单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 22701 - 22720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22701 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Using Machine Learning Techniques and Its Application to Medical Research
2021-Oct-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9111513
PMID:34829742
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综述 | 本文综述了机器学习技术在单细胞分析中的应用及其在医学研究中的重要性 | 介绍了机器学习技术如何解决单细胞分析中的批次效应和转录噪音等问题，并展示了其在单细胞多组学分析中的应用 | 未明确提及具体的研究限制 | 探讨机器学习技术在单细胞分析中的应用及其对医学研究的贡献 | 单细胞分析技术及其在癌症研究中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习技术 | 单细胞数据 | NA |
| 22702 | 2024-08-08 |
Identification of Differentially Expressed Genes in Different Glioblastoma Regions and Their Association with Cancer Stem Cell Development and Temozolomide Response
2021-Oct-20, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11111047
PMID:34834399
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研究论文 | 本研究旨在识别与替莫唑胺（TMZ）耐药和胶质母细胞瘤（GBM）复发相关的潜在靶基因 | 通过基因集富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络，识别了与肿瘤复发和TMZ耐药相关的新基因集 | 研究主要基于TCGA和本地队列的数据，可能存在样本选择的偏倚 | 识别与胶质母细胞瘤复发和替莫唑胺耐药相关的基因，为治疗提供新的分子策略 | 胶质母细胞瘤患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 脑癌 | 基因表达谱分析 | 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 包括TCGA的154个原发和13个复发肿瘤样本，本地队列的29个原发和4个复发肿瘤样本，以及Gene Expression Omnibus数据集的3589个单细胞RNA测序数据 |
| 22703 | 2024-08-08 |
Percutaneous Microwave Coagulation Therapy: A Promising Therapeutic Method for Breaking the Barrier of the Intertumor Heterogeneity
2021, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2021/7773163
PMID:34840703
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析四名肺癌患者的肿瘤微环境，并使用经皮微波凝固疗法治疗，结果显示该疗法能有效应对肿瘤间异质性 | 首次研究经皮微波凝固疗法解决肿瘤间异质性的能力 | 样本量较小，仅限于四名肺癌患者 | 探讨经皮微波凝固疗法在应对肿瘤间异质性方面的效果 | 四名肺癌患者的肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四名肺癌患者 |
| 22704 | 2024-08-08 |
Novel omics technology driving translational research in precision oncology
2021, Advances in genetics
DOI:10.1016/bs.adgen.2021.08.003
PMID:34844717
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综述 | 本文总结了癌症研究面临的当前挑战，并推动使用新型基因组学解决方案，全面概述了三种最近的基因组学技术：液体活检、单细胞RNA测序和空间转录组学 | 介绍了三种新型基因组学技术及其在精准肿瘤学中的应用 | NA | 推动精准肿瘤学的转化研究 | 癌症及其相关基因组学技术 | 数字病理学 | NA | 液体活检、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 22705 | 2024-08-08 |
The Roles of IL-7 and IL-15 in Niches for Lymphocyte Progenitors and Immune Cells in Lymphoid Organs
2021, Current topics in microbiology and immunology
DOI:10.1007/978-3-030-86016-5_4
PMID:34850283
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研究论文 | 本文探讨了IL-7和IL-15在淋巴组织中对淋巴细胞前体和免疫细胞的作用 | 建立了IL-7和IL-15报告鼠系，成功检测到这两种细胞因子的表达，并利用单细胞RNA测序分析了淋巴组织中不同亚群的基质细胞 | 仍需进一步研究以阐明哪些基质细胞在骨髓中作为ILCs和NK细胞早期前体的niche | 研究IL-7和IL-15在淋巴组织中的作用及其对免疫细胞发育和维持的影响 | IL-7和IL-15在淋巴组织中的表达及其功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用特定细胞类型敲除鼠进行分析 |
| 22706 | 2024-08-08 |
A deficient MIF-CD74 signaling pathway may play an important role in immunotherapy-induced hyper-progressive disease
2023-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-021-09672-3
PMID:34797429
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）中的免疫细胞特征 | 首次发现HPD组中CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs）的富集以及CD74-MIF信号通路的缺失 | 研究仅限于体外实验，需要进一步的临床验证 | 探究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）的生物学机制 | 从健康对照和肿瘤患者的外周血单个核细胞（PBMC）中分离的CD3+细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 健康对照和接受免疫治疗的肿瘤患者的PBMC样本 |
| 22707 | 2024-08-08 |
Endothelial TRPV4-eNOS coupling as a vital therapy target for treatment of hypertension
2022-05, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.15755
PMID:34822720
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研究论文 | 研究探讨了内皮细胞中TRPV4与eNOS的相互作用及其在高血压治疗中的潜在作用 | 首次整合单细胞RNA测序、单细胞功能研究和药物筛选于大动脉中，并设计了小分子药物JNc-463以改善高血压中的TRPV4-eNOS相互作用 | NA | 探索TRPV4与eNOS在大动脉中的相互作用及其在高血压中的作用 | 内皮细胞中的TRPV4与eNOS相互作用 | NA | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用TRPV4EC-/-小鼠模型和JNc-463小分子药物进行研究 |
| 22708 | 2024-08-08 |
Deciphering the Dynamic Molecular Program of Radiation-Induced Endothelial Senescence
2022-03-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2021.11.019
PMID:34808254
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研究论文 | 本研究通过系统生物学方法，解析了辐射诱导的内皮细胞衰老相关的动态转录程序。 | 首次揭示了辐射诱导内皮细胞早衰过程中白细胞介素-1信号通路的关键作用，以及内皮细胞向间充质细胞转化的过程。 | 研究主要集中在体外实验，辐射对内皮细胞衰老的影响还需体内实验进一步验证。 | 探究辐射诱导内皮细胞衰老的动态分子机制及其对正常组织损伤的影响。 | 辐射诱导的内皮细胞衰老及其相关分子程序。 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的内皮细胞样本 |
| 22709 | 2024-08-08 |
Induced cell-autonomous neutropenia systemically perturbs hematopoiesis in Cebpa enhancer-null mice
2022-03-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005851
PMID:34814180
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研究论文 | 研究Cebpa增强子缺失小鼠模型中，细胞自主性中性粒细胞减少如何系统性地干扰造血过程 | 首次揭示了Cebpa增强子缺失导致的细胞自主性中性粒细胞减少对造血干细胞的静止状态和造血过程的系统性影响 | NA | 探讨Cebpa增强子缺失对造血干细胞数量和造血过程的影响及其机制 | Cebpa增强子缺失小鼠的骨髓和造血干细胞 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 涉及Cebpa增强子缺失小鼠和野生型小鼠的骨髓移植实验 |
| 22710 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome of mesenchymal stromal cells to fabricate bioactive hydroxyapatite materials for bone regeneration
2022-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.009
PMID:34820571
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了间充质基质细胞在三维羟基磷灰石支架和成骨培养基中的转录景观，以探索骨再生材料的生物活性 | 本文揭示了羟基磷灰石支架中类似于软骨内骨化的成骨过程，并阐明了成骨培养基介导的成骨机制，为改善成骨生物材料提供了新见解 | NA | 研究骨修复材料的成骨微环境，以加速骨再生 | 间充质基质细胞在羟基磷灰石支架和成骨培养基中的转录景观 | 数字病理学 | 骨疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22711 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Human Dental Pulp Stem Cell and Human Periodontal Ligament Stem Cell
2022-Feb, Journal of endodontics
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.joen.2021.11.005
PMID:34801591
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞的特征及异质性 | 本研究首次在单细胞水平上探讨了人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞的转录组特征及其差异 | 研究样本仅来自两个无龋齿的前磨牙，样本量较小 | 探讨人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞在单细胞水平的转录组特征及其差异 | 人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2个无龋齿的前磨牙 |
| 22712 | 2024-08-08 |
Bringing precision oncology to cellular resolution with single-cell genomics
2022-02, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-021-10129-4
PMID:34807338
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综述 | 本文概述了单细胞癌症测序领域的发展，并提供了一个路线图，将这些技术从研究工具转变为向临床肿瘤学家提供高分辨率、治疗导向细节的诊断仪器。 | 单细胞测序技术的发展为理解癌症的病因、发病机制和治疗反应性提供了新的见解，并开始为肿瘤内临床相关的亚群提供生物标志物和药物靶点。 | 目前这些技术主要集中在基础肿瘤生物学研究，尚未广泛应用于临床诊断。 | 将单细胞测序技术从研究工具发展为临床诊断仪器，提供高分辨率的治疗导向细节。 | 单细胞测序技术在癌症研究中的应用及其向临床诊断的转化。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 22713 | 2024-08-08 |
circRNAome profiling reveals circFgfr2 regulates myogenesis and muscle regeneration via a feedback loop
2022-02, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12859
PMID:34811940
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研究论文 | 本研究通过环状RNA组分析揭示了circFgfr2通过反馈环路调控肌生成和肌肉再生的机制。 | 首次揭示了circFgfr2在肌生成和肌肉再生中的作用及其通过miR-133/Map3k20/JNK/Klf4反馈环路的调控机制。 | NA | 探究环状RNA在肌生成和骨骼肌发育中的动态表达、功能和机制。 | 环状RNA circFgfr2及其在肌生成和肌肉再生中的作用。 | RNA研究 | NA | RNA测序（RNA-seq）、微阵列、RT-qPCR、western blotting、双荧光素酶活性测定、RNA免疫沉淀、RNA荧光原位杂交、染色质免疫沉淀 | NA | RNA | 52,918个高可信度环状RNA，其中2916个在人、小鼠和猪中保守 |
| 22714 | 2024-08-08 |
HMGB1/Foxp1 regulates hypoxia-induced inflammatory response in macrophages
2022-Feb, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11728
PMID:34816539
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研究论文 | 本研究探讨了高迁移率族蛋白B1（HMGB1）及其靶基因叉头框蛋白P1（Foxp1）在心肌梗死（MI）模型中巨噬细胞的炎症反应中的作用 | 首次研究了Foxp1在心肌梗死中巨噬细胞的作用，并验证了HMGB1通过下调Foxp1加剧巨噬细胞的炎症反应 | NA | 研究HMGB1和Foxp1在心肌梗死中巨噬细胞炎症反应中的作用 | 心肌梗死模型中巨噬细胞的HMGB1和Foxp1基因 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE136088数据集 |
| 22715 | 2024-08-08 |
Emerging Single-cell Approaches to Understand HIV in the Central Nervous System
2022-02, Current HIV/AIDS reports
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11904-021-00586-7
PMID:34822063
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综述 | 本综述重点介绍了与HIV在中枢神经系统（CNS）转化研究相关的新兴单细胞测序方法，总结了CNS中HIV的有限单细胞研究，并讨论了未来HIV转化CNS研究的机会 | 利用单细胞技术的新方法在基因组、蛋白质组、转录组和表观基因组研究中提高了分辨率和深度。单细胞分析可以揭示HIV感染者CNS的扰动，并有助于揭示CNS中隐藏的HIV库的分子身份 | NA | 探讨HIV在中枢神经系统中的研究进展和未来研究方向 | HIV在中枢神经系统中的单细胞研究 | NA | HIV | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22716 | 2024-08-08 |
Pathogenic Mechanisms Underlying Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-01-24, Annual review of pathology
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化（IPF）的发病机制，涉及细胞类型和信号通路的复杂相互作用 | 近期单细胞RNA测序研究揭示了一种具有异常基底细胞特征的新型AEC，可能干扰正常的上皮修复并促进促纤维化表型 | NA | 探讨IPF的发病机制，利用新型生物信息学工具发现疾病通路、细胞特异性机制和细胞间相互作用 | 特发性肺纤维化的发病机制 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22717 | 2024-08-08 |
Peanut oral immunotherapy differentially suppresses clonally distinct subsets of T helper cells
2022-01-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI150634
PMID:34813505
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和配对的T细胞受体α/β测序，评估了12名花生过敏患者在口服免疫治疗（OIT）过程中CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞的转录组 | 本研究首次揭示了OIT过程中不同临床反应与花生反应性CD4+ T细胞的预先存在特征以及Th2细胞亚群的抑制之间的关系 | 本研究仅涉及12名患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨口服免疫治疗（OIT）对花生过敏患者临床结果的免疫学基础 | 花生过敏患者的CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序，T细胞受体α/β测序 | NA | 转录组数据 | 12名花生过敏患者 |
| 22718 | 2024-08-08 |
Comparative Proteome Signatures of Trace Samples by Multiplexed Data-Independent Acquisition
2022-01, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100177
PMID:34793982
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研究论文 | 本文结合DIA和Tandem-Mass-Tag（TMT）-multiplexing两种分析策略，开发了一种新的、独立于鉴定的蛋白质组数据分析流程，用于从超低输入样本中生成高度可重复的、定量的蛋白质组特征 | 本文开发了一种新的、独立于鉴定的蛋白质组数据分析流程，允许在数百个样本中定量比较DIA-TMT蛋白质组特征，无需考虑其生物学来源，以识别细胞类型和单个蛋白质敲除 | NA | 旨在通过结合DIA和TMT-multiplexing技术，提高单细胞蛋白质组分析的可重复性和定量性 | 超低输入样本的蛋白质组特征 | 蛋白质组学 | NA | DIA和Tandem-Mass-Tag（TMT）-multiplexing | NA | 蛋白质组数据 | 数百个样本 |
| 22719 | 2024-08-08 |
Macrophage-Targeted Therapy Unlocks Antitumoral Cross-talk between IFNγ-Secreting Lymphocytes and IL12-Producing Dendritic Cells
2022-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0326
PMID:34795032
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研究论文 | 本研究评估了使用BLZ945（一种小分子CSF1R抑制剂）治疗的小鼠肺肿瘤免疫微环境，通过单细胞RNA测序和机制验证方法，揭示了CSF1R靶向治疗如何重塑CSF1R细胞景观并激活抗肿瘤细胞间的交叉对话。 | 首次展示了CSF1R靶向治疗不仅通过细胞耗竭，而是通过重塑CSF1R细胞景观来激活抗肿瘤细胞间的交叉对话，包括IFNγ产生的自然杀伤细胞和T细胞以及IL12产生的树突状细胞。 | 研究主要在动物模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探讨CSF1R抑制剂在肺肿瘤免疫治疗中的作用机制。 | 小鼠肺肿瘤中的免疫细胞，特别是CSF1R细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 免疫学 | 肺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 22720 | 2024-08-08 |
Early lung carcinogenesis and tumor microenvironment observed by single-cell transcriptome analysis
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101277
PMID:34800916
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究了从不吸烟患者的肺磨玻璃结节（GGN）和正常肺组织中观察到的早期肺癌发生和肿瘤微环境 | 首次揭示了肺癌细胞中与小泡处理和表面活性物质稳态相关的基因集富集，以及肿瘤微环境中免疫细胞的特定变化 | 研究样本仅来自6名从不吸烟的患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期肺癌发生过程中癌细胞特异性标志物和肿瘤微环境的变化 | 从不吸烟患者的肺磨玻璃结节和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11个肺磨玻璃结节和正常肺组织样本，来自6名从不吸烟患者 |