单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-10-01	NMDAR antagonists suppress tumor progression by regulating tumor-associated macrophages 2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2302126120 PMID:37967215	研究论文	本研究揭示了NMDAR在肿瘤相关巨噬细胞中的免疫抑制功能及其拮抗剂的抗肿瘤作用	首次发现NMDAR通过钙内流和活性氧生成调控肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制功能，并证明NMDAR拮抗剂可增强抗肿瘤免疫	研究仅针对肝细胞肉瘤和纤维肉瘤模型，未验证其他肿瘤类型	探究NMDAR在肿瘤微环境中对巨噬细胞的调控机制及治疗潜力	肿瘤相关巨噬细胞、T细胞、NK细胞	肿瘤免疫学	肝细胞肉瘤、纤维肉瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	临床前肝肿瘤模型
102	2025-10-01	Controlling donor and newborn neuron migration and maturation in the eye through microenvironment engineering 2023-11-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2302089120 PMID:37931105	研究论文	本研究通过微环境工程方法调控供体和新生神经元在眼中的迁移与成熟过程	建立了'计算机模拟-体外实验-体内验证'框架，利用SDF1分子构建人工梯度显著提升视网膜神经节细胞的迁移效率	仅测试了六种受体-配体候选物中的最优分子，未验证其他候选分子的效果	开发控制移植后供体细胞功能的微环境工程技术	视网膜神经节细胞(RGCs)和干细胞来源的神经元	神经再生工程	青光眼和视神经病变	单细胞转录组分析、计算机模拟分析、体外功能实验	NA	转录组数据、实验观察数据	人类发育视网膜单细胞转录组数据
103	2025-10-01	Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution 2023-10, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06569-5 PMID:37758947	研究论文	本研究通过STARmap PLUS原位测序技术构建了小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱	开发了STARmap PLUS原位测序方法，首次在三维空间中以单细胞分辨率同时分析1022个基因，创建了包含109万个高质量细胞的空间图谱	NA	构建小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱，揭示大脑解剖结构和功能的分子基础	成年小鼠大脑和脊髓组织	空间转录组学	NA	STARmap PLUS原位测序、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、空间位置数据	109万个高质量细胞，覆盖整个成年小鼠大脑和脊髓
104	2025-10-01	A cellular and molecular spatial atlas of dystrophic muscle 2023-07-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2221249120 PMID:37410813	研究论文	本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNAseq数据，构建了营养不良肌肉的高分辨率细胞和分子空间图谱	首次结合空间转录组学和单细胞RNAseq技术，揭示了DMD肌肉中细胞群体的非均匀分布和异步再生过程	研究基于D2-mdx小鼠模型，需要进一步验证在人类DMD肌肉中的适用性	研究杜氏肌营养不良症(DMD)中异步肌肉再生对疾病进展的生物学机制	严重营养不良的D2-mdx小鼠模型的肌肉组织	空间生物学	杜氏肌营养不良症	空间转录组学、单细胞RNAseq	NA	空间转录组数据、单细胞RNAseq数据	D2-mdx小鼠肌肉组织样本
105	2025-10-01	Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease 2023-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-022-01251-x PMID:36732642	研究论文	开发了一种结合空间转录组学和蛋白质检测的新方法，用于绘制阿尔茨海默病小鼠模型中的单细胞转录状态和组织病理学	首次将高分辨率空间转录组学与蛋白质检测在同一组织切片中结合，实现了亚细胞分辨率下的分子与病理关联分析	目前仅在阿尔茨海默病小鼠模型中验证，尚未在人类组织或其他疾病模型中应用	开发能够全面捕捉复杂疾病时空动态变化的研究方法	阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织（8月龄和13月龄）	空间转录组学	阿尔茨海默病	STARmap PLUS（空间转录组学结合蛋白质检测）	NA	空间转录组数据、蛋白质表达数据、组织图像	阿尔茨海默病小鼠模型在不同时间点（8月和13月）的脑组织样本
106	2025-10-01	A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche 2023-01, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-022-01243-4 PMID:36543915	研究论文	通过多组学单细胞/细胞核和空间转录组学技术构建人类肺部空间分辨图谱，发现并验证气道黏膜下腺体中的免疫生态位	首次发现并验证气道黏膜下腺体中存在IgA浆细胞生存生态位，揭示了腺体上皮细胞通过表达CCL28、APRIL和IL-6招募B细胞和IgA浆细胞并促进其局部存活和抗体分泌的新机制	仅使用健康人类肺部样本，未涉及疾病状态下的验证	重新定义肺部和气道的组织结构，解析肺部细胞类型的空间分布特征	健康人类肺部五个近端到远端位置的样本	空间转录组学	呼吸系统疾病	多组学单细胞/细胞核测序、空间转录组学	计算数据整合分析	单细胞转录组数据、空间转录组数据	五个不同位置的健康人类肺部样本
107	2025-10-01	Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens 2021-12, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-021-00938-x PMID:34663959	研究论文	通过单细胞RNA测序和多重误差鲁棒荧光原位杂交技术解析小鼠伏隔核的分子和细胞异质性	首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的空间分辨细胞分类体系	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种	揭示伏隔核功能多样性的分子、细胞和解剖学基础	小鼠伏隔核脑区细胞	神经科学	神经疾病	单细胞RNA测序、多重误差鲁棒荧光原位杂交	NA	基因表达数据、空间定位数据	NA
108	2025-09-30	Single-cell transcriptomics unveils iron dysregulation in macrophages: Implicated genes in periodontitis pathogenesis identified via Mendelian randomization 2026-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101544 PMID:41019505	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
109	2025-09-30	Uncovering stromal cell fate genes and a novel risk stratification in UCEC by integrating single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis 2026-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101743 PMID:41019513	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
110	2025-09-30	CAR T cell engineering impacts antigen-independent activation and co-inhibition 2025-Dec-11, Molecular therapy. Methods & clinical development DOI:10.1016/j.omtm.2025.101586 PMID:41020262	研究论文	比较慢病毒载体和睡美人转座子系统在CAR-T细胞工程中的差异及其对T细胞特性的影响	首次系统比较慢病毒和睡美人非病毒系统在CAR-T细胞制造中的差异，发现工程方式会显著影响T细胞的表型和功能特性	患者来源的T细胞在睡美人系统中CAR表达率较低，增殖能力减弱，T细胞多样性降低	评估不同CAR-T细胞工程方法对T细胞特性的影响	健康供体和慢性淋巴细胞白血病患者来源的T细胞	细胞工程与免疫治疗	白血病	慢病毒载体、睡美人转座子、流式细胞术、单细胞测序	NA	流式细胞数据、单细胞测序数据	健康供体和CLL患者来源的T细胞样本
111	2025-09-30	Single-cell multiomics reveals multiple adipogenic pathways and diverse multilineage specializations during embryonic fat tail morphogenesis 2025-Oct-17, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.113496 PMID:41019374	研究论文	本研究通过单细胞多组学技术揭示了绵羊胚胎尾部脂肪形态发生过程中的多种脂肪生成途径和多样化的多谱系特化	首次在脂肪尾绵羊胚胎发育过程中应用单细胞多组学测序技术，揭示了脂肪沉积的三种主要细胞来源和关键增强子驱动的基因调控网络	研究聚焦于特定绵羊品种的胚胎发育过程，结果在其他哺乳动物中的普适性需要进一步验证	探究哺乳动物胚胎脂肪生成的细胞来源和分子调控机制	脂肪尾绵羊胚胎发育过程中的脂肪组织	单细胞生物学	NA	单细胞多组学测序、scRNA-seq、snATAC-seq	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	绵羊胚胎E50至E80发育阶段的组织样本
112	2025-09-30	Ptgs2+ CPTC Function as a "Force-Immune Axis" by Responding to Acupuncture and Mediating M2 Macrophage Activation for Anti-Inflammatory Effects 2025-Oct-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202501175RR PMID:41017691	研究论文	本研究通过单细胞测序发现Ptgs2+ CPTC作为'力学-免疫轴'响应针刺刺激并通过Il6-Il6st-Stat3通路激活M2巨噬细胞产生抗炎效应	首次确立Ptgs2+ CPTC作为连接机械刺激与免疫调节的关键'力学-免疫轴'	NA	探索筋膜组织中细胞景观及其在针刺抗炎机制中的作用	腹部中线筋膜中的Cd34+/Pdgfra+端细胞(CPTC)及其亚群	细胞生物学	炎症性疾病	单细胞测序、深度学习、细胞形态学分析	深度学习模型	单细胞测序数据、细胞形态数据	痢疾大鼠模型
113	2025-09-30	Activated MAFB in ovarian cancer promotes cytoskeletal remodeling and immune microenvironment suppression by interfering with m6A modifications through WTAP competition 2025-Oct, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03522-w PMID:40796955	研究论文	本研究揭示了MAFB通过竞争WTAP干扰m6A修饰，促进卵巢癌细胞骨架重塑和免疫微环境抑制的新机制	首次发现MAFB通过竞争性结合m6A甲基转移酶复合物核心组分WTAP，建立MAFB-WTAP-CD55调控轴，连接转录调控与表观转录组修饰	NA	探索卵巢癌免疫逃避的分子机制，识别关键调控因子	卵巢癌患者临床队列和单细胞转录组数据	癌症生物学	卵巢癌	单细胞转录组测序，临床队列分析，临床前模型验证	NA	转录组数据，临床数据	多个临床队列和单细胞转录组数据集
114	2025-09-30	Taurine improves bovine oocyte maturation through recovering mitochondrial dysfunction and oxidative stress-induced apoptosis after microplastics exposure 2025-Oct, Journal of dairy science IF:3.7Q2 DOI:10.3168/jds.2025-26435 PMID:40818686	研究论文	本研究探讨微塑料暴露对牛卵母细胞的生殖毒性及牛磺酸的修复作用	首次揭示微塑料通过线粒体功能障碍导致牛卵母细胞成熟失败，并发现牛磺酸可逆转此毒性效应	研究仅使用牛卵母细胞，未涉及其他物种验证	探究微塑料对雌性生殖系统的毒性机制及牛磺酸的保护作用	牛卵母细胞	生殖毒理学	生殖系统疾病	免疫荧光染色、单细胞转录组测序	NA	图像数据、基因表达数据	未明确样本数量
115	2025-09-30	The Role of p53 in Adipocyte Differentiation and Lipid Metabolism in Obese Mice via Transcriptional Regulation of Lgals3 2025-Oct, Obesity (Silver Spring, Md.) DOI:10.1002/oby.24363 PMID:40897545	研究论文	本研究探讨p53通过转录调控Lgals3在肥胖小鼠脂肪细胞分化和脂质代谢中的作用	首次揭示p53通过转录抑制Lgals3调控脂肪细胞分化和脂质代谢的新机制	研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系，人类临床验证尚需进一步研究	研究p53对Lgals3表达的调控作用及其在肥胖相关代谢紊乱中的功能	高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型和3T3-L1前脂肪细胞系	分子生物学	肥胖症	生物信息学分析、单细胞RNA测序、双荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀、RT-qPCR、Western blot	NA	基因表达数据、蛋白质数据、代谢表型数据	六个肥胖相关微阵列数据集和单细胞RNA测序数据，高脂饮食小鼠模型，3T3-L1细胞系
116	2025-09-30	Alpha Linolenic and Stearic Acids Modulate Genes Related to Viral Entry and Inflammatory Response in THP-1 Derived Macrophages Exposed to SARS-CoV-2 2025-Oct, Food science & nutrition IF:3.5Q2 DOI:10.1002/fsn3.70529 PMID:41019181	研究论文	研究α-亚麻酸和硬脂酸对THP-1来源巨噬细胞在SARS-CoV-2暴露下病毒进入和炎症反应相关基因表达的调节作用	首次通过单细胞RNA测序数据发现巨噬细胞在COVID-19中基因表达的关键变化，并验证游离脂肪酸对病毒进入和炎症反应的调控作用	研究仅使用细胞系进行体外实验，未涉及动物模型或临床验证	阐明α-亚麻酸和硬脂酸是否能够调节对SARS-CoV-2的炎症反应	THP-1来源巨噬细胞和Beas2B支气管上皮细胞	分子生物学	COVID-19	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外细胞实验	细胞模型	基因表达数据、细胞实验数据	两种细胞系(THP-1和Beas2B)
117	2025-09-30	Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence 2025-Sep-29, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2 DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589 PMID:40999941	综述	本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展	利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群，包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞	需要进一步开展空间转录组学和蛋白质组学研究，改进动物模型，并将机制发现与靶向治疗联系起来	探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制	浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞等免疫细胞及成纤维细胞	免疫学	IgG4相关疾病	单细胞RNA测序、高重免疫荧光	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	NA
118	2025-09-30	The loss of microRNA-26b promotes aortic calcification through the regulation of cell-specific target genes 2025-Sep-29, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvaf117 PMID:40737220	研究论文	本研究首次揭示microRNA-26b缺失通过调控细胞特异性靶基因促进主动脉钙化的机制	首次探索miR-26b在血管钙化中的作用，结合单细胞转录组学和网络分析识别细胞特异性靶点	NA	探讨miR-26b在血管钙化中的潜在作用机制	miR-26b基因敲除小鼠和主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病变患者的主动脉组织	分子生物学	心血管疾病	micro-PET/CT成像、RNA测序、单细胞RNA测序、网络分析	NA	基因表达数据、影像数据	miR-26b基因敲除小鼠和人类主动脉组织样本
119	2025-09-30	Tumor microenvironment delineates differential responders to trastuzumab emtansine in HER2-positive metastatic breast cancer patients previously treated with pyrotinib: an exploratory biomarker analysis of a phase II study (NJMU-BC02) 2025-Sep-29, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02409-2 PMID:41016944	研究论文	本研究探索T-DM1在吡咯替尼和/或曲妥珠单抗+帕妥珠单抗治疗失败的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效及潜在生物标志物	首次通过单细胞RNA测序发现癌细胞低细胞周期活性、活化巨噬细胞和CD8+ T细胞与T-DM1良好疗效相关	样本量较小（36例），为探索性研究需要进一步验证	评估T-DM1在经治HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效并探索预测生物标志物	HER2阳性转移性乳腺癌患者	肿瘤学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	临床数据和RNA测序数据	36例HER2阳性转移性乳腺癌患者
120	2025-09-30	The Biomarkers and Underlying Mechanisms of Mitochondrial and PCD Related Genes in Epilepsy by Combining Transcriptome and Single-Cell Sequencing 2025-Sep-29, Journal of Korean Neurosurgical Society IF:1.4Q3 DOI:10.3340/jkns.2024.0230 PMID:41017268	研究论文	本研究通过结合转录组和单细胞测序技术，识别了与癫痫中线粒体和程序性细胞死亡相关的生物标志物LTBR和IRF1	首次将线粒体相关基因和程序性细胞死亡相关基因与癫痫联系起来，并采用多种算法和单细胞测序技术进行综合分析	LTBR不适合作为药物靶点，研究样本量有限	探索癫痫中线粒体和程序性细胞死亡相关基因的生物标志物及其机制	癫痫患者样本和对照样本	生物信息学	癫痫	转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR、分子对接	Spearman相关分析、ROC曲线分析	基因表达数据	使用GSE134697和GSE168375两个数据集，并包含临床样本验证