单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-09-30	Single-cell transcriptomics unveils iron dysregulation in macrophages: Implicated genes in periodontitis pathogenesis identified via Mendelian randomization 2026-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101544 PMID:41019505	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
2	2025-09-30	Uncovering stromal cell fate genes and a novel risk stratification in UCEC by integrating single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis 2026-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2025.101743 PMID:41019513	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
3	2025-09-30	CAR T cell engineering impacts antigen-independent activation and co-inhibition 2025-Dec-11, Molecular therapy. Methods & clinical development DOI:10.1016/j.omtm.2025.101586 PMID:41020262	研究论文	比较慢病毒载体和睡美人转座子系统在CAR-T细胞工程中的差异及其对T细胞特性的影响	首次系统比较慢病毒和睡美人非病毒系统在CAR-T细胞制造中的差异，发现工程方式会显著影响T细胞的表型和功能特性	患者来源的T细胞在睡美人系统中CAR表达率较低，增殖能力减弱，T细胞多样性降低	评估不同CAR-T细胞工程方法对T细胞特性的影响	健康供体和慢性淋巴细胞白血病患者来源的T细胞	细胞工程与免疫治疗	白血病	慢病毒载体、睡美人转座子、流式细胞术、单细胞测序	NA	流式细胞数据、单细胞测序数据	健康供体和CLL患者来源的T细胞样本
4	2025-09-30	Single-cell multiomics reveals multiple adipogenic pathways and diverse multilineage specializations during embryonic fat tail morphogenesis 2025-Oct-17, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.113496 PMID:41019374	研究论文	本研究通过单细胞多组学技术揭示了绵羊胚胎尾部脂肪形态发生过程中的多种脂肪生成途径和多样化的多谱系特化	首次在脂肪尾绵羊胚胎发育过程中应用单细胞多组学测序技术，揭示了脂肪沉积的三种主要细胞来源和关键增强子驱动的基因调控网络	研究聚焦于特定绵羊品种的胚胎发育过程，结果在其他哺乳动物中的普适性需要进一步验证	探究哺乳动物胚胎脂肪生成的细胞来源和分子调控机制	脂肪尾绵羊胚胎发育过程中的脂肪组织	单细胞生物学	NA	单细胞多组学测序、scRNA-seq、snATAC-seq	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	绵羊胚胎E50至E80发育阶段的组织样本
5	2025-09-30	Ptgs2+ CPTC Function as a "Force-Immune Axis" by Responding to Acupuncture and Mediating M2 Macrophage Activation for Anti-Inflammatory Effects 2025-Oct-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202501175RR PMID:41017691	研究论文	本研究通过单细胞测序发现Ptgs2+ CPTC作为'力学-免疫轴'响应针刺刺激并通过Il6-Il6st-Stat3通路激活M2巨噬细胞产生抗炎效应	首次确立Ptgs2+ CPTC作为连接机械刺激与免疫调节的关键'力学-免疫轴'	NA	探索筋膜组织中细胞景观及其在针刺抗炎机制中的作用	腹部中线筋膜中的Cd34+/Pdgfra+端细胞(CPTC)及其亚群	细胞生物学	炎症性疾病	单细胞测序、深度学习、细胞形态学分析	深度学习模型	单细胞测序数据、细胞形态数据	痢疾大鼠模型
6	2025-09-30	Activated MAFB in ovarian cancer promotes cytoskeletal remodeling and immune microenvironment suppression by interfering with m6A modifications through WTAP competition 2025-Oct, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03522-w PMID:40796955	研究论文	本研究揭示了MAFB通过竞争WTAP干扰m6A修饰，促进卵巢癌细胞骨架重塑和免疫微环境抑制的新机制	首次发现MAFB通过竞争性结合m6A甲基转移酶复合物核心组分WTAP，建立MAFB-WTAP-CD55调控轴，连接转录调控与表观转录组修饰	NA	探索卵巢癌免疫逃避的分子机制，识别关键调控因子	卵巢癌患者临床队列和单细胞转录组数据	癌症生物学	卵巢癌	单细胞转录组测序，临床队列分析，临床前模型验证	NA	转录组数据，临床数据	多个临床队列和单细胞转录组数据集
7	2025-09-30	Taurine improves bovine oocyte maturation through recovering mitochondrial dysfunction and oxidative stress-induced apoptosis after microplastics exposure 2025-Oct, Journal of dairy science IF:3.7Q2 DOI:10.3168/jds.2025-26435 PMID:40818686	研究论文	本研究探讨微塑料暴露对牛卵母细胞的生殖毒性及牛磺酸的修复作用	首次揭示微塑料通过线粒体功能障碍导致牛卵母细胞成熟失败，并发现牛磺酸可逆转此毒性效应	研究仅使用牛卵母细胞，未涉及其他物种验证	探究微塑料对雌性生殖系统的毒性机制及牛磺酸的保护作用	牛卵母细胞	生殖毒理学	生殖系统疾病	免疫荧光染色、单细胞转录组测序	NA	图像数据、基因表达数据	未明确样本数量
8	2025-09-30	The Role of p53 in Adipocyte Differentiation and Lipid Metabolism in Obese Mice via Transcriptional Regulation of Lgals3 2025-Oct, Obesity (Silver Spring, Md.) DOI:10.1002/oby.24363 PMID:40897545	研究论文	本研究探讨p53通过转录调控Lgals3在肥胖小鼠脂肪细胞分化和脂质代谢中的作用	首次揭示p53通过转录抑制Lgals3调控脂肪细胞分化和脂质代谢的新机制	研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系，人类临床验证尚需进一步研究	研究p53对Lgals3表达的调控作用及其在肥胖相关代谢紊乱中的功能	高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型和3T3-L1前脂肪细胞系	分子生物学	肥胖症	生物信息学分析、单细胞RNA测序、双荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀、RT-qPCR、Western blot	NA	基因表达数据、蛋白质数据、代谢表型数据	六个肥胖相关微阵列数据集和单细胞RNA测序数据，高脂饮食小鼠模型，3T3-L1细胞系
9	2025-09-30	Alpha Linolenic and Stearic Acids Modulate Genes Related to Viral Entry and Inflammatory Response in THP-1 Derived Macrophages Exposed to SARS-CoV-2 2025-Oct, Food science & nutrition IF:3.5Q2 DOI:10.1002/fsn3.70529 PMID:41019181	研究论文	研究α-亚麻酸和硬脂酸对THP-1来源巨噬细胞在SARS-CoV-2暴露下病毒进入和炎症反应相关基因表达的调节作用	首次通过单细胞RNA测序数据发现巨噬细胞在COVID-19中基因表达的关键变化，并验证游离脂肪酸对病毒进入和炎症反应的调控作用	研究仅使用细胞系进行体外实验，未涉及动物模型或临床验证	阐明α-亚麻酸和硬脂酸是否能够调节对SARS-CoV-2的炎症反应	THP-1来源巨噬细胞和Beas2B支气管上皮细胞	分子生物学	COVID-19	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外细胞实验	细胞模型	基因表达数据、细胞实验数据	两种细胞系(THP-1和Beas2B)
10	2025-09-30	Plasma proteome correlations with liver stiffness in pediatric cholestasis implicate epithelial to mesenchymal transition 2025-Oct-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000796 PMID:41021277	研究论文	本研究通过分析儿童胆汁淤积性肝病患者的血浆蛋白质组与肝脏硬度测量值的相关性，揭示了疾病特异性蛋白质特征	首次在多种儿童胆汁淤积性疾病中系统分析血浆蛋白质组与肝脏硬度的相关性，并发现上皮间质转化通路在所有三种疾病中均显著富集	样本量相对有限，且为横断面研究无法确定因果关系	探索儿童胆汁淤积性疾病中血浆蛋白质组与肝脏纤维化程度的关系	187名儿童（93例胆道闭锁、31例α-1抗胰蛋白酶缺乏症、46例Alagille综合征患者及17名健康对照）	数字病理学	肝胆疾病	慢解离率修饰适体扫描分析、振动控制弹性成像、单细胞转录组学	弹性网络模型、机器学习模型	蛋白质组数据、临床参数、转录组数据	187名儿童（93例BA、31例A1AT、46例ALGS、17例健康对照）
11	2025-09-30	Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence 2025-Sep-29, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2 DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589 PMID:40999941	综述	本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展	利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群，包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞	需要进一步开展空间转录组学和蛋白质组学研究，改进动物模型，并将机制发现与靶向治疗联系起来	探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制	浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞等免疫细胞及成纤维细胞	免疫学	IgG4相关疾病	单细胞RNA测序、高重免疫荧光	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	NA
12	2025-09-30	The loss of microRNA-26b promotes aortic calcification through the regulation of cell-specific target genes 2025-Sep-29, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvaf117 PMID:40737220	研究论文	本研究首次揭示microRNA-26b缺失通过调控细胞特异性靶基因促进主动脉钙化的机制	首次探索miR-26b在血管钙化中的作用，结合单细胞转录组学和网络分析识别细胞特异性靶点	NA	探讨miR-26b在血管钙化中的潜在作用机制	miR-26b基因敲除小鼠和主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病变患者的主动脉组织	分子生物学	心血管疾病	micro-PET/CT成像、RNA测序、单细胞RNA测序、网络分析	NA	基因表达数据、影像数据	miR-26b基因敲除小鼠和人类主动脉组织样本
13	2025-09-30	Tumor microenvironment delineates differential responders to trastuzumab emtansine in HER2-positive metastatic breast cancer patients previously treated with pyrotinib: an exploratory biomarker analysis of a phase II study (NJMU-BC02) 2025-Sep-29, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02409-2 PMID:41016944	研究论文	本研究探索T-DM1在吡咯替尼和/或曲妥珠单抗+帕妥珠单抗治疗失败的HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效及潜在生物标志物	首次通过单细胞RNA测序发现癌细胞低细胞周期活性、活化巨噬细胞和CD8+ T细胞与T-DM1良好疗效相关	样本量较小（36例），为探索性研究需要进一步验证	评估T-DM1在经治HER2阳性转移性乳腺癌患者中的疗效并探索预测生物标志物	HER2阳性转移性乳腺癌患者	肿瘤学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	临床数据和RNA测序数据	36例HER2阳性转移性乳腺癌患者
14	2025-09-30	The Biomarkers and Underlying Mechanisms of Mitochondrial and PCD Related Genes in Epilepsy by Combining Transcriptome and Single-Cell Sequencing 2025-Sep-29, Journal of Korean Neurosurgical Society IF:1.4Q3 DOI:10.3340/jkns.2024.0230 PMID:41017268	研究论文	本研究通过结合转录组和单细胞测序技术，识别了与癫痫中线粒体和程序性细胞死亡相关的生物标志物LTBR和IRF1	首次将线粒体相关基因和程序性细胞死亡相关基因与癫痫联系起来，并采用多种算法和单细胞测序技术进行综合分析	LTBR不适合作为药物靶点，研究样本量有限	探索癫痫中线粒体和程序性细胞死亡相关基因的生物标志物及其机制	癫痫患者样本和对照样本	生物信息学	癫痫	转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR、分子对接	Spearman相关分析、ROC曲线分析	基因表达数据	使用GSE134697和GSE168375两个数据集，并包含临床样本验证
15	2025-09-30	Pathogenicity of Mediator Complex Subunit 27 (MED27) in a Neurodevelopmental Disorder with Cerebellar Atrophy 2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202505535 PMID:41017421	研究论文	本研究探讨MED27基因变异导致神经发育障碍伴小脑萎缩的致病机制	首次通过体外干细胞和体内小鼠模型阐明MED27部分功能缺失导致小脑萎缩的分子机制，并建立了研究介体亚基致病性变异的原型	研究主要聚焦于MED27的致病机制，对其他介体亚基的研究仍需进一步验证	揭示MED27相关神经发育障碍的致病机制并开发精准基因疗法	携带MED27患者特异性变异的体外干细胞和Med27功能缺失小鼠模型	神经发育疾病研究	神经发育障碍	单细胞分辨率空间转录组学、转录组分析	小鼠模型、干细胞模型	基因表达数据、染色质相互作用数据	MED27变异患者群体及对应的动物和细胞模型
16	2025-09-30	Extracellular Vesicle-Packaged circTAX1BP1 from Cancer-Associated Fibroblasts Regulates RNA m6A Modification through Lactylation of VIRMA in Colorectal Cancer Cells 2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202514008 PMID:41017455	研究论文	本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过细胞外囊泡传递circTAX1BP1调控结直肠癌肝转移的新机制	首次发现CAF来源的EV-packaged circTAX1BP1通过促进VIRMA乳酸化修饰调控RNA m6A修饰，并鉴定出ITGA11 myCAFs亚群在正反馈环路中的关键作用	机制研究主要基于体外实验和PDX模型，需要进一步临床验证	探索结直肠癌肝转移的分子机制并寻找治疗靶点	结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、细胞外囊泡(EVs)	癌症生物学	结直肠癌	单细胞RNA测序、PDX模型	NA	测序数据、实验数据	包含PDX模型在内的多个实验体系
17	2025-09-30	Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations 2025-Sep-29, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1 DOI:10.1177/15230864251372607 PMID:41020442	综述	探讨氧化还原机制在微血管生理和病理生理中的调控作用及治疗策略	强调微血管与大血管对ROS/RNS反应的差异，提出单细胞RNA测序揭示不同血管床内皮细胞的独特基因特征	技术挑战限制了可靠关联ROS/RNS水平与微血管结果的能力，缺乏针对微血管氧化还原信号的成功疗法	阐明氧化还原介导的微血管功能障碍在疾病发病机制中的具体作用	微血管内皮细胞及其对活性氧/活性氮物种(ROS/RNS)的响应	血管生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
18	2025-09-30	Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment 2025-Sep-29, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology DOI:10.1007/s00210-025-04593-y PMID:41020944	研究论文	通过多组学孟德尔随机化研究揭示铁死亡调节因子CTSB通过调控免疫微环境驱动前列腺癌进展	首次提供铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据，发现CTSB是关键因果风险因子	研究主要基于遗传学证据，需要进一步实验验证机制细节	探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌的遗传因果关系及免疫介导机制	前列腺癌患者样本和731种免疫细胞类型	生物信息学	前列腺癌	多组学孟德尔随机化、单细胞RNA测序、基因集富集分析、免疫浸润分析	孟德尔随机化模型	基因组数据、转录组数据、蛋白组数据	涉及多种前列腺癌组织和细胞样本，具体样本量未明确说明
19	2025-09-30	Single-cell transcriptomic analyses provide insights into SPP1+ TAM-mediated immune suppression and CD8+ T cell dysfunction in lung cancer 2025-Sep-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04180-3 PMID:41021043	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过A2AR信号通路介导CD8+ T细胞功能失调的免疫抑制机制	首次系统比较原发性和脑转移性肺癌中SPP1+ TAM与CD8+ T细胞的相互作用，并证实抗SPP1治疗可逆转T细胞耗竭	研究主要基于临床前模型，需要进一步临床试验验证	探究SPP1+ TAM介导的免疫抑制机制及其在肺癌治疗中的潜在价值	肺癌原发灶和脑转移灶的免疫微环境，特别是SPP1+ TAM和CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、qPCR、Western blot、共培养实验	NA	单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、细胞功能数据	肺癌原发和脑转移组织样本（具体数量未明确说明）
20	2025-09-30	Multi-omics analysis of ILF2 reveals its prognostic value and functional roles across pan-cancer 2025-Sep-29, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-03609-6 PMID:41021104	研究论文	通过多组学分析揭示ILF2在泛癌中的预后价值和功能作用	首次对ILF2进行系统性泛癌分析，涵盖表达模式、预后意义、遗传变异、免疫浸润特征和治疗反应等多个维度	ILF2在泛癌中的具体分子机制仍需进一步实验验证	探究ILF2在多种癌症中的生物学功能和临床意义	多种癌症类型，特别关注肝细胞癌	生物信息学	泛癌分析（包括肝细胞癌等多种恶性肿瘤）	多组学分析、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、转录组数据、临床数据	多种癌症类型的临床样本和数据集