单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 9841 - 9860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9841 | 2024-08-15 |
CD11b+ lung dendritic cells at different stages of maturation induce Th17 or Th2 differentiation
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25307-x
PMID:34413303
|
研究论文 | 研究报道了在不同成熟阶段的小鼠肺部CD11b+树突状细胞（DC）如何诱导Th17或Th2分化 | 首次揭示了肺部cDC2在不同成熟阶段对Th17和Th2分化的影响，并通过单细胞RNA测序分析了其发展过程 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨肺部树突状细胞在不同成熟阶段对T细胞分化的影响 | 小鼠肺部的CD11b+树突状细胞及其在Th17和Th2分化中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠肺部的多个树突状细胞亚群 |
| 9842 | 2024-08-15 |
CoCoA-diff: counterfactual inference for single-cell gene expression analysis
2021-08-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02438-4
PMID:34404460
|
研究论文 | 本文介绍了一种因果推断框架CoCoA-diff，用于在单细胞RNA-seq数据中优先考虑疾病基因，无需事先了解控制变量即可调整混杂因素 | CoCoA-diff方法在模拟和真实世界数据分析中显著提高了统计能力，并识别了215个在不同细胞类型中差异调节的因果基因 | NA | 寻找基因组医学中的因果基因 | 单细胞RNA-seq数据中的疾病基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 因果推断框架 | 基因表达数据 | 70,000个脑细胞 |
| 9843 | 2024-08-15 |
Exploring the Biological Activity and Mechanism of Xenoestrogens and Phytoestrogens in Cancers: Emerging Methods and Concepts
2021-Aug-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168798
PMID:34445499
|
综述 | 本文综述了外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制，以及新兴的研究方法和概念 | 介绍了患者来源的异种移植（PDX）模型和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的新应用，以及敏感期（WOS）这一新兴概念 | NA | 探讨外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的作用及其机制，以及如何利用这些知识开发预防和治疗癌症的新方法 | 外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 患者来源的异种移植（PDX）模型 | RNA | 18项临床试验 |
| 9844 | 2024-08-15 |
Defining the variety of cell types in developing and adult human kidneys by single-cell RNA sequencing
2021-Aug-11, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-021-00156-w
PMID:34381054
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了发育中和成人人类肾脏中的细胞类型多样性 | 本文通过比较单细胞RNA测序时代前后的文献，发现了新的细胞类型和中间细胞阶段，以及复杂的分子特征和谱系途径 | 单细胞RNA测序技术存在局限性，导致细胞类型多样性在文献中仍然存在差异 | 确定人类肾脏中细胞类型的数量 | 发育中和成人人类肾脏组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人肾脏中鉴定出41种肾源性细胞群和32种非肾源性细胞群 |
| 9845 | 2024-08-15 |
RNA velocity-current challenges and future perspectives
2021-08, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202110282
PMID:34435732
|
综述 | 本文回顾了RNA速度建模方法的现状，讨论了其局限性和潜在缺陷，并提供了应对挑战的指导 | 提出了将RNA速度概念推广到更广泛的生物系统和模式的未来方向 | 讨论了RNA速度方法的局限性和潜在陷阱 | 探讨RNA速度方法的现状及未来发展方向 | RNA速度建模方法及其在生物系统中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9846 | 2024-08-15 |
N6-Methyladenosine Regulators and Related LncRNAs Are Potential to be Prognostic Markers for Uveal Melanoma and Indicators of Tumor Microenvironment Remodeling
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.704543
PMID:34395276
|
研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（mA）调节因子和相关长链非编码RNA（lncRNA）在葡萄膜黑色素瘤（UM）中的预后标志物作用及其对肿瘤微环境（TME）重塑的影响 | 首次系统地识别了mA调节因子，并构建了基于mA调节因子的预后风险签名，通过单细胞测序数据验证了其在UM中的表达分布 | NA | 探索mA调节因子和相关lncRNA在UM中的预后标志物作用及对TME的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | LASSO Cox分析 | 转录组数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的转录组和临床数据，以及GSE139829数据集的单细胞测序数据 |
| 9847 | 2024-08-15 |
The transcription factor Hhex cooperates with the corepressor Tle3 to promote memory B cell development
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0713-6
PMID:32601467
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析和CRISPR-Cas9筛选方法，识别了在向记忆B细胞分化的生发中心B细胞中，转录因子Hhex和共抑制因子Tle3在调节记忆B细胞分化中的作用 | 首次揭示了Hhex和Tle3在记忆B细胞分化中的协同作用，并发现了Bcl-6对Hhex的直接抑制作用以及Hhex缺陷细胞中Bcl2过表达对记忆B细胞分化的挽救作用 | NA | 研究记忆B细胞分化过程中的转录因子调控机制 | 记忆B细胞的分化过程及其相关转录因子和共抑制因子的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析，CRISPR-Cas9筛选 | NA | RNA | NA |
| 9848 | 2024-08-15 |
Single-Cell RNA Sequencing of Lymph Node Stromal Cells Reveals Niche-Associated Heterogeneity
2018-05-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.04.006
PMID:29752062
|
研究论文 | 本研究利用基于液滴的单细胞RNA测序技术，揭示了淋巴结基质细胞的异质性及其在免疫反应中的作用 | 首次全面揭示了淋巴结基质细胞的多样性，并识别出九种非内皮基质细胞簇 | NA | 探索淋巴结基质细胞的多样性及其在免疫功能中的作用 | 淋巴结基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 九种非内皮基质细胞簇 |
| 9849 | 2024-08-14 |
Single-cell transcriptomic analysis uncovers heterogeneity in the labial gland microenvironment of primary Sjögren's syndrome
2024-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2024.100248
PMID:39131726
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了原发性干燥综合征患者唇腺微环境的细胞和分子机制 | 揭示了唇腺微环境中上皮细胞分化减少和干扰素信号通路增强等新的细胞功能变化 | 样本量较小，仅包括三名患者和三名健康对照 | 探究原发性干燥综合征唇腺微环境的细胞和分子机制 | 原发性干燥综合征患者的唇腺细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 32,337个细胞，来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康个体 |
| 9850 | 2024-08-14 |
Tailored endothelialization enabled by engineered endothelial cell vesicles accelerates remodeling of small-diameter vascular grafts
2024-Nov, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.006
PMID:39131628
|
研究论文 | 本文通过应用工程化内皮细胞囊泡来伪装血管移植物，以增强血管重塑，从而创建具有定制化内皮化的微小直径血管移植物（SDVG）。 | 本文创新性地通过代谢糖工程将叠氮基团修饰的工程化内皮细胞囊泡（ECVs-N）精确连接到PCL-DBCO制成的血管移植物上，形成ECVG，有助于抑制血小板粘附和激活，促进内皮细胞粘附并增强抗炎作用。 | NA | 研究目的是通过工程化内皮细胞囊泡实现微小直径血管移植物的定制化内皮化，以克服传统血管移植物的局限性。 | 研究对象是微小直径血管移植物（SDVG）及其内皮化过程。 | 生物工程 | 心血管疾病 | 代谢糖工程，点击化学 | NA | 单细胞转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9851 | 2024-08-14 |
Novel prognostic alternative splicing events in colorectal Cancer: Impact on immune infiltration and therapy response
2024-Sep-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112603
PMID:39043103
|
研究论文 | 本研究旨在全面分析结直肠癌（CRC）中的选择性剪接（AS）特征，并阐明其与CRC免疫微环境的关系 | 本研究首次构建了一个包含15个AS事件的预测模型，并揭示了BCAS1作为ANO7|58341|AT剪接事件潜在调控因子的作用 | NA | 全面分析结直肠癌中的选择性剪接特征及其与免疫微环境的关系 | 结直肠癌患者的转录组数据、临床信息和AS事件的PSI值 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | Cox比例风险模型 | 转录组数据 | CRC患者的数据来自TCGA和TCGA SpliceSeq数据库 |
| 9852 | 2024-08-14 |
TIM-3/CD68 double-high expression in Glioma: Prognostic characteristics and potential therapeutic approaches
2024-Sep-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112665
PMID:39002523
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研究论文 | 本研究探讨了TIM-3和CD68在胶质瘤中的表达及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 发现TIM-3在胶质瘤中的表达主要集中在巨噬细胞上，与CD68的双高表达可能成为胶质瘤的新升级标志物 | NA | 寻找胶质瘤中的有价值的免疫治疗靶点，并探索潜在的免疫治疗策略 | TIM-3和CD68在胶质瘤中的表达及其与患者生存率的关系 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 免疫组织化学(IHC)、多重荧光免疫组织化学(mIHC)、生物信息学分析 | NA | 单细胞测序数据 | 187名胶质瘤患者 |
| 9853 | 2024-08-14 |
Comprehensive transcriptomic analysis of immune-related genes in diabetic foot ulcers: New insights into mechanisms and therapeutic targets
2024-Sep-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112638
PMID:39079197
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析糖尿病足溃疡（DFU）中的免疫相关基因表达，探索DFU中免疫相关基因与病理机制的关联 | 首次系统性地研究了DFU中免疫相关基因的表达差异，并识别了关键的免疫相关基因 | 样本量较小，且仅限于DFU患者和健康对照组 | 探索糖尿病足溃疡中免疫相关基因的表达变化及其与病理机制的关系 | 糖尿病足溃疡患者的伤口活检样本 | 数字病理学 | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10名糖尿病足溃疡患者和11名健康对照 |
| 9854 | 2024-08-14 |
Single-cell RNA-sequencing analysis reveals α-syn induced astrocyte-neuron crosstalk-mediated neurotoxicity
2024-Sep-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112676
PMID:39053230
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了α-突触核蛋白诱导的星形胶质细胞与神经元之间的交叉对话介导的神经毒性机制 | 首次详细探讨了α-突触核蛋白如何通过增强星形胶质细胞与神经元之间的通信，特别是通过TNF和炎症相关信号通路，导致神经毒性 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨α-突触核蛋白在星形胶质细胞与神经元交叉对话中的作用及其对神经毒性的影响 | α-突触核蛋白、星形胶质细胞、神经元、TNF和炎症相关信号通路 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用来自Hua-Syn (A53T)和野生型小鼠的脑前额叶皮层和中脑样本 |
| 9855 | 2024-08-14 |
Mitoclone2: an R package for elucidating clonal structure in single-cell RNA-sequencing data using mitochondrial variants
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae095
PMID:39131821
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research paper | 本文介绍了一个名为mitoClone2的R包，用于通过整合单细胞测序实验中发现的线粒体异质性变异来识别克隆群体结构 | mitoClone2包提供了与常用克隆结构划分工具的内置兼容性，能够直接使用多重BAM文件作为输入，并包含人类和小鼠线粒体基因组的注释，以及用于调用、过滤、聚类和可视化变异的辅助函数 | NA | 阐明单细胞RNA测序数据中的克隆结构 | 单细胞RNA测序数据中的线粒体变异 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 9856 | 2024-08-14 |
CilioGenics: an integrated method and database for predicting novel ciliary genes
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae554
PMID:38989623
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研究论文 | 本文开发了一种名为CilioGenics的综合方法和数据库，用于预测人类新的纤毛基因 | CilioGenics方法结合了单细胞RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用、比较基因组学、转录因子网络分析和文本挖掘等多种方法，提高了预测纤毛基因的能力 | NA | 揭示人类纤毛基因的完整列表，以诊断与纤毛相关的人类疾病，即纤毛病 | 人类纤毛基因 | 比较基因组学 | 纤毛病 | 单细胞RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用、转录因子网络分析、文本挖掘 | NA | 基因数据 | NA |
| 9857 | 2024-08-14 |
Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003
PMID:38776915
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析，研究了猪到人肾脏异种移植中的细胞动力学和异种移植与受者之间的相互作用。 | 首次详细描述了异种移植后肾脏和受者外周血单个核细胞的细胞动力学，为优化异种移植结果提供了新的见解。 | 本文主要集中在细胞和分子层面的分析，未涉及临床结果的长期追踪。 | 揭示异种移植过程中的细胞动力学和受者免疫反应，以优化异种移植策略。 | 猪到人肾脏异种移植中的细胞动力学和受者免疫反应。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和纵向RNA测序 | NA | RNA | 两例猪到人肾脏异种移植 |
| 9858 | 2024-08-14 |
Enhanced microglial dynamics and a paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contribute to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2024-Aug-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02775-1
PMID:39102080
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研究论文 | 本研究探讨了无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者大脑中与认知抵抗相关的机制，发现AsymAD病例中核心斑块增多、纤维状斑块积累减少以及斑块周围微胶质细胞增多，且病理tau聚集较少。 | 首次揭示了AsymAD病例中斑块微环境中微胶质细胞的高效肌动蛋白细胞运动机制和减少的tau播种活性，这些机制可能保护大脑免受Aβ引发的毒性级联反应。 | NA | 探究无症状阿尔茨海默病患者大脑中抵抗病理变化和认知衰退的机制。 | 无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的大脑组织。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 一批无症状阿尔茨海默病（AsymAD）患者的尸检大脑样本 |
| 9859 | 2024-08-14 |
STdGCN: spatial transcriptomic cell-type deconvolution using graph convolutional networks
2024-Aug-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03353-0
PMID:39103939
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研究论文 | 本文介绍了一种利用图卷积网络（STdGCN）进行空间转录组细胞类型反卷积的方法，该方法结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST）数据进行细胞类型鉴定 | STdGCN模型在多个数据集上表现优于17种最先进模型，能够准确地描绘肿瘤微环境和组织发育中的细胞交互 | NA | 开发一种新的方法来提高空间转录组数据的细胞类型分辨率 | 空间转录组数据中的细胞类型鉴定 | 数字病理学 | 乳腺癌，心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组（ST） | 图卷积网络（GCN） | 转录组数据 | 多个数据集，包括人类乳腺癌Visium数据集和人类心脏ST数据 |
| 9860 | 2024-08-14 |
The society for craniofacial genetics and developmental biology 46th annual meeting
2024-08, American journal of medical genetics. Part A
DOI:10.1002/ajmg.a.63615
PMID:38563316
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会议报告 | 第46届颅面遗传学和发育生物学学会年会在辛辛那提儿童医院医疗中心举行，重点讨论了颅面发育、人类遗传学、转化和再生方法以及临床管理的新发现 | NA | NA | NA | NA | 发育生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 122名参会者 |