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当前共找到 35128 篇文献,本页显示第 1001 - 1020 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1001 2025-12-30
SMASH: Scalable Method for Analyzing Spatial Heterogeneity of genes in spatial transcriptomics data
2023-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为SMASH的非参数方法,用于高效识别空间转录组数据中的空间变异基因,以平衡计算需求和统计功效 SMASH方法在计算效率和统计功效之间取得了平衡,相比现有方法在模拟场景中表现出更优的统计能力和鲁棒性 NA 开发一种可扩展的方法来分析空间转录组数据中基因的空间异质性,识别与细胞/点空间位置共变表达的空间变异基因 空间转录组数据中的基因表达模式 空间转录组学 NA 空间转录组学 非参数方法 空间转录组数据 四个来自不同平台的空间转录组数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1002 2025-12-29
LncRNA ZFAS1 in hepatocellular carcinoma: A systematic review of molecular mechanisms and clinical translation
2026-Apr, Non-coding RNA research IF:5.9Q1
综述 本文系统综述了长链非编码RNA ZFAS1在肝细胞癌中的分子机制及其临床转化前景 系统性地整合了ZFAS1作为竞争性内源RNA、编码微肽调控铁死亡、通过外泌体重塑肿瘤微环境等多维机制,并提出了结合多组学与AI建模的未来研究方向 当前转化挑战包括ZFAS1亚型异质性、液体活检灵敏度不足以及肿瘤微环境动态相互作用的复杂性 阐明长链非编码RNA ZFAS1在肝细胞癌发生发展中的分子机制,并探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的临床转化潜力 肝细胞癌患者组织、血浆样本及相关分子机制 自然语言处理 肝细胞癌 多组学整合(空间转录组学/单细胞测序)、AI驱动的网络建模 NA 文本(文献数据) NA NA 空间转录组学, 单细胞测序 NA NA
1003 2025-12-29
FGF7 promotes load-bearing tendon regeneration and suppresses fibrosis
2025-Dec-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了成纤维细胞生长因子7(FGF7)在减轻纤维化和促进承重肌腱再生中的作用 揭示了FGF7在驱动肌腱生成和抑制纤维化中的双重作用,并开发了负载重组FGF7的水凝胶作为潜在治疗策略 NA 研究FGF7在肌腱纤维化和再生中的功能,以开发治疗策略 小鼠模型、人类肌腱病变样本、肌腱干细胞/祖细胞 数字病理学 肌腱病变 单细胞RNA测序,ProTracer技术 NA RNA测序数据,细胞谱系追踪数据 Fgf7敲除小鼠和人类肌腱病变样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1004 2025-12-29
Multi-omics analysis reveals distinct spatial compartmentalization of lung repair niches in pediatric ARDS
2025-Dec-27, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了儿童急性呼吸窘迫综合征(PARDS)中与预后相关的、空间区隔化的肺修复生态位 首次在儿童流感相关PARDS中整合单细胞RNA测序、空间转录组学和血浆蛋白质组学,并结合人类肺细胞图谱(HLCA)和成人COVID-19数据进行跨年龄比较,识别出与生存相关的KRT17阳性上皮细胞等关键修复特征 本研究为试点性病例系列研究,样本量小,需要在更大的多中心队列中进行验证 探究儿童相较于成人在急性呼吸窘迫综合征中生存率更高、肺修复能力更强的潜在机制 儿童流感相关急性呼吸窘迫综合征(PARDS)患者的肺组织、支气管肺泡灌洗液(BALF)和血浆 数字病理学 肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学, 血浆蛋白质组学 NA 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质数据 试点性病例系列研究(具体样本数未明确说明), 结合了公共儿科PARDS气道scRNA-seq数据和成人致死性COVID-19肺数据 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1005 2025-12-27
Single-cell RNA sequencing defines prognostic subtypes and identifies AIF1L as a therapeutic target in colorectal cancer
2025-Dec-26, BMC cancer IF:3.4Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1006 2025-12-29
An innovative in vitro system unveils IGF1R signaling regulating Merkel cell generation
2025-Dec-26, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本文开发了新型体外培养系统,包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人源多能干细胞衍生的皮肤类器官,以研究Merkel细胞的发育过程 首次建立了包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人源皮肤类器官在内的创新体外系统,用于监测Merkel细胞发育,并发现Polycomb抑制复合物抑制剂能有效促进Merkel细胞生成 NA 研究Merkel细胞的发育机制及其调控信号通路 Merkel细胞、小鼠和人源皮肤类器官 数字病理学 NA 单细胞转录组学、空间转录组学、药理学筛选 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1007 2025-12-29
Probing Cellular Landscapes in Plants via Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec-25, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1
综述 本文全面综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在植物系统中的应用,包括其在解析细胞异质性、发育轨迹、应激反应以及整合空间转录组学和多组学方法方面的进展与挑战 整合了跨植物物种和组织类型的见解,提供了关于植物发育和适应的交叉视角,并批判性地评估了关键技术挑战及潜在解决方案 植物系统中scRNA-seq与功能基因组学及空间技术的整合仍然有限,在基因调控、应激反应和细胞命运决定的理解上存在关键空白 综述单细胞转录组学在植物细胞景观探测中的应用、进展与挑战,以促进基因发现和性状改良 多种植物组织 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,多组学方法(如结合染色质可及性或蛋白质表达) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1008 2025-12-29
Phospholipid scramblase 1 (PLSCR1) regulates interferon-lambda receptor 1 (IFN-λR1) and IFN-λ signaling in influenza A virus (IAV) infection
2025-Dec-24, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了磷脂爬行酶1(PLSCR1)在甲型流感病毒感染中调控干扰素-λ受体1(IFN-λR1)和干扰素-λ信号通路的机制 揭示了PLSCR1通过结合Ifn-λr1启动子调控其表达,并在细胞表面与IFN-λR1相互作用以调节干扰素-λ信号,同时发现其脂质爬行酶活性在抗流感功能中非必需,并首次在纤毛气道上皮细胞中证实PLSCR1作为细胞内在防御因子的作用 动物模型研究有限,未完全探索PLSCR1表达区室和酶活性的机制 阐明PLSCR1在甲型流感病毒感染中的抗病毒机制,为靶向人类宿主因子如PLSCR1的新型抗流感药物开发提供基础 甲型流感病毒感染的细胞和小鼠模型 NA 甲型流感病毒感染 单细胞RNA测序,转录组分析 NA RNA测序数据,转录组数据 甲型流感病毒感染的小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1009 2025-12-29
Spatial multi-omics profiling uncovers metabolic heterogeneity in Sjögren's syndrome and identifies PS(36:1) as a potential therapeutic target
2025-Dec-24, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学技术,揭示了干燥综合征中唾液腺免疫微环境的细胞类型分布及代谢异质性,并识别出PS(36:1)作为潜在治疗靶点 首次从空间多组学角度全面解析干燥综合征的转录和代谢特征,结合单细胞分辨率数据识别出PS(36:1)在淋巴细胞灶中的异常富集及其与CD4+ T细胞的关联 样本量较小(仅8例人类唇腺样本),且主要基于小鼠模型验证,人类临床验证尚需进一步研究 探究干燥综合征的发病机制并寻找新的治疗靶点 干燥综合征患者的唇腺样本、健康对照样本及NOD/ShiLtj小鼠模型 数字病理学 干燥综合征 单细胞RNA测序、空间转录组学、空间代谢组学、免疫组化、HE染色、唾液流率检测、免疫荧光 NA 基因表达数据、代谢物数据、图像数据 8例人类唇腺样本(4例干燥综合征患者,4例健康对照)及NOD/ShiLtj小鼠 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、空间代谢组学 NA NA
1010 2025-12-29
Single-cell sequencing reveals APOE deletion alleviates adipose wasting in cancer cachexia via macrophage repolarization
2025-Dec-24, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了ApoE缺失通过巨噬细胞重编程缓解癌症恶病质中的脂肪消耗 首次在癌症恶病质背景下揭示ApoE通过调控巨噬细胞表型转换(M2样表型富集)来维持脂肪组织稳态的新机制 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限;巨噬细胞表型转换的具体信号通路尚未完全阐明 探究ApoE在癌症恶病质脂肪组织重塑中的功能与机制 癌症恶病质患者样本、小鼠模型、脂肪细胞、巨噬细胞 单细胞组学 癌症恶病质 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光、基因敲除 NA 单细胞转录组数据、组织切片图像 未明确样本数量(包含患者血浆/脂肪组织、小鼠模型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1011 2025-12-29
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-Dec-23, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究通过消耗纤维蛋白原,评估了其在胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤生长和转移中的作用 首次使用临床测试中的技术平台(反义寡核苷酸或含小干扰RNA的脂质纳米颗粒)在PDAC患者来源的异种移植模型中消耗纤维蛋白原,并结合蛋白质组学和空间转录组学分析机制 纤维蛋白原消耗未影响晚期转移阶段(如肝定植),且研究主要基于异种移植模型,可能不完全反映人类疾病复杂性 探究纤维蛋白原在PDAC肿瘤进展和转移中的功能,并评估靶向纤维蛋白原作为临床治疗策略的潜力 胰腺导管腺癌(PDAC)患者来源的异种移植模型 肿瘤生物学 胰腺癌 反义寡核苷酸技术、小干扰RNA脂质纳米颗粒、蛋白质组学、空间转录组学 患者来源的异种移植模型 蛋白质组数据、空间转录组数据 3个PDAC患者来源的异种移植模型 NA 空间转录组学 NA NA
1012 2025-12-29
Plasticizer mixture exposure-induced preeclampsia pathogenesis: Integrated single-cell and bulk transcriptomics, network toxicology, and molecular docking insights
2025-Dec-22, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk转录组学、网络毒理学及分子对接技术,阐明了多种增塑剂联合暴露诱发子痫前期的致病机制 首次整合单细胞转录组测序、网络毒理学和分子动力学模拟,系统揭示了ATBC、DEP、DMP和DOP四种增塑剂混合物通过靶向BCL6、FLT1和INHA基因干扰胎盘滋养细胞分化的新机制 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内动物模型或人群队列的直接暴露证据 阐明多种增塑剂联合暴露导致子痫前期的生物靶点和致病机制 子痫前期胎盘组织及其中关键的绒毛细胞滋养细胞 计算生物学 子痫前期 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, RT-qPCR, 免疫组化 机器学习 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,涉及子痫前期和对照组的胎盘组织 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1013 2025-12-29
Evolution of the Spatial transcriptomic landscape during the progression of high-grade pancreatic intraductal papillary mucinous neoplasms to invasive cancer
2025-Dec-18, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.] IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,分析了同一患者从正常胰腺、高级别胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤到浸润性胰腺导管腺癌的演变过程 首次在单例患者中整合空间转录组学与多种计算分析方法,系统描绘了IPMN向PDAC恶性转化的空间分子景观演变,并识别出ELF3/MYC/KLF4扩增及7个功能异质性亚克隆 仅基于单个患者的三个组织样本,样本量小,需要更大队列验证发现 阐明高级别胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤向浸润性胰腺导管腺癌恶性转化的分子机制 同一患者的正常胰腺组织、高级别IPMN组织、浸润性PDAC组织 空间转录组学 胰腺癌 空间转录组学 Spatial inferCNV, SpaCET, CellChat 空间转录组数据 3例新鲜组织样本(来自同一患者) NA 空间转录组学 NA NA
1014 2025-12-29
Sequential Inflammatory and Matrisome Programs Drive Remodeling of the Mouse Carotid-Jugular Arteriovenous Fistula
2025-Dec-16, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究利用bulk和单细胞RNA测序技术,描绘了小鼠颈动脉-颈静脉动静脉瘘(AVF)术后颈静脉的转录组和细胞演化过程 首次通过单细胞分析揭示了小鼠AVF模型中炎症和细胞外基质重塑的时序性程序,并与人类数据进行比较验证了其转化相关性 未明确说明样本的具体数量,且模型与人类疾病的完全对应性仍存在不确定性 验证小鼠AVF模型在模拟人类静脉重塑过程中的细胞和分子机制方面的转化相关性 小鼠颈动脉-颈静脉动静脉瘘(AVF)模型中的颈静脉组织 单细胞组学 心血管疾病 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1015 2025-12-29
RXR-Mediated Remodeling of Transcriptional and Chromatin Landscapes in APP Mouse Brain: Insights from Integrated Single-Cell RNA and ATAC Profiling
2025-Dec-11, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和ChIP-seq技术,揭示了RXR激活在APP/PS1ΔE9小鼠大脑中介导的多层次转录级联反应和细胞类型特异性染色质重塑 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中整合单细胞多组学技术(scRNA-seq、snATAC-seq和RXR ChIP-seq),系统解析了RXR信号通路如何通过现有调控支架(而非新建支架)重塑转录和染色质景观 研究基于小鼠模型,人类疾病中的RXR调控机制可能存在差异;Bexarotene治疗的具体临床转化潜力仍需进一步验证 探究RXR激活如何影响染色质结构和基因表达,以揭示神经退行性疾病的相关机制 Bexarotene处理的APP/PS1ΔE9转基因小鼠(阿尔茨海默病模型)的脑组织 单细胞多组学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(snATAC-seq)、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、转录因子足迹分析 NA 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、ChIP-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
1016 2025-12-29
PD-1 regulates CD4+ T cell-mediated CD8+ T cell responses in the brain to balance viral control and neuroinflammation
2025-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了PD-1在调节CD4+ T细胞介导的CD8+ T细胞反应中的作用,以平衡小鼠多瘤病毒脑炎中的病毒控制和神经炎症 揭示了PD-1在CD4+ T细胞中的内在信号传导如何调节CD8+ T细胞效应功能,从而平衡抗病毒防御与神经损伤,为理解PD-1阻断在PML患者中效果不一提供了机制解释 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类PML的复杂性;未涉及PD-1阻断治疗的具体临床应用或长期效果评估 探究PD-1在多瘤病毒中枢神经系统感染中如何调节T细胞反应以平衡病毒清除与神经炎症 小鼠多瘤病毒(MuPyV)感染模型中的脑浸润CD4+和CD8+ T细胞 免疫学 神经炎症性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1017 2025-12-29
Biomarkers
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究结合血管和代谢脑成像与单细胞转录组学,探讨阿尔茨海默病小鼠模型中神经血管和代谢韧性的功能方面与细胞特异性分子通路的关系 整合多尺度成像(如qCBF和CEST MRI)与单细胞转录组学,构建性别特异性的健康与病理脑老化轨迹,揭示了血管和代谢变化的性别差异 研究仅使用小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性;样本量相对有限 研究阿尔茨海默病中神经血管和代谢韧性的功能方面及其与细胞特异性分子通路的关系 APP/PS1转基因小鼠和B6C3对照小鼠,包括雌性和雄性,年龄范围4-24个月 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞mRNA测序,定量脑血流成像,化学交换饱和转移MRI NA 图像,文本 100只小鼠(64只APP/PS1,33雌31雄;36只B6C3对照,17雌19雄) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1018 2025-12-29
Drug Development
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过真实世界数据分析、患者iPSC衍生神经元模型和转基因小鼠模型,评估了西地那非在阿尔茨海默病中的潜在治疗作用 首次结合大规模真实世界患者数据、患者特异性iPSC衍生神经元模型和转基因小鼠模型,全面评估西地那非在阿尔茨海默病中的保护效应和机制 需要未来临床试验来验证西地那非在阿尔茨海默病预防和治疗中的因果关系 评估西地那非在阿尔茨海默病中的临床效应大小和作用机制 老年患者数据库(MarketScan和OPTUM)、AD患者iPSC衍生神经元和脑类器官、5xFAD转基因AD小鼠模型 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq、免疫荧光染色、行为测试 NA 患者数据库、细胞模型数据、小鼠模型数据 MarketScan数据库723万老年受试者,OPTUM数据库1152万老年受试者,AD患者iPSC衍生模型,5xFAD转基因小鼠 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1019 2025-12-29
Drug Development
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,探究了阿尔茨海默病中海马体细胞间通讯的变化,以及通过星形胶质细胞向神经元转化逆转这些变化的效果 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统分析了阿尔茨海默病中细胞间通讯网络的改变,并揭示了星形胶质细胞向神经元转化如何逆转疾病相关的信号通路 研究主要基于大鼠模型,人类样本数据可能有限,且病毒介导的基因治疗方法在临床转化中可能存在安全性和效率问题 探究阿尔茨海默病中海马体细胞间通讯的变化机制,以及星形胶质细胞向神经元转化对疾病病理的逆转作用 人类阿尔茨海默病患者和大鼠模型的海马体组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 人类阿尔茨海默病患者和大鼠模型样本(具体数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Visium 10x Visium空间转录组平台
1020 2025-12-29
Comparing great apes reveals human-specific ZEB2 roles in neural development
2025-Nov-28, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1
研究论文 本研究通过比较人类、黑猩猩和猩猩的ZEB2转录因子调控差异,揭示了人类特异性在神经发育中的独特作用 首次在可控细胞系统中检测并验证了ZEB2在人类与其他大猿之间的调控差异,特别是在神经发育相关基因中的特异性作用 研究主要基于B淋巴母细胞系作为模型系统,可能无法完全反映体内神经发育的复杂性 探究ZEB2转录因子在人类与其他大猿之间的调控差异,以理解人类特异性神经发育的进化机制 人类、黑猩猩和猩猩的B淋巴母细胞系及脑类器官数据 基因组学 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 三种大猿物种的B淋巴母细胞系生物重复样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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