单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 22741 - 22760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22741 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of diverse immune phenotypes in malignant pleural effusion
2021-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27026-9
PMID:34795282
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌引起的恶性胸腔积液（MPE）中62,382个细胞的免疫表型多样性 | 首次详细描述了MPE中浸润免疫细胞的组成、谱系和功能状态，并发现了MPE中免疫细胞的转录特征和细胞间相互作用的新模式 | NA | 揭示恶性胸腔积液中免疫细胞的详细图谱，并增强对晚期非小细胞肺癌潜在诊断和治疗靶点的理解 | 非小细胞肺癌引起的恶性胸腔积液中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 62,382个细胞 |
| 22742 | 2024-08-08 |
Discriminative feature of cells characterizes cell populations of interest by a small subset of genes
2021-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009579
PMID:34797848
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研究论文 | 本文提出了一种新的细胞识别特征（DFC）方法，用于通过一小部分基因来表征感兴趣的细胞群体 | DFC方法通过使用带有自适应LASSO惩罚的逻辑回归进行二元分类和变量选择，能够优先考虑具有非独立表达的基因对，并有效捕捉细胞类型特异性标记 | DFC方法主要针对单细胞分析中的大样本量问题，可能不适用于所有类型的细胞分类任务 | 提出一种新的细胞识别方法，以替代传统的基于差异表达基因（DEG）的分析方法 | 研究对象为细胞群体及其特异性标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 逻辑回归 | 基因表达数据 | 文中未明确提及具体样本数量 |
| 22743 | 2024-08-08 |
Müller glial responses compensate for degenerating photoreceptors in retinitis pigmentosa
2021-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00693-w
PMID:34799683
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，探讨了视网膜色素变性模型（P23H）小鼠与野生型同窝小鼠中各主要视网膜细胞类型的细胞反应 | 发现Müller胶质细胞/星形胶质细胞簇中与视网膜维持相关的基因表达显著增加，表明Müller胶质细胞通过调整其转录组来支持视网膜细胞，这可能成为保护视网膜免于退化的潜在治疗靶点 | NA | 研究视网膜色素变性中视网膜细胞对视网膜细胞异常的反应 | 视网膜色素变性模型（P23H）小鼠与野生型同窝小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 视网膜色素变性模型（P23H）小鼠与野生型同窝小鼠 |
| 22744 | 2024-08-08 |
Landscape of Hopx expression in cells of the immune system
2021-Nov, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2021.e08311
PMID:34805566
|
研究论文 | 本文报道了在稳态条件下，多种免疫细胞中Hopx表达的综合模式 | 首次全面描述了Hopx在特定免疫细胞亚群中的组成性表达 | Hopx在常规树突状细胞和嗜酸性粒细胞中的表达未被研究 | 阐明Hopx在免疫细胞中的表达模式及其在多种免疫条件下的潜在作用 | CD4和CD8 T细胞、B细胞、自然杀伤细胞、NKT细胞和髓系细胞中的Hopx表达 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和流式细胞术分析 | NA | RNA | 多种类型的免疫细胞 |
| 22745 | 2024-08-08 |
Gene regulatory network analysis identifies key genes and regulatory mechanisms involved in acute myocardial infarction using bulk and single cell RNA-seq data
2021-09-09, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2021386
PMID:34814275
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研究论文 | 本研究利用批量和单细胞RNA测序数据分析基因调控网络，识别急性心肌梗死中的关键基因和调控机制 | 本研究首次结合批量和单细胞RNA测序数据构建基因调控网络和细胞间通信网络，揭示了PLAUR在心肌细胞响应缺氧中的重要作用 | 研究主要基于转录组数据，未涉及蛋白质水平或其他生物标志物的验证 | 识别急性心肌梗死的分子生物标志物，为诊断和预后提供候选关键调控基因 | 急性心肌梗死中的关键基因和调控机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | 基因调控网络 | RNA测序数据 | STEMI和NSTEMI患者的全血样本 |
| 22746 | 2024-08-08 |
MapCell: Learning a Comparative Cell Type Distance Metric With Siamese Neural Nets With Applications Toward Cell-Type Identification Across Experimental Datasets
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.767897
PMID:34796179
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研究论文 | 本文介绍了一种使用孪生神经网络（SNN）学习比较细胞类型距离度量（MapCell）的方法，并展示了其在跨实验数据集的细胞类型识别中的应用 | 提出了一种基于深度度量学习的方法，使用孪生神经网络来捕捉细胞间的相似性，并促进不同实验间细胞类型注释的转移 | NA | 探索深度度量学习方法在跨实验数据集细胞类型识别中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 孪生神经网络（SNN） | 数据集 | 小规模训练集 |
| 22747 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing deconvolutes the in vivo heterogeneity of human bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.61950
PMID:34803492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了人骨髓来源间充质干细胞的细胞异质性 | 首次系统地剖析了人骨髓来源间充质干细胞的细胞亚型，揭示了其细胞异质性及其在维持骨骼稳态中的作用 | NA | 探究人骨髓来源间充质干细胞的转录多样性 | 人骨髓来源间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自两名人类受试者的CD271骨髓单个核细胞 |
| 22748 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity of Tumor-Associated Macrophage in Non-Small Cell Lung Cancer and Differences Between Sexes
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.756722
PMID:34804043
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在性别间的差异 | 首次在单细胞水平上详细分析了非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的亚型组成和功能异质性，并比较了性别对其的影响 | 研究仅限于早期吸烟的非小细胞肺癌患者，可能无法完全代表所有非小细胞肺癌患者的情况 | 阐明非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的亚型组成和功能异质性，并探讨性别对其的影响 | 非小细胞肺癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 早期吸烟的非小细胞肺癌患者 |
| 22749 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals a Tumor-Reactive T Cell Signature Associated With Clinical Outcome and Immunotherapy Response In Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.758288
PMID:34804045
|
研究论文 | 本研究通过整合分析三个黑色素瘤中T细胞的单细胞RNA测序数据集，揭示了肿瘤微环境中T细胞的广泛异质性功能状态，并识别出表达肿瘤反应性标记和T细胞激活标志的肿瘤反应性T细胞亚群 | 本研究首次开发并验证了一个与临床结果和免疫治疗反应显著相关的肿瘤反应性T细胞相关标志（TRS），该标志在预测免疫治疗反应方面优于CD8+ T细胞浸润水平和先前发表的预后相关标志 | NA | 旨在识别肿瘤反应性T细胞并开发一个与临床结果和免疫治疗反应相关的标志 | 黑色素瘤中的T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个黑色素瘤T细胞数据集及四个外部独立队列 |
| 22750 | 2024-08-08 |
Clinical Impact of Molecular Subtyping of Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743908
PMID:34805152
|
研究论文 | 本文探讨了胰腺癌分子亚型对临床的影响及其潜在的临床意义 | 文章介绍了通过激光捕获显微切割和单细胞RNA测序技术揭示的胰腺癌细胞群体的基因组进化，以及不同亚型在化疗反应和生存率上的差异 | 文章未明确提及具体的局限性 | 研究胰腺癌分子亚型的临床相关性，以优化从实验室到临床的转化 | 胰腺癌的分子亚型及其对治疗反应和生存率的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22751 | 2024-08-08 |
Papillary Thyroid Carcinoma Landscape and Its Immunological Link With Hashimoto Thyroiditis at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.758339
PMID:34805166
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PTC的肿瘤微环境异质性及其与HT的免疫学联系 | 样本量较小，仅包括八名PTC患者，其中三名同时患有HT | 深入理解PTC的肿瘤微环境及其与HT的免疫学联系 | 甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的关系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八名PTC患者，其中三名同时患有HT |
| 22752 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Network of Peripartum Decidua that Orchestrates Delivery
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.770621
PMID:34805176
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研究论文 | 本研究通过CellCall方法基于围产期蜕膜的scRNA-seq数据重建了蜕膜细胞间的通信网络，并分析了其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 首次系统地解码了围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其内部级联反应，并探讨了其在分娩中的作用 | NA | 旨在理解妊娠维持和分娩过渡中蜕膜细胞间通信的机制 | 围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq, 单细胞BCR/TCR测序 | CellCall方法 | 单细胞RNA测序数据 | 围产期蜕膜样本 |
| 22753 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Revealed a Critical Role of SPP1/CD44-Mediated Crosstalk Between Macrophages and Cancer Cells in Glioma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.779319
PMID:34805184
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了高级别胶质瘤中SPP1/CD44介导的巨噬细胞与癌细胞间的交叉对话在肿瘤进展中的关键作用 | 本研究首次揭示了SPP1/CD44信号轴在高级别胶质瘤进展中的重要作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | NA | 旨在识别驱动高级别胶质瘤肿瘤异质性的细胞和分子机制 | 高级别胶质瘤中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个高级别胶质瘤样本 |
| 22754 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneity and tumorigenesis of BRCA1 deficient mammary tumors via single cell RNA sequencing
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63995
PMID:34815798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生机制 | 本研究首次将BRCA1缺陷型乳腺肿瘤分为四个亚型，并揭示了肿瘤内异质性的主要原因，包括细胞增殖、DNA损伤反应/修复和上皮-间质转化（EMT）的活性差异 | NA | 全面阐明BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生和进展的潜在机制 | BRCA1缺陷型乳腺肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自敲除小鼠的乳腺腺体细胞和乳腺肿瘤细胞 |
| 22755 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of cell composition and origin identified by single-cell transcriptomics in renal cysts of patients with autosomal dominant polycystic kidney disease
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.57220
PMID:34815804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿细胞组成和来源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了多囊肾囊肿可能来源于集合管或同时来源于近端小管和亨利环，并发现不同来源的囊肿上皮细胞具有不同的基因集激活 | 研究样本仅来自一名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索常染色体显性多囊肾病肾囊肿的细胞组成和来源 | 常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一名患者的正常肾组织和七个囊肿 |
| 22756 | 2024-08-08 |
Characterization of Alzheimer's Disease-Associated Excitatory Neurons via Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2021, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2021.742176
PMID:34819847
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研究论文 | 本研究利用公开的单核RNA测序数据集，在5XFAD转基因模型和野生型小鼠中揭示了与阿尔茨海默病相关的兴奋性神经元群体（C3:Ex.Neuron）的特征 | 首次详细描述了阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征，并识别出一种先前未被发现的兴奋性神经元亚型（C3.1） | NA | 探索阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征 | 阿尔茨海默病中的兴奋性神经元群体 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 5XFAD转基因模型和野生型小鼠 |
| 22757 | 2024-08-08 |
Development of an Autophagy-Based and Stemness-Correlated Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Using Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743910
PMID:34820373
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研究论文 | 本研究开发了一种基于自噬和干细胞相关性的肝细胞癌预后模型，使用批量和单细胞RNA测序数据 | 首次结合批量和单细胞RNA测序数据，构建了基于自噬相关基因的肝细胞癌预后模型，并验证了其预测效能 | 研究仅在ICGC和TCGA数据库中验证了预后模型的效能，未来需在更多独立数据集中进行验证 | 开发和验证一种新的肝细胞癌预后模型，以提高患者生存预测的准确性 | 肝细胞癌（HCC）及其自噬相关基因和干细胞特性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 使用了ICGC和TCGA数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22758 | 2024-08-08 |
Prediction of Non-canonical Routes for SARS-CoV-2 Infection in Human Placenta Cells
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.614728
PMID:34820418
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研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2在人类胎盘细胞中的非经典感染途径 | 发现了胎盘细胞中可能作为SARS-CoV-2非经典感染途径的蛋白质 | NA | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制机制 | 人类胎盘细胞中的SARS-CoV-2感染途径 | NA | COVID-19 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22759 | 2024-08-08 |
Effectively Clustering Single Cell RNA Sequencing Data by Sparse Representation
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3128576
PMID:34788219
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法SPARC，通过稀疏表示系数来测量细胞间的关系，并开发了一种异常值检测方法以辅助参数选择 | SPARC方法引入了一种新的相似性度量，利用每个细胞相对于其他细胞的稀疏表示系数来衡量细胞间的关系，并开发了异常值检测方法以帮助参数选择 | NA | 研究如何更有效地对单细胞RNA测序数据进行聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二个真实数据集 |
| 22760 | 2024-08-08 |
The effects of TNF-α/TNFR2 in regulatory T cells on the microenvironment and progression of gastric cancer
2022-04-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33873
PMID:34766338
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研究论文 | 研究探讨了TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | 揭示了TNFR2 Tregs在肿瘤微环境中高浸润水平，并处于激活和效应状态，为胃癌治疗提供了新的理论基础 | NA | 探索TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 多色免疫荧光、单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |