单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 22781 - 22800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22781 | 2024-08-08 |
Dynamic regulatory networks of T cell trajectory dissect transcriptional control of T cell state transition
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.10.011
PMID:34786214
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研究论文 | 本研究基于非小细胞肺癌中的T细胞单细胞转录组数据，提出了一种构建动态调控网络的方法，以解析T细胞状态转换的过程 | 本研究揭示了T细胞状态转换过程中频繁的调控交互重连，并进一步细化了介导每个状态转换的关键调控因子 | NA | 探究T细胞状态转换的分子调控机制 | T细胞在非小细胞肺癌中的功能状态转换 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组 | 动态调控网络 | 转录组数据 | NA |
| 22782 | 2024-08-08 |
Comprehensive analyses of bioinformatics applications in the fight against COVID-19 pandemic
2021-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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review | 本文全面总结了基于现有报告的生物信息学技术在COVID-19相关研究中的重要方法和应用 | 利用生物信息学方法，如下一代测序(NGS)和第三代测序(TGS)技术，分子动力学模拟，分子对接和人工智能(AI)技术，加速了病毒检测、药物开发和疫苗研究 | NA | 深入理解新冠病毒的基因组和蛋白质特征，临床诊断，致病机制，以及抗病毒药物和疫苗的开发 | 新冠病毒的基因组和蛋白质特征，临床诊断，致病机制，抗病毒药物和疫苗 | bioinformatics | COVID-19 | NGS, TGS, molecular dynamics simulation, molecular docking, AI | NA | genome sequence, protein structure | 超过228 million COVID-19感染病例 |
| 22783 | 2024-08-08 |
Desmosterol suppresses macrophage inflammasome activation and protects against vascular inflammation and atherosclerosis
2021-11-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2107682118
PMID:34782454
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研究论文 | 本文研究了胆固醇生物合成中间产物脱氢表雄酮在巨噬细胞中的作用，及其对血管炎症和动脉粥样硬化的保护作用 | 首次揭示了脱氢表雄酮在动脉粥样硬化病变中作为整合胆固醇稳态和免疫反应的关键分子，通过调节巨噬细胞功能来抑制炎症 | NA | 探讨脱氢表雄酮在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | 巨噬细胞和动脉粥样硬化病变 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 脂质组学和转录组学分析 | NA | 细胞 | 从动脉粥样硬化斑块中分离的CD45CD11b细胞 |
| 22784 | 2024-08-08 |
Characterization of normal and cancer stem-like cell populations in murine lingual epithelial organoids using single-cell RNA sequencing
2021-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01783-5
PMID:34785704
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠舌上皮类器官中正常和癌症干细胞样细胞群体的特征 | 揭示了舌癌中具有干细胞特性的异质细胞群体与正常干细胞群体的不同特征，为开发新型分子靶向治疗提供了依据 | NA | 开发基于特定基因表达谱的舌癌分子靶向治疗 | 小鼠舌上皮类器官中的正常和癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 舌癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 22785 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq highlights a specific carcinoembryonic cluster in ovarian cancer
2021-11-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04358-4
PMID:34775482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探索卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织的异质性，并识别关键的细胞簇和标记物，构建预测模型评估卵巢癌的预后 | 发现了与胚胎相似的卵巢癌恶性上皮细胞簇PEG10 EME，该细胞簇与不良生存率相关，并可能通过NOTCH通路影响癌症干细胞的自我更新和顺铂耐药性 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示卵巢癌的异质性，寻找有效的预后标志物和治疗策略 | 卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类算法 | 基因表达数据 | 卵巢癌、正常卵巢和胚胎组织样本 |
| 22786 | 2024-08-08 |
Immune cell and TCR/BCR repertoire profiling in systemic lupus erythematosus patients by single-cell sequencing
2021-11-12, Aging
DOI:10.18632/aging.203695
PMID:34772824
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研究论文 | 本研究利用单细胞5' RNA测序和单细胞T细胞受体(TCR)/B细胞受体(BCR)测序技术，分析了系统性红斑狼疮(SLE)患者及其对照组的免疫细胞和TCR/BCR谱系 | 首次详细描述了SLE患者中免疫细胞的转录组和TCR/BCR免疫谱系特征 | 样本量较小，仅包括十名SLE患者及其对照组 | 探索SLE患者中免疫细胞及其TCR/BCR谱系的表达和分布，以更好地理解这一致命的自身免疫疾病 | 系统性红斑狼疮患者的免疫细胞和TCR/BCR谱系 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞5' RNA测序，单细胞TCR/BCR测序 | NA | RNA序列数据 | 10名SLE患者及其对照组 |
| 22787 | 2024-08-08 |
Ionizing irradiation-induced Fgr in senescent cells mediates fibrosis
2021-Nov-12, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00741-4
PMID:34772919
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研究论文 | 研究了辐射诱导的细胞衰老在放射性肺纤维化中的作用及其机制 | 首次揭示了辐射诱导的衰老细胞中Fgr激酶的上调在放射性肺纤维化中的作用 | 仅在体外和小鼠模型中进行了实验，需要进一步的人体研究验证 | 探讨细胞衰老在放射性肺纤维化中的作用及机制 | 辐射诱导的衰老tdTOMp16阳性间充质干细胞 | NA | 肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNAseq) | NA | RNA | 小鼠肺部样本 |
| 22788 | 2024-08-08 |
Deciphering intratumoral heterogeneity using integrated clonal tracking and single-cell transcriptome analyses
2021-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26771-1
PMID:34764253
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研究论文 | 本文介绍了一种综合实验系统，通过整合单细胞转录组分析和基于DNA条形码的克隆追踪，研究肿瘤内异质性与癌细胞生长、转移和治疗反应的关系。 | 本文创新性地将单细胞转录组分析与DNA条形码克隆追踪相结合，以揭示肿瘤内异质性的分子和细胞基础。 | NA | 研究肿瘤内异质性与疾病进展和治疗抵抗的分子和细胞基础。 | 白血病细胞的基因表达与化疗反应的关系，以及特定基因表达细胞驱动的白血病扩展。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠模型 |
| 22789 | 2024-08-08 |
Deciphering cell lineage specification of human lung adenocarcinoma with single-cell RNA sequencing
2021-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26770-2
PMID:34764257
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了25名肺腺癌患者的268,471个细胞，揭示了肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性及其转录特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了肺腺癌从癌前病变到侵袭性癌的细胞异质性和分子事件 | NA | 揭示肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性和转录特征 | 肺腺癌患者的细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 268,471个细胞，来自25名患者 |
| 22790 | 2024-08-08 |
COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2021-Nov-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.10.023
PMID:34767776
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22791 | 2024-08-08 |
IRF3 Knockout Results in Partial or Complete Rejection of Murine Mesothelioma
2021-Nov-07, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10215196
PMID:34768716
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研究论文 | 研究IRF3敲除对小鼠间皮瘤的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次探讨IRF3在间皮瘤中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | NA | 探索IRF3敲除对小鼠间皮瘤的治疗潜力及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 | NA | 间皮瘤 | 流式细胞术，scRNA-Seq | NA | mRNA表达数据 | 多种小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 |
| 22792 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity and Functional Diversity of Lymphatic Endothelial Cells
2021-Nov-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111976
PMID:34769408
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示淋巴内皮细胞异质性和功能多样性方面的最新发现 | 结合单细胞RNA测序数据与成像和深入的功能实验，推进对健康和疾病中淋巴内皮细胞的了解 | 对慢性炎症疾病中淋巴内皮细胞异质性和功能多样性的知识有限 | 总结单细胞RNA测序在淋巴血管生物学领域的新发现，并探讨淋巴内皮细胞作为慢性炎症疾病新治疗靶点的可能性 | 淋巴内皮细胞的异质性、功能多样性及其与其他细胞的相互作用 | 数字病理学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22793 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis of Human Small Antral Follicles
2021-Nov-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111955
PMID:34769386
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征 | 首次描述了小腔卵泡中卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征，并探讨了不同信号通路在卵母细胞和颗粒细胞间的双向配体-受体相互作用 | NA | 揭示小腔卵泡的多样性，并填补人类卵泡发育和卵子发生分子景观图谱的空白 | 人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（SmartSeq2） | NA | 转录组数据 | 多个个体的小腔卵泡 |
| 22794 | 2024-08-08 |
Activated but impaired IFN-γ production of mucosal-associated invariant T cells in patients with hepatocellular carcinoma
2021-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003685
PMID:34789552
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）在肝细胞癌（HCC）患者中的功能和特征 | 首次详细描述了HCC患者中窦内MAIT细胞的功能和表型特征 | 研究仅限于外周血和肝脏样本，未涉及其他组织或器官 | 研究HCC患者中MAIT细胞的功能和表型变化 | HCC患者的外周血和肝脏中的MAIT细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | HCC患者和健康对照者的外周血和肝脏样本 |
| 22795 | 2024-08-08 |
Identification of astroglia-like cardiac nexus glia that are critical regulators of cardiac development and function
2021-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001444
PMID:34793438
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research paper | 本文通过荧光时间流逝成像、命运图谱和突变生成在斑马鱼模型中，鉴定了一种神经嵴来源的胶质细胞，称为nexus胶质细胞，该细胞利用Meteorin信号通过Jak/Stat3途径驱动分化并调节心率和节律。 | 首次在斑马鱼模型中鉴定出一种神经嵴来源的nexus胶质细胞，并揭示其在心脏发育和功能中的关键作用。 | NA | 研究nexus胶质细胞在心脏发育和功能中的作用及其分子机制。 | nexus胶质细胞及其在心脏中的功能。 | NA | NA | confocal time-lapse imaging, fate mapping, single-cell sequencing | NA | image, sequencing data | 涉及人类和鼠类心脏的单细胞测序数据 |
| 22796 | 2024-08-08 |
Rapid Isolation of Single Cells from Mouse and Human Teeth
2021-10-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63043
PMID:34779437
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研究论文 | 本文介绍了一种快速协议，用于从鼠和人类的牙齿中高效分离单细胞，适用于单细胞RNA测序 | 该协议通过加速组织分离步骤、酶消化和后续的单细胞悬液制备，实现了快速且温和的组织处理，适用于富含细胞外基质的组织 | NA | 开发一种快速且高效的单细胞分离方法，适用于单细胞转录组学研究 | 鼠和人类的牙齿组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 细胞 | 多个鼠和人类样本 |
| 22797 | 2024-08-08 |
Transcriptional Differences in Lipid-Metabolizing Enzymes in Murine Sebocytes Derived from Sebaceous Glands of the Skin and Preputial Glands
2021-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111631
PMID:34769061
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序方法比较了来自皮肤皮脂腺和包皮腺的小鼠皮脂细胞，揭示了两者在脂质代谢酶表达水平上的显著差异 | 发现了皮肤皮脂腺和包皮腺皮脂细胞在特定脂质类生物合成途径中基因表达的显著差异，特别是涉及甲羟戊酸途径和鞘脂回收途径的酶编码基因 | 使用包皮腺作为皮肤皮脂腺的研究模型存在局限性，需要在实验设计前仔细考虑两者之间的差异 | 比较皮肤皮脂腺和包皮腺的皮脂细胞，揭示两者之间的相似性和差异 | 小鼠皮肤皮脂腺和包皮腺的皮脂细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22798 | 2024-08-08 |
The Epithelial and Stromal Immune Microenvironment in Gastric Cancer: A Comprehensive Analysis Reveals Prognostic Factors with Digital Cytometry
2021-Oct-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13215382
PMID:34771544
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研究论文 | 本文通过数字细胞计量技术分析胃癌中的上皮和间质免疫微环境，构建了一个新的特征矩阵，利用单细胞RNA测序数据集和细胞混合反卷积方法，从批量转录组数据中估计不同上皮、间质和免疫细胞的比例，并识别出胃癌的强预后因子。 | 本文构建了一个新的特征矩阵来解析上皮和间质信号，并应用细胞混合反卷积方法从批量转录组数据中估计细胞比例，识别出胃癌的独立预后因子STEM评分。 | NA | 研究胃癌中的上皮和间质免疫微环境，识别预后因子。 | 胃癌患者的上皮、间质和免疫细胞比例及其预后影响。 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 四个独立的胃癌队列（GSE62254, GSE15459, GSE84437, TCGA-STAD） |
| 22799 | 2024-08-08 |
Epithelial-to-Mesenchymal Transition-Derived Heterogeneity in Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2021-Oct-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13215355
PMID:34771518
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综述 | 本文综述了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中由上皮间质转化（EMT）引起的异质性及其对治疗反应的影响 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了与细胞周期、细胞应激、缺氧、上皮分化及部分上皮间质转化（pEMT）相关的RNA表达特征，这些特征与不良临床特征相关 | NA | 探讨HNSCC中分子异质性的机制及其对治疗反应的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的上皮间质转化（EMT）及其相关分子特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 22800 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulation dynamics from static snapshots of gene expression variability
2021-Oct, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.104.044406
PMID:34781497
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研究论文 | 本文展示了如何利用基因表达变异性的静态群体快照来严格推断基因表达动力学的特性 | 本文提出了一种利用荧光蛋白不同成熟时间的双报告实验方法，将实验缺陷转化为分析特征，并推导出检测基因调控网络中闭环反馈调控存在的相关条件 | NA | 从单细胞测序或流式细胞术实验获得的细胞异质性数据中推断基因调控动力学 | 基因调控网络中的功能关系和基因表达动力学 | 系统生物学 | NA | 单细胞测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA |