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当前共找到 35198 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-01-14 |
A prognostic matrix gene expression signature defines functional glioblastoma phenotypes and niches
2024-Jun-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4541464/v1
PMID:38947019
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研究论文 | 本研究通过计算基因组学和蛋白质组学方法，分析胶质母细胞瘤中细胞外核心基质蛋白表达的功能和临床相关性，并开发了一个17基因的基质组表达特征用于患者分层 | 识别了基质蛋白表达特征，将胶质母细胞瘤分为高表达和低表达组，并发现该特征与患者生存、致癌改变、间充质状态及免疫检查点基因表达相关，且比MGMT启动子甲基化状态和经典亚型具有更强的预后价值 | 未明确说明样本量或数据来源的具体限制，可能依赖于现有数据库的覆盖范围和准确性 | 探究胶质母细胞瘤中细胞外核心基质蛋白表达的功能和临床意义，以改善患者分层和治疗策略优化 | 胶质母细胞瘤肿瘤组织 | 计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | 计算基因组学，蛋白质组学，单细胞转录组分析，空间解剖分析 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据，单细胞转录组数据，空间解剖数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 122 | 2026-01-14 |
Mapping Somatosensory Afferent Circuitry to Bone Identifies Neurotrophic Signals Required for Fracture Healing
2024-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597786
PMID:38895367
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研究论文 | 本研究通过绘制骨组织的体感传入神经回路，揭示了骨折愈合过程中神经源性营养信号的关键作用 | 首次系统性地绘制了长骨体感传入神经的神经解剖学回路，并发现神经元来源的FGF9是骨折修复的重要调节因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证；单细胞测序样本量相对有限 | 阐明骨骼伤害感受和再生过程中的精确神经解剖学回路及神经源性信号机制 | 小鼠长骨的体感背根神经节（DRG）传入神经元 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），逆向标记技术，多组织相互作用分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 6,648个DRG神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2026-01-14 |
Shared and Compartment-Specific Processes in Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus During Intervertebral Disc Degeneration
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309032
PMID:38403470
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康和病变人类椎间盘中的纤维环和髓核细胞，揭示了椎间盘退变过程中共享和特异性的细胞变化 | 首次在单细胞水平上同时比较了纤维环和髓核在椎间盘退变中的细胞变化，并识别出新的疾病相关细胞亚群及其调控网络 | 样本数量有限，且仅基于手术分离的组织，可能无法完全代表早期退变阶段 | 阐明椎间盘退变的细胞机制，为精准治疗提供靶点 | 人类椎间盘的纤维环和髓核组织 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 纤维环：19,978和26,983个细胞；髓核：20,884和24,489个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2026-01-14 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和活体成像技术，揭示了骨髓细胞-Mas信号在调节对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞之间致病性串扰的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和长时间活体成像，系统解析了骨髓细胞-Mas信号在AILI微环境中的调控机制，并在患者样本中验证了其临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩大规模；Mas信号的具体下游效应分子机制有待进一步阐明 | 阐明对乙酰氨基酚诱导的肝损伤中微环境的细胞互作和分子机制 | Mas1缺陷小鼠和对乙酰氨基酚诱导的肝损伤患者样本 | 单细胞组学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 影像数据 | Mas1缺陷小鼠模型和急性肝衰竭患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 125 | 2026-01-14 |
CIRI-Deep Enables Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Circular RNAs with Deep Learning
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308115
PMID:38308181
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIRI-deep的深度学习模型，用于在单细胞和空间转录组数据中全面预测环状RNA的调控 | 开发了首个能够处理单细胞和空间转录组数据的深度学习模型，专门用于环状RNA的全面预测和调控分析 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 解决单细胞和空间转录组技术在环状RNA分析中的效率限制，扩展环状RNA研究的应用范围 | 环状RNA及其在单细胞和空间转录组数据中的调控事件 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度学习 | RNA-seq数据 | 基于2500万个高置信度环状RNA调控事件的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2026-01-14 |
Quantifying Landscape-Flux via Single-Cell Transcriptomics Uncovers the Underlying Mechanism of Cell Cycle
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308879
PMID:38353329
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA速度重建细胞周期的连续向量场，量化单细胞全局非平衡动态景观-通量，揭示细胞周期调控机制 | 首次将景观-通量理论与单细胞转录组数据结合，量化细胞周期启动的基本能量成本，并识别维持细胞周期动力学的关键基因 | 方法主要基于转录组数据，可能未完全捕捉蛋白质水平或其他层面的调控机制 | 理解细胞周期的转录调控机制和驱动力量 | 细胞周期过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 向量场模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-01-14 |
Distribution-Agnostic Deep Learning Enables Accurate Single-Cell Data Recovery and Transcriptional Regulation Interpretation
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307280
PMID:38380499
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研究论文 | 本文提出了一种名为Bis的分布无关深度学习模型，用于准确恢复单细胞RNA测序数据中的缺失基因表达值 | Bis模型基于最优传输的自编码器架构，无需严格数据假设，能捕获复杂数据分布，并通过批量RNA测序数据引导重建以确保表达一致性 | 未明确提及模型在极端稀疏数据或跨物种应用中的局限性 | 开发一种能准确恢复单细胞RNA测序数据中缺失表达值的深度学习模型，以提升下游分析效果 | 单细胞RNA测序数据，包括模拟数据集、真实数据集以及头颈鳞状细胞癌微环境中的罕见细胞亚群 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 基于最优传输的自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2026-01-14 |
NAMPT-Driven M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages Leads to an Immunosuppressive Microenvironment in Colorectal Cancer
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303177
PMID:38308188
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研究论文 | 本研究探讨了NAMPT在结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞M2极化中的作用及其对免疫抑制微环境的影响 | 首次利用单细胞RNA测序数据揭示NAMPT在SPP1肿瘤相关巨噬细胞中的高表达，并发现其与预后不良相关，同时通过小鼠模型证明NAMPT缺失可改变巨噬细胞极化状态并增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，人类样本验证有限，且NAMPT靶向治疗策略的临床转化潜力尚未在人体试验中证实 | 探究NAMPT在结直肠癌肿瘤微环境中对巨噬细胞极化和免疫调节的作用机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及小鼠模型和人类结直肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2026-01-14 |
Identification of Potent siRNA Delivery Peptides Using Computer Modeling
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308345
PMID:38311577
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于计算机建模和单细胞RNA测序的筛选程序，用于识别有效的siRNA递送肽 | 结合计算机建模和单细胞RNA测序进行多阶段筛选，以识别具有理想组装、递送能力和体内组织安全性的siRNA递送肽 | NA | 开发基于肽的RNA干扰疗法，用于siRNA递送 | siRNA递送肽 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算机建模 | 序列数据 | 包含12个氨基酸的文库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-01-14 |
Melanoma Derived Exosomes Amplify Radiotherapy Induced Abscopal Effect via IRF7/I-IFN Axis in Macrophages
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304991
PMID:38286661
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤来源的外泌体通过circPIK3R3/miR-872-3p/IRF7轴促进巨噬细胞分泌I型干扰素，从而增强放疗诱导的远隔效应 | 首次发现肿瘤来源外泌体携带的circPIK3R3通过调控巨噬细胞IRF7/I-IFN轴介导放疗远隔效应的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究多依赖体外实验 | 探究放疗诱导肿瘤远隔效应的详细分子机制 | 黑色素瘤荷瘤小鼠模型（皮下肿瘤和肺转移灶） | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、荧光素酶报告基因、RNA Pull-down、荧光原位杂交 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、成像数据、流式数据 | 荷瘤小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-01-14 |
Spatial Transcriptomic and Metabolomic Landscapes of Oral Submucous Fibrosis-Derived Oral Squamous Cell Carcinoma and its Tumor Microenvironment
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306515
PMID:38229179
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学和空间代谢组学技术，揭示了口腔黏膜下纤维化（OSF）衍生的口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其肿瘤微环境中的细胞空间分布、转录组和代谢组景观 | 首次在OSF衍生的OSCC组织中，利用空间多组学技术揭示了部分癌细胞在原位癌区域经历部分上皮-间质转化（pEMT），获得成纤维细胞样表型并参与胶原沉积，同时发现了异常的聚胺代谢在促进肿瘤发生和免疫逃逸中的关键作用 | 研究样本可能有限，且空间多组学技术的分辨率或覆盖范围可能存在技术限制，需要进一步验证和扩展研究 | 探究OSF恶性转化为OSCC的具体分子机制，包括细胞表型变化、肿瘤微环境相互作用及代谢重编程 | OSF衍生的OSCC组织样本，包括癌细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 空间多组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学（ST）、空间代谢组学（SM） | NA | 空间转录组数据、空间代谢组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-01-14 |
Single-Cell Sequencing Reveals Functional Alterations in Tuberculosis
2024-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305592
PMID:38192178
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研究论文 | 本研究开发了一个整合单细胞RNA测序和细胞表面抗体测序的新技术平台，以揭示结核病患者免疫细胞功能异质性 | 开发了一个整合基因组和表型信息的新技术平台，首次在结核病研究中同时分析单细胞转录组和表面抗体序列 | 样本量相对较小，仅基于外周血单个核细胞，未涉及组织特异性免疫反应 | 阐明结核分枝杆菌与人类免疫细胞相互作用的功能异质性，以确定宿主免疫强度和结核病结局 | 原发性结核病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 细胞表面抗体测序 | NA | 单细胞转录组数据, 抗体序列数据 | 23,990个外周血单个核细胞，来自新队列的原发性结核病患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 133 | 2026-01-14 |
Olfactomedin-4 + neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage and worsen host survival after Clostridioides difficile infection
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.553751
PMID:37662327
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研究论文 | 本研究探讨了嗜中性粒细胞在艰难梭菌感染（CDI）中加剧肠道上皮细胞损伤的作用，并首次建立了CDI后骨髓、血液和结肠嗜中性粒细胞的转录组图谱 | 首次利用单细胞转录组学揭示了CDI中嗜中性粒细胞的亚型和生物学通路，特别是OLFM4+嗜中性粒细胞在加剧肠道上皮损伤中的致病作用 | 研究主要基于动物模型和细胞共培养，人类样本验证有限，且未深入探讨OLFM4的具体作用机制 | 阐明嗜中性粒细胞在CDI中的功能角色及其对肠道上皮损伤的影响 | 嗜中性粒细胞、肠道上皮细胞、CDI感染的小鼠模型和人类样本 | 数字病理学 | 肠道感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2026-01-13 |
Spatial transcriptomics in the human left atrial appendage and pulmonary vein sleeve
2026 Mar-Apr, Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.carpath.2025.107802
PMID:41314481
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析人类左心耳和肺静脉袖组织的基因表达空间分布 | 首次在人类肺静脉和左心耳组织中应用空间转录组学技术，揭示了AF相关基因PITX2、SHOX2和HCN4的空间表达模式 | 样本来源于未使用的移植供体，可能无法完全代表AF患者的病理状态 | 探究心房颤动（AF）治疗中肺静脉隔离的分子机制和基因表达特征 | 人类肺静脉（PV）和左心耳（LAA）组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | Seurat聚类分析 | 空间转录组数据 | 未使用的移植供体组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2026-01-13 |
NeuN expression in health and disease: A histological perspective on neuronal heterogeneity
2026-Feb, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-18-965
PMID:40697072
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综述 | 本文综述了NeuN（Rbfox3）作为神经元标记物在健康和疾病状态下的表达模式、分子调控机制及其在神经科学研究与诊断中的意义 | 提出NeuN不应被视为二元标记物，而是神经元状态的动态指标，并建议采用多标记策略和空间转录组学等分子工具来提高神经元分析的分辨率 | NA | 探讨NeuN在神经元异质性中的表达变化及其在病理条件下的调控，以改进神经元识别和功能评估 | 成熟神经元，特别是嗅球僧帽细胞、小脑浦肯野细胞和视网膜光感受器等NeuN阴性神经元类型 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 免疫组织化学、空间转录组学、RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2026-01-13 |
Deciphering the role of angiogenesis in glioblastoma: Integrative insights from transcriptomic profiling, single-cell sequencing and interpretable machine learning approaches
2026-Feb, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156305
PMID:41380386
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研究论文 | 本研究通过整合转录组分析、单细胞测序和可解释机器学习方法，揭示了血管生成相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 | 识别了六个核心血管生成相关基因（BMP2、FSCN1、NET1、AEBP1、SEMA3G和RAB37），构建了新的风险分层模型，并通过SHAP分析增强了模型的可解释性，同时结合免疫荧光验证了FSCN1蛋白的多功能定位 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要进一步的前瞻性验证和实验研究来确认这些基因的生物学机制和临床转化潜力 | 系统研究血管生成相关基因在胶质母细胞瘤疾病进展中的功能意义，并开发预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序，转录组分析 | LASSO回归，Cox回归，多种生存预测算法 | 转录组数据，单细胞测序数据 | CGGA-GBM、GSE43378和GSE7696队列中的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2026-01-13 |
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf193
PMID:41522665
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，系统性地绘制了Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达图谱，揭示了其在平滑肌细胞中的稳定定位 | 首次采用自上而下的转录组学策略，结合系统范围和组织特异性映射，证实了Mustn1在多种肌肉骨骼组织（骨、滑膜、肌肉、肌腱）的平滑肌细胞中与Acta2共定位，并发现其与未表征的Sox9谱系细胞簇及肌肉骨骼纤维脂肪源性祖细胞存在重叠 | 研究依赖于开源单细胞RNA测序数据集，可能受数据质量和样本来源限制，未进行实验验证Mustn1蛋白功能 | 探究Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的细胞特异性表达模式，以理解其在发育和修复中的作用 | 肌肉骨骼组织（骨、滑膜、肌肉、肌腱）中的细胞，特别是表达aSMA的平滑肌细胞和Sox9谱系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2026-01-13 |
New insight into the risk stratification and treatment priority of breast cancer: TMT scoring system
2026-Jan-13, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004615
PMID:41427575
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研究论文 | 本研究引入了一种基于17个核心基因的肿瘤线粒体转移（TMT）评分系统，用于评估线粒体动力学及其对肿瘤微环境的影响，并探讨其与乳腺癌临床结局的关联 | 开发了新的TMT评分系统，结合多细胞和单细胞分辨率分析线粒体转移与免疫代谢特征的关联，并通过共培养实验验证发现 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性临床验证 | 改善乳腺癌的风险分层和治疗优先级，探索线粒体动力学作为预后生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），共培养实验 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 基于TCGA-BRCA和GEO数据库的综合数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-01-13 |
Extracellular matrix-derived mechanical force induces CDK4/6 inhibitor resistance by inhibiting NEK10 dependent cell cycle regulation in breast cancer
2026-Jan-12, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004527
PMID:41427545
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研究论文 | 本研究探讨了细胞外基质来源的生物力学信号如何通过抑制NEK10依赖的细胞周期调控，介导HR+、HER2-乳腺癌对CDK4/6抑制剂的耐药性 | 首次揭示了ECM生物力学信号通过细胞骨架依赖途径下调NEK10，进而抑制p53/CDKN1A轴并激活CDK2信号，导致CDK4/6抑制剂耐药的分子机制 | 研究主要基于体外模型和有限临床样本，体内验证和更大规模的前瞻性临床研究仍需进行 | 探究ECM来源的生物力学信号在乳腺癌CDK4/6抑制剂耐药中的作用及机制 | HR+、HER2-乳腺癌细胞、患者肿瘤组织及临床样本 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质印迹数据、临床预后数据 | 23例乳腺癌患者的单细胞测序数据、1092例TCGA患者数据、25例临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 140 | 2026-01-13 |
HMGB2-RAD21 Axis Promotes Fibro/Adipogenic Progenitor Proliferation and Regulates Fat Infiltration
2026-Jan-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514363
PMID:41524172
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了HMGB2-RAD21轴在调控猪胚胎肌肉中纤维/脂肪祖细胞增殖和脂肪浸润中的关键作用 | 首次构建了猪胚胎肌肉的发育图谱，并识别出HMGB2亚群作为调控FAP池大小的关键决定因素，揭示了HMGB2通过靶向RAD21在体内调控FAP增殖的新机制 | 研究主要基于猪和小鼠模型，在人类疾病中的直接应用仍需进一步验证，且对HMGB2-RAD21轴的具体分子通路细节有待深入探索 | 探究肌肉间脂肪浸润的分子和细胞机制，以改善肉类品质并减轻病理性的脂肪浸润 | 猪胚胎肌肉组织和小鼠模型中的纤维/脂肪祖细胞 | 单细胞测序 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 猪胚胎肌肉样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |