单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
9781 2024-08-17
Single-Cell RNA-Seq of T Cells in B-ALL Patients Reveals an Exhausted Subset with Remarkable Heterogeneity
2021-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患者和健康个体的外周血T细胞,发现了患者中具有显著异质性的耗竭T细胞亚群 首次揭示了B-ALL患者中耗竭T细胞的异质性及其亚群特征,并探讨了其可能的起源 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示B-ALL患者中T细胞的功能集群,为免疫治疗和临床反应预测提供策略 B-ALL患者和健康个体的外周血T细胞 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序 NA RNA 健康个体和B-ALL患者的T细胞样本
9782 2024-08-17
CD177 modulates the function and homeostasis of tumor-infiltrating regulatory T cells
2021-10-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析肾透明细胞癌患者的免疫细胞,发现肿瘤浸润调节T细胞(TI Treg)存在两种不同的转录命运,其中Fate-1与较差的预后相关,并发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达,阻断CD177可减少Treg细胞的抑制活性,为TI Treg特异性免疫治疗提供新靶点 首次发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达,并揭示其对Treg细胞功能和肿瘤生长的影响 研究主要在体外和小鼠模型中进行,需要进一步在临床试验中验证 探索肿瘤浸润调节T细胞的功能和潜在治疗靶点 肾透明细胞癌患者的免疫细胞及肿瘤浸润调节T细胞 免疫学 肾癌 单细胞RNA测序 NA RNA 肾透明细胞癌患者
9783 2024-08-17
Escape of hair follicle stem cells causes stem cell exhaustion during aging
2021-10, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究探讨了衰老过程中毛囊干细胞(HF-SCs)耗竭的机制 首次在活体动物中观察到衰老过程中毛囊干细胞的耗竭过程,并揭示了上皮细胞从毛囊干细胞微环境中逃逸的新机制 NA 阐明衰老过程中毛囊干细胞耗竭的机制及其对组织退化的影响 衰老小鼠的毛囊干细胞及其上皮细胞 NA NA 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序(ATAC-seq) NA 细胞 衰老小鼠
9784 2024-08-17
Spatial Transcriptomics of Nematodes Identifies Sperm Cells as a Source of Genomic Novelty and Rapid Evolution
2021-01-04, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1
研究论文 本文通过比较两种远缘线虫的空间转录组,揭示了精子细胞中新基因的富集及其在快速进化中的作用 首次在线虫中发现“睾丸外”假说,表明精子相关区域中新基因的富集 NA 探究基因表达的进化和新基因在空间分辨率下的作用 两种远缘线虫Caenorhabditis elegans和Pristionchus pacificus的空间转录组 基因组学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 两种线虫的成年虫体
9785 2024-08-16
Dissecting the dynamic cellular transcriptional atlas of adult teleost testis development throughout the annual reproductive cycle
2024-Oct-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,详细剖析了成年黑岩鱼在不同生殖周期阶段(退化、再生和分化)的睾丸细胞动态转录图谱,揭示了精子发生过程中的分子事件。 本研究首次描绘了从精原细胞到精子细胞的连续发育轨迹,并展示了精原细胞在年度发育周期中从糖酵解到线粒体呼吸的生物能量转换,以及通过重新聚类分析揭示的更深层次的异质性和分子特征。 NA 研究旨在揭示鱼类睾丸在年度生殖周期中的细胞组成和分子事件的动态变化。 成年黑岩鱼的睾丸细胞。 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 来自不同生殖周期阶段的成年黑岩鱼睾丸细胞
9786 2024-08-16
Interleukin-24: A molecular mediator of particulate matter's impact on skin aging
2024-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现,在暴露于颗粒物(PM)的皮肤中,IL-24在角质形成细胞和成纤维细胞中高度上调,并探讨了IL-24在PM诱导的皮肤老化中的作用及潜在抑制策略。 首次揭示了IL-24在颗粒物诱导的皮肤老化中的关键作用,并通过高通量筛选找到了抑制IL-24-STAT3信号通路的化合物,如洛伐他汀。 研究主要集中在体外皮肤模型上,未来需要进一步的体内研究以验证这些发现。 探讨颗粒物对皮肤老化的影响及其分子机制,并寻找潜在的干预策略。 角质形成细胞和成纤维细胞中的IL-24表达及其在皮肤老化中的作用。 NA 皮肤老化 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及暴露于颗粒物的体外皮肤模型中的角质形成细胞和成纤维细胞
9787 2024-08-16
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-Sep, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学技术,探讨了内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性以及ICAM1与PTGS2在其中的相互作用 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术,揭示了慢性根尖周炎中内皮细胞的多样性及其与ICAM1-PTGS2相互作用的关系 研究样本量较小,且仅限于特定的内皮细胞和巨噬细胞类型 探究内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性及其与ICAM1-PTGS2相互作用的关系 内皮细胞、巨噬细胞以及ICAM1和PTGS2的相互作用 数字病理学 牙周病 单细胞RNA测序、蛋白质组学 NA RNA、蛋白质 五个慢性根尖周炎样本
9788 2024-08-16
Treating epidermolytic ichthyosis and ichthyosis with confetti with epidermal autografts cultured from revertant skin
2024-Aug-14, The British journal of dermatology
研究论文 本文评估了从逆转皮肤培养的自体表皮移植物(CEAs)在治疗表皮松解性鱼鳞病(EI)和斑点状鱼鳞病(IWC)患者中的可行性 首次尝试使用从患者自身逆转表皮角质形成细胞生产的CEAs进行治疗,并证明了其潜在的安全性和局部治疗效果 研究样本量小,且在24周后观察到鱼鳞病病变的复发 评估从逆转表皮角质形成细胞生产的自体表皮移植物在EI和IWC患者中的治疗效果 表皮松解性鱼鳞病和斑点状鱼鳞病患者 NA 鱼鳞病 扩增子测序和液滴数字聚合酶链反应分析 NA RNA测序数据 3名患者
9789 2024-08-16
Fibroblasts with high matrix metalloproteinase 2 expression regulate CD8+ T-cell residency and inflammation via CD100 in psoriasis
2024-Aug-14, The British journal of dermatology
研究论文 本文探讨了高表达基质金属蛋白酶2(MMP2)的成纤维细胞通过CD100轴调节银屑病中CD8+ T细胞的驻留和炎症的作用。 首次揭示了MMP2hi成纤维细胞通过促进CD100从CD8+ T细胞膜上脱落以及上调CD103,增强CD8+ T细胞驻留,从而加剧银屑病炎症的新机制。 NA 阐明成纤维细胞和MMP2-CD100轴在调节银屑病炎症中的作用。 银屑病患者中的CD8+ T细胞和成纤维细胞。 数字病理学 银屑病 免疫荧光、酶联免疫吸附试验、单细胞转录组测序、细胞相互作用分析、定量逆转录聚合酶链反应。 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据。 从银屑病患者中分离的CD8+ T细胞样本。
9790 2024-08-16
Natural killer cells promote neutrophil extracellular traps and restrain macular degeneration in mice
2024-Aug-14, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了自然杀伤细胞(NK细胞)在促进中性粒细胞外陷阱形成和抑制小鼠脉络膜新生血管形成中的作用 首次揭示了NK细胞通过CCR5受体参与招募和渗出,以及通过NKG2D受体抑制中性粒细胞外陷阱形成,从而在脉络膜新生血管形成中发挥保护作用 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人体中验证NK细胞的作用 探讨NK细胞在年龄相关性黄斑变性(nvAMD)中的作用及其潜在的治疗价值 自然杀伤细胞(NK细胞)、中性粒细胞外陷阱、脉络膜新生血管形成 免疫学 年龄相关性黄斑变性 Olink蛋白质组分析、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据、RNA序列数据 涉及人类捐赠者和小鼠模型的NK细胞
9791 2024-08-16
[The application of the diagnosis and therapy of single cell sequencing technology in central nervous system tumors]
2024-Aug-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
综述 本文综述了单细胞测序技术在中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后方面的应用 单细胞测序技术为揭示中枢神经系统肿瘤的复杂生态系统提供了机会 大多数研究成果尚未达到临床应用水平 探讨单细胞测序在中枢神经系统肿瘤中的应用及其对肿瘤预后和复发预防的潜在影响 中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后 数字病理学 神经系统肿瘤 单细胞测序技术 NA 细胞 NA
9792 2024-08-16
Integrated Single-Cell RNA-seq and ATAC-seq Reveals Heterogeneous Differentiation of CD4+ Naive T Cell Subsets is Associated with Response to Antidepressant Treatment in Major Depressive Disorder
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过综合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和ATAC-seq技术,分析了8名健康个体和8名重度抑郁症(MDD)患者在接受抗抑郁治疗前后的外周血单个核细胞,揭示了CD4+幼稚T细胞亚群的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联。 本研究首次结合scRNA-seq和ATAC-seq技术,揭示了MDD患者中CD4+幼稚T细胞的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联,并识别出响应者中特定激活的CD4+幼稚T细胞群及其上游调控因子ETS。 研究样本量较小,且仅包括8名MDD患者和8名健康个体,可能影响结果的普遍性。 探讨重度抑郁症患者抗抑郁治疗反应的分子机制。 重度抑郁症(MDD)患者和健康个体的外周血单个核细胞。 数字病理学 抑郁症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和ATAC-seq NA RNA和染色质可及性数据 8名MDD患者和8名健康个体
9793 2024-08-16
Unraveling the connection between Hashimoto's Thyroiditis and non-alcoholic fatty liver disease: exploring the role of CD4+central memory T cells through integrated genetic approaches
2024-Aug, Endocrine IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过综合遗传方法探讨桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的联系,特别是CD4+中央记忆T细胞的作用。 本研究首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化等方法,揭示了CD4+中央记忆T细胞在桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病中的关键作用,并鉴定了MAGI3基因作为这两种疾病的标志基因。 NA 探索桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的潜在联系。 桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的CD4+中央记忆T细胞。 遗传学 桥本甲状腺炎,非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序,孟德尔随机化 NA 基因表达数据 桥本甲状腺炎、非酒精性脂肪肝病及健康对照的单细胞RNA测序数据
9794 2024-08-16
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-Aug-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本文研究了慢性HCV感染患者中表达突变IGHV1-69编码抗原受体的B细胞,这些细胞与病毒中和相关,并显示出类似淋巴瘤的转录组特征 首次揭示了淋巴瘤样细胞可能源自抗HCV免疫反应,并提供了这些细胞在病毒清除后仍持续存在并可能导致B细胞功能障碍和淋巴瘤风险的机制基础 NA 探讨慢性HCV感染患者中B细胞的免疫反应及其与淋巴瘤样细胞的关系 慢性HCV感染患者及接受直接抗病毒治疗的患者的B细胞受体(BCR) 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 慢性HCV感染患者及HCV治疗后持续病毒学应答(SVR)患者的样本
9795 2024-08-16
In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution
2024-Aug, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文开发了一种体内单细胞CRISPR策略,用于系统研究150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态,揭示了肿瘤坏死因子(TNF)信号模块在肿瘤进化中的作用。 首次采用体内单细胞CRISPR筛选技术,结合超声引导的子宫内慢病毒微注射、单细胞RNA测序和引导捕获,实时监测克隆扩展并记录其背后的基因程序。 NA 研究肿瘤进化模型中,恶性转化前随机分布的驱动突变如何导致少数克隆转化为恶性肿瘤的机制。 150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态。 数字病理学 鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA
9796 2024-08-16
Integrated multi-omic analyses uncover the effects of aging on cell-type regulation in glucose-responsive tissues
2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序和代谢组学数据,探讨了衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 首次全面评估了衰老及其相关细胞类型响应的影响,并识别了潜在的血液生物标志物 NA 研究衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 脂肪组织和肌肉组织 组学 NA 转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序、代谢组学 共表达网络分析 转录组、甲基组、单细胞RNA、代谢组 NA
9797 2024-08-16
Tracing Immunological Interaction in Trimethylamine N-Oxide Hydrogel-Derived Zwitterionic Microenvironment During Promoted Diabetic Wound Regeneration
2024-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本研究开发了一种新型三甲胺N-氧化物(TMAO)衍生的两性离子水凝胶,用于促进糖尿病伤口愈合,并探索了两性离子水凝胶周围的多细胞生态系统 首次使用两性离子水凝胶促进糖尿病伤口愈合,并通过单细胞RNA测序揭示了不同细胞在两性离子微环境中的作用 NA 解析糖尿病伤口愈合过程中的多细胞特征并寻求治疗策略 糖尿病伤口愈合过程中的免疫调节机制 生物材料 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
9798 2024-08-16
Astaxanthin Alleviates Autoimmune Hepatitis by Modulating CD8+ T Cells: Insights From Mass Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过使用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析,探讨了虾青素(ASX)通过调节CD8+ T细胞减轻自身免疫性肝炎(AIH)的作用。 本研究首次通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,揭示了虾青素对CD8+ T细胞数量和功能的调节作用,并预测了关键的转录因子及构建了细胞间通信网络。 研究仅在AIH的小鼠模型中进行,未来需要进一步在人体中验证虾青素的效果和机制。 探讨虾青素在自身免疫性肝炎中的作用及其对CD8+ T细胞的调节机制。 自身免疫性肝炎(AIH)的小鼠模型及CD8+ T细胞。 NA 自身免疫性疾病 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞数据 小鼠模型中的多个样本
9799 2024-08-16
Sexually Dimorphic Response to Hepatic Injury in Newborn Suffering from Intrauterine Growth Restriction
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了宫内生长受限(IUGR)新生猪肝脏细胞的景观,揭示了性别依赖的IUGR诱导的肝脏损伤模式 首次探索了利用早期发育可塑性逆转不良胎儿编程结果的可能性,并发现了Apolipoprotein A4(APOA4)作为IUGR男性中对抗缺氧的保护性反应的新型生物标志物 研究仅限于猪模型,可能需要进一步的人体研究来验证结果 研究宫内生长受限对新生儿肝脏功能的影响及性别差异 宫内生长受限的新生猪 NA 肝脏疾病 scRNA-seq NA 细胞 来自同一胎儿的猪仔
9800 2024-08-16
Identification and Characterization of Metastasis-Initiating Cells in ESCC in a Multi-Timepoint Pulmonary Metastasis Mouse Model
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,在多时间点肺转移小鼠模型中鉴定并表征了食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)。 本研究首次鉴定出ESCC中的转移起始细胞,并识别出一组7个转移起始标志基因(MIS),这些基因在功能研究和生物信息学分析中显示出对早期转移微环境的潜在重塑作用。 本研究主要基于小鼠模型和临床样本,未来需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。 旨在鉴定和表征食管鳞状细胞癌中的转移起始细胞,并探索其在早期转移中的作用。 食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)及其相关标志基因。 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个时间点的肺转移小鼠模型中的ESCC细胞
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