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当前共找到 35128 篇文献,本页显示第 861 - 880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
861 2026-01-01
Disturbed flow induces reprogramming of endothelial cells to immune-like and foam cells under hypercholesterolaemia during atherogenesis
2025-Dec-31, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪,验证了在动脉粥样硬化形成过程中,紊乱血流和高胆固醇血症共同诱导内皮细胞重编程为免疫样细胞和泡沫细胞的新假说 提出了“血流诱导的内皮细胞重编程”新概念,并首次通过遗传谱系追踪模型验证了内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞的转化 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类数据来源于公共数据库的再分析,需要进一步在人体样本中进行直接验证 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生中的协同作用机制 小鼠颈动脉内皮细胞、人主动脉内皮细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 95只小鼠的98,553个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
862 2026-01-01
Pan cohort immune biomarker of CD8 lymphocyte activation enabling HGSOC outcome prediction and treatment response
2025-Dec-31, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究开发了一个基于CD8⁺ T细胞活化的免疫预后特征(CIPS),用于晚期高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的预后预测和治疗反应评估 通过整合机器学习方法开发了一个10基因特征,该特征能独立预测生存期,并在多个独立队列中验证,超越了现有临床病理变量和56个已发表模型 研究主要基于转录组数据,未涉及蛋白质水平验证;样本均为晚期HGSOC患者,可能不适用于早期疾病 开发与CD8⁺ T细胞活化相关的稳健生物标志物,以指导HGSOC的临床管理和个性化免疫治疗策略 874名晚期高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)患者 机器学习 卵巢癌 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA-seq分析 机器学习整合方法 转录组数据、临床数据 874名晚期HGSOC患者,并在多个独立队列中验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
863 2026-01-01
Exacerbated salmonellosis in poly(ADP-ribose) polymerase 14-deficient mice
2025-Dec-30, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 本研究探讨了PARP14在小鼠沙门氏菌感染模型中的作用,发现PARP14缺失会加剧肠道炎症和组织病理学变化 首次在沙门氏菌感染模型中系统研究PARP14的多细胞类型调节功能,揭示了其在Th17细胞分化和上皮细胞转录组调控中的双重作用 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;PARP14的具体分子机制仍需进一步阐明 探究PARP14在沙门氏菌感染引起的黏膜炎症中的功能和作用机制 PARP14基因敲除小鼠及其在沙门氏菌感染后的肠道组织反应 分子生物学与免疫学 感染性疾病(沙门氏菌感染) RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, TaqMan qPCR, 免疫组织化学 基因敲除小鼠模型 基因表达数据(RNA-Seq, scRNA-Seq), 组织病理图像 未明确说明具体样本数量,但涉及PARP14敲除小鼠和对照小鼠的感染实验 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
864 2026-01-01
Elucidation of population-based bacterial adaptation to antimicrobial treatment by single-cell sequencing analysis of the gut microbiome of a hospital patient
2025-Dec-30, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序技术分析了一名接受抗生素治疗的急性脑出血患者的肠道微生物组,揭示了细菌对抗菌治疗的群体适应性机制 首次在单细胞水平上追踪了抗生素治疗期间肠道微生物中抗生素抗性基因(ARGs)的进化路径和水平基因转移(HGT)事件,特别是在未分类菌种中的发现 研究仅基于单一样本(一名患者),样本量有限,且未进行纵向时间点采样以全面追踪动态变化 阐明在抗生素治疗压力下,肠道微生物群体通过获得和进化抗性基因来适应环境的机制 一名成年男性急性脑出血患者的肠道微生物组 微生物组学 急性脑出血 单细胞测序 NA 单细胞基因组数据 1名患者 NA 单细胞测序 NA NA
865 2026-01-01
Senescence-associated gene pathways are differentially expressed in equine aging-related osteoarthritis
2025-Dec-30, American journal of veterinary research IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和mRNA测序数据分析,探讨了马匹衰老相关骨关节炎中衰老相关基因通路的差异表达 首次在马匹骨关节炎模型中结合局部关节和系统性白细胞样本,系统评估衰老基因表达异质性,并应用定制化3,043基因衰老集进行通路分析 样本量相对有限(n=65),且研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 确定骨关节炎马匹关节和白细胞中衰老基因的相对表达,为senotherapeutics治疗策略提供依据 马匹的滑膜液细胞和周边血单核细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序, mRNA测序 limma差异分析, fast gene set enrichment analysis 转录组数据 65个样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
866 2026-01-01
CellScope: high-performance cell atlas workflow with tree-structured representation
2025-Dec-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了CellScope,一种用于构建多聚类级别高分辨率细胞图谱的高性能框架 提出了一种两阶段流形拟合过程进行基因选择和降噪,并结合UMAP可视化与层次聚类,以树状结构同时直观展示细胞在多个生物层次(如细胞谱系、细胞类型和细胞亚型)上的关系 未在摘要中明确说明 解决当前单细胞分析框架无法同时探索和可视化多个生物层次细胞层级结构的问题 单细胞测序数据 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
867 2026-01-01
Machine learning-enabled spatial multi-omics uncovers lactate-driven targets and tumor microenvironmental reprogramming in cancer
2025-Dec-30, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光及机器学习模型,揭示了乳酸在肺腺癌肿瘤微环境中的空间分布、细胞类型特异性效应及其对血管生成、免疫抑制和预后的影响 首次将空间代谢组学与单细胞/空间转录组学及机器学习模型相结合,系统解析了乳酸在肿瘤微环境中的空间异质性及其对特定细胞亚群(如内皮细胞)的调控作用,并利用多种机器学习框架一致识别出乳酸驱动的不良预后关键决定因素 研究主要聚焦于肺腺癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证;空间多组学技术的分辨率仍有提升空间;机器学习模型的生物学解释性可进一步深化 阐明乳酸在肿瘤代谢重编程中的空间与细胞类型特异性作用,并识别其驱动的微环境重塑机制与治疗靶点 肺腺癌(LUAD)肿瘤组织及其微环境中的细胞(包括上皮细胞、成纤维细胞、T/NK细胞、单核/巨噬细胞、内皮细胞等) 机器学习 肺癌 单细胞转录组测序、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光、生存分析 随机森林、弹性网络回归、SVM、ANN、决策树 转录组数据、代谢组数据、空间成像数据、临床生存数据 未明确具体样本数量,但使用了TCGA生存数据及多组学整合数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 NA NA
868 2026-01-01
Unraveling the cellular characteristics of cardiomyopathy with rare variant-driven gene signatures using multi-omics analysis
2025-Dec-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合全基因组测序和单细胞转录组学数据,揭示了罕见变异驱动的基因特征在心肌病中的细胞特性 结合罕见变异负担分析和单细胞转录组学,首次系统性地探索了心肌病中未表征变异的功能及其在细胞异质性中的作用 样本主要来自韩国人群,可能限制了结果的普适性;单细胞数据来自独立数据集,未直接与变异样本匹配 表征心肌病相关基因中的罕见变异,并揭示其在细胞层面的生物学影响 245名无关的韩国心肌病患者(包括扩张型和肥厚型心肌病)及11,664个心脏组织细胞 数字病理学 心血管疾病 全基因组测序, 单细胞RNA-seq NA 基因组序列, 转录组数据 245名患者和11,664个细胞 NA 全基因组测序, 单细胞RNA-seq NA NA
869 2026-01-01
Glycosylated IgG antibodies contribute to the recovery of haemorrhagic fever with renal syndrome patients
2025-Dec-29, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析肾综合征出血热患者的B细胞亚群,结合超高效液相色谱检测IgG糖基化,揭示了IgG糖基化在汉坦病毒感染恢复中的关键作用 首次系统研究了肾综合征出血热患者中IgG抗体的糖基化特征,发现急性期患者抗体分泌记忆B细胞和浆母细胞显著扩增,并揭示了糖基化相关基因在特定B细胞亚群中的差异表达,为优化糖工程治疗抗体提供了新见解 样本来源仅限于外周血单核细胞,未涉及其他组织或体液;研究为观察性分析,缺乏直接的机制验证实验;糖基化分析的深度和广度可能受技术限制 探究肾综合征出血热患者中IgG抗体的糖基化特征及其在病毒感染恢复中的作用 肾综合征出血热患者的外周血单核细胞及IgG抗体 免疫学 肾综合征出血热 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 超高效液相色谱 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 色谱数据 肾综合征出血热患者的外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
870 2026-01-01
Spatial transcriptomics: integrating platforms and computational approaches for clinical insights
2025-Dec-26, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文全面回顾了空间转录组学技术的原理、数据分析流程、最新应用及标准化现状,并探讨了其面临的挑战与未来方向 对空间转录组学领域进行了系统性梳理,整合了不同技术平台与计算分析方法,并特别关注了临床转化路径与标准化挑战 作为综述文章,未涉及原始实验数据或新算法验证,主要基于现有文献进行归纳总结 为研究人员提供理解空间转录组学技术进展、挑战及未来方向的清晰框架,促进该技术的进一步发展和临床转化 空间转录组学技术本身及其在生物研究和临床诊断中的应用 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
871 2026-01-01
SOX11 modulates BCR signaling through the PAX5/CD19 axis for therapeutic targeting in BTK-resistant mantle cell lymphoma
2025-Dec-23, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究揭示了转录因子SOX11通过激活PAX5/CD19轴驱动BCR信号通路,为BTK抑制剂耐药的套细胞淋巴瘤提供了新的治疗靶点 首次发现SOX11通过转录调控PAX5/CD19轴介导BCR信号传导,并证明SOX11抑制剂对多种耐药模型(包括BTK抑制剂、BCL2抑制剂和CAR-T耐药)均有效 研究主要基于细胞系和异种移植模型,尚未进行临床试验验证 探索套细胞淋巴瘤中BTK抑制剂耐药的分子机制并寻找新的治疗靶点 套细胞淋巴瘤(MCL)细胞系、患者来源的异种移植(PDX)模型 肿瘤生物学 套细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确具体样本数量,包括伊布替尼敏感和耐药的患者样本、细胞系及PDX模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
872 2026-01-01
Turncoat antibodies unmasked in a model of autoimmune demyelination: From biology to therapy
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中发现了分泌自身抗体的卵泡外浆母细胞,并开发了一种合成抗体变体来中和致病性抗MOG抗体 首次在EAE模型中鉴定出分泌非亲和力成熟IgG抗体的卵泡外浆母细胞,并证明合成抗体8-18C5及其变体可阻断致病性抗体结合并减轻疾病严重程度 研究基于小鼠模型,结果在人类疾病中的直接应用需进一步验证 开发选择性中和自身抗体的疗法,以治疗自身免疫性疾病 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型及MOG抗体疾病患者 NA 自身免疫性脱髓鞘疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
873 2026-01-01
Single-nucleus and spatial transcriptomics reveal the cell populations of intercalary meristems in bamboo
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术,结合染色体水平基因组组装和高分辨率解剖图谱,揭示了竹子节间分生组织的细胞群体动态及其遗传基础 首次在竹子中整合单核RNA测序与空间转录组学,构建了节间分生组织的动态单核转录组连续体,并识别了关键的干细胞样亚群及其功能 研究主要基于毛竹,结果在其他单子叶植物中的普适性有待验证,且功能实验仅初步探索了特定基因的作用 理解单子叶植物节间分生组织的细胞群体动态、遗传基础及其在快速茎伸长中的作用 毛竹的节间分生组织及其相关细胞群体 植物发育生物学 NA 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位杂交, 超微结构成像 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 涉及毛竹节间分生组织的三个关键发育阶段(初始细胞分裂期、快速细胞分裂期、快速细胞伸长期) NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
874 2026-01-01
Spatial organization of stromal subtypes stratifies colorectal cancer patients and predicts clinical outcomes
2025-Dec-19, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多路成像技术,揭示了结直肠癌中肿瘤相关基质细胞的异质性及其空间组织,并发现特定亚群与患者临床预后的关联 首次系统性地结合单细胞转录组和空间成像技术,识别了结直肠癌中肿瘤相关基质细胞亚群的空间分布模式,特别是NGFR基质细胞在三级淋巴结构中的组织状态,并建立了其与疾病无进展生存期的相关性 研究主要基于观察性数据,因果机制尚未完全阐明;样本量可能有限,需要更大规模队列验证;空间成像技术可能受分辨率限制,影响亚群精确定位 探究结直肠癌肿瘤微环境中肿瘤相关基质细胞亚群的空间组织及其临床意义 结直肠癌患者肿瘤组织中的肿瘤相关基质细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,多路成像 SCENIC分析 单细胞转录组数据,空间成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
875 2026-01-01
Mapping Gene Impact on Single-cell Transcriptomic Networks via Perturbation Response Scanning
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为单细胞扰动影响指数(scPII)的数据驱动度量方法,用于量化基因扰动对系统层面的影响,无需依赖CRISPR筛选信息 将最初为蛋白质结构动力学开发的扰动响应框架应用于单细胞转录组网络,以识别最易受扰动的基因模块 未明确提及具体的技术或数据限制,但方法依赖于基因调控网络的准确性 开发一种量化基因扰动系统级影响的方法,以识别对细胞状态有最大全局影响的基因 单细胞转录组网络和基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
876 2026-01-01
CrebA regulation of secretory capacity: genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-Dec-10, Genetics IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过DNA结合实验、表达分析和单细胞RNA测序,揭示了果蝇CrebA转录因子通过直接调控分泌途径组分基因来增强胚胎唾液腺的分泌能力,并探讨了其与哺乳动物同源蛋白的保守功能 首次结合全基因组转录谱分析和体内DNA结合研究,系统评估CrebA在调控分泌能力中的作用,并利用单细胞RNA测序技术比较突变体与野生型样本,深入探索CrebA结合与基因调控的关系 CrebA结合大量基因但仅调控部分,功能结合与非功能结合的区分机制尚不明确;CrebA是否在所有果蝇胚胎组织中驱动分泌途径组分基因表达或调控其他组织特异性功能仍需进一步研究 探究果蝇CrebA转录因子在增强分泌能力中的调控机制及其与哺乳动物同源蛋白的保守性 果蝇胚胎唾液腺及多种组织中的分泌途径组分基因 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、DNA结合实验、表达分析、结合位点诱变 NA 基因表达数据、DNA结合数据 CrebA缺失突变胚胎与现有野生型样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
877 2026-01-01
Stem cell-based approach to identify regulatory TFs during mammalian cell differentiation
2025-Dec-09, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本文开发了一种结合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR转录因子功能缺失筛选的方法,用于识别哺乳动物细胞分化过程中的关键转录因子 整合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR筛选,系统性识别脊髓运动神经元分化中的关键转录因子,并揭示小鼠与人类之间的调控保守性 方法主要针对脊髓运动神经元分化,在其他分化途径中的普适性有待进一步验证 识别哺乳动物细胞分化过程中关键的转录因子 小鼠和人类的脊髓运动神经元分化过程 单细胞组学 NA 单细胞转录组学, CRISPR筛选 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
878 2026-01-01
Plasma metabolites, metabolic risk score and colorectal cancer risk: a prospective cohort study
2025-Dec, European journal of epidemiology IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过前瞻性队列分析,探讨了血浆代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险之间的关联 首次结合LASSO-COX和随机森林方法筛选代谢物,并构建代谢风险评分,同时联合生活方式因素评估结直肠癌风险 研究基于英国生物银行数据,可能受人群特异性限制,且代谢物测量为单时间点,无法反映动态变化 评估代谢物、代谢风险评分及其与生活方式因素的联合效应对结直肠癌风险的影响 英国生物银行中的82,514名参与者 代谢组学与流行病学 结直肠癌 血浆代谢物分析、单细胞RNA测序 LASSO-COX、随机森林、Cox回归 代谢组数据、临床随访数据、单细胞RNA测序数据 82,514名参与者,其中1,151例结直肠癌病例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
879 2026-01-01
Distinct roles of Atf3, Zfp711 and Bcl6b in early embryonic hematopoietic and endothelial lineage specification
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术结合基因敲除,探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b三个转录因子在小鼠胚胎干细胞早期造血和内皮谱系分化中的不同作用 首次在单细胞分辨率下系统研究Atf3、Zfp711和Bcl6b在早期胚胎造血发育中的功能,揭示了它们对谱系分化的特异性调控机制 研究基于体外小鼠胚胎干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂性;Bcl6b敲除未观察到明显表型,其功能需进一步探索 解析早期胚胎造血发育中转录因子的调控网络 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的造血和内皮谱系细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因敲除 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 未明确样本数量,使用体外分化的小鼠胚胎干细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
880 2026-01-01
Immunological dynamics in orthotopic compared with subcutaneous murine models of HPV-positive oropharyngeal cancer
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了皮下与舌根原位小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的差异 首次利用单细胞RNA测序系统比较了不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽癌免疫动态方面的准确性,并揭示了模型选择与免疫治疗反应预测的相关性 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类肿瘤样本的免疫特征,且样本量有限 评估不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的适用性 HPV阳性口咽鳞状细胞癌的小鼠模型(皮下和舌根原位模型) 单细胞测序 口咽癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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