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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-04-04 |
Epithelial tubule interconnection driven by HGF-Met signaling in the kidney
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416887121
PMID:39705305
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了肝细胞生长因子(HGF)通过MAPK信号通路和基质金属蛋白酶(MMPs)促进小鼠胚胎肾脏上皮小管吻合的关键机制 | 首次明确了HGF-Met信号通路在驱动上皮小管相互连接(吻合)过程中的核心作用,并开发了一种可视化定量小管连接的新方法 | 研究主要基于小鼠胚胎肾脏模型,其在成年组织或人类组织中的普适性仍需验证 | 探究肾脏上皮小管网络形成过程中小管相互连接的分子机制 | 小鼠胚胎肾脏上皮小管 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2026-04-04 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629650
PMID:39764057
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IN-DEPTH的空间多组学整合方法,结合SGCC分析,用于解析淋巴组织及EBV相关DLBCL的肿瘤微环境 | 开发了IN-DEPTH方法,实现同一切片上的空间蛋白质组学与转录组学迭代整合,并引入SGCC进行多模态空间分析 | 未明确说明样本量限制或技术适用范围的具体局限性 | 开发并应用空间多组学整合方法以深入解析疾病组织结构和肿瘤微环境 | 淋巴组织及EBV阳性和阴性弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞空间多组学整合 | k-bandlimited Spectral Graph Cross-Correlation (SGCC) | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞空间多组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-04-04 |
Single-Cell RNA Sequencing of Mutant Whole Mouse Embryos: From the Epiblast to the End of Gastrulation
2024-06-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66866
PMID:38949298
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研究论文 | 本文介绍了一种针对突变小鼠胚胎在E6.5至E8天原肠胚形成阶段进行单细胞RNA测序的稳健方法 | 开发了一种克服突变胚胎单细胞分析技术限制的完整方法,包括优化育种、定时妊娠、同日基因分型和细胞/细胞核分离流程 | 方法主要针对小鼠胚胎,且在原肠胚形成阶段应用,可能不直接适用于其他发育阶段或物种 | 研究突变如何影响原肠胚形成阶段的细胞景观 | 突变小鼠胚胎(E6.5至E8天) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微滴式单细胞分析 |
| 164 | 2026-04-04 |
IL-1β Inhibition Partially Negates the Beneficial Effects of Diet-Induced Atherosclerosis Regression in Mice
2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320800
PMID:38695167
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研究论文 | 本研究探讨了在Apoe-/-小鼠中,通过饮食诱导动脉粥样硬化消退后,抑制IL-1β对斑块稳定性和组成的意外有害影响 | 首次结合平滑肌细胞谱系追踪、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,揭示了IL-1β在维持饮食诱导的斑块稳定性和减少斑块负担中的关键作用,挑战了IL-1β抑制可能有益的预期 | 研究仅在Apoe-/-小鼠模型中进行,结果可能无法直接外推至人类;未探讨IL-1β抑制影响斑块稳定性的所有潜在分子机制 | 探究降低饮食脂质对晚期动脉粥样硬化病变组成和稳定性的影响,以及IL-1β抑制在此过程中的作用 | Apoe-/-小鼠(平滑肌细胞谱系追踪模型)的主动脉和头臂动脉粥样硬化病变 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、免疫染色、高分辨率共聚焦显微镜z-stack分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、成像数据 | Apoe-/-小鼠(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2026-04-04 |
Single-cell RNA sequencing of mutant whole mouse embryos: from the epiblast to the end of gastrulation
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591777
PMID:38746120
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研究论文 | 本文设计了一种稳健的流程,用于对E6.5至E8阶段的小鼠胚胎进行单细胞和细胞核分析,以研究突变胚胎在胚胎发育过程中的细胞景观 | 开发了一种针对突变小鼠胚胎的单细胞RNA测序方法,克服了基因分型、定时妊娠和细胞数量少等技术限制,提高了在胚胎发育阶段进行单细胞分析的可行性 | 方法主要针对小鼠胚胎,可能不直接适用于其他物种或更晚期的发育阶段,且依赖于优化的育种和基因分型流程 | 研究突变如何影响胚胎发育过程中的细胞景观和基因表达动态 | 小鼠胚胎,特别是从E6.5到E8阶段的突变胚胎 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微滴式单细胞分析 |
| 166 | 2026-04-04 |
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152673
PMID:35900794
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓微环境中IL-6信号通路在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用 | 建立了模拟年龄相关MDS向AML进展的小鼠模型,并首次证明骨髓微环境特异性IL-6信号是白血病转化的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者样本验证相对有限,且未详细探讨IL-6信号下游的具体分子机制 | 探究骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的分子机制,特别是衰老微环境的作用 | mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型、高风险MDS患者的CD34阳性细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和MDS患者细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-04-04 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
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研究论文 | 本研究评估了在标准单细胞RNA测序样本制备条件下,混合来自无关供体的外周血单个核细胞是否会引起同种异体反应性转录响应 | 首次系统评估了在标准scRNA-seq样本制备条件下混合无关供体PBMCs是否会引起同种异体反应性基因表达变化,并识别了与PBMC制备方法和样本多重标记技术相关的技术假象 | 研究仅评估了30分钟4°C共孵育条件,未测试更长时间或不同温度条件;主要关注CD4+ T细胞中的同种异体反应性标记 | 评估样本多重技术在单细胞RNA测序中混合无关供体PBMCs时是否引入同种异体反应性假象,为横向免疫学研究建立基准 | 外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 单个供体PBMCs与无关供体PBMCs混合实验,并分析了公开可用的scRNA-seq数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq, 样本多重技术 | 10x Genomics scRNA-seq平台, BD单细胞多重试剂盒(SCMK) | 10x Genomics单细胞RNA测序平台结合MULTI-seq和/或BD SCMK标记技术 |
| 168 | 2026-04-04 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
|
研究论文 | 本文介绍了CSEA-DB数据库,一个用于人类复杂性状与细胞类型关联的综合性资源库 | 整合了5120个GWAS汇总统计数据与超过90万个单细胞转录组数据,通过deTS算法进行了超过1000万次性状-细胞类型关联分析,首次构建了大规模的人类复杂性状与细胞类型特异性关联图谱 | 数据库依赖现有GWAS和单细胞数据的质量和覆盖范围,可能未涵盖所有组织或细胞类型 | 构建一个参考数据库,用于解析人类复杂性状与细胞类型特异性之间的遗传关联 | 人类复杂性状和疾病相关的遗传变异及细胞类型 | 生物信息学 | 复杂疾病 | GWAS, 单细胞转录组测序 | deTS算法 | GWAS汇总统计数据, 单细胞RNA-seq数据 | 超过900,000个细胞,涵盖71个成人和胎儿组织的752种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2026-04-04 |
Single-Cell Sequencing of Developing Human Gut Reveals Transcriptional Links to Childhood Crohn's Disease
2020-12-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.010
PMID:33290721
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序绘制了人类肠道发育的单细胞图谱,并揭示了与儿童克罗恩病相关的转录联系 | 首次在6-10周孕期的发育中人类肠道中识别出不同于LGR5表达细胞的循环上皮前体细胞,并发现克罗恩病中胎儿转录因子的重新激活 | 研究样本仅涵盖6-10周孕期的胎儿肠道,可能无法全面反映整个发育过程;疾病对比局限于儿童克罗恩病,未涉及其他肠道疾病 | 探索人类肠道发育的细胞类型相互作用,并理解其与儿童克罗恩病的关联 | 发育中的人类肠道组织(6-10周孕期)和儿童克罗恩病患者的肠道上皮细胞 | 单细胞测序 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但包括6-10周孕期的胎儿肠道组织和儿童克罗恩病患者与健康对照的肠道上皮样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2026-04-04 |
Simultaneous single-cell profiling of lineages and cell types in the vertebrate brain
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4103
PMID:29608178
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scGESTALT的新方法,它结合了CRISPR-Cas9条形码编辑的谱系追踪能力和单细胞RNA测序的细胞类型识别功能,用于同时分析脊椎动物大脑中的谱系关系和细胞类型 | scGESTALT方法首次将可诱导的CRISPR-Cas9条形码编辑与单细胞RNA测序相结合,能够在发育的多个时间点捕获谱系信息,并识别出数百种细胞类型 | 方法目前主要应用于斑马鱼大脑,虽然可推广到其他多细胞生物,但尚未在更复杂的哺乳动物系统或疾病模型中广泛验证 | 研究目的是开发一种同时分析细胞谱系关系和分子身份的方法,以揭示脊椎动物大脑发育过程中的分化限制 | 研究对象是斑马鱼大脑中的细胞,包括其谱系关系和细胞类型 | 单细胞组学 | NA | CRISPR-Cas9条形码编辑,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约60,000个转录组来自幼年斑马鱼大脑 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2026-04-03 |
Single-cell RNA sequencing and functional analysis reveal the role of altered glycosylation levels of hepatic macrophages in liver cirrhosis
2025-05, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02218-y
PMID:39888412
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示了肝巨噬细胞糖基化水平改变在肝硬化中的作用 | 首次在单细胞水平上结合糖基化和转录组数据,分析肝硬化中免疫细胞糖基化模式的变化及其功能影响,特别是巨噬细胞在免疫微环境重塑中的核心作用 | 研究基于现有数据,样本量可能有限,且未进行实验验证糖基化靶向治疗策略的有效性 | 探究肝硬化中免疫细胞糖基化水平的变化及其在疾病进展中的作用 | 肝硬化患者和健康对照者的肝组织样本 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肝硬化与健康对照肝组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2026-04-03 |
Eosinophilic esophagitis drives tissue fibroblast regenerative programs toward pathologic dysfunction
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.028
PMID:39617290
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了嗜酸性食管炎(EoE)中组织成纤维细胞的再生程序向病理性功能障碍转变的分子机制 | 首次在EoE中系统描述了成纤维细胞的病理性再生程序转变,并识别出CD73活性降低和ATP处理异常作为关键驱动因素 | 研究主要基于体外实验和活检样本,缺乏长期体内验证;样本量相对有限 | 探究慢性EoE炎症如何诱导病理性成纤维细胞功能障碍及其分子机制 | 嗜酸性食管炎患者与健康对照的食管成纤维细胞 | 单细胞组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,成纤维细胞分化与迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫染色图像 | EoE患者与健康对照的食管活检样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2026-04-03 |
Effect of tumor microenvironment in pancreatic cancer on the loss of β-cell mass: implications for type 3c diabetes
2025-04, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-024-02204-w
PMID:39760782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和病理分析,探讨了胰腺导管腺癌肿瘤微环境对β细胞质量减少的影响及其在3c型糖尿病发病机制中的作用 | 首次在单细胞水平上系统揭示了胰腺导管腺癌肿瘤微环境与邻近胰岛β细胞之间的相互作用,并明确了肿瘤微环境通过诱导β细胞凋亡导致β细胞质量减少,从而触发3c型糖尿病的具体机制 | 研究主要基于体外细胞实验和临床样本分析,缺乏体内动物模型的直接验证;样本量相对有限,可能影响统计效力;未深入探讨肿瘤微环境中具体信号分子介导β细胞凋亡的详细通路 | 阐明胰腺导管腺癌肿瘤微环境如何导致β细胞质量减少并引发3c型糖尿病的机制 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织、邻近胰腺组织(近端和远端)、正常供体胰腺组织、INS-1E细胞系和PANC-1细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, TUNEL染色, RT-qPCR, CCK8检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 病理图像, 基因表达数据 | 来自供体的正常胰腺组织、非糖尿病和3c型糖尿病患者的癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2026-04-03 |
Thymic and T-cell intrinsic critical roles associated with severe combined immunodeficiency and Omenn syndrome due to a heterozygous variant (G201R) in PSMB10
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1082
PMID:39734035
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研究论文 | 本文通过免疫学和分子表征研究,探讨了PSMB10基因杂合变异(G201R)如何导致严重联合免疫缺陷和Omenn综合征,并揭示了其在胸腺和T细胞发育中的关键作用 | 首次详细描述了PSMB10杂合变异(G201R)通过显性负效应减少免疫蛋白酶体表达,影响CD8 T细胞阳性选择、T细胞受体多样性以及自身反应性T细胞的阴性选择,并利用人工胸腺器官模型和单细胞RNA测序技术验证了胸腺上皮细胞中的表达模式 | 研究基于单个病例,样本量有限,且未进行大规模队列验证;人工胸腺器官模型可能无法完全模拟体内胸腺微环境 | 旨在对携带PSMB10杂合变异的婴儿进行免疫学和分子表征,以阐明该变异导致严重联合免疫缺陷和Omenn综合征的机制 | 一名携带PSMB10杂合变异(p.G201R)的婴儿及其细胞样本(包括PBMCs、EBV转化的B细胞、成纤维细胞和CD34+细胞) | 免疫学 | 严重联合免疫缺陷和Omenn综合征 | 流式细胞术、免疫印迹、人工胸腺器官培养、单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据、蛋白质表达数据、基因表达数据 | 1名患者及其父母(作为对照),以及从患者获取的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-02-15 |
A single approach, multiple insights: Harnessing spatial transcriptomics and proteomics to identify novel therapeutic targets of alcohol-associated hepatitis
2025-Apr, Alcohol, clinical & experimental research
DOI:10.1111/acer.70007
PMID:39948688
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2026-04-03 |
Endothelial FOSL1 drives angiotensin II-induced myocardial injury via AT1R-upregulated MYH9
2025-Apr, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01410-9
PMID:39592734
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研究论文 | 本研究揭示了FOSL1/MYH9轴在血管紧张素II诱导的心肌损伤中的关键作用,并确定FOSL1是心肌缺血再灌注诱导的内皮细胞损伤的潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞测序和假时间分析发现FOSL1通过调控MYH9表达介导血管紧张素II诱导的心肌内皮功能障碍,并证实靶向FOSL1可改善心肌缺血再灌注损伤 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体中进行验证 | 探究血管紧张素II诱导心肌损伤的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠心肌组织、原代心脏内皮细胞、人脐静脉内皮细胞 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 假时间分析, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2026-04-03 |
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70010
PMID:40229922
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综述 | 本文挑战了迷走神经作为简单饱腹感信号被动传递器的传统观点,强调其作为主动编码多种餐食相关信息的复杂系统,并整合单细胞转录组学、神经环路映射和功能成像等最新进展 | 提出迷走神经传入神经元(VANs)不仅是饱腹感传感器,还具有特化亚群、多样感觉模态和下游脑环路,能主动编码机械拉伸、营养成分、代谢状态和微生物代谢物等多方面信息 | NA | 更新对迷走神经感觉通路在控制进食-饱腹感及更广泛功能(如食物奖赏和记忆形成)中作用的理解 | 迷走神经传入神经元(VANs)及其下游脑环路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、神经环路映射、功能成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2026-04-03 |
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.29.564555
PMID:39677775
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研究论文 | 本研究探讨了乳腺浸润性小叶癌中MDC1作为ER共调节因子的新功能,及其与DNA修复功能障碍和PARP抑制剂敏感性的关联 | 发现MDC1在ILC细胞中作为ER共调节因子的新活性,这种活性与典型的DNA修复功能失调相关,但缺乏传统DNA修复缺陷特征,并揭示了ILC中一种独特的HR功能障碍形式 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证有限,且未详细探讨MDC1-ER相互作用的分子机制 | 探究MDC1在乳腺浸润性小叶癌中的双重功能及其与DNA修复和PARP抑制剂敏感性的关系 | 乳腺浸润性小叶癌细胞及肿瘤组织 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 | 多个ILC异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2026-04-03 |
TEAD3 and TEAD4 play overlapping role in bovine preimplantation development
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0307
PMID:39679917
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研究论文 | 本研究揭示了在牛胚胎植入前发育过程中,TEAD3和TEAD4转录因子在滋养外胚层命运决定中发挥重要且重叠的功能 | 首次在牛中发现TEAD3特异性表达于滋养外胚层细胞,并证明TEAD3与TEAD4在牛胚胎植入前发育中具有冗余作用,这与小鼠中TEAD4的直接调控作用不同 | 研究主要聚焦于牛胚胎植入前发育阶段,未探讨TEAD3和TEAD4在其他发育阶段或物种中的功能 | 确定TEAD3在牛胚胎植入前发育中的功能角色 | 牛胚胎植入前发育过程中的胚胎细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA干扰,碱基编辑技术,RNA测序分析,免疫荧光分析 | NA | RNA测序数据,免疫荧光图像数据 | 未明确指定样本数量,但涉及牛胚胎植入前发育阶段的胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-04-03 |
Key glycometabolism during oocyte maturation and early embryonic development
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0275
PMID:39846956
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综述 | 本综述探讨了葡萄糖代谢在卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的核心作用,及其对能量产生、发育决策和表观遗传调控的影响 | 揭示了葡萄糖、脂肪酸、氨基酸和核苷酸之间的复杂相互作用,并探索了非侵入性代谢监测如何革新胚胎选择和个性化辅助生殖技术 | NA | 推进生殖医学和胚胎学,通过研究代谢过程改善生育治疗结果 | 哺乳动物配子和早期胚胎 | 生殖医学 | 生育障碍 | 单细胞测序、代谢组学、生物信息学 | NA | 代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |