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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3141 - 3160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 3141 | 2025-10-06 |
Multi-gene anoikis signature combined with tumor microenvironment stratifies prognosis in cutaneous melanoma with experimental validation of PTK6
2025-Jul-26, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149686
PMID:40721013
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研究论文 | 本研究开发了一个整合失巢凋亡特征和肿瘤微环境的预后分类器，用于皮肤黑色素瘤的预后分层，并通过实验验证了PTK6的关键作用 | 首个整合失巢凋亡抵抗和免疫微环境特征的预后模型，并通过体内外实验验证了PTK6通过Hippo通路调控失巢凋亡抵抗的机制 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测模型并探索其分子机制 | 皮肤黑色素瘤患者和细胞/动物模型 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 体外实验, 体内实验 | 风险评分模型, 共识聚类, RS-TME分类器 | 基因表达数据, 单细胞数据 | TCGA-CM队列471例患者，GSE65904验证队列214例患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3142 | 2025-10-06 |
Integration of Single-Cell Analysis and Bulk RNA Sequencing Data Using Multi-Level Attention Graph Neural Network for Precise Prognostic Stratification in Thyroid Cancer
2025-Jul-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17142411
PMID:40723292
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发多级注意力图神经网络模型用于甲状腺癌的精确预后分层 | 首次将单细胞分析与批量RNA测序数据整合，应用多级注意力图神经网络模型进行甲状腺癌预后预测 | 样本量相对有限，仅包含15个单细胞样本和489个TCGA患者数据 | 提高甲状腺癌预后预测精度，探索T细胞在肿瘤微环境中的作用 | 甲状腺癌患者，重点关注T细胞亚型 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 多级注意力图神经网络(MLA-GNN) | 基因表达数据 | 15个单细胞RNA测序样本和489个TCGA患者 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 3143 | 2025-10-06 |
Cancer-Associated Fibroblasts Establish Spatially Distinct Prognostic Niches in Subcutaneous Colorectal Cancer Mouse Model
2025-Jul-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17142402
PMID:40723284
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学系统表征了MC38皮下结直肠癌小鼠模型中肿瘤微环境的空间异质性 | 首次在皮下结直肠癌模型中识别出由癌症相关成纤维细胞分隔的两个空间不同肿瘤区域，并揭示了区域特异性细胞生态系统和细胞间通讯网络 | 研究仅限于小鼠皮下肿瘤模型，可能无法完全反映人类原发肿瘤的复杂性 | 探究皮下结直肠癌模型中肿瘤微环境的空间组织和调控机制 | MC38皮下结直肠癌小鼠模型 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3144 | 2025-10-06 |
Integrated Multi-Omics Profiling Reveals That Highly Pyroptotic MDMs Contribute to Psoriasis Progression Through CXCL16
2025-Jul-18, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071763
PMID:40722833
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了银屑病中单核细胞来源巨噬细胞的高焦亡状态通过CXCL16促进疾病进展的机制 | 首次系统揭示了银屑病中细胞特异性焦亡模式，发现MDMs通过CXCL16-CXCR6信号轴激活Th17细胞驱动皮肤炎症的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，实验验证仍需进一步扩展 | 探究银屑病中细胞特异性焦亡模式及其免疫调节机制 | 银屑病患者和健康对照的皮肤组织样本 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,细胞通讯分析,体外实验,体内实验 | Gene Set Variation Analysis, AUCell, CIBERSORT, CellChat | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 21个转录组数据集和2个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3145 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal Heterogeneity of Tumor Glucose Metabolism Reprogramming: From Single-Cell Mechanisms to Precision Interventions
2025-Jul-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146901
PMID:40725147
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综述 | 系统总结肿瘤葡萄糖代谢重编程的时空异质性及其在精准干预中的应用 | 整合单细胞测序、空间组学和代谢成像技术，从静态批量分析转向单细胞分辨率的动态研究 | NA | 探讨肿瘤葡萄糖代谢重编程的时空异质性机制及精准治疗策略 | 肿瘤细胞及其代谢特征 | 肿瘤代谢研究 | 癌症 | 单细胞测序, 空间组学, 代谢成像 | NA | 代谢组学数据, 表观遗传数据, 免疫学数据 | NA | NA | 单细胞代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3146 | 2025-10-06 |
MICA+ Tumor Cells Modulate Macrophage Phenotype and Function via PPAR/EHHADH-Mediated Fatty Acid Metabolism in Hepatocellular Carcinoma (HCC)
2025-Jul-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17142365
PMID:40723248
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研究论文 | 本研究揭示了肝癌中MICA+肿瘤细胞通过PPAR/EHHADH介导的脂肪酸代谢调控巨噬细胞表型和功能的机制 | 首次发现MICA表达与EHHADH基因关联，并通过PPAR/EHHADH通路调控脂肪酸氧化，从而影响巨噬细胞M2样极化 | 研究主要基于肝癌组织，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 探究MICA表达与肿瘤相关巨噬细胞表型转换之间的关联及其代谢机制 | 肝细胞癌肿瘤组织和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, IHC染色, 生物信息学分析 | 共培养模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 组织染色图像 | TCGA数据库和收集的HCC肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3147 | 2025-10-06 |
Targeting Sodium Transport Reveals CHP1 Downregulation as a Novel Molecular Feature of Malignant Progression in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Insights from Integrated Multi-Omics Analyses
2025-Jul-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15071019
PMID:40723891
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示CHP1下调是透明细胞肾细胞癌恶性进展的新分子特征 | 首次发现钠离子转运相关基因CHP1在ccRCC恶性进展中的渐进性下调及其作为预后生物标志物的潜力 | 样本量相对有限（90个单细胞RNA-seq样本），需要进一步功能验证 | 构建ccRCC的细胞和转录组景观，研究恶性进展过程中的基因表达动态 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 多组学分析 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，蛋白质组学，免疫组化，分子对接，虚拟筛选 | 伪时间轨迹分析，Mfuzz聚类，细胞间通讯建模 | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据，免疫组化图像 | 90个单细胞RNA-seq样本，包含534,227个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 3148 | 2025-10-06 |
Chemoresistance Evolution in Ovarian Cancer Delineated by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146760
PMID:40725006
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示卵巢癌化疗耐药演变过程 | 首次在卵巢癌中利用单细胞转录组分析揭示化疗在不同肿瘤病灶部位对肿瘤微环境的重塑作用 | 样本来源仅限于卵巢癌患者，未验证其他癌症类型的普适性 | 研究化疗对卵巢癌肿瘤微环境的重塑机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自不同肿瘤病灶部位的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3149 | 2025-10-06 |
Renal Single-Cell RNA Sequencing and Digital Cytometry in Dogs with X-Linked Hereditary Nephropathy
2025-Jul-12, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15142061
PMID:40723524
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和数字细胞计数技术研究犬类X连锁遗传性肾病的肾脏细胞特征 | 首次在犬类XLHN模型中应用单细胞RNA测序技术，并利用机器学习驱动的数字细胞计数解析肾脏细胞组成变化 | 样本量较小（仅2只犬），仅使用死后肾脏皮质组织 | 探究犬类慢性肾脏病的细胞机制 | 患有X连锁遗传性肾病的犬类肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 数字细胞计数, 批量mRNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 2只犬（1只患病雄性，1只杂合子雌性），共13,190个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3150 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell Analysis Dissects Regulatory Mechanisms Underlying Tumor-Associated Macrophage Plasticity in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jul-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070817
PMID:40725473
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq分析，揭示肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的表观遗传异质性和调控机制 | 首次在肝细胞癌中构建了TAMs的高分辨率染色质可及性图谱，揭示了SPP1 TAMs亚型的预后意义及其表型转换的调控轨迹 | 样本量相对有限，需要更大规模队列验证发现 | 解析肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的表观遗传调控机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多区域分析, 伪时序分析 | 调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3151 | 2025-10-06 |
Gut Microbiome Alterations in Colorectal Cancer: Mechanisms, Therapeutic Strategies, and Precision Oncology Perspectives
2025-Jul-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17142294
PMID:40723178
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综述 | 探讨肠道微生物组改变在结直肠癌发病机制中的作用及微生物调控治疗策略 | 整合人工智能、单细胞/空间转录组学等新技术，提出微生物组衍生生物标志物用于结直肠癌精准诊疗的新视角 | 存在个体间差异性、因果推断困难和监管障碍等挑战 | 阐明肠道微生物组在结直肠癌发生发展中的作用机制及治疗策略 | 结直肠癌患者肠道微生物组 | 精准医学 | 结直肠癌 | 基因测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 人工智能 | NA | 微生物组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3152 | 2025-10-06 |
Precision Medicine in Hematologic Malignancies: Evolving Concepts and Clinical Applications
2025-Jul-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071654
PMID:40722725
|
综述 | 概述精准医学在血液系统恶性肿瘤中的基础技术、疾病特异性进展及新兴发展方向 | 系统整合分子分析技术、液体活检和微小残留病监测等工具，提出单细胞测序、空间转录组学和AI算法等新兴发展方向 | 存在成本高昂、可及性差异、标准化缺失及临床整合障碍等挑战 | 推动精准医学在血液肿瘤领域的临床转化与应用 | 急性髓系白血病、急性淋巴细胞白血病、慢性髓系白血病、慢性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤等血液恶性肿瘤 | 自然语言处理 | 血液系统恶性肿瘤 | 下一代测序(NGS)、全外显子组测序(WES)、RNA测序(RNA-seq)、表观基因组学分析、蛋白质组学分析、液体活检、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检 | NA | NA |
| 3153 | 2025-10-06 |
Identification of Glycolysis-Related Genes in MAFLD and Their Immune Infiltration Implications: A Multi-Omics Analysis with Experimental Validation
2025-Jul-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071636
PMID:40722708
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别了MAFLD中与糖酵解相关的关键基因，并探索了它们与免疫浸润的关系 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据，识别MAFLD中糖酵解相关关键基因及其与免疫浸润的相互作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；实验验证主要在动物模型中进行 | 识别驱动MAFLD进展的糖酵解相关关键基因，阐明其与免疫浸润的相互作用 | MAFLD患者和对照组的多组学数据，以及蛋氨酸胆碱缺乏饮食小鼠模型 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | MAFLD患者和对照组的多组学数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3154 | 2025-10-06 |
RGCN-BA: relational graph convolutional network with batch awareness for single-cell RNA sequencing clustering
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf378
PMID:40728858
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研究论文 | 提出一种结合批次感知的关系图卷积网络RGCN-BA，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 将细胞聚类和批次效应校正整合到统一深度学习框架中，通过关系图卷积网络处理批次信息作为不同边类型 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 开发能够同时处理单细胞RNA测序数据聚类和批次效应校正的统一方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 关系图卷积网络(RGCN) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3155 | 2025-10-06 |
Dynamic changes of synergy relationship between lncRNA and immune checkpoint in cancer progression
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf370
PMID:40728857
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研究论文 | 本研究通过整合免疫检查点和lncRNA-mRNA相互作用数据，构建了lncRNA-免疫检查点协同网络，揭示了在癌症进展中的动态协同关系 | 首次系统性地分析了lncRNA与免疫检查点在癌症进展中的阶段特异性协同关系，并验证了其在空间转录组数据中的一致性 | 研究基于计算预测和已有数据库，需要进一步实验验证具体的分子机制 | 探索lncRNA与免疫检查点在癌症进展中的协同作用机制 | 癌症患者和相关的lncRNA-免疫检查点协同网络 | 生物信息学 | 癌症 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，阶段特异性协同评分，空间转录组学验证 | 网络分析模型 | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3156 | 2025-10-06 |
PU.1 regulation of type 1 dendritic cell function via NF-κB pathway in inhibition of non-small cell lung cancer progression
2025-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.101154
PMID:40727943
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研究论文 | 本研究探讨转录因子PU.1通过NF-κB通路调控1型常规树突状细胞功能抑制非小细胞肺癌进展的机制 | 首次揭示PU.1通过NF-κB通路调控cDC1细胞功能在非小细胞肺癌中的抑癌作用 | 未明确说明样本数量和实验模型的具体类型 | 研究PU.1转录因子调控cDC1细胞功能及其在非小细胞肺癌治疗中的潜力 | 非小细胞肺癌组织中的1型常规树突状细胞(cDC1) | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序, CIBERSORT算法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3157 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Unveils Key Regulators and Signaling Pathways in Lung Adenocarcinoma Progression
2025-Jun-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071606
PMID:40722679
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌进展中的关键调控因子和信号通路 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘肺腺癌进展过程中上皮细胞特异性转录程序及肿瘤微环境内细胞间通讯的动态变化 | 研究基于多个患者队列但样本量有限，且未进行功能验证实验 | 解析肺腺癌进展过程中的细胞特异性转录调控机制和肿瘤微环境动态变化 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞 | 单细胞组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、谱系轨迹分析、转录调控网络重建 | 单细胞转录组数据 | 多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3158 | 2025-10-06 |
Identification of Immune Hub Genes in Obese Postmenopausal Women Using Microarray and Single-Cell RNA Seq Data
2025-Jun-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070783
PMID:40725440
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研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了绝经后肥胖女性脂肪组织中的免疫枢纽基因 | 首次结合WGCNA、PPI网络分析和单细胞RNA测序技术系统鉴定绝经后肥胖女性的免疫枢纽基因，并在斑马鱼模型中实验验证 | 基因名称在摘要中未完整显示，样本来源和数量信息不明确 | 阐明肥胖相关免疫失调的分子机制，寻找绝经后肥胖女性的潜在治疗靶点 | 绝经后肥胖女性的脂肪组织 | 生物信息学 | 肥胖症 | 微阵列, 单细胞RNA-seq, WGCNA, PPI分析, ssGSEA, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 微阵列, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3159 | 2025-10-06 |
Dissecting the Cellular Heterogeneity Underlying Liver Diseases Through the Integration of GWASs and Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jun-27, Biology
DOI:10.3390/biology14070777
PMID:40723338
|
研究论文 | 通过整合GWAS和单细胞RNA测序技术解析肝脏疾病的细胞异质性 | 首次将六种肝脏疾病的GWAS数据与约16.8万个人类肝细胞的单细胞转录组数据整合，使用scDRS方法揭示疾病相关遗传信号在非实质细胞中的特异性分布 | 研究主要关注遗传风险与细胞状态的关联，未涉及功能验证实验 | 解析肝脏疾病遗传风险的细胞特异性机制 | 人类肝脏细胞 | 生物信息学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, GWAS | scDRS | 基因组数据, 转录组数据 | 约168,000个肝细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3160 | 2025-10-06 |
Cell-Type Annotation for scATAC-Seq Data by Integrating Chromatin Accessibility and Genome Sequence
2025-Jun-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15070938
PMID:40723810
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研究论文 | 提出了一种整合染色质可及性和基因组序列的深度学习框架scAttG，用于单细胞ATAC测序数据的细胞类型注释 | 首次将图注意力网络和卷积神经网络结合，同时利用染色质可及性信号和基因组序列特征进行细胞类型注释 | 未明确说明模型在特定细胞类型或组织中的性能限制 | 开发更准确和稳健的单细胞ATAC测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | GAT, CNN | 基因组序列, 染色质可及性数据 | 多个scATAC-seq数据集 | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |