单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 8961 - 8980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8961 | 2024-09-06 |
Characterization of cancer-related fibroblasts (CAF) in hepatocellular carcinoma and construction of CAF-based risk signature based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1009789
PMID:36211448
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研究论文 | 研究探讨了肝细胞癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）特征，并基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据构建了CAF相关的风险特征 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别出肝细胞癌中的四个CAF簇，并构建了包含六个基因的CAF相关风险特征，用于预测肝细胞癌的预后 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探索肝细胞癌中CAF的特征，并建立基于CAF的风险特征以预测肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌中的癌症相关成纤维细胞（CAF）及其相关的风险特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | Lasso回归 | RNA测序数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 |
| 8962 | 2024-09-06 |
Prognostic characteristics of immune subtypes associated with acute myeloid leukemia and their identification in cell subsets based on single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.990034
PMID:36211454
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研究论文 | 研究分析了急性髓系白血病（AML）患者的免疫亚型特征及其在细胞亚群中的识别 | 通过单细胞测序分析，识别了与AML预后相关的九个关键免疫基因，并构建了预测模型 | 研究结果需要在更大样本量的研究中进一步验证 | 探讨AML患者的免疫微环境特征及其在细胞亚群中的表达，并构建预后评估模型 | 急性髓系白血病（AML）患者的免疫亚型和细胞亚群 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 151名AML患者 |
| 8963 | 2024-09-06 |
Mapping and modeling the genomic basis of differential RNA isoform expression at single-cell resolution with LR-Split-seq
2021-10-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02505-w
PMID:34620214
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研究论文 | 开发并表征了一种名为LR-Split-seq的长读长单细胞RNA测序技术，用于在单细胞分辨率下识别全长转录本异构体 | LR-Split-seq结合了组合条形码技术，能够在相对经济和设计灵活的情况下对单细胞进行长读长测序 | NA | 研究单细胞分辨率下RNA异构体表达的基因组基础 | C2C12肌生成系统中的单细胞 | 基因组学 | NA | LR-Split-seq | NA | RNA序列 | C2C12肌生成系统中的单细胞 |
| 8964 | 2024-09-06 |
OVOL1 Regulates Psoriasis-Like Skin Inflammation and Epidermal Hyperplasia
2021-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.10.025
PMID:33333123
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研究论文 | 研究揭示了OVOL1在调节银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的保护作用 | 首次发现OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的保护作用，并通过RNA测序揭示了Ovol1缺失对表皮分化和炎症反应的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类银屑病患者中验证 | 探讨OVOL1在银屑病样皮肤炎症和表皮增生中的分子机制 | OVOL1在银屑病样皮肤炎症中的作用及其对表皮分化和免疫细胞的影响 | NA | 银屑病 | RNA测序 | NA | RNA | Ovol1缺失小鼠的皮肤样本 |
| 8965 | 2024-09-06 |
Integrated Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility Analysis Reveals Regulators of Mammary Epithelial Cell Identity
2020-10-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108273
PMID:33086071
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学和染色质可及性分析，揭示了乳腺上皮细胞身份的调控因子 | 本文首次通过整合单细胞转录组学和染色质可及性分析，无偏倚地重建了小鼠乳腺上皮细胞系统的细胞类型及其基因调控特征，并定义了分泌型腔细胞内的分化状态 | NA | 揭示乳腺上皮细胞身份及其分化的调控机制 | 小鼠乳腺上皮细胞系统及其基因调控特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 转录组数据和染色质可及性数据 | 小鼠乳腺上皮细胞系统中的多个细胞样本 |
| 8966 | 2024-09-06 |
Coronavirus disease-19 and fertility: viral host entry protein expression in male and female reproductive tissues
2020-07, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2020.05.001
PMID:32622411
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研究论文 | 研究分析了男性和女性生殖系统中SARS-CoV-2感染风险相关的细胞类型 | 首次系统分析了男性和女性生殖组织中SARS-CoV-2进入宿主细胞的关键基因和蛋白的表达情况 | 研究基于已有的基因和蛋白表达数据，未涉及临床患者样本 | 识别男性和女性生殖系统中因表达SARS-CoV-2进入细胞所需基因和蛋白而易受感染的细胞类型 | 男性和女性生殖系统中的细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 18个人类卵丘细胞样本 |
| 8967 | 2024-09-06 |
Approaches for integrating heterogeneous RNA-seq data reveal cross-talk between microbes and genes in asthmatic patients
2020-06-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02033-z
PMID:32571363
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研究论文 | 研究开发了一种集成降维和统计建模的流程，用于解析哮喘患者痰液样本中复杂的RNA-seq数据，揭示微生物与基因之间的相互作用 | 提出了LDA-link方法，通过降维的LDA主题将微生物与基因连接起来，并验证了该方法的有效性 | NA | 研究哮喘患者痰液样本中微生物与基因之间的相互作用 | 哮喘患者的痰液样本 | 生物信息学 | 哮喘 | RNA-seq | LDA | RNA-seq数据 | NA |
| 8968 | 2024-09-05 |
Single-cell spatial transcriptomics in cardiovascular development, disease, and medicine
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101163
PMID:39224111
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研究论文 | 本文介绍了单细胞空间转录组学在心血管发育、疾病和医学中的应用，并强调了其在心血管研究中的最新进展。 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，提供了对心血管疾病发病机制的多维度、多层次、多视角和动态的理解。 | NA | 探讨单细胞空间转录组学技术在心血管疾病风险分层和个体化治疗中的应用。 | 心血管疾病的发病机制、细胞间相互作用以及疾病进展的时空特征。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8969 | 2024-09-05 |
Single-cell sequencing reveals that specnuezhenide protects against osteoporosis via activation of METTL3 in LEPR+ BMSCs
2024-Oct-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176908
PMID:39154827
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制 | 首次揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制 | NA | 阐明骨质疏松发病机制并提出新型治疗药物 | 骨质疏松和LEPR+ BMSCs | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠骨质疏松模型 |
| 8970 | 2024-09-05 |
CelltypeR: A flow cytometry pipeline to characterize single cells from brain organoids
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110613
PMID:39224516
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研究论文 | 本文开发了一个完整的流程，用于在复杂组织中可重复地表征细胞类型，特别是脑组织和诱导多能干细胞（iPSC）衍生的脑模型 | 结合流式细胞术（FC）抗体面板与计算流程CelltypeR，实现了数据对齐、无监督聚类优化、细胞类型注释和统计比较 | NA | 开发一个通用的方法，用于在复杂组织中可重复地识别细胞类型 | 人诱导多能干细胞衍生的中脑类器官中的主要脑细胞类型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 流式细胞术（FC）, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 8971 | 2024-09-05 |
Gut Microbiota Defines Functional Direction of Colonic Regulatory T Cells with Unique TCR Repertoires
2024-Sep-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300395
PMID:39101764
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了无特定病原体和无菌小鼠结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性，发现肠道微生物群影响结肠调节T细胞的功能方向和克隆型扩展 | 首次揭示了肠道微生物群与免疫细胞相互作用的新模块，该模块可能有助于开发治疗肠道炎症疾病的新疗法 | NA | 研究肠道微生物群如何改变结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性 | 结肠调节T细胞 | 免疫学 | 肠道炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无特定病原体和无菌小鼠的结肠调节T细胞 |
| 8972 | 2024-09-05 |
Glycolysis in Peritubular Endothelial Cells and Microvascular Rarefaction in CKD
2024-Sep-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000488
PMID:39226371
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研究论文 | 本研究探讨了慢性肾脏病（CKD）中肾小管周围内皮细胞的糖酵解代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | 首次揭示了肾小管周围内皮细胞中糖酵解失调是CKD中微血管稀疏的启动因素，并通过恢复糖酵解改善了微血管稀疏和纤维化病变。 | NA | 研究CKD中肾小管周围内皮细胞的代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | CKD患者的肾小管周围内皮细胞和CKD小鼠模型。 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞测序和代谢分析 | NA | 细胞代谢数据 | CKD患者和CKD小鼠模型的肾小管周围内皮细胞 |
| 8973 | 2024-09-05 |
The heterogeneity of erythroid cells: insight at the single-cell transcriptome level
2024-Sep, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03903-9
PMID:38953986
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的最新进展及其对红细胞功能异质性、新亚群识别、不同红细胞谱系追踪和命运决定机制揭示的贡献 | 强调了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的应用，特别是在识别前所未知的细胞亚群、分析细胞异质性和单个细胞的转录组特征方面的优势 | NA | 系统总结单细胞转录组测序技术的最新发展及其对红细胞研究的影响 | 红细胞及其在血液中的异质性和功能 | 生命科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 8974 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals heterogeneity in epithelial cells between high- and low-grade bladder urothelial carcinoma
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.078
PMID:38796363
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8975 | 2024-09-05 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals the protective effects of lactate-mediated lactylation of microglia-related proteins on spinal cord injury
2024-Sep, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70028
PMID:39218784
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序与批量RNA测序分析，揭示了乳酸介导的微胶质蛋白乳酸化对脊髓损伤的保护作用 | 首次探讨了乳酸介导的微胶质蛋白乳酸化在脊髓损伤后的神经保护机制 | NA | 阐明糖酵解产生的乳酸对微胶质功能及其在脊髓损伤后潜在神经保护机制的影响 | 微胶质细胞及其相关蛋白的乳酸化 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 成年雄性C57BL/6小鼠 |
| 8976 | 2024-09-05 |
Aging-Associated Molecular Changes in Human Alveolar Type I Cells
2024-Sep, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.35534/jrbtm.2024.10012
PMID:39220636
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据，分析了老年人肺泡I型细胞的分子变化 | 首次详细描述了老年人肺泡I型细胞的分子变化，包括细胞衰老和趋化因子基因表达增加，以及上皮特征的减少 | 研究仅限于健康人肺部的数据，未涉及疾病状态下的情况 | 探讨年龄相关的人肺泡I型细胞分子变化机制 | 人肺泡I型细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 8977 | 2024-09-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals microenvironmental infiltration in non-small cell lung cancer with different responses to immunotherapy
2024-Sep, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3736
PMID:39228151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌中主要病理反应（MPR）和非主要病理反应（NMPR）样本的细胞组成，揭示了免疫治疗反应不同的肿瘤微环境差异 | 本研究发现了在MPR和NMPR样本中CD8+ T细胞群体的明显差异，并识别出一系列新的生物标志物，为预测治疗反应和克服免疫治疗耐药性提供了理论基础 | NA | 探索非小细胞肺癌中不同免疫治疗反应的肿瘤微环境差异 | 非小细胞肺癌中的主要病理反应（MPR）和非主要病理反应（NMPR）样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括四个主要MPR样本和八个主要NMPR样本 |
| 8978 | 2024-09-05 |
The heart is a resident tissue for hematopoietic stem and progenitor cells in zebrafish
2024-Aug-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51920-7
PMID:39217144
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和显微镜技术，证明了斑马鱼心脏内皮细胞（EdCs）能够产生并维持稳定的造血细胞群 | 首次揭示了斑马鱼心脏内皮细胞作为造血干细胞和前体细胞的驻留组织，并提供了新的造血细胞来源 | NA | 探究斑马鱼心脏内皮细胞对造血细胞系的贡献 | 斑马鱼心脏内皮细胞及其产生的造血干细胞和前体细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 8979 | 2024-09-05 |
Canine mesenteric lymph nodes (MLNs) characterization by sc-RNAseq: insights compared to human and mouse MLNs
2024-08-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71310-9
PMID:39217215
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术对犬肠系膜淋巴结（MLNs）进行表征，并与人类和小鼠的MLNs进行比较 | 首次对犬肠系膜淋巴结进行详细的单细胞RNA测序分析，并构建了预测图谱 | NA | 探究犬肠系膜淋巴结的免疫细胞组成及其与人类和小鼠的异同 | 犬肠系膜淋巴结的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 健康犬的肠系膜淋巴结样本 |
| 8980 | 2024-09-05 |
Eganelisib combined with immune checkpoint inhibitor therapy and chemotherapy in frontline metastatic triple-negative breast cancer triggers macrophage reprogramming, immune activation and extracellular matrix reorganization in the tumor microenvironment
2024-Aug-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009160
PMID:39214650
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研究论文 | 本文首次报道了在一线转移性三阴性乳腺癌（mTNBC）中，Eganelisib联合免疫检查点抑制剂疗法和化疗的II期临床研究MARIO-3的转化分析结果，揭示了肿瘤微环境中巨噬细胞重编程、免疫激活和细胞外基质重组的基因特征。 | Eganelisib作为一种新型PI3K-γ抑制剂，能够重塑肿瘤微环境，通过减少骨髓细胞向肿瘤的招募并重新编程肿瘤相关巨噬细胞（TAMs），从免疫抑制转变为免疫激活表型，增强免疫检查点抑制剂的活性。 | 研究主要集中在PD-L1阴性肿瘤的治疗效果，对于其他类型的肿瘤或PD-L1阳性肿瘤的治疗效果尚未充分探讨。 | 评估Eganelisib联合抗PD-L1药物atezolizumab和nab-paclitaxel在一线mTNBC中的临床效果和机制。 | 转移性三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫荧光、GeoMx数字空间分析、免疫组织化学 | NA | 肿瘤活检样本、外周血样本 | 肿瘤活检样本11对，空间转录组学分析12对，PD-L1免疫组织化学分析18对 |