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当前共找到 35128 篇文献,本页显示第 941 - 960 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
941 2025-12-31
Plasma cell identity escape drives resistance to anti-BCMA T-cell-redirecting therapy in multiple myeloma
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过全基因组测序和单细胞RNA测序,揭示了多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的T细胞重定向疗法产生原发性耐药的细胞和分子机制,包括基因组复杂性和浆细胞身份逃逸现象 首次提出“浆细胞身份逃逸”概念,并发现其与高增殖特征、BCMA表达降低及CD8 T细胞免疫失调相关,通过临床队列和临床前模型验证了这些机制 研究样本量相对有限(102例复发患者),且主要关注原发性耐药,对继发性耐药机制探讨不足,临床前模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 探究多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的CAR-T和T细胞衔接子疗法产生原发性耐药的机制 接受抗BCMA CAR-T或T细胞衔接子治疗的复发多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞 数字病理学 多发性骨髓瘤 全基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 基因组数据, 转录组数据 102例复发多发性骨髓瘤患者 NA 全基因组测序, 单细胞RNA测序 NA NA
942 2025-12-31
OddSNP: a predictive framework for optimizing multiplexed single-cell RNA-seq experiments
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一个名为OddSNP的预测框架,用于优化多重单细胞RNA测序实验的设计 提出了SNP-信息含量(SNP-IC)这一可量化的新指标,能够基于简单的未混合先导数据准确预测基于基因型的分型成功率 未明确说明该框架在不同组织类型或疾病模型中的普适性验证情况 为单细胞RNA测序中的供体多重实验提供可靠的实验设计指导 干细胞和类器官模型 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 预测模型 基因型数据、测序数据 多个大规模数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
943 2025-12-31
Early skin seeding regulatory T cells modulate PPARγ-dependent skin pigmentation
2025-Dec-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了早期皮肤定居调节性T细胞(ETregs)在新生儿皮肤中通过调控PPARγ信号通路,促进毛囊黑素干细胞介导的皮肤色素沉着的作用 首次揭示了ETregs在出生后第一周内对皮肤色素沉着的关键调控作用,并明确了PPARγ信号通路在此过程中的核心地位 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来源于对白癜风患者的单细胞转录组分析,需要进一步验证ETregs在人类皮肤发育中的具体机制 探究早期皮肤定居调节性T细胞(ETregs)在新生儿皮肤发育中对色素沉着的调控机制 小鼠新生儿皮肤组织、人类白癜风患者皮肤组织 免疫学与皮肤生物学 白癜风 单细胞转录组分析、转录组学分析 NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
944 2025-12-31
Copula modeling of gene coexpression in single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文评估了六种Copula模型在单细胞RNA测序数据中模拟基因共表达的能力,发现高斯Copula在准确性和速度之间提供了最佳平衡 首次系统评估Copula模型在scRNA-seq数据中模拟基因共表达的应用,比较了不同模型的准确性和效率 Vine Copula虽具高准确性潜力,但当前实现无法扩展到典型scRNA-seq数据集的大规模 开发准确的统计模型来模拟单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式 单细胞RNA测序数据中的基因共表达 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Copula模型(包括高斯Copula、Vine Copula等) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
945 2025-12-31
Phenotypic and functional characterization of tumor-reactive T cells in malignant pleural effusions
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过高维流式细胞术、单细胞RNA测序和T细胞受体测序,对恶性胸腔积液(MPE)中的肿瘤反应性T细胞进行了表型和功能表征,并与肺转移瘤和血液中的T细胞进行比较 首次系统比较了MPE、肿瘤和血液中T细胞的组成、转录组和功能特性,发现MPE富含肿瘤反应性T细胞且具有较低的终末耗竭特征和较高的细胞毒性潜力 研究仅基于一名黑色素瘤患者的样本,样本量小,结果可能需要更大规模研究验证 表征恶性胸腔积液中肿瘤反应性T细胞的表型和功能特性,评估其作为过继性细胞疗法来源的潜力 恶性胸腔积液、肺转移瘤和血液中的T细胞 数字病理学 黑色素瘤 高维流式细胞术、单细胞RNA测序、T细胞受体测序、体外激活和细胞毒性实验 NA 流式细胞数据、单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 一名转移性黑色素瘤患者的同步采集的MPE、肺转移瘤和血液样本 NA 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA NA
946 2025-12-31
From features to slice: parameter-cloud modeling of spatial transcriptomics for simulation and 3D interpolatory augmentation
2025-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了FEAST,一个用于空间转录组学数据计算模拟和三维插值增强的计算基础设施 提出了参数云建模方法,能够灵活控制空间和转录异质性,捕获高阶基因依赖性,并扩展到三维或对齐感知的上下文 未在摘要中明确提及 开发一个用于空间转录组学数据模拟、增强和三维重建的计算平台 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 参数云建模 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
947 2025-12-31
C3a-C3aR1-Mediated Interactions Between Fibroblast-Like Synoviocytes and Macrophages Promote the Progression of Rheumatoid Arthritis
2025-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜中成纤维样滑膜细胞与巨噬细胞通过C3a-C3aR1信号介导的相互作用,促进疾病进展的机制 首次结合成像质谱流式细胞术和单细胞RNA测序解析RA滑膜细胞邻域,并发现FLS与巨噬细胞间通过C3a-C3aR1信号形成正反馈环路驱动炎症 研究主要基于胶原诱导关节炎小鼠模型,人体内的验证和临床转化仍需进一步探索 探究类风湿关节炎滑膜炎症微环境中细胞间相互作用机制及潜在治疗靶点 类风湿关节炎患者滑膜组织、胶原诱导关节炎小鼠模型 数字病理学 类风湿关节炎 成像质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA 图像, 单细胞转录组数据 未明确样本数量,涉及RA患者滑膜组织与CIA小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
948 2025-12-31
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究探讨了成熟三级淋巴结构(mTLS)在直肠癌中的抗肿瘤免疫作用及其受新辅助治疗的影响 首次在直肠癌中系统评估mTLS与B细胞介导的免疫特征及预后的关联,并揭示新辅助治疗对TLS的破坏作用 回顾性研究设计可能引入选择偏倚,样本量有限且需进一步验证 阐明mTLS在直肠癌肿瘤免疫微环境中的作用及新辅助治疗的免疫调节效应 直肠癌患者组织样本 数字病理学 直肠癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组化, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 组织图像 队列1:bulk RNA-seq 123例,免疫组化/多重免疫荧光161例,scRNA-seq/scBCR-seq 10例;队列2:bulk RNA-seq 19例,免疫组化125例 NA 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 空间转录组学相关技术 NA NA
949 2025-12-31
Subpopulation-specific apoptotic responses of hemocytes to decapod iridescent virus 1 in Macrobrachium rosenbergii
2025-Dec, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究整合流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异 首次结合流式细胞术和单细胞RNA测序技术,系统解析了罗氏沼虾血细胞亚群在DIV1感染下的凋亡动态和分化轨迹,揭示了透明细胞的凋亡激活和补偿性分化机制 研究主要关注早期感染阶段(24小时),长期感染动态和具体凋亡信号通路的功能验证有待进一步探索 探究罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异和免疫机制 罗氏沼虾的血细胞亚群,包括无颗粒细胞(透明细胞和前血细胞)、半颗粒细胞和颗粒细胞 单细胞组学 病毒感染 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
950 2025-12-31
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through intrinsic apoptosis in the neonatal lung
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过构建Stc1谱系标记小鼠,揭示了肺肌成纤维细胞中次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)作为一个发育上独特的谱系,其通过内在凋亡在新生儿肺中被清除 首次构建了能够特异性标记发育性短暂次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)的小鼠品系,并证明SCMF与肺泡管肌成纤维细胞(DMF)是发育上不同的独立谱系 研究主要基于小鼠模型,人类肺发育中SCMF的清除机制是否相同尚需验证 阐明肺肌成纤维细胞中不同谱系在肺泡发育过程中的独特贡献与命运 小鼠肺组织中的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)和肺泡管肌成纤维细胞(DMF) 发育生物学 肺发育异常 单细胞RNA测序、胚胎谱系追踪、基因敲除 遗传小鼠模型 基因表达数据、谱系追踪数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
951 2025-12-31
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用,特别是在去神经和再神经过程中的动态变化 发现了一种新型的末端施万细胞亚型,该亚型在去神经-再神经循环中起关键作用,并识别了SPP1信号作为神经肌肉接头动态的关键调节因子 NA 探究肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 肌肉驻留施万细胞,包括末端施万细胞和髓鞘施万细胞亚型 数字病理学 神经肌肉疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
952 2025-12-31
A Complete Spatial Map of Mouse Retinal Ganglion Cells Reveals Density and Gene Expression Specializations
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学和机器学习技术,绘制了小鼠视网膜神经节细胞亚型的完整空间分布图,揭示了其密度和基因表达的特异性 首次结合en-face冷冻切片、空间转录组学和机器学习,全面映射所有已知RGC亚型的空间分布,并发现亚型内基因表达沿背腹轴或在ART区域内外存在意外变异 ART区域与灵长类黄斑的基因谱相关性有限,提示小鼠与灵长类中央视觉的特化可能不同,研究结果可能受物种差异限制 探索小鼠视网膜神经节细胞亚型的空间分布特化和基因表达模式,以理解其视觉功能基础 小鼠视网膜神经节细胞亚型 空间转录组学 NA 空间转录组学,机器学习 机器学习 空间转录组数据,图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
953 2025-12-31
FastCCC: A permutation-free framework for scalable, robust, and reference-based cell-cell communication analysis in single cell transcriptomics studies
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为FastCCC的无置换框架,用于单细胞转录组学研究中的细胞间通讯分析,该框架具有可扩展性、鲁棒性,并支持基于参考的分析 提出了首个无置换的CCC分析框架,利用快速傅里叶变换卷积解析计算p值;引入了模块化代数运算框架以捕获广泛的CCC模式;构建了首个涵盖19种组织类型、450多种细胞类型、约1600万细胞的人类CCC参考面板 未明确提及具体限制,但暗示现有CCC方法在分析复杂数据集时存在能力不足 开发一种可扩展、鲁棒且支持参考的单细胞转录组学细胞间通讯分析方法 单细胞转录组数据中的细胞间通讯 单细胞转录组学 COVID-19 单细胞RNA-seq 基于快速傅里叶变换的卷积模型 单细胞转录组数据 约1600万细胞(参考面板) NA 单细胞RNA-seq NA NA
954 2025-12-31
Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia
2024-Oct-16, Research square
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了阿尔茨海默病大脑中微胶质细胞的异质性及其与淀粉样斑块的空间分布关系 首次整合多队列、多脑区的单细胞与空间转录组学数据,系统绘制了微胶质细胞在阿尔茨海默病中的多样性图谱,并揭示了其状态与淀粉样斑块空间定位的特异性关联 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本来源和脑区覆盖可能仍存在一定局限性 阐明阿尔茨海默病中微胶质细胞的转录状态异质性及其空间分布特征 实验模型和人类大脑中的微胶质细胞,包括阿尔茨海默病患者与对照样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 空间定位数据, 免疫染色图像 多队列、多脑区样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
955 2025-12-31
Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance
2023-May-03, Research square
研究论文 本研究通过单细胞转录组学技术,在肺毛细血管内皮细胞中发现了五个具有不同分子特征和功能的新细胞群 首次识别出五个新的肺毛细血管内皮细胞群,包括表达特定离子转运蛋白的细胞群、具有再生功能的“根”细胞群以及具有血管生成调节能力的细胞群 研究主要基于单细胞转录组学数据,需要进一步的体内功能验证 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在生理和病理过程中的功能 肺毛细血管内皮细胞 单细胞组学 肺疾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
956 2025-12-30
Integrating Single-Cell Sequencing, Machine Learning, and Molecular Docking to Elucidate the Molecular Network Linking Myocardial Infarction and DEHP Exposure
2026-Jan, Journal of biochemical and molecular toxicology IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞测序、机器学习和分子对接技术,揭示了环境塑化剂DEHP通过结合SLC2A3和MMP9等核心基因,在特定免疫细胞中加剧心肌梗死的分子机制 首次结合单细胞RNA测序、机器学习算法集成和分子对接模拟,系统解析了DEHP在心肌梗死中细胞类型特异性的促炎免疫失调网络,并识别出六个核心诊断生物标志物 研究主要基于公共转录组数据集和计算预测,缺乏体内或体外实验的直接功能验证 阐明DEHP暴露与心肌梗死发病机制之间的细胞类型特异性分子联系 DEHP(邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯)暴露下的免疫细胞与心肌梗死相关分子靶点 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 分子对接模拟 集成机器学习算法(11种算法) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个公共数据集(GSE66360, GSE60993, GSE61144, GSE48060, GSE141512, GSE269269),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
957 2025-12-30
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了肠道微生物-胆汁酸-TLR3信号轴在驱动间质性膀胱炎膀胱损伤中的作用 首次结合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序,识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变,并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 研究主要基于实验模型,人类样本验证有限,且具体机制细节需进一步探索 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征(HIC)的上游驱动机制,以寻找生物标志物和靶向治疗机会 Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 多组学整合分析 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 NA 基因组, 代谢组, 转录组数据 NA NA 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 NA NA
958 2025-12-30
Venetoclax resistance in preclinical KMT2A-rearranged acute lymphoblastic leukemia models is characterized by high inter- and intra-model heterogeneity
2025-Dec-29, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究利用KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞系和异种移植模型,揭示了Venetoclax耐药性的产生机制,并强调了其高度异质性 首次在KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病临床前模型中系统表征了Venetoclax耐药性的出现,揭示了肿瘤抑制因子TP53和促凋亡分子BAX的新发及已知致病性变异,并通过单细胞RNA测序发现了肿瘤微环境在耐药性发展中的潜在作用 研究基于临床前模型(细胞系和异种移植),其结果向临床转化的直接相关性尚需验证;耐药机制具有高度异质性,可能难以找到普适性的单一解决方案 阐明KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病对BCL-2抑制剂Venetoclax产生继发性耐药的机制 KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞系和异种移植模型 NA 急性淋巴细胞白血病 靶向DNA测序, mRNA测序, 单细胞mRNA测序, 蛋白质表达分析 NA 基因组序列数据, 转录组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 未明确具体样本数量,涉及KMT2A重排的ALL细胞系和异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
959 2025-12-30
ADME Profiling of Quantum Dots and Immune Responses: Impact of Dynamic Inflammatory Mediator Changes on the Nervous System
2025-Dec-29, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 本研究系统评估了碲化镉量子点的体内分布、神经行为效应及细胞反应,揭示了其诱发持续性神经炎症并损害学习记忆功能的多细胞机制 首次通过单细胞RNA测序技术解析量子点诱导神经毒性的多细胞协调响应机制,明确了小胶质细胞、少突胶质前体细胞和内皮细胞在炎症、氧化及细胞应激通路中的关键作用 研究仅使用小鼠模型,未验证其他物种;量子点类型和表面修饰单一;长期神经毒性效应需进一步追踪 评估量子点的神经安全性并阐明其神经毒性机制 注射巯基丙酸修饰碲化镉量子点的小鼠模型 单细胞组学 神经毒性 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠海马组织单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
960 2025-12-30
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2025-Dec-29, Molecular and cellular biology IF:3.2Q3
研究论文 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴促进巨噬细胞-成纤维细胞交互作用,从而加速肛瘘愈合的分子机制 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF轴调控巨噬细胞M1极化和成纤维细胞功能的分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证;NF-κB抑制剂的反转实验仅部分验证通路参与 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子作用机制 肛瘘伤口愈合过程、巨噬细胞与成纤维细胞的交互作用 生物信息学与分子生物学 肛瘘 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR NA 基因表达数据、测序数据、体外实验数据、体内实验数据 转录组数据集(GSE28914, GSE203244)、小鼠肛瘘模型 NA 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA NA
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