单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
9821 2024-08-15
A novel STING variant triggers endothelial toxicity and SAVI disease
2024-09-02, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本文报道并描述了一种新的STING变异体(F269S),该变异体在SAVI患者中发现,并探讨了其在细胞和分子水平上的功能及其对疾病的影响。 首次报道了STING F269S变异体,并揭示了其在SAVI发病机制中的作用,特别是在内皮细胞和免疫细胞之间的相互作用。 NA 研究STING F269S变异体在SAVI疾病中的病理作用及其分子机制。 STING F269S变异体及其在SAVI患者中的功能和影响。 NA 肺间质疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 单个SAVI患者
9822 2024-08-15
Single-cell RNA sequencing data analysis utilizing multi-type graph neural networks
2024-Sep, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据分析模型scDMG,利用去噪自编码器和多类型图神经网络学习细胞间的拓扑信息和潜在表示 引入零膨胀负二项分布模型到去噪自编码器中进行数据降维和去噪,并集成多类型图神经网络作为编码器处理不同类型的单细胞RNA测序数据集 NA 改进单细胞RNA测序数据的分析和处理方法 单细胞RNA测序数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 图神经网络 序列数据 NA
9823 2024-08-15
Single-cell Transcriptome Landscape of DNA Methylome Regulators Associated with Orofacial Clefts in the Mouse Dental Pulp
2024-Sep, The Cleft palate-craniofacial journal : official publication of the American Cleft Palate-Craniofacial Association
研究论文 研究通过单细胞转录组测序分析了与小鼠牙髓中DNA甲基化调控因子相关的转录组图谱,探讨其与口腔颌面裂的关系 首次在单细胞分辨率下研究了与DNA甲基化和去甲基化相关的调控基因在小鼠牙髓间充质干细胞中的表达情况 研究未涉及人类患者,且仅限于小鼠模型 旨在研究与DNA甲基化和去甲基化相关的调控基因在单细胞水平的转录组图谱 小鼠牙髓中的间充质干细胞及其在不同骨分化阶段的亚群 数字病理学 口腔颌面裂 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 未具体说明样本数量
9824 2024-08-15
Prdm1 positively regulates liver Group 1 ILCs cancer immune surveillance and preserves functional heterogeneity
2024-Aug-12, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示了Prdm1在调节肝脏cNK细胞和ILC1s功能中的作用,特别是在肝癌免疫监视中的重要性 首次揭示了Prdm1在维持cNK细胞和肝脏ILC1s功能异质性中的新机制 研究主要基于Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型,可能需要进一步的人体研究验证 探索Prdm1在肝脏cNK细胞和ILC1s中的调控机制及其在肝癌免疫治疗中的潜在应用 肝脏cNK细胞和ILC1s的功能及其在肝癌中的作用 免疫学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 使用Ncr1驱动的条件性敲除小鼠模型进行研究
9825 2024-08-15
Integrated analysis of spatial transcriptomics and CT phenotypes for unveiling the novel molecular characteristics of recurrent and non-recurrent high-grade serous ovarian cancer
2024-Aug-12, Biomarker research IF:9.5Q1
research paper 本研究通过整合空间转录组学和CT表型数据,揭示了高级别浆液性卵巢癌复发和非复发患者的分子特征 本研究首次结合空间转录组学和CT数据,识别了与高级别浆液性卵巢癌复发相关的特定细胞群富集和差异表达基因 研究样本量较小,仅包括八名患者,可能影响结果的普遍性 探索高级别浆液性卵巢癌的分子特征,为个性化医疗提供诊断和治疗靶点 高级别浆液性卵巢癌的复发和非复发患者 digital pathology 卵巢癌 空间转录组学 (ST) NA 转录组数据 8名高级别浆液性卵巢癌患者
9826 2024-08-15
Single-cell multiomics analysis reveals cell/tissue-specific associations in bipolar disorder
2024-Aug-06, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,探讨了双相情感障碍(BD)的细胞起源和组织异质性 本研究首次发现了一个名为ADCY1的新脑细胞簇,并从高分辨率遗传角度揭示了胶质细胞是与BD相关的主要细胞病理 NA 探讨双相情感障碍的细胞起源和组织异质性 双相情感障碍(BD)的细胞和组织特征 数字病理学 精神疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC-seq、RNA-seq、全基因组关联研究(GWAS) NA 基因组数据 包括8个胚胎和胎儿脑样本(1,266个细胞)、210个成人脑ATAC-seq数据、314个成人脑bulk RNA-seq数据和413,466个GWAS汇总数据
9827 2024-08-15
Single-cell landscape revealed immune characteristics associated with disease phases in brucellosis patients
2024-Aug, iMeta IF:23.7Q1
research paper 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了布鲁氏菌病患者在不同疾病阶段的免疫特征 首次系统地揭示了布鲁氏菌病在不同感染阶段的综合免疫反应,特别是急性期的细胞因子风暴和慢性期的Th1反应失调 NA 旨在深入理解布鲁氏菌病的免疫发病机制,并为开发新的有效治疗策略提供依据 布鲁氏菌病患者及健康捐赠者的免疫细胞 digital pathology brucellosis scRNA-seq NA 细胞 290,369个细胞来自35个个体,包括29名布鲁氏菌病患者和6名健康捐赠者
9828 2024-08-15
Cell-type-specific expression analysis of liver transcriptomics with clinical parameters to decipher the cause of intrahepatic inflammation in chronic hepatitis B
2024-Aug, iMeta IF:23.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和临床参数,分析了慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的细胞类型特异性表达,以揭示其机制 采用贝叶斯线性模型和群体特异性表达分析(PSEA)将基因表达与临床参数关联,并验证了多免疫染色技术 NA 探讨慢性乙型肝炎患者肝脏炎症的机制 慢性乙型肝炎患者的肝脏炎症 数字病理学 乙型肝炎 多组学研究 贝叶斯线性模型 转录组数据 来自慢性乙型肝炎患者的肝脏样本
9829 2024-08-15
Dominant dystrophic epidermolysis bullosa is associated with glycolytically active GATA3+ T helper 2 cells which may contribute to pruritus in lesional skin
2024-Jul-16, The British journal of dermatology
研究论文 研究通过RNA测序分析了主导性营养不良性大疱性表皮松解症(DDEB)患者的皮肤转录组,以识别减轻患者瘙痒的治疗目标。 首次通过单细胞RNA测序揭示了DDEB皮肤中与瘙痒相关的糖酵解活性GATA3+ Th2细胞的存在,并验证了抗Th2药物在治疗DDEB瘙痒中的有效性。 研究样本量较小,仅包括六名DDEB患者和四名健康个体,可能影响结果的普遍性。 旨在通过分析DDEB患者的皮肤转录组,寻找减轻瘙痒的治疗靶点。 主导性营养不良性大疱性表皮松解症(DDEB)患者的受影响和未受影响的皮肤样本。 NA 营养不良性大疱性表皮松解症 RNA测序 NA 转录组数据 六名DDEB患者和四名健康个体的皮肤活检样本,以及五名个体的单细胞转录组数据。
9830 2024-08-15
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-Jul-10, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了干细胞因子(SCF)和粒细胞集落刺激因子(G-CSF)联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用。 首次揭示了SCF+G-CSF治疗通过调节小胶质细胞和外周髓系细胞的转录谱,减轻阿尔茨海默病病理变化的新机制。 研究仅限于老年APP/PS1小鼠模型,需要进一步在人类或其他动物模型中验证。 探索SCF+G-CSF治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中减轻阿尔茨海默病病理变化的潜在机制。 老年APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞。 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 28个月大的APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞
9831 2024-08-15
Single-Cell and Spatial Transcriptome Profiling Identifies the Transcription Factor BHLHE40 as a Driver of EMT in Metastatic Colorectal Cancer
2024-Jul-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组测序技术,揭示了BHLHE40转录因子在结直肠癌转移中的作用,特别是在上皮间质转化(EMT)过程中的作用 首次通过单细胞和空间转录组测序技术,结合细胞间通讯分析,识别出BHLHE40作为驱动结直肠癌EMT的关键转录因子 NA 阐明驱动结直肠癌上皮间质转化(EMT)的细胞机制 结直肠癌患者的非转移性和转移性原发性肿瘤 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组测序 NA RNA序列 22个样本,包括11个非转移性原发性肿瘤和11个转移性原发性肿瘤
9832 2024-08-07
[Applications of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis: the progress and prospect]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
9833 2024-08-07
[Application and progress of single-cell RNA sequencing in chronic rhinosinusitis]
2024-Jun-07, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
9834 2024-08-15
Placenta accreta spectrum disorder at single-cell resolution: a loss of boundary limits in the decidua and endothelium
2024-04, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1
研究论文 本研究使用单细胞和空间分辨转录组学技术,分析了胎盘植入谱系障碍中母胎界面的细胞异质性 首次在单细胞分辨率下描述胎盘植入谱系障碍的细胞图谱,揭示了母胎界面细胞类型间的显著基因表达差异 研究样本量较小,仅包括12个胎盘样本 深入理解胎盘植入谱系障碍的病理生理机制 胎盘植入谱系障碍中的母胎界面细胞异质性 数字病理学 胎盘疾病 单细胞RNA测序、空间分辨转录组学 NA 转录组数据 12个胎盘样本,包括6个胎盘植入谱系障碍样本和6个对照样本
9835 2024-08-15
Single-cell atlas of the liver myeloid compartment before and after cure of chronic viral hepatitis
2024-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究利用基于板的单细胞RNA测序技术,深入分析了慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染患者在接受直接作用抗病毒药物(DAAs)治疗前后肝脏髓系细胞的变化。 发现了治疗后细胞类型的特异性变化,如增殖的CD1C+常规树突状细胞的增加,以及病毒载量与治疗后干扰素刺激基因表达之间的反向关系。 NA 研究慢性病毒感染治愈后肝脏免疫系统的变化,为开发新的治疗策略提供见解。 慢性丙型肝炎病毒感染患者的肝脏髓系细胞。 数字病理学 肝炎 单细胞RNA测序 NA RNA 慢性丙型肝炎病毒感染患者的肝脏细针抽吸样本
9836 2024-08-15
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics IF:3.0Q2
综述 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究进展 单细胞研究提供了胎盘中新型细胞类型以及与母体暴露和并发症相关的细胞类型特异性标志的见解 NA 增强对孕期细胞动态变化的理解 母婴健康 单细胞测序 母婴健康 单细胞测序技术 NA 转录组数据 16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱,31个关于母体暴露和并发症的单细胞研究
9837 2024-08-15
Single-Cell Histone Modification Profiling with Cell Enrichment Using sortChIC
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了一种名为sortChIC的排序辅助单细胞染色质免疫切割测序技术,用于在单细胞水平上绘制组蛋白后转录修饰(PTMs)图谱 该技术结合了组蛋白PTM位置的映射与基于表面染色的细胞富集,使得可以整合现有的稀有细胞类型富集策略 NA 旨在研究细胞类型特异性动态变化,特别是在异质性体内环境中 单细胞中的组蛋白后转录修饰(PTMs) 生物技术 NA sortChIC NA 单细胞数据 NA
9838 2024-08-15
Characterization of Wnt signaling pathway under treatment of Lactobacillus acidophilus postbiotic in colorectal cancer using an integrated in silico and in vitro analysis
2023-12-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合计算和体外实验分析,探讨了乳酸菌酸ophilus后生物制剂对结直肠癌中Wnt信号通路的影响 首次采用单细胞RNA测序和深度学习方法ExpiMap分析结直肠癌中的差异表达基因,并研究了乳酸菌酸ophilus后生物制剂对其的影响 研究仅限于HT-29细胞系,未来研究应扩展到其他细胞系和临床试验 探讨乳酸菌酸ophilus后生物制剂对结直肠癌中Wnt信号通路的影响及其治疗潜力 结直肠癌中的差异表达基因及乳酸菌酸ophilus后生物制剂对其的影响 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、实时定量PCR(RT-qPCR)、流式细胞术 NA 基因表达数据 HT-29细胞系及正常邻近组织
9839 2024-08-15
Microglia promote anti-tumour immunity and suppress breast cancer brain metastasis
2023-Dec, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 研究通过单细胞RNA测序和基因工程小鼠模型,发现脑部常驻的微胶质细胞在乳腺癌脑转移中起到抗炎和抑制肿瘤的作用 首次明确微胶质细胞在乳腺癌脑转移中的肿瘤抑制作用,并发现其在人类微胶质细胞中的保守性 NA 探讨微胶质细胞在乳腺癌脑转移中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 微胶质细胞在乳腺癌脑转移中的功能及其对患者预后的影响 NA 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 使用基因工程小鼠模型和人类样本进行研究
9840 2024-08-15
Loss of Mir146b with aging contributes to inflammation and mitochondrial dysfunction in thioglycollate-elicited peritoneal macrophages
2021-08-23, eLife IF:6.4Q1
研究论文 研究探讨了Mir146b在衰老过程中对腹膜巨噬细胞炎症和线粒体功能障碍的影响 首次通过RNA测序方法发现Mir146b在衰老的腹膜巨噬细胞中表达下降,并揭示了其对巨噬细胞功能的影响 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探究巨噬细胞衰老过程中的分子机制及其对免疫功能的影响 衰老过程中的腹膜巨噬细胞 NA NA RNA测序 NA RNA 小鼠腹膜巨噬细胞
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