatitis patients
2025-Nov-04, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 通过单细胞多组学分析揭示了1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺中年龄相关B细胞的扩增现象 首次在AIP胰腺中发现IgD-年龄相关B细胞(ABCs)的扩增,并揭示了CXCL9+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴招募ABCs以及Tfh细胞通过IL-21与ABCs相互作用的新机制 样本量有限,仅基于活检样本分析,需要更大规模研究验证 表征1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺的局部免疫特征 1型自身免疫性胰腺炎患者的胰腺活检组织 单细胞组学 自身免疫性胰腺炎 单细胞RNA测序,免疫受体组库测序,空间转录组测序,流式细胞术,多色免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫受体序列数据 AIP患者胰腺活检样本 NA 单细胞RNA测序,单细胞免疫受体组库测序,空间转录组学 NA NA
291 2025-11-08
PA2G4 in CAFs promotes biochemical recurrence of prostate cancer via H3K18la
2025-Nov-04, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过多组学分析鉴定前列腺癌相关成纤维细胞乳酸代谢特征并建立预后指数 首次发现CAFs通过乳酸代谢影响前列腺癌进展,建立新型乳酸代谢相关临床预后指数LMCAFCPI,并揭示PA2G4通过抑制H3K18la调控前列腺癌增殖转移的新机制 NA 探索前列腺癌相关成纤维细胞通过乳酸代谢影响前列腺癌进展的机制并开发预后工具 前列腺癌相关成纤维细胞和前列腺癌组织样本 生物信息学 前列腺癌 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习,CUT-TAG测序 机器学习模型 转录组数据,表观遗传数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
292 2025-11-08
Loss of Actrt1 in non-hematopoietic stroma suppresses pathological angiogenesis and tumor progression
2025-Nov-04, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究揭示了Actrt1通过非造血基质细胞促进肿瘤血管生成和肿瘤进展的新机制 首次发现Actrt1在肿瘤微环境中通过非造血内皮细胞调控病理性血管生成,而不影响发育性血管生成 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性有待进一步验证 探究Actrt1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤血管生成的影响 B16F1和MC38肿瘤模型小鼠、骨髓嵌合体、主动脉环、后肢缺血模型 肿瘤生物学 肿瘤 单细胞RNA测序、免疫荧光、骨髓移植、主动脉环分析 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织图像数据 多种小鼠肿瘤模型和实验体系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
293 2025-11-08
A new model of gastric pre-neoplasia induced by aberrant ADAR1-mediated double-stranded RNA signaling
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过构建胃壁细胞特异性敲除ADAR1的小鼠模型,揭示了异常双链RNA信号传导在胃前瘤形成中的作用机制 首次建立了由ADAR1介导的双链RNA信号异常驱动的胃前瘤形成新遗传模型,并发现线粒体双链RNA在此过程中的富集现象 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 明确双链RNA反应失调在胃上皮细胞中对胃前瘤形成的影响 ADAR1基因敲除小鼠的胃组织 分子病理学 胃癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫电子显微镜,免疫沉淀 基因敲除小鼠模型 转录组数据,组织学图像,免疫学数据 多种基因型小鼠的胃组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
294 2025-11-08
Heterogeneity of acute myeloid leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Nov-04, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络,探索疾病异质性 首次结合单细胞数据和单样本网络分析方法,在细胞类型特异性水平上揭示AML患者的基因调控异质性 样本量有限,网络推断方法的一致性有待进一步验证 探索急性髓系白血病在基因调控水平的异质性,为个性化治疗提供依据 急性髓系白血病患者和健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 生物信息学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3, LIONESS 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
295 2025-11-08
IGF1-mediated mesenchymal-endothelial transition as a potential regulatory target in calcific aortic valve disease
2025-Nov-03, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究首次证实主动脉瓣间质细胞在钙化条件下具有向内皮细胞转分化的能力 首次发现并证实主动脉瓣间质细胞可通过间质-内皮转分化获得内皮细胞功能,揭示了IGF1-PI3K-AKT-HIF信号通路在此过程中的关键作用 研究样本量有限,主要基于动物模型和体外实验,人类临床验证仍需进一步研究 探究钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞向内皮细胞转分化的机制及其治疗潜力 人类钙化主动脉瓣组织、猪主动脉瓣原代细胞、Col1a2-CreERT:R26R-tdTomato基因工程小鼠 心血管疾病研究 钙化性主动脉瓣疾病 免疫荧光分析、转录组测序、Western blot、qPCR、单细胞测序数据分析 NA 组织切片图像、基因表达数据、蛋白质印迹数据 16例CAVD患者钙化主动脉瓣、猪主动脉瓣原代细胞、基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
296 2025-11-08
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网通过调控LDHA表达促进结直肠癌肝转移的机制 首次发现NETs通过PI3K/AKT通路调控糖代谢关键酶LDHA表达促进结直肠癌转移 NA 探索中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌肝转移中的作用机制 结直肠癌细胞、裸鼠肝脏异种移植模型 肿瘤生物学 结直肠癌 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
297 2025-11-08
Fragile X mental retardation 1 gene FMR1 promotes proliferation, migration, and invasion of gastric cancer cells via c-MYC
2025-Nov-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨FMR1基因通过c-MYC信号通路促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的机制 首次揭示FMR1在胃癌中通过稳定c-MYC蛋白促进肿瘤恶性表型的新机制 研究主要基于体外实验和数据库分析,需要更多体内实验验证 阐明FMR1基因在胃癌发生发展中的作用机制 胃癌细胞系和临床胃癌组织样本 癌症生物学 胃癌 qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 单细胞转录组学, 免疫共沉淀, ELISA NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 TCGA队列和临床样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA TIMER2.0平台, TISIDB数据库, inferCNV分析工具
298 2025-11-08
GCNLA: Inferring Cell-Cell Interactions From Spatial Transcriptomics With Long Short-Term Memory and Graph Convolutional Networks
2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出一种基于图卷积网络和长短期记忆注意力模块的GCNLA网络架构,用于从空间转录组数据推断细胞间相互作用 GCNLA不仅能学习细胞的空间结构,还能捕获远端细胞间的相互作用信息,注意力模块进一步提取和增强与细胞间相互作用相关的特征 NA 从空间转录组数据推断细胞间相互作用 细胞间相互作用 空间转录组学 NA 空间转录组学 图卷积网络(GCN), 长短期记忆网络(LSTM) 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 seqFISH, MERFISH NA
299 2025-11-08
Spatially informed phenotyping by cyclic-in-situ-hybridisation identifies novel fibroblast populations and their pathogenic niches in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过循环原位杂交技术结合空间转录组学,在系统性硬化症皮肤中发现并表征了新型成纤维细胞亚群及其致病作用 首次在单细胞分辨率下实现原位深度转录谱分析,发现SFRP2+网状真皮成纤维细胞和CCL19+非血管周成纤维细胞两个新型亚群 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 通过空间转录组学技术研究系统性硬化症皮肤中成纤维细胞亚群的分布特征和致病机制 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤组织 空间转录组学 系统性硬化症 循环原位杂交,单细胞RNA测序 BANKSY聚类算法 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤样本 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
300 2025-11-08
Brain tumors induce widespread disruption of calvarial bone and alteration of skull marrow immune landscape
2025-Nov, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究揭示胶质母细胞瘤通过改变破骨细胞活性和增加颅骨通道数量,导致颅骨骨髓免疫景观改变并影响肿瘤进展 首次发现脑肿瘤会诱导颅骨骨髓免疫景观改变,并揭示骨吸收抑制对免疫检查点抑制剂疗效的影响 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 探究脑肿瘤对颅骨骨髓免疫环境的影响机制 胶质母细胞瘤小鼠模型和患者样本 免疫学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型和患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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