单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 8921 - 8940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8921 | 2024-09-06 |
The immune microenvironment of steatotic hepatocellular carcinoma: Current findings and future prospects
2024-Sep-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000516
PMID:39225682
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研究论文 | 本文综述了非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）的免疫微环境，并探讨了利用单细胞RNA测序、空间转录组学和质谱成像等前沿技术解析其复杂性 | 本文介绍了利用代谢抑制剂、表观遗传抑制剂和免疫调节剂等新型治疗手段，以改善MASH-HCC对PD-1抑制剂的反应 | 本文主要基于临床前模型讨论治疗创新，尚未涉及临床试验数据 | 探讨MASH-HCC的免疫微环境及其对免疫检查点抑制剂的反应，并提出个性化治疗策略 | 非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）及其免疫微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱成像 | NA | RNA | NA |
| 8922 | 2024-09-06 |
NKG2C/KLRC2 tumor cell expression enhances immunotherapeutic efficacy against glioblastoma
2024-Aug-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009210
PMID:39214651
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研究论文 | 研究探讨了NKG2C/KLRC2在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达及其对免疫治疗效果的影响 | 发现NKG2C/KLRC2在肿瘤细胞中的高表达与PD-1单克隆抗体治疗效果的增强相关，提示其可能作为免疫检查点抑制剂治疗的预测生物标志物 | 研究结果需要在未来的前瞻性试验中进一步验证 | 探讨NKG2C/KLRC2在GBM中的表达及其对免疫微环境的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其免疫微环境 | 免疫学 | 神经系统肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 包括大量和单细胞RNA测序的GBM数据集，以及来自两个临床试验的样本 |
| 8923 | 2024-09-06 |
scParser: sparse representation learning for scalable single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Aug-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03345-0
PMID:39152499
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研究论文 | 提出了一种名为scParser的稀疏表示学习方法，用于可扩展的单细胞RNA测序数据分析 | scParser模型能够揭示基因表达如何影响表型的关键机制，并能识别出对疾病发病机制有贡献的细胞亚群中的生物过程 | NA | 开发一种可扩展的方法，用于整合分析单细胞RNA测序数据，并理解不同细胞群体中生物条件的异质性效应 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 稀疏表示学习 | scParser | RNA测序数据 | NA |
| 8924 | 2024-09-06 |
Periodontal Ligament Cell Apoptosis Activates Lepr+ Osteoprogenitors in Orthodontics
2024-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241262706
PMID:39104161
|
研究论文 | 研究了正畸牙齿移动过程中牙槽骨重塑的潜在机制，特别是Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞的作用 | 首次报道了正畸牙齿移动过程中压缩侧的骨形成现象，并揭示了PDLC凋亡激活Lepr+成骨前体细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类中验证 | 探讨正畸牙齿移动过程中新骨形成的潜在机制 | Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析、荧光标记技术 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型和体外细胞培养 |
| 8925 | 2024-09-06 |
Identification and Validation of Prognostic Model for Tumor Microenvironment-Associated Genes in Bladder Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing Data Sets
2024-Aug, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO.23.00661
PMID:39151107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别并验证了与膀胱癌肿瘤微环境相关的预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据构建了膀胱癌的预后模型，并验证了其预测性能 | 研究主要基于公共数据库的数据，未来需进行体外验证 | 阐明膀胱癌进展中肿瘤微环境与细胞多样性的关系，并构建预后模型 | 膀胱癌的肿瘤微环境相关基因及预后模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和多变量Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的正常和肿瘤膀胱细胞数据，以及TCGA的病人随访数据 |
| 8926 | 2024-09-06 |
Dystrophin deficiency impairs cell junction formation during embryonic myogenesis from pluripotent stem cells
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110242
PMID:39040067
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研究论文 | 研究了肌营养不良蛋白缺乏对人类多能干细胞在胚胎肌生成过程中细胞连接形成的影响 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了肌营养不良蛋白缺乏导致细胞在体节阶段分化为替代分支，并影响了细胞状态转换相关的细胞连接蛋白 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内模型 | 探讨肌营养不良蛋白缺乏对胚胎肌生成过程中细胞连接形成的影响 | 人类多能干细胞在胚胎肌生成过程中的细胞连接形成 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 8927 | 2024-09-06 |
Single-cell decoding of drug induced transcriptomic reprogramming in triple negative breast cancers
2024-Jul-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03318-3
PMID:39026273
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研究论文 | 研究探讨了三阴性乳腺癌中单细胞转录组在药物诱导下的重编程机制 | 首次结合单细胞转录组和基因组拷贝数数据，揭示了药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的克隆响应和转录重编程 | 研究仅限于三阴性乳腺癌，且样本量相对较小 | 探讨药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的转录组重编程机制 | 三阴性乳腺癌细胞的单细胞转录组和基因组拷贝数数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53,641个过滤后的细胞 |
| 8928 | 2024-09-06 |
Salivary Gland Tissue Recombination Can Modify Cell Fate
2024-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241247484
PMID:38715201
|
研究论文 | 研究探讨了唾液腺组织重组对细胞命运的影响 | 首次全面无偏倚地利用单细胞RNA测序和成像分析，探索组织重组方法对细胞命运调控的影响 | 研究主要集中在胚胎小鼠唾液腺的组织重组，未涉及其他物种或成体组织 | 阐明组织间相互作用在细胞分化中的作用 | 胚胎小鼠唾液腺的间质和上皮组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎小鼠唾液腺的间质和上皮组织 |
| 8929 | 2024-09-06 |
A Novel Mechanism of MSCs Responding to Occlusal Force for Bone Homeostasis
2024-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241236120
PMID:38665065
|
研究论文 | 研究了咬合力对骨稳态的影响机制，特别是MSC在失去咬合力后对牙槽骨的影响 | 首次揭示了咬合力通过Yap/Taz/Ptn轴调控MSC介导的血管生成，从而维持牙槽骨稳态的机制 | 研究仅在鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨失去咬合力后牙槽骨损失的机制 | 鼠牙槽骨中的非造血细胞（CD45细胞） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠牙槽骨中的非造血细胞 |
| 8930 | 2024-09-06 |
Single cell transcriptomics reveals distinct transcriptional responses to oxycodone and buprenorphine by iPSC-derived brain organoids from patients with opioid use disorder
2024-Jun, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01837-8
PMID:36302966
|
研究论文 | 研究使用单细胞转录组学分析了来自阿片类药物使用障碍患者的iPSC衍生的脑类器官对羟考酮和丁丙诺啡的不同转录反应 | 首次在单细胞水平上揭示了羟考酮和丁丙诺啡对iPSC衍生的脑类器官的不同转录反应，特别是丁丙诺啡对胶质细胞的显著影响和羟考酮诱导的I型干扰素信号 | 研究仅限于男性OUD患者，样本量较小，且仅进行了7天的药物处理 | 探讨阿片类药物对脑细胞类型功能的单细胞水平调控机制 | 来自阿片类药物使用障碍患者的iPSC衍生的脑类器官 | 单细胞转录组学 | 阿片类药物使用障碍 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | Seurat整合分析管道 | 转录组数据 | 3名男性OUD患者 |
| 8931 | 2024-09-06 |
BEST4+ cells in the intestinal epithelium
2024-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00042.2024
PMID:38557358
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综述 | 本文综述了BEST4+细胞在人类肠上皮中的新发现及其潜在功能 | BEST4+细胞是单细胞转录组学揭示的一种新型成熟吸收细胞，具有独特的基因表达谱 | 大多数关于BEST4+细胞功能的假设缺乏功能验证，特别是由于小鼠中不存在BEST4+细胞 | 总结现有关于BEST4+细胞的文献，强调其在健康和疾病中肠上皮的预测作用 | BEST4+细胞及其在肠上皮中的功能 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类、猕猴、猪、斑马鱼和兔子的肠上皮细胞 |
| 8932 | 2024-09-06 |
Macrophages in necrotic liver lesion repair: opportunities for therapeutical applications
2024-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00053.2024
PMID:38618702
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综述 | 本文综述了肝巨噬细胞在坏死性肝损伤修复中的不同作用及其作为治疗急性肝衰竭和急性慢性肝衰竭新疗法潜在靶点的可能性 | 通过使用更具体的巨噬细胞标记物、靶向细胞耗竭和单细胞RNA测序，揭示了几种单核细胞来源的巨噬细胞亚群在诱导肝损伤和炎症以及肝修复和再生中的重要作用 | 尚未明确区分常驻巨噬细胞和浸润巨噬细胞的功能差异 | 探讨肝巨噬细胞在促进坏死性肝损伤修复和死亡细胞清除中的不同作用，并将其作为开发新疗法的潜在靶点 | 肝巨噬细胞及其在肝损伤修复中的作用 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8933 | 2024-09-06 |
Spatiotemporal Evolution of Developing Palate in Mice
2024-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241232317
PMID:38619065
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序，揭示了小鼠胚胎期腭部发育的时空转录景观 | 首次整合单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序，揭示了腭部发育过程中细胞亚群的空间分布和细胞间通讯网络 | 研究仅限于C57BL/6 J小鼠，结果的普适性有待进一步验证 | 探索腭部发育过程中主要细胞群体及其作用机制 | 小鼠胚胎期腭部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间增强分辨率组学测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6 J小鼠胚胎期腭部样本，分别在胚胎第12.5天、14.5天和16.5天采集 |
| 8934 | 2024-09-06 |
Distinct subpopulations of human subcutaneous adipose tissue precursor cells revealed by single-cell RNA sequencing
2024-04-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00726.2023
PMID:38581663
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了人体皮下脂肪组织前体细胞的不同亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人体皮下脂肪组织前体细胞的不同亚群，并分析了这些亚群在不同部位的特异性表达 | 研究样本仅来自八名女性，且未涉及男性样本，可能存在性别差异的影响 | 探讨人体皮下脂肪组织前体细胞在不同部位的差异及其对脂肪生成的影响 | 人体皮下腹部和臀股部脂肪组织中的脂肪来源干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 八名女性 |
| 8935 | 2024-09-06 |
IL-36 Regulates Neutrophil Chemotaxis and Bone Loss at the Oral Barrier
2024-04, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231225413
PMID:38414292
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研究论文 | 研究探讨了IL-36家族在口腔屏障中调节中性粒细胞趋化性和骨丢失的机制 | 首次揭示了IL-36γ在口腔屏障中通过纤维母细胞促进中性粒细胞趋化性的作用，并阐明了其在牙周炎中的病理生理功能 | 研究主要集中在体外和体内实验，缺乏临床数据支持 | 探讨纤维母细胞在口腔屏障中驱动中性粒细胞趋化信号的特定调节机制 | IL-36家族在口腔屏障中的作用及其对中性粒细胞趋化性和骨丢失的影响 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和鼠类牙龈上皮细胞及鼠类中性粒细胞 |
| 8936 | 2024-09-06 |
CD52 mRNA expression predicts prognosis and response to immune checkpoint blockade in melanoma
2024-03, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13151
PMID:37975535
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研究论文 | 研究CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和免疫检查点阻断反应预测价值 | 首次分析了CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和预测免疫检查点阻断反应的作用，并探讨了其与不同免疫细胞亚群和免疫检查点表达的关系 | 研究样本量有限，且仅基于TCGA数据库和单细胞RNA测序数据，缺乏临床试验验证 | 探讨CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和免疫检查点阻断反应的预测价值 | CD52 mRNA表达在黑色素瘤中的预后和免疫检查点阻断反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 445例未治疗的黑色素瘤患者和121例接受抗PD-1免疫检查点阻断的黑色素瘤患者 |
| 8937 | 2024-09-06 |
A Cell Cycle-aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-cell RNA-seq and ATAC-seq
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578213
PMID:38352302
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络（CCAN），用于去除单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应，同时保留细胞类型特异性变异 | 首次提出了一种计算模型来研究单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应 | 未提及 | 研究单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据的集成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 细胞周期感知网络（CCAN） | 单细胞RNA测序数据，单细胞ATAC测序数据 | 多个基准数据集 |
| 8938 | 2024-09-06 |
IRF9 and STAT1 as biomarkers involved in T-cell immunity in atherosclerosis
2024, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39234946
|
研究论文 | 研究旨在识别与程序性细胞死亡（PCD）相关的生物标志物，并探索动脉粥样硬化的关键调控机制 | 通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞RNA测序数据，识别了与动脉粥样硬化相关的免疫细胞类型和关键基因 | 研究主要基于基因表达数据和单细胞RNA测序数据，缺乏实验验证 | 识别与动脉粥样硬化相关的生物标志物和调控机制 | 动脉粥样硬化和对照组的基因表达数据，以及单细胞RNA测序数据 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | GSE20129和GSE23746的基因表达数据，GSE159677的单细胞RNA测序数据 |
| 8939 | 2024-09-06 |
Radiotherapy-Induced Neurocognitive Impairment Is Driven by Heightened Apoptotic Priming in Early Life and Prevented by Blocking BAX
2023-10-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1337
PMID:37470810
|
研究论文 | 本文研究了放射治疗引起的神经认知功能障碍的机制，并发现通过阻断BAX可以预防这种损伤 | 开发了一种新的放射治疗诱导神经认知功能障碍的小鼠模型，并发现BAX在其中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨放射治疗引起的神经认知功能障碍的机制，并寻找预防方法 | 放射治疗对不同年龄段小鼠神经认知功能的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 8940 | 2024-09-06 |
Transcriptomic profiling of cardiac tissues from SARS-CoV-2 patients identifies DNA damage
2023-03, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13577
PMID:36107637
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研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2患者心脏组织的转录组图谱，发现DNA损伤相关基因的上调 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染患者心脏组织中DNA损伤和修复相关基因的上调，并通过γ-H2Ax免疫组化进一步验证 | 样本量较小，且仅包括SARS-CoV-2、pH1N1和对照组患者，可能影响结果的普适性 | 探讨SARS-CoV-2感染对心脏组织的分子影响 | SARS-CoV-2、pH1N1和对照组患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 7例SARS-CoV-2患者、2例pH1N1患者和6例对照组患者的心脏组织 |