单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-03-31
Valvular Leaflets Are Not Innocent Bystanders: Divergent Fibrotic Remodeling Accompanies Functional Mitral and Tricuspid Regurgitation
2026-Apr, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨功能性瓣膜反流中瓣叶纤维化重塑的机制,揭示了二尖瓣和三尖瓣反流的不同病理过程 首次系统比较功能性二尖瓣和三尖瓣反流中瓣叶特异性纤维化重塑机制,并识别出PDK4和IFN信号作为潜在治疗靶点 样本量相对有限,单细胞RNA测序仅基于19个瓣叶样本,且动物模型可能无法完全模拟人类疾病 阐明功能性瓣膜反流中瓣叶纤维化重塑的细胞机制和潜在治疗策略 心脏移植患者的功能性二尖瓣和三尖瓣反流瓣叶组织,以及原发性瓣膜内皮细胞和间质细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,组织病理学分析 NA RNA测序数据,组织图像数据 单细胞RNA测序:19个FVR瓣叶样本(FMR:8个,FTR:11个);bulk RNA测序:82个样本(FMR/FTR各41个) NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
302 2026-03-31
Glial Plasticity and Dysfunction: Mechanistic Insights and Therapeutic Opportunities in Neurodegeneration
2026-Apr, Journal of neurochemistry IF:4.2Q2
综述 本文综述了神经胶质细胞在神经退行性疾病中的多样生理病理作用及新兴治疗策略 整合单细胞转录组学、谱系追踪和活体成像等先进技术,系统揭示胶质细胞的异质性、可塑性及其在神经退行性疾病中的双重角色,并评估基于胶质细胞可塑性的新兴治疗策略 面临细胞异质性、递送障碍和缺乏特异性生物标志物等临床转化挑战 探讨胶质细胞在神经退行性疾病中的作用机制及治疗潜力 星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞和施万细胞等神经胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、多发性硬化症等神经退行性疾病 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
303 2026-03-31
ZFP36L1 promotes non-small cell lung cancer progression under hypoxia by modulating CXCL9:SPP1 polarity: A single-cell transcriptomic study
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了ZFP36L1在缺氧条件下通过调节巨噬细胞CXCL9:SPP1极化促进非小细胞肺癌进展的机制 首次在单细胞水平上阐明ZFP36L1通过调控巨噬细胞极化影响NSCLC进展,并建立了从体外实验到患者来源类器官和体内小鼠模型的完整验证体系 研究主要聚焦于巨噬细胞极化机制,其他免疫细胞类型在缺氧微环境中的作用未充分探讨,且临床样本量有限 探究ZFP36L1在非小细胞肺癌进展中的分子机制及其与肿瘤微环境缺氧状态的关联 非小细胞肺癌细胞、巨噬细胞、患者来源类器官、ZFP36L1基因敲除小鼠模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光、流式细胞术、ELISA、双荧光素酶报告基因、ChIP、CCK-8、Transwell、克隆形成、划痕实验、H&E染色、EdU检测、CellTiter-Glo检测 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据 未明确说明具体样本数量,但包含患者来源类器官和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
304 2026-03-31
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用高分辨率空间转录组技术,解析了猪雌性早期性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞分化及进入减数分裂的空间动态 首次应用空间转录组技术于猪早期性腺研究,揭示了细胞间空间定位与通讯机制,特别是BMP信号通路在生殖细胞发育中的关键作用 研究仅聚焦于猪模型,结果可能不完全适用于其他哺乳动物;空间转录组技术分辨率虽高,但可能无法捕获所有细胞亚型的细微差异 探究哺乳动物早期性腺发育中生殖细胞与体细胞间的空间通讯机制 猪雌性早期性腺组织,包括原始生殖细胞、性腺体细胞(如颗粒细胞、间质细胞、内皮细胞) 空间转录组学 NA 空间转录组测序 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但基于猪早期性腺组织 NA 空间转录组学 NA NA
305 2026-03-31
Defocus Coding and Transcriptomic Remodeling in the Mouse Myopic Retina
2026-Mar-30, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 本研究通过全细胞记录和单细胞RNA测序技术,探索了小鼠近视视网膜中离焦编码和转录组重塑的机制 揭示了视网膜侧向抑制网络(特别是水平细胞而非AII无长突细胞)对光学离焦的响应,以及多巴胺能无长突细胞在聚焦图像中的最大兴奋作用,并首次在单细胞水平上展示了近视视网膜中GABA能突触和间隙连接通路的协调重塑 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类近视机制,且未涉及长期治疗干预效果 探究视网膜如何感知聚焦与离焦信号,并将其转化为调控眼轴生长的遗传信号 小鼠视网膜细胞,特别是水平细胞、AII无长突细胞和多巴胺能无长突细胞 数字病理学 近视 全细胞记录,单细胞RNA测序 NA 电生理记录数据,单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠视网膜细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
306 2026-03-31
Non-neuronal sites of latency for alphaherpesviruses
2026-Mar-30, Journal of virology IF:4.0Q2
综述 本文综述了α疱疹病毒在神经元外细胞(如免疫细胞)中建立潜伏感染的新证据,并探讨了其在病毒发病机制中的潜在作用 提出了α疱疹病毒(如BoHV-1和HSV-1)的基因组可在扁桃体和淋巴组织等部位的免疫细胞亚群中持续存在并支持应激诱导的病毒再激活,挑战了传统认为潜伏感染仅限于感觉神经元的观点 在人类α疱疹病毒中,区分真正的‘潜伏感染’与流产性或持续性感染仍然具有挑战性 探讨α疱疹病毒在神经元外细胞中建立潜伏感染的证据及其在病毒潜伏、再激活和传播中的作用 α疱疹病毒亚科成员(如HSV-1、BoHV-1)及其在神经元和非神经元细胞(特别是免疫细胞)中的感染状态 NA 疱疹病毒感染 单细胞转录组学、空间分析 NA NA NA NA NA NA NA
307 2026-03-31
Astrocytes in neuroinflammation and brain cancer
2026-Mar-30, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 本文综述了星形胶质细胞在神经炎症和脑癌(特别是胶质瘤)进展中的主动调控作用,并提出了一个整合时空映射和液体活检的转化研究框架 提出了一个4D时空映射框架来重建星形胶质细胞轨迹,并引入了基于胶质液体活检的概念来分离肿瘤与星形胶质细胞来源的分析物 作为一篇综述,主要基于现有证据进行综合,未报告新的原始实验数据或临床验证结果 阐明星形胶质细胞在胶质瘤进展和神经炎症中的动态作用,并推动相关治疗策略的临床转化 星形胶质细胞及其在胶质瘤微环境中的状态转变 数字病理学 脑癌(胶质瘤) 单细胞转录组学、单核转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 转录组数据、蛋白质数据、空间成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
308 2026-03-31
IGSF9 drives malignant transformation and predicts early-stage lung adenocarcinoma in integrated transcriptomic analyses
2026-Mar-29, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合转录组分析,识别了IGSF9作为早期肺腺癌的潜在诊断生物标志物和治疗靶点,并揭示了其在恶性转化中的多面性作用 首次将IGSF9识别为早期肺腺癌的诊断生物标志物,并利用单细胞RNA测序和多种分析技术(如细胞间通讯推断、拷贝数变异分析和伪时间轨迹重建)系统阐明了其在肿瘤微环境中的表达定位和功能机制 研究主要基于转录组数据,缺乏直接的体内或体外功能验证实验来确认IGSF9的致癌机制 阐明早期肺腺癌的分子机制,并识别有效的早期检测生物标志物和治疗干预靶点 肺腺癌(LUAD),特别是早期阶段的肿瘤样本 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序,随机森林,LASSO,拷贝数变异分析,伪时间轨迹重建 随机森林(RF),最小绝对收缩和选择算子(LASSO) 转录组数据,单细胞RNA测序数据 未在摘要中明确指定样本数量,但提及使用了独立外部数据集进行验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
309 2026-03-31
SAA/FPR2 Signaling Between Pericentral Hepatocytes and Macrophages Exacerbates Zonated Liver Transplant Injury
2026-Mar-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学等技术,揭示了肝移植中FOXO1/SAA/FPR2信号轴在中央区肝细胞损伤中的关键作用 首次系统性地整合单细胞、空间转录组学、染色质可及性分析、蛋白质组学和bulk RNA-seq数据,揭示了肝移植损伤中中央区肝细胞与巨噬细胞间SAA/FPR2信号通路的区域特异性机制 研究主要基于小鼠模型和临床样本验证,人类样本的深入机制和长期疗效仍需进一步探索 阐明肝移植中中央区肝细胞选择性缺血再灌注损伤的分子机制 肝移植移植物、小鼠HIRI模型、临床LT样本、体外实验 数字病理学 肝移植损伤 单细胞转录组学, 空间转录组学, 染色质可及性分析, 蛋白质组学, bulk RNA-seq NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间数据 临床LT标本、小鼠HIRI模型和体外实验样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
310 2026-03-31
Comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation reveal the role of circadian rhythm-related genes in the crosstalk between osteoporosis and atherosclerosis
2026-Mar-27, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了昼夜节律相关基因在骨质疏松与动脉粥样硬化相互作用中的关键角色 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出骨质疏松与动脉粥样硬化共存的共享标记基因,特别是AEBP1,并验证其在两种疾病中的上调表达 研究主要基于小鼠模型和人类样本的体外分析,临床转化和机制深入探讨仍需进一步研究 识别骨质疏松与动脉粥样硬化共存的共享标记基因和细胞机制 人类骨髓和颈动脉样本、自然衰老小鼠和腺嘌呤诱导的小鼠模型 生物信息学 骨质疏松与动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微计算机断层扫描、免疫组化、免疫荧光、Von Kossa染色、RT-qPCR NA RNA测序数据、图像数据 人类骨髓和颈动脉样本(具体数量未明确)、小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
311 2026-03-31
ACOT8-mediated palmitate accumulation promotes M1 macrophage polarization in renal ischemia-reperfusion injury via activation of the cGAS-STING pathway
2026-Mar-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了ACOT8通过调控棕榈酸积累,激活cGAS-STING通路,从而促进巨噬细胞M1极化,加剧肾缺血再灌注损伤的分子机制 整合多组学数据与多层次实验验证,首次阐明ACOT8通过调控脂质代谢(特别是棕榈酸)影响巨噬细胞极化的新机制,并利用肾脏特异性AAV9载体敲低ACOT8进行功能验证 研究主要在动物模型和体外细胞实验中进行,其临床转化潜力及在人类患者中的确切作用尚需进一步验证 探究ACOT8在肾缺血再灌注损伤中的作用及分子机制,寻找潜在治疗靶点 肾缺血再灌注损伤模型小鼠、肾小管上皮细胞、巨噬细胞 生物信息学与多组学整合分析 急性肾损伤 单细胞RNA测序、脂质组学、pQTL孟德尔随机化分析、机器学习算法(LASSO, SVM-RFE)、体内外实验验证 LASSO, SVM-RFE 转录组数据、单细胞RNA测序数据、脂质组学数据 未明确说明具体样本数量,涉及多个转录组数据集、动物模型及体外细胞实验 NA 单细胞RNA-seq, 脂质组学 NA NA
312 2026-03-31
Liver Sinusoidal Endothelial Cells and Laminin dictate cholangiocytes' fate in chronic liver disease
2026-Mar-27, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究揭示了在慢性肝病中,毛细血管化的CD34+肝窦内皮细胞通过维持层粘连蛋白沉积来限制胆管反应细胞向肝细胞分化的机制 首次识别出层粘连蛋白包围的胆管反应细胞亚群,并阐明CD34+肝窦内皮细胞通过调控层粘连蛋白影响胆管反应细胞命运的微环境机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;DR来源的肝细胞对整体肝再生的贡献程度仍需进一步量化 探究慢性肝病中胆管反应细胞向肝细胞分化的微环境调控机制 小鼠慢性肝损伤模型、人类肝病组织样本、胆管反应细胞、肝窦内皮细胞 数字病理学 慢性肝病 免疫组织化学、流式细胞术、RT-qPCR、空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 组织图像、基因表达数据、空间转录组数据 小鼠模型及人类肝病组织样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA RESOLVE分子图谱技术用于空间转录组分析
313 2026-03-31
Dnmt1 mediates epigenetic restriction of invasive traits in clonal crayfish
2026-Mar-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了环境变化如何通过下调Dnmt1 DNA甲基转移酶来增强三色螯虾的入侵行为,揭示了表观遗传机制在调节入侵性中的作用 首次在克隆性入侵物种中,通过体内敲低Dnmt1,结合单细胞RNA测序和全基因组亚硫酸氢盐测序,揭示了DNA甲基化在调控免疫细胞扩张和神经前体耗竭中的关键作用,并关联了核小体不稳定性与转录变化 研究主要基于实验室环境下的表型模拟,可能未完全反映自然条件下的复杂生态交互;且Dnmt1的具体下游通路和长期进化影响尚需进一步探索 探究表观遗传机制如何调控克隆性入侵物种的入侵性行为 三色螯虾(Procambarus virginalis) 表观遗传学 NA 全基因组亚硫酸氢盐测序, 单细胞RNA测序, 图像细胞术, dsRNA体内敲低 NA 基因组DNA甲基化数据, 单细胞转录组数据, 行为学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 全基因组亚硫酸氢盐测序 NA NA
314 2026-03-31
Species-specific roles of SP1 in bovine and human embryonic genome activation and early embryonic development
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牛胚胎中主要胚胎基因组激活的异步启动,并探讨了转录因子SP1在牛和人类胚胎早期发育中的保守和物种特异性作用 揭示了牛胚胎中主要胚胎基因组激活在8细胞阶段的异步启动,并通过多组学分析发现SP1在调节胚胎基因组激活和早期发育中的保守和物种特异性功能 NA 探究胚胎基因组激活的分子特征及转录因子SP1在哺乳动物早期胚胎发育中的作用 牛和人类胚胎 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,多组学分析 NA RNA测序数据,染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
315 2026-03-31
Quantifying the fidelity of in vitro human cell culture systems using a biomedical foundation model
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用生物医学基础模型(BMFM-RNA)定量评估了人类肠道上皮细胞体外培养系统的保真度 首次提出利用基于单细胞RNA测序数据训练的生物医学基础模型(BMFM-RNA)对体外培养细胞进行定量基准测试的方法框架 研究主要聚焦于肠道上皮细胞,方法在其他器官系统的适用性仍需进一步验证 建立定量评估人类原代细胞体外培养系统保真度的标准化方法 人类肠道上皮细胞(IECs) 计算生物学 NA 单细胞RNA测序 生物医学基础模型(BMFM-RNA) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
316 2026-03-31
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2026-Mar-23, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为NCLUSION的非参数无限混合模型,用于同时识别标记基因并聚类单细胞RNA测序数据 NCLUSION模型利用贝叶斯稀疏先验,在聚类过程中统一选择标记基因,避免了传统方法中用户指定启发式规则和事后差异表达分析导致的假发现率膨胀问题 未在摘要中明确说明 开发一种可扩展的非参数聚类方法,用于单细胞RNA测序数据分析,以同时实现细胞聚类和标记基因选择 单细胞RNA测序数据 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 非参数无限混合模型,变分推断算法 基因表达数据 可扩展至数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
317 2026-03-31
Hypothyroidism impairs skeletal muscle regeneration after injury by altering myogenic and nonmyogenic pathways
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和FUCCI报告小鼠模型,揭示了甲状腺功能减退通过改变肌源性和非肌源性通路,损害骨骼肌损伤后再生过程 首次在单细胞分辨率上阐明了甲状腺功能减退如何通过双重模式(直接的肌源性细胞周期与氧化程序转录调控,以及由FAP和免疫信号网络介导的间接旁分泌重塑)损害肌肉再生 研究基于小鼠模型,结果向人类临床的转化需要进一步验证;观察时间最长至损伤后2个月,更长期的再生结局尚不明确 探究甲状腺激素信号在骨骼肌损伤后再生过程中的具体作用通路 小鼠的胫骨前肌(在心肌毒素诱导损伤后) 单细胞组学 肌肉疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞周期分析(FUCCI报告系统) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
318 2026-03-31
Extracellular vesicle miR-93-5p cargo regulates glomerular endothelial cell damage in Alport syndrome
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了miR-93-5p在减轻Alport综合征肾小球损伤中的作用,并验证了人羊水干细胞来源的细胞外囊泡通过其miR-93-5p货物调节疾病活动的能力 揭示了miR-93-5p在肾小球内皮细胞中的特异性下调及其通过hAFSC-EVs传递调节VEGFR1和VEGFR2信号通路的机制 研究主要基于体外和动物模型,人类患者数据验证有限,且未详细探讨其他可能涉及的miRNA或信号通路 探究miR-93-5p在Alport综合征肾小球内皮细胞损伤中的调控作用及hAFSC-EVs的治疗潜力 肾小球内皮细胞、人羊水干细胞来源的细胞外囊泡、Alport综合征动物模型及患者活检组织 分子生物学与病理学 Alport综合征 空间转录组学、空间分子成像、转录组学分析、蛋白质组学分析 NA 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、成像数据 包括动物模型和人类患者活检组织,具体样本数量未明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
319 2026-03-31
Spatial Distribution of K13-Positive Airway Epithelial Cells in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Mar-23, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过空间免疫荧光、单细胞RNA测序和细胞通讯分析,揭示了K13阳性气道上皮细胞在特发性肺纤维化(IPF)中的异常激活及其在远端气道近端化重塑中的关键作用 首次发现K13 hillock细胞在IPF中异位上调,驱动远端气道近端化表型转变,并通过命运重编程和上皮-间质串扰促进纤维化进程 研究主要基于组织样本和体外培养,缺乏体内功能验证模型;样本量未明确说明,可能限制统计效力 阐明K13阳性气道上皮细胞在特发性肺纤维化气道重塑中的作用机制 IPF患者和对照者的肺组织样本,特别是气道上皮细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 空间免疫荧光,单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外培养实验,细胞通讯分析 CellChat 图像,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
320 2026-03-31
Interpretable learning of temporal cellular dynamics from single-cell data
2026-Mar-23, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了一种名为NeuroVelo的新方法,用于从静态单细胞转录组数据中重建时间细胞动态 NeuroVelo结合了最优线性投影和非线性神经常微分方程,利用动力学系统理论在优化潜在空间中同时确定细胞转换和驱动基因表达时间动态的基因相互作用 未在摘要中明确提及 从静态单细胞数据中学习时间细胞动态,以克服现有方法的解释性和预测能力限制 单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞RNA-seq 神经常微分方程 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部