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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-02 |
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198545
PMID:41665972
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研究论文 | 本研究探讨了代谢减重手术对肥胖青少年2型糖尿病患者早期肾损伤的缓解作用及其分子机制 | 首次在青少年2型糖尿病肥胖患者中,通过配对肾活检样本,结合单细胞RNA测序、代谢组学和蛋白质组学,系统揭示了垂直袖状胃切除术后肾脏的结构和分子适应性变化,并发现了mTORC1/JAK/STAT信号通路的下调 | 样本量较小(n=5),且为观察性研究,无法完全排除混杂因素的影响 | 探究代谢减重手术如何缓解肥胖青少年2型糖尿病患者的早期肾损伤 | 患有2型糖尿病和严重肥胖的青少年 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,代谢组学,蛋白质组学,组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,组织学图像,临床数据 | 5名青少年(IMPROVE-T2D队列)的配对肾活检样本;64名青少年(Teen-LABS队列)的循环蛋白质组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-04-02 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究探讨了在闭合性头部损伤模型中,炎症小体适配蛋白ASC如何促进持续的神经炎症和轻度认知障碍 | 首次在单细胞水平揭示ASC在闭合性头部损伤后微胶质细胞中的选择性表达,并证明其在维持神经炎症和认知障碍中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;长期效应和具体分子机制需进一步探索 | 探究炎症小体相关基因在闭合性头部损伤模型中的细胞表达和功能意义 | 小鼠模型中的皮质组织,特别是微胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮质组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-04-02 |
Hmx2 and Dmrt2 Coordinate the Differentiation of Intercalated Cell Subtypes in Kidney
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000885
PMID:41051882
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Hmx2和Dmrt2在肾脏闰细胞亚型分化中的关键作用及其相互调控关系 | 首次明确了Hmx2和Dmrt2作为相互排斥的转录因子,分别调控B型和A型闰细胞的分化命运,并发现Dmrt2缺失时Hmx3表达激活的新补偿机制 | 未在Foxp1缺陷小鼠中通过Dmrt2敲入挽救闰细胞分化缺陷,表明可能存在其他调控通路 | 探究肾脏闰细胞亚型分化的转录调控机制 | 小鼠肾脏闰细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 条件性基因敲除、基因敲入、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、尿液酸化数据 | 小鼠模型及人类肾脏单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-04-02 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-Apr, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 本研究探讨了母体肥胖如何通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,揭示了母体肥胖通过增强AP-1转录因子对炎症基因启动子的可及性,直接抑制神经发生关键因子的机制 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;体外实验可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明母体肥胖影响胚胎神经发育的分子机制 | 母体肥胖小鼠模型中的胚胎(E11.5和E13.5)及神经源性细胞 | 单细胞组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, Gene Ontology分析 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 小鼠胚胎(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-02 |
Artificial soil (ArtSoil): Recreating soil conditions in synthetic plant growth media
2026-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70833
PMID:41911577
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研究论文 | 本文开发了一种名为人工土壤(ArtSoil)的合成植物生长培养基,旨在模拟自然土壤条件,以更准确地研究植物生长 | 通过结合土壤提取物(ASE)来维持土壤微生物群和土壤因子,同时无需糖补充,为实验室植物生长提供了更接近自然的替代方案 | NA | 开发一种合成生长培养基,以在实验室条件下更准确地模拟土壤环境,用于植物生理学和组学研究 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2026-04-02 |
Single Cell Analysis Reveals Dynamic Changes of Distinct Cell Populations in Human Nickel Allergy
2026-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70108
PMID:41090989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光分析,揭示了人类镍过敏中不同细胞群体的动态变化 | 首次在单细胞水平上识别了镍特异性激活的内皮细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和CCR7+树突状细胞,并明确了皮肤驻留T细胞在早期过敏反应中的非参与性 | 样本量有限,仅分析了镍过敏患者,且时间点仅限于8小时和72小时 | 探究人类镍过敏中不同细胞类型在致敏和激发阶段的作用机制 | 镍过敏患者的皮肤样本 | 单细胞组学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 镍过敏患者的皮肤样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-04-02 |
Goblet of fire: how Chlamydia ignites region-specific colitis by hijacking goblet cells
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI204928
PMID:41919496
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和单细胞RNA-seq数据分析,揭示了Chlamydia muridarum如何通过劫持杯状细胞并激活IDO1/kyneurine轴,驱动克罗恩病在特定肠道区域(如近端结肠)的炎症反应 | 首次鉴定出Chlamydia muridarum作为区域限制性炎症的必要且充分驱动因子,并阐明了其通过杯状细胞IDO1/kyneurine轴促进结肠特异性炎症的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自单细胞RNA-seq数据集分析,需要进一步实验验证其在人体中的直接适用性 | 探究克罗恩病区域特异性炎症的调控因素 | 小鼠模型中的肠道炎症及人类克罗恩病患者的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA-seq | TNF驱动的小鼠模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-04-02 |
KGLAR: Deconvoluting Spatial Transcriptomics Data with Single-cell Transcriptomes through Knowledge-guided NMF and Least Angle Regression
2026-Apr-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00815-w
PMID:41920506
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2026-04-02 |
In vivo CRISPR screens identify CBX4 as an epigenetic regulator for cancer immunotherapy
2026-Mar-31, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200564
PMID:41915438
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研究论文 | 本研究通过体内CRISPR筛选发现CBX4是癌症免疫治疗的关键表观遗传调控因子 | 首次通过体内CRISPR筛选鉴定出CBX4作为表观遗传免疫检查点,揭示了其通过沉默逆转录转座子调控肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肝癌患者数据,在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探索表观遗传调控因子在肿瘤免疫治疗耐药中的作用机制 | 小鼠肿瘤模型、接受新辅助抗PD-1治疗的肝癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 体内CRISPR-Cas9筛选、单细胞RNA测序、空间转录组学 | CRISPR筛选模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-04-02 |
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Mar-31, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70166
PMID:41915478
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化和孟德尔随机化分析,揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化和遗传支持的关键候选基因 | 首次在CTEPH中整合多组学数据(单细胞转录组、DNA甲基化、孟德尔随机化)进行互补分析,并识别出具有遗传支持的新型候选基因(如ETS1和FGR)及其诊断潜力 | 样本量相对有限,且为观察性研究,需进一步功能验证和更大队列验证 | 早期识别慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物以支持更准确的诊断和个体化治疗 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 遗传数据 | 未明确具体样本数,涉及CTEPH患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 | NA | NA |
| 51 | 2026-04-02 |
Sparser2Sparse: Single-shot Sparser-to-Sparse Learning for Spatial Transcriptomics Imputation with Natural Image Co-learning
2026-Mar-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3679252
PMID:41915529
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研究论文 | 提出了一种名为S2S-ST的新型单次稀疏到稀疏学习框架,用于空间转录组学数据插补,并利用自然图像进行协同训练 | 1) 提出稀疏到稀疏的自监督学习策略,利用ST数据内在空间模式从更稀疏子集预测部分观测稀疏区域;2) 引入与自然图像的跨域协同学习以增强特征表示;3) 设计级联数据一致性插补网络(CDCIN),在迭代优化预测的同时保持采样基因数据的保真度 | NA | 解决高分辨率空间转录组学数据成本高、稀缺性的挑战,实现从稀疏输入进行准确数据插补 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 级联数据一致性插补网络(CDCIN) | 空间转录组学数据,自然图像 | 多种组织类型(包括乳腺癌、肝脏和淋巴组织) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-04-02 |
Biomimetic Bamboo-Inspired Bone Repair Scaffold: Reversing Degraded States and Promoting Mesenchymal Stem Cell Differentiation
2026-Mar-31, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00387
PMID:41915781
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研究论文 | 本研究报道了一种受竹子和骨小梁结构启发的多功能骨修复支架,旨在通过上调关键基因逆转骨质疏松中骨髓间充质干细胞的衰老表型,从而促进骨再生 | 设计了一种结合聚乳酸纳米取向纤维和I型胶原的仿生支架,其独特的纺锤形互连孔隙结构模拟了骨小梁的管腔陷窝,并通过上调Slc25a33和Crabp1基因来逆转细胞衰老 | 研究主要在老年骨质疏松大鼠模型中进行,尚未在更广泛的骨质疏松模型或临床患者中验证其长期安全性和有效性 | 开发一种能够逆转骨髓间充质干细胞衰老、促进骨质疏松性骨缺损修复的新型骨支架材料 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)、老年骨质疏松大鼠 | 组织工程与再生医学 | 骨质疏松症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、组织学数据、力学性能数据 | 15月龄老年骨质疏松大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-04-02 |
Identification of suicide brain transcriptomic signatures using meta-analysis of multiple cohorts
2026-Mar-31, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-03978-8
PMID:41916959
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研究论文 | 本研究通过整合多个公开的死后脑转录组数据集和一个国内队列,进行了一项全面的荟萃分析,以识别自杀相关的脑转录组特征 | 首次通过整合16个队列的转录组数据进行大规模荟萃分析,识别出自杀相关的多个基因和长链非编码RNA,并揭示了小胶质细胞、星形胶质细胞、免疫反应和髓鞘调控等潜在分子通路 | 研究主要基于死后脑组织样本,可能受到死后变化、样本异质性和技术平台差异的影响,且识别出的基因仅达到名义显著性水平 | 识别自杀的脑转录组生物标志物,以促进有效的预防和治疗策略的开发 | 死后人脑组织样本 | 生物信息学 | 精神疾病 | RNA测序, 微阵列, 单细胞RNA测序 | 荟萃分析, 差异表达分析, 通路富集分析, 细胞集富集分析 | 转录组数据 | 16个队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-04-02 |
Complement 5a receptor 2 attenuates diabetic kidney disease by promoting mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane formation mediated by PSS-MFN2 interaction
2026-Mar-31, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-026-00873-w
PMID:41916963
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研究论文 | 本研究揭示了补体5a受体2(C5aR2)通过促进PSS-MFN2相互作用介导的线粒体相关内质网膜形成,从而改善糖尿病肾病(DKD)的新机制 | 首次阐明了C5aR2在DKD中的非经典代谢调控作用,发现其通过c-FOS/PSS/MFN2信号轴促进MAM形成和磷脂酰丝氨酸生物合成,并证实C5aR2特异性激动剂P59的治疗潜力 | 研究主要在动物模型中进行,临床转化效果需进一步验证;单细胞测序分析样本量有限 | 探究C5aR2在糖尿病肾病代谢调控中的作用机制 | 糖尿病肾病患者组织样本、糖尿病小鼠模型(包括C5aR2缺陷小鼠和db/db小鼠)、近端肾小管细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织病理数据 | 糖尿病肾病患者组织、多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-04-02 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2026-Mar-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71027-5
PMID:41917025
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研究论文 | 本研究揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染期间被激活,通过免疫调节和组织重塑增强肺部防御功能 | 首次在免疫正常和免疫抑制宿主中,利用细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序技术,系统研究了肺成纤维细胞对烟曲霉感染的功能响应,并发现了一个具有获得性免疫调节特性和增强细胞外基质分泌能力的成纤维细胞亚群 | NA | 探究肺成纤维细胞在烟曲霉感染引起的肺部损伤中的功能响应及其在宿主防御中的作用 | 烟曲霉感染的小鼠模型中的肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺部感染/侵袭性曲霉病 | 单细胞RNA测序,细胞谱系追踪,靶向细胞消融 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-04-02 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
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研究论文 | 本文提出了一种基于空间转录组数据的生成式AI模型,用于预测大脑血管系统的空间组织结构 | 利用空间mRNA引导的生成模型Tera-MIND,通过Cldn5和Acta2基因的共表达模式及其学习到的注意力图,在细胞级别分辨率上预测大脑血管空间组织 | NA | 探索大脑血管系统的结构变异性和区域特异性功能,以解释疾病模型中的神经学改变 | 小鼠大脑血管系统 | 数字病理学 | 神经疾病 | 空间转录组学 | 生成式AI模型,基于patch和边界感知的扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 57 | 2026-04-02 |
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01394-1
PMID:41917254
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法,系统性地揭示了VDAC2在泛癌中的致癌作用及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路影响肿瘤进展和免疫逃逸的机制 | 首次在泛癌层面系统性地整合了批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据来研究VDAC2,并识别了VDAC2-BAK1-IFNγ这一在消化系统癌症中重要的新通路 | 体外实验验证主要集中于胃癌细胞,需要在更多癌症类型和体内模型中进行进一步验证 | 系统性地挖掘VDAC2在泛癌中的作用,探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 泛癌数据集、胃癌细胞系 | 机器学习 | 泛癌(重点关注消化系统癌症) | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-PCR, 细胞共培养, CCK-8检测, Transwell侵袭实验, ELISA | NA | 转录组数据, 细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of urothelial carcinoma with basal/squamous differentiation identifies Galectin-7 as a specific marker of squamous lineage commitment
2026-Mar-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04927-z
PMID:41917522
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2026-04-02 |
Compact and informative representation learning for scRNA-seq data clustering with masked information bottleneck
2026-Mar-31, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02590-y
PMID:41917934
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研究论文 | 提出了一种名为scMIB的掩码信息瓶颈框架,用于从单细胞RNA测序数据中学习紧凑且信息丰富的表示,以提升细胞聚类的准确性和鲁棒性 | 结合了基于掩码的去噪策略与信息瓶颈目标,通过扰动基因表达模式并训练模型恢复信息结构,同时压缩冗余信号并保留对聚类最相关的信息,还引入了掩码一致性学习机制以捕获稳定的基因水平模式 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中高稀疏性、噪声和冗余性对细胞聚类准确性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码信息瓶颈框架 | 基因表达数据 | 多个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-04-02 |
Translation of scRNA-Seq to a clinical blood test for infection diagnostics
2026-Mar-31, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2026.2647154
PMID:41918251
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DIRECT LS-TA的新型血液检测方法,用于感染诊断,通过单细胞类型特异性基因表达分析提高准确性 | 开发了无需细胞分选的单细胞类型(单核细胞)特异性基因表达定量方法,相比传统方法更经济且易于临床实施 | 方法主要针对单核细胞,可能不适用于其他细胞类型;且依赖于广泛可用的PCR设备,可能受限于特定实验室条件 | 开发一种临床可用的血液检测方法,用于早期和准确诊断发热性疾病 | 发热性疾病患者的外周血样本,特别是单核细胞的基因表达 | 数字病理学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序,定量PCR,数字PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |