本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-01-01 |
The mouse neonatal small intestine is regionally specialized for protein absorption and transepithelial transport
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205127
PMID:41208810
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠新生儿小肠中空肠与回肠肠上皮细胞在蛋白质吸收与跨上皮转运方面的区域特异性功能分工 | 首次通过体内外转运实验结合转录组学方法,系统阐明了新生儿小肠不同区段(空肠与回肠)肠上皮细胞在完整蛋白质转运与降解方面的功能分化及其分子基础 | 研究主要基于小鼠模型,人类新生儿肠道是否存在完全相同的机制仍需验证;Dab2条件性敲除对蛋白质转运的影响机制尚未完全解析 | 探究新生儿肠道蛋白质吸收的区域特异性机制及其分子调控网络 | 新生小鼠小肠肠上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、遗传学方法、体内外转运实验 | NA | 转录组数据、遗传数据、功能实验数据 | 新生小鼠肠道组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 882 | 2026-01-01 |
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052610
PMID:41048045
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和类器官实验,揭示了ETV1作为肠道L细胞中PYY激素表达的关键转录调节因子 | 首次发现ETV1特异性调控PYY表达而不影响GLP-1,揭示了L细胞谱系中特定激素的转录调控机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官实验,尚未在人体中验证;ETV1对PYY的调控作用较为有限 | 探究肠道L细胞中激素GLP-1和PYY的转录调控机制 | 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 883 | 2026-01-01 |
NETosis-Like Response Triggered by Extracellular Vesicle (EV)-Delivered Viral Nucleic Acid, a Novel Cellular Immune Mechanism in Crustacean
2025-Dec, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70210
PMID:41457043
|
研究论文 | 本研究揭示了在甲壳动物中,细胞外囊泡递送病毒核酸触发NETosis样反应的新型细胞免疫机制 | 首次在甲壳动物中基于单细胞转录组学鉴定出中性粒细胞样细胞,并揭示了由EVs递送病毒核酸介导的新型NETosis诱导机制 | 研究主要聚焦于甲壳动物模型,机制在脊椎动物中的普适性尚未验证 | 探究甲壳动物中细胞外囊泡在病毒核酸递送和NETosis样免疫反应中的作用机制 | 泥蟹的血细胞(特别是中性粒细胞样细胞)和WSSV病毒 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 884 | 2026-01-01 |
High Shear Stress-Induced Endothelial Piezo1 Downregulation Promotes Intracranial Aneurysm Formation via the PDGF-BB/PDGFRβ Paracrine Signaling Pathway
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70715
PMID:41457305
|
研究论文 | 本研究揭示了高剪切应力通过下调内皮细胞Piezo1表达,进而激活YAP/β-catenin信号通路促进PDGF-BB分泌,最终通过PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路诱导血管平滑肌细胞表型转化,从而促进颅内动脉瘤形成的机制 | 首次阐明了内皮细胞机械敏感离子通道Piezo1在高剪切应力诱导颅内动脉瘤形成中的关键作用,并发现了PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路作为Piezo1下游效应器的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;AAV2-BR1-Tie2-Cre介导的Piezo1条件性敲除可能存在脱靶效应 | 探究高剪切应力诱导颅内动脉瘤形成的分子机制,重点关注内皮细胞Piezo1通道在其中的作用 | 人类颅内动脉瘤样本、小鼠颅内动脉瘤模型、体外共培养的内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 血管生物学与疾病机制研究 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、平行板流动腔系统、AAV介导的基因敲除、细胞共培养、受体-配体对分析 | 小鼠颅内动脉瘤模型、体外细胞共培养模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括人类IA样本、Piezo1flox/flox转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 885 | 2026-01-01 |
A novel computational analysis integrating social determinants information from EHR and literature with Alzheimer's disease biological knowledge through large language models and knowledge graphs
2025-Dec, Innovation in aging
IF:4.9Q1
DOI:10.1093/geroni/igaf102
PMID:41458885
|
研究论文 | 本研究利用大型语言模型和知识图谱整合电子健康记录与文献中的社会健康决定因素信息,通过图深度学习预测阿尔茨海默病相关生物网络中的链接 | 首次将社会健康决定因素与阿尔茨海默病生物知识通过知识图谱和大型语言模型进行整合,并利用图深度学习进行链接预测 | 研究主要基于现有文献和电子健康记录数据,可能受数据质量和覆盖范围的限制 | 探索社会健康决定因素对阿尔茨海默病的影响,并整合生物知识以增强疾病理解 | 阿尔茨海默病及相关痴呆症 | 自然语言处理 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | 图深度学习 | 文本、多模态生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 886 | 2026-01-01 |
Exploration of the Prognostic Value of PANoptosis-Related Genes in Bladder Cancer
2025 Nov-Dec, American journal of men's health
DOI:10.1177/15579883251404985
PMID:41451445
|
研究论文 | 本研究系统探讨了PANoptosis相关基因在膀胱癌中的预后价值及临床意义 | 首次在膀胱癌中识别出两种具有显著生存差异的PANoptosis分子亚型,并构建了一个包含九个关键基因的预后模型,该模型在训练集和验证集中均表现出强大的风险分层能力,同时通过单细胞测序分析揭示了这些基因在肿瘤微环境中的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进行进一步验证,实验验证仅针对KCNJ15、FASN和ADAMTS12三个基因在组织中的过表达,未涵盖模型中的所有基因 | 探索PANoptosis相关基因在膀胱癌中的预后价值,并构建一个用于患者风险分层的预后模型 | 膀胱癌患者及其相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序,生物信息学分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 887 | 2026-01-01 |
B cell transcriptomics reveals lasting dysregulation and rapid decline of protective memory after hepatitis C cure
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.664545
PMID:41473304
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和抗体库特征分析,揭示了慢性丙型肝炎治愈后B细胞转录失调持续存在及保护性记忆快速下降的机制 | 首次通过整合单细胞转录组学和抗体库分析,发现慢性丙型肝炎治愈后B细胞仍存在转录失调,并识别出TNF-α信号作为慢性B细胞过度活化的关键驱动因素,以及CD86hi记忆B细胞亚群在病毒清除后快速下降 | 研究未明确探讨B细胞失调的长期临床影响或具体干预策略 | 探究慢性丙型肝炎治愈后B细胞免疫记忆失调的机制及其可逆性 | 慢性丙型肝炎患者的B细胞 | 单细胞组学 | 丙型肝炎 | 单细胞转录组学, 抗体库特征分析 | NA | 转录组数据, 抗体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 888 | 2026-01-01 |
Adhesion-Related Pathways and Functional Polarization of Astrocytes in Traumatic Brain Injury: Insights from Single-cell RNA Sequencing
2025-04-27, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-025-08858-w
PMID:40287916
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析创伤性脑损伤小鼠模型中星形胶质细胞的亚型与功能动态,揭示了A1与A2两种反应性亚型的功能差异及黏附相关通路在功能极化中的关键调控作用 | 首次在创伤性脑损伤模型中系统描绘星形胶质细胞的功能异质性,发现黏附相关通路(间隙连接、黏附连接、钙依赖性黏附)具有亚型特异性表达模式和时间动态变化,并提出A1与A2状态间存在潜在转换轨迹 | 研究基于小鼠模型,人类创伤性脑损伤的星形胶质细胞反应可能存在差异;单细胞RNA测序未能完全揭示蛋白质水平的功能变化 | 探究创伤性脑损伤后星形胶质细胞功能异质性的调控机制 | 创伤性脑损伤小鼠模型的皮质与海马组织中的星形胶质细胞 | 单细胞组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 多个不同损伤严重程度的数据集(未明确具体样本数) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2026-01-01 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4397799/v1
PMID:40092444
|
研究论文 | 本研究验证了“双重打击”假说,即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因,但需要高胆固醇血症才能诱导完全的内皮重编程和动脉粥样硬化斑块形成 | 首次在遗传谱系示踪模型中验证了血流诱导的内皮细胞重编程假说,并发现了内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞转变的新现象 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步深入 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生过程中对内皮细胞重编程的协同作用 | 小鼠动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 890 | 2026-01-01 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.641843
PMID:40093090
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,验证了在动脉粥样硬化形成过程中,紊乱血流与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞重编程的机制 | 首次提出并验证了“两阶段假说”,即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因,但需要高胆固醇血症才能诱导完全重编程和动脉粥样硬化斑块发展,并发现了内皮细胞向泡沫细胞转化的新现象 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证依赖于公开数据集,且实验时间点仅限于2周和4周,可能未覆盖长期动态变化 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化形成中对内皮细胞重编程的协同作用机制 | 小鼠动脉内皮细胞,特别是暴露于紊乱血流的左颈总动脉区域 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 95只小鼠,共98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 891 | 2026-01-01 |
Annexin A's Life in Pan-Cancer: Especially in Glioma Immune Cells
2025-02-26, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-024-08827-9
PMID:40011350
|
研究论文 | 本文通过整合多组学数据,全面评估了ANXA2和ANXA4在多种癌症中的表达模式及功能影响,特别聚焦于胶质母细胞瘤 | 利用单细胞测序分析揭示ANXA2和ANXA4在胶质母细胞瘤中主要由M2巨噬细胞表达,并强调了使用多种分析方法识别差异表达基因的重要性 | 分析工具之间存在差异,可能影响结果的一致性 | 研究ANXA家族在泛癌分析及胶质瘤中的预后意义和功能作用 | ANXA2和ANXA4基因,以及胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞测序分析,多组学数据整合 | NA | 基因组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 892 | 2026-01-01 |
Cross-tissue multi-omics analyses reveal the gut microbiota's absence impacts organ morphology, immune homeostasis, bile acid and lipid metabolism
2025-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.272
PMID:40027481
|
研究论文 | 本研究通过跨组织多组学分析,揭示了肠道菌群缺失对器官形态、免疫稳态、胆汁酸和脂质代谢的影响 | 首次结合空间转录组学、单细胞RNA测序和靶向胆汁酸代谢组学,系统评估了无菌小鼠中肠道菌群缺失的多器官效应,并发现了自噬驱动的脂滴分解和ZBTB20-LPL轴在脂质稳态中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且仅比较了无菌和特定病原体自由状态,未涵盖菌群组成变化的中间状态 | 探究肠道菌群缺失如何影响宿主器官形态、免疫稳态及代谢过程 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的多个器官 | 多组学分析 | 非传染性疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向胆汁酸代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 无菌和特定病原体自由小鼠的多器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 893 | 2026-01-01 |
Targeting PDCD4 in cancer and atrial fibrillation: mechanistic insights from integrated multi-omics and single-cell analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1593815
PMID:40766329
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析,揭示了PDCD4在房颤和癌症中的调控机制,并识别了关键基因和潜在治疗靶点 | 首次整合多组学、单细胞RNA测序和分子对接分析,系统阐明PDCD4在房颤中的调控网络,并发现其与癌症(如ACC)的交叉调控机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内实验和更大规模的临床队列验证 | 探究PDCD4在房颤中的分子机制,识别关键调控基因和潜在治疗靶点 | 房颤患者的外周血单个核细胞(PBMCs)、单细胞RNA测序数据、癌症数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、qRT-PCR、分子对接 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络、miRNA-mRNA调控网络、转录因子分析 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床样本数据 | 房颤患者和健康对照的外周血单个核细胞样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 894 | 2026-01-01 |
Identifying and validating hypoxia- and metabolism-related hub genes and cell communication in atherosclerosis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1680482
PMID:41458991
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物信息学分析,识别并验证了与动脉粥样硬化相关的缺氧和代谢枢纽基因及其细胞通讯机制 | 整合单细胞测序数据、缺氧相关基因和代谢相关基因,首次系统性地识别了动脉粥样硬化中的DE-MH-RGs,并通过多种分析方法验证了枢纽基因的诊断潜力和治疗靶点 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,缺乏实验验证,且样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 揭示动脉粥样硬化中缺氧和代谢相关基因的调控机制,识别潜在的诊断标志物和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者和正常对照的基因表达数据,包括单细胞测序数据和AS相关数据集 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,基因表达分析,功能富集分析,蛋白互作网络分析 | LASSO逻辑回归,GSEA,GSVA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 基于公共数据集GSE100927和GSE159677,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 895 | 2026-01-01 |
Celline: a flexible tool for one-step retrieval and integrative analysis of public single-cell RNA sequencing data
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1684227
PMID:41458999
|
研究论文 | 本文介绍了Celline,一个用于一站式检索和整合分析公共单细胞RNA测序数据的灵活工具 | 开发了一个端到端的Python包,通过单行命令自动从多个公共存储库检索原始scRNA-seq数据,并利用大语言模型提取元数据,整合了多种现有工具进行质量控制、细胞类型注释、批次校正和轨迹推断 | NA | 为研究人员提供一个无缝检索、预处理、整合和分析公共单细胞RNA测序数据的解决方案 | 公共单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 2个小鼠大脑皮层数据集(胚胎期14.5天和18天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2026-01-01 |
Characteristics of CD103+CD8+ T cells in the spleen of Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1668438
PMID:41459157
|
研究论文 | 本研究通过构建疟原虫感染小鼠模型,利用单细胞RNA测序和流式细胞术分析了脾脏中CD103+CD8+ T细胞的特性及其在感染过程中的变化 | 首次在疟原虫感染模型中系统描述了脾脏CD103+CD8+ T细胞的表型和功能特征,并发现转录因子LEF1可能通过结合Itgae启动子序列调控CD103表达 | 研究仅在小鼠模型中进行,未在人类样本中验证;机制研究主要基于生物信息学预测和报告基因实验,缺乏体内功能验证 | 探究疟原虫感染过程中脾脏CD103+CD8+ T细胞的特性及其功能意义 | C57BL/6小鼠脾脏中的CD45+细胞,特别是CD103+CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、qPCR、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、基因表达数据 | 未明确样本数量,使用C57BL/6小鼠构建感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 897 | 2026-01-01 |
Clustering Analysis of Multiple Omics Data Types Identifies Cancer Patients With Consistent Survival Outcomes
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251394107
PMID:41459353
|
研究论文 | 本研究通过聚类分析多种组学数据类型,识别出具有一致生存结果的癌症患者 | 比较不同组学数据层聚类结果在捕获生存相关患者群组方面的一致性,并识别出跨组学数据一致聚类的患者群组及其与生存结果的关联 | 研究基于TCGA数据,可能受样本量和数据质量的限制,且未验证聚类结果在独立队列中的可重复性 | 评估不同组学数据类型聚类分析在癌症分层中的一致性及其与患者生存结果的关系 | TCGA中20种癌症类型的患者 | 机器学习 | 癌症 | miRNA表达分析、基因表达分析、DNA甲基化分析 | 聚类分析 | miRNA表达数据、基因表达数据、DNA甲基化数据 | TCGA中20种癌症类型的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 898 | 2026-01-01 |
Phase 1 study of chidamide in combination with venetoclax, azacitidine, aclarubicin, cytarabine and G-CSF for refractory/relapsed acute myeloid leukemia: clinical safety, efficacy, and correlative analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698710
PMID:41459484
|
研究论文 | 本研究评估了西达本胺联合维奈托克、阿扎胞苷、阿柔比星、阿糖胞苷和G-CSF(CACAG-VEN方案)在复发/难治性急性髓系白血病(R/R-AML)患者中的疗效、安全性及相关生物标志物分析 | 首次在R/R-AML中评估CACAG-VEN联合方案的疗效,并利用单细胞RNA测序揭示治疗后MCL1、HIF1A和ABCC1下调,以及线粒体活性和p53信号通路的变化 | 样本量较小(34例患者),为单臂I期研究,缺乏随机对照,随访时间中位数为461天,可能不足以评估长期生存 | 评估CACAG-VEN方案作为R/R-AML挽救诱导治疗的安全性和有效性,并进行相关生物标志物分析 | 复发或难治性急性髓系白血病(R/R-AML)患者 | 数字病理 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 34例R/R-AML患者(17例难治性,17例复发),其中4例患者治疗前后共8份骨髓样本进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 899 | 2026-01-01 |
Integrated analysis of the relationship between metabolic pathways and immune infiltration in rheumatoid arthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1679356
PMID:41459480
|
研究论文 | 本研究通过整合分析RNA-Seq数据和临床信息,探讨了类风湿关节炎中代谢通路与免疫浸润之间的关系,并构建了诊断模型 | 首次系统性地整合了代谢通路活性、免疫细胞浸润和共表达网络分析,识别出连接代谢重编程与免疫失调的关键枢纽基因,并利用LASSO模型构建了具有诊断潜力的工具 | 研究主要基于公开数据库的回顾性数据,部分发现(如COX7C的作用)仍需更多实验验证,且样本来源和异质性可能影响结果的普适性 | 阐明类风湿关节炎中代谢通路与免疫浸润之间的相互作用关系,并开发基于关键基因的诊断模型 | 类风湿关节炎患者与健康对照的RNA-Seq数据、临床信息以及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-Seq, scRNA-seq, WGCNA, LASSO逻辑回归 | LASSO逻辑回归模型 | 基因表达数据(RNA-Seq, scRNA-seq)、临床数据 | 来自GEO数据库的多个独立数据集(具体样本数量未在摘要中明确说明) | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 900 | 2026-01-01 |
Tertiary lymphoid structure drives allograft rejection via IFN-γ-JAK-STAT-dependent atypical memory B cell differentiation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728290
PMID:41459486
|
研究论文 | 本研究通过深度学习病理组学模型和单细胞RNA测序分析,揭示了三级淋巴结构通过IFN-γ-JAK-STAT通路驱动非典型记忆B细胞分化,从而介导移植物排斥的免疫机制 | 首次发现三级淋巴结构通过IFN-γ-JAK-STAT依赖的非典型记忆B细胞分化途径驱动移植物排斥,并开发了预测排斥反应的深度学习病理组学模型 | 研究主要基于回顾性队列和动物模型,需要前瞻性临床研究验证治疗靶点的有效性 | 探究三级淋巴结构在肝移植排斥反应中的病理作用、功能和形成机制 | 儿童活体肝移植后的肝活检组织、小鼠原位肝移植模型 | 数字病理学 | 肝移植排斥 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 深度学习, 生物信息学分析 | 深度学习病理组学模型 | 组织图像, 基因表达谱, 单细胞转录组数据 | 590例肝活检样本(来自三个转录组数据库)和11例单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |