单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 35198 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2026-01-13
Integrative single cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics uncovers distinct macrophage-fibroblast cross-talk in human hip synovium between patients with femoroacetabular impingement and osteoarthritis
2026-Jan-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了人类髋关节滑膜中巨噬细胞与成纤维细胞在股骨髋臼撞击症和骨关节炎患者之间的独特交互作用 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统比较了FAI和髋关节OA患者滑膜细胞的组成、转录组特征及细胞间相互作用,并识别了EREG+成纤维细胞样滑膜细胞的关键作用及其与COL1A1+IGFBP5+纤维化巨噬细胞通过FGF2-SDC4信号通路的交互 样本量较小(每组6例),且研究局限于髋关节滑膜,未全面评估其他关节或疾病阶段的影响 探究股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者滑膜细胞组成、转录组变化及细胞间相互作用的差异,以揭示疾病发展机制 人类髋关节滑膜样本,来自FAI和髋关节OA患者 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 12例患者样本(FAI和髋关节OA各6例) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
142 2026-01-13
RTCB is Essential for Early Mouse Embryogenesis
2026-Jan-12, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过构建Rtcb条件性敲除小鼠模型,揭示了RTCB在早期小鼠胚胎发育中的关键作用及其通过YY1-RTCB-NUSAP1轴调控原肠胚形成的机制 首次在小鼠模型中系统证明了RTCB对早期胚胎发育的必需性,并提出了一个由转录因子YY1调控、通过RTCB稳定Nusap1 mRNA来维持细胞增殖的原肠胚形成新调控轴 研究主要基于小鼠模型,在人类胚胎中的保守性需要进一步验证;YY1-RTCB-NUSAP1轴的具体分子机制仍需深入解析 探究RTCB在哺乳动物生殖和早期胚胎发育中的功能 小鼠胚胎、NIH 3T3细胞系 发育生物学 胚胎发育障碍 条件性基因敲除、组织学分析、免疫组化、定量PCR、单细胞RNA测序 Ddx4-Cre条件敲除小鼠模型 基因表达数据、组织图像、单细胞转录组数据 未明确样本数量的小鼠胚胎及细胞系实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
143 2026-01-13
Progenitor CD8+ T cells and hyper-Treg crosstalk: a driver of immune checkpoint inhibitor resistance in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Jan-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探索了食管鳞状细胞癌中肿瘤抗原呈递和肿瘤微环境内细胞间相互作用如何驱动免疫检查点抑制剂耐药性 首次在ESCC中系统揭示了抗原呈递恶性上皮细胞的异质性,并发现了由祖细胞样CD8+ T细胞和过度活化Treg细胞通过CLEC2C-KLRB1轴介导的细胞间通讯是驱动ICI耐药的关键机制 研究基于公开的24例患者数据,样本量相对有限,且为回顾性分析,需要前瞻性研究进一步验证 阐明食管鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂耐药的机制,并寻找潜在的治疗靶点 接受化疗和免疫检查点抑制剂治疗的24例食管鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 单细胞组学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,空间蛋白表达数据 24例食管鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
144 2026-01-13
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mTOR-driven cellular fate of spindle cells and immune evasion in classic Kaposi's sarcoma
2026-Jan-12, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了经典卡波西肉瘤中mTOR驱动的纺锤状细胞命运和免疫逃逸机制,并评估了二甲双胍的治疗潜力 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析了经典卡波西肉瘤中纺锤状细胞的分化状态及其与免疫细胞的相互作用机制 研究仅纳入两名患者样本,样本量较小,需要更大规模研究验证 评估mTOR抑制剂二甲双胍在经典卡波西肉瘤中的治疗潜力及其分子机制 经典卡波西肉瘤患者组织样本 数字病理学 卡波西肉瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 2名经典卡波西肉瘤患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
145 2026-01-13
Pathological mechanisms and treatment strategies for immune checkpoint inhibitor-associated myocarditis: insights from single-cell sequencing
2026-Jan-11, Basic research in cardiology IF:7.5Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在免疫检查点抑制剂相关心肌炎(ICI-M)研究中的应用进展,并探讨了基于机制见解的靶向治疗策略 系统总结了单细胞测序技术在揭示ICI-M这一罕见但严重的心脏毒性疾病的细胞组成变化和基因表达特征方面的关键作用,并提出了在不损害抗肿瘤免疫的前提下减轻心脏炎症的精准干预框架 本文是一篇综述,未报告原始实验数据;单细胞测序技术在ICI-M研究中的应用仍处于早期阶段,相关临床转化证据有限 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制,并探讨基于单细胞测序技术发现的靶向治疗策略 免疫检查点抑制剂相关心肌炎 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
146 2026-01-13
Reconstructing Coherent Functional Landscape From Multi-Modal Multi-Slice Spatial Transcriptomics by a Variational Spatial Gaussian Process
2026-Jan-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了一种名为stVGP的变分空间高斯过程框架,用于从多模态、多切片空间转录组数据中重建连贯的功能景观 stVGP通过整合空间高斯过程与空间分层变换器,实现了跨切片对齐、批次效应校正和虚拟组织切片生成,支持连续3D重建和基因表达插值 NA 开发一个统一、可扩展的框架,用于建模复杂组织和发育系统中的3D空间景观 多模态、多切片空间转录组数据集 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 变分空间高斯过程框架 空间转录组数据和病理图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
147 2026-01-13
Protoplast-Based Functional Genomics and Genome Editing: Progress, Challenges and Applications
2026-Jan-11, Plant, cell & environment
综述 本文综述了基于原生质体的功能基因组学和基因组编辑技术的进展、挑战与应用 整合了1050篇文献分析,并突出了单细胞转录组学在原生质体系统中的新应用,以及原生质体再生在作物改良中的实际价值 NA 探索植物如何感知和响应环境,并促进作物改良 植物原生质体,包括模式物种和经济作物 功能基因组学 NA 原生质体系统、单细胞转录组学、CRISPR/Cas RNP编辑 NA 文献数据、转录组数据 基于1050篇已发表文章的分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
148 2026-01-13
Prior high fiber intake impinges on the cellular responses of mesenteric adipose and intestinal tissues to subsequent high fat feeding
2026-Jan-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过饮食转换实验,利用单核及空间转录组学技术,揭示了高纤维饮食预处理如何重塑肠系膜脂肪和肠道组织对后续高脂饮食的细胞反应 首次结合单核转录组学和空间转录组学,系统描绘了饮食转换过程中脂肪和肠道组织的时空动态响应,并发现了性别二态性细胞群重塑现象 研究基于小鼠模型,人类组织的直接适用性需进一步验证;长期饮食效应的分子机制仍需深入探索 探究高纤维饮食预处理对后续高脂饮食挑战下组织特异性反应的调控机制 C57BL/6J小鼠的肠系膜白色脂肪组织和肠道组织(十二指肠和结肠) 空间转录组学 肥胖症 单核转录组测序、空间转录组测序 NA 转录组数据、空间基因表达数据 C57BL/6J小鼠群体(具体数量未在摘要中说明) NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
149 2026-01-13
Rumen microbiome biogeography and ventral epithelial architecture in three ruminant species
2026-Jan-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了三种反刍动物(狍、梅花鹿和绵羊)瘤胃微生物组的空间生物地理分布及腹侧瘤胃上皮的遗传多样性 首次系统揭示了瘤胃微生物组的空间异质性及腹侧瘤胃上皮的单细胞转录组特征,并发现维生素B对上皮生长的促进作用 研究仅涵盖三种反刍动物,样本量有限,且未探讨环境因素对微生物组空间分布的影响 探究反刍动物瘤胃微生物组的空间分布规律及腹侧上皮的细胞功能分化 狍、梅花鹿和绵羊的瘤胃微生物组及腹侧瘤胃上皮组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、批量RNA测序(RNA-seq) NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、代谢组数据 三种反刍动物的11个瘤胃囊区域样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 批量RNA-seq NA NA
150 2026-01-13
Molecular characterization of palmitoylation in prostate cancer reveals KIFC2 as a prognostic biomarker and potential therapeutic target
2026-Jan-10, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过整合转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,全面分析了前列腺癌中的蛋白质棕榈酰化相关基因,揭示了KIFC2作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 首次系统整合多组学数据(包括单细胞和空间转录组)来表征前列腺癌中的棕榈酰化作用,并鉴定出KIFC2这一新的关键基因 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 阐明蛋白质棕榈酰化在前列腺癌中的作用机制,并寻找新的生物标志物和治疗靶点 前列腺癌(PCa)组织样本和PC3、DU145前列腺癌细胞系 生物信息学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 无监督共识聚类, 加权基因共表达网络分析 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 未明确具体样本数量,但使用了多个数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
151 2026-01-13
Cannabidiol exerts antiinflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation in humans
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究在单细胞水平上评估了稳态下口服大麻二酚(CBD)联合他克莫司治疗对人体免疫细胞的药效学影响 首次在单细胞水平上描述了稳态CBD联合他克莫司治疗下的人类免疫调节效应,揭示了CBD对T效应记忆细胞分化的独特维持作用及其混合免疫调节特性 研究为体外I期试验,样本量较小(23名参与者),且未评估长期临床结局 阐明CBD在人体内的免疫调节作用机制,特别是对移植受者疼痛管理的临床安全性 23名口服CBD(Epidiolex)参与者的外周血单个核细胞 NA NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测,串联质谱 NA 单细胞转录组数据,细胞因子蛋白数据,流式细胞术数据 23名参与者 NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA NA
152 2026-01-13
FDX1-mediated cuproptosis promotes cholestatic liver injury exacerbated by taurocholic acid-enhanced copper accumulation
2026-Jan-09, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了胆汁淤积性肝损伤中铜过载通过牛磺胆酸增强和FDX1介导的铜死亡机制驱动肝损伤 首次发现胆汁淤积条件下牛磺胆酸能增强肝脏铜积累,并阐明FDX1通过稳定DLAT单体和LIAS介导的脂酰化在铜死亡中的复杂调控作用 单中心回顾性研究,样本量有限,主要基于动物和细胞模型,临床转化需进一步验证 探究铜在胆汁淤积性肝损伤中的作用及其具体分子机制 胆汁淤积患者肝组织、胆道闭锁患者肝标本、胆汁淤积大鼠模型、肝细胞 数字病理学 肝病 单细胞测序、转录组分析 NA 测序数据、临床数据、实验数据 胆汁淤积患者和胆道闭锁患者的肝组织样本,以及大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
153 2026-01-13
TLR3 stimulation rejuvenates aged mesenchymal stem cells and restores immunosuppressive function in graft-versus-host disease
2026-Jan-09, Transplant immunology IF:1.6Q3
研究论文 本研究探讨了间充质干细胞衰老对移植物抗宿主病治疗效果的影响,并发现通过TLR3激动剂刺激可逆转衰老表型,恢复其免疫抑制功能 首次在单细胞水平揭示了MSC衰老导致免疫调节亚群丢失和TLR3信号下调的分子机制,并证明TLR3激动剂刺激是一种可临床转化的衰老MSC功能恢复策略 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性仍需进一步验证;体外扩增条件可能影响衰老表型 探究MSC衰老对GVHD治疗效果的影响,并寻找恢复衰老MSC功能的方法 人类间充质干细胞(早期传代P5和晚期传代P15)及小鼠GVHD模型 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及早期(P5)和晚期(P15)传代的人类MSC及小鼠GVHD模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
154 2026-01-13
The role of insulin-like growth factor binding proteins in TGF-β1-induced fibroblast-myofibroblast transition during endometriosis fibrosis
2026-Jan-09, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)在子宫内膜异位症(EMS)纤维化过程中TGF-β1诱导的成纤维细胞-肌成纤维细胞转化(FMT)中的作用 首次定义了IGFBPs在EMS纤维化中的角色,并突出IGFBP6作为潜在的抗纤维化因子和治疗靶点 NA 研究IGFBPs在EMS相关纤维化中TGF-β1诱导的FMT过程中的作用 子宫内膜异位症(EMS)中的异位子宫内膜细胞,特别是异位子宫内膜基质细胞(EcESCs) 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
155 2026-01-13
Integrative Spatial Omics and Artificial Intelligence: Transforming Cancer Research with Omics Data and AI
2026-Jan-09, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1
综述 本文探讨了空间组学与人工智能在癌症研究中的整合应用,包括空间转录组学和空间蛋白质学等技术的进展及其在肿瘤学中的应用 整合多组学数据与组织空间数据,结合人工智能和机器学习技术,以增强对肿瘤微环境空间动态的理解,并推动预测模型和个性化治疗策略的发展 面临高维数据复杂性、计算限制以及分析流程标准化等挑战 通过整合空间组学和人工智能技术,改善癌症研究中的数据分析、预测建模和临床转化 多组学数据(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、表观基因组学、代谢组学)和组织空间数据,以及肿瘤微环境 机器学习 癌症 空间条形码、原位测序、数字空间分析 深度学习模型、基于空间图的分析 多组学数据、空间数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质学 NA NA
156 2026-01-13
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Jan-09, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据,揭示了矽肺病中免疫-基质微环境的关键驱动机制 首次在矽肺病中鉴定出中间CCL2高表达的单核样巨噬细胞(MLM)亚群及其分化为炎症和纤维化前亚型,并开发了位点特异性小鼠模型以揭示免疫-基质相互作用 研究主要基于单细胞测序数据,缺乏功能验证实验来确认预测的细胞间相互作用在疾病中的直接作用 探究矽肺病中巨噬细胞与基质细胞之间的相互作用如何驱动纤维化进程 矽肺病患者和小鼠模型的肺灌洗液细胞 数字病理学 矽肺病 单细胞RNA测序(scRNAseq) 细胞-细胞通讯建模 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,涉及人类患者和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
157 2026-01-13
Biomarkers Informed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics - Biomarkers for Grade 3 Follicular Lymphoma
2026-Jan-09, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别并验证了AID、CXCR4、CD71和Ki67作为滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物,旨在改善预后分层 首次结合单细胞和空间转录组学数据,从正常生发中心和滤泡性淋巴瘤样本中识别出与中心母细胞和中心细胞相关的基因表达谱,并通过免疫组化验证了这些生物标志物在区分滤泡性淋巴瘤3级中的潜力 研究样本量相对较小(59例滤泡性淋巴瘤标本),且需要进一步在统一治疗的队列中进行临床验证 识别客观的生物标志物以改进滤泡性淋巴瘤的预后分层,特别是针对3级滤泡性淋巴瘤 正常生发中心细胞和滤泡性淋巴瘤样本(包括1-2级和3级) 数字病理学 滤泡性淋巴瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组化 NA 转录组数据,图像数据 59例滤泡性淋巴瘤标本(42例1-2级,17例3级)及扁桃体样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
158 2026-01-13
Single-cell transcriptomics reveals the landscape of immune phenotypes in pituitary neuroendocrine tumors
2026-Jan-09, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了垂体神经内分泌肿瘤中免疫表型的异质性及细胞间通讯网络 首次在单细胞水平上系统描绘了三种主要PitNET谱系(PIT1、SF1、TPIT)中免疫细胞组成的差异,并鉴定出由CTLA4-CD86通路介导的Treg细胞与巨噬细胞/小胶质细胞之间新的免疫抑制性相互作用 样本量相对有限(22例),且为单中心研究,可能影响结果的普适性 阐明垂体神经内分泌肿瘤的免疫异质性及肿瘤微环境中的细胞间通讯网络 22例来自手术患者的新鲜垂体神经内分泌肿瘤样本 数字病理学 垂体神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序,多重免疫组化,流式细胞术,体外共培养实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据,流式数据 22例新鲜PitNET样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
159 2026-01-13
Single-cell transcriptome analysis of patient-derived organoids captures inter- and intratumor heterogeneity and uncovers targetable pathways in high grade serous ovarian cancer
2026-Jan-08, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析患者来源的类器官,揭示了高级别浆液性卵巢癌的肿瘤间和肿瘤内异质性,并识别了可靶向的治疗通路 首次在患者来源的类器官模型中利用单细胞转录组学全面表征高级别浆液性卵巢癌的细胞异质性,并发现化疗耐药性与氧化磷酸化代谢转换的关联,以及化疗诱导的MHC-II上调作为免疫治疗新靶点 研究样本量有限,仅基于类器官模型和少量患者样本,未进行大规模临床验证 表征高级别浆液性卵巢癌患者来源类器官的细胞异质性,并探索化疗耐药性的潜在机制和可靶向脆弱性 高级别浆液性卵巢癌患者来源的类器官、腹水来源的卵巢癌细胞以及独立患者的组织样本 数字病理学 卵巢癌 单细胞转录组学、免疫组织化学分析、化疗处理实验 NA 单细胞转录组数据、组织图像数据 来自铂耐药和铂敏感高级别浆液性卵巢癌患者的活检样本衍生的类器官,以及独立患者的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
160 2026-01-13
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2026-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为STAN的计算框架,用于从空间转录组学数据中推断空间信息化的转录因子活性 提出了一个线性混合效应计算方法,整合了TF-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和组织学特征,以预测具有空间信息的、斑点特异性的转录因子活性 NA 系统性地推断转录因子活性及其在细胞身份中的作用,以充分利用空间转录组学数据的潜力 淋巴结、背外侧前额叶皮层、乳腺癌和胶质母细胞瘤的空间转录组学数据集 计算生物学 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 空间转录组学 线性混合效应模型 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部