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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-02 |
Deconvolving cell-type-specific gene expression profiles from bulk RNA-seq samples
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014101
PMID:41886524
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研究论文 | 本文开发了一种基于U-Net的深度学习算法BLUE，用于从bulk RNA-seq样本中解卷积细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱 | 利用U-Net架构的强大特征提取和表示学习能力，首次实现从bulk RNA-seq数据中准确预测细胞类型特异性基因表达谱，性能显著优于现有解卷积算法 | 未明确说明算法对实验成本的依赖程度或数据规模要求 | 整合bulk RNA-seq和scRNA-seq的优势，利用现有bulk RNA-seq数据集进行细胞类型特异性分析 | bulk RNA-seq样本中的细胞类型比例和基因表达谱 | 自然语言处理 | 癌症 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | U-Net | RNA-seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-04-02 |
Exploring the developmental mechanisms of tea plant trichomes using genomics and single-cell transcriptome sequencing
2026-Mar, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf352
PMID:41918624
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研究论文 | 本研究通过基因组测序和单细胞转录组测序，探索了茶树毛状体的发育机制 | 首次提供了三倍体茶树品种的高质量染色体级别基因组组装，并构建了木本植物的单细胞图谱，鉴定了毛状体特异性标记基因和发育轨迹 | NA | 探索茶树毛状体的发育机制，为茶树育种提供遗传资源 | 福鼎大白茶（三倍体白茶品种）及其叶片组织 | 基因组学 | NA | PacBio长读长测序、Hi-C支架、单核RNA测序 | NA | 基因组序列、单细胞转录组数据 | 叶片组织混合样本 | PacBio | 长读长测序、Hi-C、单核RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-04-02 |
Tumor-infiltrating lymphocytes demonstrate potent anti-tumor efficacy and synergize with PD-1 blockade in bladder cancer
2026-Feb-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07924-6
PMID:41749249
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研究论文 | 本研究探讨了从膀胱癌患者中分离并扩增的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的抗肿瘤功效，并评估了其与PD-1抑制剂Nivolumab联合治疗的协同作用 | 首次在膀胱癌中系统评估TIL的体外扩增、表型特征及其与PD-1阻断的协同抗肿瘤效果，并利用患者来源类器官（PDO）和单细胞测序技术进行功能验证 | 研究样本量有限（48例样本），且体内验证仅使用了细胞系来源的异种移植模型，缺乏更复杂的体内模型验证 | 评估TIL在膀胱癌中的抗肿瘤潜力及其与免疫检查点抑制剂联合治疗的效果 | 膀胱癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞、膀胱癌细胞系、患者来源类器官及小鼠异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、T细胞受体（TCR）测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验（ELISA）、细胞活力（ATP）和凋亡（caspase 3/7）检测 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞术数据、体外功能实验数据 | 48例膀胱癌患者样本，其中33例成功扩增TIL | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-04-02 |
Single-cell hdWGCNA and experimental validation identify an innovative T-cell-associated prognostic model and immune microenvironment in lung adenocarcinoma with lymph node metastasis
2026-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15649-4
PMID:41742055
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据和高维加权基因共表达网络分析，构建了一个基于T细胞标志基因（CD69、GOLGA8A和IL16）的预后模型，用于评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后 | 首次结合单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析，构建了针对淋巴结转移性肺腺癌的T细胞相关预后模型，并通过实验验证了模型基因的表达 | 研究依赖于公共数据库的单细胞RNA测序数据，样本来源和数量可能有限，且模型在更广泛人群中的验证仍需进一步研究 | 建立基于T细胞的预后模型，以评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后并优化靶向治疗和免疫治疗策略 | 淋巴结转移性肺腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，高维加权基因共表达网络分析，差异表达分析，Cox/LASSO回归，蛋白质-蛋白质相互作用分析，RNA结合蛋白调控网络分析，药物调控研究，分子对接，基因表达谱分析，定量实时PCR，免疫组织化学，多重免疫荧光 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-04-02 |
Oncolytic Zika virus therapy leverages CCR2+ monocytes to boost anti-glioblastoma T cell responses
2026-Feb-23, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag037
PMID:41729934
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研究论文 | 本研究探讨了溶瘤寨卡病毒（ZIKV）通过激活CCR2+单核细胞来增强抗胶质母细胞瘤CD8+ T细胞反应的机制 | 揭示了ZIKV通过CCR2+单核细胞介导的T细胞反应增强机制，为克服胶质母细胞瘤免疫抑制提供了新策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探究ZIKV治疗胶质母细胞瘤的免疫机制，特别是单核细胞在其中的作用 | 胶质母细胞瘤小鼠模型中的CCR2+单核细胞和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-04-02 |
Single-cell and spatial transcriptomics define 20E-driven developmental reprogramming in silkworm wing disc
2026-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69518-6
PMID:41730863
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研究论文 | 本研究构建了家蚕翅盘10个时间点的时空单细胞图谱，揭示了20-羟基蜕皮酮驱动的发育重编程过程 | 首次在家蚕翅盘中构建了高分辨率的时空单细胞图谱，并提出了描述渐进命运决定的五阶段基因转换模型 | 研究主要基于家蚕模型，其结论在其他昆虫中的普适性有待验证 | 解析昆虫翅发育的时空调控逻辑和激素驱动的器官发生机制 | 家蚕翅盘细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | 10个时间点的翅盘样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2026-04-02 |
Calibrating tissue level PDE models of ligand dynamics using single cell and spatial transcriptomics data
2026-Feb-19, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00657-8
PMID:41714655
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研究论文 | 本研究开发了一个计算流程，利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据来校准组织水平的配体动力学偏微分方程模型 | 提出了一个将单细胞RNA测序和空间转录组学数据整合到机制模型参数校准中的统一计算框架，并展示了结合近似贝叶斯计算与梯度优化方法的优势 | 研究仅使用了两个开源的人类皮肤数据集作为案例研究，模型和方法的普适性需要在更多组织和条件下验证 | 开发一个利用现代转录组学数据校准组织水平机制模型的计算框架 | 人类皮肤组织中的配体（特别是转化生长因子β亚型）动力学 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 偏微分方程模型，近似贝叶斯计算，梯度优化 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 两个开源人类皮肤数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 108 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics maps early B-cell and T-cell activation in hidradenitis suppurativa
2026-Feb-19, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.01.041
PMID:41722764
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学分析，揭示了化脓性汗腺炎早期阶段B细胞和T细胞的免疫激活先于皮肤隧道和三级淋巴结构形成 | 首次在化脓性汗腺炎中明确了免疫激活的时间顺序，发现早期病变中已存在显著的B细胞富集、17型T细胞通路激活和中性粒细胞浸润，并识别出表达促炎细胞因子、抗原呈递机制和免疫球蛋白的多功能B细胞 | 研究样本量相对有限（156个感兴趣区域），且仅与痤疮聚合症和银屑病进行了比较，可能未涵盖所有炎症性皮肤病的异质性 | 阐明化脓性汗腺炎中免疫激活与晚期结构形成的时序关系 | 化脓性汗腺炎、痤疮聚合症和银屑病的皮肤组织样本 | 数字病理学 | 皮肤炎症性疾病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 156个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-04-02 |
Single-cell atlas of hepatic cellular plasticity and immune niche reprogramming in liver cirrhosis
2026-Feb-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07858-z
PMID:41709311
|
研究论文 | 本研究利用公开可用的单细胞测序数据集，解析肝硬化中疾病相关的免疫细胞亚型、基因表达谱及转录因子活性变化，以理解其在疾病发生和进展中的作用 | 通过整合多种生物信息学工具，首次在单细胞水平系统描绘了肝硬化的细胞可塑性及免疫微环境重编程图谱，并识别出关键的免疫调控轴和潜在治疗靶点 | 研究依赖于公开数据集，可能受限于样本来源、测序平台和批次效应，且为观察性分析，需进一步实验验证 | 解析肝硬化中免疫细胞的动态变化、细胞间通讯网络及转录调控机制，以揭示疾病进展的免疫学基础 | 肝硬化患者的肝脏单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Monocle, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 35,017个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-04-02 |
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02454-1
PMID:41578023
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研究论文 | 本研究构建了一个整合双模态的人类视网膜细胞图谱，包含约390万个细胞，识别了超过130种细胞类型 | 整合了转录组和染色质可及性数据，创建了首个大规模、多供体、多实验室的人类视网膜细胞参考图谱 | NA | 深入理解视网膜的分子特征和细胞多样性，以促进对视网膜功能和病理的研究 | 人类视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 约390万个细胞，来自125名不同祖先背景的供体 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-04-02 |
Gut Microbiome, Immune Cells, and Heart Failure: A Multi-Omics Mendelian Randomization Study
2026-Jan-23, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000550655
PMID:41915616
|
研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化分析，探讨了肠道微生物组通过免疫细胞对心力衰竭的因果影响 | 首次结合肠道微生物组、免疫细胞和心力衰竭的GWAS数据，利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，通过eQTL孟德尔随机化分析揭示微生物与免疫互作在心力衰竭中的因果机制 | 研究依赖于公开的GWAS摘要数据，可能受限于样本异质性和潜在混杂因素，且因果推断基于遗传工具变量，需实验验证 | 探究肠道微生物组通过免疫调节对心力衰竭发病的因果关系 | 肠道微生物分类群、免疫细胞（如CD4+T细胞、NK/T细胞）和心力衰竭患者及健康对照 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序（snRNA-seq）、表达数量性状位点（eQTL）分析 | 孟德尔随机化（MR）模型 | 遗传摘要数据、单细胞转录组数据 | 基于公开GWAS和单细胞测序数据，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-04-02 |
Loss of HOXA10 activates NLRP3 for epithelial plasticity and pyroptosis in endometrium during embryo implantation
2026-01-15, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaaf007
PMID:41575153
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子HOXA10通过抑制NLRP3来维持子宫内膜上皮细胞特性，其下调会激活NLRP3介导的炎症小体形成和细胞焦亡，从而为胚胎植入创造条件的分子机制 | 首次发现HOXA10通过直接调控NLRP3表达来控制胚胎植入过程中的上皮重塑，并阐明了NLRP3在诱导上皮可塑性（pEMT）和细胞焦亡中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型，在人类子宫内膜中的验证尚需进一步研究；NLRP3抑制剂MCC950的具体作用机制和长期影响有待深入探索 | 探究胚胎植入过程中子宫内膜上皮细胞重塑的分子调控机制 | 小鼠子宫内膜（特别是腔上皮细胞） | 生殖生物学/发育生物学 | 生殖系统疾病（胚胎植入相关） | CUT&RUN测序，单细胞RNA-seq，免疫染色 | NA | 基因组学数据，转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-04-02 |
Network Hypoactivity in ALG13-CDG: Disrupted Developmental Pathways and E/I Imbalance as Early Drivers of Neurological Features in CDG
2026-01-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020147
PMID:41597222
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC皮质类器官，揭示了ALG13-CDG是一种大脑特异性低糖基化疾病，通过多组学与功能分析阐明了其导致皮质网络功能障碍的机制 | 首次通过人类皮质类器官模型揭示ALG13-CDG的大脑特异性糖基化缺陷机制，并整合多组学与电生理记录发现早期网络活动低下及兴奋/抑制失衡的发育时序异常 | 类器官模型虽能模拟早期发育，但无法完全再现成熟大脑的复杂结构与环路；研究样本量有限；机制验证仍需进一步体内实验 | 阐明ALG13-CDG疾病中ALG13功能缺失对大脑糖基化及神经发育的影响机制 | ALG13-CDG患者来源的iPSC皮质类器官 | 神经发育疾病研究 | 先天性糖基化障碍（CDG） | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、糖蛋白质组学、N-聚糖成像、脂质组学、代谢组学、MEA电生理记录 | 人类皮质类器官模型 | 多组学数据（转录组、蛋白质组、糖基化组、脂质组、代谢组）及电生理信号 | ALG13-CDG患者来源的iPSC皮质类器官（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 114 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals hepatocyte heterogeneity in response to radiation-induced liver injury and regeneration
2026-01, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2025.111225
PMID:41429723
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了辐射诱导肝损伤后肝细胞的异质性反应与再生机制 | 首次在辐射诱导肝损伤模型中，结合单细胞和单核RNA测序以及蛋白质组学分析，系统描绘了肝细胞亚群在空间和时间上的动态响应，并验证了人类肝组织中的保守通路激活 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本验证有限；未深入探讨长期再生效果或临床转化潜力 | 阐明辐射诱导肝损伤的分子机制及肝细胞再生过程 | 大鼠肝细胞及人类肝组织 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 大鼠模型及人类肝组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-04-02 |
GSK3β as a potential regulator in AML: A pan-cancer multi-omics analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344994
PMID:41915675
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，分析了GSK3α/β在31种癌症中的表达模式，揭示了其在肿瘤发生和免疫调节中的不同作用，并验证了GSK3β在AML中的关键调控功能 | 首次通过泛癌多组学分析揭示了GSK3α/β在不同癌症中的差异失调模式，并发现GSK3β在AML中作为高优先级治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞系验证，缺乏体内实验和临床样本的直接验证 | 探究GSK3α/β在多种癌症中的表达模式、预后价值及免疫调节功能 | 31种癌症的多组学数据及AML细胞系（THP-1） | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 多组学分析、单细胞RNA-seq、体外细胞实验 | Cox回归分析 | 多组学数据、基因表达数据 | TCGA、GTEx及单细胞RNA-seq数据库中的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-04-02 |
Integrated transcriptome and single-cell sequencing analysis identify blood-pancreas shared lncRNA biomarkers in new-onset T2DM
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345359
PMID:41915667
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研究论文 | 本研究通过整合转录组测序和单细胞RNA测序，识别了初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 首次整合外周血转录组与胰岛单细胞测序数据，识别血液与胰腺共享的lncRNA作为T2DM早期系统性生物标志物 | 样本量相对较小，且为横断面研究，需进一步纵向验证 | 识别初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 初发2型糖尿病患者的外周血样本和胰岛组织 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | RNA-seq数据 | 初始队列：8名T2DM患者和8名对照；单细胞队列：17名T2DM供体；验证队列：85名T2DM患者和85名对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-04-02 |
Single-Cell/Nucleus RNA-Sequencing for Phytohormone Signaling in Plants
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_10
PMID:41917663
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综述 | 本文详细介绍了单细胞/单核RNA测序技术在植物激素信号研究中的应用方法 | 利用scRNA-seq和snRNA-seq技术，在转录组水平实现细胞异质性的高分辨率映射，为植物激素信号研究提供了新方法 | NA | 研究植物激素信号传导的基因调控网络 | 植物细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-04-02 |
Single-Cell Transcriptomics in Arabidopsis in Response to Salicylic Acid and Jasmonic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_11
PMID:41917664
|
研究论文 | 本文提供了针对拟南芥水杨酸和茉莉酸响应的单细胞核RNA测序实验方案及生物信息学分析流程 | 开发了针对植物激素处理的单细胞核RNA测序端到端实验方案，并结合计算流程实现细胞类型分辨的激素免疫响应解析 | NA | 解析水杨酸和茉莉酸在植物免疫中的细胞类型特异性响应机制 | 拟南芥 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-04-02 |
Stereo-Seq Transcriptomics in Arabidopsis Leaves in Response to Salicylic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_12
PMID:41917665
|
研究论文 | 本文描述了一个完整的Stereo-seq工作流程，用于研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 首次将Stereo-seq技术应用于拟南芥叶片响应水杨酸的空间转录组研究，并提供了从样本制备到数据分析的完整工作流程 | 未明确说明样本数量，且工作流程可能受特定平台限制 | 研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 拟南芥叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | STOmics, MGI | 空间转录组学 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片, DNBSEQ平台 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片用于文库构建，DNBSEQ平台用于测序 |
| 120 | 2026-04-02 |
APOE and CCR2: Potential Macrophage-Specific Biomarkers in the Rheumatoid Arthritis Synovial Microenvironment Identified by Bioinformatics and Experimental Verification in Murine Models
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S587712
PMID:41918589
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，在类风湿关节炎滑膜微环境中识别出APOE和CCR2作为潜在的巨噬细胞特异性生物标志物 | 结合批量与单细胞RNA-seq数据，识别出在滑膜巨噬细胞中特异性高表达并与炎症反应相关的枢纽基因APOE和CCR2，并通过实验验证了其表达调控 | 需要进一步研究以阐明APOE和CCR2在类风湿关节炎中的具体作用机制 | 识别类风湿关节炎中巨噬细胞特异性的枢纽基因并研究其生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织及小鼠RAW264.7细胞系 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, ELISA, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |